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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-05 |
Identification of a novel immune-related gene signature for prognosis and the tumor microenvironment in patients with uveal melanoma combining single-cell and bulk sequencing data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1099071
PMID:36793711
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研究论文 | 本研究构建了一种与免疫相关的预后特征，用于葡萄膜黑色素瘤患者的预后和肿瘤微环境分析 | 提出了一种基于免疫相关基因S100A13、MMP9和SEMA3B的新型预后特征，并验证了其在多个数据集中的预测能力 | 研究中未提到样本的多样性和其他潜在的影响因素 | 构建与免疫相关的预后标志并阐明葡萄膜黑色素瘤的分子和免疫分类 | 以葡萄膜黑色素瘤患者为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和批量RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个bulk RNA测序数据集和一个单细胞测序数据集的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2024-08-05 |
Long-Read Single-Cell Sequencing Using scCOLOR-seq
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2996-3_18
PMID:36781734
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研究论文 | 本文描述了一种使用Oxford Nanopore测序系统进行高精度单细胞纠正长读长测序(scCOLOR-seq)的方法 | 该方法通过滴液包封细胞，提高了Oxford Nanopore第三代测序平台的基本调用准确性 | 文章中未提及特定的局限性 | 研究旨在开发一种有效的单细胞测序技术 | 研究对象为单个细胞 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 923 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing combined with machine learning reveals the mechanism of interaction between epilepsy and stress cardiomyopathy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1078731
PMID:36776884
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研究论文 | 本研究探讨了癫痫与应激性心肌病之间的相互作用机制 | 该论文通过单细胞测序与机器学习结合，揭示癫痫与应激性心肌病共同表达的基因及其生物功能 | 未提及具体的样本数量和研究范围的限制 | 研究癫痫与应激性心肌病共享的遗传特征和潜在分子机制 | 癫痫数据集和应激性心肌病数据集中的共同表达差异基因 | 机器学习 | 癫痫，心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 924 | 2024-08-05 |
RUNX1/CD44 axis regulates the proliferation, migration, and immunotherapy of gliomas: A single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1086280
PMID:36776876
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研究论文 | 这篇文章讨论了RUNX1/CD44轴在胶质瘤中的增殖、迁移和免疫治疗中的作用 | 揭示CD44在胶质瘤免疫浸润中的关键作用，并探讨其作为预测免疫治疗反应的生物标志物的潜力 | 尚未对胶质瘤中CD44表达的临床和免疫特征进行全面分析 | 研究CD44在胶质瘤中的表达及其与免疫反应的关系 | 对胶质瘤的分子和临床数据进行分析 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | NA | 分子和临床数据 | 分析了来自公共基因组数据库的胶质瘤数据 | NA | NA | NA | NA |
| 925 | 2024-08-05 |
By integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq in sphingolipid metabolism, CACYBP was identified as a potential therapeutic target in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1115272
PMID:36776843
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq，识别了在肺腺癌中CACYBP作为潜在治疗靶点 | 首次将鞘脂代谢与肺腺癌预后的相关基因进行系统性分析，并建立了基于鞘脂相关基因的预后模型 | 未详细说明样本多样性及该模型在临床应用中的有效性 | 确定与肺腺癌相关的主要鞘脂相关基因并开发相应的预后模型 | 肺腺癌患者的鞘脂代谢相关基因及其免疫环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq | Lasso回归和COX回归模型 | 基因表达数据 | 涉及334个基因的研究，未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 926 | 2024-08-05 |
Bibliometric analysis of single-cell sequencing researches on immune cells and their application of DNA damage repair in cancer immunotherapy
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1067305
PMID:36776314
|
研究论文 | 本文对2011-2021年间关于免疫细胞单细胞测序的文献进行了计量分析 | 该研究为单细胞测序在癌症免疫治疗中应用的理解提供新视角 | 未提及研究的具体局限性 | 探讨单细胞测序在免疫细胞研究和癌症免疫治疗中的应用 | 对免疫细胞的单细胞测序研究进行分析 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献 | 1460个出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 927 | 2024-08-05 |
Clinical and immunological features of an APLAID patient caused by a novel mutation in PLCG2
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1014150
PMID:36776842
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研究论文 | 本文描述了一名由于PLCγ2基因新变异引起的APLAID患者的临床和免疫特征 | 首次报道了携带新PLCγ2突变的APLAID患者，其髓样树突细胞显著减少，并进行了全面的免疫特征分析 | 仅针对单个病例进行分析，样本量有限 | 研究APLAID综合征的遗传及免疫特征 | 一名7岁APLAID患者 | 数字病理学 | 自体炎症疾病 | 全外显子组测序（WES）、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 血液样本 | 1名APLAID患者和1名健康儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 928 | 2024-08-08 |
Network analyses of upper and lower airway transcriptomes identify shared mechanisms among children with recurrent wheezing and school-age asthma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1087551
PMID:36776870
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研究论文 | 本研究通过网络分析上呼吸道和下呼吸道转录组，识别反复喘息和学龄哮喘儿童之间的共同机制 | 本研究首次结合单细胞转录组数据和细胞解卷积方法，通过共识加权基因共表达网络分析，识别了反复喘息和学龄哮喘之间的共识模块和共享通路 | 本研究主要基于转录组数据，未涉及其他类型的生物标志物或临床数据 | 旨在阐明反复喘息和学龄哮喘的发病机制及其之间的机制关系 | 反复喘息和学龄哮喘儿童的上呼吸道和下呼吸道转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 鼻腔和气管刷拭样本 | NA | NA | NA | NA |
| 929 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies Fgf23-expressing osteocytes in response to 1,25-dihydroxyvitamin D3 treatment
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1102751
PMID:36776964
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了在小鼠股骨中响应1,25-二羟基维生素D3治疗的表达Fgf23的成骨细胞 | 首次使用scRNA-seq技术鉴定了响应1,25-二羟基维生素D3治疗的表达Fgf23的成骨细胞亚群 | 由于成骨细胞分离的技术困难，使用scRNA-seq分析表达Fgf23的成骨细胞的研究较少 | 鉴定响应1,25-二羟基维生素D3治疗的表达Fgf23的成骨细胞亚群 | 小鼠股骨中的成骨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠股骨中的成骨细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 930 | 2024-08-08 |
Identification of metabolic signatures related to metastasis and immunotherapy resistance in oral squamous cell carcinoma
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:36777871
|
研究论文 | 本研究旨在识别与口腔鳞状细胞癌（OSCC）转移和免疫治疗抵抗相关的代谢基因，并构建一个与OSCC预后相关的代谢基因预测模型 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，识别了与OSCC转移和免疫治疗抵抗相关的代谢基因，并构建了预测模型 | NA | 识别与口腔鳞状细胞癌转移和免疫治疗抵抗相关的代谢基因，并构建预测模型 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）的代谢基因及其与转移和免疫治疗抵抗的关系 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq | WGCNA, LASSO | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的RNA-seq和scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 931 | 2024-08-08 |
Physiological hypoxia improves growth and functional differentiation of human intestinal epithelial organoids
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1095812
PMID:36793710
|
研究论文 | 本文研究了生理性低氧环境对人类肠道上皮类器官生长和功能分化的影响 | 首次探讨了模拟体内生理性低氧环境对肠道上皮类器官作为临床前模型的转化价值的影响 | NA | 评估在生理性低氧环境下人类肠道类器官的建立和培养情况，并比较其在不同氧气浓度下的生长、分化和免疫反应 | 人类肠道上皮类器官 | NA | 炎症性肠病，结直肠癌 | 免疫荧光染色，单细胞RNA测序（scRNA-seq），ELISA | NA | 图像，基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 932 | 2024-08-08 |
Endothelial Indoleamine-2,3-Dioxygenase-1 is not Critically Involved in Regulating Antitumor Immunity in the Central Nervous System
2023, International journal of tryptophan research : IJTR
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/11786469231153111
PMID:36798537
|
研究论文 | 研究探讨了内皮细胞中的吲哚胺-2,3-双加氧酶-1（eIDO1）在调节中枢神经系统抗肿瘤免疫中的作用 | 通过单细胞RNA测序数据揭示了IDO1在人脑胶质瘤组织中主要由激活的内皮细胞表达，并显示出与JAK/STAT信号通路相关的CXCL11基因表达特征 | 实验仅在同基因实验性胶质瘤模型中进行，可能限制了结果的普遍性 | 研究eIDO1在脑肿瘤免疫中的作用 | 内皮细胞中的IDO1表达及其对肿瘤浸润T细胞频率和肿瘤生长的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人脑胶质瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 933 | 2024-08-08 |
demuxmix: Demultiplexing oligonucleotide-barcoded single-cell RNA sequencing data with regression mixture models
2023-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.27.525961
PMID:36747615
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研究论文 | 本文介绍了一种基于负二项回归混合模型的单细胞RNA测序数据解复用方法demuxmix | demuxmix方法通过概率分类框架提供液滴分配的错误概率，并利用RNA文库中检测到的基因与HTO计数之间的正相关性来解释HTO数据中的部分变异，从而提高液滴分配的准确性 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据解复用方法，以提高解复用的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项回归混合模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 934 | 2024-08-08 |
The Hidradenitis Suppurativa 'Omics Database (HS-OmicsDB)
2023-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.524600
PMID:36747861
|
研究论文 | 本文介绍了Hidradenitis Suppurativa（HS）的'Omics数据库（HS-OmicsDB），旨在聚合公开可用的'Omics数据以增强HS研究 | 首次为Hidradenitis Suppurativa（HS）建立了一个纵向的'Omics数据库，包括未治疗HS患者的批量和单细胞RNA测序数据 | NA | 增强Hidradenitis Suppurativa（HS）的研究 | Hidradenitis Suppurativa（HS）患者的'Omics数据 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括未治疗HS患者的批量和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 935 | 2024-08-08 |
Investigating the Complexity of Gene Co-expression Estimation for Single-cell Data
2023-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525447
PMID:36747724
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研究论文 | 本研究测试了现有的基因共表达估计方法在具有已知真实共表达网络的模拟数据集上的表现 | 通过使用从实验数据中学习的参数生成新的模拟数据集，这些模拟更好地捕捉了真实世界单细胞数据集的潜在属性 | 所有方法在模拟和实验数据集上的估计结果显示出高假发现率，可能是由于数据中的高稀疏性水平 | 深入测试现有基因共表达估计方法在单细胞数据上的表现 | 基因共表达估计方法在单细胞RNA测序数据上的性能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因共表达网络 | 数十个模拟数据集和八个实验数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 936 | 2024-08-05 |
Systemically Identifying Triple-Negative Breast Cancer Subtype-Specific Prognosis Signatures, Based on Single-Cell RNA-Seq Data
2023-01-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12030367
PMID:36766710
|
研究论文 | 本研究提出了一种单细胞RNA测序基础的生物信息学方法来识别三阴性乳腺癌亚型特异性预后标志物。 | 通过单细胞RNA-seq数据识别三阴性乳腺癌亚型相关的生物标志物，以克服传统RNA-seq的局限性。 | 研究主要依赖于生物信息学分析，可能缺乏临床验证。 | 识别三阴性乳腺癌亚型特异性预后标志物，以改善治疗效果。 | 关注三阴性乳腺癌的不同分子亚型及其相关预后标志物。 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 在四个独立验证数据集中进行确认，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 937 | 2024-08-05 |
Actin-like Protein 6A Expression Correlates with Cancer Stem Cell-like Features and Poor Prognosis in Ovarian Cancer
2023-Jan-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24032016
PMID:36768349
|
研究论文 | 本研究探讨了Actin-like Protein 6A在卵巢癌中的表达与癌症干细胞特征的关系及其对预后的影响 | 发现ACTL6A的高表达与卵巢癌患者的不良预后相关，并且可以作为预测耐药、转移和预后的生物标志物 | 未提及具体的临床试验数据以支持结果 | 探索与卵巢癌发展相关的遗传标记的机制和临床价值 | 分析来自多个数据库的与卵巢癌相关的差异表达基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用GSE185833和GSE176246数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 938 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis Reveals a Cell Atlas and Cell Communication in Yak Ovary
2023-Jan-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24031839
PMID:36768166
|
研究论文 | 本文揭示了牦牛卵巢的细胞图谱和细胞间通信 | 首次利用单细胞RNA测序构建了牦牛卵巢的细胞图谱，识别出不同细胞类型及其特定分子标记 | 研究中未提及样本规模及其对结果的可能影响 | 阐明牦牛在高海拔环境中的生殖适应机制 | 牦牛卵巢中的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 939 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptome Profiling of Mouse Hippocampal Single Cell Microzone in Parkinson's Disease
2023-Jan-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24031810
PMID:36768134
|
研究论文 | 本研究分析了帕金森病中不同空间位置的小鼠海马体单细胞的基因表达特征，并探讨了基因表达调控对学习和记忆机制的影响 | 首次揭示了帕金森病中海马体空间定位细胞的转录组图谱和异质性，并证明了PD受损的学习和记忆能力受到CA1和CA3亚区神经元基因协同效应的影响 | NA | 分析小鼠海马体不同空间位置的单细胞基因表达特征，并探讨基因表达调控对学习和记忆机制的影响 | 小鼠海马体不同空间位置的单细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序和空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 74个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 940 | 2024-08-05 |
Spatially resolved transcriptomics: advances and applications
2023-Jan, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000141
PMID:36742187
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review | 这篇文章总结并比较了空间转录组学的主要方法 | 文章强调了空间转录组学的技术进步及其在生物研究和临床中的潜在应用 | NA | 本研究旨在提高对生物过程和疾病的理解 | 主要涉及神经科学、癌症生物学、发育生物学和血液学的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |