单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2024-08-08 |
Phenotypes and Functions of Human Dendritic Cell Subsets in the Tumor Microenvironment
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2938-3_2
PMID:36905506
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综述 | 本文综述了人类树突状细胞亚型在肿瘤微环境中的表型、功能及定位 | 利用流式细胞术、免疫荧光技术以及单细胞RNA测序和成像质谱细胞术等高输出技术来研究树突状细胞亚型 | NA | 探讨树突状细胞亚型在肿瘤微环境中的作用 | 人类树突状细胞亚型的表型、功能及在肿瘤微环境中的定位 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 成像质谱细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 862 | 2024-08-08 |
Harnessing Single-Cell RNA Sequencing to Identify Dendritic Cell Types, Characterize Their Biological States, and Infer Their Activation Trajectory
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2938-3_22
PMID:36905526
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术（scRNAseq）来识别树突状细胞类型，描述其生物学状态，并推断其激活轨迹 | 本文提供了一个scRNAseq分析流程，并附带了一个完整的GitHub教程，旨在帮助实验室和生物信息学研究人员利用scRNAseq数据解析树突状细胞或其他细胞类型的生物学特性 | 对于新用户来说，选择合适的分析策略和计算工具可能具有挑战性，且需要特定的、稳健的和可行的策略来注释细胞类型和激活状态 | 更好地理解树突状细胞生物学并将其应用于临床，确定哪些树突状细胞类型和激活状态组合介导哪些功能以及如何介导 | 树突状细胞的类型、功能和调控，以及其生理激活状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA序列 | 从正常或肿瘤携带的小鼠肺部分离的单核吞噬细胞的公共数据集 |
| 863 | 2024-08-08 |
Characterization of Developmental Trajectories of Dendritic Cell Hematopoiesis Through Single-Cell RNA Sequencing Methods
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2938-3_23
PMID:36905527
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研究论文 | 本文介绍了使用单细胞RNA测序技术处理小鼠骨髓以追踪树突状细胞分化轨迹的工作流程 | 本文提供了一个起点，帮助初入树突状细胞发育和细胞发展轨迹分析领域的研究人员 | NA | 追踪树突状细胞的分化轨迹 | 小鼠骨髓中的树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 864 | 2024-08-08 |
Upregulation of APOC1 Promotes Colorectal Cancer Progression and Serves as a Potential Therapeutic Target Based on Bioinformatics Analysis
2023, Journal of oncology
DOI:10.1155/2023/2611105
PMID:36908705
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了APOC1基因在结直肠癌（CRC）中的表达模式及其生物学功能，并评估了其在CRC发展中的作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了APOC1在CRC组织中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中过表达，并通过体外敲低方法验证了APOC1抑制对CRC细胞生长和迁移的影响。 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的体内实验来验证APOC1作为治疗靶点的有效性。 | 研究APOC1基因在结直肠癌中的表达及其对疾病进展的影响，并探索其作为潜在治疗靶点的可能性。 | APOC1基因在结直肠癌中的表达及其与疾病进展的关系。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括结直肠癌组织、周围正常结直肠组织、肝转移癌组织和正常肝组织。 |
| 865 | 2024-08-08 |
A novel prognostic scoring model based on copper homeostasis and cuproptosis which indicates changes in tumor microenvironment and affects treatment response
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1101749
PMID:36909185
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研究论文 | 本文构建了一个基于铜稳态和铜死亡的预后评分模型，用于预测肿瘤微环境的变化并辅助选择肝细胞癌患者的治疗策略 | 首次结合铜稳态和铜死亡，展示了铜相关生物过程在肝细胞癌中的总体潜在风险 | NA | 构建一个预后评分系统，预测肿瘤微环境的变化并辅助选择治疗策略 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境和治疗反应 | 数字病理学 | 肝癌 | LASSO和多元Cox回归分析，单细胞RNA测序，实时qPCR | NA | 基因表达数据 | 21名肝细胞癌患者及其邻近正常组织 |
| 866 | 2024-08-08 |
Diversity of arterial cell and phenotypic heterogeneity induced by high-fat and high-cholesterol diet
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.971091
PMID:36910156
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了高脂高胆固醇饮食对Apoe小鼠主动脉弓细胞类型和表型异质性的影响 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细描绘了高脂高胆固醇饮食诱导的主动脉弓细胞转录组图谱，揭示了细胞异质性 | 研究仅限于Apoe小鼠模型，且样本量相对较小 | 探究高脂高胆固醇饮食对主动脉弓细胞类型和表型异质性的影响 | Apoe小鼠的主动脉弓细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组5,416个细胞，高脂高胆固醇饮食组2,739个细胞 |
| 867 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome dynamics of the autotaxin-lysophosphatidic acid axis during muscle regeneration reveal proliferative effects in mesenchymal fibro-adipogenic progenitors
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1017660
PMID:36910157
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研究论文 | 研究探讨了自分泌素-溶血磷脂酸轴在肌肉再生过程中的单细胞转录组动态变化及其对间充质纤维脂肪前体细胞增殖的影响 | 首次探索了LPA在调节组织驻留FAPs命运和分化中的作用，并展示了ENPP2-LPAR-PLPP轴在肌肉细胞类型和FAP谱系群体中的重要性 | 尚未探索LPA在调节组织驻留FAPs命运和分化中的具体作用 | 研究自分泌素-溶血磷脂酸轴在肌肉再生过程中的作用及其对细胞增殖和分化的影响 | 骨骼肌系统中的间充质纤维脂肪前体细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了公开的批量和单细胞RNA测序数据集 |
| 868 | 2024-08-08 |
Canine peripheral blood TCRαβ T cell atlas: Identification of diverse subsets including CD8A+ MAIT-like cells by combined single-cell transcriptome and V(D)J repertoire analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1123366
PMID:36911660
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序与免疫组库测序相结合的方法，生成了健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱 | 首次在犬类中发现黏膜相关恒定T细胞（MAIT）样细胞，并识别出多种未在犬类中描述过的T细胞群体 | 犬类T细胞多样性的研究受限于缺乏物种特异性的抗体用于流式细胞术 | 生成健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱，以促进对发病机制的理解并开发新的治疗策略 | 健康犬的外周血TCRαβ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq）与免疫组库测序 | NA | 转录组 | 22个TCRαβ T细胞集群 |
| 869 | 2024-08-08 |
Characteristic gene expression in the liver monocyte-macrophage-DC system is associated with the progression of fibrosis in NASH
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1098056
PMID:36911682
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研究论文 | 本研究探讨了非酒精性脂肪性肝炎（NASH）小鼠模型中肝脏单核-巨噬细胞-树突状细胞（MMD）系统的细胞特征、分布和发育轨迹，并明确了与NASH小鼠和患者肝脏纤维化进展相关的MMD系统特征基因。 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了NASH小鼠模型中MMD系统的转录组图谱，并发现了与纤维化进展相关的特征基因Fmnl1和Myh9。 | NA | 探索NASH小鼠模型中肝脏MMD系统的细胞特征及其与纤维化进展的关系。 | NASH小鼠模型中的肝脏MMD系统及其特征基因。 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NASH和正常小鼠的肝脏组织样本 |
| 870 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis in two patients with rare systemic autoinflammatory diseases treated with anti-TNF therapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1091336
PMID:36911721
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了两名罕见系统性自身炎症疾病患者在接受抗TNF治疗前后的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了系统性自身炎症疾病患者在接受抗TNF治疗前后细胞转录组的变化，并探讨了治疗反应的潜在机制 | 研究样本仅限于两名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨系统性自身炎症疾病患者在接受抗TNF治疗前后的疾病机制和治疗反应 | 两名系统性自身炎症疾病患者的PBMCs和PMNs细胞 | 数字病理学 | 自身炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名患者 |
| 871 | 2024-08-08 |
Defining ovine dermal papilla cell markers and identifying key signaling pathways regulating its intrinsic properties
2023, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2023.1127501
PMID:36923053
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研究论文 | 本研究基于之前的单细胞转录组测序数据，验证了绵羊真皮乳头细胞（DPC）的新标记基因，并探讨了Wnt/β-catenin信号通路对其内在特性的调控机制 | 首次揭示了绵羊DPC的内在特性及其在连续培养中的调控机制 | NA | 研究绵羊DPC的标记基因及其内在特性的调控机制 | 绵羊的真皮乳头细胞 | NA | NA | 免疫荧光染色，碱性磷酸酶染色 | NA | 单细胞转录组测序数据 | 绵羊羔羊皮肤样本 |
| 872 | 2024-08-08 |
WT1+ glomerular parietal epithelial progenitors promote renal proximal tubule regeneration after severe acute kidney injury
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.79326
PMID:36923529
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研究论文 | 本研究探讨了WT1+肾小球壁上皮祖细胞在严重急性肾损伤后促进肾近端小管再生的作用 | 发现了一组WT1+肾小球壁上皮细胞在严重急性肾损伤后促进肾近端小管再生/修复的作用，并证明了WT1在肾小球壁上皮细胞和近端小管上皮细胞中的表达对肾近端小管再生至关重要 | NA | 阐明WT1+肾小球壁上皮细胞在急性肾损伤后肾近端小管再生中的作用 | WT1+肾小球壁上皮细胞及其在肾近端小管再生中的功能 | NA | 肾脏疾病 | 基因细胞系追踪和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用缺血-再灌注损伤小鼠模型进行研究 |
| 873 | 2024-08-08 |
Single-cell resolution reveals RalA GTPase expanding hematopoietic stem cells and facilitating of BCR-ABL1-driven leukemogenesis in a CRISPR/Cas9 gene editing mouse model
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.76993
PMID:36923939
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研究论文 | 本文通过CRISPR/Cas9基因编辑技术构建RalA敲入小鼠模型，研究RalA GTPase对造血干细胞和白血病干细胞自我更新及BCR-ABL1驱动的白血病发生的影响 | 首次揭示RalA GTPase在调控白血病干细胞和正常造血干细胞自我更新中的关键作用，并发现RalA通过与RAC1相互作用促进BCR-ABL诱导的白血病发生 | NA | 探究RalA GTPase在造血干细胞和白血病干细胞自我更新及BCR-ABL1驱动的白血病发生中的作用 | RalA GTPase、造血干细胞、白血病干细胞、BCR-ABL1驱动的白血病 | 数字病理学 | 慢性髓性白血病 | CRISPR/Cas9基因编辑、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 小鼠模型、患者来源的肿瘤异种移植模型 |
| 874 | 2024-08-08 |
Comprehensive genomics analysis of aging related gene signature to predict the prognosis and drug resistance of colon adenocarcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1121634
PMID:36925638
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研究论文 | 本研究旨在通过综合基因组分析，识别与衰老相关的基因特征，以预测结肠腺癌的预后和药物抗性 | 本研究首次基于衰老相关途径，开发了一种新的预后标志物，并验证了其在结肠腺癌中的预测性能 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模验证 | 识别基于衰老的亚型并构建预后标志物，以预测结肠腺癌患者的预后并指导免疫治疗或化疗决策 | 结肠腺癌患者及其基因表达、拷贝数变异和单核苷酸变异数据 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 无监督共识聚类分析、单变量Cox分析和LASSO | 基因表达数据、拷贝数变异数据和单核苷酸变异数据 | 13个样本 |
| 875 | 2024-08-08 |
Single-Cell and Transcriptome-Based Immune Cell-Related Prognostic Model in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023, Journal of oncology
DOI:10.1155/2023/5355269
PMID:36925653
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞数据库中与免疫细胞相关的差异标记基因，构建了针对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的预后风险模型，以辅助临床诊断和靶向治疗 | 本研究利用单细胞转录组数据和配体-受体关系对数据，构建了一个多层网络，并基于此网络筛选出与预后相关的基因，最终建立了一个预后风险评分模型 | NA | 构建一个基于单细胞和转录组数据的免疫细胞相关预后模型，以评估透明细胞肾细胞癌的预后 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 多层网络 | 单细胞数据 | 使用了来自TCGA和CPTAC的ccRCC表型和表达谱数据 |
| 876 | 2024-08-05 |
resVAE ensemble: Unsupervised identification of gene sets in multi-modal single-cell sequencing data using deep ensembles
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1091047
PMID:36875765
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研究论文 | 提出了一种使用深度集成的无监督基因集识别方法。 | 使用自编码器的集成和随后的排名聚合提取共识特征，从而减少偏倚。 | 缺乏样本量和具体应用案例的实例验证。 | 旨在改进单细胞测序数据分析中的功能标识。 | 不同模态的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 集成自编码器 | 测序数据 | 使用了不同模态的数据集，具体样本数量未说明 |
| 877 | 2024-08-05 |
The intestine: A highly dynamic microenvironment for IgA plasma cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1114348
PMID:36875083
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综述 | 本文章讨论了肠道上皮细胞与IgA浆细胞的空间相互作用及其对IgA浆细胞生成、归巢和寿命的潜在贡献 | 介绍了空间转录组学作为一种新技术，用于解决肠道IgA浆细胞生物学中的未解问题 | NA | 探讨肠道微环境对IgA浆细胞的影响及其生物学特性 | IgA浆细胞和肠道上皮细胞 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 878 | 2024-08-08 |
Destin2: Integrative and cross-modality analysis of single-cell chromatin accessibility data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1089936
PMID:36873935
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研究论文 | 提出了一种名为Destin2的新型统计和计算方法，用于单细胞ATAC-seq数据的跨模态降维、聚类和轨迹重建 | Destin2通过整合来自峰可及性、基序偏差分数和伪基因活性的细胞水平表观基因组数据，学习共享流形，并进行聚类和/或轨迹推断 | NA | 开发一种跨模态分析方法，用于单细胞染色质可及性数据的整合和分析 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 实际scATAC-seq数据集 |
| 879 | 2024-08-08 |
Precision immunointerception of EGFR-driven tumorigenesis for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1036563
PMID:36875137
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研究论文 | 本研究针对常见的EGFR突变，开发了一种多肽疫苗E Vax，并在小鼠模型中评估了其预防EGFR突变驱动的肺癌发生的效果 | 开发了一种针对EGFR L858R、T790M和Del19突变的多肽疫苗E Vax，并证明了其在小鼠模型中有效预防肺癌发生 | 研究结果主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 开发和评估针对EGFR突变的新型疫苗，以预防肺癌的发生 | EGFR突变驱动的肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了同基因和遗传工程改造的EGFR突变驱动的小鼠肺癌模型 |
| 880 | 2024-08-08 |
A novel autophagy-related long non-coding RNAs signature predicting progression-free interval and I-131 therapy benefits in papillary thyroid carcinoma
2023, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2023-0660
PMID:36880066
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研究论文 | 本研究旨在探讨自噬相关长非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的预后和预测价值 | 构建了一个新的六长非编码RNA签名，用于预测甲状腺乳头状癌患者的无进展间隔和I-131治疗效益 | NA | 探索自噬相关长非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的预后和预测价值 | 甲状腺乳头状癌患者的自噬相关基因和长非编码RNA表达数据 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 长非编码RNA分析 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA数据库的甲状腺乳头状癌患者数据 |