单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 1181 - 1191 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in the context of neuropathic pain: progress, challenges, and prospects
2023-01, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2022.07.004
PMID:35902034
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经病理性疼痛研究中的应用、挑战和前景 | scRNA-seq技术能够无偏差、高通量和高分辨率地分析与神经病理性疼痛相关的细胞转录组，有助于深入理解疼痛机制并实现个性化疼痛管理 | scRNA-seq在神经病理性疼痛领域的应用相对较新，且主要基于动物模型，需要更多关注转化医学研究 | 探索神经病理性疼痛的机制，以改善临床上对疼痛的诊断、治疗和管理 | 神经病理性疼痛及其相关细胞的转录组 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 1182 | 2024-08-08 |
Cerebral organoids containing an AUTS2 missense variant model microcephaly
2023-01-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awac244
PMID:35802027
|
研究论文 | 本文利用人脑类器官模型研究了携带AUTS2基因错义变异的患者的神经病理生理机制 | 使用CRISPR-Cas9基因编辑技术纠正变异并展示了受损的类器官生长和神经前体细胞增殖缺陷的恢复，以及通过单细胞RNA测序揭示了AUTS2在人皮质发育中神经前体细胞的新作用 | NA | 研究AUTS2基因变异引起的神经发育障碍的分子机制 | 携带AUTS2基因错义变异的患者的脑类器官 | NA | 神经发育障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | 类器官，RNA | 单个患者 |
| 1183 | 2024-08-08 |
A 3-Gene Random Forest Model to Diagnose Non-obstructive Azoospermia Based on Transcription Factor-Related Henes
2023-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-01008-8
PMID:35715550
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法，基于转录因子相关基因，建立了一个用于诊断非阻塞性无精症的3基因随机森林模型 | 本研究首次筛选并验证了ETV2、TBX2和ZNF689三个转录因子在非阻塞性无精症诊断中的高诊断能力，并成功建立了随机森林诊断模型 | NA | 旨在通过机器学习算法识别具有高诊断能力的转录因子，用于非阻塞性无精症的诊断 | 非阻塞性无精症的诊断标志物 | 机器学习 | 男性不育症 | RT-qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 转录组数据 | 训练数据集包括11个对照组和47个非阻塞性无精症患者，外部验证集包括31个和20个样本，本地验证集包括20个对照组和20个非阻塞性无精症患者，单细胞RNA测序分析基于432个睾丸细胞样本 |
| 1184 | 2024-08-05 |
Assimilating Epigenetics and Transcriptomics for the Identification of Prognostic Novel Biomarkers and Imminent Targets in Colorectal Carcinoma with Therapeutic Potential
2023, Current molecular medicine
IF:2.2Q3
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研究论文 | 本文探讨了表观遗传学和转录组学在结直肠癌中识别预后新生物标志物和潜在治疗靶点的应用 | 研究结合了表观遗传学和转录组学，为结直肠癌的诊断和预后提供了新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 识别结直肠癌的预后新生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌及其相关的表观遗传学和转录组学特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学 | 单细胞转录组学 | 文本 | NA |
| 1185 | 2024-08-05 |
Dynamic Autophagy Map in Mouse Female Germ Cells Throughout the Fetal to Postnatal Life
2023-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-00940-z
PMID:35501593
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研究论文 | 本研究调查了小鼠雌性生殖细胞在胎儿到出生后生活中的自噬动态表达。 | 发现了阶段特异性的自噬相关基因，并绘制了自噬图谱，提供了对小鼠雌性生殖细胞发育自噬调控网络的新见解。 | NA | 研究小鼠雌性生殖细胞中自噬的潜在机制。 | 研究七类生殖细胞的自噬相关基因的动态表达。 | 数字病理学 | 女性不育 | 单细胞RNA-seq, 免疫荧光, 透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据 | 七种类型的生殖细胞 |
| 1186 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity and biology of valve cells in cardiac valve disease
2023-01, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2022.03.012
PMID:35414472
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综述 | 本文综述了心脏瓣膜疾病中瓣膜细胞的多样性和生物学特性，特别关注使用单细胞RNA测序技术发现的瓣膜细胞异质性和功能 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了瓣膜细胞的异质性和功能，为个性化治疗心脏瓣膜疾病提供了新的见解 | 文章主要为综述性质，未提供新的实验数据或研究结果 | 深入理解心脏瓣膜疾病的病理生物学，以开发更好的替代疗法 | 心脏瓣膜疾病中的瓣膜细胞 | 数字病理学 | 心脏瓣膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 1187 | 2024-08-08 |
The immune microenvironment shapes transcriptional and genetic heterogeneity in chronic lymphocytic leukemia
2023-01-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021006941
PMID:35358998
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研究论文 | 本文通过整合批量转录组分析和单细胞RNA测序，研究了慢性淋巴细胞白血病（CLL）中微环境和分子事件的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序和RNA速度分析揭示了CLL细胞在淋巴结中的命运轨迹，并发现激活的肿瘤细胞亚群与较差的预后相关 | 研究仅限于34名患者，且未探讨所有可能影响CLL进展的遗传和环境因素 | 探究CLL中微环境与分子事件的相互作用及其对疾病进展的影响 | CLL患者的周围血和淋巴结样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），全外显子测序（WES） | NA | 转录组数据 | 34名患者 |
| 1188 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals intrahepatic and peripheral immune characteristics related to disease phases in HBV-infected patients
2023-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325915
PMID:35361683
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了HBV感染患者肝脏和外周血的免疫特征，揭示了不同疾病阶段免疫细胞的动态变化 | 首次详细描述了HBV感染不同阶段肝脏和外周血中免疫细胞的特征及其相互作用，为理解HBV感染的免疫病理机制提供了新的视角 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证结果的普遍性 | 深入解析HBV感染不同阶段的免疫反应，为开发有效的治疗策略提供科学依据 | HBV感染患者的肝脏和外周血样本 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 46对肝脏和血液样本来自23名个体 |
| 1189 | 2024-08-08 |
Network-Based Structural Learning Nonnegative Matrix Factorization Algorithm for Clustering of scRNA-Seq Data
2023 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2022.3161131
PMID:35316190
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研究论文 | 本文提出了一种基于网络的结构学习非负矩阵分解算法（SLNMF），用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的细胞类型识别和轨迹推断 | SLNMF算法通过构建细胞间的相似网络并利用网络拓扑结构提取细胞的潜在特征，通过结构约束保留网络结构信息，显著提高了细胞类型识别和轨迹推断的性能 | NA | 开发一种新的算法以提高scRNA-seq数据中细胞类型识别和细胞轨迹推断的准确性 | scRNA-seq数据中的细胞类型和细胞轨迹 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解 | SLNMF算法 | scRNA-seq数据 | 14个scRNA-seq数据集，单细胞数量从49到26,484不等 |
| 1190 | 2024-08-08 |
IsoCell: An Approach to Enhance Single Cell Clustering by Integrating Isoform-Level Expression Through Orthogonal Projection
2023 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2022.3147193
PMID:35100120
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研究论文 | 本文提出了一种通过正交投影整合isoform水平表达来增强单细胞聚类的方法IsoCell | 首次提出将isoform水平表达信息与基因水平表达信息结合，以增强单细胞聚类分析 | NA | 探索通过整合isoform水平表达信息来提高单细胞聚类分析的性能 | 单细胞RNA测序数据中的isoform水平表达信息 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 正交投影矩阵 | 基因表达数据 | 十六个scRNA-seq数据集 |
| 1191 | 2024-08-08 |
A Clustering Ensemble Method for Cell Type Detection by Multiobjective Particle Optimization
2023 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3132400
PMID:34860653
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研究论文 | 本文提出了一种基于多目标粒子优化的聚类集成算法CEMP，用于通过单细胞RNA测序数据检测细胞类型 | 引入了一种多子空间投影方法，用于将原始数据映射到低维子空间，以检测复杂的数据结构，并提出了一种聚类集成优化方法 | NA | 开发新的计算方法以揭示细胞群体中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类集成算法 | 基因表达数据 | 9个真实单细胞RNA测序数据集 |