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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-01-07 |
Single-cell reconstruction and mutation enrichment analysis identifies dysregulated cardiomyocyte and endothelial cells in congenital heart disease
2023-12-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究结合基因组学与单细胞转录组学，对先天性心脏病（CHD）进行了综合分析，识别了90个潜在的风险基因，并揭示了心肌细胞和心内膜细胞是主要的CHD相关细胞类型 | 首次将基因组学与CHD单细胞转录组学进行综合分析，识别了6个新的候选CHD基因，并揭示了CHD基因的异质性表达 | NA | 识别先天性心脏病（CHD）的潜在风险基因和相关细胞类型，以理解其表型异质性 | 先天性心脏病（CHD）患者的心脏组织 | 单细胞转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个CHD组织和4个对照组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2026-01-07 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.11.543319
PMID:37398354
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠肝脏脓肿形成的遗传和免疫决定因素，特别是TLR4介导的早期炎症反应在脓肿易感性中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统性地描述了E. coli肝脏脓肿的免疫细胞组成和遗传易感性，并发现TLR4介导的早期炎症反应在脓肿形成与细菌清除之间的权衡机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；脓肿形成的详细分子机制仍需进一步探索 | 探究E. coli肝脏脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 小鼠肝脏组织及E. coli感染模型 | 数字病理学 | 肝脏感染 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种小鼠品系（如C57BL/6N雌性） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2026-01-07 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543353
PMID:37333273
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研究论文 | 本文揭示了ENPP1作为抗癌cGAMP-STING通路中的先天免疫检查点，通过抑制细胞外cGAMP水解和激活免疫抑制性腺苷信号，促进乳腺癌生长和转移 | 首次在单细胞水平上证明ENPP1通过协同抑制cGAMP-STING抗肿瘤免疫和激活免疫抑制性腺苷信号驱动乳腺癌进展，并发现选择性抑制其cGAMP水解活性可恢复旁分泌cGAMP-STING信号 | 研究主要聚焦于乳腺癌，未广泛验证其他癌症类型；机制研究依赖于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究ENPP1在肿瘤发生中的分子和细胞机制，特别是其在cGAMP-STING通路中的免疫调节作用 | 乳腺癌细胞、肿瘤微环境中的基质细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及乳腺癌患者数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2026-01-07 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
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研究论文 | 本文介绍了一种基于甘露醇的缓冲液（PBS-M），用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 | 提出了一种低盐度磷酸盐缓冲液补充D-甘露醇（PBS-M）的方法，能减少细胞死亡和背景mRNA，提高海洋生物单细胞RNA测序的数据质量和细胞状态检测能力 | NA | 改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序兼容性和数据质量 | 海鞘血细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2026-01-06 |
Single-cell insights into epithelial morphogenesis in the neonatal mouse uterus
2023-12-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316410120
PMID:38019863
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠子宫上皮细胞的形态发生过程 | 首次在新生儿期小鼠子宫中应用单细胞转录组技术，识别了上皮细胞异质性、新腺体上皮基因以及调控网络 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类或其他哺乳动物；样本时间点限于出生后1至15天 | 阐明新生儿期子宫上皮细胞的成熟、决定和分化的细胞与分子机制 | 新生小鼠子宫的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠子宫上皮细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2026-01-03 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了PD-1阻断疗法（Nivolumab）对头颈鳞状细胞癌中调节性T细胞（Treg）的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Nivolumab治疗后HNSCC肿瘤微环境中Treg数量增加、抑制活性增强的机制，并识别了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴及KRAS信号通路等关键变化 | 样本量较小（仅4名供体的8个组织），且为观察性研究，需进一步验证机制 | 研究PD-1阻断疗法如何影响HNSCC肿瘤微环境中的Treg细胞 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名HNSCC供体的8个组织（治疗前后配对样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2026-01-01 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了默克尔细胞癌患者外周血中免疫细胞的动态变化，揭示了免疫治疗耐受的机制 | 采用纵向多组学方法，结合单细胞RNA测序和批量RNA数据验证，识别了T细胞耗竭、B细胞失调和单细胞亚群变化作为免疫逃逸的关键标志 | 样本量较小（仅基于四名患者的时间点数据），且主要依赖外周血分析，可能未完全反映肿瘤微环境的变化 | 探究默克尔细胞癌患者免疫治疗耐受的细胞机制和免疫逃逸条件 | 默克尔细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌（默克尔细胞癌） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名患者的外周血样本，采集自四个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-12-31 |
Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance
2023-May-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2887159/v1
PMID:37205391
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，在肺毛细血管内皮细胞中发现了五个具有不同分子特征和功能的新细胞群 | 首次识别出五个新的肺毛细血管内皮细胞群，包括表达特定离子转运蛋白的细胞群、具有再生功能的“根”细胞群以及具有血管生成调节能力的细胞群 | 研究主要基于单细胞转录组学数据，需要进一步的体内功能验证 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在生理和病理过程中的功能 | 肺毛细血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-12-30 |
Unravelling cancer subtype-specific driver genes in single-cell transcriptomics data with CSDGI
2023-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011450
PMID:38096269
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为CSDGI的无监督计算方法，用于从单细胞转录组数据中推断癌症亚型特异性驱动基因 | 首次提出在癌症亚型水平上探索驱动基因的方法，并应用了基于低秩残差神经网络的编码器-解码器框架 | 方法依赖于单细胞转录组数据，可能未考虑其他组学层面的信息 | 推断癌症亚型特异性驱动基因以理解肿瘤异质性 | 肿瘤单细胞转录组数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 编码器-解码器框架，低秩残差神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2025-12-30 |
Molecular traces of Drosophila hemocytes reveal transcriptomic conservation with vertebrate myeloid cells
2023-12, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011077
PMID:38113249
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据比较果蝇血细胞与脊椎动物免疫细胞，揭示果蝇血细胞在转录组层面与脊椎动物骨髓细胞的保守性 | 首次系统性地利用单细胞RNA测序数据进行跨物种比较分析，识别果蝇血细胞中保守的CD基因标记，并验证CG8501（CD59）在吞噬作用中的功能 | 分析基于转录组数据，功能验证有限，且可能未涵盖所有免疫细胞类型或发育阶段 | 探究果蝇血细胞与脊椎动物免疫系统在分子层面的保守性，以理解免疫系统进化 | 果蝇血细胞和脊椎动物免疫细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-12-30 |
A postmeiotically bifurcated roadmap of honeybee spermatogenesis marked by phylogenetically restricted genes
2023-12, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011081
PMID:38048317
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了蜜蜂雄蜂精子发生过程中的转录组学特征，特别是发现了一种与系统发育限制基因相关的减数分裂后分化路径 | 首次在蜜蜂中利用单细胞RNA测序技术，揭示了减数分裂后精子细胞的分化路径，并发现小精子细胞中系统发育限制基因的高表达和突变负荷 | 研究仅基于3天和14天两个时间点的样本，可能未覆盖精子发生的完整动态过程，且样本量有限 | 探究蜜蜂雄蜂精子发生过程中的分子特征，特别是减数分裂后精子细胞的转录组学变化 | 蜜蜂（Apis mellifera）雄蜂的睾丸组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3天和14天龄蜜蜂雄蜂睾丸样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-12-30 |
Spatial transcriptomics reveals novel genes during the remodelling of the embryonic human arterial valves
2023-11, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010777
PMID:38011284
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了人类胚胎动脉瓣在重塑过程中的新基因表达模式 | 首次应用空间转录组学于人类胚胎动脉瓣研究，克服了微小结构解剖难题，并识别出四个小鼠基因组中不存在且与瓣膜发育相关的新基因 | 研究仅基于CS16和CS19两个胚胎阶段，样本量有限，且未涵盖整个胚胎发育周期 | 探究人类胚胎动脉瓣在形态和遗传水平上的形成与重塑机制 | 人类胚胎动脉瓣组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类胚胎CS16和CS19阶段的动脉瓣样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 193 | 2025-12-30 |
Attention-based deep clustering method for scRNA-seq cell type identification
2023-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011641
PMID:37948464
|
研究论文 | 本文提出了一种名为AttentionAE-sc的新型注意力融合自编码器方法，用于单细胞RNA测序数据的无监督聚类和细胞类型识别 | 通过注意力机制融合了基于零膨胀负二项分布和基于图自编码器的两种聚类策略，能够处理数据稀疏性和高维性，无需指定聚类数量 | 未提及方法在超大规模数据集上的计算效率，也未讨论对批次效应的处理能力 | 开发一种综合性的深度学习方法，以改进单细胞RNA测序数据的聚类分析和细胞类型识别 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 注意力机制融合的自编码器 | 基因表达数据 | 16个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-12-30 |
MIGGRI: A multi-instance graph neural network model for inferring gene regulatory networks for Drosophila from spatial expression images
2023-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011623
PMID:37939200
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MIGGRI的两阶段方法，利用多实例图神经网络从果蝇空间表达图像中推断基因调控网络 | 创新点包括采用多实例图神经网络模型，结合对比学习从空间表达图像中提取调控特征，并应用于半监督学习，以处理图像集合的复杂性和多实例特性 | NA | 研究目的是从空间表达图像中推断基因调控网络，以更精细地描述转录因子与靶基因之间的相互作用 | 研究对象是果蝇胚胎的空间基因表达图像 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 195 | 2025-12-30 |
SMASH: Scalable Method for Analyzing Spatial Heterogeneity of genes in spatial transcriptomics data
2023-10, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010983
PMID:37862362
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SMASH的非参数方法，用于在空间转录组学数据中识别空间可变基因，以平衡计算效率和统计功效 | SMASH方法在计算需求和统计功效之间实现了平衡，相比现有方法具有更高的统计功效和鲁棒性 | NA | 识别空间转录组学数据中与细胞/点空间位置共变的基因，以理解复杂组织的结构和功能特征 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非参数方法 | 空间转录组学数据 | 四个来自不同平台的空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-12-30 |
SMASH: Scalable Method for Analyzing Spatial Heterogeneity of genes in spatial transcriptomics data
2023-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.23.533980
PMID:36993287
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SMASH的非参数方法，用于高效识别空间转录组数据中的空间变异基因，以平衡计算需求和统计功效 | SMASH方法在计算效率和统计功效之间取得了平衡，相比现有方法在模拟场景中表现出更优的统计能力和鲁棒性 | NA | 开发一种可扩展的方法来分析空间转录组数据中基因的空间异质性，识别与细胞/点空间位置共变表达的空间变异基因 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非参数方法 | 空间转录组数据 | 四个来自不同平台的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 197 | 2025-12-29 |
Impact of chemotherapeutic agents on liver microenvironment: oxaliplatin create a pro-metastatic landscape
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02804-z
PMID:37697332
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研究论文 | 本研究探讨了奥沙利铂对肝脏微环境的影响，发现其通过诱导免疫抑制促进结直肠癌肝转移 | 首次利用单细胞RNA测序揭示奥沙利铂如何改变肝脏免疫微环境，并证明T细胞补充可逆转其促转移效应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且未涉及其他化疗药物的比较 | 探究奥沙利铂对肝脏预转移微环境的影响及其在结直肠癌肝转移中的作用机制 | BALB/c和BALB/c-nude小鼠模型、CT26细胞系、结直肠癌患者样本 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、LDH检测、细胞增殖与凋亡实验、荟萃分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、临床荟萃数据 | 小鼠模型及结直肠癌患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-12-24 |
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40761-5
PMID:37699906
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、谱系追踪和基因靶向技术，揭示了皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子动态，并发现了一种非内皮性间充质神经周细胞类型 | 首次描述了一种非典型VE-钙黏蛋白细胞群，即非内皮性间充质神经周细胞，并揭示了Alk1在该细胞中维持神经分支稳态的新作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性的验证尚需进一步研究 | 探究皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子机制 | 小鼠皮肤VE-钙黏蛋白细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、基因靶向 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-12-24 |
Constructing a full, multiple-layer interactome for SARS-CoV-2 in the context of lung disease: Linking the virus with human genes and microbes
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011222
PMID:37410793
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研究论文 | 本研究通过开发MLCrosstalk统计建模方法，构建了SARS-CoV-2在肺部疾病背景下的全多层互作网络，整合病毒、人类基因和微生物数据 | 首次提出基于潜在狄利克雷分配的MLCrosstalk方法，超越已知蛋白质互作，构建包含miRNA、人类蛋白编码基因和外源微生物的完整SARS-CoV-2互作组 | 方法依赖患者样本数据的共现模式，可能受样本选择和测序技术限制，且网络推断需要进一步实验验证 | 构建SARS-CoV-2感染的全互作网络，以促进COVID-19新药开发、区分长新冠特征并识别器官病理学标志 | SARS-CoV-2病毒、人类蛋白编码基因、microRNAs（miRNAs）及外源微生物（如Rothia mucilaginosa和Prevotella melaninogenica） | 生物信息学 | COVID-19 | 统计建模、网络传播分析、单细胞测序数据验证 | 潜在狄利克雷分配（LDA） | 多源组学数据（微生物、基因、miRNA、蛋白质互作） | 未明确指定样本数量，基于患者样本数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-12-24 |
Single-cell transcriptomics of adult skin VE-cadherin expressing lineages during hair cycle
2023-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533784
PMID:36993228
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠毛发周期中表达VE-cadherin的皮肤细胞群体，揭示了血管内皮细胞在毛发生长过程中的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下比较了毛发周期静止期和生长期中VE-cadherin表达细胞的转录组变化，发现了持续增殖的内皮细胞亚群和与血管重塑相关的代谢改变 | 研究仅针对VE-cadherin表达细胞群体，未涵盖皮肤中所有细胞类型；使用小鼠模型的结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探究成年皮肤中血管内皮细胞谱系在毛发周期中的细胞和分子动力学变化 | 通过Cdh5-CreER遗传标记的VE-cadherin表达细胞，包括血液和淋巴管结构细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 单细胞转录组数据 | 从毛发周期静止期（telogen）和生长期（anagen）分选的VE-cadherin表达细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |