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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-17 |
Unagi: Deep Generative Model for Deciphering Cellular Dynamics and In-Silico Drug Discovery in Complex Diseases
2023-Dec-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3676579/v1
PMID:38196613
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研究论文 | 本文介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络，用于分析时间序列单细胞转录组数据，以解码复杂疾病中的细胞动态并进行计算机药物发现 | UNAGI是一种专门针对时间序列单细胞转录组数据设计的深度生成模型，能够捕获疾病进展中的复杂细胞动态，并增强药物扰动建模和发现能力 | NA | 开发一种计算工具，用于详细分析疾病进展并进行靶向计算机药物干预 | 时间序列单细胞转录组数据，特别是来自特发性肺纤维化（IPF）患者和COVID数据集的数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-12-14 |
Single-cell profiling of alveolar rhabdomyosarcoma reveals RAS pathway inhibitors as cell-fate hijackers with therapeutic relevance
2023-02-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade9238
PMID:36753540
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序等技术揭示了肺泡型横纹肌肉瘤的细胞异质性，并发现RAS通路抑制剂能诱导肿瘤细胞向有利分化方向转变，具有治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和高内涵成像解析aRMS的细胞层次，并筛选出能“劫持”肿瘤细胞命运的RAS通路抑制剂组合 | 研究主要基于患者来源的原代培养细胞，体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究肺泡型横纹肌肉瘤的细胞异质性、发育停滞机制及潜在治疗靶点 | 患者来源的原代肺泡型横纹肌肉瘤细胞 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 高内涵成像 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 患者来源的原代培养细胞（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-13 |
Determinants of Survival with Combined HER2 and PD-1 Blockade in Metastatic Esophagogastric Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3769
PMID:37406106
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研究论文 | 本研究探讨了在转移性食管胃癌中，联合使用HER2和PD-1阻断疗法（帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗）的生存决定因素，并评估了多种生物标志物和测序技术 | 通过整合89Zr-曲妥珠单抗PET、血浆循环肿瘤DNA动态监测和单细胞RNA测序，揭示了患者内基因组异质性对治疗反应的影响，并识别了与治疗抵抗相关的转录程序 | 研究基于相对较小的样本量（如MSK队列n=226），且为观察性研究，可能受限于回顾性数据分析和潜在的选择偏倚 | 识别转移性食管胃癌患者在接受HER2和PD-1联合阻断疗法时的预后生物标志物和抵抗机制 | 转移性食管胃癌患者，包括接受帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗联合治疗的患者以及MSK队列中的曲妥珠单抗治疗患者 | 数字病理学 | 食管胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、全外显子测序、循环肿瘤DNA（ctDNA）监测、89Zr-曲妥珠单抗PET成像 | 多变量Cox回归模型 | 影像数据（PET）、基因组数据（ctDNA、scRNA-seq、全外显子测序） | MSK队列中226名曲妥珠单抗治疗患者，以及来自MSK和三星的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-12-13 |
Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2268257
PMID:37849962
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研究论文 | 本研究揭示了放疗未能有效诱导T细胞浸润的机制，并提出通过抑制DPP4来增强放疗疗效的策略 | 首次发现树突状细胞在放疗后高表达DPP4是限制T细胞浸润的关键因素，并提出DPP4抑制剂联合放疗可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于临床前模型，尚未在大型临床试验中验证；机制研究主要聚焦于DPP4对趋化因子的调控 | 探究放疗联合免疫治疗的增效机制，寻找增强放疗诱导抗肿瘤免疫应答的新策略 | 肺癌和黑色素瘤患者样本、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-12 |
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-12-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.09.003
PMID:37865091
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了严重哮喘患者气道中CD4+组织驻留记忆T细胞的异质性及其与疾病严重性的关联 | 首次在严重哮喘患者气道中发现CD103+ CD4+ TRM细胞显著增加，并揭示其具有细胞毒性和促炎非TH2细胞因子表达特征 | 样本量相对较小（30例患者），且未明确这些TRM细胞的具体功能机制或治疗靶点 | 探究严重哮喘中除TH2细胞外的其他CD4+ T细胞亚群在气道炎症和重塑中的作用 | 从30名轻度和严重哮喘患者的支气管肺泡灌洗样本中分离的CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 30例患者（轻度和严重哮喘），超过50,000个气道CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-12-12 |
Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging
2023-12, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2023.111878
PMID:37827221
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和微阵列转录组数据，探讨了皮肤细胞在衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化，并筛选出可能调控皮肤衰老的关键氧化应激相关基因 | 首次在单细胞水平上系统比较了年轻与老年皮肤中不同类型细胞的氧化应激反应和解毒能力差异，并识别出ANXA1和APOE作为潜在的关键调控基因 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏蛋白质水平和功能实验验证；样本量可能有限；未考虑环境因素（如紫外线）的交互影响 | 阐明皮肤衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化机制，识别关键调控基因 | 人类皮肤细胞（包括角质形成细胞、黑色素细胞、血管内皮细胞、成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和免疫细胞） | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-12 |
Single-cell mapping reveals several immune subsets associated with liver metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.010
PMID:37633269
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研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术绘制了胰腺导管腺癌（PDAC）的免疫图谱，揭示了与肝转移相关的特定免疫细胞亚群 | 首次在PDAC中结合多部位（原发灶、血液、淋巴结）样本进行高维单细胞分析，并识别出与肝转移潜能相关的CD103+PD-1+CD39+ T细胞减少和CD73+巨噬细胞增加的免疫特征 | 样本量相对较小（26个样本来自11名患者），且为观察性研究，需要更大队列验证 | 探究晚期PDAC肿瘤微环境中与转移相关的免疫细胞动态变化，以寻找免疫治疗新策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的不同阶段组织样本（原发肿瘤、血液、淋巴结） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞质谱流式技术（CyTOF）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光免疫组化 | NA | 单细胞蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、组织图像数据 | 26个样本（11个原发肿瘤组织、10个血液样本、5个淋巴结样本），来自11名PDAC患者 | NA | 单细胞蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-12-12 |
Single-cell transcriptomics reveal a hyperacute cytokine and immune checkpoint axis after cardiac arrest in patients with poor neurological outcome
2023-07-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.05.003
PMID:37257452
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了心脏骤停后神经系统预后不良患者中存在的超急性细胞因子和免疫检查点轴 | 首次在单细胞分辨率下定义了临床心脏骤停诱导的先天免疫网络，并识别了与不良预后相关的Nectin-2+单核细胞和Tim-3+自然杀伤细胞亚群 | 研究样本量未明确说明，且结论主要基于观察性数据，需要进一步实验验证 | 探究心脏骤停后系统性炎症反应与神经系统损伤之间的关联 | 心脏骤停住院患者 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-12-11 |
MLKL deficiency alleviates neuroinflammation and motor deficits in the α-synuclein transgenic mouse model of Parkinson's disease
2023-12-01, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00686-5
PMID:38041169
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研究论文 | 本研究探讨了MLKL蛋白在帕金森病中的神经保护作用，通过基因敲除小鼠模型和单细胞RNA-seq分析，发现MLKL缺乏能减轻神经炎症和运动缺陷 | 首次在α-synuclein转基因小鼠模型中揭示MLKL缺乏对帕金森病神经炎症和运动症状的改善作用，并结合单细胞RNA-seq技术提供了细胞类型特异的转录组证据 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类患者中进行验证，且长期效应和具体分子机制需进一步探索 | 探究MLKL蛋白在帕金森病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠模型（Tg-Mlkl）、原代神经元细胞、人iPSC来源的中脑类器官 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA-seq | 转基因小鼠模型、基因敲除模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确指定样本数量，但涉及转基因小鼠、原代细胞和类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-12-11 |
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-10-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d3mo00049d
PMID:37403821
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研究论文 | 介绍了一个名为TALKIEN的在线R/Shiny应用，用于通过构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络可视化分子对话信息 | 开发了一个简单直观的在线工具，整合了配体-受体相互作用网络构建、系统生物学分析和下游通路展示，支持药物靶点信息 | NA | 旨在帮助研究人员解释分子通信，特别是通过配体-受体相互作用来预测细胞间通信 | 基因或蛋白质列表，代表细胞谱系 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | 基因或蛋白质列表 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2025-12-11 |
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-09, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02223-8
PMID:37658228
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研究论文 | 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍（ASD）风险/致病基因，发现Wnt1内含子1中的一种新型突变，该突变导致WNT1表达降低，并在人源化大鼠模型中引发ASD样行为和中脑多巴胺能神经元发育性缺失 | 首次报道中脑多巴胺能神经元的发育性缺失是ASD的发病机制，并揭示异常祖细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元缺失的细胞基础 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探索ASD的潜在致病机制，特别是遗传突变对神经发育的影响 | 人源化大鼠模型，重点关注中脑多巴胺能神经元 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列数据，行为数据 | 未明确指定样本数量，但涉及大规模基因筛查和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-12-10 |
Identification of PHACTR4 as A New Biomarker for Diabetic Nephropathy and Its Correlation with Glomerular Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2023-11, Iranian journal of kidney diseases
IF:0.8Q4
DOI:10.52547/ijkd.7858
PMID:38043109
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研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞测序数据分析，鉴定出PHACTR4作为糖尿病肾病的新型生物标志物，并揭示了其与肾小球内皮功能障碍和免疫浸润的关联 | 首次将PHACTR4鉴定为糖尿病肾病中与肾小球内皮细胞功能障碍相关的关键生物标志物，并利用单细胞测序数据揭示了其在炎症反应中的调控作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏动物模型或临床样本的体内验证 | 鉴定与糖尿病肾病肾小球内皮细胞功能障碍相关的生物标志物 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据、人肾小球内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 微阵列测序, 单细胞RNA-seq, RT-PCR | LASSO逻辑回归, WGCNA, ssGSEA | 基因表达数据 | GSE30528和GSE131882数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 13 | 2025-12-10 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
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研究论文 | 本文提出了一种基于甘露醇的缓冲液（PBS-M），用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 | 开发了一种低盐度磷酸盐缓冲液，通过添加D-甘露醇来维持高盐度海洋细胞的活力，从而提高了scRNA-seq的数据质量和细胞代表性 | 研究主要针对海鞘血细胞，可能未广泛测试于其他海洋生物或细胞类型，且未详细探讨缓冲液对长期细胞保存或不同测序平台的影响 | 旨在优化单细胞RNA测序技术，以更好地应用于高盐度环境中的海洋生物研究 | 海鞘的血细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及海鞘血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-12-07 |
Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts
2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2041
PMID:36239989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术，揭示了结直肠癌肝转移微环境中SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞之间的免疫抑制性空间网络 | 首次在结直肠癌肝转移微环境中鉴定出具有代谢改变和泡沫细胞特征的SPP1+巨噬细胞，并发现其与成纤维细胞通过配体-受体对形成空间邻近的互作网络，共同促进免疫抑制 | 研究主要基于微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本，可能不适用于其他亚型；样本量相对有限，需要更大队列验证 | 表征结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞组成和相互作用，以理解免疫抑制机制 | 结直肠癌肝转移组织、配对正常肝组织及外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、多重空间成像、批量基因表达与细胞反卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间成像数据、批量基因表达数据 | 一系列微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本及配对组织 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2025-12-06 |
CellNeighborEX: deciphering neighbor-dependent gene expression from spatial transcriptomics data
2023-11-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202311670
PMID:37815040
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研究论文 | 提出一种名为CellNeighborEX的新方法，用于从空间转录组学数据中解析细胞邻居依赖的基因表达 | 开发了一种能有效捕获不同微环境影响的新方法，通过直接细胞定位或多细胞转录组混合来分类细胞，识别与伙伴细胞类型相关的多样化基因集 | NA | 研究细胞邻居依赖的基因表达，以理解细胞间相互作用 | 小鼠胚胎、大脑和肝癌组织中的细胞 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2025-12-06 |
Imprinted genes and the manipulation of parenting in mammals
2023-11, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00644-3
PMID:37714957
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综述 | 本文探讨了基因组印记在哺乳动物亲代抚育行为中的角色及其进化意义 | 利用单细胞RNA测序数据，揭示了印记基因与亲代抚育质量之间的双向、迭代关系 | NA | 研究基因组印记如何影响哺乳动物的亲代抚育行为及其进化背景 | 哺乳动物中的印记基因及其在亲代抚育中的作用 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-12-06 |
Spatiotemporal, optogenetic control of gene expression in organoids
2023-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01986-w
PMID:37735569
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研究论文 | 本研究结合光遗传学和基因扰动技术，在类器官中实现了目标基因表达的可编程时空控制 | 首次将光遗传学与基因扰动技术结合，用于控制类器官中基因表达的时空模式，并通过空间和单细胞转录组分析揭示了SHH信号在神经发育中的新调控机制 | 未明确说明技术适用范围、效率或潜在脱靶效应，且可能仅限于特定类器官模型 | 开发控制类器官中基因表达时空模式的方法，以研究人类发育和疾病建模 | 干细胞衍生的类器官，特别是人类神经发育类器官模型 | 生物医学工程 | NA | 光遗传学、基因扰动技术、空间转录组学、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-12-05 |
Neuronal types in the mouse amygdala and their transcriptional response to fear conditioning
2023-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01469-3
PMID:37884748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了成年小鼠杏仁核在恐惧学习和记忆巩固过程中的细胞类型分类，并识别出130种神经元类型及其空间分布 | 首次在恐惧学习背景下，利用单细胞转录组学构建了小鼠杏仁核的详细细胞类型图谱，并揭示了特定神经元亚群在恐惧记忆编码和检索中的转录响应 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；单细胞测序技术可能无法捕获所有低丰度转录本 | 探究杏仁核在恐惧学习和记忆巩固过程中的神经元类型及其转录响应机制 | 成年小鼠杏仁核的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括天真和恐惧条件化的小鼠样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-12-05 |
High-Salt Diet Causes Defective Oocyte Maturation and Embryonic Development to Impair Female Fertility in Mice
2023-12, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202300401
PMID:37863820
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研究论文 | 本研究探讨高盐饮食对小鼠卵母细胞成熟、胚胎发育及雌性生育力的影响及其机制 | 首次揭示高盐饮食通过破坏卵母细胞自噬、凋亡水平和线粒体功能，导致卵母细胞减数分裂停滞、受精失败和早期胚胎发育缺陷，从而损害雌性生育力 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他哺乳动物中验证；机制研究主要基于转录组数据，需进一步实验验证 | 探究高盐饮食对雌性生殖细胞发育及生育力的影响机制 | C57BL/6雌性小鼠的卵母细胞、胚胎及生育力指标 | 生殖生物学 | 生育力障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6雌性小鼠（对照组与高盐饮食组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-12-04 |
Ursa: A Comprehensive Multiomics Toolbox for High-Throughput Single-Cell Analysis
2023-12-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msad267
PMID:38091963
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Ursa的自动化单细胞多组学R软件包，旨在为非生物信息学专家提供一站式单细胞分析解决方案 | 开发了首个集成6种自动化单细胞组学和空间转录组学工作流程的综合工具箱，通过自动化流程降低生物信息学分析门槛 | 未提及该工具包在特定疾病数据集上的验证效果，也未说明与现有工具的基准比较结果 | 开发易用的生物信息学工具以加速单细胞多组学研究，弥合生物信息学专家与非专家之间的技术鸿沟 | 单细胞多组学数据分析工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学分析 | 自动化分析流程 | 基因组学、转录组学、表观遗传学、蛋白质组学、免疫组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |