单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2301 - 2320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2024-08-07 |
Vector-borne Trypanosoma brucei parasites develop in artificial human skin and persist as skin tissue forms
2023-Nov-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43437-2
PMID:37996412
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研究论文 | 研究介绍了先进的人工皮肤模型，并使用采采蝇自然感染该皮肤模型，通过单细胞RNA测序详细描述了寄生虫在皮肤中的发育过程 | 首次展示了Trypanosoma brucei在人工人类皮肤中的发育过程，并发现了寄生虫进入可逆静止状态的新型皮肤组织形式 | NA | 研究Trypanosoma brucei在人工人类皮肤中的发育及其在感染维持中的作用 | Trypanosoma brucei寄生虫及其在人工皮肤中的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2302 | 2024-08-05 |
Single-cell epigenomics and spatiotemporal transcriptomics reveal human cerebellar development
2023-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43568-6
PMID:37993461
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研究论文 | 本文结合单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性状态系统描绘了人类胎儿小脑发育的整合时空景观 | 揭示了转录因子和顺式调控元件（CREs）在祖细胞分化和细胞命运决定中的分层作用，并提供了基因表达调控图 | NA | 阐明人类小脑发育的分子调控网络及其时空特征 | 人类胎儿小脑发育过程中不同区域的颗粒细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 2303 | 2024-08-05 |
Transfer learning for clustering single-cell RNA-seq data crossing-species and batch, case on uterine fibroids
2023-11-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad426
PMID:37991248
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研究论文 | 本文提出了一种新的图基深度嵌入聚类方法，利用跨物种和批次的迁移学习来聚类单细胞RNA-seq数据 | 创新地提出了GDEC方法，通过图卷积网络及DEC，改善了稀疏基因表达矩阵带来的挑战，并在多种细胞群体中发现了新的细胞类型 | NA | 旨在通过迁移学习提高单细胞RNA-seq数据的聚类效果 | 单细胞RNA-seq数据，特别是子宫肌瘤数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图卷积网络 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 2304 | 2024-08-05 |
A rapid and sensitive, multiplex, whole mount RNA fluorescence in situ hybridization and immunohistochemistry protocol
2023-Nov-22, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01108-9
PMID:37993896
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研究论文 | 本研究提出了一种快速、灵敏的全挂RNA荧光原位杂交和免疫组化协议 | 该研究适应了一种基于混合先前协议的三天全挂RNA-FISH方法，增强了探针信号，并实现了三种转录本的同时检测 | 目前尚未报告易于可靠应用的全挂FISH协议 | 探讨植物组织中的基因表达空间特征 | 研究对象为拟南芥花序和单子叶植物根的基因转录本 | 数字病理学 | NA | RNA荧光原位杂交（FISH） | 无抗体的杂交链反应（HCR） | NA | NA |
| 2305 | 2024-08-07 |
Liver cancer stem cell dissemination and metastasis: uncovering the role of NRCAM in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02893-w
PMID:37993901
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研究论文 | 本研究探讨了NRCAM在肝癌干细胞（LCSCs）功能和肝细胞癌（HCC）转移中的作用及其机制 | 首次揭示了NRCAM通过激活上皮-间质转化（EMT）和转移相关基质金属蛋白酶（MMPs）促进LCSCs迁移和侵袭的机制 | NA | 揭示NRCAM对LCSCs功能和HCC转移的贡献及其详细机制 | 肝癌干细胞（LCSCs）和肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 117例HCC患者和29例非HCC患者 |
| 2306 | 2024-08-05 |
The Promotion of Humoral Immune Responses in Humans via SOCS1-Mediated Th2-Bias Following SARS-CoV-2 Vaccination
2023-Nov-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11111730
PMID:38006062
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研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2疫苗接种后通过SOCS1介导的Th2偏倚促进人类体液免疫反应的机制 | 研究首次指出SOCS1在T细胞中的变化与Th2偏倚及抗SARS-CoV-2抗体产生之间的关联 | 研究只关注了抗体变化的高低分组，可能未能全面反映所有个体的免疫反应 | 探讨SARS-CoV-2疫苗接种后Th1/Th2偏倚对宿主免疫反应的影响 | 接种三剂SARS-CoV-2疫苗后的抗体变化显著的个体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | 三个剂量接种后的样本，具体数量未提及 |
| 2307 | 2024-08-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Gastrointestinal Cancers: Unveiling Their Dynamic Roles in the Tumor Microenvironment
2023-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216505
PMID:38003695
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综述 | 本文总结了癌associated成纤维细胞（CAFs）在胃肠癌肿瘤微环境中的动态作用。 | 揭示了CAFs在肿瘤进展中的多重作用和与免疫系统的动态相互作用 | 未提及具体的研究限制 | 探讨胃肠癌中CAFs在肿瘤微环境中的作用 | 癌associated成纤维细胞及其在肿瘤进展中的角色 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 文献数据 | NA |
| 2308 | 2024-08-05 |
Integrative multiomics analysis of neointima proliferation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.14.567053
PMID:38014255
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研究论文 | 本文探讨了人类大隐静脉中新内膜增生的多组学分析及其对旁路移植物疾病的影响 | 首次揭示了新内膜增生期间基因和蛋白表达的动态变化，识别了新的人类特异性分子和细胞机制 | 研究主要基于体外组织培养模型，可能无法完全反映体内实际情况 | 研究人类大隐静脉中新内膜增生的转录组学和蛋白质组学动态 | 对73名患者的大隐静脉样本进行多组学分析 | 数字病理 | 旁路移植物疾病 | RNA测序和蛋白质组学分析 | NA | 组织样本 | 73个患者样本 |
| 2309 | 2024-08-05 |
CGCom: a framework for inferring Cell-cell Communication based on Graph Neural Network
2023-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.10.566642
PMID:38014057
|
研究论文 | CGCom是一种基于图神经网络的细胞-细胞通信推断框架 | 该框架结合了单细胞空间转录组数据和配体-受体信息，以提高细胞间通信推断的准确性 | 该研究未涉及在其他类型的数据集上验证CGCom的通用性 | 探索如何利用空间转录组数据推断细胞-细胞通信 | 研究细胞间通信模式和相互作用的细胞对 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | 图神经网络 (GNN) | 单细胞空间转录组数据 | 应用于小鼠胚胎seqFISH数据集的研究 |
| 2310 | 2024-08-05 |
Linking Adiponectin and Its Receptors to Age-Related Macular Degeneration (AMD)
2023-Nov-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113044
PMID:38002042
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综述 | 这篇综述文章探讨了脂联素及其受体与年龄相关性黄斑变性之间的关系 | 提出了脂联素/受体信号在维持眼部稳态和防治眼病中的关键作用 | 脂联素抑制性肽APN1用于治疗人类AMD的可能性处于早期阶段，需要更多的临床研究 | 探讨脂联素在眼部健康中的作用及其与年龄相关性黄斑变性的关系 | 探讨脂联素及其受体在视网膜功能和视觉敏锐度中的作用 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2311 | 2024-08-07 |
Intercellular Molecular Crosstalk Networks within Invasive and Immunosuppressive Tumor Microenvironment Subtypes Associated with Clinical Outcomes in Four Cancer Types
2023-Nov-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113057
PMID:38002057
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了四种癌症类型中肿瘤微环境亚型的分子特征及其与临床结果的关联 | 首次在单细胞分辨率下揭示了肿瘤微环境亚型的特定特征和功能，并识别了与患者生存、侵袭和免疫逃逸相关的关键细胞和分子相互作用 | 研究仅限于四种癌症类型，且依赖于单细胞RNA测序数据，可能无法全面反映所有肿瘤微环境的复杂性 | 探讨肿瘤微环境亚型在癌症进展中的作用及其与临床结果的关联 | 乳腺癌、结直肠癌、食管癌和胰腺癌的肿瘤微环境亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | RNA测序数据 | 250个临床样本，超过200,000个细胞 |
| 2312 | 2024-08-05 |
Insights into the Interaction of Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Sleep-Disordered Breathing
2023-Nov-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11113038
PMID:38002038
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综述 | 本文概述了心脏衰竭与保留射血分数（HFpEF）与睡眠障碍呼吸（SDB）之间的相互作用 | 强调了HFpEF与SDB之间的机械平行，并探索了个性化治疗策略 | HFpEF的治疗选择有限，且尚未成功的通用疗法可能无法适用于所有患者 | 研究HFpEF的常见病因和表型，尤其是在SDB的背景下 | 主要针对罹患HFpEF的患者及其伴随的SDB病症 | 心血管疾病 | 心脏衰竭 | 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |
| 2313 | 2024-08-05 |
LMD: Multiscale Marker Identification in Single-cell RNA-seq Data
2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.12.566780
PMID:38014159
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研究论文 | 介绍了一种新的工具Localized Marker Detector (LMD)，用于识别单细胞RNA-seq数据中的“局部基因” | LMD能在不依赖于聚类或差异表达分析的情况下识别细胞亚型或功能状态的细粒度标记 | 仅在特定数据集中测试，未体现其一般性或在其他数据集中的有效性 | 旨在提升单细胞RNA-seq数据中细胞标记的准确识别 | 聚焦于定量分析与其细胞相似性相关的基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了Tabula Muris骨髓数据集中的已知细胞类型标记 |
| 2314 | 2024-08-05 |
Spatial proteo-transcriptomic profiling reveals the molecular landscape of borderline ovarian tumors and their invasive progression
2023-Nov-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.11.13.23298409
PMID:38014221
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研究论文 | 本文探讨了从边缘型卵巢肿瘤到低级别浆液性癌的分子演变及其侵袭进展。 | 本研究创新性地结合了空间蛋白质组学和空间转录组学，阐明了肿瘤发生的过程和机制。 | 本研究的局限性在于对特定基因和靶点的药物抑制验证，可能存在样本和环境的特异性。 | 研究从边缘型卵巢肿瘤向低级别浆液性癌转变的分子机制。 | 研究对象为边缘型浆液性肿瘤及其向低级别浆液性癌转变的肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间蛋白质组学和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 2315 | 2024-08-05 |
Development of a Comprehensive Gene Signature Linking Hypoxia, Glycolysis, Lactylation, and Metabolomic Insights in Gastric Cancer through the Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2023-Nov-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11112948
PMID:38001949
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研究论文 | 本文建立了一个综合基因特征模型，连接缺氧、糖酵解、乳酸化和代谢组学在胃癌中的作用 | 创新点在于首次结合缺氧、糖酵解和乳酸化相关基因进行生存预测以及医疗反应的评估 | 未明确提及本研究的局限性 | 研究胃癌中缺氧-糖酵解-乳酸化基因的综合模型 | 重点关注胃癌患者的生存、代谢特征、药物敏感性和免疫反应 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未提供 |
| 2316 | 2024-08-07 |
A novel missense variant in CDK5RAP2 associated with non-obstructive azoospermia
2023-Nov, Taiwanese journal of obstetrics & gynecology
IF:2.0Q2
DOI:10.1016/j.tjog.2023.03.015
PMID:38008501
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研究论文 | 本研究通过家系外显子测序和生物信息学分析，发现并验证了一个与非阻塞性无精症相关的CDK5RAP2基因的新错义变异 | 报道了一个CDK5RAP2基因的新错义变异，该变异在近亲家系中与男性不育和非阻塞性无精症共分离 | NA | 鉴定可能导致非阻塞性无精症的新单基因突变 | 一个有三个非阻塞性无精症兄弟和一个生育能力正常的兄弟的近亲家系 | NA | 男性不育 | 外显子测序，生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，蛋白质模型 | 一个家系中的四个兄弟 |
| 2317 | 2024-08-07 |
Characterization of Canine Peyer's Patches by Multidimensional Analysis: Insights from Immunofluorescence, Flow Cytometry, and Single-Cell RNA Sequencing
2023-Nov-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2300091
PMID:38015460
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研究论文 | 本文通过免疫荧光、流式细胞术和单细胞RNA测序等多维分析方法，对犬类Peyer's patches的结构和功能进行了全面研究 | 首次在犬类中使用单细胞RNA测序技术研究Peyer's patches中的免疫细胞亚群，并生成了特异性针对犬类M细胞的抗体 | NA | 深入理解犬类Peyer's patches的结构和功能，以增强疫苗接种策略并阐明疾病机制 | 犬类Peyer's patches | 免疫学 | NA | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未提及 |
| 2318 | 2024-08-05 |
Pharmacogenomic Analysis of Combined Therapies against Glioblastoma Based on Cell Markers from Single-Cell Sequencing
2023-Oct-30, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph16111533
PMID:38004399
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序发现生物标志物，以开发针对胶质母细胞瘤的个性化预防和治疗策略 | 建立了与 pyroptosis 相关基因的 LASSO Cox 回归模型，以准确预测胶质母细胞瘤患者的生存率 | 个性化或预测医学尚处于初步阶段，治疗选项仍然有限 | 探索胶质母细胞瘤的生物标志物，并结合最新技术开发个性化治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者的生物标志物和数种天然化合物 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，系统药理学，药物多靶点疗法 | LASSO Cox回归模型 | 生物标志物表达数据 | NA |
| 2319 | 2024-08-05 |
Machine Learning Analysis of Alzheimer's Disease Single-Cell RNA-Sequencing Data across Cortex and Hippocampus Regions
2023-Oct-28, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb45110544
PMID:37998721
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研究论文 | 该文章探讨了阿尔茨海默病的单细胞RNA测序数据分析 | 通过机器学习方法整合大规模单细胞RNA测序数据，揭示不同脑区和年龄组的基因表达模式 | 未详细提及实验中可能面临的具体限制 | 研究阿尔茨海默病在大脑皮层和海马区的病理差异 | 健康小鼠和阿尔茨海默病小鼠的单细胞RNA测序样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | 3个不同案例研究中的多个样本 |
| 2320 | 2024-08-05 |
Role of Pericytes in Cardiomyopathy-Associated Myocardial Infarction Revealed by Multiple Single-Cell Sequencing Analysis
2023-Oct-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11112896
PMID:38001896
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研究论文 | 本研究揭示了周细胞在与心肌病相关的急性心肌梗死中的潜在功能 | 首次系统地整合了心肌病患者和急性心肌梗死个体的单细胞数据，突出了周细胞的作用 | 本研究可能受到样本量和研究对象多样性的限制 | 探索周细胞在心肌病相关急性心肌梗死中的机制 | 心肌病患者和急性心肌梗死个体的单细胞数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |