单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-05 |
Human Pancreatic α-Cell Heterogeneity and Trajectory Inference Analysis Using Integrated Single Cell- and Single Nucleus-RNA Sequencing Platforms
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.19.567715
PMID:38014078
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研究论文 | 通过整合单细胞和单核RNA测序技术研究人类胰腺α细胞异质性及其与β细胞的相互转化轨迹 | 首次发现人类胰腺α细胞存在五个不同亚群，并揭示了α-β细胞双向转化的潜在轨迹和特征基因 | 研究主要基于体外胰岛和胰岛移植物，未完全模拟体内自然环境 | 探索人类胰腺α细胞异质性及其在2型糖尿病中与β细胞的相互转化机制 | 人类胰岛细胞（来自非糖尿病供体和2型糖尿病患者）及人类胰岛移植物 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 轨迹推断分析, RNA速率分析 | 轨迹推断模型, PAGA分析 | 单细胞转录组数据, 单核转录组数据 | 人类胰岛样本（来自非糖尿病供体和2型糖尿病患者）及人类胰岛移植物样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-05 |
Identification of a novel cuproptosis-related gene signature for rheumatoid arthritis-A prospective study
2023-11, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3535
PMID:37338187
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，鉴定出与类风湿关节炎相关的铜死亡关键基因DLAT | 首次在类风湿关节炎中系统研究铜死亡相关基因，发现DLAT作为关键生物标志物与滤泡辅助性T细胞密切相关 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索铜死亡相关基因在类风湿关节炎发病机制中的作用 | 类风湿关节炎患者样本和永生化人软骨细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 生物信息学分析，qRT-PCR，单细胞测序，细胞实验 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-05 |
Exploration of s new biomarker in osteosarcoma and association with clinical outcomes: TOP2A+ cancer associated fibroblasts
2023-11, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3528
PMID:37246449
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别骨肉瘤中致癌性癌症相关成纤维细胞亚群TOP2A+ CAFs，并构建预后预测模型 | 首次系统研究骨肉瘤中CAFs的作用，识别出TOP2A+ CAFs这一致癌亚群，并基于其差异表达基因构建高精度预后预测模型 | 样本量较小（仅6例单细胞数据），需要更大规模研究验证 | 探索骨肉瘤中癌症相关成纤维细胞的作用并开发预后预测工具 | 骨肉瘤患者样本和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，LASSO回归，ROC分析 | LASSO回归，列线图模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 6例单细胞RNA测序样本，88例预后分析样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-05 |
Cellular age explains variation in age-related cell-to-cell transcriptome variability
2023-12-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278144.123
PMID:37973195
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠单细胞转录组数据，发现细胞年龄能够解释年龄相关转录组变异的大部分差异 | 提出了一个新颖的启发式模型来解释不同细胞类型衰老速率差异的原因 | 研究仅基于小鼠数据，需要在人类和其他物种中进一步验证 | 理解为什么某些细胞类型的转录组会显示衰老迹象而其他细胞类型不会 | 小鼠多种组织和年龄的单细胞转录组数据 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 启发式模型 | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠组织和年龄的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-05 |
Spatially distinct molecular patterns of gene expression in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Nov-17, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02572-6
PMID:37978501
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织中不同病理区域的基因表达模式 | 首次在IPF肺组织中应用空间转录组学技术，揭示了组织学正常区域与纤维化区域的转录组差异 | 样本量相对有限(32例IPF患者和12例对照)，且仅使用福尔马林固定石蜡包埋组织 | 理解IPF肺组织不同病理区域的转录组差异及其分子机制 | 特发性肺纤维化患者和对照者的肺组织样本 | 空间转录组学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学，数字空间分析，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，组织图像数据 | 32例IPF患者和12例对照者，共231个感兴趣区域 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | GeoMx Nanostring Digital Spatial Profiling on FFPE tissue |
| 186 | 2025-10-05 |
An Integrated Map of Cell Type-Specific Gene Expression in Pancreatic Islets
2023-11-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0130
PMID:37582230
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研究论文 | 本研究构建了胰岛细胞类型特异性基因表达的综合图谱 | 首次创建了包含192,203个细胞的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱，并提供了可视化工具和开放分析流程 | 研究样本主要来自人类供体，可能无法完全代表所有人群特征 | 建立胰岛细胞类型特异性基因表达的标准化参考资源 | 人类胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 192,203个细胞，来自65名供体（包括无糖尿病、1型糖尿病自身抗体阳性、1型糖尿病和2型糖尿病患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2025-10-05 |
CIARA: a cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data
2023-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201264
PMID:37294170
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研究论文 | 开发了一种名为CIARA的聚类独立算法，用于从单细胞测序数据中识别稀有细胞类型的标记基因 | 提出不依赖聚类的方法直接识别稀有细胞类型标记基因，可应用于多种单细胞组学数据类型 | NA | 开发识别稀有细胞类型标记基因的计算工具 | 单细胞测序数据中的稀有细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | CIARA算法 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-10-05 |
The Genetic Landscape of Familial Pulmonary Fibrosis
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202204-0781OC
PMID:36622818
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研究论文 | 通过全外显子组测序和遗传分析对569个家族性肺纤维化家系进行综合遗传风险评估 | 定义了已知FPF相关基因中罕见变异的流行率，发现了新的候选基因和通路，并开发了跨家系评估罕见变异基因的工具 | 未能在多个家系中发现共享的新罕见变异基因，表明大多数FPF家系存在遗传异质性 | 探索家族性肺纤维化的遗传风险因素 | 569个家族性肺纤维化家系中的患病个体 | 遗传学 | 肺纤维化 | 全外显子组测序, 候选基因测序, 共分离分析, 基因负荷分析, 单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据 | 569个FPF家系 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq methods to interrogate virus-host interactions
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00972-2
PMID:36414692
|
综述 | 总结单细胞RNA测序技术及其在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在解析病毒基因组与宿主反应异质性、感染细胞与旁观者细胞差异反应及细胞间通讯网络方面的创新应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序方法在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 病毒与宿主细胞的相互作用机制 | 自然语言处理 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome sequencing of plant leaf expressing anti-HER2 VHH-FcK cancer therapeutic protein
2023-12-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02833-5
PMID:38114492
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析表达抗HER2 VHH-FcK癌症治疗蛋白的转基因烟草叶片 | 首次在植物系统中应用单细胞RNA测序技术分析重组治疗蛋白的组织特异性表达模式 | 仅针对烟草叶片进行研究，未验证其他植物组织或物种 | 优化植物生物质中重组治疗蛋白的生产效率 | 转基因烟草（Nicotiana tabacum）叶片细胞 | 植物生物技术 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转基因烟草叶片细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-10-05 |
Autologous Airway Basal Cell Transplantation Alleviates Airway Epithelium Defect in Recurrent Benign Tracheal Stenosis
2023-12-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad062
PMID:37804518
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研究论文 | 本研究通过自体气道基底细胞移植联合生物凝胶治疗复发性良性气管狭窄，探索其在气道再上皮化中的治疗效果 | 首次将自体气道基底细胞移植与生物凝胶涂层相结合，应用于气管狭窄的再生治疗 | 研究仅在犬类动物模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 探索自体基底细胞移植在恢复气道稳态和治疗气管狭窄中的治疗效果 | 复发性良性气管狭窄患者的气道黏膜和建立气管狭窄模型的犬类 | 单细胞测序 | 气管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 犬类动物模型，分为4个实验组，随访16周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Angiotensinogen and Galanin as Unique Molecular Markers of Acinar Cells in Murine Salivary Glands
2023-12, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0125
PMID:37823745
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定小鼠唾液腺腺泡细胞的独特分子标记物 | 首次发现血管紧张素原和甘丙肽分别作为颌下腺浆液性腺泡细胞和舌下腺黏液性腺泡细胞的特异性标记物 | 研究仅使用4周龄小鼠，未涵盖其他发育阶段 | 鉴定小鼠颌下腺和舌下腺腺泡细胞的分子标记物 | 小鼠颌下腺和舌下腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 4周龄小鼠 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 193 | 2025-10-05 |
Global decoupling of cell differentiation from cell division in early embryo development
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551123
PMID:37546736
|
研究论文 | 本研究通过阻断斑马鱼胚胎细胞周期并采用单细胞RNA测序分析，揭示了细胞分化与细胞分裂在早期胚胎发育中的解耦现象 | 首次在胚胎尺度上证明细胞分裂对所有胚胎组织初始细胞类型分化是非必需的，并展示了结合胚胎水平扰动与单细胞RNA测序的新方法 | 研究仅关注早期原肠胚形成至分节结束阶段，未涉及后期发育过程；细胞分裂缺失导致部分细胞类型分化速度减慢和应激反应 | 探究细胞分裂在细胞分化过程中的作用机制 | 斑马鱼早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-10-05 |
