单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5356 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-01-30 |
Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids
2023-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac034
PMID:39872117
|
研究论文 | 本文通过构建胆固醇暴露模型，利用人类多能干细胞衍生的脑类器官，揭示了母体高胆固醇暴露可能导致后代神经发育障碍的机制 | 首次使用人类多能干细胞衍生的脑类器官构建胆固醇暴露模型，揭示了高胆固醇对神经祖细胞增殖的抑制作用及其与自闭症谱系障碍（ASD）的潜在关联 | 研究主要基于体外模型，未涉及动物或人体实验，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨母体高胆固醇暴露对后代神经发育的影响及其机制 | 人类多能干细胞衍生的脑类器官 | 神经发育生物学 | 自闭症谱系障碍（ASD） | 单细胞测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | NA |
| 222 | 2025-01-30 |
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad006
PMID:39872951
|
研究论文 | 本文通过两步诱导协议从人类孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，以研究基因组印记在胚胎发育中的作用 | 首次从孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，为研究基因组印记提供了新模型 | 由于发育缺陷和伦理限制，对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 | 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及父母起源偏差对人类发育和病理机制的影响 | 孤雌生殖干细胞（hPg-ESCs）及其衍生的扩展多能干细胞（hPg-EPSCs） | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
The role of T cells and shared genes in psoriasis and inflammatory bowel disease based on single-cell RNA and comprehensive analysis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152754
PMID:37806279
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和综合分析，探讨了银屑病和炎症性肠病中T细胞和共享基因的作用 | 本文通过单细胞RNA分析和免疫浸润分析，发现了在疾病中显著升高的CD4 T和γδ T细胞，并确定了具有优异诊断特性的共享基因 | NA | 研究银屑病和炎症性肠病中T细胞和共享基因的作用及其在疾病机制中的重要性 | 银屑病和炎症性肠病中的T细胞和共享基因 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 224 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptional gene signature analysis identifies IL-17 signaling pathway as the key pathway in sepsis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152763
PMID:38039751
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组基因特征分析，识别出IL-17信号通路在脓毒症中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了IL-17信号通路在脓毒症中的重要作用，并验证了该通路相关基因在脓毒症患者中的上调表达 | 研究仅基于公开数据库的数据，未进行实验验证 | 旨在识别与脓毒症临床严重程度和预后相关的关键通路，为脓毒症的诊断和治疗提供潜在的生物标志物和治疗靶点 | 健康对照人群和脓毒症患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序 | t-SNE和UMAP降维分析 | 转录组数据 | 使用了来自脓毒症数据库GSE167363、GSE100159和GSE133822的血液样本数据 |
| 225 | 2025-01-25 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2023-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.25.573304
PMID:38234839
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，发现晚期复制区域与核层相关联，并倾向于发生染色体断裂 | 首次揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，并发现晚期复制区域与染色体断裂的关联 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎，未涉及其他哺乳动物或人类胚胎 | 研究哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式及其对基因组稳定性的影响 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 牛和小鼠的早期胚胎样本 |
| 226 | 2025-01-25 |
Mural cell-derived chemokines provide a protective niche to safeguard vascular macrophages and limit chronic inflammation
2023-10-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.08.002
PMID:37652021
|
研究论文 | 本文研究了血管巨噬细胞维持机制，揭示了壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF保护巨噬细胞存活及其稳态功能，从而限制慢性炎症 | 发现了壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF维持血管巨噬细胞的稳态功能，并揭示了这一机制在动脉粥样硬化中的保护作用 | 研究主要关注动脉粥样硬化，未涉及其他慢性炎症疾病 | 研究血管巨噬细胞的维持机制及其在慢性炎症中的作用 | 血管巨噬细胞和壁细胞（周细胞和平滑肌细胞） | 生物医学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组学、共培养实验、基因敲除实验 | NA | 图像、基因表达数据 | NA |
| 227 | 2025-01-25 |
Endothelial CCRL2 induced by disturbed flow promotes atherosclerosis via chemerin-dependent β2 integrin activation in monocytes
2023-08-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad085
PMID:37279540
|
研究论文 | 本文研究了内皮CCRL2在动脉粥样硬化中的作用及其通过chemerin依赖的β2整合素激活机制 | 揭示了CCRL2-chemerin-β2整合素轴在动脉粥样硬化中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证 | 探讨CCRL2及其配体chemerin在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | 内皮细胞、单核细胞、ApoE-/-小鼠 | 生物医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq、Di-E-GSSG测定、邻近连接测定 | 小鼠模型 | 基因表达数据、血清数据 | ApoE-/-小鼠、急性动脉粥样硬化性卒中患者和健康个体的血清样本 |
| 228 | 2024-08-07 |
RNA visualization and single-cell transcriptomics: methods and applications
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2286761
PMID:38047544
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2025-01-25 |
Single-Cell RNA sequencing investigation of female-male differences under PAD conditions
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1251141
PMID:37745110
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了在PAD条件下男女之间的差异，特别是内皮细胞在受到不同机械刺激下的基因表达变化 | 首次结合d-flow和硬度两个因素，研究其对内皮细胞表型的影响，并探讨了性别在这些过程中的作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探索性别对PAD相关促动脉粥样硬化通路的影响 | 内皮细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 230 | 2025-01-24 |
Using single-cell RNA sequencing to generate predictive cell-type-specific split-GAL4 reagents throughout development
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2307451120
PMID:37523539
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序（scRNAseq）数据集生成预测性细胞类型特异性split-GAL4试剂的高效管道（scMarco），用于发育过程中的细胞类型特异性标记 | 利用现有的发育单细胞RNA测序数据集选择split-GAL4的基因对，提供了一种高效且预测性的管道（scMarco），基于原生基因调控元件在发育的任何时间生成细胞类型特异性的split-GAL4系 | 需要大量时间和资源筛选增强子表达模式的组合 | 生成细胞类型特异性工具，用于发育过程中不同细胞类型的靶向操作 | 发育中的视觉系统 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 231 | 2025-01-24 |
Therapy-associated remodeling of pancreatic cancer revealed by single-cell spatial transcriptomics and optimal transport analysis
2023-Jun-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.28.546848
PMID:37425692
|
研究论文 | 本文利用高复杂度单细胞空间转录组学和解剖学方法，研究了人类胰腺癌中多细胞邻域和细胞间相互作用的重塑，特别是与特定恶性亚型和新辅助化疗/放疗相关的重塑 | 开发了SCOTIA（空间约束最优运输交互分析），这是一种包含空间距离和配体-受体基因表达成本函数的最优运输模型，用于揭示治疗响应中的配体-受体相互作用变化 | 研究结果需要进一步验证，特别是在其他类型的癌症和疾病中的应用 | 研究胰腺癌肿瘤微环境中细胞间相互作用的重塑及其对治疗响应的影响 | 人类胰腺癌中的多细胞邻域和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高复杂度单细胞空间转录组学 | 最优运输模型（SCOTIA） | 单细胞空间转录组数据 | NA |
| 232 | 2025-01-23 |
Molecular and spatial landmarks of early mouse skin development
2023-10-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.015
PMID:37591247
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、空间细胞类型分配和细胞谱系追踪技术，解构了早期胚胎小鼠皮肤的关键发育过程 | 揭示了早期皮肤发育中的细胞多样性和组织架构，发现了毛囊诱导、肌肉支持和筋膜形成的成纤维细胞的时空出现，以及PCM肌肉的形成、无周细胞覆盖的血管萌芽和皮肤中最早的肥大细胞和树突状免疫细胞的定居 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类皮肤发育 | 探索早期皮肤发育过程中的细胞类型多样性和组织架构的形成 | 早期胚胎小鼠皮肤 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学、空间细胞类型分配、细胞谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 早期胚胎小鼠皮肤样本 |
| 233 | 2025-01-23 |
Epigenetic Induction of Smooth Muscle Cell Phenotypic Alterations in Aortic Aneurysms and Dissections
2023-09-19, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了主动脉瘤和夹层（AAD）中平滑肌细胞（SMC）表型转换的转录组和表观遗传动态 | 揭示了SMC从收缩表型向增殖、细胞外基质产生和炎症表型转变的表观遗传机制，并识别了IRF3在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩展 | 探讨主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转换的机制 | 小鼠和人类主动脉瘤和夹层组织中的平滑肌细胞 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、单细胞染色质可及性测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据 | 小鼠模型和人类主动脉瘤和夹层组织样本 |
| 234 | 2025-01-23 |
Machine Learning Reveals Synovial Fibroblast Genes Associated with Pain Affect Sensory Nerve Growth in Rheumatoid Arthritis
2023-Aug-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.08.17.23294232
PMID:37662384
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研究论文 | 本文通过机器学习方法揭示了与类风湿性关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因，这些基因影响感觉神经的生长 | 使用了一种新的机器学习方法——基于图的基因表达模块识别（GbGMI），来识别与疼痛相关的基因模块，并验证了这些基因在早期未治疗的类风湿性关节炎患者中的表达 | 研究样本主要来自长期类风湿性关节炎患者和早期未治疗患者，可能不适用于其他类型的关节炎或疾病阶段 | 研究类风湿性关节炎疼痛的分子机制，特别是滑膜成纤维细胞基因与感觉神经生长的关系 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织和感觉神经元 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | GbGMI | 基因表达数据 | 长期类风湿性关节炎患者和早期未治疗患者的滑膜活检样本 |
| 235 | 2025-01-23 |
Single-cell transcriptomics and epigenomics unravel the role of monocytes in neuroblastoma bone marrow metastasis
2023-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39210-0
PMID:37365178
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组和表观基因组分析，揭示了单核细胞在神经母细胞瘤骨髓转移中的作用 | 首次在神经母细胞瘤骨髓转移的背景下，结合单细胞转录组和表观基因组分析，揭示了单核细胞的角色及其与肿瘤微环境的相互作用 | 样本量较小，仅包括11名患者和5名年龄匹配的无转移对照 | 研究神经母细胞瘤骨髓转移的分子机制，特别是单核细胞在其中的作用 | 神经母细胞瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组分析、表观基因组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、表观基因组数据 | 11名神经母细胞瘤患者和5名年龄匹配的无转移对照的骨髓样本 |
| 236 | 2025-01-22 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1
PMID:38077031
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研究论文 | 本文研究了COVID-19后急性后遗症（PASC）的长期生理后果，特别是呼吸系统PASC的病理生理机制 | 通过空间转录组学和成像技术，发现了免疫细胞与上皮祖细胞之间的失调近端相互作用，这在呼吸系统PASC中独特存在，而在急性COVID-19或特发性肺纤维化（IPF）中不存在 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨COVID-19后急性后遗症（PASC）的病理生理机制，特别是呼吸系统PASC的驱动因素 | PASC患者的肺功能异常和/或病毒感染介导的肺纤维化 | 病理生理学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学、成像技术 | 小鼠模型 | 转录组数据、图像数据 | 三个独立的PASC患者临床队列 |
| 237 | 2025-01-19 |
Expansion spatial transcriptomics
2023-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01911-1
PMID:37349575
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研究论文 | 本文介绍了一种扩展空间转录组学方法，通过组织清除和扩展来提高空间分辨率，并在小鼠脑样本中展示了其效果 | 通过组织清除和扩展技术克服了传统捕获阵列空间分辨率受限的问题，实现了更高的空间分辨率 | 目前仅在小鼠脑样本中进行了验证，尚未在其他组织或物种中广泛应用 | 提高空间转录组学的空间分辨率，以更精确地解析组织中的基因表达 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 扩展空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠脑样本 |
| 238 | 2025-01-19 |
Generation and Functional Analysis of Defective Viral Genomes during SARS-CoV-2 Infection
2023-06-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00250-23
PMID:37074178
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2感染过程中缺陷病毒基因组（DVGs）的生成及其与宿主抗病毒免疫反应的关系 | 首次揭示了SARS-CoV-2 DVGs在自然感染中的干扰素刺激活性，并确定了DVG重组的新热点 | 需要进一步研究DVG生成的机制及其如何调节宿主反应和感染结果 | 探讨SARS-CoV-2感染过程中DVGs的生成和功能 | COVID-19患者的感染和尸检肺组织 | 病毒学 | COVID-19 | RNA-seq, NGS | NA | RNA-seq数据 | COVID-19患者的感染和尸检肺组织样本 |
| 239 | 2025-01-19 |
scRNA-Seq and imaging mass cytometry analyses unveil iNKT cells-mediated anti-tumor immunity in pancreatic cancer liver metastasis
2023-05-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216149
PMID:36990268
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和成像质谱流式细胞术分析，揭示了iNKT细胞在胰腺癌肝转移中的抗肿瘤免疫作用 | 首次全面探索了iNKT细胞在胰腺癌肝转移中的作用，并揭示了α-半乳糖神经酰胺（αGC）激活iNKT细胞后对肿瘤微环境中免疫细胞的全局变化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索iNKT细胞在胰腺癌肝转移中的抗肿瘤免疫作用 | 胰腺癌肝转移小鼠模型中的iNKT细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），成像质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，成像质谱流式细胞术数据 | 超过30,000个免疫细胞 |
| 240 | 2025-01-19 |
Preparation of noninfectious scRNAseq samples from SARS-CoV-2-infected epithelial cells
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281898
PMID:36827401
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研究论文 | 本文描述了一种从SARS-CoV-2感染的上皮细胞中制备非传染性单细胞RNA测序（scRNAseq）样本的方法 | 提出了一种在BSL2设施中安全进行scRNAseq分析的方法，使更多研究人员能够进行SARS-CoV-2细胞的分子分析 | 需要进一步验证该方法在其他类型细胞和病毒中的适用性 | 开发一种安全的方法，用于在较低生物安全级别的实验室中研究SARS-CoV-2感染的细胞 | SARS-CoV-2感染的非洲绿猴肾上皮细胞（Vero-E6）和分化在气液界面上的人肺上皮细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA数据 | 非洲绿猴肾上皮细胞和人肺上皮细胞 |