单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2341 - 2360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2341 | 2024-08-05 |
Transcriptional profiles reveal histologic origin and prognosis across 33 The Cancer Genome Atlas tumor types
2023-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-234
PMID:37969389
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研究论文 | 研究揭示了通过转录组特征可以区分不同组织来源的肿瘤及其预后 | 通过使用肿瘤组织特异性基因集(TTSGs)，为肿瘤的组织起源和细胞干性提供了一种新的评估方法 | 研究的样本主要来源于TCGA，可能无法全面反映所有肿瘤类型的特性 | 旨在识别可以用于评估肿瘤组织起源和细胞干性的分子特征 | 从33种肿瘤类型中选取了9,875名患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | NA | RNA表达数据分析 | t-SNE和kNN算法 | 基因表达数据 | 9,875名患者的33种肿瘤类型数据 |
| 2342 | 2024-08-07 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
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研究论文 | 评估造血干细胞移植（HSCT）受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的体液和适应性免疫反应 | 揭示了移植受者在记忆T细胞群体中存在缺陷，这些缺陷与T细胞反应缺失相关 | 样本量相对较小，且仅包括HSCT受者和少数健康对照 | 研究SARS-CoV-2 mRNA疫苗在造血干细胞移植受者中的疗效 | 造血干细胞移植受者和健康对照对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，TCR和BCR测序 | NA | 血液样本 | 42名造血干细胞移植受者和5名健康对照 |
| 2343 | 2024-08-07 |
Exploring the Shared Gene Signatures and Molecular Mechanisms between Bladder Urothelial Carcinoma and Metabolic Syndrome
2023-Oct, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
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研究论文 | 本研究旨在探讨膀胱尿路上皮癌（BLCA）与代谢综合征（MS）之间的共同基因特征及潜在分子机制 | 通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和逻辑最小绝对收缩与选择算子（LASSO）回归模型，筛选并验证了五个关键基因，并分析了它们在BLCA和MS中的表达及与临床病理特征和预后的关系 | NA | 探索膀胱尿路上皮癌与代谢综合征之间的共同基因特征及潜在分子机制 | 膀胱尿路上皮癌和代谢综合征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 逻辑最小绝对收缩与选择算子（LASSO）回归模型 | 转录组数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的BLCA和MS的转录组数据，以及TCGA-BLCA队列的数据 |
| 2344 | 2024-08-07 |
Comprehensive Transcriptomic Analysis for Thymic Epithelial Cells of Aged Mice and Humans
2023-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2023.23.e36
PMID:37970235
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研究论文 | 本文通过全面的转录组分析，研究了老年小鼠和人类胸腺上皮细胞的生物学特性 | 首次在跨物种层面上验证了老年胸腺上皮细胞中的变化，并揭示了新的潜在机制 | NA | 探讨老年胸腺上皮细胞功能障碍的精确机制及其在人类和小鼠中的共性 | 老年小鼠和人类的胸腺上皮细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 年轻和老年小鼠的胸腺上皮细胞，以及公开的人类胸腺上皮细胞单细胞RNA测序数据 |
| 2345 | 2024-08-05 |
[Identification of SULF1 as a Shared Gene in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
and Lung Adenocarcinoma]
2023-Sep-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
研究论文 | 本研究鉴定了在特发性肺纤维化和肺腺癌中共享的基因SULF1 | 文章创新性在于识别SULF1作为具有潜在免疫相关生物标志物和治疗靶点的共享基因 | 本研究可能在样本量和多样性方面存在局限性，具体的临床应用仍需进一步验证 | 探索IPF与肺腺癌之间的共享致病基因和分子通路 | 研究对象为特发性肺纤维化（IPF）和肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学分析 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 共识别出529个共享基因 |
| 2346 | 2024-08-07 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Merkel细胞癌患者的免疫治疗耐受性进行了纵向多组学分析，识别了T细胞、B细胞和单核细胞的反应特征。 | 首次通过纵向多组学研究揭示了Merkel细胞癌患者免疫治疗耐受性的细胞特征和动态变化。 | 研究样本量较小，仅包括四个时间点的外周血样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究Merkel细胞癌患者免疫逃逸的机制及促进免疫逃避的恶性细胞条件。 | Merkel细胞癌患者的免疫细胞反应和耐药性机制。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个时间点的外周血样本 |
| 2347 | 2024-08-07 |
Corrigendum to :Comparative analysis of peripheral blood immunoinflammatory landscapes in patients with acute cholangitis and its secondary septic shock using single-cell RNA sequencing
2023-Dec-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149178
PMID:37945389
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2348 | 2024-08-07 |
Identification of the role of MCM6 in bladder cancer prognosis, immunotherapy response, and in vitro experimental investigation using multi-omics analysis
2023-Dec-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122253
PMID:37951536
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了MCM6在膀胱癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响，并通过体外实验验证了MCM6的功能。 | 首次详细探讨了MCM6在膀胱癌中的具体作用，并通过多组学分析和体外实验验证了其对膀胱癌预后和免疫治疗反应的影响。 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验，可能需要进一步的临床试验来验证MCM6作为膀胱癌预后和免疫治疗标志物的有效性。 | 探索MCM6在膀胱癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响。 | MCM6在膀胱癌中的作用及其对患者预后和免疫治疗反应的影响。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中明确提及。 |
| 2349 | 2024-08-05 |
Optomicrofluidic detection of cancer cells in peripheral blood via metabolic glycoengineering
2023-12-05, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00678f
PMID:37955355
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研究论文 | 本文报道了一种基于代谢糖工程的癌细胞监测新方法 | 此技术通过代谢标记手段显著提高了癌细胞的标记效率和荧光信号强度 | 研究中未提及与其他细胞类型标记的对比结果与可能的干扰因素 | 探索一种新的技术用于周边血液中癌细胞的检测 | 研究对象为在外周血单核细胞中通过代谢标记的多种癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 代谢糖工程 | NA | 荧光信号数据 | 涉及三种不同的癌细胞系 |
| 2350 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals novel immune-associated biomarkers for predicting prognosis in AML patients with RUNX1::RUNX1T1
2023-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111178
PMID:37951201
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研究论文 | 本研究揭示了AHCY可能作为预测具有RUNX1::RUNX1T1的急性髓性白血病患者预后和T细胞增殖活化效率的新指标 | 通过单细胞转录组数据发现AHCY与急性髓性白血病患者的预后相关，提出其作为新生物标志物的潜力 | 未在研究中详细讨论AHCY的机制及其在临床应用中的具体验证 | 揭示有关急性髓性白血病患者T细胞增殖和激活相关基因的表达情况 | 以RUNX1::RUNX1T1的急性髓性白血病患者为研究对象 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 来自三个研究的数据，包含TCGA LAML (n = 145) 和 GEO 数据集 (n = 104) |
| 2351 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics and neurofilament light chain reveal changes in lesion patterns in murine autoimmune neuroinflammation
2023-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02947-y
PMID:37957728
|
研究论文 | 这项研究探讨了小鼠自身免疫性神经炎中的损伤模式变化。 | 本文揭示了急性复发和慢性阶段中神经轴突损伤的时空分布及其病理机制。 | 研究主要基于小鼠模型，可能会限制对人类疾病的直接应用。 | 研究神经轴突损伤在多发性硬化不同阶段的变化及机制。 | 实验性自免疫性脑脊髓炎（EAE）模型的神经轴突损伤。 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 免疫组化、单分子阵列、空间转录组学、微胶质细胞/轴突共同培养 | NA | NA | 使用了EAE模型的神经元和神经胶质细胞样本 |
| 2352 | 2024-08-07 |
Comparative immunological landscape between pre- and early-stage LUAD manifested as ground-glass nodules revealed by scRNA and scTCR integrated analysis
2023-11-13, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-023-01322-x
PMID:37957625
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序的整合分析，揭示了早期肺腺癌（LUAD）表现为磨玻璃结节（GGN）的免疫学特征 | 发现了五个关键模块驱动早期LUAD的恶性进展，并揭示了早期LUAD的肿瘤微环境特征，包括调节性T细胞的积累和CD8+ T细胞的功能丧失 | NA | 探究早期肺腺癌（LUAD）表现为磨玻璃结节（GGN）的恶性进展机制及其免疫学特征 | 正常肺组织、癌前病变和早期LUAD表现为肺磨玻璃结节（GGN）的样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA）和T细胞受体（TCR）测序 | NA | 单细胞数据 | 5个正常肺组织，3个癌前病变和4个早期LUAD表现为肺磨玻璃结节（GGN）的样本 |
| 2353 | 2024-08-05 |
Implications of single-cell immune landscape of tumor microenvironment for the colorectal cancer diagnostics and therapy
2023-Nov-11, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02226-z
PMID:37950801
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综述 | 这篇文章提供了对结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中免疫景观的单细胞研究的综合概述 | 重点探讨了肿瘤相关巨噬细胞等关键免疫因子如何调节CRC的肿瘤微环境 | 没有提及具体的实验数据或样本分析 | 旨在揭示结直肠癌微环境中的免疫细胞相互作用及其对治疗响应的影响 | 主要研究结直肠癌中的免疫细胞以及它们与肿瘤的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 2354 | 2024-08-07 |
Infiltrating myeloid cell-derived properdin markedly promotes microglia-mediated neuroinflammation after ischemic stroke
2023-Nov-11, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02946-z
PMID:37951917
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研究论文 | 本文研究了渗入的髓系细胞来源的properdin在缺血性中风后通过微胶质细胞介导的神经炎症中的作用 | 发现properdin作为渗入的外周髓系细胞与微胶质细胞之间的新媒介，进一步激活微胶质细胞并加剧缺血性脑损伤 | NA | 探讨properdin在调节中风后微胶质细胞介导的神经炎症中的作用 | 髓系细胞来源的properdin及其在缺血性中风中的作用 | 神经科学 | 中风 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，转录组测序 | NA | RNA | 使用全局和条件性（髓系特异性）properdin敲除小鼠进行实验 |
| 2355 | 2024-08-05 |
Mediating oxidative stress through the Palbociclib/miR-141-3p/STAT4 axis in osteoporosis: a bioinformatics and experimental validation study
2023-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-46813-6
PMID:37949959
|
研究论文 | 本研究探索了Palbociclib/miR-141-3p/STAT4轴在骨质疏松症中介导氧化应激的作用 | 首次提出了Palbociclib/miR-141-3p/STAT4轴，并提供了氧化应激在骨质疏松症机制中的新见解 | 该研究的局限性在于仅利用了特定的基因组数据集，缺乏更广泛的人体样本验证 | 研究氧化应激在骨质疏松症中作用的分子机制 | 探讨与氧化应激相关的基因及其与炎症因子的关系 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | RT-qPCR, Elisa, 加权相关网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 人类血液样本 |
| 2356 | 2024-08-07 |
Subtyping of COVID-19 samples based on cell-cell interaction in single cell transcriptomes
2023-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-46350-2
PMID:37949890
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研究论文 | 本研究利用细胞间相互作用评分对单细胞转录组数据进行样本级聚类，以探索COVID-19患者的异质性并发现新的亚型 | 首次采用细胞间相互作用评分进行样本级聚类，揭示了COVID-19患者在同一严重程度级别下的免疫异质性 | NA | 探索COVID-19患者的异质性并发现新的亚型 | COVID-19患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2357 | 2024-08-05 |
CamoTSS: analysis of alternative transcription start sites for cellular phenotypes and regulatory patterns from 5' scRNA-seq data
2023-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42636-1
PMID:37945584
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研究论文 | 本研究介绍了一种计算方法套件CamoTSS，用于准确识别转录起始位点（TSS）并量化其表达 | CamoTSS通过利用cDNA在读取1中的信息，有效检测替代TSS的使用，这是其创新之处 | 该研究未提及具体的局限性 | 研究旨在开发一种有效的方法来分析细胞转录组数据中的转录起始位点 | 研究对象包括来自不同生物过程的人类细胞类型、胸腺的发展以及癌症状态 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含多种实验数据集 |
| 2358 | 2024-08-05 |
Leveraging a disulfidptosis/ferroptosis-based signature to predict the prognosis of lung adenocarcinoma
2023-Nov-09, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03125-z
PMID:37946181
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研究论文 | 本研究利用基于二硫酯死亡和铁死亡的特征预测肺腺癌的预后 | 首次识别出四个与肺腺癌预后相关的最佳二硫酯死亡/铁死亡相关基因 | 尚需更多临床样本以验证模型的普适性 | 探讨二硫酯死亡和铁死亡在肺腺癌发展中的关系并建立预后模型 | 肺腺癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序、单细胞测序、SNP数据分析 | LASSO COX预后模型 | 基因组数据、临床数据 | NA |
| 2359 | 2024-08-05 |
The integrative multi-omics approach identifies the novel competing endogenous RNA (ceRNA) network in colorectal cancer
2023-11-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-46620-z
PMID:37945594
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研究论文 | 本研究识别了结直肠癌中的新竞争性内源RNA（ceRNA）网络 | 揭示了hsa_circ_000240作为ceRNA在结直肠癌中的作用，以及与其相关的关键基因和表观遗传学机制 | 研究未能阐明hsa_circ_000240在结直肠癌中的具体致病机制 | 探讨hsa_circ_000240在结直肠癌中的功能及其相关的基因网络 | 研究对象为结直肠癌患者的肿瘤和正常组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | qRT-PCR, 微阵列, RNA测序, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 包括匹配的结直肠癌肿瘤和相邻正常组织样本 |
| 2360 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell RNA-seq analysis of vascularized cerebral organoids
2023-11-09, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01711-1
PMID:37940920
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研究论文 | 本文探讨了不同血管化策略对人类脑类器官中神经系统和血管的影响 | 整合多种血管化和未血管化类器官及胎儿大脑的单细胞RNA测序数据，揭示了多种血管化策略的相似性和独特性 | 缺乏对不同血管化策略的全面表征和比较可能影响结果的普遍性 | 探索不同血管化策略对人类脑类器官内神经和血管细胞的影响 | 人类脑类器官及其血管化模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个血管化和未血管化类器官及胎儿大脑 |