Transcriptional changes in specific subsets of Drosophila neurons following inhibition of the serotonin transporter
2023-06-24, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-023-02521-3
PMID:37355701
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析果蝇蘑菇体神经元在血清素转运蛋白抑制后的转录组变化 | 首次在果蝇特定神经元亚型中系统分析血清素转运蛋白抑制的转录效应，并比较发育期与成年期的差异 | 蘑菇体神经元转录组变化有限，且一个突变等位基因导致显著的人工表达变化 | 探究血清素转运蛋白抑制对特定神经元亚型转录组的影响 | 果蝇蘑菇体中的Kenyon细胞 | 神经科学 | NA | 荧光激活细胞分选，bulk RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 果蝇Kenyon细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2025-10-05 |
RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Traumatic Spinal Cord Injury (Review)
2023, Sovremennye tekhnologii v meditsine
DOI:10.17691/stm2023.15.6.08
PMID:39944372
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综述 | 总结基于单细胞和单核RNA测序的转录组分析技术在创伤性脊髓损伤细胞特征鉴定和研究中的进展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，精确定位脊髓损伤区域并在细胞分子水平分析病理图像 | 需要更多人类细胞群体特异性数据与实验模型数据的比较分析 | 理解脊髓功能机制并建立治疗靶点 | 创伤性脊髓损伤中的细胞类型和神经组织细胞 | 空间转录组学 | 创伤性脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-05 |
A mouse model of ZTTK syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.19.567732
PMID:38014320
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研究论文 | 本研究通过建立ZTTK综合征小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血过程中的关键作用 | 首次建立SON单倍体不足小鼠模型，成功模拟人类ZTTK综合征症状，并通过单细胞转录组分析揭示了造血发育异常机制 | 未明确说明样本量大小，且为动物模型研究，结果向人类临床转化的有效性需要进一步验证 | 研究SON基因在器官发育和造血过程中的功能，探索ZTTK综合征的发病机制 | SON单倍体不足小鼠模型及其造血干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | ZTTK综合征 | 单细胞转录组测序，表面标志物分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-10-05 |
An analysis of classical multidimensional scaling with applications to clustering
2023-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaac004
PMID:36761434
|
研究论文 | 本文分析了经典多维标度法的理论性能，并应用于噪声数据聚类 | 建立了分析经典多维标度法嵌入样本质量的理论框架，提出了信噪比缩放条件 | NA | 分析经典多维标度法的统计性能，为下游统计分析奠定基础 | 经典多维标度法及其在聚类分析中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 多维标度法，距离聚类算法 | 经典多维标度法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，自然语言数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of Rohon-Beard neurons implicates Fgf signaling in axon maintenance and cell survival
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.26.554953
PMID:37693470
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼Rohon-Beard神经元，揭示其分为三个亚类并发现Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统鉴定斑马鱼Rohon-Beard神经元的三个分子亚类，并发现Fgf信号通路对其轴突维持和细胞存活的调控机制 | 研究主要聚焦斑马鱼幼虫期神经元，未验证在成年个体或其他物种中的普适性 | 探究斑马鱼外周感觉神经元的分子分类及其发育调控机制 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Cytomulate: accurate and efficient simulation of CyTOF data
2023-11-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03099-1
PMID:37974276
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研究论文 | 开发了一种准确高效的CyTOF数据模拟算法Cytomulate | 能够捕捉CyTOF数据的多种特征，在整体数据分布学习上优于scDesign2、Splatter等单细胞RNA-seq导向方法和LAMBDA等生成模型 | NA | 为流式飞行时间质谱数据分析方法的开发和评估提供基础 | CyTOF数据 | 机器学习 | NA | 流式飞行时间质谱 | 生成模型 | 质谱数据 | NA | NA | 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
Single-cell Mayo Map (scMayoMap): an easy-to-use tool for cell type annotation in single-cell RNA-sequencing data analysis
2023-10-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01728-6
PMID:37858214
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研究论文 | 开发了一个名为scMayoMap的易于使用的单细胞RNA测序数据细胞类型注释工具及其配套数据库 | 构建了全面的细胞标记物数据库scMayoMapDatabase，并开发了无需标记训练数据集或预定义细胞亚群标记物的用户友好注释工具 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 开发准确且用户友好的单细胞RNA测序数据细胞类型注释工具 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 48个独立的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |