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当前共找到 5353 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2025-12-24
Systematic single cell RNA sequencing analysis reveals unique transcriptional regulatory networks of Atoh1-mediated hair cell conversion in adult mouse cochleae
2023, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了成年小鼠耳蜗中Atoh1介导的毛细胞转换过程中的独特转录调控网络 采用多种高通量测序分析工具(WGCNA、SCENIC、ARACNE和VIPER)构建独立的表达模块,并识别出多个转换阶段,发现了包括Nhlh1、Lhx3、Barhl1和Nfia在内的关键调控因子 研究基于现有数据集(Yamashita等人,2018年)进行分析,可能受限于原始数据的质量和样本量,且主要关注成年小鼠模型,结果在人类或其他哺乳动物中的适用性需进一步验证 探究成年哺乳动物耳蜗中毛细胞再生的调控机制,特别是Atoh1诱导的支持细胞向毛细胞转换过程 成年小鼠耳蜗中的支持细胞和毛细胞 单细胞转录组学 听力损失 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 基于Yamashita等人(2018年)和Kolla等人(2020年)的公开数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
202 2025-12-23
Single-cell RNA-sequencing profiles reveal the developmental landscape of the Manihot esculenta Crantz leaves
2023-12-30, Plant physiology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,构建了木薯叶片的单细胞转录组图谱,揭示了其细胞发育景观和光合特性 首次在木薯叶片中应用单细胞RNA测序技术,识别了15个细胞簇和120个候选标记基因,并构建了细胞发育轨迹图,发现了6个与细胞分化命运相关的基因 NA 在细胞水平上研究木薯叶片的结构和光合特性,为提升木薯产量和营养提供理论基础 木薯(Manihot esculenta Crantz)叶片 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 11,177个高质量叶片细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
203 2024-08-07
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-12, The Plant journal : for cell and molecular biology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
204 2025-12-23
Identification and validation of prognostic and tumor microenvironment characteristics of necroptosis index and BIRC3 in clear cell renal cell carcinoma
2023, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过分析TCGA和GEO数据库,识别了与坏死性凋亡相关的基因簇和预后模型,并验证了枢纽基因BIRC3在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用 首次构建了基于坏死性凋亡相关基因的预后模型,并深入探讨了BIRC3基因在ccRCC免疫微环境中的关键作用 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏大规模临床样本验证,且实验部分仅限于细胞系水平 探索坏死性凋亡在透明细胞肾细胞癌中的调控机制及其临床意义 透明细胞肾细胞癌患者数据、细胞系及单细胞测序数据 生物信息学 肾癌 单细胞测序、定量实时PCR、CCK8实验、transwell实验、伤口愈合实验 LASSO回归模型 基因表达数据、单细胞测序数据 TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
205 2025-12-23
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液中的细胞异质性,发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在可作为肾脏疾病潜在的微创诊断标志物 首次通过单细胞RNA测序在肾炎患者的外周血和尿液中鉴定出近端小管细胞,并发现其与肾脏组织中的炎症性近端小管细胞具有高度相似的基因表达谱,提出了替代侵入性肾活检的潜在微创诊断方法 研究样本量较小(仅4名患者),且仅针对肾炎患者,结果在其他肾脏疾病中的普适性有待验证 探索肾脏疾病的病理机制并开发微创诊断方法 肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液样本 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4名肾炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
206 2025-12-20
The role of LSM1 in breast cancer: Shaping metabolism and tumor-associated macrophage infiltration
2023-12, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨LSM1在乳腺癌中的作用,揭示其作为诊断和预后标志物的潜力,并分析其对代谢和肿瘤免疫微环境的影响 首次通过多组学方法将LSM1鉴定为晚期乳腺癌的诊断标志物,并利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术分析其与免疫细胞的关联 研究样本量相对较小(54例患者活检),且需要进一步验证LSM1在更大队列中的临床应用价值 探究LSM1在乳腺癌临床病理、肿瘤免疫微环境和精准肿瘤学中的潜在作用 乳腺癌患者组织样本(包括活检和组织微阵列)以及乳腺癌细胞系 数字病理 乳腺癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 生物信息学分析 NA 转录组数据, 图像数据 54例乳腺癌患者活检和组织微阵列 NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
207 2025-12-20
Identification of cytokine-induced cell communications by pan-cancer meta-analysis
2023, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞和泛癌水平转录组学整合,识别了细胞因子介导的细胞间通讯,并构建了全面的细胞因子-受体图谱 开发了一种单细胞方法主动表达62对细胞因子-受体对,揭示了稳定的细胞因子介导的细胞通讯,涉及84种细胞因子和受体,并在泛癌水平进行了整合分析 研究基于转录组学数据,可能未完全捕捉蛋白质水平的相互作用;样本量虽大,但某些癌症类型可能代表性不足 揭示不同癌症中细胞因子介导的细胞间通讯机制及其在癌症发展和治疗反应中的作用 41,900个细胞,涵盖25种癌症类型,以及来自TCGA的10,967个样本,涉及32种癌症类型 生物信息学 泛癌 单细胞转录组学,泛癌meta分析,功能富集分析,共突变分析 NA 单细胞转录组数据,TCGA突变数据,临床生存数据 41,900个细胞(25种癌症类型),10,967个样本(32种TCGA癌症类型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
208 2025-12-20
Elucidating the role of nicotinamide N-methyltransferase-p53 axis in the progression of chronic kidney disease
2023, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究探讨了烟酰胺N-甲基转移酶(NNMT)在慢性肾病(CKD)进展中的作用,特别是其通过p53轴促进肾间质纤维化的机制 首次通过单细胞转录组测序(scRNA-seq)发现NNMT在纤维母细胞中特异性增加,并揭示了NNMT通过调节p53的DNA甲基化和磷酸化促进纤维化的新机制 研究主要基于小鼠UUO模型和体外细胞实验,尚未在人类临床样本中验证,且NNMT的具体下游信号通路仍需进一步阐明 阐明NNMT在慢性肾病肾间质纤维化中的作用机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 小鼠(UUO模型)和培养的肾间质纤维母细胞(NRK-49F) 数字病理学 慢性肾病 单细胞转录组测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 小鼠肾脏组织(UUO与假手术组对比)及培养细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
209 2025-12-17
Unagi: Deep Generative Model for Deciphering Cellular Dynamics and In-Silico Drug Discovery in Complex Diseases
2023-Dec-18, Research square
研究论文 本文介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络,用于分析时间序列单细胞转录组数据,以解码复杂疾病中的细胞动态并进行计算机药物发现 UNAGI是一种专门针对时间序列单细胞转录组数据设计的深度生成模型,能够捕获疾病进展中的复杂细胞动态,并增强药物扰动建模和发现能力 NA 开发一种计算工具,用于详细分析疾病进展并进行靶向计算机药物干预 时间序列单细胞转录组数据,特别是来自特发性肺纤维化(IPF)患者和COVID数据集的数据 机器学习 特发性肺纤维化 单细胞转录组测序 深度生成神经网络 时间序列单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
210 2025-12-13
Determinants of Survival with Combined HER2 and PD-1 Blockade in Metastatic Esophagogastric Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究探讨了在转移性食管胃癌中,联合使用HER2和PD-1阻断疗法(帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗)的生存决定因素,并评估了多种生物标志物和测序技术 通过整合89Zr-曲妥珠单抗PET、血浆循环肿瘤DNA动态监测和单细胞RNA测序,揭示了患者内基因组异质性对治疗反应的影响,并识别了与治疗抵抗相关的转录程序 研究基于相对较小的样本量(如MSK队列n=226),且为观察性研究,可能受限于回顾性数据分析和潜在的选择偏倚 识别转移性食管胃癌患者在接受HER2和PD-1联合阻断疗法时的预后生物标志物和抵抗机制 转移性食管胃癌患者,包括接受帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗联合治疗的患者以及MSK队列中的曲妥珠单抗治疗患者 数字病理学 食管胃癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全外显子测序、循环肿瘤DNA(ctDNA)监测、89Zr-曲妥珠单抗PET成像 多变量Cox回归模型 影像数据(PET)、基因组数据(ctDNA、scRNA-seq、全外显子测序) MSK队列中226名曲妥珠单抗治疗患者,以及来自MSK和三星的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
211 2025-12-13
Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration
2023, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究揭示了放疗未能有效诱导T细胞浸润的机制,并提出通过抑制DPP4来增强放疗疗效的策略 首次发现树突状细胞在放疗后高表达DPP4是限制T细胞浸润的关键因素,并提出DPP4抑制剂联合放疗可增强抗肿瘤免疫 研究主要基于临床前模型,尚未在大型临床试验中验证;机制研究主要聚焦于DPP4对趋化因子的调控 探究放疗联合免疫治疗的增效机制,寻找增强放疗诱导抗肿瘤免疫应答的新策略 肺癌和黑色素瘤患者样本、肿瘤微环境中的免疫细胞 肿瘤免疫学 肺癌、黑色素瘤 单细胞测序 NA 转录组数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
212 2025-12-12
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-12-08, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本文通过单细胞转录组分析,揭示了严重哮喘患者气道中CD4+组织驻留记忆T细胞的异质性及其与疾病严重性的关联 首次在严重哮喘患者气道中发现CD103+ CD4+ TRM细胞显著增加,并揭示其具有细胞毒性和促炎非TH2细胞因子表达特征 样本量相对较小(30例患者),且未明确这些TRM细胞的具体功能机制或治疗靶点 探究严重哮喘中除TH2细胞外的其他CD4+ T细胞亚群在气道炎症和重塑中的作用 从30名轻度和严重哮喘患者的支气管肺泡灌洗样本中分离的CD4+ T细胞 单细胞转录组学 哮喘 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 30例患者(轻度和严重哮喘),超过50,000个气道CD4+ T细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
213 2025-12-12
Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging
2023-12, Mechanisms of ageing and development IF:5.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和微阵列转录组数据,探讨了皮肤细胞在衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化,并筛选出可能调控皮肤衰老的关键氧化应激相关基因 首次在单细胞水平上系统比较了年轻与老年皮肤中不同类型细胞的氧化应激反应和解毒能力差异,并识别出ANXA1和APOE作为潜在的关键调控基因 研究主要基于转录组数据分析,缺乏蛋白质水平和功能实验验证;样本量可能有限;未考虑环境因素(如紫外线)的交互影响 阐明皮肤衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化机制,识别关键调控基因 人类皮肤细胞(包括角质形成细胞、黑色素细胞、血管内皮细胞、成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和免疫细胞) 单细胞组学 皮肤衰老 单细胞RNA测序, 微阵列转录组分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
214 2025-12-12
Single-cell mapping reveals several immune subsets associated with liver metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过单细胞质谱流式技术绘制了胰腺导管腺癌(PDAC)的免疫图谱,揭示了与肝转移相关的特定免疫细胞亚群 首次在PDAC中结合多部位(原发灶、血液、淋巴结)样本进行高维单细胞分析,并识别出与肝转移潜能相关的CD103+PD-1+CD39+ T细胞减少和CD73+巨噬细胞增加的免疫特征 样本量相对较小(26个样本来自11名患者),且为观察性研究,需要更大队列验证 探究晚期PDAC肿瘤微环境中与转移相关的免疫细胞动态变化,以寻找免疫治疗新策略 胰腺导管腺癌(PDAC)患者的不同阶段组织样本(原发肿瘤、血液、淋巴结) 数字病理学 胰腺癌 单细胞质谱流式技术(CyTOF)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重荧光免疫组化 NA 单细胞蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、组织图像数据 26个样本(11个原发肿瘤组织、10个血液样本、5个淋巴结样本),来自11名PDAC患者 NA 单细胞蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA NA
215 2025-12-12
Single-cell transcriptomics reveal a hyperacute cytokine and immune checkpoint axis after cardiac arrest in patients with poor neurological outcome
2023-07-14, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了心脏骤停后神经系统预后不良患者中存在的超急性细胞因子和免疫检查点轴 首次在单细胞分辨率下定义了临床心脏骤停诱导的先天免疫网络,并识别了与不良预后相关的Nectin-2+单核细胞和Tim-3+自然杀伤细胞亚群 研究样本量未明确说明,且结论主要基于观察性数据,需要进一步实验验证 探究心脏骤停后系统性炎症反应与神经系统损伤之间的关联 心脏骤停住院患者 单细胞组学 心血管疾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
216 2025-12-11
MLKL deficiency alleviates neuroinflammation and motor deficits in the α-synuclein transgenic mouse model of Parkinson's disease
2023-12-01, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 本研究探讨了MLKL蛋白在帕金森病中的神经保护作用,通过基因敲除小鼠模型和单细胞RNA-seq分析,发现MLKL缺乏能减轻神经炎症和运动缺陷 首次在α-synuclein转基因小鼠模型中揭示MLKL缺乏对帕金森病神经炎症和运动症状的改善作用,并结合单细胞RNA-seq技术提供了细胞类型特异的转录组证据 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类患者中进行验证,且长期效应和具体分子机制需进一步探索 探究MLKL蛋白在帕金森病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 小鼠模型(Tg-Mlkl)、原代神经元细胞、人iPSC来源的中脑类器官 神经科学 帕金森病 单细胞RNA-seq 转基因小鼠模型、基因敲除模型 基因表达数据、行为数据 未明确指定样本数量,但涉及转基因小鼠、原代细胞和类器官 NA 单细胞RNA-seq NA NA
217 2025-12-11
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-10-30, Molecular omics IF:3.0Q3
研究论文 介绍了一个名为TALKIEN的在线R/Shiny应用,用于通过构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络可视化分子对话信息 开发了一个简单直观的在线工具,整合了配体-受体相互作用网络构建、系统生物学分析和下游通路展示,支持药物靶点信息 NA 旨在帮助研究人员解释分子通信,特别是通过配体-受体相互作用来预测细胞间通信 基因或蛋白质列表,代表细胞谱系 生物信息学 癌症 单细胞测序,空间转录组学 NA 基因或蛋白质列表 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
218 2025-12-11
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-09, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍(ASD)风险/致病基因,发现Wnt1内含子1中的一种新型突变,该突变导致WNT1表达降低,并在人源化大鼠模型中引发ASD样行为和中脑多巴胺能神经元发育性缺失 首次报道中脑多巴胺能神经元的发育性缺失是ASD的发病机制,并揭示异常祖细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元缺失的细胞基础 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 探索ASD的潜在致病机制,特别是遗传突变对神经发育的影响 人源化大鼠模型,重点关注中脑多巴胺能神经元 神经科学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序 NA 基因序列数据,行为数据 未明确指定样本数量,但涉及大规模基因筛查和大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
219 2025-12-10
Identification of PHACTR4 as A New Biomarker for Diabetic Nephropathy and Its Correlation with Glomerular Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2023-11, Iranian journal of kidney diseases IF:0.8Q4
研究论文 本研究通过整合微阵列和单细胞测序数据分析,鉴定出PHACTR4作为糖尿病肾病的新型生物标志物,并揭示了其与肾小球内皮功能障碍和免疫浸润的关联 首次将PHACTR4鉴定为糖尿病肾病中与肾小球内皮细胞功能障碍相关的关键生物标志物,并利用单细胞测序数据揭示了其在炎症反应中的调控作用 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏动物模型或临床样本的体内验证 鉴定与糖尿病肾病肾小球内皮细胞功能障碍相关的生物标志物 糖尿病肾病患者的基因表达数据、人肾小球内皮细胞 生物信息学 糖尿病肾病 微阵列测序, 单细胞RNA-seq, RT-PCR LASSO逻辑回归, WGCNA, ssGSEA 基因表达数据 GSE30528和GSE131882数据集(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 微阵列 NA NA
220 2025-12-07
Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts
2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术,揭示了结直肠癌肝转移微环境中SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞之间的免疫抑制性空间网络 首次在结直肠癌肝转移微环境中鉴定出具有代谢改变和泡沫细胞特征的SPP1+巨噬细胞,并发现其与成纤维细胞通过配体-受体对形成空间邻近的互作网络,共同促进免疫抑制 研究主要基于微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本,可能不适用于其他亚型;样本量相对有限,需要更大队列验证 表征结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞组成和相互作用,以理解免疫抑制机制 结直肠癌肝转移组织、配对正常肝组织及外周血单个核细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、多重空间成像、批量基因表达与细胞反卷积分析 NA 单细胞转录组数据、空间成像数据、批量基因表达数据 一系列微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本及配对组织 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
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