单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2024-08-05 |
Strategy of Patient-Specific Therapeutics in Cardiovascular Disease Through Single-Cell RNA Sequencing
2023-Jan, Korean circulation journal
IF:3.0Q2
DOI:10.4070/kcj.2022.0295
PMID:36627736
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序技术及其在心血管疾病中的应用 | 探讨了单细胞测序技术在精准医学中的临床应用 | 未具体提及技术的局限性 | 研究单细胞RNA测序在心血管疾病中的应用 | 分析心脏和血管的单细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 1022 | 2024-08-05 |
Transcriptomic Analysis of Human Podocytes In Vitro: Effects of Differentiation and APOL1 Genotype
2023-Jan, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2022.10.011
PMID:36644347
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研究论文 | 本研究分析了人类足细胞的转录组，以探讨分化和APOL1基因型的影响 | 该研究首次综合分析了人类尿源性足细胞的转录组特征，揭示APOL1高风险变体对足细胞功能的影响 | 研究仅使用了有限的细胞系，可能无法全面反映所有足细胞的转录特征 | 理解APOL1高风险变体对足细胞病理的作用机制 | 人类尿源性足细胞样上皮细胞（HUPEC）及其转录组 | 数字病理学 | 肾小管间质病 | 转录组分析 | NA | RNA | 4个细胞系（2个APOL1高风险，2个低风险） |
| 1023 | 2024-08-05 |
Initiative of clinical single-cell biomedicine in clinical and translational medicine
2023-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1173
PMID:36629041
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研究论文 | 临床单细胞生物医学是一个新兴学科，旨在整合单细胞分子和临床表型以揭示新的疾病特异性诊断和疗法 | 提出了临床单细胞生物医学(cscBioMed)的倡议，促进单细胞生物学和医学的发现与发展 | NA | 希望通过建立临床单细胞动态监测和早期预测系统来改善人类健康 | 总括单细胞RNA测序、空间转录组学以及基于单细胞的生物标志物和靶点 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1024 | 2024-08-08 |
Perspectives on single-nucleus RNA sequencing in different cell types and tissues
2023-Jan, Journal of pathology and translational medicine
IF:1.7Q3
DOI:10.4132/jptm.2022.12.19
PMID:36623812
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综述 | 本文综述了单核RNA测序（snRNA-seq）在不同细胞类型和组织中的实验和分析步骤，以及其方法和特征。 | snRNA-seq作为一种替代或补充方法，适用于难以分离的细胞类型，有助于理解细胞多样性和疾病状态的改变。 | snRNA-seq存在一些局限性，如细胞分离的困难，这可能影响其使用和数据解释的准确性。 | 旨在提供snRNA-seq的全面概述，以增加其应用并改善生物学数据的解释。 | 研究对象包括不同细胞类型和组织中的单核RNA测序技术。 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 1025 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial sequencing application in pathology
2023-Jan, Journal of pathology and translational medicine
IF:1.7Q3
DOI:10.4132/jptm.2022.12.12
PMID:36623813
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综述 | 本文综述了空间转录组测序的当前方法，包括其技术背景、组织准备和分析流程，并探讨了其在病理诊断中的应用潜力 | 结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）与空间测序，提供同时包含组织学和单细胞信息的分子基础 | NA | 探讨空间转录组测序在病理诊断中的应用及其对疾病理解的提升 | 空间转录组测序技术及其在病理学中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1026 | 2024-08-08 |
Catecholamine induces Kupffer cell apoptosis via growth differentiation factor 15 in alcohol-associated liver disease
2023-01, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00921-x
PMID:36631664
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研究论文 | 本文研究了在酒精相关性肝病中，儿茶酚胺通过生长分化因子15诱导库普弗细胞凋亡的机制 | 发现了儿茶酚胺/GDF15轴在库普弗细胞凋亡中的新保护机制，并揭示了肠道与肝脏之间的独特神经代谢免疫轴 | NA | 探讨儿茶酚胺在慢性酒精暴露下对炎症库普弗细胞的调节作用 | 库普弗细胞在酒精相关性肝病中的凋亡机制 | NA | 酒精相关性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 慢性乙醇喂养的小鼠及早期酒精相关性肝病患者 |
| 1027 | 2024-08-08 |
TREM2hi resident macrophages protect the septic heart by maintaining cardiomyocyte homeostasis
2023-01, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00715-5
PMID:36635449
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研究论文 | 本文研究了脓毒症诱导的心肌病（SICM）中，一种名为CD163RETNLA（Mac1）的心脏驻留巨噬细胞亚群通过维持心肌细胞稳态来保护心脏的作用 | 首次鉴定并描述了Mac1亚群在SICM中的作用，并展示了TREM2 Mac1细胞在清除受损线粒体和预防SICM中的潜在治疗价值 | NA | 探讨脓毒症诱导的心肌病中免疫细胞亚群的作用，特别是Mac1亚群的功能 | 心脏驻留巨噬细胞亚群Mac1及其在脓毒症诱导的心肌病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1028 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals functional changes in tumour-infiltrating B lymphocytes after chemotherapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2023-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1181
PMID:36650114
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞（TIL-Bs）的功能变化。 | 首次详细描述了化疗前后TIL-Bs的功能异质性，并发现化疗后TIL-Bs的某些功能如共刺激和CD40信号传导得到增强。 | 研究样本量有限，且仅限于食管鳞状细胞癌，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在研究食管鳞状细胞癌中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞的功能异质性。 | 食管鳞状细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞及其在化疗前后的功能变化。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 共分析了23个样本，涉及81,246个细胞。 |
| 1029 | 2024-08-08 |
Efficient generation of lower induced motor neurons by coupling Ngn2 expression with developmental cues
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111896
PMID:36596304
|
研究论文 | 本研究通过结合转录因子Neurogenin2（Ngn2）的过表达与小分子模式化，将人类多能干细胞（hPSCs）分化为下位诱导运动神经元（liMoNes/liMNs） | 本研究创新性地结合了Ngn2的过表达与小分子模式化，实现了高效率和高重复性的下位诱导运动神经元生成 | NA | 推动对运动神经元生物学及其在疾病中功能障碍的认知 | 人类多能干细胞分化为下位诱导运动神经元 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 50个人类多能干细胞系 |
| 1030 | 2024-08-08 |
Diverse effector and regulatory functions of fibro/adipogenic progenitors during skeletal muscle fibrosis in muscular dystrophy
2023-Jan-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105775
PMID:36594034
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Duchenne肌营养不良症中骨骼肌纤维化的细胞机制，特别是纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）在其中的作用 | 首次揭示了FAPs在骨骼肌纤维化中的双重作用，既是细胞外基质（ECM）的主要来源，也是ECM调控基因的主要表达细胞 | 研究仅限于Duchenne肌营养不良症的疾病小鼠模型，未涉及其他模型或人类样本 | 探讨Duchenne肌营养不良症中骨骼肌纤维化的细胞机制 | 纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）及其在骨骼肌纤维化中的作用 | NA | 肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠膈肌和股四头肌的单细胞样本 |
| 1031 | 2024-08-05 |
Systematic benchmarking of statistical methods to assess differential expression of circular RNAs
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac612
PMID:36592056
|
研究论文 | 本文比较了38种用于评估环状RNA差异表达的统计方法。 | 首次系统性评估适用于环状RNA表达数据的不同差异表达方法的性能。 | 研究集中于特定的统计方法，未涵盖所有可能的方法或数据类型。 | 评估不同统计方法在环状RNA差异表达分析中的有效性。 | 环状RNA的表达数据，特别是RNA-seq数据。 | 生物统计学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的数据集数量和类型的具体信息未说明 |
| 1032 | 2024-08-08 |
scGMAAE: Gaussian mixture adversarial autoencoders for diversification analysis of scRNA-seq data
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac585
PMID:36592058
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scGMAAE的深度生成模型，用于单细胞RNA测序数据的多样化分析 | scGMAAE模型假设不同类型的细胞的低维嵌入遵循不同的正态分布，结合贝叶斯变分推断和对抗训练，提供了复杂数据的解释性潜在表示，并发现不同类型细胞的统计分布 | NA | 开发一种新的深度生成模型，以提高单细胞RNA测序数据分析的灵活性、可控性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | 大量单细胞RNA测序数据 |
| 1033 | 2024-08-08 |
CD8+ T cell-intrinsic IL-6 signaling promotes resistance to anti-PD-L1 immunotherapy
2023-01-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100878
PMID:36599350
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研究论文 | 本文探讨了白细胞介素6（IL-6）在抗PD-L1免疫治疗中的作用，发现IL-6与atezolizumab治疗反应不佳相关，并提出联合阻断PD-L1和IL-6受体（IL6R）可增强抗肿瘤效果 | 首次揭示了IL-6在CD8+ T细胞中的内在信号传导对抗PD-L1免疫治疗抵抗性的影响，并提出联合治疗策略 | NA | 探讨IL-6在抗PD-L1免疫治疗中的作用及改善治疗效果的策略 | 晚期肾癌、乳腺癌和膀胱癌患者以及肿瘤模型中的CD8+ T细胞 | NA | 肾癌、乳腺癌、膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床试验涉及大量晚期肾癌、乳腺癌和膀胱癌患者，以及肿瘤模型中的小鼠 |
| 1034 | 2024-08-08 |
SPOCK1 and POSTN are valuable prognostic biomarkers and correlate with tumor immune infiltrates in colorectal cancer
2023-Jan-07, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-022-02621-2
PMID:36611136
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研究论文 | 本研究旨在基于基质和免疫评分筛选结直肠癌（CRC）中的有价值预后生物标志物，并探讨其与肿瘤免疫浸润的关系。 | 本研究首次发现SPOCK1和POSTN作为结直肠癌的关键预后基因，并揭示了它们与肿瘤浸润免疫细胞的关联。 | 研究主要基于TCGA数据库和公共数据集，未来需通过更多临床样本验证这些生物标志物的预后价值。 | 筛选结直肠癌中的有价值预后生物标志物，并探讨其与肿瘤免疫浸润的关系。 | 结直肠癌（CRC）中的免疫细胞和基质细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | ESTIMATE算法, WGCNA, 单因素COX回归分析, scRNA-seq, TIMER, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA数据库中的CRC样本，具体数量未在摘要中明确。 |
| 1035 | 2024-08-05 |
A comprehensive single-cell map of T cell exhaustion-associated immune environments in human breast cancer
2023-01-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35238-w
PMID:36609566
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research paper | 本研究系统地研究了人类乳腺癌中疲惫T细胞相关的免疫环境 | 通过单细胞转录组学和成像质谱细胞术的结合，揭示了乳腺癌中有无疲惫T细胞存在的免疫环境之间的基本差异 | 研究主要集中于乳腺癌的腔型亚型，可能不适用于所有乳腺癌类型 | 深入了解乳腺癌中疲惫T细胞的免疫环境 | 人类乳腺肿瘤样本中疲惫和非疲惫T细胞的免疫环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学，成像质谱细胞术 | NA | 样本 | 研究中涉及了在人类乳腺癌中多种免疫环境的单细胞样本 |
| 1036 | 2024-08-08 |
Enhanced angiogenic properties of umbilical cord blood primed by OP9 stromal cells ameliorates neurological deficits in cerebral infarction mouse model
2023-01-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-27424-7
PMID:36609640
|
研究论文 | 研究探讨了OP9基质细胞预处理的脐带血在脑梗死小鼠模型中的血管生成特性及其对神经功能缺陷的影响 | 开发了一种快速且可行的方法，通过使用OP9增强脐带血的M2型、组织保护和促血管生成特性 | NA | 研究OP9预处理的脐带血在脑梗死模型中的血管生成特性和对神经功能缺陷的影响 | 脐带血与OP9基质细胞的共培养及其在脑梗死小鼠模型中的应用 | NA | 脑梗死 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 1037 | 2024-08-05 |
Macrophage response mediated by extracellular matrix: recent progress
2023-01-05, Biomedical materials (Bristol, England)
DOI:10.1088/1748-605X/aca946
PMID:36595269
|
研究论文 | 本文探讨了ECM支架介导的巨噬细胞反应在组织再生中的作用 | 使用单细胞测序技术识别参与宿主对生物材料反应的不同巨噬细胞表型 | 传统的M1/M2命名法存在局限，尚未形成统一的标准 | 研究ECM支架如何与巨噬细胞相互作用以影响组织再生 | 探讨影响组织再生的高度异质性和可塑性巨噬细胞亚群 | 再生医学 | 组织缺损 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 1038 | 2024-08-05 |
Transcription factors: key regulatory targets of vascular smooth muscle cell in atherosclerosis
2023-01-05, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00586-2
PMID:36604627
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综述 | 这篇文章重点讨论了转录因子在动脉粥样硬化中作为血管平滑肌细胞的关键调控靶点的作用 | 首次系统性地评估了转录因子如何通过多种保守的顺式调控元件和转录因子之间的复杂相互作用调节VSMC基因 | 对VSMCs的理解仍在不断发展，可能需要更多实验数据支持 | 探讨转录因子在血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化过程中的调控作用 | 血管平滑肌细胞及其与转录因子的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 体内单细胞测序技术与CreERT2-loxP系统 | NA | NA | NA |
| 1039 | 2024-08-08 |
Single-cell-led drug repurposing for Alzheimer's disease
2023-01-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-27420-x
PMID:36604493
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞的系统生物学流程，用于识别阿尔茨海默病的药物再利用候选物 | 利用单细胞RNA测序数据、全基因组关联研究结果和多种基因注释资源，构建了多细胞的阿尔茨海默病分子网络，以获得细胞特异性的疾病病理生理学见解 | NA | 旨在通过单细胞技术识别阿尔茨海默病的潜在药物再利用候选物 | 阿尔茨海默病患者的脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 分子网络 | 基因组数据 | NA |
| 1040 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of glial diversity in the human hippocampus across the postnatal lifespan
2023-Jan-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.12.007
PMID:36608676
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |