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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-05 |
The intestine: A highly dynamic microenvironment for IgA plasma cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1114348
PMID:36875083
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综述 | 本文章讨论了肠道上皮细胞与IgA浆细胞的空间相互作用及其对IgA浆细胞生成、归巢和寿命的潜在贡献 | 介绍了空间转录组学作为一种新技术，用于解决肠道IgA浆细胞生物学中的未解问题 | NA | 探讨肠道微环境对IgA浆细胞的影响及其生物学特性 | IgA浆细胞和肠道上皮细胞 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 882 | 2024-08-08 |
Destin2: Integrative and cross-modality analysis of single-cell chromatin accessibility data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1089936
PMID:36873935
|
研究论文 | 提出了一种名为Destin2的新型统计和计算方法，用于单细胞ATAC-seq数据的跨模态降维、聚类和轨迹重建 | Destin2通过整合来自峰可及性、基序偏差分数和伪基因活性的细胞水平表观基因组数据，学习共享流形，并进行聚类和/或轨迹推断 | NA | 开发一种跨模态分析方法，用于单细胞染色质可及性数据的整合和分析 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 实际scATAC-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 883 | 2024-08-08 |
Precision immunointerception of EGFR-driven tumorigenesis for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1036563
PMID:36875137
|
研究论文 | 本研究针对常见的EGFR突变，开发了一种多肽疫苗E Vax，并在小鼠模型中评估了其预防EGFR突变驱动的肺癌发生的效果 | 开发了一种针对EGFR L858R、T790M和Del19突变的多肽疫苗E Vax，并证明了其在小鼠模型中有效预防肺癌发生 | 研究结果主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 开发和评估针对EGFR突变的新型疫苗，以预防肺癌的发生 | EGFR突变驱动的肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了同基因和遗传工程改造的EGFR突变驱动的小鼠肺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 884 | 2024-08-08 |
A novel autophagy-related long non-coding RNAs signature predicting progression-free interval and I-131 therapy benefits in papillary thyroid carcinoma
2023, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2023-0660
PMID:36880066
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研究论文 | 本研究旨在探讨自噬相关长非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的预后和预测价值 | 构建了一个新的六长非编码RNA签名，用于预测甲状腺乳头状癌患者的无进展间隔和I-131治疗效益 | NA | 探索自噬相关长非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的预后和预测价值 | 甲状腺乳头状癌患者的自噬相关基因和长非编码RNA表达数据 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 长非编码RNA分析 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA数据库的甲状腺乳头状癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 885 | 2024-08-08 |
Defining Selective Neuronal Resilience and Identifying Targets of Neuroprotection and Axon Regeneration Using Single-Cell RNA Sequencing: Computational Approaches
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3012-9_2
PMID:36881293
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研究论文 | 本文描述了一种计算工作流程，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）的小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）在视神经压迫（ONC）后的表达谱 | 本文采用监督分类方法，通过迭代策略从损伤反应中解卷积类型特异性基因签名，以识别与恢复力相关的分子标志物 | NA | 旨在识别46种分子定义的RGC类型之间的生存动态差异及其相关分子特征 | 小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）在视神经压迫后的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 监督分类方法 | 基因表达数据 | 六个时间点的RGCs scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 886 | 2024-08-08 |
Defining Selective Neuronal Resilience and Identifying Targets for Neuroprotection and Axon Regeneration Using Single-Cell RNA Sequencing: Experimental Approaches
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3012-9_1
PMID:36881292
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了轴突损伤后不同神经元类型的生存和基因表达变化 | 利用单细胞RNA测序技术，系统地追踪轴突损伤后的神经元生存和基因表达变化 | NA | 识别区分具有恢复力和易感性的神经元群体的分子特征，揭示神经保护和轴突再生的潜在靶点 | 神经元类型在神经退行性疾病中的不同影响 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠视网膜作为实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 887 | 2024-08-08 |
Effects of Dlx2 overexpression on the genes associated with the maxillary process in the early mouse embryo
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1085263
PMID:36891149
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研究论文 | 研究Dlx2过表达对小鼠早期胚胎上颌突相关基因的影响 | 通过bulk RNA-Seq、scRNA-Seq和CUT&Tag分析，全面揭示了Dlx2过表达对上颌突早期发育的转录调控效应 | NA | 阐明Dlx2在颅面发育中的转录调控作用 | 小鼠早期胚胎上颌突的发育 | 发育生物学 | NA | RNA-Seq, scRNA-Seq, CUT&Tag | NA | RNA | E10.5上颌突的小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 888 | 2024-08-08 |
scRNA-seq reveals aging-related immune cell types and regulators in vaginal wall from elderly women with pelvic organ prolapse
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1084516
PMID:36891295
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了老年女性盆腔器官脱垂患者阴道壁中与年龄相关的免疫细胞类型及其关键调控因子 | 首次探讨了盆腔器官脱垂患者盆腔微环境中与年龄相关的差异，并发现了新的细胞类型和关键调控因子 | NA | 揭示盆腔器官脱垂患者盆腔微环境中与年龄相关的免疫细胞类型及其关键调控因子 | 老年女性盆腔器官脱垂患者的阴道壁 | 数字病理学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 包括对照组（<60岁）、年轻盆腔器官脱垂组（<60岁）和老年盆腔器官脱垂组（>60岁） | NA | NA | NA | NA |
| 889 | 2024-08-08 |
Ferroptosis Suppressor Protein 1 Inhibition Promotes Tumor Ferroptosis and Anti-tumor Immune Responses in Liver Cancer
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.03.001
PMID:36893885
|
研究论文 | 研究探讨了铁死亡抑制蛋白1（FSP1）在肝细胞癌（HCC）中的表达及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了FSP1在HCC中的高表达及其通过抑制铁死亡促进肿瘤生长的机制，并发现FSP1抑制剂能有效减少HCC负担并增强免疫浸润 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的临床试验验证FSP1抑制剂的疗效和安全性 | 探索FSP1作为HCC治疗新靶点的潜力 | 肝细胞癌（HCC）及其治疗 | 数字病理学 | 肝癌 | 逆转录定量聚合酶链反应，染色质免疫沉淀，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人类HCC和配对非肿瘤组织样本，以及使用 hydrodynamic tail vein injection 模型的动物实验 | NA | NA | NA | NA |
| 890 | 2024-08-05 |
Exploring the role of sphingolipid-related genes in clinical outcomes of breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1116839
PMID:36860848
|
研究论文 | 本研究探讨了与鞘脂相关的基因在乳腺癌临床结果中的作用 | 本研究建立了一个基于七个鞘脂相关基因的乳腺癌预后模型，首次将这些基因与临床结果、肿瘤进展和免疫变化联系起来 | 本研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本选择和数据完整性方面的局限 | 研究乳腺癌患者临床结果与鞘脂代谢基因的关系 | 乳腺癌患者的临床数据与肿瘤细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 (scRNA-seq), Cox回归分析, Lasso回归分析 | 预后模型 | 基因表达数据、临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌数据 | NA | NA | NA | NA |
| 891 | 2024-08-05 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to construct prognostic signatures to explore the role of glutamine metabolism in breast cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1135297
PMID:36843602
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq来构建预后特征，以探讨谷氨酸代谢在乳腺癌中的作用 | 提出了一种全新的预后风险特征，基于与谷氨酸代谢相关的基因，能够提高乳腺癌患者的预后预测 | 本研究可能受到公共数据集的限制，可能缺乏特定人群的验证 | 探讨谷氨酸代谢在乳腺癌患者预后中的作用 | 乳腺癌患者，涉及谷氨酸代谢相关基因的研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | WGCNA，Cox模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 892 | 2024-08-05 |
TNFR2 expression predicts the responses to immune checkpoint inhibitor treatments
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1097090
PMID:36865537
|
研究论文 | 研究表明TNFR2的表达可以预测癌症患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 提出TNFR2作为预测免疫检查点抑制剂疗效的新生物标志物 | 研究的结果需要进一步验证以加强其可靠性 | 识别新的生物标志物以提高免疫检查点抑制剂疗法的疗效 | 重点研究TNFR2在肿瘤微环境中对免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 分析的样本来自全癌症数据库的单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 893 | 2024-08-05 |
iSC.MEB: an R package for multi-sample spatial clustering analysis of spatial transcriptomics data
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad019
PMID:36845201
|
研究论文 | 本文介绍了iSC.MEB，一个用于空间转录组数据的多样本空间聚类分析的R软件包 | iSC.MEB结合了经验贝叶斯方法和隐藏马尔可夫随机场，允许用户同时估计批次效应并进行空间聚类 | NA | 提高空间转录组数据的分析能力 | 空间转录组数据集 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | 隐藏马尔可夫随机场 | 转录组数据 | 两个空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 894 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Reveals Necroptosis-Related Prognostic Genes of Glioblastoma
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/2926655
PMID:36860730
|
研究论文 | 这篇文章探讨了与凋亡相关的预后基因在神经胶质瘤中的作用 | 该研究识别了神经胶质瘤中的凋亡相关基因并构建了一个风险模型，提出了新的预后标志 | 样本仅来自手术样本，可能未能代表所有GBM患者 | 研究胃肠道肿瘤的凋亡作用及其对预后的影响 | 研究对象为神经胶质瘤（GBM）患者的组织样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 手术样本分析获得的样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 895 | 2024-08-08 |
High GNG4 predicts adverse prognosis for osteosarcoma: Bioinformatics prediction and experimental verification
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.991483
PMID:36845726
|
研究论文 | 本研究旨在阐明GNG4在骨肉瘤中的生物学作用及其预后价值 | 首次通过生物信息学分析和实验验证，确定GNG4在骨肉瘤中的高表达作为致癌基因和可靠的预后标志物 | NA | 阐明GNG4在骨肉瘤中的生物学作用及其预后价值 | GNG4在骨肉瘤中的表达及其对预后的影响 | NA | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 58例骨肉瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 896 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the metabolic changes and the prognostic value of malignant hepatocyte subpopulations and predict new therapeutic agents for hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1104262
PMID:36860314
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了恶性肝细胞亚群的代谢变化及其预后价值，并预测了肝细胞癌的新治疗药物 | 利用单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌中的细胞亚群，并通过基因集富集分析探索了不同细胞亚群间的通路异质性 | NA | 探讨肝细胞癌中的代谢变化及其预后价值，并寻找新的治疗策略 | 肝细胞癌的细胞亚群及其代谢变化 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 转录组数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 897 | 2024-08-08 |
MiRNA and Potential Prognostic Value in Non-Smoking Females with Lung Adenocarcinoma by High-Throughput Sequencing
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S401544
PMID:36860345
|
研究论文 | 本研究旨在探索非吸烟女性肺腺癌中的预后相关差异表达miRNA，并建立预后模型 | 构建了一个基于三种差异表达miRNA的新型预后模型，用于预测非吸烟女性肺腺癌的生存情况 | 样本量较小，仅包含8个样本 | 探索非吸烟女性肺腺癌中的预后相关差异表达miRNA并建立预后模型 | 非吸烟女性肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | miRNA测序 | Cox回归分析 | miRNA数据 | 8个非吸烟女性肺腺癌手术样本 | NA | NA | NA | NA |
| 898 | 2024-08-08 |
Epstein-Barr virus DNA seropositivity links distinct tumoral heterogeneity and immune landscape in nasopharyngeal carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1124066
PMID:36860875
|
研究论文 | 研究探讨了Epstein-Barr病毒DNA血清阳性（Sero+）和血清阴性（Sero-）的鼻咽癌（NPC）在肿瘤异质性和免疫景观上的差异 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了Sero+和Sero- NPC在细胞组成和功能上的多细胞生态系统差异 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 阐明Epstein-Barr病毒DNA血清状态与鼻咽癌肿瘤微环境特征的关系，为合理免疫治疗策略的发展提供见解 | Epstein-Barr病毒DNA血清阳性和阴性的鼻咽癌患者 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 28,423个细胞来自十个NPC样本和一个非肿瘤鼻咽组织 | NA | NA | NA | NA |
| 899 | 2024-08-08 |
Identifying key multifunctional components shared by critical cancer and normal liver pathways via SparseGMM
2023-01-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100392
PMID:36814838
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SparseGMM的统计方法，用于从多组学数据中发现基因调控网络 | SparseGMM通过结合共表达模式和贝叶斯框架，定量测量调控因子的置信度和目标基因分配的不确定性 | NA | 提高对具有遗传基础的疾病的理解 | 肝癌和正常肝组织 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 高斯混合模型（Gaussian mixtures） | 多组学数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 900 | 2024-08-08 |
Graph embedding and Gaussian mixture variational autoencoder network for end-to-end analysis of single-cell RNA sequencing data
2023-01-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100382
PMID:36814845
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为autoCell的深度学习方法，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的丢失填补和特征提取 | autoCell结合了图嵌入和概率深度高斯混合模型，用于推断高维稀疏scRNA-seq数据的分布 | NA | 开发一种端到端的分析工具，用于处理和分析scRNA-seq数据 | scRNA-seq数据，特别是人类胚胎植入前发育轨迹和与疾病相关的星形胶质细胞（DAAs） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码网络 | 基因表达数据 | 模拟数据集和生物学相关的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |