单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-10-30 |
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2402606/v1
PMID:36747878
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研究论文 | 研究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 首次揭示了人类心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的分子机制，并展示了通过靶向炎症治疗组织纤维化的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类心脏样本，可能存在种属差异 | 探讨心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞的相互作用机制 | 心肌梗死和心脏纤维化中的免疫细胞与成纤维细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | 38名急性心肌梗死和慢性心力衰竭患者的心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-10-21 |
Virus infection pattern imprinted and diversified the differentiation of T-cell memory in transcription and function
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1334597
PMID:38264657
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研究论文 | 研究比较了由不同病毒（CMV、EBV和SARS-CoV-2）诱导的记忆T细胞的转录组和功能差异 | 发现CD28和CTLA4可作为评估T细胞抗病毒能力的连续指标，并提出REL是CMV特异性T细胞产生细胞因子的主要调控因子 | NA | 理解不同病毒特异性记忆T细胞的差异，为开发新的抗病毒治疗策略提供基础 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-10-21 |
ATF5 promotes malignant T cell survival through the PI3K/AKT/mTOR pathway in cutaneous T cell lymphoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1282996
PMID:38223508
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研究论文 | 研究探讨了转录因子ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的作用及其通过PI3K/AKT/mTOR通路促进恶性T细胞生存的机制 | 首次揭示了ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的肿瘤特异性高表达及其促进肿瘤生存的机制 | 研究仅限于两个CTCL细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 识别皮肤T细胞淋巴瘤中肿瘤特异性的转录因子 | 皮肤T细胞淋巴瘤中的恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 两个CTCL细胞系Myla和H9 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-10-21 |
Comprehensive analysis of senescence-associated genes in sepsis based on bulk and single-cell sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1322221
PMID:38259686
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞测序数据分析了与脓毒症相关的衰老相关基因，并开发了一种基于关键基因的脓毒症诊断模型 | 本文首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，揭示了衰老相关基因与脓毒症之间的关联，并开发了一种高可靠性的诊断模型 | 本文仅使用了两个RNA表达数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨衰老相关基因与脓毒症之间的关系，并开发一种新的脓毒症诊断模型 | 衰老相关基因、脓毒症患者、健康对照组 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 无监督聚类分析、加权基因共表达网络分析 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个RNA表达数据集（GSE28750和GSE57065），具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-10-21 |
Single-cell sequencing reveals an important role of SPP1 and microglial activation in age-related macular degeneration
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1322451
PMID:38259505
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研究论文 | 研究衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 揭示了SPP1和微胶质细胞激活在年龄相关性黄斑变性中的重要作用，并提出SPP1可能成为潜在的治疗靶点 | 需要更多的体外和体内研究来验证结果和治疗效果 | 探讨衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性病理生理中的作用 | 人类视网膜神经节细胞和年龄相关性黄斑变性患者 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 118例人类黄斑神经视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-10-21 |
Application progress of single-cell sequencing technology in mesenchymal stem cells research
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1336482
PMID:38264356
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在间充质干细胞研究中的应用进展 | 单细胞测序技术揭示了间充质干细胞在基因表达异质性、分化过程中的动态转录变化以及调控因子在关键过程中的作用 | NA | 探讨单细胞测序技术在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-10-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in post-acute sequelae of SARS-CoV-2 patients with persistent respiratory symptoms
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1268510
PMID:38259488
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研究论文 | 研究了COVID-19后遗症患者中持续呼吸症状的髓系细胞特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了COVID-19后遗症患者中髓系细胞的转录组特征 | 样本量较小，仅包括3名患者和1名对照组 | 探讨COVID-19后遗症患者中持续呼吸症状的免疫反应和细胞特征 | COVID-19后遗症患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3名COVID-19后遗症患者和1名对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-10-21 |
nPCA: a linear dimensionality reduction method using a multilayer perceptron
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1290447
PMID:38259616
|
研究论文 | 提出了一种使用多层感知器的线性降维方法nPCA，旨在保留原始数据的线性投影并生成更好的降维结果 | nPCA方法结合了深度学习和线性投影，能够在降维过程中保留更多原始数据的信息，是对传统PCA方法的改进 | 文章未详细讨论nPCA方法在处理大规模数据时的性能和计算效率 | 开发一种新的线性降维方法，能够在保留线性投影的同时生成更好的降维结果 | nPCA算法在10个公共数据集和6个单细胞RNA测序数据集上的性能 | 机器学习 | NA | 多层感知器 | 多层感知器 | 数据集 | 10个公共数据集和6个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-10-20 |
A guidebook of spatial transcriptomic technologies, data resources and analysis approaches
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.01.016
PMID:38213887
|
review | 本文详细介绍了空间转录组技术的开发、数据资源和分析方法 | 本文整合了大量空间转录组数据，并介绍了多种计算方法来分析空间转录组数据，为研究人员提供了全面的指导 | NA | 帮助研究人员选择最适合其目标的空间转录组技术，并整合数据以促进数据的可访问性和可用性 | 空间转录组技术、数据资源和分析方法 | 基因组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-10-19 |
Application of single-cell RNA sequencing methods to develop B cell targeted treatments for autoimmunity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103690
PMID:37520578
|
研究论文 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序方法开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 本文提出利用单细胞RNA测序技术识别自身免疫病中的致病性自身反应性B细胞，以开发更精确的靶向治疗 | NA | 开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 自身反应性B细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-10-17 |
Adversarial training improves model interpretability in single-cell RNA-seq analysis
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad166
PMID:38099262
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研究论文 | 本文探讨了通过对抗训练提高单细胞RNA测序数据分析中模型鲁棒性和可解释性的方法 | 本文首次展示了对抗训练不仅提高了模型的鲁棒性，还增强了模型的可解释性 | 本文仅在一个特定任务上验证了方法的有效性，需要在更多任务上进行评估 | 提高预测计算模型在生物学和医学领域的鲁棒性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型预测 | 机器学习 | NA | 对抗训练 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-10-14 |
Unveiling the novel immune and molecular signatures of ovarian cancer: insights and innovations from single-cell sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288027
PMID:38022625
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在卵巢癌中的应用，揭示了其免疫和分子特征 | 单细胞测序技术能够提供比传统批量测序更详细的基因、转录组、蛋白质、表观基因组和代谢信息 | NA | 探讨单细胞测序技术在卵巢癌中的应用及其对诊断、治疗和预后指标开发的指导作用 | 卵巢癌的免疫和分子机制 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 基因、转录组、蛋白质、表观基因组和代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-09-30 |
A marker gene-based method for identifying the cell-type of origin from single-cell RNA sequencing data
2023, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2023.102196
PMID:37424758
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于标记基因的单细胞RNA测序数据细胞类型识别方法Sargent | Sargent是一种无需转换和聚类的单细胞注释算法，能够快速准确地识别细胞类型起源，并保留了基于聚类的手动注释的灵活性和生物可解释性 | NA | 开发一种能够快速准确识别单细胞RNA测序数据中细胞类型起源的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括模拟数据和来自人体器官（如PBMC、心脏、肾脏和肺）的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-09-30 |
Overview of single-cell RNA sequencing analysis and its application to spermatogenesis research
2023 Jan-Dec, Reproductive medicine and biology
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/rmb2.12502
PMID:36726594
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序分析及其在精子发生研究中的应用 | 单细胞RNA测序识别出成鼠睾丸中的间充质细胞和II型先天淋巴细胞作为新的睾丸细胞类型，以及详细的生殖细胞亚型 | 单细胞RNA测序分析需要广泛的实验技术和生物信息学知识，对许多实验生物学家和临床医生来说难以使用 | 使单细胞RNA测序分析更加普及，并总结了使用该技术在人类和小鼠精子发生研究中获得的最新见解 | 人类和小鼠的精子发生过程 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-09-28 |
Vancomycin-induced gut microbial dysbiosis alters enteric neuron-macrophage interactions during a critical period of postnatal development
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1268909
PMID:37901245
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研究论文 | 研究万古霉素引起的肠道微生物失调如何影响新生期关键阶段的肠神经-巨噬细胞相互作用 | 首次揭示了新生期万古霉素暴露通过影响巨噬细胞数量和表型，进而改变肠神经系统发育的机制 | 研究仅在鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨万古霉素引起的肠道微生物失调对新生期肠神经-巨噬细胞相互作用的影响 | 新生期小鼠的肠神经系统和巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生期小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-09-28 |
Using combined single-cell gene expression, TCR sequencing and cell surface protein barcoding to characterize and track CD4+ T cell clones from murine tissues
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1241283
PMID:37901204
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研究论文 | 本文描述了从鼠类组织中分离scRNA/TCR-seq兼容的CD4 T细胞的方法，并详细介绍了细胞处理、质量控制、样本多路复用和测序策略，以及从测序数据生成的生物信息学分析流程 | 本文结合了单细胞基因表达、TCR测序和细胞表面蛋白条形码技术，以无偏的方式研究细胞转录程序及其异质性 | NA | 开发和优化从鼠类组织中分离和分析CD4 T细胞克隆的方法 | 鼠类组织中的CD4 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 鼠类皮肤、脾脏和淋巴结中的CD4 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-09-28 |
Single-cell profiling reveals immune disturbances landscape and HLA-F-mediated immune tolerance at the maternal-fetal interface in preeclampsia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1234577
PMID:37854606
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研究论文 | 研究揭示了子痫前期中母胎界面免疫紊乱的图谱以及HLA-F介导的免疫耐受 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了子痫前期中母胎界面免疫紊乱的图谱，并探讨了HLA-F在母胎免疫耐受中的作用 | 研究主要集中在细胞水平，未涉及更广泛的临床数据或动物模型 | 探讨子痫前期中母胎界面免疫紊乱的机制及HLA-F的作用 | 子痫前期的母胎界面免疫状态及HLA-F的功能 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 101,250个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-09-27 |
Independent prognostic biomarker FERMT3 associated with immune infiltration and immunotherapy response in glioma
2023, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2023.2264325
PMID:37795794
|
研究论文 | 研究探讨了FERMT3作为胶质瘤独立预后生物标志物及其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 | 首次揭示了FERMT3在胶质瘤中的独立预后价值及其与免疫微环境和免疫治疗反应的关联 | 研究主要基于现有数据集和临床组织样本的分析，缺乏大规模前瞻性临床试验验证 | 探讨FERMT3在胶质瘤中的预后价值及其与免疫微环境和免疫治疗反应的关系 | 胶质瘤患者的FERMT3表达及其与免疫细胞浸润和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 免疫组化、多重免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 多个数据集和临床组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-09-27 |
Preparing Arabidopsis thaliana root protoplasts for cryo electron tomography
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1261180
PMID:37810374
|
研究论文 | 本文描述了一种用于冷冻电子断层扫描（cryo-ET）的拟南芥根原生质体制备工作流程 | 首次将原生质体用于冷冻电子显微镜（cryo-EM）和冷冻电子断层扫描（cryo-ET）研究 | 整个工作流程从植物生长到倾斜系列采集可能需要几个月时间 | 开发一种新的方法，将植物原生质体作为冷冻电子断层扫描的工具 | 拟南芥根原生质体 | NA | NA | 冷冻电子显微镜（cryo-EM）、冷冻电子断层扫描（cryo-ET）、冷冻聚焦离子束铣削（cryo-FIB） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-09-27 |
New insight into the role of fibroblasts in the epithelial immune microenvironment in the single-cell era
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259515
PMID:37809065
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综述 | 本文综述了单细胞时代下成纤维细胞在表皮免疫微环境中的作用 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了成纤维细胞在表皮免疫微环境中的功能和空间异质性及其与其他细胞类型的相互作用 | NA | 总结成纤维细胞在炎症性皮肤病表皮免疫微环境中的最新进展，并讨论其在纤维化和非纤维化炎症性皮肤病中的不同功能和分子机制 | 成纤维细胞在表皮免疫微环境中的作用 | NA | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 (ST) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |