单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2541 - 2560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2024-08-05 |
Analysis of potential biomarkers for diabetic kidney disease based on single-cell RNA-sequencing integrated with a single-cell sequencing assay for transposase-accessible chromatin
2023-10-11, Aging
DOI:10.18632/aging.205107
PMID:37827693
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研究论文 | 该文章分析了基于单细胞RNA测序的潜在糖尿病肾病生物标志物 | 本研究结合了转座酶可及染色质的单细胞测序，揭示了糖尿病肾病中开放的染色质区域和基因表达的差异 | 未详细描述研究的局限性 | 识别与糖尿病肾病相关的差异表达基因和转录因子 | 使用db/db和db/m小鼠的肾脏进行分析 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)与单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)的结合 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自db/db和db/m小鼠的肾脏样本 |
| 2542 | 2024-08-07 |
Eosinophils promote pulmonary matrix destruction and emphysema via Cathepsin L
2023-10-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01634-x
PMID:37816708
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在哮喘和肺气肿小鼠模型中识别嗜酸性粒细胞亚群，并分析其功能，发现嗜酸性粒细胞衍生的组织蛋白酶L在肺组织中导致细胞外基质降解，从而引发肺气肿 | 首次揭示了嗜酸性粒细胞衍生的组织蛋白酶L在肺气肿发展中的具体机制，并提出靶向这一途径可能成为治疗肺气肿的新策略 | 需要进一步研究针对组织蛋白酶L的治疗策略在肺气肿患者中的应用 | 探究嗜酸性粒细胞在肺气肿发展中的作用机制 | 嗜酸性粒细胞及其衍生的组织蛋白酶L在肺气肿中的作用 | NA | 肺气肿 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 2543 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis identifies two distinct phenotypes of newly-onset microscopic polyangiitis
2023-10-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41328-0
PMID:37821442
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了新发显微镜下多血管炎患者的免疫学基础，并识别出两种不同的表型 | 首次通过单细胞多组学分析，识别出新发显微镜下多血管炎的两种不同免疫表型，并提供了个性化治疗和准确预后预测的临床见解 | NA | 探讨显微镜下多血管炎的临床异质性的免疫学基础 | 新发显微镜下多血管炎患者的外周血单个核细胞 | NA | 显微镜下多血管炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 新发显微镜下多血管炎患者的外周血单个核细胞样本 |
| 2544 | 2024-08-07 |
A novel monoclonal antibody reveals the enrichment of NADPH oxidase 5 in human splenic endothelial cells
2023-10-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44018-5
PMID:37821487
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研究论文 | 本文报道了一种新型抗NOX5单克隆抗体的开发和表征，该抗体能够识别人NOX5蛋白，并在多种应用中成功检测到NOX5的表达。 | 开发了一种新型抗NOX5单克隆抗体，能够在Western blot、免疫细胞化学和组织化学中识别人NOX5蛋白。 | NA | 研究NOX/DUOX家族的NADPH氧化酶在不同细胞和组织中的蛋白质水平检测。 | 人NOX5蛋白在不同组织和细胞类型中的表达和定位。 | NA | NA | 免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 涉及人脾脏、睾丸和卵巢的组织样本，以及多种细胞类型。 |
| 2545 | 2024-08-07 |
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2023.09.003
PMID:37827122
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研究论文 | 本文通过结合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序（称为双扰动测序），识别了弓形虫效应蛋白，这些蛋白影响宿主细胞转录 | 首次使用双扰动测序方法来识别和推断弓形虫效应蛋白的功能，这种方法可以广泛应用于研究宿主-微生物转录交互作用 | NA | 识别影响宿主细胞转录的弓形虫效应蛋白，并揭示其功能和免疫逃避机制 | 弓形虫效应蛋白及其在宿主细胞转录调节中的作用 | NA | NA | CRISPR敲除筛选，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2546 | 2024-08-05 |
Multi-species atlas resolves an axolotl limb development and regeneration paradox
2023-10-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41944-w
PMID:37816738
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研究论文 | 本研究通过多物种的单细胞转录组学图谱解析了水怪肢体发育和再生的矛盾 | 首次确认水怪中存在具有AER特征的细胞，并揭示其在再生过程中的不同表现 | 仅使用了几个物种的细胞，对水怪肢体再生机制的理解可能存在局限 | 探讨水怪在再生过程中肢体发育程序的重现程度 | 水怪及其他几种物种的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 多个物种的细胞，包括水怪、人类、老鼠、鸡和青蛙 |
| 2547 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveals heterogeneity of fibroblast and pivotal genes in psoriasis
2023-10-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44346-6
PMID:37816883
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研究论文 | 本文研究了银屑病的异质性及其关键基因，采用了综合的单细胞和空间转录组学分析 | 本研究首次整合了大规模转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了关键基因与纤维细胞的相互作用 | 未深入探讨其他治疗方法对这些关键基因的影响 | 阐明银屑病的潜在发病机制 | 银屑病患者及其皮损与非皮损样本中的纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 2548 | 2024-08-07 |
Exploring oncogenes for renal clear cell carcinoma based on G protein-coupled receptor-associated genes
2023-Oct-10, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00795-z
PMID:37816979
|
研究论文 | 本研究基于G蛋白偶联受体相关基因探讨肾透明细胞癌中的癌基因 | 首次探讨G蛋白偶联受体在预测肾透明细胞癌预后中的作用，并建立基于G蛋白偶联受体相关基因的疾病模型 | NA | 探索G蛋白偶联受体相关基因在肾透明细胞癌诊断和预后中的作用 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括63个肿瘤样本和14个正常样本 |
| 2549 | 2024-08-07 |
Characterization of tumour microenvironment reprogramming reveals invasion in epithelial ovarian carcinoma
2023-Oct-10, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-023-01270-7
PMID:37817210
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据探讨了肿瘤微环境重编程与上皮性卵巢癌侵袭之间的关系 | 发现了缺氧、氧化磷酸化和糖酵解在细胞间质上皮转化过程中的生物活性轨迹，并确定了HMGA1、EGR1和RUNX1作为上皮性卵巢癌中EMT过程的关键驱动因子 | NA | 揭示上皮性卵巢癌中肿瘤侵袭和肿瘤微环境重编程的分子机制及生物标志物 | 上皮性卵巢癌的肿瘤细胞侵袭及其分子机制 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2550 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a peripheral landscape of immune cells in Schistosomiasis japonica
2023-Oct-10, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-023-05975-y
PMID:37817226
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了日本血吸虫病感染者外周血单个核细胞的免疫景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了日本血吸虫病患者外周免疫细胞的转录图谱 | 样本量较小，且仅基于外周血单个核细胞进行分析 | 深入理解血吸虫病中的免疫机制 | 日本血吸虫病感染者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康对照组4例，慢性血吸虫病组4例，晚期血吸虫病组2例 |
| 2551 | 2024-08-05 |
scIBD: a self-supervised iterative-optimizing model for boosting the detection of heterotypic doublets in single-cell chromatin accessibility data
2023-10-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03072-y
PMID:37814314
|
研究论文 | 提出了一种自监督迭代优化模型scIBD，用于提高单细胞染色质可及性数据中异质双重体的检测 | scIBD引入了一种自适应策略，以模拟高可信度的异质双重体并进行自我监督 | 对特定于检测的挑战以及多重测定的影响未进行详细讨论 | 提高单细胞染色质可及性数据中异质双重体的检测准确性 | 单细胞染色质可及性 sequencing (scCAS) 数据中的异质双重体 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | 自监督迭代优化模型 | 数据集（模拟和真实） | 多种模拟和真实数据集 |
| 2552 | 2024-08-05 |
Pan-Cancer Analysis of Patient Tumor Single-Cell Transcriptomes Identifies Promising Selective and Safe Chimeric Antigen Receptor Targets in Head and Neck Cancer
2023-Oct-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194885
PMID:37835579
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研究论文 | 该文章分析了患者肿瘤单细胞转录组数据，以识别头颈癌中有前景的选择性和安全的嵌合抗原受体靶点 | 发现了二十个新的嵌合抗原受体靶点，其中五个具有优越的选择性和安全性分数 | 在几乎所有癌种中，未能找到比当前靶点更好的选择，显示当前靶点空间近乎最佳 | 寻找适合肿瘤免疫治疗的新型嵌合抗原受体靶点 | 患者肿瘤单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2553 | 2024-08-07 |
Integrated Analyses of Single-Cell Transcriptome and Mendelian Randomization Reveal the Protective Role of Resistin in Sepsis Survival in Intensive Care Unit
2023-Oct-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914982
PMID:37834432
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和孟德尔随机化分析，探讨了在重症监护室（ICU）中抵抗素对脓毒症患者生存的保护作用 | 本研究首次通过孟德尔随机化分析探讨了抵抗素在脓毒症中的保护作用，并利用meQTL分析确定了影响脓毒症的CpG位点 | NA | 探索脓毒症中细胞类型特异性差异表达基因（DEGs），并研究抵抗素在脓毒症患者生存中的作用 | 脓毒症患者和健康对照的单细胞及批量转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组分析，孟德尔随机化分析，meQTL分析 | NA | 转录组数据 | 560个细胞类型特异性差异表达基因 |
| 2554 | 2024-08-07 |
A SARS-CoV-2 related signature that explores the tumor microenvironment and predicts immunotherapy response in esophageal squamous cell cancer
2023-10-06, Aging
DOI:10.18632/aging.205090
PMID:37812215
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2相关基因在食管鳞状细胞癌中的特征及其对免疫治疗反应的预测作用 | 首次研究了SARS-CoV-2相关基因在食管鳞状细胞癌中的作用，并开发了一种基于这些基因的风险签名，用于预测免疫治疗反应 | NA | 研究SARS-CoV-2相关基因在食管鳞状细胞癌中的特征及其对免疫治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq | Lasso回归 | RNA-seq数据 | NA |
| 2555 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Regional Transcript Changes in Early and Late Stages of rd1 Model Mice with Retinitis Pigmentosa
2023-Oct-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914869
PMID:37834317
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研究论文 | 使用空间转录组学分析rd1小鼠不同年龄视网膜层的变化 | 首次揭示了视网膜色素变性在早期和晚期阶段的区域转录变化 | 未明确涵盖临床治疗方法 | 研究视网膜色素变性病理机制的时间变化 | rd1小鼠 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | rd1小鼠和对照组 |
| 2556 | 2024-08-05 |
Spatial Heterogeneity of Integrins and Their Ligands in Primary Breast Tumors
2023-10, Discovery medicine
IF:2.0Q3
DOI:10.24976/Discov.Med.202335178.86
PMID:37811629
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研究论文 | 本文研究了原发性乳腺肿瘤中整合素及其配体的形态学和空间异质性 | 该研究揭示了乳腺癌中整合素-配体表达簇的空间异质性及其对肿瘤功能异质性的重大影响 | 研究主要集中在乳腺癌的特定样本上，结果可能不适用于其他类型的癌症 | 研究原发性乳腺肿瘤中整合素及其配体的表达特征与空间异质性 | 原发性乳腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，10X Visium方法 | NICHES算法 | 组织样本 | 5个样本的21个簇，包含多种功能整合素-配体对 |
| 2557 | 2024-08-05 |
ESICCC as a systematic computational framework for evaluation, selection, and integration of cell-cell communication inference methods
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278001.123
PMID:37827697
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研究论文 | 本文开发了一个名为ESICCC的系统基准框架，用于评估和比较细胞间通信推断方法的性能 | 创新点在于系统性地比较了18种配体-受体推断方法和5种配体/受体-靶标推断方法 | 尚未提及分析结果的长期生物学影响 | 旨在填补细胞间通信推断方法比较的空白 | 对116个数据集的细胞间通信推断方法进行评估与比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST) | NA | 数据集 | 116个数据集，包括15个ST数据集、15个细胞系扰动数据集、2个细胞类型特异性表达/蛋白质组学数据集和84个采样或未采样的scRNA-seq数据集 |
| 2558 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of bronchoscopy specimens: development of a rapid minimal handling protocol
2023-10, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2023-0017
PMID:37815826
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research paper | 本文开发了一种快速且最小化处理的协议，用于从支气管刷取样品中制备单细胞悬浮液，以便进行单细胞RNA测序。 | 本文提出了一种新的、侵入性较小的支气管刷取样方法，用于单细胞RNA测序，以减少传统方法的风险和限制。 | 目前主要限制是使用侵入性方法（如气道活检、手术切除）进行单细胞RNA测序研究，这些方法存在固有风险。 | 开发一种快速且最小化处理的协议，用于从支气管刷取样品中制备单细胞悬浮液，以便进行单细胞RNA测序。 | 支气管刷取样品中的单细胞悬浮液。 | digital pathology | airway diseases | scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 2559 | 2024-08-07 |
Dissection of key factors correlating with H5N1 avian influenza virus driven inflammatory lung injury of chicken identified by single-cell analysis
2023-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011685
PMID:37819993
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，研究了H5N1和H9N2禽流感病毒感染鸡肺组织后的转录组变化，揭示了不同病毒株引起的炎症反应差异及其潜在机制 | 首次系统性地分析了H5N1和H9N2禽流感病毒感染鸡肺组织后16种细胞类型（19个集群）的转录组，并开发了这些细胞类型的标记基因目录 | NA | 揭示禽流感病毒感染鸡肺组织后的免疫反应机制 | 鸡肺组织中的16种细胞类型 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | H5N1和H9N2禽流感病毒感染的鸡肺组织样本 |
| 2560 | 2024-08-07 |
Transcriptional Regulation of Airway Epithelial Cell Differentiation: Insights into the Notch Pathway and Beyond
2023-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914789
PMID:37834236
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综述 | 本文综述了气道上皮细胞分化的转录调控机制，特别关注了Notch信号通路及其相关因素 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了气道上皮细胞的组成，包括一些特殊和罕见的细胞类型 | NA | 探讨气道上皮细胞分化的机制，为呼吸系统疾病的治疗提供靶向疗法 | 气道上皮细胞的分化过程及其在呼吸系统疾病中的作用 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |