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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-29 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术分析了人类蜕膜T细胞的转录组、蛋白质组和T细胞受体库，揭示了其在母胎界面独特的转录编程和克隆分布 | 首次同时获取单细胞水平的转录组、有限蛋白质组和受体库数据，系统揭示了蜕膜T细胞独特的转录编程特征和克隆多样性降低现象 | 样本量相对有限，蛋白质检测为有限蛋白质组而非全面蛋白质组，功能验证实验不足 | 探究母胎界面免疫耐受机制中T细胞的角色和特性 | 人类蜕膜T细胞和匹配的外周血T细胞 | 单细胞组学 | 生殖免疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、有限蛋白质数据、T细胞受体序列数据 | 人类蜕膜和外周血T细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-29 |
Preparation of noninfectious scRNAseq samples from SARS-CoV-2-infected epithelial cells
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281898
PMID:36827401
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研究论文 | 本文描述了一种从SARS-CoV-2感染细胞中制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法，使研究能在BSL2设施中安全进行 | 开发了一种使用甲醇-丙酮固定和灭活SARS-CoV-2的方法，使单细胞RNA测序分析能在较低生物安全级别的设施中进行，扩大了研究社区的可及性 | 方法仅在非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞上测试，可能不适用于所有细胞类型或病毒株，且未评估长期存储对样本质量的影响 | 开发一种安全制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法，以促进SARS-CoV-2宿主反应的高通量研究 | SARS-CoV-2感染的非洲绿猴肾上皮细胞（Vero-E6）和原代人肺上皮细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、组织培养感染剂量测定（TCID50）、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及两种细胞类型（Vero-E6细胞和原代人肺上皮细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-03-28 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf9941
PMID:37824646
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研究论文 | 本研究利用单细胞和多重空间转录组学技术，揭示了人类丘脑发育过程中的分子动态和细胞命运轨迹 | 首次在人类丘脑发育中应用单细胞和空间转录组学，明确了丘脑神经元在妊娠中期的分化及其分子和空间核团组织 | 研究主要聚焦于妊娠中期，未涵盖丘脑发育的完整时间范围，且样本数量有限 | 阐明人类丘脑发育过程中的分子轨迹和细胞命运特化机制 | 人类丘脑发育过程中的神经元细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-03-28 |
Protocol for using single-cell sequencing to study the heterogeneity of NF1 nerve sheath tumors from clinical biospecimens
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102297
PMID:37167059
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研究论文 | 本文介绍了一种从神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤中获取单细胞悬液，并在10x平台上进行转录组分析的实验方案 | 提出了一种针对临床神经鞘肿瘤样本的单细胞测序实验方案，并整合了生物信息学工具进行发育轨迹构建和比较分析 | 该方案主要针对神经纤维瘤病1型相关肿瘤，可能不适用于其他类型肿瘤，且依赖于10x平台技术 | 研究神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤的异质性 | 神经纤维瘤病1型相关的神经鞘肿瘤临床样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x平台单细胞转录组分析 |
| 5 | 2026-03-28 |
Differentiation and single-cell RNA-seq analyses of human pluripotent-stem-cell-derived renal organoids
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102314
PMID:37220001
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研究论文 | 本文介绍了一种将人类多能干细胞分化为肾脏类器官的协议，包括维护、分化、单细胞RNA-seq分析和验证步骤 | 提供了一种快速、可重复的人类肾脏发育和疾病建模模型，并详细描述了使用CRISPR-Cas9同源定向修复进行基因组工程以生成肾脏疾病模型 | NA | 开发人类肾脏发育和疾病建模的协议 | 人类多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq，CRISPR-Cas9 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-28 |
Protocol to assess fatal embolism risks from human stem cells
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102268
PMID:37133989
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研究论文 | 本文提出了一种协议，用于识别人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs）中促栓塞亚群并预测ADSC输注的致命栓塞风险 | 开发了一种结合单细胞RNA-seq数据分析和数学建模的协议，以预测干细胞治疗中的栓塞风险 | 协议细节依赖于先前研究（Yan et al., 2022），可能需进一步验证 | 评估干细胞治疗中的栓塞风险，以提升细胞质量和临床应用安全性 | 人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-28 |
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102239
PMID:37120815
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞用于单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种针对人类皮肤屏障特性的高活性免疫细胞分离方法，适用于单细胞RNA测序 | 协议依赖于酶解和流式细胞术，可能对细胞活性有特定要求，且未详细讨论所有潜在技术挑战 | 开发一种从人类皮肤中分离免疫细胞的方法，以支持单细胞RNA测序在炎症性疾病研究中的应用 | 人类皮肤活检样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-28 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
|
研究论文 | 本文介绍了一种在高脂饮食诱导的肥胖小鼠中，通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析阴道γδ T细胞的实验方案 | 开发了针对肥胖小鼠阴道γδ T细胞分析的综合实验方案，结合单细胞RNA测序和流式细胞术，以研究肥胖对生殖器疱疹易感性的影响 | NA | 研究肥胖如何影响生殖器疱疹（由HSV-2引起）的易感性，并分析阴道γδ T细胞在其中的作用 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠的阴道γδ T细胞 | 数字病理学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-28 |
Protocol for tumor dissociation and fluorescence-activated cell sorting of human head and neck cancers
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102294
PMID:37149858
|
protocol | 本文描述了一种用于新鲜人类头颈部肿瘤标本解离及荧光激活细胞分选获取活性单细胞的逐步操作方案 | 提供了一种标准化的头颈部肿瘤组织解离与单细胞分选流程，支持下游单细胞RNA测序和三维患者来源类器官生成等应用 | NA | 建立头颈部肿瘤单细胞研究的前处理实验方案 | 人类头颈部肿瘤组织 | digital pathology | head and neck cancer | fluorescence-activated cell sorting (FACS), single-cell RNA sequencing, organoid culture | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-28 |
Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102222
PMID:37060557
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研究论文 | 本文介绍了一种从HIV感染患者中分离外周血单个核细胞并进行单细胞RNA测序及整合分析的实验方案 | 结合10x Genomics单细胞测序技术和Illumina NovaSeq平台，对HIV感染患者的PBMCs进行单细胞转录组分析，并整合B细胞亚群功能和BCR受体库轨迹分析 | 未提及样本量大小或具体患者特征，可能限制结果的普适性 | 研究HIV感染对免疫细胞转录组的影响 | HIV感染患者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics protocol, Illumina NovaSeq 6000 | 10x Genomics单细胞测序方案结合Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 11 | 2026-03-25 |
Graph embedding and Gaussian mixture variational autoencoder network for end-to-end analysis of single-cell RNA sequencing data
2023-01-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100382
PMID:36814845
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研究论文 | 提出了一种名为autoCell的深度学习框架，用于单细胞RNA测序数据的端到端分析，包括插补、特征提取和疾病相关网络识别 | 结合图嵌入和概率深度高斯混合模型的变分自编码网络，用于处理高维稀疏scRNA-seq数据，并应用于细胞发育轨迹分析和疾病相关细胞鉴定 | 未明确说明模型在大型数据集上的计算效率或与其他先进方法的全面比较 | 开发一种深度学习方法来改善单细胞RNA测序数据的分析，包括插补和特征提取 | 单细胞RNA测序数据，包括模拟数据集和生物学相关数据集，如人类胚胎和阿尔茨海默病样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器，高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-21 |
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01589-9
PMID:37563308
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研究论文 | 本研究通过整合小鼠模型和人类单细胞测序数据，鉴定并验证了人类exTreg细胞是具有细胞毒性的CD4+ T细胞亚群 | 首次将小鼠模型中的exTreg细胞转录组特征映射到人类单细胞数据，鉴定出CD16+CD56+的细胞毒性CD4+ T细胞作为人类exTreg细胞，并证实其克隆扩增和细胞毒功能 | 研究主要基于转录组和表面标志物分析，对exTreg细胞在动脉粥样硬化中的具体功能机制和临床意义需要进一步验证 | 鉴定人类动脉粥样硬化中由调节性T细胞转化而来的exTreg细胞的分子特征和功能特性 | 小鼠和人类的调节性T细胞（Treg）及其转化形成的exTreg细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | RNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 流式细胞术, T细胞受体测序, 细胞杀伤实验, CD107a脱颗粒实验 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 流式数据, 序列数据 | 来自FoxP3ROSA26-Apoe小鼠模型的Treg和exTreg细胞，以及人类外周血样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-21 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549345
PMID:37503290
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研究论文 | 本文通过重新分析小鼠模型中的单细胞RNA测序数据，挑战了单纯疱疹病毒1型在非神经元神经节细胞中存在潜伏感染的观点 | 揭示了3'端单细胞RNA测序实验中脱靶引物效应导致非多聚腺苷酸化的HSV-1内含子RNA被错误检测，并首次系统论证了神经元细胞死亡导致的RNA污染是先前结论的主要成因 | 研究基于已发表数据的二次分析，缺乏新的实验验证；结论主要依赖于生物信息学推断，可能存在未考虑的技术偏差 | 验证单纯疱疹病毒1型潜伏感染的细胞特异性，澄清单细胞测序数据分析中的技术假象 | 小鼠外周神经节中的神经元与非神经元细胞 | 数字病理学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析流程 | 单细胞转录组数据 | 基于已发表小鼠模型单细胞数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'端单细胞RNA测序实验 |
| 14 | 2026-03-20 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.17.553733
PMID:37645822
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖症中血小板反应蛋白-1（THBS1）如何促进膈肌纤维脂肪基质扩张和收缩功能障碍 | 首次确立THBS1作为肥胖诱导膈肌基质重塑和收缩功能障碍的必要介质，并识别其作为潜在治疗靶点 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证；未详细探讨THBS1下游信号通路 | 探究THBS1在肥胖相关膈肌功能障碍中的作用机制 | 野生型和THBS1敲除小鼠的膈肌组织 | NA | 肥胖症 | bulk转录组学, single-cell转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和THBS1敲除小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-20 |
Human ureteric bud organoids recapitulate branching morphogenesis and differentiate into functional collecting duct cell types
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01429-5
PMID:36038632
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研究论文 | 本研究描述了从人类多能干细胞高效分化出输尿管芽类器官和功能性集合管细胞，模拟肾脏发育过程 | 首次实现人类多能干细胞在无血清条件下高效分化为输尿管芽类器官，并展示其分支形态发生和功能性集合管细胞分化 | NA | 肾脏再生医学，旨在通过干细胞分化模拟肾脏发育和功能 | 人类多能干细胞、输尿管芽类器官、集合管细胞 | 再生医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-19 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的算法，通过将空间转录组数据与匹配的组织学图像中的核形态对齐，实现单细胞水平的去卷积、卷积和聚类分析 | STIE算法首次通过核形态相似性和邻域信息，从斑点间高达约70%的间隙区域恢复缺失细胞，实现了真正的单细胞水平分析，超越了现有方法仅关注斑点大小提升的局限 | 算法依赖于匹配的组织学图像和核形态数据，可能受图像质量或配准误差影响，且在处理高度异质或重叠细胞时性能未完全评估 | 旨在解决基于斑点的空间转录组学中无法精确捕获单细胞转录组的问题，实现单细胞水平的分辨率提升 | 真实和模拟的空间转录组学数据，包括低分辨率和高分辨率斑点 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 图像、文本（转录组数据） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-03-19 |
Endogenous adenine mediates kidney injury in diabetic models and predicts diabetic kidney disease in patients
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170341
PMID:37616058
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研究论文 | 本研究提出内源性腺嘌呤可能是糖尿病肾病（DKD）的致病因子，并探讨了尿腺嘌呤/肌酐比值（UAdCR）作为预测终末期肾病（ESKD）的机制性生物标志物的潜力 | 首次提出内源性腺嘌呤是DKD的致病因子，发现UAdCR可作为无大量白蛋白尿患者ESKD的预测生物标志物，并确定了腺嘌呤通过mTOR通路促进肾损伤的机制 | 研究主要基于观察性队列，因果关系需进一步实验验证；样本来自特定人群，结果外推需谨慎 | 探究内源性腺嘌呤在糖尿病肾病发生发展中的作用，并寻找预测DKD进展的机制性生物标志物 | 糖尿病患者（来自CRIC、SMART2D和美国印第安人研究）、糖尿病小鼠模型、肾小管细胞 | 代谢组学与转录组学 | 糖尿病肾病 | 空间代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 尿液代谢物数据、空间代谢组数据、单细胞转录组数据 | 多个队列的糖尿病患者（具体人数未明确说明）、糖尿病小鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106164
PMID:36915697
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了高脂饮食诱导的肥胖对海马区小胶质细胞功能失调的影响及其与认知障碍的关联 | 利用单细胞转录组学分析，揭示了肥胖状态下海马小胶质细胞在细胞间通讯、免疫调节和蛋白质处理方面的动态变化机制 | 研究基于小鼠模型，其机制在人类中的适用性仍需进一步验证 | 探究肥胖诱导的认知障碍中海马小胶质细胞激活的精确分子机制 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型中的海马小胶质细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-03-19 |
Cross center single-cell RNA sequencing study of the immune microenvironment in rapid progressing multiple myeloma
2023-Jan-26, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-022-00340-x
PMID:36702834
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研究论文 | 本研究通过多中心单细胞RNA测序，分析了快速进展型多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫微环境特征 | 首次通过多中心协作的单细胞RNA测序研究，系统比较了快速进展与非进展多发性骨髓瘤患者的免疫微环境差异，并验证了不同研究中心数据的一致性 | 样本量相对有限（18名患者），且为横断面研究，无法确定观察到的细胞群变化与疾病进展的因果关系 | 探究多发性骨髓瘤快速进展的免疫微环境机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD138样本 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 48份骨髓样本（来自18名患者），共计102,207个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-03-18 |
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1290696
PMID:37900283
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综述 | 本文综述了黑色素瘤中预后和预测性免疫生物标志物检测的最新方法 | 整合了从批量组织基因表达谱到单细胞空间转录组学和基于人工智能的图像分析等多种技术，以全面表征黑色素瘤免疫微环境 | 作为综述文章，未提供原始实验数据或新方法验证，主要总结现有研究 | 改进黑色素瘤的免疫基础预测和预后生物标志物检测方法 | 黑色素瘤患者，特别是II-IV期患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因表达谱分析，空间转录组学，人工智能图像分析 | NA | 图像，文本（基因表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |