单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2281 - 2300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2281 | 2024-08-07 |
A novel prognostic signature and immune microenvironment characteristics associated with disulfidptosis in papillary thyroid carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1308352
PMID:38033866
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研究论文 | 研究基于单细胞RNA测序数据，探讨了二硫化物应激相关基因与甲状腺乳头状癌临床结果及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 首次构建了基于二硫化物应激相关基因的4基因风险模型，并验证了其在甲状腺乳头状癌中的独立预后价值 | NA | 探索二硫化物应激相关基因与甲状腺乳头状癌临床结果及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 甲状腺乳头状癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO分析 | RNA测序数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE191288数据集和TCGA-THCA数据库的数据 |
| 2282 | 2024-08-07 |
Cascading effects of hypobaric hypoxia on the testis: insights from a single-cell RNA sequencing analysis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1282119
PMID:38033870
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了低压低氧环境对睾丸的级联效应及其对生殖细胞发育的影响。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了低压低氧环境对生殖细胞形成的调控作用及精子分化的影响。 | 研究仅限于实验室条件下的细胞和基因水平分析，未涉及临床或实际环境中的应用。 | 旨在阐明低压低氧环境对生殖细胞发育的调控机制及其对精子分化的影响。 | 研究对象包括生殖细胞、体细胞以及低压低氧环境对其相互作用的影响。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2283 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identified two subtypes and a taurine-related signature to predict the prognosis and efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.014
PMID:38034399
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研究论文 | 本研究通过综合分析识别出两种异质性肝细胞癌亚型及与牛磺酸相关的特征，用于预测肝细胞癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次识别并验证了两种具有不同牛磺酸代谢特征的肝细胞癌亚型，并构建了一个基于牛磺酸代谢相关基因的风险模型，用于评估患者的预后、免疫细胞浸润、免疫治疗反应和药物敏感性 | NA | 研究旨在识别能够预测肝细胞癌患者预后和免疫治疗反应的可靠生物标志物 | 肝细胞癌患者及其牛磺酸代谢特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 转录组数据分析 | 风险模型 | 转录组数据 | 多个独立的外部队列 |
| 2284 | 2024-08-07 |
Construction of EMT related prognostic signature for kidney renal clear cell carcinoma, through integrating bulk and single-cell gene expression profiles
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1302142
PMID:38035023
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞基因表达数据，构建了与肾透明细胞癌（KIRC）相关的上皮-间质转化（EMT）预测模型 | 本研究构建了一个新的EMT相关预测模型，并发现si-LGALS1能够抑制KIRC细胞的迁移和侵袭能力 | NA | 挖掘更多与EMT相关的细节，并为KIRC构建预测模型 | 肾透明细胞癌（KIRC）及其EMT过程 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 2,249个显著差异表达基因（DEGs）在KIRC样本中，其中289个DEGs在上皮细胞中 |
| 2285 | 2024-08-07 |
Insights on epithelial cells at the single-cell level in hepatocellular carcinoma prognosis and response to chemotherapy
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1292831
PMID:38044951
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌中的上皮细胞，旨在为肝细胞癌的预后和药物治疗反应提供靶点洞察 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肝细胞癌中上皮细胞的组成、分化演化和功能景观，并建立了一个与临床特征、上皮-间质转化及药物敏感性预测紧密相关的3基因风险模型 | NA | 专注于上皮细胞，为检测肝细胞癌的预后和药物治疗反应提供靶点洞察 | 肝细胞癌中的上皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自GSE149614的数据，包括八个主要的细胞亚群 |
| 2286 | 2024-08-05 |
The role of LSM1 in breast cancer: Shaping metabolism and tumor-associated macrophage infiltration
2023-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.107008
PMID:37995895
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研究论文 | 本研究探讨了LSM1在乳腺癌中的角色，尤其是在代谢和肿瘤相关巨噬细胞浸润方面 | 发现LSM1作为晚期乳腺癌的诊断标志物，并揭示其与免疫细胞和能量代谢的联系 | 需要进一步研究以确认LSM1在乳腺癌临床病理和精确肿瘤学中的潜力 | 探讨LSM1在乳腺癌进展中的角色及其作为潜在诊断和预后标志物的可能性 | 研究对象为乳腺癌及其相关的免疫微环境和代谢变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 组织活检样本和组织微阵列 | 54例乳腺癌患者的活检 |
| 2287 | 2024-08-07 |
Identification of potential diagnostic biomarkers for tenosynovial giant cell tumour by integrating microarray and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov-29, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-023-04279-2
PMID:38017559
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研究论文 | 本文通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了腱鞘巨细胞瘤的潜在诊断生物标志物 | 本文首次通过单细胞RNA测序和微阵列数据的整合分析，识别了腱鞘巨细胞瘤中的骨吸收细胞特异性上调基因 | 研究依赖于已有的公开数据集，未进行体内外实验验证 | 旨在识别高灵敏度和特异性的生物标志物，以辅助诊断腱鞘巨细胞瘤 | 腱鞘巨细胞瘤的诊断生物标志物 | 数字病理学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和两个微阵列数据集 |
| 2288 | 2024-08-07 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas identified a novel fibroblast subpopulation activated to guide oral barrier immunity in periodontitis
2023-Nov-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88183
PMID:38015204
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞图谱，并鉴定出一种新型纤维母细胞亚群，该亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫。 | 首次鉴定出一种新型纤维母细胞亚群（AG纤维母细胞），并揭示了其在牙周炎中引导口腔炎症的机制。 | NA | 揭示牙周炎中异常口腔屏障免疫的启动机制。 | 小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞。 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自小鼠牙周炎模型的牙龈细胞 |
| 2289 | 2024-08-05 |
LncPCD: a manually curated database of experimentally supported associations between lncRNA-mediated programmed cell death and diseases
2023-11-27, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baad087
PMID:38011720
|
研究论文 | LncPCD是一个手动整理的数据库，提供lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间的实验支持关联信息 | 建立了一个专门的数据库LncPCD，记录了lncRNA介导的程序性细胞死亡与多种疾病之间的关系 | 数据库的当前版本可能不包含所有潜在的lncRNA与PCD的关联，且需要持续更新 | 提供关于lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间关联的全面信息 | 记录lncRNA与五种主要PCD形式及331种疾病之间的6666个关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据库 | 331种疾病，1222个lncRNA |
| 2290 | 2024-08-05 |
scDREAMER for atlas-level integration of single-cell datasets using deep generative model paired with adversarial classifier
2023-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43590-8
PMID:38012145
|
研究论文 | 该文章介绍了scDREAMER，一个用于单细胞数据集集成的深度生成模型框架 | scDREAMER结合了深度生成模型和对抗性训练，实现了无监督和监督的多批次数据集成 | 没有提到特定的局限性 | 旨在整合多个组织位置、时间和条件下生成的异质单细胞测序数据集 | 涉及六个真实的基准数据集 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 对抗性分类器 | 单细胞测序数据 | 100万个细胞 |
| 2291 | 2024-08-05 |
Deciphering tumor-infiltrating dendritic cells in the single-cell era
2023-Nov-27, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00459-2
PMID:38012715
|
综述 | 本文概述了肿瘤微环境中树突状细胞的亚型及其功能。 | 采用单细胞测序技术对树突状细胞的异质性进行高分辨率特征描述，揭示了以前未被认识的树突状细胞群体的多样性。 | 未提及具体的实验数据和样本大小 | 旨在总结肿瘤微环境中树突状细胞的知识，以帮助了解肿瘤免疫。 | 不同人类肿瘤中树突状细胞的亚型及其功能和相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 2292 | 2024-08-05 |
Robust mapping of spatiotemporal trajectories and cell-cell interactions in healthy and diseased tissues
2023-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43120-6
PMID:38007580
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研究论文 | 本研究开发了三种计算统计算法，以整合不同数据类型并深入理解细胞过程 | 提出了空间图基的方法和新的细胞间互动分析测试，显著降低假发现率 | 没有提及具体的数据源和实验验证细节 | 提升对健康和疾病组织中细胞过程的理解 | 健康和疾病组织中的细胞 | 数字病理学 | 癌症进展 | 空间转录组学（ST） | 空间图模型 | 基因表达、物理距离、组织形态 | NA |
| 2293 | 2024-08-05 |
Role of arachidonic acid metabolism in intervertebral disc degeneration: identification of potential biomarkers and therapeutic targets via multi-omics analysis and artificial intelligence strategies
2023-Nov-25, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-023-01962-5
PMID:38007425
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研究论文 | 该研究探讨了花生四烯酸代谢在椎间盘退变中的作用，识别了潜在的生物标志物和治疗靶点 | 首次通过多组学分析和人工智能策略识别IVDD相关的枢纽基因并开发预测模型 | 需要在更大规模的临床样本中验证所识别的生物标志物和治疗靶点的有效性 | 探讨花生四烯酸代谢与椎间盘退变的关系，识别早期生物标志物及治疗靶点 | 主要针对椎间盘退变及其相关的生物标志物和靶向药物 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，机器学习，人工神经网络 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 2294 | 2024-08-07 |
Comprehensive clinicopathological significance and putative transcriptional mechanisms of Forkhead box M1 factor in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-25, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-023-03250-z
PMID:38001498
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研究论文 | 本研究探讨了Forkhead box M1因子（FOXM1）在肝细胞癌（HCC）中的临床病理意义及其潜在的转录机制 | 本研究首次在大规模多中心研究中证实了FOXM1在HCC中的上调，并揭示了其在细胞周期途径中通过激活其他转录因子促进HCC进展的潜在机制 | NA | 探讨FOXM1在HCC中的临床病理意义及其转录机制 | FOXM1因子在肝细胞癌中的表达及其转录机制 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 组织微阵列、免疫组化染色、基因芯片、高通量测序、染色质免疫沉淀后测序（ChIP-seq）、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 4235个HCC组织样本和3461个非HCC组织样本 |
| 2295 | 2024-08-05 |
Pregnancy-responsive pools of adult neural stem cells for transient neurogenesis in mothers
2023-11-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo5199
PMID:37995223
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研究论文 | 本文探讨了妊娠期间母体中成人神经干细胞的响应及其对神经发生的影响 | 研究发现多个区域特异的成人神经干细胞会在妊娠期间被招募，产生短期的嗅球间神经元波 | 未提及具体的局限性 | 研究妊娠如何影响成人神经干细胞的激活及神经发生 | 研究对象为成年小鼠的神经干细胞及其在妊娠期间的反应 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 成年小鼠 |
| 2296 | 2024-08-07 |
The extrafollicular B cell response is a hallmark of childhood idiopathic nephrotic syndrome
2023-Nov-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43504-8
PMID:37996443
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了儿童特发性肾病综合征（INS）中B细胞的转录程序，表明外滤泡B细胞反应是主要的免疫扰动。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了INS患儿血液样本中B细胞的转录特征，并证实了外滤泡B细胞反应的存在。 | 研究样本量较小，仅包括13名INS患儿和24名健康对照，可能影响结果的普遍性。 | 探讨B细胞在儿童特发性肾病综合征发病机制中的作用。 | 儿童特发性肾病综合征（INS）患儿的B细胞。 | NA | 儿童特发性肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 13名INS患儿和24名健康对照 |
| 2297 | 2024-08-07 |
Mouse models of pediatric high-grade gliomas with MYCN amplification reveal intratumoral heterogeneity and lineage signatures
2023-Nov-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43564-w
PMID:38001143
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研究论文 | 本文通过培育hGFAP-cre::Trp53::lsl-MYCN小鼠，生成了一个遗传工程小鼠模型，用于研究MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤发生和分子特征 | 首次揭示了MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤内异质性和神经元及少突胶质细胞谱系特征 | NA | 研究MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的生物学特性和临床特征，并提出替代治疗方案 | MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2298 | 2024-08-07 |
Molecular subtyping based on immune cell marker genes predicts prognosis and therapeutic response in patients with lung adenocarcinoma
2023-Nov-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11579-7
PMID:38001428
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研究论文 | 本研究利用免疫细胞标记基因对肺腺癌进行分子亚型分类，并探讨其与临床结果和治疗反应的关系 | 通过单细胞RNA测序识别的免疫细胞标记基因，构建了肺腺癌免疫差异评分模型，用于预测患者的预后和治疗反应 | NA | 探索肺腺癌的分子亚型特征，明确免疫微环境、临床结果和治疗反应之间的关联 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 基因数据 | 1441个免疫细胞标记基因，GSE72094队列的患者 |
| 2299 | 2024-08-05 |
A Mendelian Randomization-Based Causal Investigation on Bacterial Infection-Related Genes and Neurodegenerative Diseases
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230893
PMID:38007792
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研究论文 | 本研究探讨了细菌感染相关基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 通过孟德尔随机化，确定了7个与细菌感染途径相关的基因在阿尔茨海默病和帕金森病中的因果关联 | 尚未深入研究细菌慢性感染与神经退行性疾病的关系 | 分析细菌感染基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 阿尔茨海默病和帕金森病相关基因 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据 | 根据全基因组关联研究（GWAS）的数据 |
| 2300 | 2024-08-05 |
Single Cell Sequencing Analysis for Blood Tissue
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230872
PMID:38007772
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析血液组织样本 | 首次在血液组织中使用单细胞测序揭示细胞异质性 | 研究仅限于血液组织样本，可能无法广泛应用于其他组织类型 | 探索不同细胞类型在生理和病理条件下的分子特征和功能差异 | 血液组织样本中的单个细胞 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞测序 | 主成分分析（PCA）和莱顿聚类 | 基因组、转录组和表观基因组数据 | 血液组织样本中的细胞 |