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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2024-08-08 |
Cell-type-specific densities in mouse somatosensory cortex derived from scRNA-seq and in situ RNA hybridization
2023, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2023.1118170
PMID:37007642
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和原位RNA杂交(ISH)图像,研究了小鼠体感皮层中细胞类型的特定密度分布 | 该方法无需选择特定细胞类型的基因子集,也不限于使用样本间变异性低的ISH图像,并补偿了细胞体大小和转录组不完全性的差异 | NA | 研究小鼠体感皮层中细胞类型的分布模式 | 小鼠体感皮层中的细胞类型分布 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),原位RNA杂交(ISH) | NA | 图像,转录组数据 | P56小鼠体感皮层样本 | NA | NA | NA | NA |
| 822 | 2024-08-08 |
Immune responses of different COVID-19 vaccination strategies by analyzing single-cell RNA sequencing data from multiple tissues using machine learning methods
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1157305
PMID:37007947
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研究论文 | 本研究通过分析来自多个组织的单细胞RNA测序数据,利用机器学习方法探讨不同COVID-19疫苗策略引发的免疫反应差异 | 本研究采用机器学习方法分析单细胞转录组数据,筛选出关键基因,并通过特征增量选择框架构建最优分类器,为疫苗策略提供量化规则 | NA | 揭示不同疫苗策略下SARS-CoV-2感染后仓鼠目标细胞的免疫基因表达水平差异 | 仓鼠的血液、肺和鼻黏膜中的不同细胞类型 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 决策树、随机森林 | RNA测序数据 | 包括未接种组、两剂腺病毒疫苗组、两剂减毒病毒疫苗组、两剂mRNA疫苗组和mRNA/减毒疫苗组共五个组 | NA | NA | NA | NA |
| 823 | 2024-08-08 |
EMP1 as a Potential Biomarker in Liver Fibrosis: A Bioinformatics Analysis
2023, Gastroenterology research and practice
IF:2.0Q3
DOI:10.1155/2023/2479192
PMID:37008256
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞转录组数据和微阵列数据集,分析了肝纤维化过程中细胞特异性表达的差异基因,特别是EMP1蛋白在不同类型肝纤维化中的表达模式 | 首次揭示EMP1在肝纤维化中的细胞特异性表达,并探讨其在肝损伤后的激活和增殖过程中的潜在作用 | NA | 探索肝纤维化过程中的细胞特异性标记基因 | 肝纤维化中的细胞特异性表达基因EMP1 | 生物信息学 | 肝病 | 单细胞转录组RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括人肝组织和经不同诱导处理的鼠肝组织 | NA | NA | NA | NA |
| 824 | 2024-08-08 |
Prognostic implication of heterogeneity and trajectory progression induced by enzalutamide in prostate cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1148898
PMID:37008945
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,构建了一个由10个基因组成的预测模型(ENZ-sig),用于预测前列腺癌患者在使用enzalutamide治疗后的无复发生存期 | 首次构建了enzalutamide诱导的基因特征(ENZ-sig),用于预测前列腺癌的进展和无复发生存期 | NA | 研究enzalutamide在前列腺癌中的预后意义及其诱导的异质性和轨迹进展 | 前列腺癌患者在使用enzalutamide治疗后的预后 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 三个enzalutamide刺激模型(0小时、48小时和168小时)以及六个独立数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 825 | 2024-08-08 |
Integrated proteome sequencing, bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers in different grades of intervertebral disc degeneration
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1136777
PMID:37009470
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研究论文 | 本研究通过综合分析蛋白质组测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,旨在识别不同等级椎间盘退变中的潜在生物标志物 | 本研究首次综合利用蛋白质组测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序技术,结合机器学习算法筛选关键基因,以识别椎间盘退变的潜在生物标志物 | 研究样本仅包括八个等级的椎间盘退变病例,可能影响结果的普遍性和广泛应用 | 识别不同等级椎间盘退变中的潜在生物标志物 | 椎间盘退变(IDD)的不同等级 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 蛋白质组测序(PRO-seq)、批量RNA测序(bRNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习(ML)算法 | 蛋白质、RNA | 八个等级的椎间盘退变病例 | NA | NA | NA | NA |
| 826 | 2024-08-08 |
Endothelin-1-Endothelin receptor B complex contributes to oligodendrocyte differentiation and myelin deficits during preterm white matter injury
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1163400
PMID:37009471
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研究论文 | 研究探讨了早产儿脑白质损伤中内皮素-1与内皮素受体B复合体对少突胶质细胞分化及髓鞘缺陷的影响 | 揭示了神经元与少突胶质前体细胞相互作用的新信号模块,为早产儿脑白质损伤的治疗提供了新视角 | NA | 改善移植的少突胶质前体细胞在脑白质损伤中的分化能力,以促进其临床应用 | 早产儿脑白质损伤中的少突胶质前体细胞分化及髓鞘形成 | NA | 早产儿脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 827 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals enriched memory T-cell subpopulations in hypertension
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1132040
PMID:37009484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了高血压患者循环记忆T细胞的亚群及其在血压升高中的作用 | 首次在高血压患者中通过单细胞RNA测序技术鉴定出四种记忆T细胞亚群,并发现CD8效应记忆T细胞在血压升高中的重要作用 | 研究仅限于高血压患者的循环记忆T细胞,未涉及其他类型的细胞或组织 | 探讨记忆T细胞在高血压患者中的维持和功能 | 高血压患者的循环记忆T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 高血压患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 828 | 2024-08-05 |
Tissue specific imprinting on innate lymphoid cells during homeostasis and disease process revealed by integrative inference of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1127413
PMID:36960063
|
研究论文 | 这篇文章揭示了固有淋巴细胞在不同组织中的转录特征和异质性 | 本研究首次系统性地探索了在稳态、炎症和肿瘤过程中固有淋巴细胞的组织特异性标记 | 具体的细胞机制和功能尚未在文章中深入探讨 | 研究固有淋巴细胞在不同组织中的表型和转录特征 | 六种不同组织中的人类固有淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌, 克罗恩病 | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | 从六种不同组织中收集的大量固有淋巴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 829 | 2024-08-05 |
Porcine anti-human lymphocyte immunoglobulin depletes the lymphocyte population to promote successful kidney transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1124790
PMID:36969156
|
研究论文 | 本研究探讨了猪抗人淋巴细胞免疫球蛋白在肾移植中的作用及其对淋巴细胞群体的影响 | 首次详细分析了pALG对外周血单核细胞的结合亲和力及其作用机制 | 样本量较小,仅包括12名肾移植受者 | 评估pALG在肾移植患者中对淋巴细胞群体的影响和免疫特征 | 肾移植受者及其对pALG的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 血液样本 | 12名肾移植受者 | NA | NA | NA | NA |
| 830 | 2024-08-05 |
Expression and prognostic value of PRDX family in colon adenocarcinoma by integrating comprehensive analysis and in vitro and in vivo validation
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1136738
PMID:36969053
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研究论文 | 通过综合分析和体外体内验证,探讨了PRDX家族在结肠腺癌中的表达和预后价值 | 首次提出PRDX4在结肠腺癌预后和分期中的重要性,成为潜在的预后标志物 | 研究聚焦于PRDX4,其他PRDX家族成员的作用尚未深入探讨 | 探讨PRDX家族在结肠腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 结肠腺癌患者的PRDX家族表达和相关临床数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多中心数据库分析,体外细胞实验,体内异种移植实验 | NA | 转录表达数据,临床预后数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 831 | 2024-08-05 |
RobustTree: An adaptive, robust PCA algorithm for embedded tree structure recovery from single-cell sequencing data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1110899
PMID:36968591
|
研究论文 | 该文章提出了一种名为RobustTree的算法,用于从单细胞测序数据恢复嵌入树结构 | RobustTree通过扩展鲁棒主成分分析(RPCA)处理树结构优化,并提出了一种自适应参数选择方案来解决树优化问题 | NA | 研究如何从嘈杂和异质的单细胞测序数据中恢复内在的拓扑结构 | 生物过程中的树结构,如细胞发育轨迹和肿瘤进化历史 | 数字病理学 | NA | 鲁棒主成分分析(RPCA) | NA | 高维数据 | 应用于多个合成和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 832 | 2024-08-05 |
TOX regulates T lymphocytes differentiation and its function in tumor
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.990419
PMID:36969216
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研究论文 | 本研究探讨了TOX在肿瘤中调节T淋巴细胞分化及其功能 | 揭示了TOX在不同T淋巴细胞发展阶段的异质性,并探讨了其对T淋巴细胞活化和衰竭的调节作用 | NA | 深入理解T淋巴细胞的发育阶段和功能特征 | T淋巴细胞及其发育阶段的异质性 | 数字病理学 | 肿瘤疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 833 | 2024-08-05 |
Cervical cancer immune infiltration microenvironment identification, construction of immune scores, assisting patient prognosis and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1135657
PMID:36969161
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研究论文 | 本研究系统评估了 cervical cancer 的免疫微环境,并建立了免疫细胞浸润评分系统和关键基因的识别 | 建立了免疫细胞浸润评分系统,筛选出三个关键基因与 cervical cancer 的免疫微环境相关联 | 研究对 cervical cancer 免疫浸润环境的系统性研究仍有不足 | 评估宫颈癌的肿瘤免疫微环境,并构建免疫细胞浸润评分系统 | 宫颈癌的免疫细胞群体和关键免疫相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 结合了 TCGA 和 GEO 数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 834 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of nicotinamide metabolism-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1145552
PMID:36969219
|
研究论文 | 该文章开发了一种与烟酰胺代谢相关的特征以预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗响应 | 开发了一种新的6基因烟酰胺代谢相关特征(NMRS),并证明其作为独立指标与乳腺癌预后显著相关 | 在样本外验证和临床应用中的局限性未被详细讨论 | 研究烟酰胺代谢如何影响乳腺癌患者的生存、肿瘤微环境和治疗效果 | 研究对象为乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 数据来自TCGA和ICGC等多个数据库,具体样本数量未详述 | NA | NA | NA | NA |
| 835 | 2024-08-05 |
Bulk and single-cell transcriptome analyses of islet tissue unravel gene signatures associated with pyroptosis and immune infiltration in type 2 diabetes
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1132194
PMID:36967805
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研究论文 | 本文探讨了与2型糖尿病中焦亡和免疫浸润相关的基因特征 | 首次揭示了焦亡相关基因与免疫细胞在2型糖尿病胰岛功能障碍中的作用 | 缺乏对焦亡与免疫细胞在2型糖尿病中作用的更广泛的临床验证 | 探索与2型糖尿病相关的焦亡和免疫浸润的关键基因和通路 | 研究对象为2型糖尿病患者的胰岛组织样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 1892个胰岛样本 | NA | NA | NA | NA |
| 836 | 2024-08-08 |
A novel myeloid cell marker genes related signature can indicate immune infiltration and predict prognosis of hepatocellular carcinoma: Integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1118377
PMID:36959981
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研究论文 | 通过整合分析大量和单细胞RNA测序数据,开发了一种与骨髓细胞标记基因相关的特征,用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫浸润水平 | 首次定义了317个与肝细胞癌相关的骨髓细胞标记基因,并构建了一个八基因特征,用于预测患者的生存风险和免疫浸润水平 | NA | 研究肿瘤相关骨髓细胞相关基因与肝细胞癌的关联 | 肝细胞癌患者的骨髓细胞标记基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO Cox方法 | RNA数据 | 使用了来自TCGA和ICGC数据集的肝细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 837 | 2024-08-08 |
The Identification of Immune-Related Biomarkers for Osteoarthritis Immunotherapy Based on Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2023/5574636
PMID:36960385
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,识别与骨关节炎免疫治疗相关的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析探索骨关节炎的免疫相关生物标志物,并发现VEGFA可能作为骨关节炎的新生物标志物 | 研究仅基于GEO数据库中的RNA测序数据,样本量和数据来源有限 | 探索骨关节炎的新生物标志物,为骨关节炎的诊断和治疗提供新方向 | 骨关节炎患者的滑膜组织 | 基因组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 838 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of cell heterogeneity in the sex difference in primary hyperparathyroidism
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1165890
PMID:36960393
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性甲状旁腺功能亢进症(PHPT)患者性别间甲状旁腺组织细胞的差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PHPT中性别差异与甲状旁腺细胞异质性的关系 | 未提及具体的研究局限性 | 探索男女PHPT患者甲状旁腺组织细胞的差异 | PHPT患者的甲状旁腺组织细胞 | 数字病理学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达谱 | 来自男女PHPT患者的甲状旁腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 839 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell transcriptome analysis reveals the metabolic changes and the prognostic value of malignant hepatocyte subpopulations and predict new therapeutic agents for hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1162375
PMID:36969048
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 840 | 2024-08-08 |
Differentiation-related genes in tumor-associated macrophages as potential prognostic biomarkers in non-small cell lung cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1123840
PMID:36969247
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研究论文 | 本研究评估了肿瘤相关巨噬细胞中的分化相关基因(DRGs)在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用 | 首次探讨了肿瘤相关巨噬细胞中分化相关基因作为非小细胞肺癌的潜在预后生物标志物 | NA | 评估分化相关基因在肿瘤相关巨噬细胞中的作用及其作为非小细胞肺癌预后生物标志物的潜力 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞中的分化相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 分析了来自TCGA、UCSC和GEO数据库的数据,涉及1,738个分化相关基因 | NA | NA | NA | NA |