单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2024-08-08 |
Etiology of end-stage liver cirrhosis impacts hepatic natural killer cell heterogenicity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1137034
PMID:37063898
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了不同病因导致肝硬化的终末期肝脏中自然杀伤细胞的异质性 | 首次揭示了疾病病因对肝硬化期间自然杀伤细胞行为的影响 | NA | 探讨疾病病因对肝硬化期间自然杀伤细胞异质性的影响 | 肝硬化终末期肝脏中的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自非酒精性脂肪性肝炎、慢性丙型肝炎感染和原发性硬化性胆管炎患者的肝硬化终末期肝脏样本 |
| 782 | 2024-08-08 |
PIK3C2A is a prognostic biomarker that is linked to immune infiltrates in kidney renal clear cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1114572
PMID:37063922
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研究论文 | 本文研究了PIK3C2A在肾透明细胞癌中的表达模式及其作为预后生物标志物的意义，并探讨了其与肿瘤免疫浸润的关系 | 首次揭示了PIK3C2A在肾透明细胞癌中的预后价值及其与免疫细胞浸润水平的关联 | NA | 探讨PIK3C2A在肾透明细胞癌中的预后作用及其与肿瘤免疫的关系 | PIK3C2A在肾透明细胞癌中的表达及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq, Western blot | NA | 基因表达数据 | 多个数据集和TCGA数据库中的样本 |
| 783 | 2024-08-08 |
Prognostic value of autophagy-related genes based on single-cell RNA-sequencing in colorectal cancer
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1109683
PMID:37065476
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据评估自噬相关基因在结直肠癌中的预后价值和潜在功能 | 开发了一种基于11个关键自噬相关基因的风险模型，这些基因可能作为结直肠癌的潜在治疗靶点 | NA | 评估自噬相关基因在结直肠癌中的预后价值 | 结直肠癌患者的自噬相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16,270个细胞 |
| 784 | 2024-08-08 |
PDGF-D-induced immunoproteasome activation and cell-cell interactions
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.047
PMID:37066124
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研究论文 | 本研究探讨了血小板源性生长因子-D（PDGF-D）在视网膜色素上皮（RPE）细胞中过表达对免疫蛋白酶体活性和细胞间相互作用的影响 | 首次揭示了PDGF-D过表达显著上调关键免疫蛋白酶体基因，增加RPE细胞的抗原处理/呈递能力，并发现PDGF-D过表达的RPE-脉络膜组织中配体-受体对数量显著增加，表明细胞间相互作用增强 | NA | 研究PDGF-D在眼部疾病中的作用及其对眼部细胞和细胞间相互作用的影响 | 视网膜色素上皮细胞和PDGF-D过表达的RPE-脉络膜组织 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用PDGF-D过表达的RPE细胞的小鼠模型 |
| 785 | 2024-08-05 |
Single-cell mapping of N6-methyladenosine in esophageal squamous cell carcinoma and exploration of the risk model for immune infiltration
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1155009
PMID:37025404
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（m6A）在食道鳞状细胞癌中的分布及其对免疫浸润的风险模型的构建 | 首次在食道鳞状细胞癌中进行单细胞m6A映射，构建了与免疫浸润相关的风险模型 | 缺乏对m6A具体机制的深入探讨 | 研究m6A在食道癌发展中的作用及其机制 | 174名食道鳞状癌患者的RNA-seq和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 食道癌 | RNA-seq | NA | 基因序列数据 | 174个食道鳞状癌患者的样本以及4个单细胞样本 |
| 786 | 2024-08-05 |
Disease modeling of ADAMTS9-related nephropathy using kidney organoids reveals its roles in tubular cells and podocytes
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1089159
PMID:37035301
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研究论文 | 本研究揭示了ADAMTS9在肾小管细胞和足细胞中的功能角色。 | 识别到新的复合杂合ADAMTS9变异，探讨其在肾脏疾病中的作用。 | 本研究主要集中在ADAMTS9的功能，未探讨其他相关基因的影响。 | 研究ADAMTS9缺失与肾小管病及肾小球病之间的关系。 | 研究两名患有肾小管病的NPHP-RC兄妹的ADAMTS9突变。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 肾脏类器官 | 基因表达 | 2名兄妹 |
| 787 | 2024-08-05 |
Identification of an immune subtype-related prognostic signature of clear cell renal cell carcinoma based on single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1067987
PMID:37035172
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研究论文 | 本研究构建了一个与免疫亚型相关的预后模型，以预测透明细胞肾细胞癌患者的预后 | 首次基于单细胞测序分析定义了ccRCC的免疫亚型相关基因，并构建了一个包含五个基因的预后模型 | 该研究可能缺乏多中心大样本验证以确保模型的普适性 | 旨在预测透明细胞肾细胞癌患者的预后并为治疗策略提供指导 | 聚焦于透明细胞肾细胞癌患者及其免疫亚型特征 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 包含TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 |
| 788 | 2024-08-05 |
Mitochondria-associated gene expression perturbation predicts clinical outcomes and shows potential for targeted therapy in neuroblastoma
2023, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2023.1094926
PMID:37025299
|
研究论文 | 本文探讨了与线粒体相关的基因表达扰动如何预测神经母细胞瘤的临床结果，并展示其作为靶向治疗的潜力 | 提出了线粒体相关蛋白（MAPs）在神经母细胞瘤中的关键作用，并识别出一组独立于MYCN扩增状态的MAP基因标志 | 对线粒体相关蛋白在神经母细胞瘤中作用的全面研究仍然不足，需进一步探索 | 研究线粒体相关基因在神经母细胞瘤中的表达及其与临床结局的关系 | 神经母细胞瘤患者的线粒体相关基因 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 分析了1,712个MAP基因及相关的细胞系和人类初级T细胞 |
| 789 | 2024-08-05 |
Benchmarking of Nanopore R10.4 and R9.4.1 flow cells in single-cell whole-genome amplification and whole-genome shotgun sequencing
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.038
PMID:37025654
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研究论文 | 该文章评估了R10.4流动单元在癌细胞分析中的优势和缺陷。 | 这是首次通过使用ONT R10.4和R9.4.1 MinION流动单元对单细胞全基因组测序进行基准测试。 | 文章未提及具体的样本多样性或其他类型的癌细胞分析局限性。 | 评估新一代测序技术在癌症基因组学和表观基因组学研究中的应用。 | 该研究主要针对人类非小细胞肺癌细胞系HCC78进行分析。 | 基因组学 | 肺癌 | NGS | NA | 基因组数据 | 单细胞样本 |
| 790 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA analysis to identify five cytokines signaling in immune-related genes for melanoma survival prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1148130
PMID:37026000
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析五种细胞因子信号在黑色素瘤生存预后中的作用 | 首次构建并验证了基于单细胞RNA测序数据的机器学习模型，具有成为新治疗靶点和预后生物标志物面板的潜力 | NA | 评估细胞因子信号在与免疫相关基因中的预测价值，以便诊断和治疗黑色素瘤患者 | 黑色素瘤患者及其免疫相关基因的细胞因子信号 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | RNA-seq数据 | NA |
| 791 | 2024-08-08 |
A novel 7-chemokine-genes predictive signature for prognosis and therapeutic response in renal clear cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1120562
PMID:37021054
|
研究论文 | 本研究旨在建立一个针对肾透明细胞癌（ccRCC）的7种趋化因子基因预测签名，以评估患者的预后和治疗反应 | 本研究首次构建了基于7种趋化因子基因的预测签名，并验证了其在ccRCC中的预后价值和治疗反应预测能力 | 需要进一步的临床试验来验证该预测签名在实际治疗中的应用效果 | 建立一个趋化因子基因签名，用于评估肾透明细胞癌的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | mRNA测序数据 | 526名肾透明细胞癌患者（263名训练组样本和263名验证组样本） |
| 792 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and stem cells of vascular endothelial cells in blood vessel formation and homeostasis: Insights from single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1146399
PMID:37025170
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞与血管生成及稳态关系研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术发现了新的动脉、静脉和毛细血管内皮细胞的分子特征，以及先前未被识别的特殊内皮细胞亚型 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞研究中的应用前景 | 血管内皮细胞的异质性和内皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种小鼠组织和人体器官 |
| 793 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell analysis and machine learning to create glycosylation-based gene signature for prognostic prediction of uveal melanoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1163046
PMID:37033251
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习技术，创建了基于糖基化的基因特征，用于预测葡萄膜黑色素瘤的预后 | 首次利用糖基化相关基因特征作为独立预测因子，为葡萄膜黑色素瘤的临床诊断和治疗提供了新视角 | NA | 揭示糖基化相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后中的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 基因数据 | NA |
| 794 | 2024-08-08 |
The integrated single-cell analysis developed a lactate metabolism-driven signature to improve outcomes and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1154410
PMID:37033259
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析，开发了一种基于乳酸代谢驱动的特征，以改善肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 构建了一个基于乳酸代谢相关基因的预测模型，用于预测肺腺癌患者的免疫治疗效果 | NA | 开发新的治疗肺腺癌患者的目标 | 肺腺癌患者的乳酸代谢相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | cox回归和lasso回归 | 基因数据 | 590个调控乳酸代谢的基因 |
| 795 | 2024-08-08 |
Single-cell protein activity analysis reveals a novel subpopulation of chondrocytes and the corresponding key master regulator proteins associated with anti-senescence and OA progression
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1077003
PMID:37033917
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和metaVIPER算法，揭示了与抗衰老和骨关节炎进展相关的新型软骨细胞亚群及其关键主调控蛋白 | 首次通过单细胞蛋白活性分析，识别出与骨关节炎进展和细胞抗衰老相关的新型软骨细胞亚群及其关键调控蛋白 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在基因丢失问题 | 深入了解软骨细胞的分子特征，并为骨关节炎的有效干预策略提供理论基础 | 软骨细胞及其在骨关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 62,449个来自健康个体和骨关节炎患者的软骨细胞，以及24,675个人类软骨细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 796 | 2024-08-08 |
Imputation of single-cell transcriptome data enables the reconstruction of networks predictive of breast cancer metastasis
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.036
PMID:37035549
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据插补技术，重建了预测乳腺癌转移的细胞类型特异性基因网络 | 首次展示了通过插补单细胞RNA测序数据，有效重建细胞类型特异性基因网络，并识别出乳腺癌转移的关键基因 | NA | 探索单细胞转录组数据在重建细胞类型特异性基因网络中的应用，并识别乳腺癌转移的关键基因 | 七种原发性和九种转移性乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 七种原发性和九种转移性乳腺癌细胞系 |
| 797 | 2024-08-08 |
Comparison of cell subsets in chronic obstructive pulmonary disease and controls based on single-cell transcriptome sequencing
2023, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine
IF:1.4Q3
DOI:10.3233/THC-236002
PMID:37038777
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术比较了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者与对照组的细胞亚群差异 | 利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究COPD患者与对照组的细胞亚群分类，并探讨长链非编码RNA（lncRNA）在单细胞水平的表达 | NA | 旨在进一步理解COPD患者适应性免疫细胞反应的机制 | COPD患者与对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从Gene Expression Omnibus（GEO）数据库下载的COPD患者外周血单个核细胞数据 |
| 798 | 2024-08-08 |
Age- and Microbiota-Dependent Cell Stemness Plasticity Revealed by Cattle Cell Landscape
2023, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0025
PMID:37040481
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了新生和成年牛的多个器官的细胞图谱，揭示了年龄和微生物群依赖的细胞干细胞可塑性。 | 本文首次揭示了新生反刍动物前胃上皮细胞的转录不一致性和随机性，并发现了一种新生牛特有的新型细胞类型。 | NA | 研究新生和成年反刍动物细胞差异，以改善家养反刍动物的健康和性能。 | 新生和成年牛的多个器官，包括瘤胃、网胃、重瓣胃、皱胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠、直肠、肝脏、唾液腺和乳腺。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 235,941个高质量单细胞，涵盖78种细胞类型 |
| 799 | 2024-08-05 |
Lack of association between leptin concentrations and cystic fibrosis: A meta-analysis and regression
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1126129
PMID:36992806
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meta-analysis | 本综述旨在评估囊性纤维化患者与非囊性纤维化对照组之间的瘦素状态的定量差异 | 研究表明囊性纤维化患者与健康个体在瘦素水平上没有显著差异，揭示了瘦素在囊性纤维化病理生理学中的作用的局限性 | 本研究未能确定瘦素与第一秒用力呼气容量（FEV1）之间的关联，且在不同细胞中肺泡灌洗液中瘦素及瘦素受体的表达水平较低 | 评估囊性纤维化与瘦素浓度之间的关联 | 共纳入919名囊性纤维化患者和397名对照组，以分析瘦素水平 | NA | 囊性纤维化 | 系统评价 | 固定效应或随机效应模型 | NA | 919名囊性纤维化患者和397名对照组 |
| 800 | 2024-08-05 |
Prognostic signatures of sphingolipids: Understanding the immune landscape and predictive role in immunotherapy response and outcomes of hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1153423
PMID:37006285
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研究论文 | 本研究旨在识别影响肝细胞癌预后的关键鞘脂基因，并建立可靠的预后模型 | 提出了一个六基因特征和一个诺莫图，提供了鞘脂相关基因与免疫微环境之间的联系，揭示了新的免疫治疗策略 | 研究主要依赖于数据集，不同数据源之间的整合可能导致偏差 | 识别肝细胞癌中的关键鞘脂基因并开发预后模型 | 肝细胞癌患者的鞘脂基因及其在肿瘤微环境中的影响 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | LASSO-Cox分析、单细胞测序、机器学习 | 诺莫图 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集 |