单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2521 - 2540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2521 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of the germ cells and somatic cells during mitotic quiescence stage in goats
2023-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301278
PMID:37823602
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了山羊在有丝分裂静止阶段生殖细胞和体细胞的转录特征 | 首次在山羊中揭示了有丝分裂静止阶段生殖细胞和体细胞的转录特征，并分析了细胞类型间的共同和特异的基因本体类别、转录因子调控网络及细胞间相互作用 | NA | 探究山羊有丝分裂静止阶段生殖细胞和体细胞的调控机制及其功能重要性 | 山羊在E85、E105和E125时期的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 山羊在E85、E105和E125时期的生殖细胞和体细胞样本 |
| 2522 | 2024-08-07 |
Butylparaben weakens female fertility via causing oocyte meiotic arrest and fertilization failure in mice
2023-Nov-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2023.115561
PMID:37837697
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研究论文 | 本研究探讨了丁基对羟基苯甲酸酯（butylparaben）对雌性小鼠生殖能力的影响，特别是对卵母细胞质量和受精能力的影响 | 首次报道了丁基对羟基苯甲酸酯通过影响卵母细胞的减数分裂能力和受精潜力来削弱雌性小鼠的生育能力 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探究丁基对羟基苯甲酸酯对雌性小鼠生殖能力的影响 | 雌性小鼠的卵母细胞质量和受精能力 | NA | 生殖疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2523 | 2024-08-05 |
Stomach encyclopedia: Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal cell diversity and homeostatic regulation of human stomach
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113236
PMID:37819756
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和亚细胞水平的空间转录组学分析揭示了人类胃的细胞多样性和稳态调节 | 构建了迄今为止最大的胃细胞数据集，识别了LEFTY1作为未表征的干细胞标记物 | 未提及具体的研究限制 | 揭示人类胃的细胞生物学和细胞群体的相互作用 | 人类胃细胞，包括胃和肠化生细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 | NA | 细胞数据 | 约380,000个细胞 |
| 2524 | 2024-08-07 |
In-depth analysis of human virus-specific CD8+ T cells delineates unique phenotypic signatures for T cell specificity prediction
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113250
PMID:37837618
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研究论文 | 本文通过高维质谱流式细胞术和单细胞RNA测序，深入分析了114名健康捐赠者和55名癌症患者外周血样本中针对CMV、EBV、流感病毒和SARS-CoV-2抗原的CD8 T细胞反应 | 利用机器学习方法提取抗原特异性T细胞的表型特征，并预测批量CD8 T细胞的病毒特异性 | NA | 评估感染历史并理解其对保护性免疫的贡献 | 人类病毒特异性CD8 T细胞的表型特征 | 免疫学 | NA | 高维质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | 机器学习 | 细胞 | 114名健康捐赠者和55名癌症患者的外周血样本 |
| 2525 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics: Emerging Technologies in Tissue Gene Expression Profiling
2023-10-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c02029
PMID:37814884
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评论 | 本文讨论了空间转录组技术的当前状态和进展，旨在提供高分辨率的基因表达图谱 | 介绍了高通量、范围广泛的转录组分析技术，以及单细胞分辨率的方法 | 未详细描述特定技术的缺点和适用范围的可能限制 | 探讨空间转录组技术在组织基因表达分析中的应用和发展 | 包括不同技术在组织架构、发育生物学和疾病研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 基于微切割、测序和单分子FISH等多种技术的方法 | NA | RNA数据 | NA |
| 2526 | 2024-08-07 |
Ewing Sarcoma Single-cell Transcriptome Analysis Reveals Functionally Impaired Antigen-presenting Cells
2023-10-24, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0027
PMID:37823774
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了尤文肉瘤的免疫微环境，揭示了功能受损的抗原呈递细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了尤文肉瘤的免疫微环境，发现了肿瘤细胞与免疫微环境的相互作用机制 | 研究样本仅限于18个尤文肉瘤组织样本，可能影响结果的普遍性 | 探索尤文肉瘤的免疫微环境，为免疫治疗提供新的策略 | 尤文肉瘤的免疫微环境和抗原呈递细胞的功能 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18个尤文肉瘤组织样本 |
| 2527 | 2024-08-05 |
Spatial downregulation of CD74 signatures may drive invasive component development in part-solid lung adenocarcinoma
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107699
PMID:37810252
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研究论文 | 本文探讨了部分实性肺腺癌中CD74标记的空间下调如何驱动侵袭性成分的发展 | 结合空间转录组学和病理注释，揭示了早期肺腺癌的空间组成和演变轨迹 | 仅研究了20个部分实性结节，而且4个样本使用了单细胞RNA测序，样本量相对较小 | 定义早期肺腺癌的空间组成及其演化轨迹 | 20个部分实性结节（PSNs）和匹配的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | 20个部分实性结节，4个样本进行了单细胞RNA测序 |
| 2528 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling reveals immune and stromal cell heterogeneity in primary Sjögren's syndrome
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107943
PMID:37810210
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了原发性干燥综合征（pSS）患者和非pSS对照组中免疫和间质细胞的异质性 | 首次揭示了pSS患者中SOX9下调的肌上皮细胞、扩大的ACKR1内皮亚群以及外周血中IGHD幼稚B细胞的扩展，以及纤维母细胞在间质-免疫相互作用网络中的关键作用 | NA | 揭示原发性干燥综合征中免疫和间质细胞的异质性，为治疗策略提供见解 | 原发性干燥综合征患者和非pSS对照组的免疫和间质细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 11名pSS患者和5名非pSS对照组 |
| 2529 | 2024-08-05 |
Miniature spatial transcriptomics for studying parasite-endosymbiont relationships at the micro scale
2023-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42237-y
PMID:37838705
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研究论文 | 本文探讨了使用小型空间转录组学技术研究寄生虫与内共生体之间的关系 | 提出了一种小型空间转录组学的概念，能够揭示微小样本中的基因表达模式 | 未提及研究的具体局限性 | 研究寄生虫与内共生细菌Wolbachia之间的相互作用 | 成虫雌性Brugia malayi的生殖组织及发育中的胚胎 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小型样本类型 |
| 2530 | 2024-08-07 |
Cancer stem cell-derived CHI3L1 activates the MAF/CTLA4 signaling pathway to promote immune escape in triple-negative breast cancer
2023-10-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04532-6
PMID:37838657
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌干细胞通过CHI3L1/MAF/CTLA4信号通路促进免疫逃逸的分子机制 | 首次揭示了三阴性乳腺癌干细胞通过CHI3L1/MAF/CTLA4轴影响免疫逃逸的新机制 | NA | 利用单细胞转录组测序揭示CHI3L1/MAF/CTLA4信号通路在三阴性乳腺癌中通过肿瘤干细胞与免疫细胞相互作用介导免疫逃逸的分子机制 | 三阴性乳腺癌干细胞、免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三阴性乳腺癌组织中的八个细胞亚群 |
| 2531 | 2024-08-07 |
Benchmarking strategies for cross-species integration of single-cell RNA sequencing data
2023-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41855-w
PMID:37838716
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研究论文 | 本文评估了28种基因同源性映射方法和数据集成算法的组合，在不同生物学场景下进行跨物种单细胞RNA测序数据整合的能力 | 开发了一种新的生物学保守度量，用于评估细胞类型可区分性的维持 | NA | 探索不同物种间细胞类型的进化关系，并确保数据整合结果真正反映生物学特性 | 跨物种单细胞RNA测序数据的整合策略 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | scANVI, scVI, SeuratV4, SAMap | 基因表达数据 | 多种生物学设置下的数据集 |
| 2532 | 2024-08-05 |
Nr4a1 marks a distinctive ILC2 activation subset in the mouse inflammatory lung
2023-10-13, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01690-3
PMID:37833706
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研究论文 | 这篇文章研究了小鼠急性炎性肺中ILC2的激活亚群。 | 文章首次识别了小鼠肺中四种ILC2亚群，并揭示了Nr4a1标记的激活亚群的独特特征及其与PD-1的关系 | 研究主要集中于小鼠模型，结果的临床转化可能有限 | 阐明ILC2激活的分子机制及其在疾病防治中的作用 | 小鼠中的ILC2亚群，尤其是Nr4a1+ILC2 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、基因报告和基因敲除 | NA | NA | NA |
| 2533 | 2024-08-05 |
Pan-cancer spatially resolved single-cell analysis reveals the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and tumor microenvironment
2023-10-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01876-x
PMID:37833788
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研究论文 | 研究揭示了癌相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 识别了四个不同功能亚组的CAF，并分析了它们的空间分布特征 | 关于CAF异质性的研究仅限于六种常见癌症类型及少数稀有癌症类型 | 探讨癌相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用和相互作用 | 癌相关成纤维细胞及其在不同癌症类型中的功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及六种常见癌症类型和两种稀有癌症类型的数据集 |
| 2534 | 2024-08-05 |
Daily turnover of active giant virus infection during algal blooms revealed by single-cell transcriptomics
2023-10-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf7971
PMID:37824628
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了藻类潮汐期间活性巨病毒感染的日常周转情况 | 首次应用单细胞RNA测序技术剖析了巨病毒在海洋藻类中的活性感染与宿主转录组 | 本研究仅集中于12,000个单细胞的转录组，可能存在样本偏倚 | 研究巨病毒对海洋藻类的感染动态及其对微生物食物链的影响 | 在海洋环境中，研究了12,000个单细胞藻类的病毒感染状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12,000个单细胞藻类样本 |
| 2535 | 2024-08-05 |
Comprehensive cell atlas of the first-trimester developing human brain
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf1226
PMID:37824650
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研究论文 | 该文章揭示了人类大脑早期发育过程中的细胞类型及其轨迹 | 首次详尽地揭示了在妊娠初期人类大脑中细胞类型的建立及其空间分布 | 未提及样本的具体来源及样本大小的限制 | 研究人类大脑在妊娠初期的发展过程 | 人类大脑在妊娠5到14周时的细胞状态和轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | 妊娠5到14周的人类大脑样本 |
| 2536 | 2024-08-07 |
Kindlin-2 in myoepithelium controls luminal progenitor commitment to alveoli in mouse mammary gland
2023-10-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06184-2
PMID:37833248
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研究论文 | 本文研究了Kindlin-2在乳腺肌上皮细胞中调控腔内祖细胞向肺泡细胞分化的分子机制 | 发现了Kindlin-2-Stat3-Dll1信号级联在肌上皮细胞中通过抑制Notch信号来驱动腔内祖细胞向肺泡细胞分化的作用 | NA | 探究肌上皮细胞在乳腺发育过程中调控腺泡分化的分子机制 | Kindlin-2在肌上皮细胞中的作用及其对腔内祖细胞分化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了五种基因修饰的小鼠品系 |
| 2537 | 2024-08-07 |
Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
2023-10-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06204-1
PMID:37833290
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在人结直肠癌球状模型中区分增殖和静止癌细胞群体，并识别出ATF3作为静止癌细胞的新标志物 | 首次识别ATF3作为静止结直肠癌细胞的新标志物，并探讨了其与DDIT4和TRIB3在转录水平的相互作用 | NA | 开发新的靶向治疗策略以消除肿瘤细胞并延缓肿瘤复发 | 结直肠癌细胞中的增殖和静止细胞群体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2538 | 2024-08-05 |
The early life immune dynamics and cellular drivers at single-cell resolution in lamb forestomachs and abomasum
2023-Oct-12, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-023-00933-1
PMID:37821933
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研究论文 | 本研究探讨了羔羊四室胃在早期免疫发育中的细胞动态和基因表达模式 | 首次在单细胞分辨率下揭示了羔羊四室胃的免疫动态及相关细胞驱动因子 | 研究主要集中在特定的时间点，可能未能全面捕捉免疫发育的复杂动态 | 分析羔羊四室胃早期的免疫发育和细胞驱动机制 | 羔羊的四室胃在不同年龄段的免疫发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄（5, 10, 15, 25天）羔羊的四室胃样本 |
| 2539 | 2024-08-07 |
Characterization of immune microenvironment in patients with HPV-positive and negative head and neck cancer
2023-10-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02611-3
PMID:37828063
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，研究了HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的免疫微环境特征 | 首次详细描述了HPV阳性和阴性HNSCC患者的免疫微环境差异，并揭示了B细胞表面标记物FCER2与改善生存率的关联 | NA | 探究HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌患者的免疫微环境特征及其与临床结果的关系 | HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌患者的免疫微环境 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA序列 | 1403个上调基因和1877个下调基因 |
| 2540 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing technology applied to epigenetics for the study of tumor heterogeneity
2023-10-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-023-01574-x
PMID:37821906
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在表观遗传学领域的应用，揭示了肿瘤异质性的表观遗传机制 | 介绍了单细胞测序在理解肿瘤微环境中细胞的表观遗传层次的最新进展 | 研究对当前技术工具和方法的局限性进行了概述 | 探讨表观遗传机制如何影响肿瘤的异质性 | 主要关注肿瘤微环境中的单细胞及其表观遗传特征 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | NA |