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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2261 | 2024-08-07 |
Identification of biomarkers and immune infiltration in acute myocardial infarction and heart failure by integrated analysis
2023-07-26, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20222552
PMID:37334672
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研究论文 | 本研究通过综合分析方法,鉴定了急性心肌梗死和心力衰竭中的生物标志物和免疫浸润情况 | 本研究首次通过xCell算法和单细胞RNA测序数据,分析了急性心肌梗死和心力衰竭患者的免疫细胞浸润模式,并验证了相关枢纽基因 | NA | 旨在分析急性心肌梗死和心力衰竭患者的枢纽基因和免疫浸润情况 | 急性心肌梗死和心力衰竭患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自急性心肌梗死患者的五个公开基因表达数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2262 | 2024-08-07 |
Intratumoral PPT1-positive macrophages determine immunosuppressive contexture and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006655
PMID:37385725
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌(HCC)中PPT1阳性巨噬细胞对免疫抑制微环境和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了PPT1阳性巨噬细胞在HCC中的作用,及其对免疫微环境和治疗反应的影响 | 研究样本仅来自中山医院的169名患者,可能限制了结果的普遍性 | 识别在HCC发展中起关键作用的巨噬细胞亚群 | 肝细胞癌(HCC)中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 169名HCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2263 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of murine bone marrow megakaryocytes at single-cell resolution
2023-May, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100158
PMID:37255850
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞序列技术,分析小鼠骨髓巨核细胞的异质性 | 首次在小鼠骨髓中以单细胞分辨率探讨巨核细胞的空间异质性 | 仅分析了小鼠的巨核细胞,可能不适用于其他物种或人类细胞 | 探讨小鼠骨髓巨核细胞的空间分布及其在转录组上的异质性 | C57BL/6J小鼠的骨髓巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 44个单个巨核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2264 | 2024-08-05 |
Glucocorticoid activation by HSD11B1 limits T cell-driven interferon signaling and response to PD-1 blockade in melanoma
2023-04-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004150
PMID:37028818
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研究论文 | 这篇文章探讨了HSD11B1如何通过限制T细胞驱动的干扰素信号通路反过来影响黑色素瘤对PD-1阻断的反应 | 识别了HSD11B1作为负反馈机制,并提出HSD11B1抑制剂与免疫检查点抑制剂(ICIs)结合使用的药物重定位策略 | 需要更加仔细的人群分层来评估疗效 | 旨在识别影响黑色素瘤免疫治疗反应的新机制 | 使用不同的同基因黑色素瘤小鼠模型研究PD-1的阻断影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 组织样本 | 使用了多种小鼠模型和两组患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2265 | 2024-08-07 |
Scleraxis-lineage cells are required for tendon homeostasis and their depletion induces an accelerated extracellular matrix aging phenotype
2023-01-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.84194
PMID:36656751
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研究论文 | 本研究通过在小鼠中耗尽Scleraxis-lineage细胞,开发了一种加速肌腱细胞外基质(ECM)衰老的新模型,并探讨了其对肌腱稳态的影响 | 首次开发了一种通过耗尽Scleraxis-lineage细胞来加速肌腱ECM衰老的模型,并揭示了该模型中肌腱细胞功能的变化 | NA | 探究肌腱稳态破坏的机制,为开发维持肌腱健康的治疗方法提供依据 | Scleraxis-lineage细胞在肌腱稳态和ECM衰老中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2266 | 2024-08-07 |
Tr1 Cells Emerge and Suppress Effector Th17 Cells in Glomerulonephritis
2023-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300305
PMID:37850963
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研究论文 | 本研究探讨了Tr1细胞在肾小球肾炎(GN)中的出现及其抑制效应Th17细胞的功能 | 首次详细研究了Tr1细胞在肾小球肾炎中的出现及其在疾病中的调控功能 | NA | 验证Tr1细胞在实验性肾小球肾炎中的治疗潜力 | Tr1细胞在肾小球肾炎中的作用及其调控机制 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了实验性新月形肾小球肾炎的小鼠模型和双Foxp3mRFP IL-10eGFP报告小鼠,以及抗中性粒细胞胞浆自身抗体相关肾小球肾炎患者的肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2267 | 2024-08-05 |
A Spatial Transcriptome Reveals Changes in Tumor and Tumor Microenvironment in Oral Cancer with Acquired Resistance to Immunotherapy
2023-11-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13121685
PMID:38136558
|
研究论文 | 这项研究揭示了在口腔癌患者获得免疫治疗耐药后,肿瘤及其微环境的动态变化 | 本研究采用空间转录组技术揭示了获得免疫治疗耐药后的表观遗传修饰相关通路的激活 | 本研究仅基于一个患者的案例,样本量较小,缺乏广泛适用性 | 研究免疫治疗对口腔癌及其微环境的影响 | 77岁男性口腔鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 口腔癌 | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 1个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2268 | 2024-08-05 |
Good Cop, Bad Cop: Profiling the Immune Landscape in Multiple Myeloma
2023-11-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13111629
PMID:38002311
|
综述 | 本文描述了多发性骨髓瘤中骨髓微环境各成分的作用以及免疫治疗的临床试验。 | 结合经典免疫表型分析与单细胞测序技术的先进免疫特征分析,揭示了特定免疫细胞在多发性骨髓瘤中的作用。 | 未提供具体的临床试验数据和结果,可能限制对免疫治疗效果的全面理解 | 探讨多发性骨髓瘤中骨髓微环境对疾病发展的影响。 | 主要研究多发性骨髓瘤及其相关的免疫细胞和骨髓微环境。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序技术 | NA | NA | 采用外周血和骨髓中的特定免疫细胞进行分析,但样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 2269 | 2024-08-07 |
Hnf4 activates mimetic-cell enhancers to recapitulate gut and liver development within the thymus
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230461
PMID:37399024
|
研究论文 | 研究通过Hnf4α和Hnf4γ转录因子激活模拟细胞增强子,重现胸腺中的肠道和肝脏发育 | 揭示了Hnf4在胸腺中的基因调控机制,并发现了Hnf4γ在肠道微褶细胞和IgA反应中的作用 | NA | 探讨Hnf4在胸腺中模拟细胞的基因调控机制 | 胸腺中的模拟细胞(mTECs)及其在肠道和肝脏发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2270 | 2024-08-07 |
Paired single-cell host profiling with multiplex-tagged bacterial mutants reveals intracellular virulence-immune networks
2023-07-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2218812120
PMID:37399397
|
research paper | 本文开发了一种名为scPAIR-seq的单细胞方法,用于分析感染过程中宿主细胞和细菌突变体的相互作用 | scPAIR-seq方法能够同时捕获感染宿主细胞和内部细菌突变体的条形码,从而分析突变体对宿主转录组的影响 | NA | 研究宿主细胞与内部细菌病原体相遇后复杂的表型及其对感染结果的影响 | 宿主细胞和内部细菌病原体的相互作用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 使用了感染了Typhimurium分泌系统效应子突变体库的巨噬细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2271 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and macrophage-to-mesenchymal transition in bicuspid calcific aortic valve disease
2023-06-30, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00390-w
PMID:37391760
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研究论文 | 该文章研究了二尖瓣钙化主动脉瓣病中的细胞异质性和巨噬细胞转化为间充质细胞的过程。 | 首次在单细胞水平上揭示了二尖瓣病中细胞的异质性以及巨噬细胞向间充质细胞转化的机制 | 样本量较小,仅涉及四个BAV标本,需要更多样本进行进一步验证 | 探讨二尖瓣疾病中的细胞组成及其在钙化过程中的作用 | 四个存在主动脉瓣狭窄的二尖瓣患者的BAV标本 | 数字病理学 | 主动脉瓣钙化疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 4个BAV标本 | NA | NA | NA | NA |
| 2272 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF2 as a prognostic biomarker associated with fibrosis and immune infiltration in advanced hepatocellular carcinoma
2023-Jun-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05391-0
PMID:37386390
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研究论文 | 本文分析了KLF2在晚期肝细胞癌中的预后生物标志物的作用,特别关注其与纤维化和免疫浸润的关系 | 首次系统性研究了KLF2在肝细胞癌(HCC)中的调节机制及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要依赖于现有数据库,未进行独立的临床验证 | 探索KLF2作为晚期HCC的潜在诊断和预后生物标志物 | 晚期肝细胞癌(HCC)患者的样本数据和单细胞测序结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公共数据库,具体样本量不详 | NA | NA | NA | NA |
| 2273 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas of Neonatal Mouse Hearts Reveals an Unexpected Cardiomyocyte
2023-12-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.122.028287
PMID:38014657
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研究论文 | 本文通过设计新生小鼠心脏细胞的分离程序,提供了出生后四个不同阶段心脏细胞的单细胞分辨率详细图谱 | 本文发现了意外的红细胞样心肌细胞-终末期心肌细胞,并提供了心肌细胞与其他心脏细胞之间全面相互作用的初步蓝图 | NA | 研究心肌细胞的异质性并提供在不同生理条件和疾病中的参考 | 新生小鼠心脏的心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 10,000个心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2274 | 2024-08-05 |
Unveiling Hypothalamic Molecular Signatures via Retrograde Viral Tracing and Single-Cell Transcriptomics
2023-12-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02789-6
PMID:38049462
|
研究论文 | 本研究通过逆行病毒追踪和单细胞转录组学揭示了下丘脑分子的特征 | 本研究创新地结合了多样化数据集进行验证,提供了更细致的下丘脑细胞类型多样性 | 本研究的局限性未在摘要中提及 | 深入理解下丘脑神经回路及其分子身份 | 来自CRH-IRES-Cre小鼠的1,533个下丘脑细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 细胞转录组数据 | 1,533个来自CRH-IRES-Cre小鼠的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2275 | 2024-08-05 |
Identification of efferocytosis-related subtypes in gliomas and elucidating their characteristics and clinical significance
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1295891
PMID:38161335
|
研究论文 | 本研究识别了胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型,并探讨了其特征和临床意义 | 首次通过分析137个与吞噬凋亡相关的基因,建立了与吞噬凋亡相关的胶质瘤亚型分类,并探讨了其在免疫环境、细胞间通信和代谢过程中的特征 | 未提及特定实验设计或样本选择的限制 | 探讨胶质瘤中吞噬凋亡相关亚型的特征和临床意义 | 胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型及其相关特征 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NMF算法 | 基因表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2276 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA landscape of osteoimmune microenvironment in osteoporotic vertebral compression fracture and Kümmell's disease
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1276098
PMID:38161331
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的分子途径、细胞群组成和细胞间相互作用的差异 | NA | 探讨骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8741个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2277 | 2024-08-07 |
APOL1 Induces Pyroptosis of Fibroblasts Through NLRP3/Caspase-1/GSDMD Signaling Pathway in Ulcerative Colitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S437875
PMID:38161356
|
研究论文 | 本研究探讨了APOL1通过NLRP3/Caspase-1/GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡在溃疡性结肠炎中的作用 | 首次揭示了APOL1通过NLRP3-Caspase1-GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡,并促进趋化因子CXCL1的释放,这一发现有助于理解溃疡性结肠炎的发病机制 | NA | 研究APOL1在溃疡性结肠炎中诱导纤维母细胞焦亡的作用及其分子机制 | 溃疡性结肠炎中的纤维母细胞 | NA | 溃疡性结肠炎 | 生物信息学分析、免疫组织化学、免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE193677和GSE231993数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2278 | 2024-08-07 |
Urinary PART1 and PLA2R1 Could Potentially Serve as Diagnostic Markers for Diabetic Kidney Disease Patients
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S445341
PMID:38162802
|
研究论文 | 本研究通过bulk-seq、scRNA-seq和snRNA-seq数据分析,识别出与糖尿病肾病相关的尿液-肾脏特异性基因,特别是PART1和PLA2R1,这些基因可能作为早期诊断糖尿病肾病的标志物 | 首次识别出尿液中的PART1和PLA2R1作为糖尿病肾病的潜在诊断标志物,并探讨了它们与肾脏损伤和蛋白尿的关系 | 研究样本量较小,且仅包括糖尿病肾病患者和健康对照组,未来研究需扩大样本量并考虑更多疾病阶段的患者 | 探索糖尿病肾病的非侵入性诊断方法,特别是早期诊断 | 糖尿病肾病患者和健康对照组的尿液样本 | NA | 糖尿病肾病 | bulk-seq, scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 尿液样本 | 56个尿液样本,包括11个来自糖尿病肾病患者和11个来自健康对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 2279 | 2024-08-07 |
Single-cell analyses EMP1 as a marker of the ratio of M1/M2 macrophages is associated with EMT, immune infiltration, and prognosis in bladder cancer
2023, Bladder (San Francisco, Calif.)
DOI:10.14440/bladder.2023.852
PMID:38163006
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞分析中EMP1作为M1/M2巨噬细胞比例的标志物与膀胱癌的EMT、免疫浸润及预后的关联 | 首次研究了M1和M2巨噬细胞联合作用在膀胱癌发展、生长、进展和转移中的意义,并识别了EMP1作为关键基因 | 研究样本量较小,仅涉及32名患者 | 探究EMP1在膀胱癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 膀胱癌中的M1/M2巨噬细胞比例及EMP1基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | Cibersortx算法、流式细胞术、Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)、Gene Set Variation Analysis (GSVA)、Gene Ontology (GO)、单细胞转录组分析(scRNA-seq)、Cellchat | NA | 基因表达数据 | 32名膀胱癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2280 | 2024-08-07 |
Deciphering the Divergent Gene Expression Landscapes of m6A/m5C/m1A Methylation Regulators in Hepatocellular Carcinoma Through Single-Cell and Bulk RNA Transcriptomic Analysis
2023, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S448047
PMID:38164510
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA转录组分析,探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | 本研究首次在单细胞水平上探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达,并验证了其在癌组织和邻近非癌肝组织中的表达 | 本研究仅分析了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达差异,未深入探讨其具体功能和机制 | 探索m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 收集了成人肝细胞癌患者的癌组织和邻近非癌肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |