单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-14 |
Early Deregulation of Cholangiocyte NR0B2 During Primary Sclerosing Cholangitis
2023, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.07.023
PMID:39130146
|
研究论文 | 本文通过PubMed数据挖掘，研究了原发性硬化性胆管炎（PSC）中胆管细胞NR0B2的早期失调，并探讨了其与代谢和癌前重编程的关系。 | 首次揭示了PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在代谢和癌前重编程中的作用，并提出了针对NR0B2的治疗策略。 | NA | 研究PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在疾病进展中的作用。 | 胆管细胞NR0B2的表达及其在PSC中的作用。 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个PSC肝脏转录组训练和验证队列，FXR激动剂或FXR敲除小鼠肝脏转录组，Abcb4-/-小鼠PSC模型肝脏单细胞转录组。 |
| 122 | 2024-08-11 |
Age-dependent Microglial Disease Phenotype Results in Functional Decline in Gut Macrophages
2023, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.09.006
PMID:36908772
|
研究论文 | 研究探讨了年龄依赖性的肌肉层巨噬细胞（MMs）的遗传特征变化及其与微胶质细胞的比较 | 首次揭示了肌肉层巨噬细胞随年龄增长而出现的老年状态表型，及其与微胶质细胞疾病相关表型的相似性 | 研究主要集中在小鼠和人类组织上，可能需要更多物种的数据支持 | 识别肌肉层巨噬细胞在年龄依赖性变化中的遗传特征，并比较其与微胶质细胞的基因表达 | 小鼠和人类的肌肉层巨噬细胞及其基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序和定量实时PCR | NA | 基因表达数据 | 年轻（3个月）和老年（16-24个月）的C57BL/6小鼠及人类组织 |
| 123 | 2024-08-07 |
Delayed boosting improves human antigen-specific Ig and B cell responses to the RH5.1/AS01B malaria vaccine
2023-01-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163859
PMID:36692019
|
研究论文 | 研究通过延迟分次剂量（DFx）给药方案（0-1-6个月），使用AS01B佐剂的RH5.1疟疾抗原，深入分析了PfRH5特异性Ig和B细胞反应，发现DFx给药能增加循环中PfRH5特异性B细胞和血清IgG1的数量和持久性 | 首次揭示了DFx给药对体液反应的深远影响，并提出了可能增强抗体持久性的机制，包括血清Ig通过改善FcRn结合和潜在的细胞反应从循环短命浆细胞向非外周长命浆细胞的转变 | NA | 研究疫苗递送方式的改进如何增加血清抗体持久性，以最大化疫苗效力 | PfRH5特异性Ig和B细胞反应 | 免疫学 | 疟疾 | ELISA, 流式细胞术, 系统血清学, 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 血清, 细胞 | NA |
| 124 | 2024-08-07 |
Dry eye disease in mice activates adaptive corneal epithelial regeneration distinct from constitutive renewal in homeostasis
2023-01-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2204134120
PMID:36595669
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠角膜上皮在稳态、老化、糖尿病和干眼病（DED）状态下的转录状态，揭示了DED中角膜上皮适应性再生的独特响应。 | 本研究首次提供了区分稳态更新与适应性再生的全局标记，并验证了SPARC作为适应性再生标记的表达，加速了角膜上皮细胞的伤口闭合。 | NA | 探索干眼病状态下角膜上皮的适应性再生机制，并为未来研究眼部表面干细胞在健康和疾病中的功能提供框架和图谱。 | 小鼠角膜上皮细胞在不同生理和病理状态下的转录状态。 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 125 | 2024-08-05 |
DUSP6 mediates resistance to JAK2 inhibition and drives leukemic progression
2023-01, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00486-8
PMID:36581736
|
研究论文 | 本研究揭示DUSP6在髓系恶性肿瘤转化中的作用及其作为潜在治疗靶点的价值 | 发现DUSP6的异常表达与疾病转化相关，且DUSP6-RSK1通路可作为药物靶点 | 未详细探讨DUSP6在不同患者中的具体作用机制 | 探索DUSP6在髓系恶性肿瘤和急性髓性白血病转化中的角色 | 靶向DUSP6 的治疗效果及其在患者衍生的异种移植模型中的作用 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | PDX模型 | 基因表达数据 | 多名患者的骨髓干细胞和祖细胞 |
| 126 | 2024-08-05 |
Graphene oxide elicits microbiome-dependent type 2 immune responses via the aryl hydrocarbon receptor
2023-01, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-022-01260-8
PMID:36509925
|
研究论文 | 这项研究展示了石墨烯氧化物通过芳香烃受体影响微生物组和免疫反应 | 本研究揭示了石墨烯氧化物对肠道微生物组的调节作用及其通过芳香烃受体介导的免疫反应 | 未提及特定的实验条件或样本的长期效果 | 探索石墨烯氧化物与肠道微生物组及免疫系统相互作用的机制 | 成年斑马鱼及其无菌幼体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 成年斑马鱼和无菌幼体的细胞样本 |
| 127 | 2024-08-05 |
Prediction of HLA genotypes from single-cell transcriptome data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1146826
PMID:37180102
|
研究论文 | 本文探讨如何从单细胞转录组数据中预测HLA基因型。 | 开发了多个计算HLA分型工具并展示了高准确性的基因型预测模型。 | 尚不清楚从单细胞数据直接预测HLA基因型的可行性。 | 评估和扩展现有HLA基因型预测工具的性能。 | 人类单细胞数据与标准分子基因分型的比较。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 组合模型 | 转录组数据 | NA |
| 128 | 2024-08-04 |
Integration of spatial and single-cell data across modalities with weak linkage
2023-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.12.523851
PMID:36711792
|
研究论文 | 本文提出了一种新的跨模态数据集成方法MaxFuse，以解决单细胞和空间组学数据之间的弱链接问题 | MaxFuse方法通过迭代共同嵌入、数据平滑和细胞匹配来实现高质量的数据集成，即使在信息关联性较弱的情况下也能保持高鲁棒性和准确性 | 目前的方法依赖于高度相关的先验“链接”特征，当相关特征稀少或缺乏信息时，现有方法会失败 | 研究目的在于提升单细胞和空间组学数据的跨模态集成能力 | 研究对象主要是单细胞测序和空间蛋白组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 空间条形码技术 | NA | 多组学数据 | 通过对单细胞和空间真实多组学数据集的基准测试进行验证 |
| 129 | 2024-08-05 |
Transcriptomic profiling of retinal cells reveals a subpopulation of microglia/macrophages expressing Rbpms and Spp1 markers of retinal ganglion cells (RGCs) that confound identification of RGCs
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525216
PMID:36747805
|
研究论文 | 本文分析了小鼠视网膜的微胶质细胞和巨噬细胞，发现其中特定亚群可能导致对视网膜神经节细胞的误识别 | 揭示了Rbpms+和Spp1+微胶质细胞/巨噬细胞在视网膜神经节细胞鉴定中的潜在混淆作用 | 仅分析了小鼠的视网膜细胞，无法推广到其他物种 | 研究视网膜神经节细胞的生物学及其亚型 | 视网膜微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 视网膜细胞亚群体 |
| 130 | 2024-08-05 |
The meningeal transcriptional response to traumatic brain injury and aging
2023-01-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81154
PMID:36594818
|
研究论文 | 本研究利用高通量RNA测序技术探讨了脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 | 该研究揭示了年轻和衰老小鼠在轻微脑损伤后的脑膜转录组动态变化 | 研究对脑膜生物学的基本认识仍然不足 | 探讨脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 | 研究对象为年轻和衰老小鼠的脑膜 | 数字病理学 | 神经疾病 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 年轻小鼠和衰老小鼠 |
| 131 | 2024-08-05 |
Robust segregation of donor and recipient cells from single-cell RNA-sequencing of transplant samples
2023, Frontiers in transplantation
DOI:10.3389/frtra.2023.1161146
PMID:38993922
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法，通过单细胞RNA测序准确区分供体和受体细胞。 | 创新性地开发了一种新的两阶段基因型发现方法，对移植样本具有较强的鲁棒性，能够在更低的基因型比例下更准确地区分供体和受体细胞。 | 尚未提及文章的具体限制 | 旨在开发用于移植生物学背景下的单细胞RNA测序的生物信息学工具。 | 研究对象为移植样本中的单细胞，包括供体和受体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括虚拟数据及实际的器官移植的单细胞RNA测序数据 |
| 132 | 2024-08-04 |
Compressed phenotypic screens for complex multicellular models and high-content assays
2023-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525189
PMID:36747859
|
研究论文 | 本文提出了一种通过压缩筛选法来提高复杂多细胞模型的高通量表型筛选效率 | 文章创新性在于通过对生化干预进行汇总并运用计算解卷积，建立了压缩筛选的专门方法 | 未明确提及具体的局限性 | 研究旨在提高复杂多细胞模型中的表型筛选效率，以促进药物发现 | 研究对象为患者衍生的胰腺癌类器官以及与肿瘤微环境（TME）相关的重组蛋白配体库 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 高内容成像 | 使用了高度生物活性的化合物库进行受控基准测试 |
| 133 | 2024-08-05 |
Single Cell Transcriptomics Identifies Distinct Choroid Cell Populations Involved in Visually Guided Eye Growth
2023, Frontiers in ophthalmology
DOI:10.3389/fopht.2023.1245891
PMID:38390290
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了参与视觉引导眼睛生长的不同脉络膜细胞群体 | 首次提供了主要脉络膜细胞类型及其在调节眼睛生长中的基因表达变化的全面概况 | 大部分显著的基因表达变化相对较小，并且仅在一种罕见细胞群体中观察到最高的变化 | 阐明脉络膜在后天眼球生长中的作用 | 小鸡脉络膜细胞群体及其基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鸡脉络膜的24个细胞群体 |
| 134 | 2024-08-05 |
RNA-binding proteins that are highly expressed and enriched in healthy cartilage but suppressed in osteoarthritis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1208315
PMID:37457300
|
研究论文 | 本研究揭示了在健康软骨中高度表达且富集的RNA结合蛋白在骨关节炎中的表达变化。 | 研究首次绘制了健康软骨中RNA结合蛋白的全球表达图谱，并发现TIPARP作为骨关节炎的新型介导因子和潜在治疗靶点。 | 本研究主要依赖于已有的RNA测序数据，缺乏临床样本的验证。 | 探讨RNA结合蛋白在健康软骨与骨关节炎中的表达及其潜在作用。 | 主要集中在健康 cartilage 和骨关节炎 cartilage 中的RNA结合蛋白。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 健康和骨关节炎人类软骨的RNA测序数据，包含1542个RNA结合蛋白 |
| 135 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics unveils xylem cell development and evolution
2023-01-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02845-1
PMID:36624504
|
研究论文 | 该研究揭示了木质部细胞在不同植物物种中的发育谱系和进化关系 | 通过单细胞转录组学和激光捕获微切割技术，首次解析了多个木本被子植物的木质部细胞发育谱系 | 研究主要集中在有限数量的木本被子植物上，可能无法全面代表所有植物的木质部细胞发展 | 探索不同植物的木质部细胞类型的发育和进化过程 | 四种不同的木本被子植物的木质部细胞类型 | 数字植物学 | NA | 单细胞转录组分析，激光捕获微切割 | NA | 转录组数据 | 四种木本被子植物的多个样本 |
| 136 | 2024-08-05 |
H2-O deficiency promotes regulatory T cell differentiation and CD4 T cell hyperactivity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304798
PMID:38250071
|
研究论文 | 本研究揭示了H2-O缺乏如何增强胸腺调节性T细胞的分化及CD4 T细胞的活性 | 首次提供了H2-O在胸腺调节性T细胞发育中的直接证据 | 缺乏对其他潜在机制的综合考虑 | 深入理解H2-O缺乏对自体免疫性疾病的影响 | 主要研究胸腺调节性T细胞及外周CD4 T细胞 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 137 | 2024-08-05 |
Mimicking Tumor Cell Heterogeneity of Colorectal Cancer in a Patient-derived Organoid-Fibroblast Model
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.02.014
PMID:36868311
|
研究论文 | 本文开发了一种结合匹配的上皮细胞和间质成纤维细胞的结直肠癌类器官模型 | 创新点在于该模型反映了肿瘤微环境的复杂性，并提供了更贴近体内肿瘤形态的细胞异质性 | 此模型可能未能完全再现所有肿瘤微环境的复杂因素 | 研究结直肠癌中肿瘤细胞与间质成纤维细胞的相互作用 | 本研究对象为结直肠癌样本中分离的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 3D类器官模型 | 细胞 | 来自结直肠癌样本的主要成纤维细胞和肿瘤细胞 |
| 138 | 2024-08-04 |
Quantification of spatial pharmacogene expression heterogeneity in breast tumors
2023-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1686
PMID:35906899
|
研究论文 | 本研究分析了乳腺肿瘤中286个药物基因的空间表达异质性。 | 该研究利用新开发的Visium空间转录组平台，首次定量分析了乳腺肿瘤中药物基因的空间异质性。 | 本研究主要关注了六个乳腺癌样本，样本量相对较小，可能影响结果的普适性。 | 研究肿瘤组织中药物基因的空间表达异质性及其对癌症治疗的影响。 | 六个乳腺癌组织样本中的286个药物基因。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 六个乳腺癌组织样本 |
| 139 | 2024-08-05 |
Creeping fat exhibits distinct Inflammation-specific adipogenic preadipocytes in Crohn's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1198905
PMID:38111581
|
研究论文 | 本研究分析了克罗恩病患者中的爬行脂肪及其与炎症特异性脂肪前体细胞的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了爬行脂肪中与炎症和纤维化相关的脂肪前体细胞的特征 | 尚未完全理解爬行脂肪在克罗恩病纤维化发展中的潜在机制 | 分析克罗恩病中爬行脂肪的转录组特征，探索与纤维化和炎症的关系 | 研究了克罗恩病患者的爬行脂肪及其相关的预脂肪细胞群体 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 140 | 2024-08-04 |
Resveratrol attenuates staphylococcal enterotoxin B-activated immune cell metabolism via upregulation of miR-100 and suppression of mTOR signaling pathway
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1106733
PMID:36909201
|
研究论文 | 该研究探讨了白藜芦醇如何通过上调miR-100和抑制mTOR信号通路减轻金黄色葡萄球菌肠毒素B激活的免疫细胞的代谢。 | 发现miR-100在RES处理的肺单核细胞中的上调以及其对mTOR的靶向作用。 | 该研究主要在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类。 | 研究白藜芦醇对金黄色葡萄球菌肠毒素B引发的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）免疫细胞代谢的影响。 | 处理了小鼠模型以研究RES对金黄色葡萄球菌肠毒素B激活的免疫细胞的影响。 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 小鼠模型，样本数量未具体说明 |