单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2024-08-05 |
Prognostic value of SLC4A4 and its correlation with the microsatellite instability in colorectal cancer
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1179120
PMID:37152025
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研究论文 | 本研究探讨了与微卫星不稳定性相关的新生物标志物，以更好地预测结直肠癌的预后和指导药物治疗 | 确认了SLC4A4作为肿瘤抑制基因，其表达显著降低并与微卫星不稳定性呈正相关，可以在结直肠癌治疗中联合应用 | 本研究的样本量和具体分析方法可能限制了结论的普遍适用性 | 旨在探索新的生物标志物以改善结直肠癌的预后预测 | 研究对象为结直肠癌患者和相关细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | PCR检测、单细胞测序、免疫组化 | Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 844个不同表达基因，涉及多个结直肠癌细胞系 |
| 722 | 2024-08-05 |
The effects of mechanical force on fibroblast behavior in cutaneous injury
2023, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2023.1167067
PMID:37143767
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研究论文 | 本文章回顾了机械力对皮肤损伤中成纤维细胞行为的影响。 | 揭示了涉及机械感知的蛋白质及其下游通路如何影响伤口愈合和疤痕形成。 | 研究中动物模型的结果可能不完全适用于人类情况。 | 探讨机械信号在病理性疤痕形成中的作用及其潜在的临床治疗策略。 | 聚焦于皮肤伤口愈合过程中的成纤维细胞及其转变为肌成纤维细胞的行为。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 723 | 2024-08-05 |
Dissecting order amidst chaos of programmed cell deaths: construction of a diagnostic model for KIRC using transcriptomic information in blood-derived exosomes and single-cell multi-omics data in tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1130513
PMID:37153569
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研究论文 | 本文章构建了一个基于转录组信息的肾脏肿瘤（KIRC）诊断模型 | 首次结合了编程性细胞死亡相关基因与单细胞多组学数据构建KIRC的诊断模型 | 未明确指出具体限制 | 探讨KIRC的发病机制和改进其诊断方法 | 使用KIRC患者的血液来源外泌体的转录组信息进行研究 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了1428个样本和216155个单细胞 |
| 724 | 2024-08-08 |
The regeneration-responsive element careg monitors activation of Müller glia after MNU-induced damage of photoreceptors in the zebrafish retina
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1160707
PMID:37138703
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研究论文 | 本文研究了斑马鱼视网膜中光感受器受损后Müller胶质细胞的再生响应元素careg的激活情况。 | 首次发现转录报告因子careg参与斑马鱼视网膜的修复过程，并揭示了Müller胶质细胞在再生过程中的分子特征和异质性响应。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，其结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证。 | 探讨斑马鱼视网膜光感受器受损后Müller胶质细胞的再生机制。 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞和光感受器。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼视网膜中的多个细胞类型 |
| 725 | 2024-08-08 |
Transcriptional networks of transient cell states during human prefrontal cortex development
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1126438
PMID:37138706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序数据，探讨了人类前额叶皮层发育过程中的不同短暂细胞状态及其基因调控网络 | 本研究首次揭示了前额叶皮层发育中的独特中间状态和特定的基因相互作用网络，并验证了在少突胶质细胞前体细胞谱系指定中的关键基因调控成分 | NA | 阐明人类前额叶皮层发育过程中的细胞异质性及其分子调控机制 | 人类前额叶皮层的发育过程及其细胞状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 胎儿阶段的人类前额叶皮层样本 |
| 726 | 2024-08-08 |
Synergistic effect of CD47 blockade in combination with cordycepin treatment against cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1144330
PMID:37138855
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研究论文 | 本研究探讨了冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 首次展示了冬虫夏草素与抗CD47抗体联合治疗能够显著增强肿瘤抑制效果，并调节肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞的比例 | NA | 研究冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 消化道恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 727 | 2024-08-08 |
Macrophage-derived exosome promotes regulatory T cell differentiation in malignant pleural effusion
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1161375
PMID:37143656
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中促进调节性T细胞分化的作用 | 首次明确了巨噬细胞及其分泌的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节活性和功能 | NA | 探讨巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节作用 | 巨噬细胞、外泌体、T细胞及恶性胸腔积液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、miRNA微阵列 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 728 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of NK Marker Genes in Ovarian Cancer by scRNA-seq Combined with WGCNA Algorithm
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/6845701
PMID:37144238
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合WGCNA算法，鉴定和验证了卵巢癌中的NK细胞标记基因，并构建了预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 首次利用单细胞RNA测序和WGCNA算法筛选NK细胞标记基因，并构建了基于这些基因的预测模型，用于预测患者的临床结局和治疗策略 | NA | 鉴定和验证卵巢癌中的NK细胞标记基因，并开发预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 卵巢癌样本中的NK细胞标记基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | RNA | 总共包括1793个样本 |
| 729 | 2024-08-08 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal extracellular matrix mechanical regulation of lipid metabolism reprograming through YAP/TEAD4/ACADL axis in hepatocellular carcinoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.82177
PMID:37151879
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，揭示了细胞外基质机械调控通过YAP/TEAD4/ACADL轴影响肝细胞癌中脂质代谢重编程的机制 | 发现ACADL作为机械反应酶，通过细胞外基质硬度的增加激活YAP/TEAD4转录复合体，从而在转录水平上抑制ACADL，影响肝细胞癌中的脂质代谢 | NA | 研究细胞外基质硬度对肝细胞癌代谢失调的影响及其分子机制 | 肝细胞癌样本及其代谢途径 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | TCGA-LIHC数据库（n=374）和GEO数据集（GSE14520） |
| 730 | 2024-08-08 |
Receptor-ligand pair typing and prognostic risk model of response or resistance to immune checkpoint inhibitors in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1170942
PMID:37152010
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研究论文 | 研究探讨了肺腺癌（LUAD）中免疫检查点抑制剂反应或抵抗的受体-配体对类型及预测模型 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，揭示了免疫疗法反应或抵抗的转录特征，并基于LASSO Cox回归分析确定了新的预测性生物标志物 | NA | 探索免疫疗法机制并识别肺腺癌中的新治疗机会 | 肺腺癌患者对PD-1靶向治疗的反应 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA | 涉及对PD-1治疗有反应和无反应的患者的样本 |
| 731 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of peripheral blood and muscle cells reveals inflammatory features of juvenile dermatomyositis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1166017
PMID:37152289
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合生物信息学分析，探讨了幼年皮肌炎患者外周血和肌肉组织中细胞类型、细胞组成和转录组动态变化 | 首次详细分析了幼年皮肌炎相关免疫细胞的动态变化，并识别了与炎症相关的特定细胞亚型 | NA | 旨在研究幼年皮肌炎中外周血和肌肉组织的细胞类型、细胞组成和转录组动态变化，以阐明免疫细胞在发病机制中的作用 | 幼年皮肌炎患者的外周血和肌肉组织 | 数字病理学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,859个细胞 |
| 732 | 2024-08-08 |
Identification of cuproptosis-related biomarkers in dilated cardiomyopathy and potential therapeutic prediction of herbal medicines
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1154920
PMID:37168258
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研究论文 | 本研究探讨了扩张型心肌病（DCM）中铜死亡相关生物标志物的识别及其对中草药潜在治疗效果的预测 | 本研究首次系统地阐明了铜死亡与DCM病理特征之间的复杂关系，并识别了两个关键基因（FDX1和SLC31A1）及两种天然化合物（Rutin和Polydatin） | NA | 旨在理解DCM中铜死亡的生物学机制，并为药物开发提供依据 | DCM患者的心脏组织及中草药的治疗潜力 | 数字病理学 | 心血管疾病 | LASSO, RF, SVM-RFE, XGBoost, WGCNA, AUCell, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 基因表达数据, scRNA-seq数据 | DCM数据集来自Gene Expression Omnibus，具体样本数量未详细说明 |
| 733 | 2024-08-08 |
Identification of Cuproptosis-Related Subtypes, Establishment of a Prognostic Signature and Characterization of the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S404847
PMID:37168531
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法，探讨了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，以评估胃癌患者的预后和肿瘤微环境特征。 | 首次全面讨论了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，用于预测胃癌患者的预后和个性化治疗。 | NA | 探讨铜死亡与胃癌的相关性，并建立预后预测模型。 | 胃癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序, 实时定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 大量胃癌患者队列 |
| 734 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals immune infiltrate in sepsis
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1133145
PMID:37113759
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研究论文 | 本研究探讨了与脓毒症中免疫细胞浸润丰度相关的枢纽基因 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了脓毒症中的免疫浸润特征 | 未提及具体的样本来源和实验条件的局限 | 探索脓毒症中免疫细胞浸润的相关基因 | 脓毒症样本与正常样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组学 | t-SNE | 基因表达数据 | 61个脓毒症样本与正常样本 |
| 735 | 2024-08-05 |
Inferring spatial transcriptomics markers from whole slide images to characterize metastasis-related spatial heterogeneity of colorectal tumors: A pilot study
2023, Journal of pathology informatics
DOI:10.1016/j.jpi.2023.100308
PMID:37114077
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研究论文 | 本研究通过全切片图像推断空间转录组标记，以表征与结直肠肿瘤转移相关的空间异质性 | 提出了一种通过全切片图像推断RNA模式的新的预测转录组数据的方法 | 结果表明变换器和图卷积网络无法超越卷积神经网络，且对相关疾病基因的性能表现不佳 | 研究转录组数据与结直肠肿瘤转移的关系 | 来自4位III期（pT3）匹配结直肠癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组技术（Visium） | 卷积神经网络、变换器和图卷积网络 | 图像 | 4位III期结直肠癌患者的组织样本 |
| 736 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals the heterogeneity and FGG+CRP+ inflammatory cancer-associated fibroblasts replace islets in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1112576
PMID:37124494
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术揭示了胰腺癌中肿瘤微环境的空间异质性和炎症相关成纤维细胞的特征 | 首次展示了FGG+CRP+炎症相关成纤维细胞在胰腺导管腺癌中替代胰岛的现象 | 仅分析了有限的样本和空间位置，可能无法全面代表所有情况 | 探讨胰腺癌中的肿瘤微环境空间异质性 | 正常胰腺组织、胰腺癌组织、相邻肿瘤组织和肿瘤基质 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | t-分布随机邻居嵌入 | 基因表达数据 | 分析了18,075个空间点 |
| 737 | 2024-08-05 |
Construction of cancer- associated fibroblasts related risk signature based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data in bladder urothelial carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1170893
PMID:37124542
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研究论文 | 本研究构建了基于癌症相关成纤维细胞的风险标志，以解读膀胱尿路癌的免疫景观并筛选合适的治疗方案 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序数据构建膀胱尿路癌的CAFs风险标志 | 尚未在临床环境中验证风险标志的广泛适用性 | 研究膀胱尿路癌中的CAFs特征并建立CAFs风险标志 | 膀胱尿路癌样本及相关CAFs基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，RNA-seq | Cox回归，LASSO回归 | 基因数据 | 涉及124个CAF相关基因 |
| 738 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis reveals a macrophage-related marker gene signature for prognostic prediction, immune landscape, genomic heterogeneity, and drug choices in prostate cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1122670
PMID:37122696
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研究论文 | 本研究揭示了一种与巨噬细胞相关的标记基因签名在前列腺癌预后预测中的应用价值 | 通过多组学分析构建了9个基因的巨噬细胞相关标记基因预后签名，提供了新的视角和理论基础 | 未提及具体的局限性 | 探讨巨噬细胞相关网络在前列腺癌预后和治疗中的价值 | 前列腺癌患者的巨噬细胞相关标记基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序，LASSO-Cox回归分析 | NA | 基因数据 | 307个巨噬细胞相关标记基因 |
| 739 | 2024-08-08 |
Gene length is a pivotal feature to explain disparities in transcript capture between single transcriptome techniques
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1144266
PMID:37122996
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研究论文 | 本文比较了三种不同器官（心脏、肺和肾脏）的单细胞和单核转录组技术，探讨了转录组输出差异及其对下游分析的影响 | 首次直接比较单细胞和单核RNA测序技术在转录组输出方面的差异，并发现基因长度和外显子含量是影响捕获效率的关键因素 | 研究仅限于三种器官，且仅比较了两种技术，未涵盖所有可能的技术和器官 | 探讨单细胞和单核RNA测序技术在转录组捕获方面的差异及其对下游分析的影响 | 三种不同器官（心脏、肺和肾脏）的单细胞和单核转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三种器官的单细胞和单核转录组数据 |
| 740 | 2024-08-08 |
The serum soluble scavenger with 5 domains levels: A novel biomarker for individuals with heart failure
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1140856
PMID:37123263
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研究论文 | 研究探讨血清可溶性清道夫含5个结构域（SSC5D）水平与心力衰竭（HF）之间的关系 | 发现SSC5D是心力衰竭的一个特异性反应，可能作为新型生物标志物和治疗靶点 | 研究为回顾性分析，且样本主要来自上海总医院，可能存在地域和样本选择的局限性 | 探索SSC5D作为心力衰竭生物标志物的潜力 | 心力衰竭患者及正常人的血清SSC5D水平 | NA | 心血管疾病 | 定量实时聚合酶链反应，单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 276名心力衰竭或正常患者，1755种分泌蛋白，小鼠心肌梗死或主动脉缩窄模型 |