单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2221 - 2240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2221 | 2024-08-07 |
Phospholipase A2 Group IIA Is Associated with Inflammatory Hepatocellular Adenoma
2023-Dec-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010159
PMID:38201587
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研究论文 | 本研究旨在全面调查肝细胞腺瘤（HCA）的亚型分类，并比较分析HCA和肝细胞癌（HCC）组织之间的基因表达谱 | 发现磷脂酶A2组IIA（PLA2G2A）mRNA在炎症性HCA中特异性表达，这可能有助于炎症性HCA的新定义 | 研究结果需要通过其他新鲜HCA样本进行验证 | 研究HCA的亚型分类及其与HCC的基因表达差异 | 炎症性HCA、非B非C HCC、乙型肝炎病毒相关HCC及正常肝组织 | NA | 肝细胞腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 1个炎症性HCA，3个非B非C HCC，2个乙型肝炎病毒相关HCC，1个正常肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2222 | 2024-08-07 |
A new insight of immunosuppressive microenvironment in osteosarcoma lung metastasis
2023-06, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231171900
PMID:37439349
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据，揭示了骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境的复杂性 | 首次详细分类了骨肉瘤肺转移中的17个细胞集群，并发现CD63在决定T细胞和恶性细胞浸润中的关键作用 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境，为精准治疗提供依据 | 骨肉瘤肺转移的细胞集群及其免疫特性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 75,317个细胞，来自两个骨肉瘤肺转移和五个正常肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2223 | 2024-08-05 |
Biomarkers in Cancer Detection, Diagnosis, and Prognosis
2023-Dec-20, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s24010037
PMID:38202898
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综述 | 该论文描述了在癌症检测和诊断中适用的各种生物标志物 | 该文综述了影像学、血液、细胞成像、组织成像和基因方面的生物标志物在癌症中的应用 | 该文未提及研究的具体限制 | 探讨生物标志物在癌症检测、诊断和预后中的重要性 | 文中涉及的研究对象包括用于癌症检测和诊断的各种生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 影像学诊断、血基生物标志物、细胞成像、组织成像、基因组测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2224 | 2024-08-07 |
Machine Learning and Single-Cell Analysis Identify Molecular Features of IPF-Associated Fibroblast Subtypes and Their Implications on IPF Prognosis
2023-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010094
PMID:38203265
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研究论文 | 本研究旨在系统分类纤维母细胞群体，揭示纤维化肺组织中纤维母细胞亚型的分子和生物学特征，并建立与IPF相关的纤维母细胞相关预测模型 | 本研究首次使用scRNA-seq数据和hdWGCNA技术，识别出与IPF相关的纤维母细胞亚型及其共表达基因模块，并构建了基于机器学习的IPF纤维母细胞相关预测模型 | NA | 系统分类纤维母细胞群体，揭示其分子和生物学特征，并建立IPF相关的预测模型 | 纤维化肺组织中的纤维母细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, hdWGCNA | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自正常和IPF患者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2225 | 2024-08-07 |
Transcriptomic analysis of sorted lung cells revealed a proviral activity of the NF-κB pathway toward SARS-CoV-2
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108449
PMID:38213785
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研究论文 | 本研究通过深度polyA+转录组分析和新型RNA分析，研究了严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染的肺上皮细胞的转录组变化 | 本研究首次揭示了NF-κB通路在SARS-CoV-2感染中的促病毒作用，并发现了CYLD作为该通路的负调控因子具有抗病毒活性 | 研究主要集中在细胞水平，未涉及临床样本或动物模型 | 探讨SARS-CoV-2感染肺上皮细胞的转录组响应和相关调控机制 | SARS-CoV-2感染的肺上皮细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2226 | 2024-08-07 |
FEZ1 participates in human embryonic brain development by modulating neuronal progenitor subpopulation specification and migrations
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108497
PMID:38213789
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研究论文 | 本研究探讨了FEZ1蛋白在人类胚胎大脑发育中的作用，特别是在神经前体细胞亚群的分化和迁移中的作用 | 首次使用人类大脑类器官（hCOs）研究FEZ1在早期大脑发育中的表达及其对神经和突触发育基因表达的影响 | NA | 研究FEZ1在人类胚胎大脑发育中的作用及其对神经发育障碍的影响 | FEZ1蛋白及其在神经前体细胞亚群分化和迁移中的作用 | NA | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2227 | 2024-08-05 |
Uncovering the Genetic Basis of Congenital Heart Disease: Recent Advancements and Implications for Clinical Management
2023-Dec, CJC pediatric and congenital heart disease
DOI:10.1016/j.cjcpc.2023.10.008
PMID:38205435
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研究论文 | 本研究揭示了先天性心脏病的遗传基础及其对临床管理的影响 | 指出了基因组测序技术对理解先天性心脏病遗传基础的变革性影响 | 临床基于这些因素的风险预测仍然面临挑战 | 旨在深入理解先天性心脏病的遗传基础，以改善临床结果 | 分析先天性心脏病相关的遗传变异与临床结果之间的关联 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序技术 | 人诱导多能干细胞模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2228 | 2024-08-05 |
Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution
2023-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/VJGB-23-94
PMID:38213707
|
研究论文 | 本文探讨了癌症内肿瘤异质性的演变及其模型 | 提出了从进化理论的角度理解肿瘤作为复杂生态系统的观点 | 未具体细述不同方法的局限性 | 旨在揭示影响肿瘤异质性的机制以改善癌症治疗 | 探索肿瘤内的遗传和表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序，荧光原位杂交，单细胞测序 | 计算模型和算法 | 基因组数据，单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2229 | 2024-08-05 |
Integration of clinical characteristics and molecular signatures of the tumor microenvironment to predict the prognosis of neuroblastoma
2023-11, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02372-x
PMID:37712965
|
研究论文 | 本研究旨在分析神经母细胞瘤的临床特征、细胞类型和肿瘤微环境的分子特征，以更好地预测预后 | 建立了基于基因特征和临床特征的多变量Cox模型，有助于更准确地预测神经母细胞瘤的预后 | 研究可能受到样本量和所用数据来源的限制 | 改善神经母细胞瘤的预后预测 | 分析498例神经母细胞瘤患者的基因表达数据和临床信息 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox模型 | 基因表达数据 | 498例神经母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2230 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals unique features of diabetogenic T cells in anti-PD-1-induced type 1 diabetes mice
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221920
PMID:37432393
|
研究论文 | 该文章探讨了抗PD-1诱导的1型糖尿病小鼠中糖尿病T细胞的独特特征 | 首次比较了抗PD-1诱导的1型糖尿病与自发性1型糖尿病之间的差异 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类 | 了解抗PD-1治疗引发的免疫相关不良事件的特征 | 使用非肥胖型糖尿病小鼠的胰腺、胰腺引流淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞 | 使用了NOD小鼠的多种样本，包括来自胰腺和血液的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2231 | 2024-08-07 |
scGEM: Unveiling the Nested Tree-Structured Gene Co-Expressing Modules in Single Cell Transcriptome Data
2023-Aug-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15174277
PMID:37686554
|
研究论文 | 本文介绍了scGEM模型，用于揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块 | scGEM是一个嵌套树结构的非参数贝叶斯模型，能够识别和量化决定细胞类型特化和分化的潜在细胞程序 | NA | 揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块，以理解细胞功能的隐藏机制 | 单细胞转录组数据，包括外周血单个核细胞和早期脑发育细胞 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | 非参数贝叶斯模型 | 转录组数据 | 包括外周血单个核细胞、早期脑发育细胞和三阴性乳腺癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2232 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of PIT1-positive pituitary adenoma highlights the pro-tumour microenvironment mediated by IFN-γ-induced tumour-associated fibroblasts remodelling
2023-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-02126-5
PMID:36631635
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研究论文 | 这篇文章探讨了PIT1阳性垂体腺瘤中IFN-γ诱导的肿瘤相关成纤维细胞重塑所介导的促肿瘤微环境 | 本研究揭示了PIT1-PA微环境中细胞类型的功能异质性，以及IFN-γ在肿瘤相关成纤维细胞重塑中的抗肿瘤作用 | 仍需进一步研究以完全了解PIT1-PA中肿瘤相关成纤维细胞和免疫细胞的细胞和功能异质性 | 研究PIT1-阳性垂体腺瘤中的微环境及其在肿瘤发展的作用 | 研究了四个PIT1阳性垂体腺瘤样本中的28种不同细胞亚型 | 数字病理学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个PIT1-阳性垂体腺瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2233 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78511
PMID:36724009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了果蝇 fruitless基因表达神经元的转录组，揭示了性别特异性的表达模式和神经元功能差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇性别特异性神经元进行全面分析，揭示了性别间神经元数量和表达模式的差异 | NA | 探究果蝇性别特异性神经元的转录组特征及其在生殖行为中的作用 | 果蝇 fruitless基因表达的神经元 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 113个神经元集群 | NA | NA | NA | NA |
| 2234 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals Wolbachia-mediated modification in early stages of Drosophila spermatogenesis
2023-01-11, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2022.1963
PMID:36629101
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇睾丸中的基因表达谱，揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生不同阶段的细胞中产生的影响，特别是在生殖干细胞中的基因表达调控 | 由于精子发生的复杂性和睾丸细胞类型的异质性，沃尔巴克氏菌对不同阶段精子发生细胞的具体影响机制仍需进一步研究 | 探讨沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用及其与细胞质不相容性的关联 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2235 | 2024-08-07 |
Commensal microbiome promotes hair follicle regeneration by inducing keratinocyte HIF-1α signaling and glutamine metabolism
2023-01-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7555
PMID:36598999
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research paper | 研究揭示了共生微生物群通过诱导角质形成细胞HIF-1α信号传导和谷氨酰胺代谢促进毛囊再生的机制 | 首次发现皮肤共生细菌通过诱导角质形成细胞的谷氨酰胺代谢，增强皮肤和毛囊的再生能力 | NA | 探究组织损伤后干细胞代谢变化对再生的影响 | 皮肤共生细菌、角质形成细胞、毛囊再生 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 皮肤样本 | 小鼠和人类皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2236 | 2024-08-05 |
TrkA-mediated sensory innervation of injured mouse tendon supports tendon sheath progenitor cell expansion and tendon repair
2023-12-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ade4619
PMID:38117901
|
研究论文 | 本研究探讨外周神经在小鼠肌腱损伤与修复中的作用 | 首次揭示外周神经通过调控神经生长因子和TGFβ信号通路促进肌腱细胞的扩展与修复 | 需要进一步研究去神经化对肌腱机械负荷的潜在影响 | 研究外周神经在小鼠肌腱损伤后的修复过程中的作用 | 小鼠肌腱及其神经生长与修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小鼠以及人类肌腱活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2237 | 2024-08-07 |
Diversity of intratumoral regulatory T cells in B-cell non-Hodgkin lymphoma
2023-12-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010158
PMID:37695745
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序结合高维流式细胞术，解析了弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性 | 首次揭示了B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的三个不同转录状态，并发现激活的调节性T细胞在肿瘤组织中富集，具有更强的免疫抑制活性 | 研究主要集中在弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤，其他类型的B细胞非霍奇金淋巴瘤的调节性T细胞异质性尚未探讨 | 探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性及其对预后的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中的肿瘤内调节性T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，高维流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 两个独立的滤泡淋巴瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 2238 | 2024-08-05 |
Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis
2023-Oct-17, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00595-3
PMID:37848438
|
研究论文 | 这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。 | 揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制，强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系 | 尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响 | 探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制 | 小鼠模型，研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 生物样本数据 | 涉及多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2239 | 2024-08-07 |
Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features
2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.09.288
PMID:38147960
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据以及临床信息，探讨了系统性硬化症（SSc）中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性 | 本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型，提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性 | NA | 研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性 | 系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | PRESS和GENISOS两个队列的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2240 | 2024-08-07 |
De novo hematopoiesis from the fetal lung
2023-11-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022008347
PMID:37729429
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研究论文 | 本文首次证明胎儿肺是HECs的潜在来源，这些HECs具有进行EHT以产生新生HSPCs及其后代的功能能力 | 首次描述胎儿肺中的HECs，并证明其能进行EHT产生新生HSPCs，为非骨髓造血提供新视角 | NA | 探索胎儿肺中HECs的存在及其进行EHT的能力 | 胎儿肺中的HECs及其进行EHT的能力 | 生物医学 | NA | scRNA-seq, 流式细胞术, 小分子调制 | NA | 细胞 | 小鼠和人类胎儿肺的组织培养 | NA | NA | NA | NA |