单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2501 - 2520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2501 | 2024-08-07 |
Combining Bulk RNA-seq and scRNA-seq data to identify RNA m5C methyltransferases NSUN1: a rising star as a biomarker for cancer diagnosis, prognosis and therapy
2023-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-66
PMID:37859740
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研究论文 | 本研究结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，全面分析了NSUN1在癌症中的表达及其作为癌症诊断、预后和治疗标志物的潜力 | 首次在多种癌症中全面分析NSUN1的基因表达、生存状态、遗传改变、甲基化和磷酸化以及浸润性免疫细胞的关系 | 研究主要基于在线资源和公共数据库，缺乏实验验证 | 探讨NSUN1作为癌症诊断、预后和治疗标志物的有效性 | NSUN1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌，结肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，Bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多种人类癌症样本 |
| 2502 | 2024-08-07 |
Characterization of the tumor microenvironment by single-cell RNA sequencing in non-small cell lung cancer treated with neo-adjuvant immunotherapy
2023-Sep-28, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-413
PMID:37854164
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2503 | 2024-08-05 |
NG-SEM: an effective non-Gaussian structural equation modeling framework for gene regulatory network inference from single-cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad369
PMID:37864293
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研究论文 | 提出了一种新的非高斯结构方程模型框架NG-SEM，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络。 | 引入了一种灵活的噪声建模策略，以高斯混合模型近似生物系统的复杂随机特性，改进了传统结构方程模型。 | 未提及具体限制因素 | 提高单细胞RNA-seq数据中基因调控网络推断方法的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络。 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 非高斯结构方程模型 | 生物数据集 | 合成数据和真实生物数据集的多种控制实验 |
| 2504 | 2024-08-05 |
Screening single-cell trajectories via continuity assessments for cell transition potential
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad356
PMID:37864296
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研究论文 | 本文提出了一种评估细胞转变潜力的连续性的方法，用于单细胞轨迹分析 | 创新地生成了一种简单的评分算法来评估轨迹的连续性 | 当前缺乏评估指标，使得确定轨迹何时偏离连续性变得困难 | 研究单细胞轨迹的连续性评估，以提高推断准确性 | 对肠道干细胞发育和CD8+ T细胞分化的真实案例进行了研究 | 数字病理学 | 牛皮癣关节炎和急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 在模拟和真实的单细胞数据中分析了断裂情况 |
| 2505 | 2024-08-07 |
[Identification of Peripheral Blood GZMK + CD8 + T Cells As Biomarkers of Alzheimer's Disease Based on Single-Cell Transcriptome]
2023-Sep, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20230960107
PMID:37866940
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，探索阿尔茨海默病（AD）患者外周血中的免疫特征，并识别GZMK+ CD8+ T细胞作为潜在的生物标志物 | 首次发现AD患者外周血中GZMK+ CD8+ T细胞含量增加，并与其异常信号传导及RESISTIN信号通路的增强相关 | 研究仅基于单一数据集GSE168522，可能存在样本偏倚；未涉及临床验证 | 识别阿尔茨海默病的潜在血液生物标志物 | 阿尔茨海默病患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE168522数据集 |
| 2506 | 2024-08-05 |
Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2268257
PMID:37849962
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研究论文 | 本研究探讨了二肽基肽酶4抑制对放疗中T细胞浸润的促进作用 | 发现DPP4抑制可以增强放疗的抗肿瘤效果，通过促进化学趋化因子表达及T细胞浸润来实现 | 未明确提到样本数量及研究局限性 | 研究如何通过DPP4抑制增强放疗的疗效和T细胞的浸润 | 肺腺癌和黑色素瘤患者接受放疗后的T细胞浸润情况 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 2507 | 2024-08-05 |
Expression of CKS2 in Hepatocellular Carcinoma: Correlation with Survival Outcomes and Immune Microenvironment
2023, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S427624
PMID:37841370
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研究论文 | 本研究探讨了CKS2在肝细胞癌中的表达及其与生存结果和免疫微环境的关系 | 通过多组学分析揭示了CKS2在肝细胞癌进展中的作用，并提出其作为免疫治疗靶点的潜力 | 本研究主要依赖数据库分析，可能缺乏样本的多样性和临床验证 | 明确CKS2在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌患者的CKS2表达及其与免疫细胞浸润等相关性的研究 | 数字病理 | 肝癌 | qRT-PCR和Western blot | NA | 转录数据 | 使用多种数据库进行分析，具体样本数量未说明 |
| 2508 | 2024-08-05 |
Beneficial effects of ginkgetin on improving nonalcoholic steatohepatitis characterized by bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1267445
PMID:37860111
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研究论文 | 本研究评估了金固素对非酒精性脂肪性肝炎的影响及其相关机制 | 首次通过大规模和单细胞RNA测序分析揭示了金固素对NASH的影响和相关信号通路 | 该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的NASH情况 | 探究金固素对非酒精性脂肪性肝炎的改善作用及其机制 | 使用高脂饮食构建的NASH小鼠模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 构建高脂饮食小鼠模型，样本数量未具体描述 |
| 2509 | 2024-08-05 |
Transcriptional signature of islet neogenesis-associated protein peptide-treated rat pancreatic islets reveals induction of novel long non-coding RNAs
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1226615
PMID:37842306
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研究论文 | 研究揭示了INGAP-PP对大鼠胰岛施加的全球转录效应，特别是生成新的长非编码RNA | 首次识别了由INGAP-PP诱导的9种新的长非编码RNA，这些RNA在成熟的β细胞中富集 | 研究主要基于大鼠模型，可能无法完全适用于人类 | 探讨INGAP-PP在大鼠胰岛中的转录机制，以理解其对β细胞功能的影响 | 成年大鼠胰岛，通过RNA-seq分析INGAP-PP处理的样本 | 数字病理学 | 糖尿病 | RNA-seq | NA | RNA | 大鼠胰岛样本的三重处理和对照组 |
| 2510 | 2024-08-07 |
Integration of scRNA-Seq and bulk RNA-Seq uncover perturbed immune cell types and pathways of Kawasaki disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259353
PMID:37841239
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（bulk RNA-Seq）数据，揭示了川崎病（KD）中免疫细胞类型和信号通路的扰动 | 本研究首次整合scRNA-Seq和bulk RNA-Seq数据，全面展示了KD中分子和细胞的改变，并指出了潜在的治疗靶点 | 需要进一步的验证和功能研究来阐明所识别的免疫细胞类型和通路在KD发病机制中的作用，并开发针对性的干预措施 | 旨在全面理解川崎病中的免疫失调 | 川崎病患者的免疫细胞类型和信号通路 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（bulk RNA-Seq） | NA | RNA序列数据 | 82名川崎病患者 |
| 2511 | 2024-08-07 |
Deciphering Treg cell roles in esophageal squamous cell carcinoma: a comprehensive prognostic and immunotherapeutic analysis
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1277530
PMID:37842637
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了调节性T细胞（Treg细胞）在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的作用，并构建了一个与Treg细胞相关的特征（TAS），用于预测患者预后和免疫治疗反应。 | 本研究首次构建了一个与Treg细胞相关的特征（TAS），并通过多维评估验证了其预测食管鳞状细胞癌患者预后和免疫治疗反应的准确性和适用性。 | NA | 揭示Treg细胞在食管鳞状细胞癌中的作用，开发有效的预后模型和免疫治疗策略。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的Treg细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA | 临床样本包括十对肿瘤和邻近组织 |
| 2512 | 2024-08-07 |
[The Advance of the HSCT Evaluation at Single-Cell Scale --Review]
2023 Auguest, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
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综述 | 本文综述了单细胞尺度下造血干细胞移植（HSCT）评估的最新进展 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术评估HSCT后的造血动力学 | NA | 探讨单细胞尺度下HSCT评估的进展及其在改善HSCT方案和临床结果中的应用 | 造血干细胞移植的细胞组成及移植后造血干细胞的归巢、植入和分化等重要事件 | NA | 恶性血液病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 2513 | 2024-08-07 |
On the use of QDE-SVM for gene feature selection and cell type classification from scRNA-seq data
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0292961
PMID:37856458
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研究论文 | 本文研究了使用量子启发式差分进化（QDE）结合支持向量机（SVM）进行基因特征选择和细胞类型分类的方法 | 本文首次将基于分类的包装方法应用于scRNA-seq数据中的基因特征选择，特别是引入了QDE-SVM方法，显示出优于其他包装方法的细胞类型分类性能 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | scRNA-seq数据中的基因特征选择和细胞类型分类 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 支持向量机（SVM） | 基因表达数据 | 十二个已知的scRNA-seq转录组数据集 |
| 2514 | 2024-08-07 |
Coordination of Single-cell and Bulk RNA Sequencing to Construct a Cuproptosis-related Gene Prognostic Index for Endometrial Cancer Prognosis, Immune Microenvironment Infiltration, and Immunotherapy Treatment Options
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.86325
PMID:37859813
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研究论文 | 本研究旨在识别子宫内膜癌的分子亚型，并开发与铜死亡相关的基因预后指数（CRGPI），同时描述免疫特征及免疫检查点抑制剂（ICI）疗法在CRGPI定义的子宫内膜癌亚组中的疗效 | 本研究首次构建了基于铜死亡相关基因的预后指数（CRGPI），并验证了其在预测子宫内膜癌免疫治疗效果中的应用 | NA | 识别子宫内膜癌的分子亚型，开发铜死亡相关基因预后指数，并评估其在免疫治疗中的应用 | 子宫内膜癌及其免疫微环境 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | RNA测序 | Cox回归方法 | RNA测序数据 | TCGA数据集（n=492），IMvigor210数据集（n=348），GSE78220数据集 |
| 2515 | 2024-08-07 |
Formin protein FMNL1 is a biomarker for tumor-infiltrating immune cells and associated with well immunotherapeutic response
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.86965
PMID:37859818
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研究论文 | 本研究通过分析公共数据、单细胞RNA测序和多重定量免疫荧光技术，验证了Formin蛋白FMNL1作为肿瘤浸润免疫细胞的生物标志物，并与良好的免疫治疗反应相关 | 首次深入验证了FMNL1在肿瘤微环境中的免疫相关性和细胞亚群表达模式，并证实其作为免疫治疗反应的预测标志物 | 需要进一步的研究来验证FMNL1在更多癌症类型中的作用，并探索其在肿瘤微环境中更深层次的功能 | 验证FMNL1作为肿瘤浸润免疫细胞的生物标志物，并探索其在免疫治疗反应中的作用 | Formin蛋白FMNL1在肿瘤微环境中的表达模式及其与免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重定量免疫荧光 | NA | mRNA | 涉及多种癌症类型 |
| 2516 | 2024-08-07 |
Effect of methanol fixation on single-cell RNA sequencing of the murine dentate gyrus
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1223798
PMID:37860083
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研究论文 | 本研究评估了甲醇固定对小鼠齿状回单细胞悬液及其后续单细胞RNA测序分析的影响 | 首次深入评估甲醇固定对成年原代分离脑组织的影响，并展示了其在单细胞RNA测序中的适用性 | NA | 评估甲醇固定作为样本保存方法对单细胞RNA测序的影响 | 小鼠齿状回的单细胞悬液及其后续单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CEL-seq2协议的机器人辅助版本（SORT-seq） | RNA | 数千个细胞 |
| 2517 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Angiotensinogen and Galanin as Unique Molecular Markers of Acinar Cells in Murine Salivary Glands
2023-Dec, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0125
PMID:37823745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别了小鼠唾液腺中腺泡细胞的独特分子标记物。 | 揭示了唾液腺腺泡细胞多样性的特定标记物，以往研究未能发现。 | 本研究主要集中在四周龄小鼠，结果可能不适用于其他年龄段。 | 识别小鼠唾液腺腺泡细胞的分子标记物。 | 小鼠的下颌腺和舌下腺中的腺泡细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 4周龄小鼠 |
| 2518 | 2024-08-05 |
STAMarker: determining spatial domain-specific variable genes with saliency maps in deep learning
2023-11-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad801
PMID:37811885
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研究论文 | STAMarker是一个用于确定空间领域特异性可变基因的分析工具 | 提出了一种三阶段集成框架，通过关注图自编码器、全连接分类器和反向传播梯度计算显著性图来识别空间可变基因 | 现有方法仅关注单个基因，没有建模基因之间的相互依赖性 | 通过空间转录组学分析空间可变基因以了解细胞系统 | 不同平台生成的各种空间转录组数据中的空间领域特异性可变基因 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 图注意力自编码器，MLP分类器 | 空间转录组数据 | 多种平台生成的多个空间转录组数据 |
| 2519 | 2024-08-05 |
Phenotype predictions of two-person mixture using single cell analysis
2023-11, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102938
PMID:37832204
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研究论文 | 本研究探讨了利用单细胞分析进行两人DNA混合物的表型预测 | 提出了使用单细胞测序作为可靠的表型预测工具，特别是在DNA混合物中 | 在日常工作中的实施仍然面临障碍，尚需进一步方法开发 | 开发一种可靠的技术，以从DNA混合物中进行表型预测 | 分析两种不同外貌的贡献者在DNA混合物中的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 两个模拟混合物，包含各两名贡献者 |
| 2520 | 2024-08-07 |
Early Progression of Abdominal Aortic Aneurysm is Decelerated by Improved Endothelial Barrier Function via ALDH2-LIN28B-ELK3 Signaling
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302231
PMID:37822152
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研究论文 | 本研究探讨了腹主动脉瘤（AAA）中内皮屏障功能及其上游调控因子的作用，发现ALDH2通过LIN28B-ELK3信号通路改善内皮屏障功能，从而减缓AAA的早期进展 | 首次揭示了ALDH2通过LIN28B-ELK3信号通路调控内皮屏障功能，对早期AAA的进展有抑制作用 | NA | 研究腹主动脉瘤中内皮屏障功能及其上游调控因子的作用 | 腹主动脉瘤（AAA）的内皮细胞及其相关基因和信号通路 | 心血管疾病 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类主动脉夹层组织样本及AAA样本 |