单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2024-08-05 |
T-cell exhaustion signatures characterize the immune landscape and predict HCC prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1137025
PMID:37006257
|
研究论文 | 该研究探讨了T细胞耗竭指纹在肝细胞癌（HCC）免疫环境中的作用，并预测其预后 | 通过整合单细胞RNA测序和高通量RNA测序，开发了一个可靠的T细胞耗竭基础指纹，开辟了HCC患者预后和免疫治疗反应评估的新途径 | 本研究未提到关于实验结果的具体限制 | 研究T细胞耗竭在肝细胞癌中的潜在作用 | 肝细胞癌患者的T细胞耗竭基因及其与预后的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和高通量RNA测序 | LASSO-Cox分析 | RNA测序数据 | 涉及HCC患者的RNA-seq数据和10x单细胞RNA-seq数据，具体样本量未提供 |
| 802 | 2024-08-05 |
Geographically weighted linear combination test for gene-set analysis of a continuous spatial phenotype as applied to intratumor heterogeneity
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1065586
PMID:36998245
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新的计算平台GWLCT，用于基因集分析与空间数据建模的结合 | GWLCT的主要优势在于其分析超越了全局显著性，使基因集与表型之间的关联可以在肿瘤空间中变化 | 文章未提到特定的限制因素 | 研究目的是提供一种新的统计测试，分析基因集与空间表型的局部关联性 | 研究对象为从输入肿瘤样本收集的空间单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间基因表达技术（Visium） | 地理加权线性组合测试（GWLCT） | 空间单细胞RNA-seq数据 | 涉及144种不同的模拟场景和侵袭性乳腺癌组织样本 |
| 803 | 2024-08-08 |
EasyCellType: marker-based cell-type annotation by automatically querying multiple databases
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad029
PMID:36998720
|
研究论文 | 开发了一个名为EasyCellType的计算工具，通过自动查询多个数据库来基于标记进行细胞类型注释 | 提出了一个自动化的方法，结合统计测试来有效利用细胞标记数据库，并提供了一个用户友好的图形界面 | NA | 简化单细胞RNA测序数据中细胞标签注释的过程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 804 | 2024-08-08 |
Cellular complexity of the peripheral nervous system: Insights from single-cell resolution
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1098612
PMID:36998728
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，深入研究了周围神经系统（PNS）的细胞复杂性，并描述了细胞异质性在发育和再生过程中的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了PNS中的多种细胞类型，并进一步识别了神经元和胶质细胞的亚型 | NA | 深入理解周围神经系统的细胞复杂性，并为未来的遗传操作提供细胞基础 | 周围神经系统中的细胞类型及其在不同生理和病理状态下的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 805 | 2024-08-08 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data reveals the relationship between intratumor microbiome signature and host metabolic heterogeneity in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140995
PMID:36999009
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研究论文 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了肿瘤内微生物组特征与宿主代谢异质性在乳腺癌中的关系 | 首次探讨了肿瘤内微生物组与乳腺癌代谢活动之间的关联，并识别了与特定微生物相关的细胞亚群 | 研究依赖于公共数据集，可能存在数据质量和样本选择偏倚的问题 | 探索肿瘤内微生物组与乳腺癌患者代谢状态之间的关系 | 乳腺癌患者的肿瘤内微生物组和宿主代谢状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1085名乳腺癌患者和32个单细胞RNA测序样本 |
| 806 | 2024-08-08 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosomes promote murine skin wound healing by neutrophil and macrophage modulations revealed by single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1142088
PMID:36999022
|
研究论文 | 本研究探讨了人脐带间充质干细胞衍生的外泌体（hucMSC-Exosomes）对小鼠皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞单细胞转录组的影响 | 本研究首次揭示了hucMSC-Exosomes在皮肤伤口愈合中对中性粒细胞和巨噬细胞的转录组异质性的影响 | NA | 研究hucMSC-Exosomes对皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞的单细胞转录组的影响 | 人脐带间充质干细胞衍生的外泌体（hucMSC-Exosomes）对小鼠皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 中性粒细胞和巨噬细胞的转录组数据 |
| 807 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosomes promote murine skin wound healing by neutrophil and macrophage modulations revealed by single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181215
PMID:37000180
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 808 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis identifies PD-L2 as a tumor promotor in the tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1093716
PMID:37006239
|
研究论文 | 本文通过分析PD-L2在肿瘤微环境中的表达及其对肿瘤发展的影响，探讨了PD-L2作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次全面分析PD-L2在多种癌症类型中的表达及其对肿瘤微环境的影响，并验证了PD-L2在肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其功能 | NA | 探讨PD-L2在肿瘤微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | PD-L2在多种癌症类型中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | NA | TCGA, ICGC, HPA数据库分析, Kaplan-Meier和Cox回归分析, GSEA, Spearman相关分析, PPI网络, ESTIMATE算法, TIMER 2.0, scRNA-seq, 多重免疫荧光染色, 流式细胞术, 荧光激活细胞分选, qRT-PCR, 跨孔和集落形成实验, TIDE和TISMO分析, GSCA平台 | NA | mRNA, 蛋白质, 免疫细胞, 肿瘤细胞 | 多种人类癌症类型样本, 人结肠癌样本, 免疫活性同基因小鼠 |
| 809 | 2024-08-08 |
Integrative analysis revealed that distinct cuprotosis patterns reshaped tumor microenvironment and responses to immunotherapy of colorectal cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1165101
PMID:37006250
|
研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了不同的铜死亡模式如何重塑结直肠癌的肿瘤微环境及对免疫治疗的反应 | 首次探讨了铜死亡在结直肠癌中对肿瘤微环境和免疫调节的作用 | NA | 研究铜死亡模式对结直肠癌肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 结直肠癌患者的铜死亡模式及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 共识聚类分析，主成分分析，单细胞转录组数据分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 810 | 2024-08-08 |
Case report: Long-term voluntary Tyrosine Kinase Inhibitor (TKI) discontinuation in chronic myeloid leukemia (CML): Molecular evidence of an immune surveillance
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1117781
PMID:37007090
|
病例报告 | 报道了一例慢性髓性白血病患者在长期自愿中断酪氨酸激酶抑制剂治疗后，通过分子证据显示免疫监视现象的案例 | 通过单细胞转录组RNA-seq分析揭示了与NK-T细胞活化及抑制相关的分子网络，并识别出表达NKG7、granzyme H、cathepsin-W和granulysin的单细胞 | 研究仅基于单个病例，需要进一步研究评估NKG7表达在治疗自由缓解发生中的作用 | 探讨慢性髓性白血病患者在长期中断酪氨酸激酶抑制剂治疗后的分子和免疫学机制 | 慢性髓性白血病患者及其免疫细胞在治疗中断后的分子变化 | NA | 慢性髓性白血病 | 单细胞转录组RNA-seq | NA | 转录组数据 | 单个病例 |
| 811 | 2024-08-08 |
Cell-type-specific densities in mouse somatosensory cortex derived from scRNA-seq and in situ RNA hybridization
2023, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2023.1118170
PMID:37007642
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和原位RNA杂交（ISH）图像，研究了小鼠体感皮层中细胞类型的特定密度分布 | 该方法无需选择特定细胞类型的基因子集，也不限于使用样本间变异性低的ISH图像，并补偿了细胞体大小和转录组不完全性的差异 | NA | 研究小鼠体感皮层中细胞类型的分布模式 | 小鼠体感皮层中的细胞类型分布 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），原位RNA杂交（ISH） | NA | 图像，转录组数据 | P56小鼠体感皮层样本 |
| 812 | 2024-08-08 |
Immune responses of different COVID-19 vaccination strategies by analyzing single-cell RNA sequencing data from multiple tissues using machine learning methods
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1157305
PMID:37007947
|
研究论文 | 本研究通过分析来自多个组织的单细胞RNA测序数据，利用机器学习方法探讨不同COVID-19疫苗策略引发的免疫反应差异 | 本研究采用机器学习方法分析单细胞转录组数据，筛选出关键基因，并通过特征增量选择框架构建最优分类器，为疫苗策略提供量化规则 | NA | 揭示不同疫苗策略下SARS-CoV-2感染后仓鼠目标细胞的免疫基因表达水平差异 | 仓鼠的血液、肺和鼻黏膜中的不同细胞类型 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 决策树、随机森林 | RNA测序数据 | 包括未接种组、两剂腺病毒疫苗组、两剂减毒病毒疫苗组、两剂mRNA疫苗组和mRNA/减毒疫苗组共五个组 |
| 813 | 2024-08-08 |
EMP1 as a Potential Biomarker in Liver Fibrosis: A Bioinformatics Analysis
2023, Gastroenterology research and practice
IF:2.0Q3
DOI:10.1155/2023/2479192
PMID:37008256
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞转录组数据和微阵列数据集，分析了肝纤维化过程中细胞特异性表达的差异基因，特别是EMP1蛋白在不同类型肝纤维化中的表达模式 | 首次揭示EMP1在肝纤维化中的细胞特异性表达，并探讨其在肝损伤后的激活和增殖过程中的潜在作用 | NA | 探索肝纤维化过程中的细胞特异性标记基因 | 肝纤维化中的细胞特异性表达基因EMP1 | 生物信息学 | 肝病 | 单细胞转录组RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括人肝组织和经不同诱导处理的鼠肝组织 |
| 814 | 2024-08-08 |
Prognostic implication of heterogeneity and trajectory progression induced by enzalutamide in prostate cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1148898
PMID:37008945
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，构建了一个由10个基因组成的预测模型（ENZ-sig），用于预测前列腺癌患者在使用enzalutamide治疗后的无复发生存期 | 首次构建了enzalutamide诱导的基因特征（ENZ-sig），用于预测前列腺癌的进展和无复发生存期 | NA | 研究enzalutamide在前列腺癌中的预后意义及其诱导的异质性和轨迹进展 | 前列腺癌患者在使用enzalutamide治疗后的预后 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 三个enzalutamide刺激模型（0小时、48小时和168小时）以及六个独立数据集 |
| 815 | 2024-08-08 |
Integrated proteome sequencing, bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers in different grades of intervertebral disc degeneration
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1136777
PMID:37009470
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研究论文 | 本研究通过综合分析蛋白质组测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，旨在识别不同等级椎间盘退变中的潜在生物标志物 | 本研究首次综合利用蛋白质组测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，结合机器学习算法筛选关键基因，以识别椎间盘退变的潜在生物标志物 | 研究样本仅包括八个等级的椎间盘退变病例，可能影响结果的普遍性和广泛应用 | 识别不同等级椎间盘退变中的潜在生物标志物 | 椎间盘退变（IDD）的不同等级 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 蛋白质组测序（PRO-seq）、批量RNA测序（bRNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习（ML）算法 | 蛋白质、RNA | 八个等级的椎间盘退变病例 |
| 816 | 2024-08-08 |
Endothelin-1-Endothelin receptor B complex contributes to oligodendrocyte differentiation and myelin deficits during preterm white matter injury
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1163400
PMID:37009471
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研究论文 | 研究探讨了早产儿脑白质损伤中内皮素-1与内皮素受体B复合体对少突胶质细胞分化及髓鞘缺陷的影响 | 揭示了神经元与少突胶质前体细胞相互作用的新信号模块，为早产儿脑白质损伤的治疗提供了新视角 | NA | 改善移植的少突胶质前体细胞在脑白质损伤中的分化能力，以促进其临床应用 | 早产儿脑白质损伤中的少突胶质前体细胞分化及髓鞘形成 | NA | 早产儿脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 817 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals enriched memory T-cell subpopulations in hypertension
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1132040
PMID:37009484
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了高血压患者循环记忆T细胞的亚群及其在血压升高中的作用 | 首次在高血压患者中通过单细胞RNA测序技术鉴定出四种记忆T细胞亚群，并发现CD8效应记忆T细胞在血压升高中的重要作用 | 研究仅限于高血压患者的循环记忆T细胞，未涉及其他类型的细胞或组织 | 探讨记忆T细胞在高血压患者中的维持和功能 | 高血压患者的循环记忆T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 高血压患者的血液样本 |
| 818 | 2024-08-05 |
Tissue specific imprinting on innate lymphoid cells during homeostasis and disease process revealed by integrative inference of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1127413
PMID:36960063
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研究论文 | 这篇文章揭示了固有淋巴细胞在不同组织中的转录特征和异质性 | 本研究首次系统性地探索了在稳态、炎症和肿瘤过程中固有淋巴细胞的组织特异性标记 | 具体的细胞机制和功能尚未在文章中深入探讨 | 研究固有淋巴细胞在不同组织中的表型和转录特征 | 六种不同组织中的人类固有淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌, 克罗恩病 | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | 从六种不同组织中收集的大量固有淋巴细胞 |
| 819 | 2024-08-05 |
Porcine anti-human lymphocyte immunoglobulin depletes the lymphocyte population to promote successful kidney transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1124790
PMID:36969156
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研究论文 | 本研究探讨了猪抗人淋巴细胞免疫球蛋白在肾移植中的作用及其对淋巴细胞群体的影响 | 首次详细分析了pALG对外周血单核细胞的结合亲和力及其作用机制 | 样本量较小，仅包括12名肾移植受者 | 评估pALG在肾移植患者中对淋巴细胞群体的影响和免疫特征 | 肾移植受者及其对pALG的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 血液样本 | 12名肾移植受者 |
| 820 | 2024-08-05 |
Expression and prognostic value of PRDX family in colon adenocarcinoma by integrating comprehensive analysis and in vitro and in vivo validation
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1136738
PMID:36969053
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研究论文 | 通过综合分析和体外体内验证，探讨了PRDX家族在结肠腺癌中的表达和预后价值 | 首次提出PRDX4在结肠腺癌预后和分期中的重要性，成为潜在的预后标志物 | 研究聚焦于PRDX4，其他PRDX家族成员的作用尚未深入探讨 | 探讨PRDX家族在结肠腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 结肠腺癌患者的PRDX家族表达和相关临床数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多中心数据库分析，体外细胞实验，体内异种移植实验 | NA | 转录表达数据，临床预后数据 | NA |