单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the difference in human normal and degenerative nucleus pulposus tissue profiles and cellular interactions
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1108743
PMID:36760364
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 942 | 2024-08-08 |
Hallmarks of crustacean immune hemocytes at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1121528
PMID:36761772
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对虾和龙虾这两种代表性甲壳类动物的免疫血细胞异质性进行了表征，并首次在单细胞分辨率下对甲壳类动物的血细胞和免疫血细胞进行了分类 | 首次在单细胞分辨率下对甲壳类动物的血细胞和免疫血细胞进行了分类 | 由于形态学分类的限制，无脊椎动物免疫血细胞的类型尚未分类 | 确定甲壳类动物的免疫血细胞类型 | 虾和龙虾的免疫血细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 虾和龙虾分别包含11和12种类型的血细胞 |
| 943 | 2024-08-08 |
Phenotypic plasticity of malignant T cells in blood and skin of a Sézary syndrome patient revealed by single cell transcriptomics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1090592
PMID:36761972
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，研究了塞扎里综合征患者血液和皮肤中恶性T细胞的表型可塑性。 | 首次在单细胞水平上比较了塞扎里综合征患者血液和皮肤样本中恶性T细胞的转录组，揭示了这些细胞在不同微环境中的功能异质性。 | 研究仅基于单一患者的样本，可能限制了结果的普遍性。 | 比较塞扎里综合征患者血液和皮肤样本中单细胞的转录组，以揭示恶性T细胞的表型可塑性。 | 塞扎里综合征患者的血液和皮肤样本中的恶性T细胞。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单一患者 |
| 944 | 2024-08-05 |
Spatially resolved transcriptomic profiling of degraded and challenging fresh frozen samples
2023-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36071-5
PMID:36720873
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研究论文 | 本文介绍了RNA-Rescue空间转录组学（RRST），旨在改善低至中等RNA质量的新鲜冷冻样本中的mRNA回收。 | 提出了一种新的工作流程RRST，提高了从新鲜冷冻标本中回收mRNA的能力，适用于RNA质量较低的样本。 | 研究仅对五种特定组织类型进行了测试，可能限制了其广泛应用。 | 研究旨在提高新鲜冷冻样本中mRNA的回收率并提供有效的空间转录组学分析。 | 本研究对象包括来自不同组织类型的52个组织切片，涉及人类及小鼠样本。 | 数字病理学 | 肺癌、肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 共分析52个组织切片 |
| 945 | 2024-08-05 |
Multi-omics analyses of CD276 in pan-cancer reveals its clinical prognostic value in glioblastoma and other major cancer types
2023-Jan-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10575-1
PMID:36717836
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研究论文 | 本研究分析了CD276在不同癌症中的表达模式和临床意义，尤其是在脑胶质瘤中的预后价值 | 本研究通过单细胞测序和生物信息学方法系统性分析了CD276的临床预后价值和其在多种癌症中的作用 | 目前针对CD276在癌症中的作用的系统研究较少，需更多的验证和深入探讨 | 评估CD276在脑胶质瘤及其他主要癌症类型中的临床预后价值 | 研究对象为CD276在不同类型癌症（包括脑胶质瘤）中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞测序 | NA | 生物信息学数据 | 利用LinkedOmics数据库和RT-qPCR分析不同类型癌症中的CD276表达模式 |
| 946 | 2024-08-05 |
Dynamic single-cell RNA-seq analysis reveals distinct tumor program associated with microenvironmental remodeling and drug sensitivity in multiple myeloma
2023-Jan-30, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-00971-2
PMID:36717896
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了多发性骨髓瘤中肿瘤程序与微环境重塑及药物敏感性的关系 | 本研究揭示了肿瘤细胞免疫反应程序与免疫抑制表型之间的联系，提供了关于多发性骨髓瘤药物敏感性的新的见解 | 样本量较小，仅包含10名多发性骨髓瘤患者和3名健康对照者 | 研究多发性骨髓瘤中药物敏感性及临床结果的分子机制 | 针对10名多发性骨髓瘤患者及3名健康志愿者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10名多发性骨髓瘤患者和3名健康志愿者 |
| 947 | 2024-08-08 |
Inhibition of 2-arachidonoylglycerol degradation enhances glial immunity by single-cell transcriptomic analysis
2023-Jan-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02701-4
PMID:36717883
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，研究了抑制2-花生四烯酰甘油（2-AG）降解对胶质细胞免疫的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了细胞类型特异性MAGL敲除小鼠大脑中免疫相关基因和其他基本细胞途径的差异表达 | 文章未明确提及研究的局限性 | 探究抑制2-AG代谢在神经退行性疾病中的抗炎和神经保护作用的分子机制 | 海马和皮质细胞，MAGL敲除小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 细胞类型特异性MAGL敲除小鼠的海马和皮质细胞 |
| 948 | 2024-08-08 |
Determinants of renin cell differentiation: a single cell epi-transcriptomics approach
2023-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.18.524595
PMID:36711565
|
研究论文 | 本文通过单细胞表观转录组学方法，研究了FoxD1+前体细胞向肾素细胞分化的分子机制 | 首次提供了肾素细胞分化为肾小球旁细胞（JG细胞）的发育轨迹，并强调了对其阶段特异性分化重要的新因子 | NA | 全面评估驱动FoxD1+前体细胞向肾脏血管细胞分化的染色质状态和转录因子 | FoxD1+前体细胞及其后代细胞，特别是肾素细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 胚胎第12天（1234个细胞），胚胎第18天（3696个细胞），出生后第5天（1986个细胞），出生后第30天（1196个细胞） |
| 949 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals unique gene expression changes in different brain regions after sleep deprivation
2023-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.18.524406
PMID:36712009
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研究论文 | 这篇文章探讨了睡眠剥夺对不同脑区基因表达变化的影响 | 文章创新性地应用空间转录组学技术，揭示了不同脑区在睡眠剥夺后的基因表达差异 | 研究可能未考虑其他可能影响基因表达的因素，如环境因素或个体差异 | 研究睡眠剥夺对大脑不同区域基因表达的影响 | 研究对象包括小鼠大脑的不同区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同脑区的组织切片样本 |
| 950 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.10.523481
PMID:36712023
|
研究论文 | 这篇文章探讨了在先进的肝细胞癌患者中，新辅助cabozantinib和nivolumab的空间转录组学分析 | 该研究揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞和癌相关成纤维细胞的丰富程度，以及独特的分子和细胞特征，提供了增强系统治疗反应的新靶点 | 研究只涉及了15名患者，样本量较小，且只有5名患者表现出病理反应 | 研究现代系统治疗在肝细胞癌中的反应机制 | 在临床试验中接受新辅助cabozantinib和nivolumab治疗的肝细胞癌患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 15名肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 |
| 951 | 2024-08-05 |
Deconfounded Dimension Reduction via Partial Embeddings
2023-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.10.523448
PMID:36711940
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为部分嵌入（PARE）的框架，可以从基于距离的降维方法中去除混杂因素 | 提出的PARE框架允许对任何降维方法进行混杂因素的去除，扩展了现有降维工具的应用范围 | 具体的限制在摘要中没有明显提及 | 研究旨在提高降维技术在生物模式识别中的效果，减少混杂因素的影响 | 研究对象包括基因组和神经影像数据 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 高维数据 | 单细胞测序数据和神经影像测量数据 |
| 952 | 2024-08-08 |
Persistence of foetal testicular features in patients with defective androgen signalling
2023-Jan-10, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvad007
PMID:36721956
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研究论文 | 研究探讨了46,XY个体中由于雄激素信号缺陷导致的性腺组织发育异常，特别是在完全雄激素不敏感综合征（CAIS）患者中的表现 | 发现CAIS患者的性腺组织中HSD17B3在Sertoli细胞中表达，而在Leydig细胞中不表达，这一模式与典型成人睾丸不同，更类似于胎儿期小鼠睾丸 | 研究样本量较小，仅包括五名46,XY个体，可能影响结果的普遍性 | 探究雄激素信号缺陷对46,XY个体性腺发育的影响 | 46,XY个体中由于雄激素合成或作用缺陷导致的性腺组织发育异常 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织切片 | 包括四名CAIS患者、一名CYP17A1缺乏症患者和一名对照 |
| 953 | 2024-08-05 |
Gene Expression Changes in Cultured Reactive Rat Astrocyte Models and Comparison to Device-Associated Effects in the Brain
2023-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.06.522870
PMID:36712012
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研究论文 | 研究了对植入微电极阵列反应的反应性星形胶质细胞亚型及其基因表达变化 | 揭示了反应性星形胶质细胞与植入电极之间的基因表达重叠，提供了新型生物标志物的潜在信息 | 未明确指出研究的局限性 | 深入了解反应性星形胶质细胞对植入电极的反应亚型 | 两种反应性星形胶质细胞培养模型及其与大鼠运动皮层设备相关基因表达的比较 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种时间点的24小时、1周和6周大鼠组织样本 |
| 954 | 2024-08-05 |
Computational workflow and interactive analysis of single-cell expression profiling of islets generated by the Human Pancreas Analysis Program
2023-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522578
PMID:36711819
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研究论文 | 本文介绍了人类胰腺分析计划生成的胰岛单细胞表达谱的计算工作流程和交互式分析 | 提出了一种新的计算工作流程，用于分析由HPAP生成的人类胰腺高质量单细胞RNA-seq数据集 | 研究依赖于来自已故捐赠者的胰腺组织样本，可能无法全面反映活体胰腺的状况 | 了解糖尿病发生过程中的初始分子扰动，特别是胰岛功能障碍的分子病理机制 | 研究对象为67名人类捐赠者的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 67名人类捐赠者的258,379个高质量细胞 |
| 955 | 2024-08-05 |
Identification of the Hub Genes Involved in Stem Cell Treatment for Intervertebral Disc Degeneration: A Conjoint Analysis of Single-Cell and Machine Learning
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/7055264
PMID:36733465
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研究论文 | 本研究旨在识别与椎间盘退变(IDD)相关的新生物标志物 | 这是首次结合机器学习和单细胞测序数据的研究，发现了椎间盘退变的中心基因LAPTM5 | 本研究未提及样本量和样本来源的具体限制 | 研究的目的是寻找椎间盘退变的诊断生物标志物 | 研究对象为接受干细胞治疗的椎间盘退变样本 | 机器学习 | 脊柱退行性疾病 | 单细胞测序和机器学习 | 支持向量机和LASSO | 基因表达数据 | NA |
| 956 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptional Changes in Hypothalamic Corticotropin-Releasing Factor-Expressing Neurons After Early-Life Adversity Inform Enduring Alterations in Vulnerabilities to Stress
2023-Jan, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2021.12.006
PMID:36712559
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研究论文 | 这篇文章研究了早期生活逆境对下丘脑促肾上腺皮质激素释放因子(CRF)表达神经元的转录变化及其对压力脆弱性的长期影响 | 文章揭示了不同CRF细胞类型如何受到早期生活逆境的不同影响，导致压力脆弱性增加 | 暂未提到研究的具体局限性 | 探讨早期生活逆境如何影响神经内分泌和行为反应以改善心理健康 | 研究对象为发育中的雄性小鼠的CRF表达神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 发育中的雄性小鼠中CRF表达神经元的单细胞样本 |
| 957 | 2024-08-05 |
Next-Generation Morphometry for pathomics-data mining in histopathology
2023-01-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36173-0
PMID:36709324
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研究论文 | 本文开发了一个用于历史病理学的形态度量大规模提取框架，利用深度学习进行语义分割及定量特征提取 | 引入了单结构形态度量分析，结合单细胞转录组学技术，揭示了不同的肾小球群体和在疾病进展中的形态表型 | 使用的样本主要集中在肾脏组织，可能不适用于其他器官的病理分析 | 旨在开发用于大规模历史病理学数据挖掘的下一代形态度量概念 | 分析超过1000例肾脏活检和肾切除术样本 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 组织病理切片 | 超过1000例肾脏活检和肾切除术样本 |
| 958 | 2024-08-08 |
NF-YAl drives EMT in Claudinlow tumours
2023-01-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05591-9
PMID:36707502
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研究论文 | 本文探讨了NF-YAl在Claudin低表达肿瘤中驱动上皮-间质转化（EMT）的作用 | 定义并验证了与NF-YAr相关的158个基因的预测签名，并确定了与NF-YA异构体相关的特定剪接因子 | NA | 探索NF-YAl和NF-YAs在乳腺癌和胃癌中的作用及其对EMT的影响 | NF-YAl和NF-YAs在乳腺癌（BRCA）和胃癌（STAD）中的表达及其对肿瘤迁移和转移的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胃癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及两个Claudin乳腺癌细胞系SUM159PT和BT549的克隆 |
| 959 | 2024-08-08 |
Improved downstream functional analysis of single-cell RNA-sequence data using DGAN
2023-01-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-28952-y
PMID:36709340
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DGAN的深度生成自编码器网络，用于改进单细胞RNA测序数据的下游功能分析 | DGAN能够有效填补单细胞RNA测序数据中的缺失值，提高下游功能分析的准确性 | NA | 开发一种高效且稳健的单细胞RNA测序数据插补方法，以改善下游功能分析结果 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成自编码器网络 | 基因表达矩阵 | 五个公开可用的单细胞RNA测序数据集 |
| 960 | 2024-08-05 |
Highly efficient and robust π-FISH rainbow for multiplexed in situ detection of diverse biomolecules
2023-01-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36137-4
PMID:36707540
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研究论文 | 开发了一种高效且稳健的多重π-FISH彩虹方法，用于检测多种生物分子 | 该研究介绍了一种新型的π-FISH彩虹方法，能够高效且同时检测多种生物分子，并实现了与杂交链反应的结合 | NA | 提供一种稳健的生物分子原位检测技术，以支持空间多组学研究和临床诊断 | 检测多种生物分子（如DNA、RNA、蛋白质和神经递质）的表达 | 数字病理学 | 前列腺癌 | π-FISH彩虹 | NA | NA | NA |