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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals Wolbachia-mediated modification in early stages of Drosophila spermatogenesis
2023-01-11, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2022.1963
PMID:36629101
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术,分析了感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇睾丸中的基因表达谱,揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生不同阶段的细胞中产生的影响,特别是在生殖干细胞中的基因表达调控 | 由于精子发生的复杂性和睾丸细胞类型的异质性,沃尔巴克氏菌对不同阶段精子发生细胞的具体影响机制仍需进一步研究 | 探讨沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用及其与细胞质不相容性的关联 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2142 | 2024-08-07 |
Commensal microbiome promotes hair follicle regeneration by inducing keratinocyte HIF-1α signaling and glutamine metabolism
2023-01-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7555
PMID:36598999
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research paper | 研究揭示了共生微生物群通过诱导角质形成细胞HIF-1α信号传导和谷氨酰胺代谢促进毛囊再生的机制 | 首次发现皮肤共生细菌通过诱导角质形成细胞的谷氨酰胺代谢,增强皮肤和毛囊的再生能力 | NA | 探究组织损伤后干细胞代谢变化对再生的影响 | 皮肤共生细菌、角质形成细胞、毛囊再生 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 皮肤样本 | 小鼠和人类皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2143 | 2024-08-05 |
TrkA-mediated sensory innervation of injured mouse tendon supports tendon sheath progenitor cell expansion and tendon repair
2023-12-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ade4619
PMID:38117901
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研究论文 | 本研究探讨外周神经在小鼠肌腱损伤与修复中的作用 | 首次揭示外周神经通过调控神经生长因子和TGFβ信号通路促进肌腱细胞的扩展与修复 | 需要进一步研究去神经化对肌腱机械负荷的潜在影响 | 研究外周神经在小鼠肌腱损伤后的修复过程中的作用 | 小鼠肌腱及其神经生长与修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小鼠以及人类肌腱活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2144 | 2024-08-07 |
Diversity of intratumoral regulatory T cells in B-cell non-Hodgkin lymphoma
2023-12-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010158
PMID:37695745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序结合高维流式细胞术,解析了弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性 | 首次揭示了B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的三个不同转录状态,并发现激活的调节性T细胞在肿瘤组织中富集,具有更强的免疫抑制活性 | 研究主要集中在弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤,其他类型的B细胞非霍奇金淋巴瘤的调节性T细胞异质性尚未探讨 | 探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性及其对预后的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中的肿瘤内调节性T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,高维流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 两个独立的滤泡淋巴瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 2145 | 2024-08-05 |
Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis
2023-Oct-17, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00595-3
PMID:37848438
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研究论文 | 这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。 | 揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制,强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系 | 尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响 | 探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制 | 小鼠模型,研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 生物样本数据 | 涉及多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2146 | 2024-08-07 |
Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features
2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.09.288
PMID:38147960
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据以及临床信息,探讨了系统性硬化症(SSc)中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性 | 本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型,提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性 | NA | 研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性 | 系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | PRESS和GENISOS两个队列的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2147 | 2024-08-07 |
De novo hematopoiesis from the fetal lung
2023-11-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022008347
PMID:37729429
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研究论文 | 本文首次证明胎儿肺是HECs的潜在来源,这些HECs具有进行EHT以产生新生HSPCs及其后代的功能能力 | 首次描述胎儿肺中的HECs,并证明其能进行EHT产生新生HSPCs,为非骨髓造血提供新视角 | NA | 探索胎儿肺中HECs的存在及其进行EHT的能力 | 胎儿肺中的HECs及其进行EHT的能力 | 生物医学 | NA | scRNA-seq, 流式细胞术, 小分子调制 | NA | 细胞 | 小鼠和人类胎儿肺的组织培养 | NA | NA | NA | NA |
| 2148 | 2024-08-05 |
Dicoumarol is an effective post-exposure prophylactic for SARS-CoV-2 Omicron infection in human airway epithelium
2023-06-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01511-7
PMID:37301869
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研究论文 | 本研究表明,双香豆素(DCM)对多种Omicron变种的SARS-CoV-2感染具有显著的抗病毒活性 | 研究揭示了DCM作为一种自然抗凝血剂在抑制SARS-CoV-2的潜在机制,以及其在COVID-19后暴露预防中的有效性 | 研究未明确DCM对病毒吸收、外排和传播的影响,也未直接消除病毒 | 探索现有药物在抑制SARS-CoV-2感染中的应用 | 主要人类气道上皮细胞(AECs) | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序分析和免疫荧光染色 | NA | 细胞 | 77,969个来自10名健康志愿者的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2149 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in glioblastoma: is knowing the right zip code the key to the next therapeutic breakthrough?
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1266397
PMID:37916170
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review | 本文探讨了空间转录组学在胶质母细胞瘤研究中的应用 | 提出空间转录组学为研究胶质母细胞瘤及其周围脑组织的空间组织提供了新视角 | 仅讨论了当前的研究现状和未来方向,缺乏实证数据支持 | 研究空间转录组学在胶质母细胞瘤中的应用以理解其空间组织 | 胶质母细胞瘤及其与周围脑组织的相互作用 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2150 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis identifies phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase as a target in ulcerative colitis
2023-Dec-28, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v29.i48.6222
PMID:38186864
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析溃疡性结肠炎患者的细胞互作和分子特征,发现磷赖氨酸磷组氨酸无机焦磷酸磷酸酶(LHPP)在炎症调控中的潜在作用。 | 本研究首次揭示了LHPP在溃疡性结肠炎中的下调与炎症反应的负相关性,并提出LHPP作为治疗溃疡性结肠炎的潜在靶点。 | NA | 利用单细胞RNA测序技术解析溃疡性结肠炎病理中的细胞互作和分子特征。 | 溃疡性结肠炎患者的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 溃疡性结肠炎患者的组织和血浆样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2151 | 2024-08-05 |
Single-cell Analysis Reveals Inter- and Intratumour Heterogeneity in Metastatic Breast Cancer
2023-12-08, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09551-z
PMID:38066300
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研究论文 | 本研究揭示了转移性乳腺癌中的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序识别了与转移相关的分子机制,尤其是在肿瘤和转移细胞状态之间的平衡 | 未深入探讨所有潜在的分子机制,且样本来源于特定的患者衍生模型 | 识别转移过程中,特别是在肿瘤细胞群体形成过程中分子机制 | 乳腺癌患者衍生异种移植物的肿瘤及匹配的肺宏转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA数据 | 来源于五种转移性乳腺癌模型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2152 | 2024-08-07 |
Regulating the cell shift of endothelial cell-like myofibroblasts in pulmonary fibrosis
2023-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01799-2022
PMID:36758986
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研究论文 | 本研究通过创建新的肺纤维化小鼠模型,发现并证实了正常肺组织中存在一种未知的内皮细胞样肌成纤维细胞,并探讨了其在肺纤维化中的作用及机制 | 首次发现并证实了正常肺组织中的内皮细胞样肌成纤维细胞,并揭示了其在肺纤维化中的作用机制 | NA | 揭示内皮细胞样肌成纤维细胞在肺纤维化中的分化机制,并探索新的治疗策略 | 内皮细胞样肌成纤维细胞及其在肺纤维化中的作用 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠模型及人类肺纤维化样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2153 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/9856458
PMID:38189006
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撤回 | 该文章涉及对肌腱损伤发病机制的单细胞转录组学分析 | NA | NA | 研究肌腱损伤的发病机制 | 肌腱损伤的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2154 | 2024-08-05 |
New perspectives on biology, disease progression, and therapy response of head and neck cancer gained from single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.044774
PMID:38188682
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综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在头颈癌中的应用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法,揭示了肿瘤微环境中不同细胞群体之间的异质性和细胞间通信 | 未提及特定的实验或临床数据,可能限制了理论与实际的结合 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学对头颈癌的认识 | 头颈鳞状细胞癌及其微环境中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2155 | 2024-08-07 |
GAPDH: unveiling its impact as a key hypoxia-related player in head and neck squamous cell carcinoma tumor progression, prognosis, and therapeutic potential
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38187058
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研究论文 | 本文探讨了糖酵解酶GAPDH在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用,特别是在不同缺氧条件下的功能和治疗潜力 | 首次详细分析了GAPDH在HNSCC中的表达与患者生存率、免疫细胞浸润及药物疗效的关系 | 研究主要基于现有数据库和细胞系实验,未涉及临床试验验证 | 揭示GAPDH在HNSCC中的生物学功能及其对肿瘤进展、预后和治疗潜力的影响 | GAPDH在HNSCC中的表达及其与缺氧条件的关系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GSE29330、GSE41613和GSE139324等多个数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2156 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of senescence-related genes and immune infiltration in intervertebral disc degeneration: a meta-data approach utilizing bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1296782
PMID:38187091
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研究论文 | 本研究旨在通过分析大量和单细胞RNA测序数据,识别与椎间盘退变相关的衰老基因及其潜在调控机制 | 本研究通过结合大量和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于关键衰老相关差异表达基因和免疫细胞浸润的诊断模型,为椎间盘退变的发病机制和免疫治疗策略提供了新的见解 | NA | 识别与椎间盘退变相关的关键衰老基因及其潜在调控机制 | 椎间盘退变(IDD)的衰老基因和免疫浸润 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | RNA测序 | lasso回归 | RNA测序数据 | 涉及GSE34095和GSE70362数据集以及单细胞数据集GSE165722 | NA | NA | NA | NA |
| 2157 | 2024-08-07 |
The origins and dynamic changes of C3- and S100A10-positive reactive astrocytes after spinal cord injury
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1276506
PMID:38188669
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠和谱系追踪技术,探讨了脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | 首次详细描述了C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞在脊髓损伤后的起源和动态变化过程 | NA | 确定脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞 | NA | 脊髓损伤 | RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 幼年和成年脊髓损伤小鼠模型及培养的星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2158 | 2024-08-07 |
Computational identification of key transcription factors for embryonic and postnatal Sox2+ dental epithelial stem cell
2023-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573158
PMID:38187542
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研究论文 | 本文通过计算方法识别了胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞的关键转录因子 | 利用Smart-Seq2协议和ATAC-seq协议生成P2牙上皮干细胞的转录组和染色质可及性图谱,并系统地识别了E11.5细胞和P2细胞的关键转录因子 | 由于DESC标记物的表达水平过低或DESC在整体牙齿中的比例过低,之前的单细胞RNA测序实验未能明确识别出DESC集群 | 研究牙上皮干细胞的基因表达和染色质可及性特征,以识别关键转录因子 | 胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞 | NA | NA | Smart-Seq2, ATAC-seq | NA | 转录组, 染色质可及性图谱 | E11.5 Sox2+牙上皮细胞和P2牙上皮干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2159 | 2024-08-07 |
Transcriptomic Landscape of Prurigo Nodularis Lesional Skin CD3+ T Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.011
PMID:37263486
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2160 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics uncover sucrose post-phloem transport during maize kernel development
2023-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43006-7
PMID:37938556
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了玉米籽粒发育过程中蔗糖的后韧运输 | 首次利用空间转录组学分析玉米籽粒发育阶段,识别了11个细胞群体和332个分子标记基因 | 本研究主要集中于玉米籽粒的特定时段,可能无法概括其他发育阶段 | 揭示玉米籽粒中各细胞群体的基因表达及其功能 | 玉米籽粒的母体组织、后代胚胎和后代胚乳 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |