单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2024-08-08 |
CD226 identifies functional CD8+T cells in the tumor microenvironment and predicts a better outcome for human gastric cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1150803
PMID:37056782
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研究论文 | 本文研究了CD226在人胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用及其对患者预后的影响 | 首次揭示了CD226在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用，并证明了CD226CD8T细胞在胃癌患者中的预后价值 | NA | 探讨CD226在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用及其对患者预后的影响 | 人胃癌肿瘤微环境中的CD8+T细胞和CD226表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 转座酶可及染色质测序（ATAC-seq），多色免疫组织化学染色（mIHC），单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 胃癌患者的癌症组织样本 |
| 782 | 2024-08-08 |
Multi-omics integrative analysis reveals the role of tumor necrosis factor superfamily member 4 in keloidal scarring
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37056826
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，揭示了肿瘤坏死因子超家族成员4（TNFSF4）在瘢痕疙瘩中的上调表达及其生物学意义 | 首次在多组学水平上揭示了TNFSF4在瘢痕疙瘩中的上调表达及其对细胞间对话和间质成纤维细胞转录组的影响 | NA | 旨在识别瘢痕疙瘩中异常表达的免疫分子并探索其可能的生物学意义 | 瘢痕疙瘩中的免疫分子表达及TNFSF4的作用 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 免疫基因测序、微阵列数据集、高通量测序数据集、甲基化微阵列数据集、实时定量PCR分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 783 | 2024-08-08 |
M1 Microglia-derived Exosomes Promote Activation of Resting Microglia and Amplifies Proangiogenic Effects through Irf1/miR-155-5p/Socs1 Axis in the Retina
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.79784
PMID:37063422
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据集，揭示了M1小胶质细胞通过外泌体促进M0小胶质细胞活化并增强其促血管生成能力的作用机制 | 本研究首次阐明了M1小胶质细胞通过外泌体传递miR-155-5p信号，抑制Socs1并激活NFκB途径，从而放大促血管生成效应的分子机制 | NA | 揭示小胶质细胞在视网膜新生血管疾病中的病理生理和分子机制，为临床视网膜新生血管的治疗提供新的靶向策略 | 小胶质细胞及其在视网膜血管生成中的作用 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 784 | 2024-08-08 |
SIRT1 promotes glucolipid metabolic conversion to facilitate tumor development in colorectal carcinoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.76704
PMID:37063423
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研究论文 | 本文研究了SIRT1在结直肠癌中促进糖脂代谢转换以促进肿瘤发展的机制 | 首次揭示了SIRT1在结直肠癌细胞中作为糖脂代谢转换的关键调节因子，并证明了其在肿瘤进展中的重要作用 | NA | 探究结直肠癌细胞中糖脂代谢转换的机制及其在肿瘤发展中的作用 | 结直肠癌细胞、裸鼠异种移植模型和临床结直肠癌样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、RNA测序（RNA-Seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq）、Seahorse代谢分析、免疫印迹、免疫荧光和免疫组织化学（IHC） | NA | RNA | 包括癌症细胞系、裸鼠异种移植模型和临床结直肠癌样本 |
| 785 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA and transcriptome sequencing profiles identify immune-associated key genes in the development of diabetic kidney disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1030198
PMID:37063851
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组测序，识别与糖尿病肾病（DKD）发展相关的免疫相关关键基因。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和转录组测序技术，识别出与DKD发展密切相关的关键基因，并揭示了免疫细胞在DKD中的新发病机制。 | 本研究主要基于公共数据集进行分析，未来需要更多的临床样本验证这些发现。 | 发现用于预测糖尿病肾病发展的非侵入性和敏感的免疫相关生物标志物。 | 糖尿病肾病（DKD）及其相关的免疫细胞和关键基因。 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq），转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 35名DKD患者和35名健康对照 |
| 786 | 2024-08-08 |
Etiology of end-stage liver cirrhosis impacts hepatic natural killer cell heterogenicity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1137034
PMID:37063898
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了不同病因导致肝硬化的终末期肝脏中自然杀伤细胞的异质性 | 首次揭示了疾病病因对肝硬化期间自然杀伤细胞行为的影响 | NA | 探讨疾病病因对肝硬化期间自然杀伤细胞异质性的影响 | 肝硬化终末期肝脏中的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自非酒精性脂肪性肝炎、慢性丙型肝炎感染和原发性硬化性胆管炎患者的肝硬化终末期肝脏样本 |
| 787 | 2024-08-08 |
PIK3C2A is a prognostic biomarker that is linked to immune infiltrates in kidney renal clear cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1114572
PMID:37063922
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研究论文 | 本文研究了PIK3C2A在肾透明细胞癌中的表达模式及其作为预后生物标志物的意义，并探讨了其与肿瘤免疫浸润的关系 | 首次揭示了PIK3C2A在肾透明细胞癌中的预后价值及其与免疫细胞浸润水平的关联 | NA | 探讨PIK3C2A在肾透明细胞癌中的预后作用及其与肿瘤免疫的关系 | PIK3C2A在肾透明细胞癌中的表达及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq, Western blot | NA | 基因表达数据 | 多个数据集和TCGA数据库中的样本 |
| 788 | 2024-08-08 |
Prognostic value of autophagy-related genes based on single-cell RNA-sequencing in colorectal cancer
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1109683
PMID:37065476
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据评估自噬相关基因在结直肠癌中的预后价值和潜在功能 | 开发了一种基于11个关键自噬相关基因的风险模型，这些基因可能作为结直肠癌的潜在治疗靶点 | NA | 评估自噬相关基因在结直肠癌中的预后价值 | 结直肠癌患者的自噬相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16,270个细胞 |
| 789 | 2024-08-08 |
PDGF-D-induced immunoproteasome activation and cell-cell interactions
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.047
PMID:37066124
|
研究论文 | 本研究探讨了血小板源性生长因子-D（PDGF-D）在视网膜色素上皮（RPE）细胞中过表达对免疫蛋白酶体活性和细胞间相互作用的影响 | 首次揭示了PDGF-D过表达显著上调关键免疫蛋白酶体基因，增加RPE细胞的抗原处理/呈递能力，并发现PDGF-D过表达的RPE-脉络膜组织中配体-受体对数量显著增加，表明细胞间相互作用增强 | NA | 研究PDGF-D在眼部疾病中的作用及其对眼部细胞和细胞间相互作用的影响 | 视网膜色素上皮细胞和PDGF-D过表达的RPE-脉络膜组织 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用PDGF-D过表达的RPE细胞的小鼠模型 |
| 790 | 2024-08-05 |
Single-cell mapping of N6-methyladenosine in esophageal squamous cell carcinoma and exploration of the risk model for immune infiltration
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1155009
PMID:37025404
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（m6A）在食道鳞状细胞癌中的分布及其对免疫浸润的风险模型的构建 | 首次在食道鳞状细胞癌中进行单细胞m6A映射，构建了与免疫浸润相关的风险模型 | 缺乏对m6A具体机制的深入探讨 | 研究m6A在食道癌发展中的作用及其机制 | 174名食道鳞状癌患者的RNA-seq和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 食道癌 | RNA-seq | NA | 基因序列数据 | 174个食道鳞状癌患者的样本以及4个单细胞样本 |
| 791 | 2024-08-05 |
Disease modeling of ADAMTS9-related nephropathy using kidney organoids reveals its roles in tubular cells and podocytes
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1089159
PMID:37035301
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研究论文 | 本研究揭示了ADAMTS9在肾小管细胞和足细胞中的功能角色。 | 识别到新的复合杂合ADAMTS9变异，探讨其在肾脏疾病中的作用。 | 本研究主要集中在ADAMTS9的功能，未探讨其他相关基因的影响。 | 研究ADAMTS9缺失与肾小管病及肾小球病之间的关系。 | 研究两名患有肾小管病的NPHP-RC兄妹的ADAMTS9突变。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 肾脏类器官 | 基因表达 | 2名兄妹 |
| 792 | 2024-08-05 |
Identification of an immune subtype-related prognostic signature of clear cell renal cell carcinoma based on single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1067987
PMID:37035172
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研究论文 | 本研究构建了一个与免疫亚型相关的预后模型，以预测透明细胞肾细胞癌患者的预后 | 首次基于单细胞测序分析定义了ccRCC的免疫亚型相关基因，并构建了一个包含五个基因的预后模型 | 该研究可能缺乏多中心大样本验证以确保模型的普适性 | 旨在预测透明细胞肾细胞癌患者的预后并为治疗策略提供指导 | 聚焦于透明细胞肾细胞癌患者及其免疫亚型特征 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 包含TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 |
| 793 | 2024-08-05 |
Mitochondria-associated gene expression perturbation predicts clinical outcomes and shows potential for targeted therapy in neuroblastoma
2023, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2023.1094926
PMID:37025299
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研究论文 | 本文探讨了与线粒体相关的基因表达扰动如何预测神经母细胞瘤的临床结果，并展示其作为靶向治疗的潜力 | 提出了线粒体相关蛋白（MAPs）在神经母细胞瘤中的关键作用，并识别出一组独立于MYCN扩增状态的MAP基因标志 | 对线粒体相关蛋白在神经母细胞瘤中作用的全面研究仍然不足，需进一步探索 | 研究线粒体相关基因在神经母细胞瘤中的表达及其与临床结局的关系 | 神经母细胞瘤患者的线粒体相关基因 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 分析了1,712个MAP基因及相关的细胞系和人类初级T细胞 |
| 794 | 2024-08-05 |
Benchmarking of Nanopore R10.4 and R9.4.1 flow cells in single-cell whole-genome amplification and whole-genome shotgun sequencing
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.038
PMID:37025654
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研究论文 | 该文章评估了R10.4流动单元在癌细胞分析中的优势和缺陷。 | 这是首次通过使用ONT R10.4和R9.4.1 MinION流动单元对单细胞全基因组测序进行基准测试。 | 文章未提及具体的样本多样性或其他类型的癌细胞分析局限性。 | 评估新一代测序技术在癌症基因组学和表观基因组学研究中的应用。 | 该研究主要针对人类非小细胞肺癌细胞系HCC78进行分析。 | 基因组学 | 肺癌 | NGS | NA | 基因组数据 | 单细胞样本 |
| 795 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA analysis to identify five cytokines signaling in immune-related genes for melanoma survival prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1148130
PMID:37026000
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析五种细胞因子信号在黑色素瘤生存预后中的作用 | 首次构建并验证了基于单细胞RNA测序数据的机器学习模型，具有成为新治疗靶点和预后生物标志物面板的潜力 | NA | 评估细胞因子信号在与免疫相关基因中的预测价值，以便诊断和治疗黑色素瘤患者 | 黑色素瘤患者及其免疫相关基因的细胞因子信号 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | RNA-seq数据 | NA |
| 796 | 2024-08-08 |
A novel 7-chemokine-genes predictive signature for prognosis and therapeutic response in renal clear cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1120562
PMID:37021054
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研究论文 | 本研究旨在建立一个针对肾透明细胞癌（ccRCC）的7种趋化因子基因预测签名，以评估患者的预后和治疗反应 | 本研究首次构建了基于7种趋化因子基因的预测签名，并验证了其在ccRCC中的预后价值和治疗反应预测能力 | 需要进一步的临床试验来验证该预测签名在实际治疗中的应用效果 | 建立一个趋化因子基因签名，用于评估肾透明细胞癌的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | mRNA测序数据 | 526名肾透明细胞癌患者（263名训练组样本和263名验证组样本） |
| 797 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and stem cells of vascular endothelial cells in blood vessel formation and homeostasis: Insights from single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1146399
PMID:37025170
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞与血管生成及稳态关系研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术发现了新的动脉、静脉和毛细血管内皮细胞的分子特征，以及先前未被识别的特殊内皮细胞亚型 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞研究中的应用前景 | 血管内皮细胞的异质性和内皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种小鼠组织和人体器官 |
| 798 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell analysis and machine learning to create glycosylation-based gene signature for prognostic prediction of uveal melanoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1163046
PMID:37033251
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习技术，创建了基于糖基化的基因特征，用于预测葡萄膜黑色素瘤的预后 | 首次利用糖基化相关基因特征作为独立预测因子，为葡萄膜黑色素瘤的临床诊断和治疗提供了新视角 | NA | 揭示糖基化相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后中的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 基因数据 | NA |
| 799 | 2024-08-08 |
The integrated single-cell analysis developed a lactate metabolism-driven signature to improve outcomes and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1154410
PMID:37033259
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析，开发了一种基于乳酸代谢驱动的特征，以改善肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 构建了一个基于乳酸代谢相关基因的预测模型，用于预测肺腺癌患者的免疫治疗效果 | NA | 开发新的治疗肺腺癌患者的目标 | 肺腺癌患者的乳酸代谢相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | cox回归和lasso回归 | 基因数据 | 590个调控乳酸代谢的基因 |
| 800 | 2024-08-08 |
Single-cell protein activity analysis reveals a novel subpopulation of chondrocytes and the corresponding key master regulator proteins associated with anti-senescence and OA progression
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1077003
PMID:37033917
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和metaVIPER算法，揭示了与抗衰老和骨关节炎进展相关的新型软骨细胞亚群及其关键主调控蛋白 | 首次通过单细胞蛋白活性分析，识别出与骨关节炎进展和细胞抗衰老相关的新型软骨细胞亚群及其关键调控蛋白 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在基因丢失问题 | 深入了解软骨细胞的分子特征，并为骨关节炎的有效干预策略提供理论基础 | 软骨细胞及其在骨关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 62,449个来自健康个体和骨关节炎患者的软骨细胞，以及24,675个人类软骨细胞的单细胞RNA测序数据 |