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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2121 | 2024-08-05 |
Targeting neuropilin-1 abolishes anti-PD-1-upregulated regulatory T cells and synergizes with 4-1BB agonist for liver cancer treatment
2023-11-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000320
PMID:36811396
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研究论文 | 本研究探讨了神经元细胞膜蛋白-1对抗PD-1上调的调节性T细胞的影响,并与4-1BB激动剂协同用于肝癌治疗 | 揭示了抗PD-1治疗通过神经元细胞膜蛋白-1调节肝细胞癌中的调节性T细胞积累的潜在机制 | 研究可能未对所有肝癌模型进行广泛验证,可能限制了结果的普遍性 | 探讨调节性T细胞在肝细胞癌治疗中的作用及其与抗PD-1和4-1BB激动剂的协同效果 | 主要研究肝细胞癌(HCC)中的调节性T细胞及其与抗PD-1治疗的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | 人源化肝细胞癌模型 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2122 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of liver fine-needle aspirates captures immune diversity in the blood and liver in chronic hepatitis B patients
2023-11-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000438
PMID:37158243
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,通过肝细针穿刺获取慢性乙型肝炎患者的血液和肝脏样本,比较了两种单细胞RNA测序技术(Seq-Well S3和10× Chromium)在捕捉肝脏细胞多样性方面的效果,并分析了不同细胞类型在血液和肝脏中的转录组差异。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术,系统比较了慢性乙型肝炎患者血液和肝脏的免疫细胞多样性,并发现Seq-Well S3技术能有效捕捉到10× Chromium技术未能捕捉到的中性粒细胞。 | 研究主要依赖于两种特定的单细胞RNA测序技术,可能存在技术偏倚;此外,样本量未在摘要中明确提及,可能影响研究结果的普遍性。 | 克服肝脏采样的实际障碍,通过细针穿刺和单细胞RNA测序技术,全面比较慢性乙型肝炎患者血液和肝脏的免疫细胞多样性。 | 慢性乙型肝炎患者的血液和肝脏样本。 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2123 | 2024-08-07 |
Identification and characterization of a hepatic IL-13-producing ILC3-like population potentially involved in liver fibrosis
2023-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000350
PMID:37029085
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研究论文 | 本文详细研究了人体肝脏中的固有淋巴细胞(ILCs)在健康和纤维化肝脏中的组成及其在慢性肝病中的潜在作用 | 发现了一种先前未被描述的IL-13产生型ILC3样细胞亚群,该细胞在人体肝脏中富集,可能参与调节慢性肝病 | NA | 研究肝脏中固有淋巴细胞的组成及其在慢性肝病中的作用 | 肝脏中的固有淋巴细胞(ILCs) | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共分析了50个肝脏样本(非纤维化=22,纤维化=29),以及结肠和扁桃体组织(各14个)和外周血(32个) | NA | NA | NA | NA |
| 2124 | 2024-08-07 |
A neuroepithelial wave of BMP signalling drives anteroposterior specification of the tuberal hypothalamus
2023-02-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83133
PMID:36718990
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研究论文 | 本研究结合实验和生物信息学方法,探讨了胚胎期鸡的管状下丘脑前-后方向的生成机制 | 首次揭示了神经上皮来源的BMP信号波在胚胎发育中驱动管状下丘脑前-后方向特化的过程 | NA | 阐明管状下丘脑在胚胎发育中的细胞和信号通路特化机制 | 管状下丘脑的生成过程及其调控机制 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 胚胎期鸡 | NA | NA | NA | NA |
| 2125 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncovers cellular architecture and developmental trajectories in hepatoblastoma
2023-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32775
PMID:36059151
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研究论文 | 本研究揭示了肝母细胞瘤的细胞结构和发育轨迹 | 利用单细胞转录组分析,建立了肝母细胞瘤的细胞层级和亚型分类方法 | 基于仅五名患者的样本,样本量较小 | 探讨肝母细胞瘤的肿瘤发生机制及其异质性 | 肝母细胞瘤患者的肿瘤及配对远端肝组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 五名肝母细胞瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2126 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2023-May-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2880248/v1
PMID:37293022
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肾纤维化中活化成纤维细胞的转录特征,并识别了新的持久远端小管损伤模式 | 首次确定了三种具有特定转录特征的成纤维细胞簇,并识别了肾小管损伤的新空间模式 | 研究未提及样本数量及其具体来源 | 深入理解肾纤维化的分子机制和促进靶向策略的开发 | 分析了两种与临床相关的肾纤维化模型中的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2127 | 2024-08-07 |
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537573
PMID:37131612
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研究论文 | 本文研究了RhoA GEF Mcf2lb在多细胞迁移过程中对花环结构完整性的调控作用 | 首次揭示了Mcf2lb通过激活RhoA调控细胞顶端收缩,从而影响花环结构的形成和维持 | NA | 探究花环结构形成和维持的分子机制 | RhoA GEF Mcf2lb在多细胞花环结构中的作用 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 图像 | 约150个细胞组成的斑马鱼后侧线原基(pLLP) | NA | NA | NA | NA |
| 2128 | 2024-08-07 |
Phospholipase A2 Group IIA Is Associated with Inflammatory Hepatocellular Adenoma
2023-Dec-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010159
PMID:38201587
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研究论文 | 本研究旨在全面调查肝细胞腺瘤(HCA)的亚型分类,并比较分析HCA和肝细胞癌(HCC)组织之间的基因表达谱 | 发现磷脂酶A2组IIA(PLA2G2A)mRNA在炎症性HCA中特异性表达,这可能有助于炎症性HCA的新定义 | 研究结果需要通过其他新鲜HCA样本进行验证 | 研究HCA的亚型分类及其与HCC的基因表达差异 | 炎症性HCA、非B非C HCC、乙型肝炎病毒相关HCC及正常肝组织 | NA | 肝细胞腺瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 1个炎症性HCA,3个非B非C HCC,2个乙型肝炎病毒相关HCC,1个正常肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2129 | 2024-08-07 |
A new insight of immunosuppressive microenvironment in osteosarcoma lung metastasis
2023-06, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231171900
PMID:37439349
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据,揭示了骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境的复杂性 | 首次详细分类了骨肉瘤肺转移中的17个细胞集群,并发现CD63在决定T细胞和恶性细胞浸润中的关键作用 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据,可能存在样本选择偏倚 | 探讨骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境,为精准治疗提供依据 | 骨肉瘤肺转移的细胞集群及其免疫特性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 75,317个细胞,来自两个骨肉瘤肺转移和五个正常肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2130 | 2024-08-05 |
Biomarkers in Cancer Detection, Diagnosis, and Prognosis
2023-Dec-20, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s24010037
PMID:38202898
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综述 | 该论文描述了在癌症检测和诊断中适用的各种生物标志物 | 该文综述了影像学、血液、细胞成像、组织成像和基因方面的生物标志物在癌症中的应用 | 该文未提及研究的具体限制 | 探讨生物标志物在癌症检测、诊断和预后中的重要性 | 文中涉及的研究对象包括用于癌症检测和诊断的各种生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 影像学诊断、血基生物标志物、细胞成像、组织成像、基因组测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2131 | 2024-08-07 |
Machine Learning and Single-Cell Analysis Identify Molecular Features of IPF-Associated Fibroblast Subtypes and Their Implications on IPF Prognosis
2023-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010094
PMID:38203265
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研究论文 | 本研究旨在系统分类纤维母细胞群体,揭示纤维化肺组织中纤维母细胞亚型的分子和生物学特征,并建立与IPF相关的纤维母细胞相关预测模型 | 本研究首次使用scRNA-seq数据和hdWGCNA技术,识别出与IPF相关的纤维母细胞亚型及其共表达基因模块,并构建了基于机器学习的IPF纤维母细胞相关预测模型 | NA | 系统分类纤维母细胞群体,揭示其分子和生物学特征,并建立IPF相关的预测模型 | 纤维化肺组织中的纤维母细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, hdWGCNA | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自正常和IPF患者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2132 | 2024-08-07 |
Transcriptomic analysis of sorted lung cells revealed a proviral activity of the NF-κB pathway toward SARS-CoV-2
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108449
PMID:38213785
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研究论文 | 本研究通过深度polyA+转录组分析和新型RNA分析,研究了严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染的肺上皮细胞的转录组变化 | 本研究首次揭示了NF-κB通路在SARS-CoV-2感染中的促病毒作用,并发现了CYLD作为该通路的负调控因子具有抗病毒活性 | 研究主要集中在细胞水平,未涉及临床样本或动物模型 | 探讨SARS-CoV-2感染肺上皮细胞的转录组响应和相关调控机制 | SARS-CoV-2感染的肺上皮细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2133 | 2024-08-07 |
FEZ1 participates in human embryonic brain development by modulating neuronal progenitor subpopulation specification and migrations
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108497
PMID:38213789
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研究论文 | 本研究探讨了FEZ1蛋白在人类胚胎大脑发育中的作用,特别是在神经前体细胞亚群的分化和迁移中的作用 | 首次使用人类大脑类器官(hCOs)研究FEZ1在早期大脑发育中的表达及其对神经和突触发育基因表达的影响 | NA | 研究FEZ1在人类胚胎大脑发育中的作用及其对神经发育障碍的影响 | FEZ1蛋白及其在神经前体细胞亚群分化和迁移中的作用 | NA | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2134 | 2024-08-05 |
Uncovering the Genetic Basis of Congenital Heart Disease: Recent Advancements and Implications for Clinical Management
2023-Dec, CJC pediatric and congenital heart disease
DOI:10.1016/j.cjcpc.2023.10.008
PMID:38205435
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研究论文 | 本研究揭示了先天性心脏病的遗传基础及其对临床管理的影响 | 指出了基因组测序技术对理解先天性心脏病遗传基础的变革性影响 | 临床基于这些因素的风险预测仍然面临挑战 | 旨在深入理解先天性心脏病的遗传基础,以改善临床结果 | 分析先天性心脏病相关的遗传变异与临床结果之间的关联 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序技术 | 人诱导多能干细胞模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2135 | 2024-08-05 |
Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution
2023-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/VJGB-23-94
PMID:38213707
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研究论文 | 本文探讨了癌症内肿瘤异质性的演变及其模型 | 提出了从进化理论的角度理解肿瘤作为复杂生态系统的观点 | 未具体细述不同方法的局限性 | 旨在揭示影响肿瘤异质性的机制以改善癌症治疗 | 探索肿瘤内的遗传和表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序,荧光原位杂交,单细胞测序 | 计算模型和算法 | 基因组数据,单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2136 | 2024-08-05 |
Integration of clinical characteristics and molecular signatures of the tumor microenvironment to predict the prognosis of neuroblastoma
2023-11, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02372-x
PMID:37712965
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研究论文 | 本研究旨在分析神经母细胞瘤的临床特征、细胞类型和肿瘤微环境的分子特征,以更好地预测预后 | 建立了基于基因特征和临床特征的多变量Cox模型,有助于更准确地预测神经母细胞瘤的预后 | 研究可能受到样本量和所用数据来源的限制 | 改善神经母细胞瘤的预后预测 | 分析498例神经母细胞瘤患者的基因表达数据和临床信息 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox模型 | 基因表达数据 | 498例神经母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2137 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals unique features of diabetogenic T cells in anti-PD-1-induced type 1 diabetes mice
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221920
PMID:37432393
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研究论文 | 该文章探讨了抗PD-1诱导的1型糖尿病小鼠中糖尿病T细胞的独特特征 | 首次比较了抗PD-1诱导的1型糖尿病与自发性1型糖尿病之间的差异 | 研究结果主要基于小鼠模型,可能无法完全转化到人类 | 了解抗PD-1治疗引发的免疫相关不良事件的特征 | 使用非肥胖型糖尿病小鼠的胰腺、胰腺引流淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞 | 使用了NOD小鼠的多种样本,包括来自胰腺和血液的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2138 | 2024-08-07 |
scGEM: Unveiling the Nested Tree-Structured Gene Co-Expressing Modules in Single Cell Transcriptome Data
2023-Aug-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15174277
PMID:37686554
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研究论文 | 本文介绍了scGEM模型,用于揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块 | scGEM是一个嵌套树结构的非参数贝叶斯模型,能够识别和量化决定细胞类型特化和分化的潜在细胞程序 | NA | 揭示单细胞转录组数据中的基因共表达模块,以理解细胞功能的隐藏机制 | 单细胞转录组数据,包括外周血单个核细胞和早期脑发育细胞 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | 非参数贝叶斯模型 | 转录组数据 | 包括外周血单个核细胞、早期脑发育细胞和三阴性乳腺癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2139 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of PIT1-positive pituitary adenoma highlights the pro-tumour microenvironment mediated by IFN-γ-induced tumour-associated fibroblasts remodelling
2023-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-02126-5
PMID:36631635
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研究论文 | 这篇文章探讨了PIT1阳性垂体腺瘤中IFN-γ诱导的肿瘤相关成纤维细胞重塑所介导的促肿瘤微环境 | 本研究揭示了PIT1-PA微环境中细胞类型的功能异质性,以及IFN-γ在肿瘤相关成纤维细胞重塑中的抗肿瘤作用 | 仍需进一步研究以完全了解PIT1-PA中肿瘤相关成纤维细胞和免疫细胞的细胞和功能异质性 | 研究PIT1-阳性垂体腺瘤中的微环境及其在肿瘤发展的作用 | 研究了四个PIT1阳性垂体腺瘤样本中的28种不同细胞亚型 | 数字病理学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个PIT1-阳性垂体腺瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2140 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78511
PMID:36724009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了果蝇 fruitless基因表达神经元的转录组,揭示了性别特异性的表达模式和神经元功能差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇性别特异性神经元进行全面分析,揭示了性别间神经元数量和表达模式的差异 | NA | 探究果蝇性别特异性神经元的转录组特征及其在生殖行为中的作用 | 果蝇 fruitless基因表达的神经元 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 113个神经元集群 | NA | NA | NA | NA |