单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 2001 - 2020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2001 | 2024-08-04 |
Multi-transcriptomics reveals brain cellular responses to peripheral infection in Alzheimer's disease model mice
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112785
PMID:37436901
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研究论文 | 本研究揭示了外周感染对阿尔茨海默病模型小鼠大脑细胞反应的影响 | 通过多转录组技术，识别了与脑屏障功能和神经炎症相关的细胞类型和空间特异性转录变化 | 研究主要集中于特定的感染模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨外周轻度感染如何影响阿尔茨海默病相关的脑转录组和病理变化 | APP/PS1小鼠模型，及其在遭受金黄色葡萄球菌感染后的反应 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2002 | 2024-08-07 |
Functional interrogation of lymphocyte subsets in alopecia areata using single-cell RNA sequencing
2023-07-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2305764120
PMID:37428932
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了斑秃（Alopecia areata, AA）中皮肤浸润免疫细胞的异质性，并探讨了特定细胞类型在AA中的功能作用 | 首次系统地揭示了AA中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病发展中的关键作用，为AA的治疗策略提供了新的框架 | 研究主要基于C3H/HeJ小鼠模型，未来研究需要进一步验证在人类AA中的发现 | 深入理解斑秃的免疫学基础，为开发新的治疗策略提供依据 | 斑秃中的淋巴细胞亚群及其功能 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及C3H/HeJ小鼠模型及人类AA皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2003 | 2024-08-04 |
Disentangling brain vasculature in neurogenesis and neurodegeneration using single-cell transcriptomics
2023-07, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.04.007
PMID:37210315
|
评论 | 这篇文章主要探讨了利用单细胞转录组学研究脑血管在神经发生和神经退行性疾病中的作用 | 创新点在于利用单细胞转录组学揭示了血管细胞的亚型及其在胚胎和成年大脑中的组织和分区 | 该文章没有提供具体实验证据来支持所讨论的观点 | 研究神经血管相互作用在健康和疾病中的影响 | 主要研究胚胎和成年大脑中的血管细胞及其功能 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2004 | 2024-08-04 |
Spatial single-cell sequencing of meiosis I arrested oocytes indicates acquisition of maternal transcripts from the soma
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112544
PMID:37227820
|
研究论文 | 本研究探讨了在减数分裂I期被抑制的卵母细胞中母源转录本的获得 | 揭示了邻近体细胞转录本的获取作为减数分裂I期抑制期间转录本增加的机制 | 未确定环境或激素信号对处于减数分裂I期抑制的卵母细胞是否可以启动新转录 | 研究减数分裂I期被抑制的卵母细胞的转录本获取机制 | C. elegans 减数分裂I期抑制的卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2005 | 2024-08-07 |
Transcriptional dynamics of delaminating neuroblasts in the mouse otic vesicle
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112545
PMID:37227818
|
研究论文 | 本文通过高深度单细胞RNA测序分析了E10.5小鼠耳泡及其周围组织，揭示了耳泡标记物和基因表达变化，从神经母细胞脱离到CVG发育的过程。 | 提供了关于CVG发育机制的新数据集，有助于进一步识别与CVG发育相关的机制。 | NA | 深入理解参与CVG发育的转录级联反应，为治疗内耳功能障碍提供见解。 | 小鼠耳泡中的CVG前体神经母细胞和新兴的CVG神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E10.5小鼠耳泡及其周围组织的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2006 | 2024-08-07 |
Dynamic interplay between IL-1 and WNT pathways in regulating dermal adipocyte lineage cells during skin development and wound regeneration
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112647
PMID:37330908
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了发育中或受伤的小鼠皮肤中的真皮成纤维细胞（dFBs），并探讨了IL-1和WNT信号通路在调控真皮脂肪细胞谱系细胞中的作用 | 首次详细描述了IL-1和WNT信号通路在真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性中的分子机制 | NA | 揭示真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性背后的分子机制，并为缺陷性伤口愈合和瘢痕形成定义潜在的治疗靶点 | 真皮成纤维细胞（dFBs）及其在皮肤发育和伤口再生中的分化和去分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2007 | 2024-08-04 |
Inhibition of a signaling modality within the gp130 receptor enhances tissue regeneration and mitigates osteoarthritis
2023-03-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq2395
PMID:36947594
|
研究论文 | 该研究探讨了gp130受体内一种信号方式的抑制如何促进组织再生并减轻骨关节炎 | 通过对gp130的Y814位点的遗传和药理干预，首次明确了其在组织再生中的关键作用 | 研究主要集中于小鼠和大鼠，可能无法完全应用于人体 | 旨在探讨如何增强组织再生能力和减轻骨关节炎的机制 | 研究对象为gp130受体及其在小鼠和大鼠模型中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 药理调节和基因编辑 | 小鼠模型和大鼠模型 | 单细胞测序数据 | 小鼠和大鼠的样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 2008 | 2024-08-04 |
A cofunctional grouping-based approach for non-redundant feature gene selection in unannotated single-cell RNA-seq analysis
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad042
PMID:36754847
|
研究论文 | 本研究开发了一种新颖的计算方法GeneClust，用于选择scRNA-seq细胞聚类的特征基因 | 该方法通过基因表达谱对基因进行分组，并旨在最大化相关性、最小化冗余和保持互补性 | 未提及研究限制 | 研究目标是改善单细胞RNA测序分析中的细胞聚类性能 | 研究对象是在未注释的单细胞RNA测序数据集中的特征基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2009 | 2024-08-07 |
Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023-02, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.TEC.2022.0189
PMID:36719780
|
研究论文 | 本文介绍了一种简单且商业可用的方法，用于从组织工程血管移植物（TEVG）中分离细胞，以便进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，并揭示了参与TEVG早期新生组织重塑阶段的细胞亚群。 | 首次描述了植入的组织工程血管移植物在单细胞基因表达水平上的细胞组成，并展示了磁性细胞分离技术在生成高质量细胞悬液用于scRNA-Seq分析中的有效性。 | 该方法主要针对使用可生物降解合成材料作为支架成分的其他可植入材料，其广泛适用性尚需进一步验证。 | 利用单细胞RNA测序技术深入了解组织工程血管移植物的细胞组成和基因表达异质性，特别是在新生组织形成和重塑过程中的应用。 | 组织工程血管移植物（TEVG）中的细胞分离和单细胞RNA测序分析。 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2010 | 2024-08-04 |
Integration of Single-Cell RNA-Sequencing and Network Analysis to Investigate Mechanisms of Drug Resistance
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3163-8_7
PMID:37191792
|
研究论文 | 本研究探讨了抗癌药物耐药机制的单细胞RNA测序与网络分析的结合 | 提出了一种通过单细胞RNA测序结合网络分析的新方法，以识别与药物耐药相关的通路 | 未在摘要中提供具体的实验数据或样本限制信息 | 探索抗癌药物耐药的机制以发展替代治疗方法 | 药物敏感和耐药变体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PANDA | 表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2011 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of neurofibromas reveals a tumor microenvironment favorable for neural regeneration and immune suppression in a neurofibromatosis type 1 porcine model
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1253659
PMID:37817770
|
研究论文 | 本研究揭示了神经纤维瘤的细胞组成和信号传导，强调其肿瘤微环境对神经再生及免疫抑制的影响 | 首次在神经纤维瘤动物模型中观察到肿瘤相关的树突状细胞，并识别到新的成纤维细胞和免疫细胞群体 | 尚未探索成熟、非皮肤神经纤维瘤中的细胞信号网络 | 旨在探讨神经纤维瘤的细胞组成及其与正常组织的信号传导对比 | 研究对象为猪模型中的成熟神经纤维瘤及其相邻正常组织 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 猪模型中的多个成熟神经纤维瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2012 | 2024-08-07 |
Immunological Analysis of Cryptococcal Meningoencephalitis in a Murine Model
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3199-7_5
PMID:37145276
|
研究论文 | 本文描述了一种诱导产生与人类隐球菌病免疫病理学多个方面相符的C. neoformans中枢神经系统感染小鼠模型的方法，并进行了详细的免疫学分析 | 结合基因敲除小鼠、抗体阻断、细胞转移以及单细胞RNA测序等高通量技术，该模型为揭示隐球菌中枢神经系统疾病的发病机制提供了新见解 | NA | 研究隐球菌性脑膜脑炎的免疫学机制，以开发更有效的治疗策略 | 隐球菌性脑膜脑炎的免疫病理学和小鼠模型的建立 | NA | 隐球菌性脑膜脑炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2013 | 2024-08-07 |
Multi-omics segregate different transcriptomic impacts of anti-IL-17A blockade on type 17 T-cells and regulatory immune cells in psoriasis skin
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1250504
PMID:37781383
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研究论文 | 本研究探讨了系统性IL-17A阻断对银屑病皮肤中1型17 T细胞和调节性免疫细胞转录组的影响 | 首次通过多组学方法整合免疫细胞富集的scRNA-seq、微阵列和免疫组化数据，揭示了系统性IL-17A阻断在银屑病皮肤中对T17轴和调节性DC转录组的调控作用 | 研究样本量有限，且仅限于银屑病患者的皮肤样本，可能限制了结果的普遍性 | 寻找系统性IL-17A阻断促进银屑病皮肤免疫细胞亚群调节性转录组修饰的转化证据 | 银屑病患者的皮肤样本，包括治疗前后的6mm穿刺活检组织 | 数字病理学 | 银屑病 | scRNA-seq, 微阵列, 免疫组化 | NA | RNA | scRNA-seq样本18个，微阵列样本61个，免疫组化样本61个，正常对照皮肤scRNA-seq样本10个，微阵列样本8个 | NA | NA | NA | NA |
| 2014 | 2024-08-05 |
Single-Cell Suspension Preparation from Nile Tilapia Intestine for Single-Cell Sequencing
2023-02-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64688
PMID:36847395
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研究论文 | 本研究展示了一种优化的鲤鱼肠道单细胞悬浮液制备协议 | 提出并优化了针对尼罗河罗非鱼肠道的单细胞悬浮液制备方法 | 该方法主要针对特定鱼类的肠道，其他组织或鱼种可能需要进一步优化 | 开发高质量单细胞悬浮液制备方案以支持单细胞层级研究 | 尼罗河罗非鱼的肠道细胞 | 数字病理学 | NA | 胶原酶/解聚酶 | NA | 细胞悬浮液 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2015 | 2024-08-05 |
Integrative multi-omic profiling of adult mouse brain endothelial cells and potential implications in Alzheimer's disease
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113392
PMID:37925638
|
研究论文 | 本文生成了成年小鼠脑内皮细胞的综合分子图谱，探讨其在阿尔茨海默病中的潜在影响 | 研究首次整合了多组学数据，以揭示脑内皮细胞的功能异质性及其分子基础 | 该研究主要基于小鼠模型，可能限制了结果在人的适用性 | 研究血脑屏障的分子基础及其在神经疾病中的作用 | 成年小鼠脑内皮细胞及其在阿尔茨海默病中的变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序和蛋白质组学 | 单细胞RNA测序 | 分子数据 | 涉及成年小鼠和人脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2016 | 2024-08-05 |
Spatial Mapping of Genes Implicated in SARS-CoV-2 Neuroinvasion to Dorsolateral Prefrontal Cortex Gray Matter
2023-Jan, COVID
DOI:10.3390/covid3010005
PMID:36714172
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法分析与SARS-CoV-2神经侵犯相关的基因异质性 | 首次对与SARS-CoV-2脑内渗透相关的基因在背外侧前额皮质的空间分布进行表征 | 目前对SARS-CoV-2神经侵犯的基因水平生物学理解仍然很有限 | 探究 SARS-CoV-2 对人类背外侧前额皮质的影响及相关基因的空间分布 | 人类背外侧前额皮质组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 4 | NA | NA | NA | NA |
| 2017 | 2024-08-05 |
Identification and targeting of cancer-associated fibroblast signature genes for prognosis and therapy in Cutaneous melanoma
2023-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107597
PMID:37875042
|
研究论文 | 本研究探讨了与皮肤黑素瘤相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）标志基因，并提出潜在的治疗靶点 | 首次识别了FBLN1和COL5A1作为皮肤黑素瘤的CAF特异性生物标志物，提供了新的治疗方向 | 尚需更多临床数据验证所识别的CAF标志基因与预后的相关性 | 探索皮肤黑素瘤中CAF标志基因的潜力并提出治疗靶点 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 皮肤黑素瘤 | 加权基因共表达网络分析、单细胞测序分析、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2018 | 2024-08-07 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2023-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.02.565369
PMID:37961221
|
研究论文 | 研究探讨了BHLHE40蛋白在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 首次揭示了BHLHE40在调节CD4 T细胞多功能性分化中的关键作用 | NA | 研究BHLHE40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | BHLHE40蛋白在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序结合TCR分析 | NA | RNA | 使用BHLHE40缺陷小鼠进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 2019 | 2024-08-05 |
Exercise Training Reduces the Inflammatory Response and Promotes Intestinal Mucosa-Associated Immunity in Lynch Syndrome
2023-11-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0088
PMID:37724990
|
研究论文 | 本研究评估了一项为期12个月的有氧运动干预对林奇综合症患者免疫系统的影响 | 首次明确了运动对高癌症风险群体免疫系统的生物学影响 | 研究为非随机和序贯干预分配，样本量较小 | 探讨运动干预在林奇综合症患者中的潜在益处 | 21名患有林奇综合症的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 代谢组学、mRNA测序、空间转录组学 | NA | 生物标志物数据 | 21名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2020 | 2024-08-07 |
Multi-dimensional single-cell characterization revealed suppressive immune microenvironment in AFP-positive hepatocellular carcinoma
2023-Jun-19, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00563-x
PMID:37336873
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了AFP阴性和阳性肝细胞癌及其邻近正常组织的特征，揭示了AFP阳性肝细胞癌中抑制性免疫微环境的机制 | 本研究首次揭示了AFP阳性肝细胞癌中TAM-SPP1的富集及其在调节免疫微环境中的作用，并提出SPP1-CD44轴作为治疗靶点 | NA | 旨在识别AFP阴性和阳性肝细胞癌的特征及其潜在治疗靶点 | AFP阴性肝细胞癌（ANHC）、AFP阳性肝细胞癌（APHC）及其邻近正常组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6个ANHC样本、6个APHC样本和4个邻近正常组织样本，以及30个HCC样本和59个HCC样本用于进一步验证 | NA | NA | NA | NA |