单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals distinct expression patterns among genes in the mouse incisor dental pulp
2023, The International journal of developmental biology
DOI:10.1387/ijdb.220173db
PMID:37078362
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠门牙牙髓中基因的表达模式 | 揭示了SOX转录因子在间充质干细胞分化过程中的调控作用 | NA | 探讨SOX转录因子在小鼠门牙牙髓细胞分化中的表达模式 | 小鼠门牙牙髓中的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个间充质干细胞样本 |
| 762 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human chondrocytes reveals cell-cell communication alterations mediated by interactive signaling pathways in osteoarthritis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1099287
PMID:37082621
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了骨关节炎患者关节软骨组织中的细胞间通讯变化，揭示了特定信号通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 首次通过单细胞转录组测序技术揭示了骨关节炎中软骨细胞亚型间的细胞间通讯变化，并验证了特定信号通路在其中的作用 | 研究仅基于公共数据库中的数据，未进行体内外实验验证 | 探索骨关节炎发病机制中细胞间通讯的变化 | 骨关节炎患者的关节软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自骨关节炎患者的关节软骨组织样本 |
| 763 | 2024-08-08 |
Expression of OLR1 gene on tumor-associated macrophages of head and neck squamous cell carcinoma, and its correlation with clinical outcome
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2203073
PMID:37089448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了头颈鳞状细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞上的OLR1基因表达，并探讨了其与临床预后的关系 | 首次揭示了OLR1基因在肿瘤相关巨噬细胞上的特异性表达与头颈鳞状细胞癌不良预后的显著关联 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，可能需要进一步的实验验证 | 探讨OLR1基因在头颈鳞状细胞癌中的表达及其对临床预后的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤相关巨噬细胞和OLR1基因表达 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 498个头颈鳞状细胞癌患者肿瘤样本 |
| 764 | 2024-08-08 |
A novel molecular signature for predicting prognosis and immunotherapy response in osteosarcoma based on tumor-infiltrating cell marker genes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1150588
PMID:37090691
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研究论文 | 本研究基于肿瘤浸润细胞标记基因开发了一种新的分子特征，用于预测骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次基于肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）标记基因开发了一个预后模型，用于骨肉瘤的预后预测和免疫治疗反应 | NA | 开发一种新的分子特征，用于预测骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq），WGCNA，LASSO回归分析，SVM算法 | 风险模型 | RNA转录组数据 | 11个细胞簇和2044个TILs标记基因 |
| 765 | 2024-08-08 |
Single-cell immune profiling reveals immune responses in oral lichen planus
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1182732
PMID:37090715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组库测序技术，揭示了口腔扁平苔藓（OLP）黏膜免疫微环境的特征 | 首次通过单细胞免疫图谱分析，揭示了OLP中组织驻留记忆CD8+ T细胞的活化状态及其他免疫细胞的克隆扩增和基因配对偏好 | NA | 探究口腔扁平苔藓（OLP）的免疫反应机制 | 口腔扁平苔藓（OLP）的黏膜免疫微环境 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组库测序 | NA | 转录组 | 四个OLP活检样本及其配对的外周血单个核细胞（PBMCs），两个健康组织和三个健康PBMCs样本 |
| 766 | 2024-08-08 |
ProgClust: A progressive clustering method to identify cell populations
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1183099
PMID:37091787
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研究论文 | 提出了一种名为ProgClust的方法，用于分解细胞群并检测稀有细胞，通过聚类树表示单细胞数据，并设计了一种渐进搜索方法来选择细胞群特异性基因和聚类细胞 | ProgClust能够自动确定聚类数量，并有效地识别常见和稀有细胞，同时在真实未标记数据中揭示潜在的细胞亚群 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群和稀有细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类树 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 767 | 2024-08-08 |
Molecular characterization of colorectal mucinous adenocarcinoma and adenocarcinoma, not otherwise specified, identified by multiomic data analysis
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1150362
PMID:37091868
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研究论文 | 本文利用多组学数据分析了结直肠黏液腺癌和非特定类型腺癌的分子特征 | 发现了非特定类型腺癌具有免疫活跃但暴露于缺氧微环境，而黏液腺癌细胞能保护DNA免受损伤，微环境不利于白细胞穿透内皮迁移 | NA | 探究非特定类型腺癌和黏液腺癌的分子特征及其在肿瘤微环境中的差异 | 结直肠黏液腺癌、非特定类型腺癌及正常结肠组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析 | NA | 蛋白质组学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学数据 | NA |
| 768 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of GP2-enriched pancreatic progenitors to simultaneously create acinar, ductal, and endocrine organoids
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.78323
PMID:37064874
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研究论文 | 本文对富含GP2的胰腺祖细胞进行单细胞分析，以同时创建腺泡、导管和内分泌类器官 | 引入了一种新型的胰腺祖细胞分化平台，采用综合化合物筛选和先进的计算工具，提高了多能性祖细胞的产生效率 | 没有明确提到实验的限制 | 研究人类多能干细胞向多能胰腺祖细胞的转化，探讨胰腺不同谱系的生成 | GP2富集的胰腺祖细胞，研究其多谱系潜力和细胞间通讯信号 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种PP亚群体的细胞，具体样本数量未提及 |
| 769 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Single-cell RNA-seq analysis reveals cellular functional heterogeneity in dermis between fibrotic and regenerative wound healing fates
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175360
PMID:37063891
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更正 | 该文章更正了之前关于单细胞RNA测序分析的内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 770 | 2024-08-05 |
TNFα aggravates detrimental effects of SARS-CoV-2 infection in the liver
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1151937
PMID:37063909
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研究论文 | 本文分析了TNFα在SARS-CoV-2感染中对肝脏的有害影响 | 研究发现肝脏中TNFα的表达增加与病人死亡率升高相关 | 当前尚不清楚这些免疫介质在SARS-CoV-2感染过程中对患者生存的具体影响 | 探讨在SARS-CoV-2感染过程中肝脏中TNFα信号的作用及其对患者生存的影响 | 对45名因SARS-CoV-2感染去世患者进行尸检分析 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 患者生物样本数据 | 45名因SARS-CoV-2感染去世的患者 |
| 771 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing depicts metabolic changes in children with aplastic anemia
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1075408
PMID:37064094
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了儿童再生障碍性贫血的代谢变化 | 该研究首次揭示再生障碍性贫血患者T淋巴细胞和自然杀伤细胞的代谢异常路径 | 研究中没有提及样本的具体数量和来源的详细信息 | 探讨再生障碍性贫血中免疫细胞的代谢异常及其可能的治疗策略 | 儿童再生障碍性贫血患者及健康供体 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 772 | 2024-08-05 |
Three-dimensional and single-cell sequencing of liver cancer reveals comprehensive host-virus interactions in HBV infection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1161522
PMID:37063858
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研究论文 | 本研究揭示了HBV感染下肝癌的主机-病毒相互作用 | 首次应用三维基因组组织分析揭示HBV如何影响肝细胞的染色质相互作用 | 尚未探讨HBV感染的所有机制 | 研究HBV感染对肝疾病机制及主机-病毒相互作用的影响 | 针对HBV阴性及阳性肝细胞系的基因组和转录组分析 | 数字病理学 | 肝癌 | HiC测序 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq数据及ChIP-seq数据 | 使用了HepG2及HepG2-2.2.15细胞系，具体样本数量NA |
| 773 | 2024-08-05 |
Recent advances in understanding neuronal diversity and neural circuit complexity across different brain regions using single-cell sequencing
2023, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2023.1007755
PMID:37063385
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研究论文 | 本文探讨了采用单细胞测序技术对不同脑区神经元多样性和神经电路复杂性的理解进展 | 文章创新性地总结了区域特异性发现，并强调单细胞测序在理解神经电路中的应用 | 文章未详细阐述实验方法和样本数量的具体限制 | 研究脑区特异性神经元多样性和神经电路复杂性的最新进展 | 研究对象为不同脑区的神经元及其电路 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 774 | 2024-08-05 |
GRACE: Graph autoencoder based single-cell clustering through ensemble similarity learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0284527
PMID:37058497
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的单细胞聚类算法GRACE | 提出了一种基于图自编码器的单细胞聚类算法，具有高度一致的细胞分组 | NA | 旨在提高单细胞聚类的准确性 | 单细胞基因表达数据 | 数字病理学 | 复杂疾病 | 单细胞测序 | 图自编码器 | 基因表达数据 | 真实世界单细胞测序数据集 |
| 775 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals in vivo osteoimmunology interactions between the immune and skeletal systems
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1107511
PMID:37051201
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探索了免疫细胞与成骨细胞系细胞在体内的骨免疫相互作用 | 首次在单细胞分辨率下鉴定了多种可能介导免疫细胞与成骨细胞系细胞之间信号传递的配体-受体对 | NA | 揭示免疫系统与骨骼系统在体内的骨免疫相互作用 | 免疫细胞与成骨细胞系细胞的相互作用 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类股骨头和外周血单核细胞的数据集 |
| 776 | 2024-08-08 |
Analysis of necroptosis-related prognostic genes and immune infiltration in idiopathic pulmonary fibrosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1119139
PMID:37051233
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研究论文 | 本研究探讨了特发性肺纤维化（IPF）中与坏死性凋亡相关的预后基因及其与免疫浸润的关系，构建了基于坏死性凋亡相关基因的IPF预后预测模型。 | 首次深入研究了IPF中的坏死性凋亡现象及其与免疫浸润的关联，并构建了预后预测模型。 | 研究主要基于公共数据库数据，需要在更多临床样本中验证模型的准确性和适用性。 | 探究IPF中的坏死性凋亡现象及其与免疫浸润的关系，构建预后预测模型。 | 特发性肺纤维化（IPF）中的坏死性凋亡相关基因及其与免疫浸润的关系。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RT-qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个GEO数据库中的数据集，包括GSE110147, GSE70866, GSE122960, GSE213001, GSE93606，具体样本数量未详细说明。 |
| 777 | 2024-08-08 |
Combined analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals novel natural killer cell-related prognostic biomarkers for predicting immunotherapeutic response in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1142126
PMID:37056756
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研究论文 | 本研究通过结合批量和单细胞RNA测序数据，识别出与自然杀伤细胞相关的预后生物标志物，用于预测肝细胞癌的免疫治疗反应 | 首次结合批量和单细胞RNA测序数据，创建了一个基于自然杀伤细胞标记基因的独特预后特征，用于预测肝细胞癌患者的免疫治疗效果 | NA | 研究目的是识别和验证与自然杀伤细胞相关的预后生物标志物，以预测肝细胞癌患者的免疫治疗反应 | 研究对象为肝细胞癌患者的自然杀伤细胞及其相关预后生物标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 共选择了1,196个样本进行分析 |
| 778 | 2024-08-08 |
CD226 identifies functional CD8+T cells in the tumor microenvironment and predicts a better outcome for human gastric cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1150803
PMID:37056782
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研究论文 | 本文研究了CD226在人胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用及其对患者预后的影响 | 首次揭示了CD226在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用，并证明了CD226CD8T细胞在胃癌患者中的预后价值 | NA | 探讨CD226在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用及其对患者预后的影响 | 人胃癌肿瘤微环境中的CD8+T细胞和CD226表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 转座酶可及染色质测序（ATAC-seq），多色免疫组织化学染色（mIHC），单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 胃癌患者的癌症组织样本 |
| 779 | 2024-08-08 |
Multi-omics integrative analysis reveals the role of tumor necrosis factor superfamily member 4 in keloidal scarring
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37056826
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，揭示了肿瘤坏死因子超家族成员4（TNFSF4）在瘢痕疙瘩中的上调表达及其生物学意义 | 首次在多组学水平上揭示了TNFSF4在瘢痕疙瘩中的上调表达及其对细胞间对话和间质成纤维细胞转录组的影响 | NA | 旨在识别瘢痕疙瘩中异常表达的免疫分子并探索其可能的生物学意义 | 瘢痕疙瘩中的免疫分子表达及TNFSF4的作用 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 免疫基因测序、微阵列数据集、高通量测序数据集、甲基化微阵列数据集、实时定量PCR分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 780 | 2024-08-08 |
M1 Microglia-derived Exosomes Promote Activation of Resting Microglia and Amplifies Proangiogenic Effects through Irf1/miR-155-5p/Socs1 Axis in the Retina
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.79784
PMID:37063422
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据集，揭示了M1小胶质细胞通过外泌体促进M0小胶质细胞活化并增强其促血管生成能力的作用机制 | 本研究首次阐明了M1小胶质细胞通过外泌体传递miR-155-5p信号，抑制Socs1并激活NFκB途径，从而放大促血管生成效应的分子机制 | NA | 揭示小胶质细胞在视网膜新生血管疾病中的病理生理和分子机制，为临床视网膜新生血管的治疗提供新的靶向策略 | 小胶质细胞及其在视网膜血管生成中的作用 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |