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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2161 | 2024-08-05 |
Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution
2023-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/VJGB-23-94
PMID:38213707
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研究论文 | 本文探讨了癌症内肿瘤异质性的演变及其模型 | 提出了从进化理论的角度理解肿瘤作为复杂生态系统的观点 | 未具体细述不同方法的局限性 | 旨在揭示影响肿瘤异质性的机制以改善癌症治疗 | 探索肿瘤内的遗传和表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序,荧光原位杂交,单细胞测序 | 计算模型和算法 | 基因组数据,单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2162 | 2024-08-05 |
Integration of clinical characteristics and molecular signatures of the tumor microenvironment to predict the prognosis of neuroblastoma
2023-11, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02372-x
PMID:37712965
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研究论文 | 本研究旨在分析神经母细胞瘤的临床特征、细胞类型和肿瘤微环境的分子特征,以更好地预测预后 | 建立了基于基因特征和临床特征的多变量Cox模型,有助于更准确地预测神经母细胞瘤的预后 | 研究可能受到样本量和所用数据来源的限制 | 改善神经母细胞瘤的预后预测 | 分析498例神经母细胞瘤患者的基因表达数据和临床信息 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox模型 | 基因表达数据 | 498例神经母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2163 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals unique features of diabetogenic T cells in anti-PD-1-induced type 1 diabetes mice
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221920
PMID:37432393
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研究论文 | 该文章探讨了抗PD-1诱导的1型糖尿病小鼠中糖尿病T细胞的独特特征 | 首次比较了抗PD-1诱导的1型糖尿病与自发性1型糖尿病之间的差异 | 研究结果主要基于小鼠模型,可能无法完全转化到人类 | 了解抗PD-1治疗引发的免疫相关不良事件的特征 | 使用非肥胖型糖尿病小鼠的胰腺、胰腺引流淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞 | 使用了NOD小鼠的多种样本,包括来自胰腺和血液的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2164 | 2024-08-07 |
scGEM: Unveiling the Nested Tree-Structured Gene Co-Expressing Modules in Single Cell Transcriptome Data
2023-Aug-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15174277
PMID:37686554
|
研究论文 | 本文介绍了scGEM模型,用于揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块 | scGEM是一个嵌套树结构的非参数贝叶斯模型,能够识别和量化决定细胞类型特化和分化的潜在细胞程序 | NA | 揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块,以理解细胞功能的隐藏机制 | 单细胞转录组数据,包括外周血单个核细胞和早期脑发育细胞 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | 非参数贝叶斯模型 | 转录组数据 | 包括外周血单个核细胞、早期脑发育细胞和三阴性乳腺癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2165 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of PIT1-positive pituitary adenoma highlights the pro-tumour microenvironment mediated by IFN-γ-induced tumour-associated fibroblasts remodelling
2023-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-02126-5
PMID:36631635
|
研究论文 | 这篇文章探讨了PIT1阳性垂体腺瘤中IFN-γ诱导的肿瘤相关成纤维细胞重塑所介导的促肿瘤微环境 | 本研究揭示了PIT1-PA微环境中细胞类型的功能异质性,以及IFN-γ在肿瘤相关成纤维细胞重塑中的抗肿瘤作用 | 仍需进一步研究以完全了解PIT1-PA中肿瘤相关成纤维细胞和免疫细胞的细胞和功能异质性 | 研究PIT1-阳性垂体腺瘤中的微环境及其在肿瘤发展的作用 | 研究了四个PIT1阳性垂体腺瘤样本中的28种不同细胞亚型 | 数字病理学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个PIT1-阳性垂体腺瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2166 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78511
PMID:36724009
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了果蝇 fruitless基因表达神经元的转录组,揭示了性别特异性的表达模式和神经元功能差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇性别特异性神经元进行全面分析,揭示了性别间神经元数量和表达模式的差异 | NA | 探究果蝇性别特异性神经元的转录组特征及其在生殖行为中的作用 | 果蝇 fruitless基因表达的神经元 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 113个神经元集群 | NA | NA | NA | NA |
| 2167 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals Wolbachia-mediated modification in early stages of Drosophila spermatogenesis
2023-01-11, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2022.1963
PMID:36629101
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术,分析了感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇睾丸中的基因表达谱,揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生不同阶段的细胞中产生的影响,特别是在生殖干细胞中的基因表达调控 | 由于精子发生的复杂性和睾丸细胞类型的异质性,沃尔巴克氏菌对不同阶段精子发生细胞的具体影响机制仍需进一步研究 | 探讨沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用及其与细胞质不相容性的关联 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2168 | 2024-08-07 |
Commensal microbiome promotes hair follicle regeneration by inducing keratinocyte HIF-1α signaling and glutamine metabolism
2023-01-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7555
PMID:36598999
|
research paper | 研究揭示了共生微生物群通过诱导角质形成细胞HIF-1α信号传导和谷氨酰胺代谢促进毛囊再生的机制 | 首次发现皮肤共生细菌通过诱导角质形成细胞的谷氨酰胺代谢,增强皮肤和毛囊的再生能力 | NA | 探究组织损伤后干细胞代谢变化对再生的影响 | 皮肤共生细菌、角质形成细胞、毛囊再生 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 皮肤样本 | 小鼠和人类皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2169 | 2024-08-05 |
TrkA-mediated sensory innervation of injured mouse tendon supports tendon sheath progenitor cell expansion and tendon repair
2023-12-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ade4619
PMID:38117901
|
研究论文 | 本研究探讨外周神经在小鼠肌腱损伤与修复中的作用 | 首次揭示外周神经通过调控神经生长因子和TGFβ信号通路促进肌腱细胞的扩展与修复 | 需要进一步研究去神经化对肌腱机械负荷的潜在影响 | 研究外周神经在小鼠肌腱损伤后的修复过程中的作用 | 小鼠肌腱及其神经生长与修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小鼠以及人类肌腱活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2170 | 2024-08-07 |
Diversity of intratumoral regulatory T cells in B-cell non-Hodgkin lymphoma
2023-12-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010158
PMID:37695745
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序结合高维流式细胞术,解析了弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性 | 首次揭示了B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的三个不同转录状态,并发现激活的调节性T细胞在肿瘤组织中富集,具有更强的免疫抑制活性 | 研究主要集中在弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤,其他类型的B细胞非霍奇金淋巴瘤的调节性T细胞异质性尚未探讨 | 探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性及其对预后的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中的肿瘤内调节性T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,高维流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 两个独立的滤泡淋巴瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 2171 | 2024-08-05 |
Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis
2023-Oct-17, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00595-3
PMID:37848438
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研究论文 | 这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。 | 揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制,强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系 | 尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响 | 探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制 | 小鼠模型,研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 生物样本数据 | 涉及多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2172 | 2024-08-07 |
Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features
2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.09.288
PMID:38147960
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据以及临床信息,探讨了系统性硬化症(SSc)中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性 | 本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型,提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性 | NA | 研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性 | 系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | PRESS和GENISOS两个队列的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2173 | 2024-08-07 |
De novo hematopoiesis from the fetal lung
2023-11-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022008347
PMID:37729429
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研究论文 | 本文首次证明胎儿肺是HECs的潜在来源,这些HECs具有进行EHT以产生新生HSPCs及其后代的功能能力 | 首次描述胎儿肺中的HECs,并证明其能进行EHT产生新生HSPCs,为非骨髓造血提供新视角 | NA | 探索胎儿肺中HECs的存在及其进行EHT的能力 | 胎儿肺中的HECs及其进行EHT的能力 | 生物医学 | NA | scRNA-seq, 流式细胞术, 小分子调制 | NA | 细胞 | 小鼠和人类胎儿肺的组织培养 | NA | NA | NA | NA |
| 2174 | 2024-08-05 |
Dicoumarol is an effective post-exposure prophylactic for SARS-CoV-2 Omicron infection in human airway epithelium
2023-06-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01511-7
PMID:37301869
|
研究论文 | 本研究表明,双香豆素(DCM)对多种Omicron变种的SARS-CoV-2感染具有显著的抗病毒活性 | 研究揭示了DCM作为一种自然抗凝血剂在抑制SARS-CoV-2的潜在机制,以及其在COVID-19后暴露预防中的有效性 | 研究未明确DCM对病毒吸收、外排和传播的影响,也未直接消除病毒 | 探索现有药物在抑制SARS-CoV-2感染中的应用 | 主要人类气道上皮细胞(AECs) | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序分析和免疫荧光染色 | NA | 细胞 | 77,969个来自10名健康志愿者的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2175 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in glioblastoma: is knowing the right zip code the key to the next therapeutic breakthrough?
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1266397
PMID:37916170
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review | 本文探讨了空间转录组学在胶质母细胞瘤研究中的应用 | 提出空间转录组学为研究胶质母细胞瘤及其周围脑组织的空间组织提供了新视角 | 仅讨论了当前的研究现状和未来方向,缺乏实证数据支持 | 研究空间转录组学在胶质母细胞瘤中的应用以理解其空间组织 | 胶质母细胞瘤及其与周围脑组织的相互作用 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2176 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis identifies phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase as a target in ulcerative colitis
2023-Dec-28, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v29.i48.6222
PMID:38186864
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析溃疡性结肠炎患者的细胞互作和分子特征,发现磷赖氨酸磷组氨酸无机焦磷酸磷酸酶(LHPP)在炎症调控中的潜在作用。 | 本研究首次揭示了LHPP在溃疡性结肠炎中的下调与炎症反应的负相关性,并提出LHPP作为治疗溃疡性结肠炎的潜在靶点。 | NA | 利用单细胞RNA测序技术解析溃疡性结肠炎病理中的细胞互作和分子特征。 | 溃疡性结肠炎患者的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 溃疡性结肠炎患者的组织和血浆样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2177 | 2024-08-05 |
Single-cell Analysis Reveals Inter- and Intratumour Heterogeneity in Metastatic Breast Cancer
2023-12-08, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09551-z
PMID:38066300
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研究论文 | 本研究揭示了转移性乳腺癌中的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序识别了与转移相关的分子机制,尤其是在肿瘤和转移细胞状态之间的平衡 | 未深入探讨所有潜在的分子机制,且样本来源于特定的患者衍生模型 | 识别转移过程中,特别是在肿瘤细胞群体形成过程中分子机制 | 乳腺癌患者衍生异种移植物的肿瘤及匹配的肺宏转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA数据 | 来源于五种转移性乳腺癌模型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2178 | 2024-08-07 |
Regulating the cell shift of endothelial cell-like myofibroblasts in pulmonary fibrosis
2023-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01799-2022
PMID:36758986
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研究论文 | 本研究通过创建新的肺纤维化小鼠模型,发现并证实了正常肺组织中存在一种未知的内皮细胞样肌成纤维细胞,并探讨了其在肺纤维化中的作用及机制 | 首次发现并证实了正常肺组织中的内皮细胞样肌成纤维细胞,并揭示了其在肺纤维化中的作用机制 | NA | 揭示内皮细胞样肌成纤维细胞在肺纤维化中的分化机制,并探索新的治疗策略 | 内皮细胞样肌成纤维细胞及其在肺纤维化中的作用 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠模型及人类肺纤维化样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2179 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/9856458
PMID:38189006
|
撤回 | 该文章涉及对肌腱损伤发病机制的单细胞转录组学分析 | NA | NA | 研究肌腱损伤的发病机制 | 肌腱损伤的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2180 | 2024-08-05 |
New perspectives on biology, disease progression, and therapy response of head and neck cancer gained from single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.044774
PMID:38188682
|
综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在头颈癌中的应用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法,揭示了肿瘤微环境中不同细胞群体之间的异质性和细胞间通信 | 未提及特定的实验或临床数据,可能限制了理论与实际的结合 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学对头颈癌的认识 | 头颈鳞状细胞癌及其微环境中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |