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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2024-08-08 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal extracellular matrix mechanical regulation of lipid metabolism reprograming through YAP/TEAD4/ACADL axis in hepatocellular carcinoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.82177
PMID:37151879
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，揭示了细胞外基质机械调控通过YAP/TEAD4/ACADL轴影响肝细胞癌中脂质代谢重编程的机制 | 发现ACADL作为机械反应酶，通过细胞外基质硬度的增加激活YAP/TEAD4转录复合体，从而在转录水平上抑制ACADL，影响肝细胞癌中的脂质代谢 | NA | 研究细胞外基质硬度对肝细胞癌代谢失调的影响及其分子机制 | 肝细胞癌样本及其代谢途径 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | TCGA-LIHC数据库（n=374）和GEO数据集（GSE14520） | NA | NA | NA | NA |
| 742 | 2024-08-08 |
Receptor-ligand pair typing and prognostic risk model of response or resistance to immune checkpoint inhibitors in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1170942
PMID:37152010
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研究论文 | 研究探讨了肺腺癌（LUAD）中免疫检查点抑制剂反应或抵抗的受体-配体对类型及预测模型 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，揭示了免疫疗法反应或抵抗的转录特征，并基于LASSO Cox回归分析确定了新的预测性生物标志物 | NA | 探索免疫疗法机制并识别肺腺癌中的新治疗机会 | 肺腺癌患者对PD-1靶向治疗的反应 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA | 涉及对PD-1治疗有反应和无反应的患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 743 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of peripheral blood and muscle cells reveals inflammatory features of juvenile dermatomyositis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1166017
PMID:37152289
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合生物信息学分析，探讨了幼年皮肌炎患者外周血和肌肉组织中细胞类型、细胞组成和转录组动态变化 | 首次详细分析了幼年皮肌炎相关免疫细胞的动态变化，并识别了与炎症相关的特定细胞亚型 | NA | 旨在研究幼年皮肌炎中外周血和肌肉组织的细胞类型、细胞组成和转录组动态变化，以阐明免疫细胞在发病机制中的作用 | 幼年皮肌炎患者的外周血和肌肉组织 | 数字病理学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,859个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 744 | 2024-08-08 |
Identification of cuproptosis-related biomarkers in dilated cardiomyopathy and potential therapeutic prediction of herbal medicines
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1154920
PMID:37168258
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研究论文 | 本研究探讨了扩张型心肌病（DCM）中铜死亡相关生物标志物的识别及其对中草药潜在治疗效果的预测 | 本研究首次系统地阐明了铜死亡与DCM病理特征之间的复杂关系，并识别了两个关键基因（FDX1和SLC31A1）及两种天然化合物（Rutin和Polydatin） | NA | 旨在理解DCM中铜死亡的生物学机制，并为药物开发提供依据 | DCM患者的心脏组织及中草药的治疗潜力 | 数字病理学 | 心血管疾病 | LASSO, RF, SVM-RFE, XGBoost, WGCNA, AUCell, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 基因表达数据, scRNA-seq数据 | DCM数据集来自Gene Expression Omnibus，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 745 | 2024-08-08 |
Identification of Cuproptosis-Related Subtypes, Establishment of a Prognostic Signature and Characterization of the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S404847
PMID:37168531
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法，探讨了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，以评估胃癌患者的预后和肿瘤微环境特征。 | 首次全面讨论了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，用于预测胃癌患者的预后和个性化治疗。 | NA | 探讨铜死亡与胃癌的相关性，并建立预后预测模型。 | 胃癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序, 实时定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 大量胃癌患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 746 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals immune infiltrate in sepsis
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1133145
PMID:37113759
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研究论文 | 本研究探讨了与脓毒症中免疫细胞浸润丰度相关的枢纽基因 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了脓毒症中的免疫浸润特征 | 未提及具体的样本来源和实验条件的局限 | 探索脓毒症中免疫细胞浸润的相关基因 | 脓毒症样本与正常样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组学 | t-SNE | 基因表达数据 | 61个脓毒症样本与正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 747 | 2024-08-05 |
Inferring spatial transcriptomics markers from whole slide images to characterize metastasis-related spatial heterogeneity of colorectal tumors: A pilot study
2023, Journal of pathology informatics
DOI:10.1016/j.jpi.2023.100308
PMID:37114077
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研究论文 | 本研究通过全切片图像推断空间转录组标记，以表征与结直肠肿瘤转移相关的空间异质性 | 提出了一种通过全切片图像推断RNA模式的新的预测转录组数据的方法 | 结果表明变换器和图卷积网络无法超越卷积神经网络，且对相关疾病基因的性能表现不佳 | 研究转录组数据与结直肠肿瘤转移的关系 | 来自4位III期（pT3）匹配结直肠癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组技术（Visium） | 卷积神经网络、变换器和图卷积网络 | 图像 | 4位III期结直肠癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 748 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals the heterogeneity and FGG+CRP+ inflammatory cancer-associated fibroblasts replace islets in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1112576
PMID:37124494
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术揭示了胰腺癌中肿瘤微环境的空间异质性和炎症相关成纤维细胞的特征 | 首次展示了FGG+CRP+炎症相关成纤维细胞在胰腺导管腺癌中替代胰岛的现象 | 仅分析了有限的样本和空间位置，可能无法全面代表所有情况 | 探讨胰腺癌中的肿瘤微环境空间异质性 | 正常胰腺组织、胰腺癌组织、相邻肿瘤组织和肿瘤基质 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | t-分布随机邻居嵌入 | 基因表达数据 | 分析了18,075个空间点 | NA | NA | NA | NA |
| 749 | 2024-08-05 |
Construction of cancer- associated fibroblasts related risk signature based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data in bladder urothelial carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1170893
PMID:37124542
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研究论文 | 本研究构建了基于癌症相关成纤维细胞的风险标志，以解读膀胱尿路癌的免疫景观并筛选合适的治疗方案 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序数据构建膀胱尿路癌的CAFs风险标志 | 尚未在临床环境中验证风险标志的广泛适用性 | 研究膀胱尿路癌中的CAFs特征并建立CAFs风险标志 | 膀胱尿路癌样本及相关CAFs基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，RNA-seq | Cox回归，LASSO回归 | 基因数据 | 涉及124个CAF相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 750 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis reveals a macrophage-related marker gene signature for prognostic prediction, immune landscape, genomic heterogeneity, and drug choices in prostate cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1122670
PMID:37122696
|
研究论文 | 本研究揭示了一种与巨噬细胞相关的标记基因签名在前列腺癌预后预测中的应用价值 | 通过多组学分析构建了9个基因的巨噬细胞相关标记基因预后签名，提供了新的视角和理论基础 | 未提及具体的局限性 | 探讨巨噬细胞相关网络在前列腺癌预后和治疗中的价值 | 前列腺癌患者的巨噬细胞相关标记基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序，LASSO-Cox回归分析 | NA | 基因数据 | 307个巨噬细胞相关标记基因 | NA | NA | NA | NA |
| 751 | 2024-08-08 |
Gene length is a pivotal feature to explain disparities in transcript capture between single transcriptome techniques
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1144266
PMID:37122996
|
研究论文 | 本文比较了三种不同器官（心脏、肺和肾脏）的单细胞和单核转录组技术，探讨了转录组输出差异及其对下游分析的影响 | 首次直接比较单细胞和单核RNA测序技术在转录组输出方面的差异，并发现基因长度和外显子含量是影响捕获效率的关键因素 | 研究仅限于三种器官，且仅比较了两种技术，未涵盖所有可能的技术和器官 | 探讨单细胞和单核RNA测序技术在转录组捕获方面的差异及其对下游分析的影响 | 三种不同器官（心脏、肺和肾脏）的单细胞和单核转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三种器官的单细胞和单核转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 752 | 2024-08-08 |
The serum soluble scavenger with 5 domains levels: A novel biomarker for individuals with heart failure
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1140856
PMID:37123263
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研究论文 | 研究探讨血清可溶性清道夫含5个结构域（SSC5D）水平与心力衰竭（HF）之间的关系 | 发现SSC5D是心力衰竭的一个特异性反应，可能作为新型生物标志物和治疗靶点 | 研究为回顾性分析，且样本主要来自上海总医院，可能存在地域和样本选择的局限性 | 探索SSC5D作为心力衰竭生物标志物的潜力 | 心力衰竭患者及正常人的血清SSC5D水平 | NA | 心血管疾病 | 定量实时聚合酶链反应，单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 276名心力衰竭或正常患者，1755种分泌蛋白，小鼠心肌梗死或主动脉缩窄模型 | NA | NA | NA | NA |
| 753 | 2024-08-08 |
Transcriptomic analysis identified SLC40A1 as a key iron metabolism-related gene in airway macrophages in childhood allergic asthma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1164544
PMID:37123407
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析，在儿童过敏性哮喘的气道巨噬细胞中鉴定出与铁代谢相关的关键基因SLC40A1 | 首次揭示了SLC40A1基因在儿童过敏性哮喘中的潜在作用及其与铁代谢的关系 | NA | 探讨铁代谢相关基因在儿童过敏性哮喘发病机制中的作用 | 儿童过敏性哮喘患者的气道巨噬细胞 | NA | 过敏性哮喘 | 转录组分析、定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）、免疫荧光 | NA | 转录组数据 | 三个儿童哮喘基因表达数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 754 | 2024-08-08 |
Comparative analysis between high-grade serous ovarian cancer and healthy ovarian tissues using single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1148628
PMID:37124501
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了高级别浆液性卵巢癌与健康卵巢组织的细胞亚群和基因功能差异 | 首次详细比较了健康卵巢与卵巢癌细胞在细胞周期、细胞通讯等方面的差异，并验证了相关基因表达 | NA | 探讨高级别浆液性卵巢癌与健康卵巢细胞在功能、基因表达及细胞交互模式上的差异 | 高级别浆液性卵巢癌与健康卵巢组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6867个健康卵巢细胞和17056个卵巢癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 755 | 2024-08-08 |
Cell annotation using scRNA-seq data: A protein-protein interaction network approach
2023, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2023.102179
PMID:37128282
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于蛋白质-蛋白质相互作用网络的方法，用于量化scRNA-seq数据中与任何生物过程相关的通路活性 | 本文扩展了先前开发的基于蛋白质-蛋白质相互作用网络的框架，使其能够量化与任何生物过程或基因列表相关的通路活性 | NA | 旨在开发一种通用的工具，用于分析健康和疾病条件下多细胞类型中的通路活性 | 健康和癌症乳腺癌样本中的各种生物过程 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 756 | 2024-08-05 |
Recent revelations and future directions using single-cell technologies in chronic lymphocytic leukemia
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1143811
PMID:37091144
|
综述 | 本文讨论了单细胞技术在慢性淋巴细胞白血病（CLL）研究中的应用及未来方向 | 提出了多种单细胞测序技术并探讨其在CLL发病和进展研究中的应用 | 文章中提到不同单细胞技术在样本准备和数据解读方面的局限性 | 研究单细胞技术如何改善我们对慢性淋巴细胞白血病的理解 | 慢性淋巴细胞白血病的肿瘤微环境中的白血病和非恶性细胞 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序等 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 757 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals the vital cell types and dynamic development signature of atherosclerosis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1118239
PMID:37089432
|
研究论文 | 这项研究深入分析了健康和动脉粥样硬化动脉中的单细胞RNA-seq数据 | 本研究揭示了成纤维细胞在动脉粥样硬化中调节疾病过程的新机制 | 尚未提及具体的样本来源和其他细胞类型的作用 | 探讨动脉粥样硬化中的细胞类型及其动态发展特征 | 18个健康和动脉粥样硬化动脉样本 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 18个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 758 | 2024-08-05 |
A senescence-based prognostic gene signature for colorectal cancer and identification of the role of SPP1-positive macrophages in tumor senescence
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175490
PMID:37090726
|
研究论文 | 本研究构建了一种与衰老相关的结直肠癌预后模型，并探讨了SPP1阳性巨噬细胞在肿瘤衰老中的作用 | 提出了一种基于衰老相关基因的新模型，可以识别预后较差的结直肠癌患者及具有免疫抑制性肿瘤微环境 | 顺势而为的临床数据和样本的多样性可能限制了结果的推广性 | 旨在构建一个与衰老相关的结直肠癌预后模型并研究肿瘤微环境中的衰老影响 | 结直肠癌患者的转录组和临床数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组测序 | LASSO模型 | 转录组数据、临床数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 759 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis for cancer and biology of the pancreas: A review on recent progress
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1029758
PMID:37091793
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综述 | 本文回顾了单细胞转录组分析在胰腺生物学和癌症研究中的最新进展 | 文章探讨了单细胞RNA测序技术在胰腺生理和病理中的最新发现，揭示了细胞异质性和癌症组织中的新免疫靶点及分子机制 | 未提及具体的限制 | 旨在阐明单细胞分析如何推动胰腺生物学的未来研究 | 研究对象包括胰腺的健康细胞类型及癌组织 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 760 | 2024-08-05 |
An integrated bioinformatic analysis of bulk and single-cell sequencing clarifies immune microenvironment and metabolic profiles of lung adenocarcinoma to predict immunotherapy efficacy
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1163314
PMID:37091977
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和大样本测序分析肺腺癌的免疫微环境和代谢特征，以预测免疫疗法的疗效 | 提出了一种新的方法，通过单细胞与大样本测序结合，揭示了肺腺癌的免疫微环境和代谢特征 | 研究只集中在单一类型的肺腺癌，可能无法推广到其他癌症类型 | 探索免疫微环境如何影响肺腺癌免疫疗法的疗效 | 以肺腺癌的单细胞数据和TCGA大样本数据为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序和大样本测序 | NA | 基因组数据 | 使用TCGA大样本数据和GSE131907单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |