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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Isolation of Thymus Stromal Cells from Human and Murine Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2679-5_13
PMID:36255703
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研究方法论文 | 详细介绍从人类和小鼠组织中分离胸腺基质细胞的方法学 | 提供了针对胸腺基质细胞分离优化的组织解离方案 | NA | 开发胸腺基质细胞分离方法以支持下游分析 | 人类和小鼠的胸腺组织 | 单细胞分析 | 免疫系统疾病 | 组织解离、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for identifying hidden drivers from single-cell omics data
2023-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.523391
PMID:36747870
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研究论文 | 开发了一个基于互信息的计算框架scMINER，用于从单细胞RNA-seq数据中识别隐藏的转录和信号驱动因子 | 利用互信息捕获非线性细胞-细胞和基因-基因关系，能够识别传统表达分析难以检测的隐藏驱动因子 | 仅基于scRNA-seq数据，未整合多组学数据验证 | 从单细胞组学数据中识别调控细胞状态的隐藏转录和信号驱动因子 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互信息框架 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for identifying hidden drivers from single-cell omics data
2023-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2476875/v1
PMID:36747874
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研究论文 | 开发了一种基于互信息的计算框架scMINER，用于从单细胞RNA-seq数据中识别隐藏的转录和信号驱动因子 | 利用互信息捕获非线性的细胞-细胞和基因-基因关系，能够识别常规表达分析难以检测的隐藏驱动因子 | 未在摘要中明确说明具体限制 | 解决单细胞组学数据稀疏性问题，识别调控细胞状态的隐藏转录和信号驱动因子 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互信息框架 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals correct developmental dynamics and high-quality midbrain cell types by improved hESC differentiation
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.10.016
PMID:36400027
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研究论文 | 本研究通过改进人类胚胎干细胞分化方案，获得高质量中脑细胞类型并揭示其发育动态 | 发现层粘连蛋白-511、双重WNT激活联合GSK3β抑制和FGF8b能改善中脑模式化，并首次通过单细胞转录组分析显示与内源性人类腹侧中脑相似的发育动态 | 未提及具体样本数量限制，研究主要聚焦于体外分化系统 | 优化人类胚胎干细胞向中脑多巴胺能神经元的分化方案并验证细胞类型质量 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 | 单细胞生物学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-10-07 |
Predicting tumor immune microenvironment and checkpoint therapy response of head & neck cancer patients from blood immune single-cell transcriptomics
2023-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.524455
PMID:36789425
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研究论文 | 本研究探索如何通过血液单细胞转录组数据推断头颈癌患者肿瘤免疫微环境状态并预测免疫检查点治疗反应 | 首次证明肿瘤免疫细胞比例和基因表达可从匹配的PBMC单细胞转录组数据推断，并发现肿瘤记忆B细胞与调节性T细胞比例比传统标志物更能预测免疫治疗反应 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 开发基于血液单细胞转录组的肿瘤免疫微环境推断和免疫治疗反应预测方法 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 头颈癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两个头颈癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 外周血单个核细胞单细胞RNA测序 |
| 86 | 2025-10-07 |
KRT19 is a Promising Prognostic Biomarker and Associates with Immune Infiltrates in Serous Ovarian Cystadenocarcinoma
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S419235
PMID:37916194
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析发现KRT19是浆液性卵巢囊腺癌中具有前景的预后生物标志物，并与免疫浸润相关 | 首次系统分析KRT19在卵巢癌中的表达特征、预后价值和免疫浸润关联 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探讨KRT19在卵巢癌中的表达特征、预后价值和免疫学功能 | 浆液性卵巢囊腺癌患者样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 生物信息学分析，单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO和HPA数据库的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas reveals shared and distinct immune responses and metabolic profiles in SARS-CoV-2 and HIV-1 infections
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1105673
PMID:36992700
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据比较SARS-CoV-2和HIV-1感染中免疫反应的相似性和差异性 | 开发新型共识单细胞注释方法，首次系统比较两种不同病理生理学病毒感染的单细胞免疫图谱 | 样本量相对较小（仅20名患者），仅使用已发表的单细胞RNA测序数据 | 揭示SARS-CoV-2和HIV-1感染中免疫反应和代谢特征的异同 | COVID-19患者、HIV-1感染者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 病毒感染疾病 | 单细胞RNA测序 | 共识单细胞注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 111,566个单PBMCs，来自7名COVID-19患者、10名HIV-1感染者和3名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2025-10-07 |
Cell-type-specific aging clocks to quantify aging and rejuvenation in neurogenic regions of the brain
2023-01, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-022-00335-4
PMID:37118510
|
研究论文 | 开发基于单细胞转录组学的细胞类型特异性衰老时钟，用于量化大脑神经发生区域的衰老和年轻化过程 | 首次从单细胞转录组数据开发高分辨率衰老时钟，能够量化转录组年轻化 | 研究仅基于小鼠模型，样本量相对有限 | 开发细胞类型特异性衰老时钟来表征大脑神经发生区域的衰老和年轻化 | 小鼠大脑室下区神经发生区域 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 单细胞转录组数据 | 28只小鼠，覆盖从年轻到老年的不同年龄段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq identified novel genes involved in primordial follicle formation
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1285667
PMID:38149096
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术鉴定参与原始卵泡形成的新基因和配体-受体相互作用 | 首次发现ANXA7和GTF2F1在原始卵泡形成中的功能作用，以及Mdk-Sdc1配体-受体相互作用的关键机制 | 样本量有限，人类胎儿卵巢仅使用25周样本，功能验证主要在小鼠模型中进行 | 探索原始卵泡形成的分子机制及其与早发性卵巢功能不全的关系 | 小鼠和人类卵巢组织，93例POI患者和465例对照 | 单细胞组学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序,全外显子组测序,全基因组测序,免疫荧光,体外卵巢培养 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 93例POI病例和465例对照，25周人类胎儿卵巢 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子组测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-07 |
Construction of a circRNA- lincRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA regulatory network identifies genes and pathways linked to goat fertility
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1195480
PMID:37547465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了山羊颗粒细胞中ceRNA调控网络，揭示了与山羊繁殖力相关的关键基因和通路 | 首次在山羊中整合circRNA、lincRNA、lncRNA、miRNA和mRNA构建ceRNA调控网络，鉴定出18个与繁殖力相关的枢纽基因 | 研究依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据，样本量相对有限，需要进一步实验验证 | 探究高繁殖力和低繁殖力山羊颗粒细胞的转录组差异，构建ceRNA调控网络 | 济宁青山羊的颗粒细胞（15只高繁殖力，15只低繁殖力） | 生物信息学 | 繁殖障碍 | 单细胞RNA测序，功能富集分析，文献挖掘 | ceRNA调控网络，基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 30个样本（15高繁殖力，15低繁殖力） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-07 |
A novel Bayesian framework for harmonizing information across tissues and studies to increase cell type deconvolution accuracy
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac616
PMID:36631398
|
研究论文 | 提出一种新颖的贝叶斯框架tranSig，通过整合跨组织和研究的信息来提高细胞类型反卷积的准确性 | 开发了首个利用跨组织和研究的共享细胞类型特异性表达模式的贝叶斯框架来改进scRNA-seq签名矩阵推断 | NA | 提高从单细胞RNA测序数据推断细胞类型签名矩阵的准确性，以改进细胞类型反卷积分析 | 外周血、支气管肺泡灌洗液和主动脉的批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA sequencing investigation of female-male differences under PAD conditions
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1251141
PMID:37745110
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究了在周围动脉疾病条件下内皮细胞性别差异对促动脉粥样硬化通路的影响 | 首次结合血流紊乱和基质硬度两种机械环境因素，系统研究性别差异对PAD中内皮细胞表型的影响 | 当前PAD模型缺乏对血流和硬度参数的全面考虑，且研究尚未完全阐明d-flow和硬度共同作用对内皮细胞表型的影响机制 | 探索性别对暴露于血流紊乱和僵硬环境的内皮细胞促动脉粥样硬化通路的影响 | 内皮细胞(ECs)和鼠颈动脉 | 单细胞组学 | 周围动脉疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct T cell populations in immune-related adverse events of checkpoint inhibitors
2023-01-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100868
PMID:36513074
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示检查点抑制剂免疫相关不良事件中不同的T细胞群体 | 首次使用单细胞RNA测序技术结合K近邻网络图分析，识别了不同免疫相关不良事件中特定的T细胞亚群和基因特征 | 样本量有限，仅分析了特定几种免疫相关不良事件，需要更大规模研究验证 | 研究抗PD-1治疗期间T细胞的细胞变化，探索免疫相关不良事件的机制 | 癌症患者的循环T细胞 | 单细胞组学 | 癌症免疫治疗相关不良事件 | 单细胞RNA测序 | K近邻网络图布局 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Global Markers of Transcriptional Diversity across Different Forms of Cellular Senescence
2023, Aging biology
DOI:10.59368/agingbio.20230008
PMID:39781544
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析不同形式细胞衰老中的转录多样性全局标志物 | 首次通过单细胞转录组学系统比较三种主要衰老形式（癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老），发现不同衰老形式共有的细胞亚群及其特征 | 研究基于基因同质的克隆细胞系，可能无法完全反映体内衰老细胞的复杂性 | 探索不同形式细胞衰老中的转录多样性及其共同特征 | 基因同质的克隆细胞系（包括癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老） | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种衰老形式的克隆细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2024-11-23 |
SPICEMIX enables integrative single-cell spatial modeling of cell identity
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01256-z
PMID:36624346
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研究论文 | 介绍了一种名为SPICEMIX的计算方法，用于整合单细胞空间转录组数据，以揭示细胞身份 | SPICEMIX基于概率潜变量建模，能够显著改进细胞类型及其空间模式的推断，优于现有方法 | NA | 开发一种能够利用空间转录组数据独特性质揭示细胞身份的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞类型及其空间模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 概率潜变量模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠脑区的空间转录组数据，通过seqFISH+、STARmap和Visium技术获取 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-10-30 |
Systems biological assessment of the temporal dynamics of immunity to a viral infection in the first weeks and months of life
2023-Jan-31, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.01.28.23285133
PMID:36778389
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研究论文 | 本文通过多组学方法，对婴儿和幼儿在生命早期几周和几个月内对SARS-CoV-2感染的免疫动态进行了纵向分析 | 首次提供了生命早期几周和几个月内对病毒感染的免疫动态的快照 | NA | 研究婴儿和幼儿在生命早期对SARS-CoV-2感染的免疫动态 | 婴儿和幼儿对SARS-CoV-2感染的先天性和适应性免疫反应 | NA | NA | 多组学分析 | NA | 血液样本 | 感染前、感染期间和感染后收集的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-10-21 |
Virus infection pattern imprinted and diversified the differentiation of T-cell memory in transcription and function
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1334597
PMID:38264657
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研究论文 | 研究比较了由不同病毒（CMV、EBV和SARS-CoV-2）诱导的记忆T细胞的转录组和功能差异 | 发现CD28和CTLA4可作为评估T细胞抗病毒能力的连续指标，并提出REL是CMV特异性T细胞产生细胞因子的主要调控因子 | NA | 理解不同病毒特异性记忆T细胞的差异，为开发新的抗病毒治疗策略提供基础 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-10-21 |
ATF5 promotes malignant T cell survival through the PI3K/AKT/mTOR pathway in cutaneous T cell lymphoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1282996
PMID:38223508
|
研究论文 | 研究探讨了转录因子ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的作用及其通过PI3K/AKT/mTOR通路促进恶性T细胞生存的机制 | 首次揭示了ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的肿瘤特异性高表达及其促进肿瘤生存的机制 | 研究仅限于两个CTCL细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 识别皮肤T细胞淋巴瘤中肿瘤特异性的转录因子 | 皮肤T细胞淋巴瘤中的恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 两个CTCL细胞系Myla和H9 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-10-21 |
Comprehensive analysis of senescence-associated genes in sepsis based on bulk and single-cell sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1322221
PMID:38259686
|
研究论文 | 本文通过批量和单细胞测序数据分析了与脓毒症相关的衰老相关基因，并开发了一种基于关键基因的脓毒症诊断模型 | 本文首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，揭示了衰老相关基因与脓毒症之间的关联，并开发了一种高可靠性的诊断模型 | 本文仅使用了两个RNA表达数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨衰老相关基因与脓毒症之间的关系，并开发一种新的脓毒症诊断模型 | 衰老相关基因、脓毒症患者、健康对照组 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 无监督聚类分析、加权基因共表达网络分析 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个RNA表达数据集（GSE28750和GSE57065），具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-10-21 |
Single-cell sequencing reveals an important role of SPP1 and microglial activation in age-related macular degeneration
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1322451
PMID:38259505
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研究论文 | 研究衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 揭示了SPP1和微胶质细胞激活在年龄相关性黄斑变性中的重要作用，并提出SPP1可能成为潜在的治疗靶点 | 需要更多的体外和体内研究来验证结果和治疗效果 | 探讨衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性病理生理中的作用 | 人类视网膜神经节细胞和年龄相关性黄斑变性患者 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 118例人类黄斑神经视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |