单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-08 |
The Prognostic Model Established by the Differential Expression Genes Based on CD8+ T Cells to Evaluate the Prognosis and the Response to Immunotherapy in Osteosarcoma
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/6563609
PMID:36816742
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研究论文 | 本研究通过分析骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据，构建了一个基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后模型，用于评估骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了一个基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后模型，用于评估骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | NA | 探索一个能够准确评估骨肉瘤对免疫治疗反应的模型 | 骨肉瘤患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据 |
| 902 | 2024-08-08 |
Single-cell transcription analysis reveals the tumor origin and heterogeneity of human bilateral renal clear cell carcinoma
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0569
PMID:36816799
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研究论文 | 本研究通过分析来自基因表达 omnibus 数据库的单细胞转录组测序数据，揭示了人类双侧肾透明细胞癌的肿瘤起源和异质性 | 首次通过单细胞转录组测序数据分析，揭示了双侧肾透明细胞癌的细胞类型、恶性评分、肿瘤微环境和细胞干性评分等方面的差异 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及其他类型的分子数据或临床数据 | 探究双侧肾透明细胞癌的肿瘤起源、微环境、细胞分子特征和肿瘤内异质性 | 双侧肾透明细胞癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 共包含来自左侧和右侧透明细胞肾细胞癌的7143个细胞 |
| 903 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis to identify the influences of SARS-CoV-2 infections to inflammatory bowel disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1024041
PMID:36817436
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞分析，探讨了COVID-19与炎症性肠病（IBD）之间的分子和细胞交集，以理解COVID-19对IBD患者的影响 | 本研究首次通过转录组和单细胞RNA测序数据，揭示了COVID-19与IBD之间的共同差异表达基因（DEGs）和免疫细胞类型比例的变化，为理解两者之间的关联提供了新的视角 | 本研究主要基于已有的RNA测序和单细胞RNA测序数据集，可能存在样本选择偏倚和数据集之间的异质性问题 | 探讨COVID-19感染对炎症性肠病（IBD）的影响及其分子机制 | COVID-19与炎症性肠病（IBD）之间的共同差异表达基因和免疫细胞类型 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 四个RNA测序数据集和两个单细胞RNA测序数据集 |
| 904 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptomics reveals differences in the immune status of alcoholic and hepatitis B virus-related liver cirrhosis
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1132085
PMID:36817578
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了酒精性和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了酒精性和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态差异，并发现Galectin-9可能作为酒精性肝硬化治疗的新靶点 | 研究样本量较小，仅包括15个肝脏样本，可能影响结果的普遍性 | 探索酒精性和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态差异 | 酒精性肝硬化和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 15个肝脏样本，包括5个健康对照组、5个酒精性肝硬化患者组和5个乙型肝炎病毒相关肝硬化患者组 |
| 905 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profile of satellite glial cells in trigeminal ganglion
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1117065
PMID:36818656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了三叉神经节中卫星胶质细胞的转录组特征 | 首次揭示了三叉神经节中卫星胶质细胞的分子特征、异质性及其与神经元亚型的双向相互作用 | NA | 深入理解三叉神经节中卫星胶质细胞的转录特征及其与神经元的相互作用 | 三叉神经节中的卫星胶质细胞及其与神经元的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含九种细胞集群，如神经元、卫星胶质细胞、有髓鞘施万细胞、无髓鞘施万细胞、免疫细胞等 |
| 906 | 2024-08-08 |
Developmental deficits of MGE-derived interneurons in the Cntnap2 knockout mouse model of autism spectrum disorder
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1112062
PMID:36819097
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研究论文 | 本研究探讨了Cntnap2敲除小鼠模型中，源自内侧神经节隆起（MGE）的中间神经元在自闭症谱系障碍（ASD）中的发育缺陷 | 首次揭示了Cntnap2敲除小鼠中，MGE来源的中间神经元在发育过程中的细胞增殖增加和细胞死亡增多现象，以及Lhx6表达的胆碱能中间神经元的细胞和分子改变 | NA | 追踪纹状体发育中的中间神经元，并阐明其在Cntnap2敲除小鼠模型中的分子和生理改变 | Cntnap2敲除小鼠模型中的中间神经元 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | Stereo-seq和单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 907 | 2024-08-08 |
Acute injury to the mouse carotid artery provokes a distinct healing response
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1125864
PMID:36824462
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了小鼠颈动脉在导丝损伤后的愈合反应，重点关注了平滑肌细胞和成纤维细胞群体，并探讨了干细胞/内皮细胞/单核细胞（SEM）在损伤修复中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了小鼠颈动脉损伤后的愈合过程，并识别了可能参与血管再生的SEM细胞。 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨SEM细胞在人体中的作用和潜在的治疗应用。 | 深入了解血管损伤后的愈合过程，特别是平滑肌细胞和SEM细胞在其中的作用。 | 小鼠颈动脉损伤后的组织愈合反应。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠颈动脉组织样本 |
| 908 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human Alzheimer's disease brain samples reveals neuronal and glial specific cells differential expression
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0277630
PMID:36827281
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了阿尔茨海默病患者大脑样本中的神经元和胶质细胞特异性差异表达 | 首次在单细胞水平上揭示了阿尔茨海默病患者大脑中不同细胞类型的转录组变化 | 未测量APOE状态、CERAD和THAL评分 | 识别阿尔茨海默病中受影响的特定神经元群体的独特转录网络 | 阿尔茨海默病患者大脑样本中的神经元和胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从两个阿尔茨海默病患者和匹配的对照组中收集了超过25,000个单核 |
| 909 | 2024-08-08 |
Amino acid transporter SLC7A5 regulates Paneth cell function to affect the intestinal inflammatory response
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.524966
PMID:36789439
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研究论文 | 本文研究了氨基酸转运蛋白SLC7A5在小鼠肠道上皮细胞中的作用，特别是其对Paneth细胞功能和肠道炎症反应的影响。 | 首次报道了肠道上皮细胞特异性敲除氨基酸转运蛋白SLC7A5，并揭示了其对mTORC1信号通路和细胞增殖的影响。 | NA | 探讨SLC7A5在肠道上皮细胞中的功能及其对肠道炎症反应的影响。 | 小鼠肠道上皮细胞和Paneth细胞。 | NA | NA | scRNA-seq和电子显微镜分析。 | NA | 细胞和分子数据。 | 小鼠模型。 |
| 910 | 2024-08-05 |
Predicting tumor immune microenvironment and checkpoint therapy response of head & neck cancer patients from blood immune single-cell transcriptomics
2023-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.524455
PMID:36789425
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研究论文 | 本研究探讨如何从血液中推断肿瘤免疫状态并预测免疫疗法的反应 | 首次通过外周血单核细胞的scRNA-Seq推断肿瘤免疫状态，并发现其能有效预测免疫疗法反应 | 研究可能受限于样本量和特定类型肿瘤的局限性 | 研究肿瘤免疫微环境与免疫疗法反应的关系 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者的外周血单核细胞和肿瘤组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 使用了HNSCC患者的匹配外周血单核细胞和肿瘤组织的数据集 |
| 911 | 2024-08-08 |
Sample Preparation and Integrative Data Analysis of a Droplet-based Single-Cell ATAC-sequencing Using Murine Thymic Epithelial Cells
2023-Jan-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4588
PMID:36789086
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研究论文 | 本文介绍了使用液滴法单细胞ATAC测序技术（scATAC-seq）对小鼠胸腺上皮细胞（TECs）进行染色质可及性分析的方法和综合数据分析 | 采用液滴法scATAC-seq技术与scRNA-seq数据的综合分析，提高了单细胞水平上表观遗传学特征的分辨率 | NA | 揭示特定生物背景下基因调控机制的表观遗传学景观 | 小鼠胸腺上皮细胞（TECs）的表观遗传学特征 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 特定的小鼠胸腺上皮细胞亚群 |
| 912 | 2024-08-05 |
Sex-specific transcriptional signatures in the medial prefrontal cortex underlying sexually dimorphic behavioural responses to stress in rats
2023 Jan-Feb, Journal of psychiatry & neuroscience : JPN
IF:4.1Q1
DOI:10.1503/jpn.220147
PMID:36796857
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研究论文 | 本文研究了雄性和雌性大鼠在应激反应中的转录特征差异 | 首次识别出与应激相关的性别特异性转录组特征 | 研究需要进一步深入的实验验证，如单细胞测序和基因网络操控 | 探讨应激影响下雌雄大鼠的行为反应及其转录组差异 | 雌性和雄性大鼠在不同应激模型下的反应 | 数字病理学 | NA | RNA测序, qRT-PCR | NA | 转录组数据 | 雌性和雄性大鼠，具体样本数NA |
| 913 | 2024-08-05 |
Identification of a novel immune-related gene signature for prognosis and the tumor microenvironment in patients with uveal melanoma combining single-cell and bulk sequencing data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1099071
PMID:36793711
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研究论文 | 本研究构建了一种与免疫相关的预后特征，用于葡萄膜黑色素瘤患者的预后和肿瘤微环境分析 | 提出了一种基于免疫相关基因S100A13、MMP9和SEMA3B的新型预后特征，并验证了其在多个数据集中的预测能力 | 研究中未提到样本的多样性和其他潜在的影响因素 | 构建与免疫相关的预后标志并阐明葡萄膜黑色素瘤的分子和免疫分类 | 以葡萄膜黑色素瘤患者为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和批量RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个bulk RNA测序数据集和一个单细胞测序数据集的样本 |
| 914 | 2024-08-05 |
Long-Read Single-Cell Sequencing Using scCOLOR-seq
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2996-3_18
PMID:36781734
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研究论文 | 本文描述了一种使用Oxford Nanopore测序系统进行高精度单细胞纠正长读长测序(scCOLOR-seq)的方法 | 该方法通过滴液包封细胞，提高了Oxford Nanopore第三代测序平台的基本调用准确性 | 文章中未提及特定的局限性 | 研究旨在开发一种有效的单细胞测序技术 | 研究对象为单个细胞 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | 序列数据 | NA |
| 915 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing combined with machine learning reveals the mechanism of interaction between epilepsy and stress cardiomyopathy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1078731
PMID:36776884
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研究论文 | 本研究探讨了癫痫与应激性心肌病之间的相互作用机制 | 该论文通过单细胞测序与机器学习结合，揭示癫痫与应激性心肌病共同表达的基因及其生物功能 | 未提及具体的样本数量和研究范围的限制 | 研究癫痫与应激性心肌病共享的遗传特征和潜在分子机制 | 癫痫数据集和应激性心肌病数据集中的共同表达差异基因 | 机器学习 | 癫痫，心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 916 | 2024-08-05 |
RUNX1/CD44 axis regulates the proliferation, migration, and immunotherapy of gliomas: A single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1086280
PMID:36776876
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研究论文 | 这篇文章讨论了RUNX1/CD44轴在胶质瘤中的增殖、迁移和免疫治疗中的作用 | 揭示CD44在胶质瘤免疫浸润中的关键作用，并探讨其作为预测免疫治疗反应的生物标志物的潜力 | 尚未对胶质瘤中CD44表达的临床和免疫特征进行全面分析 | 研究CD44在胶质瘤中的表达及其与免疫反应的关系 | 对胶质瘤的分子和临床数据进行分析 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | NA | 分子和临床数据 | 分析了来自公共基因组数据库的胶质瘤数据 |
| 917 | 2024-08-05 |
By integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq in sphingolipid metabolism, CACYBP was identified as a potential therapeutic target in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1115272
PMID:36776843
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq，识别了在肺腺癌中CACYBP作为潜在治疗靶点 | 首次将鞘脂代谢与肺腺癌预后的相关基因进行系统性分析，并建立了基于鞘脂相关基因的预后模型 | 未详细说明样本多样性及该模型在临床应用中的有效性 | 确定与肺腺癌相关的主要鞘脂相关基因并开发相应的预后模型 | 肺腺癌患者的鞘脂代谢相关基因及其免疫环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq | Lasso回归和COX回归模型 | 基因表达数据 | 涉及334个基因的研究，未具体说明样本数量 |
| 918 | 2024-08-05 |
Bibliometric analysis of single-cell sequencing researches on immune cells and their application of DNA damage repair in cancer immunotherapy
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1067305
PMID:36776314
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研究论文 | 本文对2011-2021年间关于免疫细胞单细胞测序的文献进行了计量分析 | 该研究为单细胞测序在癌症免疫治疗中应用的理解提供新视角 | 未提及研究的具体局限性 | 探讨单细胞测序在免疫细胞研究和癌症免疫治疗中的应用 | 对免疫细胞的单细胞测序研究进行分析 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献 | 1460个出版物 |
| 919 | 2024-08-05 |
Clinical and immunological features of an APLAID patient caused by a novel mutation in PLCG2
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1014150
PMID:36776842
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研究论文 | 本文描述了一名由于PLCγ2基因新变异引起的APLAID患者的临床和免疫特征 | 首次报道了携带新PLCγ2突变的APLAID患者，其髓样树突细胞显著减少，并进行了全面的免疫特征分析 | 仅针对单个病例进行分析，样本量有限 | 研究APLAID综合征的遗传及免疫特征 | 一名7岁APLAID患者 | 数字病理学 | 自体炎症疾病 | 全外显子组测序（WES）、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 血液样本 | 1名APLAID患者和1名健康儿童 |
| 920 | 2024-08-08 |
Network analyses of upper and lower airway transcriptomes identify shared mechanisms among children with recurrent wheezing and school-age asthma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1087551
PMID:36776870
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研究论文 | 本研究通过网络分析上呼吸道和下呼吸道转录组，识别反复喘息和学龄哮喘儿童之间的共同机制 | 本研究首次结合单细胞转录组数据和细胞解卷积方法，通过共识加权基因共表达网络分析，识别了反复喘息和学龄哮喘之间的共识模块和共享通路 | 本研究主要基于转录组数据，未涉及其他类型的生物标志物或临床数据 | 旨在阐明反复喘息和学龄哮喘的发病机制及其之间的机制关系 | 反复喘息和学龄哮喘儿童的上呼吸道和下呼吸道转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 鼻腔和气管刷拭样本 |