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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-05 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06812-z
PMID:38092916
|
研究论文 | 构建了成年小鼠全脑的高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 结合700万单细胞RNA测序和430万细胞空间转录组数据，创建了包含5,322个细胞簇的层次分类系统 | 研究仅限于成年小鼠脑部，未涉及其他发育阶段或物种 | 建立哺乳动物大脑细胞类型的综合参考图谱 | 成年小鼠全脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, MERFISH | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 约700万细胞（400万通过质控）scRNA-seq，430万细胞MERFISH | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) |
| 182 | 2025-10-05 |
Latent human herpesvirus 6 is reactivated in CAR T cells
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06704-2
PMID:37938768
|
研究论文 | 本研究通过病毒基因组学分析发现人类疱疹病毒6型可在CAR T细胞中被重新激活 | 首次通过大规模病毒基因组挖掘识别出CAR T细胞中HHV-6病毒重新激活现象，并发现病毒'超级表达'细胞亚群 | 研究样本量有限，需要进一步验证病毒重新激活的临床影响 | 探究细胞治疗产品中潜伏病毒重新激活的机制和风险 | 人类CD4 T细胞、CAR T细胞治疗产品 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞测序、病毒基因组挖掘 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据 | 研究级异体CAR T细胞、临床试验患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-05 |
CD201+ fascia progenitors choreograph injury repair
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06725-x
PMID:37968392
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研究论文 | 本研究通过识别小鼠筋膜中的CD201+成纤维细胞祖细胞，揭示了其在伤口愈合过程中协调炎症反应和瘢痕形成的新机制 | 首次发现筋膜中CD201标记的多能成纤维细胞祖细胞，并阐明其通过视黄酸和缺氧信号通路调控促炎性成纤维细胞和肌成纤维细胞分化的时空序列 | 研究主要基于小鼠模型，人类组织中的验证尚需进一步研究 | 探究伤口愈合过程中成纤维细胞祖细胞的分化调控机制 | 小鼠皮肤伤口模型和筋膜组织 | 单细胞转录组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞转录组测序，遗传谱系追踪，基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 小鼠皮肤损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-05 |
Single-cell, whole-embryo phenotyping of mammalian developmental disorders
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06548-w
PMID:37968388
|
研究论文 | 本研究建立了基于单细胞RNA测序的全胚胎表型分析平台，用于系统表征小鼠发育障碍模型 | 首次将组合索引单细胞RNA测序应用于全胚胎水平，实现了对哺乳动物发育障碍的系统性分子和细胞表型分析 | 研究仅针对胚胎期13.5天的小鼠胚胎，未覆盖其他发育阶段 | 建立可扩展的小鼠遗传模型系统表型分析平台 | 101个小鼠胚胎，包括22种突变型和4种野生型基因型 | 单细胞组学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 101个小鼠胚胎，超过160万个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 组合索引单细胞RNA测序 |
| 185 | 2025-10-05 |
Self-patterning of human stem cells into post-implantation lineages
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06354-4
PMID:37369348
|
研究论文 | 人类多能干细胞自组织形成模拟早期胚胎发育后植入阶段的三维结构 | 首次实现人类干细胞自组织形成同时包含胚胎外胚层样和胚外下胚层样谱系的三维结构，模拟了人类胚胎植入后发育的关键时空事件 | 未建立胎盘细胞类型，仅涵盖Carnegie阶段4-7的发育特征 | 理解人类早期发育的基本细胞和分子机制 | 人类多能干细胞 | 发育生物学 | 先天性疾病 | 单细胞转录组测序 | 三维干细胞自组织模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-05 |
A molecularly defined and spatially resolved cell atlas of the whole mouse brain
2023-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.06.531348
PMID:36945367
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研究论文 | 通过整合MERFISH和scRNA-seq技术，构建了全小鼠大脑的高分辨率空间细胞图谱 | 首次在全脑范围内实现单细胞水平的高通量空间转录组分析，识别了5000多个转录特征不同的细胞簇 | 研究仅针对成年小鼠大脑，尚未在人类或其他物种中验证 | 解析大脑的分子和细胞结构基础 | 成年小鼠全脑约800万个细胞 | 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 约800万个细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | MERFISH技术检测>1100个基因, 整合scRNA-seq数据进行全转录组分析 |
| 187 | 2025-10-05 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.06.531121
PMID:37034735
|
研究论文 | 构建了成年小鼠全脑的高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 结合单细胞RNA测序和MERFISH空间转录组技术，首次在单细胞水平创建了全脑尺度的分层细胞分类系统 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种或人类大脑 | 建立哺乳动物大脑细胞类型的完整目录，理解大脑功能和组织原理 | 成年小鼠全脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, MERFISH空间转录组 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 约700万单细胞RNA测序细胞, 约430万MERFISH空间转录组细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | MERFISH空间转录组技术 |
| 188 | 2025-10-05 |
An integrated study to decipher immunosuppressive cellular communication in the PDAC environment
2023-11-10, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00320-6
PMID:37945567
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示胰腺导管腺癌免疫抑制微环境中肿瘤相关巨噬细胞通过LGALS9基因介导的细胞通讯机制 | 首次整合多种转录组学技术系统解析PDAC免疫抑制微环境中的细胞通讯网络，发现TAMs通过LGALS9-P4HB相互作用轴在免疫抑制中的核心作用 | 研究样本量有限，机制验证实验不足，需要进一步功能实验确认LGALS9-P4HB相互作用的生物学意义 | 解析胰腺导管腺癌免疫抑制微环境中的细胞通讯机制 | 胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的各类细胞，特别是肿瘤相关巨噬细胞 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-10-05 |
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06549-9
PMID:37730992
|
研究论文 | 本研究通过构建转基因雪貂模型揭示肺离子细胞的多样性和功能 | 首次在非啮齿类哺乳动物中建立条件性遗传雪貂模型，用于研究肺离子细胞生物学 | 研究仅限于雪貂模型，需要进一步验证在人类中的适用性 | 阐明肺离子细胞在气道生理和囊性纤维化疾病中的作用 | 转基因雪貂模型和囊性纤维化雪貂模型 | 发育生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序, 体内谱系追踪 | 条件性遗传模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 多种转基因雪貂模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-05 |
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06473-y
PMID:37704762
|
研究论文 | 开发CHOOSE系统用于自闭症高风险基因的脑类器官筛选，揭示这些基因对细胞命运决定的影响 | 开发了CRISPR-人类类器官-单细胞RNA测序(CHOOSE)系统，首次在嵌合类器官中进行高通量功能缺失筛选 | 研究仅限于36个高风险自闭症基因，且类器官模型可能无法完全模拟人脑发育的复杂性 | 研究自闭症谱系障碍相关基因在人类大脑发育过程中的作用机制 | 人类脑类器官和患者特异性诱导多能干细胞衍生的类器官 | 发育生物学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 染色质分析 | 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 染色质数据 | 36个高风险自闭症基因的扰动分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-05 |
Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05279-8
PMID:36198796
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术分析人脑类器官发育过程，建立了基因调控网络推断框架Pando，并利用遗传扰动揭示了转录因子GLI3在端脑命运决定中的关键作用 | 开发了整合多组学数据的Pando框架来推断全局基因调控网络，并通过单细胞水平的遗传扰动验证转录因子功能 | 基于类器官模型的研究可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 | 解析人脑发育过程中的基因调控网络 | 人多能干细胞衍生的神经类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 单细胞染色质可及性检测, 遗传扰动 | 基因调控网络推断模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 密集时间点的类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-10-05 |
A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breast
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06252-9
PMID:37380767
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研究论文 | 构建了成人乳腺单细胞和空间分辨率的综合基因组图谱 | 首次在单细胞和空间分辨率上构建了成人乳腺综合图谱，揭示了丰富的血管周围、内皮和免疫细胞群体以及高度多样化的管腔上皮细胞状态 | NA | 研究成人正常乳腺组织的细胞组成和空间结构 | 126名女性的714,331个细胞和20名女性的117,346个细胞核 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学，空间映射 | NA | 单细胞转录组数据，空间数据 | 714,331个细胞来自126名女性，117,346个细胞核来自20名女性 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | 使用了四种不同的空间映射技术 |
| 193 | 2025-10-05 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子调控脂肪细胞产热程序的新机制 | 首次发现乳腺导管上皮细胞通过分泌'乳腺因子'调控脂肪细胞UCP1表达，揭示了交感神经-乳腺导管接触点对脂肪产热的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性需要进一步验证 | 探究乳腺导管上皮细胞在脂肪细胞产热调控中的作用机制 | 雌性小鼠皮下白色脂肪组织和乳腺导管上皮细胞 | 细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，3D全组织免疫荧光成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-05 |
Mitochondrial integrated stress response controls lung epithelial cell fate
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06423-8
PMID:37558881
|
研究论文 | 本研究揭示了线粒体复合物I通过NAD再生调控肺上皮细胞命运的新机制 | 首次发现线粒体复合物I依赖的NAD再生在肺泡发育中通过抑制整合应激反应控制细胞命运 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探索肺上皮细胞命运的代谢调控机制 | 小鼠肺上皮细胞 | 细胞生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-05 |
Diverse clonal fates emerge upon drug treatment of homogeneous cancer cells
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06342-8
PMID:37468627
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研究论文 | 本研究开发了FateMap框架，通过DNA条形码和单细胞RNA测序技术揭示了癌细胞在抗癌治疗中的克隆命运多样性 | 开发了结合DNA条形码和单细胞RNA测序的FateMap框架，首次系统揭示了癌细胞耐药类型的多样性及其内在决定机制 | NA | 探究遗传相同癌细胞在药物治疗下产生不同耐药类型的机制 | 单细胞来源的癌细胞系和患者样本 | 单细胞生物学 | 癌症 | DNA条形码技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数十万个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2025-10-05 |
Pharmacological targeting of netrin-1 inhibits EMT in cancer
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06372-2
PMID:37532929
|
研究论文 | 本研究通过药理学方法靶向netrin-1抑制癌症中的上皮间质转化 | 首次发现netrin-1在EMT中的关键作用，并开发了靶向netrin-1的单克隆抗体NP137作为新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类癌细胞系，需要更多临床验证 | 开发靶向上皮间质转化的癌症治疗新方法 | 皮肤鳞状细胞癌小鼠模型和A549人类癌细胞系 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，基因敲低 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-05 |
A spatially resolved single cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.22.537946
PMID:37163043
|
研究论文 | 构建了首个成人正常乳腺组织的单细胞和空间分辨率综合图谱 | 首次在单细胞和空间分辨率层面系统揭示成人乳腺组织的细胞组成和空间分布特征，发现导管和小叶中丰富的组织驻留免疫细胞生态系统 | 样本数量相对有限（62名女性），主要关注正常组织，疾病状态研究较少 | 建立成人正常乳腺组织的综合细胞参考图谱 | 成人女性乳腺组织 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 535,941个细胞（来自62名女性），120,024个细胞核（来自20名女性） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | 使用了三种空间定位技术 |
| 198 | 2025-10-05 |
Predicting the Structural Impact of Human Alternative Splicing
2023-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.21.572928
PMID:38187531
|
研究论文 | 本研究使用AlphaFold2预测了超过11,000种人类剪接异构体的结构，系统分析了选择性剪接对蛋白质结构的影响 | 首次大规模预测人类剪接异构体的三维结构，并系统分析剪接变异对结构特征和功能的影响 | 仅基于计算预测，缺乏实验验证；分析范围限于已知的剪接异构体 | 探究选择性剪接对蛋白质结构的影响及其功能意义 | 人类蛋白质剪接异构体 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测，单细胞RNA测序 | AlphaFold2 | 蛋白质序列，单细胞RNA-seq数据 | 超过11,000种人类剪接异构体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens项目的单细胞RNA-seq数据 |
| 199 | 2025-10-05 |
Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno
2023-12-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1023
PMID:37941153
|
研究论文 | 提出一种名为SpatialAnno的空间转录组数据注释方法，能够有效利用非标记基因和标记基因的定性信息 | 通过因子模型估计非标记基因的低维嵌入，同时利用Potts模型促进相邻点间的空间平滑性，无需参考数据集 | NA | 开发空间转录组数据的细胞/区域类型注释方法 | 空间转录组数据中的细胞/点 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 因子模型, Potts模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和4个真实数据集 | 10x Genomics, ST, Slide-seq, seqFISH | 空间转录组学 | 10x Visium, ST, Slide-seqV1/2, seqFISH | 10x Visium平台, ST平台, Slide-seqV1/2平台, seqFISH平台 |
| 200 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of the human heart
2023-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01918-1
PMID:37568021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |