单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 2281 - 2300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2281 | 2024-08-07 |
Bioinformatics Prediction and Experimental Validation of the Role of Macrophage Polarization and Ferroptosis in Gestational Diabetes Mellitus
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S440826
PMID:38107385
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研究论文 | 本文通过生物信息学预测和实验验证，探讨了巨噬细胞极化和铁死亡在妊娠糖尿病中的作用 | 首次揭示了妊娠糖尿病中巨噬细胞极化和铁死亡在胎盘炎症中的作用，并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于回顾性队列和公开数据集，未来需在前瞻性队列中进一步验证 | 探究妊娠糖尿病中胎盘炎症的机制并寻找潜在的治疗靶点 | 妊娠糖尿病中的巨噬细胞极化和铁死亡 | 生物信息学 | 妊娠糖尿病 | 转录组测序分析，多重免疫荧光染色 | NA | 转录组数据，临床信息 | 多个公开数据集（GSE154414, GSE70493, GSE173193）和回顾性队列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2282 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Roles of Fibroblasts During Intestinal Injury and Repair in Rats with Severe Acute Pancreatitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S436511
PMID:38107381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了严重急性胰腺炎大鼠模型中肠道损伤与修复过程中细胞异质性和组成的分子机制 | 发现纤维母细胞通过细胞间通讯影响肠道损伤与修复，并揭示了RNA结合蛋白在纤维母细胞功能中的潜在作用 | NA | 探索肠道损伤与治疗的分子机制 | 严重急性胰腺炎大鼠模型的肠道组织 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三组实验，包括健康对照组、模型组和治疗组的大鼠肠道组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2283 | 2024-08-07 |
Empagliflozin targets Mfn1 and Opa1 to attenuate microglia-mediated neuroinflammation in retinal ischemia and reperfusion injury
2023-Dec-12, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02982-9
PMID:38082266
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研究论文 | 本研究评估了抗糖尿病药物恩格列净（EMPA）在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果，发现其通过调节Mfn1和Opa1基因表达来减轻由小胶质细胞介导的神经炎症 | 本研究首次揭示了EMPA通过下调NLRP3信号通路和上调线粒体融合相关基因Mfn1和Opa1的表达，来恢复线粒体动态平衡，从而减轻视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症 | NA | 评估EMPA在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果 | 视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症和线粒体功能障碍 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型，体外实验使用BV2小胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2284 | 2024-08-05 |
SingleScan: a comprehensive resource for single-cell sequencing data processing and mining
2023-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05590-9
PMID:38062357
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SingleScan的在线资源，以便更便捷地获取单细胞测序方法和数据处理流程的详细信息 | 提供了分类的单细胞转录组/基因组分析工具和流程，并总结了单细胞数据分析的典型工作流程 | 尚未提及特定的实验验证或工具有效性的评估 | 旨在为研究人员提供一个便利用于单细胞测序数据处理的资源 | 该资源旨在帮助没有计算经验的研究人员进入单细胞测序领域 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2285 | 2024-08-07 |
Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data
2023-Dec, Protist
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
PMID:38039844
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研究论文 | 本研究从公共单细胞转录组数据中鉴定了16个新的家族A DNA聚合酶序列，并讨论了其在Euglenozoa门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了Euglenozoa门中深层分支物种的家族A DNA聚合酶数据的空白 | NA | 探讨Euglenozoa门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化 | Euglenozoa门中的家族A DNA聚合酶 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性Euglenozoa和2个共生体 | NA | NA | NA | NA |
| 2286 | 2024-08-07 |
A postmeiotically bifurcated roadmap of honeybee spermatogenesis marked by phylogenetically restricted genes
2023-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011081
PMID:38048317
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研究论文 | 本文通过蜜蜂（Apis mellifera）雄性3天和14天龄的睾丸单细胞RNA测序数据，揭示了蜜蜂精子发生过程中转录图谱的后减数分裂分支现象 | 发现了蜜蜂精子发生中后减数分裂的转录分支，以及小精子细胞（sSPT）中表达的膜翅目特异性基因和较高的突变负荷 | NA | 探究蜜蜂精子发生过程中后减数分裂的分子特征 | 蜜蜂的精子发生过程及其分子机制 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3天和14天龄的蜜蜂雄性睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2287 | 2024-08-07 |
The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report
2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
DOI:10.47391/JPMA.7776
PMID:38083933
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病例报告 | 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析肿瘤性质 | 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式，有助于区分肿瘤的性质 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 | 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一例心脏肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2288 | 2024-08-05 |
Isolation, Purification, and Application of Protoplasts and Transient Expression Systems in Plants
2023-Nov-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242316892
PMID:38069215
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综述 | 本文提供了原生质体的分离、纯化及其瞬时表达系统在植物中的应用的全面概述 | 文章创新性地总结了原生质体在多种植物物种中的应用及其分离和瞬时表达系统的建立 | 文章未具体涉及不同植物物种在原生质体应用中的具体差异 | 旨在为植物科学社区提供关于原生质体分离和瞬时表达系统建立的有效资源 | 研究原生质体及其在植物中的应用 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离和瞬时表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2289 | 2024-08-07 |
Integrative Analysis of Machine Learning and Molecule Docking Simulations for Ischemic Stroke Diagnosis and Therapy
2023-Nov-22, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28237704
PMID:38067435
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）和maSigPro R包确定与中风相关的基因模块和时间依赖性基因，结合三种机器学习算法识别中风特征基因，并构建诺模图模型评估中风患者。通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析中风中的小胶质细胞亚群，利用RNA速度、伪时间和基因集富集分析（GSEA）研究小胶质细胞亚群的关系，并通过连接图（CMap）分析和分子对接筛选中风的治疗药物。 | 本研究首次结合机器学习算法和分子对接模拟，构建了用于中风诊断的诺模图模型，并筛选出潜在的治疗分子AZ_628。 | NA | 研究中风的诊断和治疗方法 | 中风及其相关基因和小胶质细胞亚群 | 机器学习 | 中风 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接 | 诺模图模型 | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2290 | 2024-08-05 |
The murine meninges acquire lymphoid tissue properties and harbour autoreactive B cells during chronic Trypanosoma brucei infection
2023-Nov, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002389
PMID:37983289
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性锥虫感染对小鼠脑膜免疫环境的影响。 | 文章首次揭示了慢性Trypanosoma brucei感染导致小鼠脑膜内异位淋巴聚合体的形成。 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床相关性需要进一步验证。 | 研究慢性感染中脑膜免疫反应的动态变化。 | 小鼠模型和第二阶段人类非洲锥虫病患者的脑脊液样本。 | 数字病理学 | 锥虫病 | 单细胞转录组学和时间飞行质谱细胞术（CyTOF） | NA | 细胞样本和脑脊液样本 | 小鼠样本和人类患者脑脊液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2291 | 2024-08-07 |
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16499
PMID:38077419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾病患者的肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的基因表达谱，以探索肾病的细胞异质性 | 首次发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在，并提出这些细胞可能作为非侵入性诊断肾病的生物标志物 | 研究样本量较小，仅包括四名肾炎患者 | 探索肾病的病理机制并开发非侵入性诊断方法 | 肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的细胞异质性 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名肾炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2292 | 2024-08-07 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了PD-1阻断疗法对头颈鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境中调节性T细胞（Tregs）的影响 | 研究发现Nivolumab治疗后Treg数量和抑制活性增加，并揭示了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴和KRAS信号通路的变化可能与Treg数量的增加有关 | 需要进一步研究以深入理解患者对免疫疗法反应的限制 | 旨在探讨Nivolumab如何影响HNSCC肿瘤微环境中浸润的Tregs | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤微环境和调节性T细胞（Tregs） | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从四名HNSCC供体中分离的八份组织样本，治疗前后各四份 | NA | NA | NA | NA |
| 2293 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16437
PMID:37651723
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2294 | 2024-08-07 |
Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies
2023-Dec, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.3869
PMID:37823726
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）与靶向致癌基因面板，对急性髓系白血病进行转录组测序，揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 | 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性，通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 | NA | 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2295 | 2024-08-07 |
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14493
PMID:37874861
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研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析，比较了人类和猪的精子发生过程，特别是精子形成阶段，揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程，识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 | NA | NA | NA | NA |
| 2296 | 2024-08-05 |
Attention-based deep clustering method for scRNA-seq cell type identification
2023-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011641
PMID:37948464
|
研究论文 | 提出了一种基于注意力机制的scRNA-seq数据聚类方法AttentionAE-sc | 结合了ZINB和GAE两种聚类策略，通过注意力机制进行融合，改善了传统聚类方法的不足 | 未具体提及传统聚类方法的局限性细节 | 开发一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法，以应对高维和稀疏数据的挑战 | 研究对象为单细胞RNA测序数据，特别是在乳腺癌单细胞图谱数据集中的应用 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基于注意力的自动编码器 | 数据集 | 16个真实的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2297 | 2024-08-07 |
Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart
2023-Oct, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-0987-9
PMID:37294383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞（MNDCMs）的异质性及其在发育过程中的变化 | 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群，该亚群具有最小的细胞间通讯，并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 | NA | 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 | 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12645个心脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2298 | 2024-08-05 |
[Advances of spatial omics in the individualized diagnosis and treatment of head and neck cancer]
2023-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology, head, and neck surgery
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研究论文 | 本文总结了空间组学在头颈癌诊断和治疗中的最新进展 | 介绍了空间组学如何弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷 | NA | 探讨空间组学在头颈癌中的应用进展 | 头颈癌的病理机制、靶点探索和药物开发 | 数字病理学 | 头颈癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2299 | 2024-08-07 |
Multilineage contribution of CD34+ cells in cardiac remodeling after ischemia/reperfusion injury
2023-05-05, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00981-8
PMID:37147443
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和可诱导的Cd34谱系追踪小鼠模型，探讨了Cd34细胞在心脏重塑中的生物学功能及其对心脏重塑的净效应 | 本研究首次揭示了Cd34细胞在心脏重塑过程中的多谱系贡献，并阐明了其在心脏纤维化、血管新生和炎症反应中的具体作用 | NA | 旨在阐明异质性Cd34细胞群的生物学功能，并研究Cd34细胞干预对心脏重塑的净效应 | Cd34细胞在心脏重塑中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的缺血心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2300 | 2024-08-07 |
Ploidy-stratified single cardiomyocyte transcriptomics map Zinc Finger E-Box Binding Homeobox 1 to underly cardiomyocyte proliferation before birth
2023-03-02, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00979-2
PMID:36862248
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了出生前后心肌细胞的转录组变化，特别是锌指E盒结合同源盒1（ZEB1）在心肌细胞增殖中的作用 | 首次揭示了ZEB1在心肌细胞增殖和内复制中的关键作用，并提供了高分辨率的心肌细胞单细胞转录组图谱 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 识别出生前后心肌细胞增殖和终末分化相关的转录因子 | 心肌细胞的转录组和增殖机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自发育中（E16.5、P1和P5）小鼠心脏的固定心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |