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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2024-08-08 |
A novel 7-chemokine-genes predictive signature for prognosis and therapeutic response in renal clear cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1120562
PMID:37021054
|
研究论文 | 本研究旨在建立一个针对肾透明细胞癌(ccRCC)的7种趋化因子基因预测签名,以评估患者的预后和治疗反应 | 本研究首次构建了基于7种趋化因子基因的预测签名,并验证了其在ccRCC中的预后价值和治疗反应预测能力 | 需要进一步的临床试验来验证该预测签名在实际治疗中的应用效果 | 建立一个趋化因子基因签名,用于评估肾透明细胞癌的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO算法 | mRNA测序数据 | 526名肾透明细胞癌患者(263名训练组样本和263名验证组样本) | NA | NA | NA | NA |
| 802 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and stem cells of vascular endothelial cells in blood vessel formation and homeostasis: Insights from single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1146399
PMID:37025170
|
研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞与血管生成及稳态关系研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术发现了新的动脉、静脉和毛细血管内皮细胞的分子特征,以及先前未被识别的特殊内皮细胞亚型 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞研究中的应用前景 | 血管内皮细胞的异质性和内皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种小鼠组织和人体器官 | NA | NA | NA | NA |
| 803 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell analysis and machine learning to create glycosylation-based gene signature for prognostic prediction of uveal melanoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1163046
PMID:37033251
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习技术,创建了基于糖基化的基因特征,用于预测葡萄膜黑色素瘤的预后 | 首次利用糖基化相关基因特征作为独立预测因子,为葡萄膜黑色素瘤的临床诊断和治疗提供了新视角 | NA | 揭示糖基化相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后中的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 804 | 2024-08-08 |
Single-cell protein activity analysis reveals a novel subpopulation of chondrocytes and the corresponding key master regulator proteins associated with anti-senescence and OA progression
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1077003
PMID:37033917
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和metaVIPER算法,揭示了与抗衰老和骨关节炎进展相关的新型软骨细胞亚群及其关键主调控蛋白 | 首次通过单细胞蛋白活性分析,识别出与骨关节炎进展和细胞抗衰老相关的新型软骨细胞亚群及其关键调控蛋白 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据,可能存在基因丢失问题 | 深入了解软骨细胞的分子特征,并为骨关节炎的有效干预策略提供理论基础 | 软骨细胞及其在骨关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 62,449个来自健康个体和骨关节炎患者的软骨细胞,以及24,675个人类软骨细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 805 | 2024-08-08 |
Imputation of single-cell transcriptome data enables the reconstruction of networks predictive of breast cancer metastasis
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.036
PMID:37035549
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据插补技术,重建了预测乳腺癌转移的细胞类型特异性基因网络 | 首次展示了通过插补单细胞RNA测序数据,有效重建细胞类型特异性基因网络,并识别出乳腺癌转移的关键基因 | NA | 探索单细胞转录组数据在重建细胞类型特异性基因网络中的应用,并识别乳腺癌转移的关键基因 | 七种原发性和九种转移性乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 七种原发性和九种转移性乳腺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 806 | 2024-08-08 |
Comparison of cell subsets in chronic obstructive pulmonary disease and controls based on single-cell transcriptome sequencing
2023, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine
IF:1.4Q3
DOI:10.3233/THC-236002
PMID:37038777
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术比较了慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者与对照组的细胞亚群差异 | 利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)研究COPD患者与对照组的细胞亚群分类,并探讨长链非编码RNA(lncRNA)在单细胞水平的表达 | NA | 旨在进一步理解COPD患者适应性免疫细胞反应的机制 | COPD患者与对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载的COPD患者外周血单个核细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 807 | 2024-08-08 |
Age- and Microbiota-Dependent Cell Stemness Plasticity Revealed by Cattle Cell Landscape
2023, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0025
PMID:37040481
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了新生和成年牛的多个器官的细胞图谱,揭示了年龄和微生物群依赖的细胞干细胞可塑性。 | 本文首次揭示了新生反刍动物前胃上皮细胞的转录不一致性和随机性,并发现了一种新生牛特有的新型细胞类型。 | NA | 研究新生和成年反刍动物细胞差异,以改善家养反刍动物的健康和性能。 | 新生和成年牛的多个器官,包括瘤胃、网胃、重瓣胃、皱胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠、直肠、肝脏、唾液腺和乳腺。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 235,941个高质量单细胞,涵盖78种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 808 | 2024-08-05 |
Lack of association between leptin concentrations and cystic fibrosis: A meta-analysis and regression
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1126129
PMID:36992806
|
meta-analysis | 本综述旨在评估囊性纤维化患者与非囊性纤维化对照组之间的瘦素状态的定量差异 | 研究表明囊性纤维化患者与健康个体在瘦素水平上没有显著差异,揭示了瘦素在囊性纤维化病理生理学中的作用的局限性 | 本研究未能确定瘦素与第一秒用力呼气容量(FEV1)之间的关联,且在不同细胞中肺泡灌洗液中瘦素及瘦素受体的表达水平较低 | 评估囊性纤维化与瘦素浓度之间的关联 | 共纳入919名囊性纤维化患者和397名对照组,以分析瘦素水平 | NA | 囊性纤维化 | 系统评价 | 固定效应或随机效应模型 | NA | 919名囊性纤维化患者和397名对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 809 | 2024-08-05 |
Prognostic signatures of sphingolipids: Understanding the immune landscape and predictive role in immunotherapy response and outcomes of hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1153423
PMID:37006285
|
研究论文 | 本研究旨在识别影响肝细胞癌预后的关键鞘脂基因,并建立可靠的预后模型 | 提出了一个六基因特征和一个诺莫图,提供了鞘脂相关基因与免疫微环境之间的联系,揭示了新的免疫治疗策略 | 研究主要依赖于数据集,不同数据源之间的整合可能导致偏差 | 识别肝细胞癌中的关键鞘脂基因并开发预后模型 | 肝细胞癌患者的鞘脂基因及其在肿瘤微环境中的影响 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | LASSO-Cox分析、单细胞测序、机器学习 | 诺莫图 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 810 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Mononuclear Cell Populations in Skeletal Muscle
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3036-5_26
PMID:36995608
|
研究论文 | 本文探讨了骨骼肌中单核细胞群体的转录组分析 | 使用了基于液滴的单细胞RNA测序技术以揭示肌肉内细胞类型的身份 | 没有具体提到研究的局限性 | 研究骨骼肌组织的细胞组成及各细胞群体之间的异质性 | 骨骼肌中的单核细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 811 | 2024-08-05 |
Integrated analysis to identify the prognostic and immunotherapeutic roles of coagulation-associated gene signature in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1107419
PMID:37006234
|
研究论文 | 本研究分析了凝血相关基因在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 首次系统分析了凝血相关基因在透明细胞肾细胞癌患者诊断、预后和个性化治疗中的重要性 | 在研究领域缺乏足够的相关研究 | 研究凝血系统异常与透明细胞肾细胞癌进展之间的关系 | 透明细胞肾细胞癌患者的凝血相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | Cox模型 | 临床样本数据 | 涉及高阶段或等级的透明细胞肾细胞癌患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 812 | 2024-08-05 |
T-cell exhaustion signatures characterize the immune landscape and predict HCC prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1137025
PMID:37006257
|
研究论文 | 该研究探讨了T细胞耗竭指纹在肝细胞癌(HCC)免疫环境中的作用,并预测其预后 | 通过整合单细胞RNA测序和高通量RNA测序,开发了一个可靠的T细胞耗竭基础指纹,开辟了HCC患者预后和免疫治疗反应评估的新途径 | 本研究未提到关于实验结果的具体限制 | 研究T细胞耗竭在肝细胞癌中的潜在作用 | 肝细胞癌患者的T细胞耗竭基因及其与预后的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和高通量RNA测序 | LASSO-Cox分析 | RNA测序数据 | 涉及HCC患者的RNA-seq数据和10x单细胞RNA-seq数据,具体样本量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 813 | 2024-08-05 |
Geographically weighted linear combination test for gene-set analysis of a continuous spatial phenotype as applied to intratumor heterogeneity
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1065586
PMID:36998245
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新的计算平台GWLCT,用于基因集分析与空间数据建模的结合 | GWLCT的主要优势在于其分析超越了全局显著性,使基因集与表型之间的关联可以在肿瘤空间中变化 | 文章未提到特定的限制因素 | 研究目的是提供一种新的统计测试,分析基因集与空间表型的局部关联性 | 研究对象为从输入肿瘤样本收集的空间单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间基因表达技术(Visium) | 地理加权线性组合测试(GWLCT) | 空间单细胞RNA-seq数据 | 涉及144种不同的模拟场景和侵袭性乳腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 814 | 2024-08-08 |
Cellular complexity of the peripheral nervous system: Insights from single-cell resolution
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1098612
PMID:36998728
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,深入研究了周围神经系统(PNS)的细胞复杂性,并描述了细胞异质性在发育和再生过程中的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了PNS中的多种细胞类型,并进一步识别了神经元和胶质细胞的亚型 | NA | 深入理解周围神经系统的细胞复杂性,并为未来的遗传操作提供细胞基础 | 周围神经系统中的细胞类型及其在不同生理和病理状态下的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 815 | 2024-08-08 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data reveals the relationship between intratumor microbiome signature and host metabolic heterogeneity in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140995
PMID:36999009
|
研究论文 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序数据,揭示了肿瘤内微生物组特征与宿主代谢异质性在乳腺癌中的关系 | 首次探讨了肿瘤内微生物组与乳腺癌代谢活动之间的关联,并识别了与特定微生物相关的细胞亚群 | 研究依赖于公共数据集,可能存在数据质量和样本选择偏倚的问题 | 探索肿瘤内微生物组与乳腺癌患者代谢状态之间的关系 | 乳腺癌患者的肿瘤内微生物组和宿主代谢状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1085名乳腺癌患者和32个单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 816 | 2024-08-08 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosomes promote murine skin wound healing by neutrophil and macrophage modulations revealed by single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1142088
PMID:36999022
|
研究论文 | 本研究探讨了人脐带间充质干细胞衍生的外泌体(hucMSC-Exosomes)对小鼠皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞单细胞转录组的影响 | 本研究首次揭示了hucMSC-Exosomes在皮肤伤口愈合中对中性粒细胞和巨噬细胞的转录组异质性的影响 | NA | 研究hucMSC-Exosomes对皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞的单细胞转录组的影响 | 人脐带间充质干细胞衍生的外泌体(hucMSC-Exosomes)对小鼠皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 中性粒细胞和巨噬细胞的转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 817 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosomes promote murine skin wound healing by neutrophil and macrophage modulations revealed by single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181215
PMID:37000180
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 818 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis identifies PD-L2 as a tumor promotor in the tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1093716
PMID:37006239
|
研究论文 | 本文通过分析PD-L2在肿瘤微环境中的表达及其对肿瘤发展的影响,探讨了PD-L2作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次全面分析PD-L2在多种癌症类型中的表达及其对肿瘤微环境的影响,并验证了PD-L2在肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其功能 | NA | 探讨PD-L2在肿瘤微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | PD-L2在多种癌症类型中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | NA | TCGA, ICGC, HPA数据库分析, Kaplan-Meier和Cox回归分析, GSEA, Spearman相关分析, PPI网络, ESTIMATE算法, TIMER 2.0, scRNA-seq, 多重免疫荧光染色, 流式细胞术, 荧光激活细胞分选, qRT-PCR, 跨孔和集落形成实验, TIDE和TISMO分析, GSCA平台 | NA | mRNA, 蛋白质, 免疫细胞, 肿瘤细胞 | 多种人类癌症类型样本, 人结肠癌样本, 免疫活性同基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 819 | 2024-08-08 |
Integrative analysis revealed that distinct cuprotosis patterns reshaped tumor microenvironment and responses to immunotherapy of colorectal cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1165101
PMID:37006250
|
研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了不同的铜死亡模式如何重塑结直肠癌的肿瘤微环境及对免疫治疗的反应 | 首次探讨了铜死亡在结直肠癌中对肿瘤微环境和免疫调节的作用 | NA | 研究铜死亡模式对结直肠癌肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 结直肠癌患者的铜死亡模式及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 共识聚类分析,主成分分析,单细胞转录组数据分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 820 | 2024-08-08 |
Case report: Long-term voluntary Tyrosine Kinase Inhibitor (TKI) discontinuation in chronic myeloid leukemia (CML): Molecular evidence of an immune surveillance
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1117781
PMID:37007090
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病例报告 | 报道了一例慢性髓性白血病患者在长期自愿中断酪氨酸激酶抑制剂治疗后,通过分子证据显示免疫监视现象的案例 | 通过单细胞转录组RNA-seq分析揭示了与NK-T细胞活化及抑制相关的分子网络,并识别出表达NKG7、granzyme H、cathepsin-W和granulysin的单细胞 | 研究仅基于单个病例,需要进一步研究评估NKG7表达在治疗自由缓解发生中的作用 | 探讨慢性髓性白血病患者在长期中断酪氨酸激酶抑制剂治疗后的分子和免疫学机制 | 慢性髓性白血病患者及其免疫细胞在治疗中断后的分子变化 | NA | 慢性髓性白血病 | 单细胞转录组RNA-seq | NA | 转录组数据 | 单个病例 | NA | NA | NA | NA |