单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2024-08-05 |
Identification of the metabolic state of surviving cardiomyocytes in the human infarcted heart by spatial single-cell transcriptomics
2023 Jan-Mar, Cardiology plus
DOI:10.1097/CP9.0000000000000038
PMID:37187809
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研究论文 | 本研究使用空间单细胞RNA测序评估心肌梗死后幸存心肌细胞的代谢状态 | 首次采用空间单细胞RNA测序分析人类心肌梗死心脏中幸存心肌细胞的代谢状态 | 没有提到研究的样本规模和患者的具体特征 | 研究幸存心肌细胞在心肌梗死后的人类心脏中的代谢状态 | 幸存的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 722 | 2024-08-05 |
High-Plex Spatial Profiling of RNA and Protein Using Digital Spatial Profiler
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3163-8_6
PMID:37191791
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研究论文 | 本文分享了使用数字空间分析仪(DSP)进行RNA和蛋白质的高通量空间分析的详细操作协议和要点 | 提出了优化数字空间分析仪(DSP)的工作程序的实用经验和操作规范 | 未提及具体的实验数据或样本分析 | 旨在为生物医学研究社区提供使用DSP的高效操作指南 | 数字空间分析技术在空间转录组学和蛋白质组学中的应用 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析仪(DSP) | NA | RNA和蛋白质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 723 | 2024-08-08 |
Analysis of candidate genes for cleft lip ± cleft palate using murine single-cell expression data
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1091666
PMID:37169019
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研究论文 | 本研究利用小鼠单细胞表达数据分析唇裂±腭裂候选基因的表达模式 | 引入单细胞RNA测序技术，提供高分辨率的胚胎小鼠面部数据资源，并展示其在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 | NA | 旨在聚合现有的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据，并为颅面研究社区提供这一资源，同时展示这些数据在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 | 唇裂±腭裂候选基因的表达模式 | 数字病理学 | 唇裂±腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 两个已发表的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 724 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiling Uncovers the Roles of Endometrial Fibrosis and Microenvironmental Changes in Adenomyosis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S402734
PMID:37179754
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨腺肌症中子宫内膜纤维化和微环境变化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了腺肌症中不同细胞类型的基因表达差异，并发现了与纤维化相关的异常基因表达 | 研究样本仅来自一位腺肌症患者，可能影响结果的普遍性 | 探究腺肌症的病理生理变化和分子机制 | 腺肌症患者的异位子宫内膜和正常子宫内膜 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 一位腺肌症患者及三位患者的样本用于验证 | NA | NA | NA | NA |
| 725 | 2024-08-08 |
Construction of a hypoxia-immune-related prognostic panel based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses in gastric cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140328
PMID:37180146
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个与胃癌中低氧和免疫相关的预后标志物面板 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，构建了胃癌中低氧相关的预后标志物面板，并评估了其对免疫浸润和免疫治疗预测的影响 | NA | 探索低氧在胃癌中的影响并建立一个低氧相关的预后标志物面板 | 胃癌中的低氧相关基因表达和免疫浸润 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, 免疫组化 | LASSO-COX回归分析 | RNA序列数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的胃癌单细胞和批量RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 726 | 2024-08-08 |
Immune heterogeneity in cardiovascular diseases from a single-cell perspective
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1057870
PMID:37180791
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review | 本文综述了从单细胞角度观察心血管疾病中免疫异质性的现象及其在三种心血管疾病中的表现 | 利用单细胞RNA测序等技术，系统性地探究免疫细胞亚群，提供了对免疫群体整合行为的深入理解 | 由于技术限制，动态免疫网络对心血管疾病的影响及其分子机制尚未完全揭示 | 增强对免疫异质性如何推动心血管疾病进展的理解，阐明免疫细胞亚群在疾病中的调控作用，指导新免疫疗法的开发 | 心血管疾病中的免疫细胞亚群及其在疾病进展中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 727 | 2024-08-08 |
Barcode demultiplexing of nanopore sequencing raw signals by unsupervised machine learning
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1067113
PMID:37181486
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研究论文 | 本文介绍了一种名为UNPLEX的新框架，用于通过直接操作记录的信号来解决纳米孔测序原始信号的条形码解复用问题 | UNPLEX结合了两种无监督机器学习方法：自动编码器和自组织映射（SOM），以提取记录信号的紧凑、潜在表示并进行聚类 | NA | 解决纳米孔测序中条形码解复用的问题 | 纳米孔测序的原始信号 | 机器学习 | NA | 纳米孔测序（ONT） | 自动编码器和自组织映射（SOM） | 信号 | 两个数据集，包含生成的类似ONT的信号 | NA | NA | NA | NA |
| 728 | 2024-08-08 |
Promising immunotherapeutic targets in lung cancer based on single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1148061
PMID:37187731
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在肺癌免疫治疗中的最新进展，特别是关注基质细胞，并提出了基于scRNA-seq识别的细胞标志物的肺癌免疫治疗预测性生物标志物和新靶点 | 利用scRNA-seq技术识别肿瘤微环境（TME）中的细胞标志物，为肺癌免疫治疗提供了新的靶点和策略 | NA | 提高肺癌患者对免疫治疗的反应 | 肺癌中的免疫治疗靶点 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 729 | 2024-08-08 |
Multicellular network analysis of melanoma heterogeneity by scRNA-seq
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193189
|
研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，绘制了人类黑色素瘤的细胞景观图 | 本研究首次通过构建细胞特异性网络（CSN）对每个细胞群体进行聚类和伪轨迹分析，提供了黑色素瘤免疫微环境的详细图谱 | NA | 揭示黑色素瘤的细胞类型组成和肿瘤免疫微环境 | 分析4645个细胞的转录组数据，来自19个黑色素瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 4645个细胞，来自19个黑色素瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 730 | 2024-08-08 |
Engineering and Modeling the Lung Mesenchyme
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-26625-6_8
PMID:37195530
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研究论文 | 本文探讨了肺间质细胞的结构及其在肺部功能中的作用，并介绍了使用单细胞RNA测序和生物工程方法研究肺间质细胞功能的新方法 | 利用单细胞RNA测序和遗传小鼠模型揭示了肺间质细胞的转录和功能异质性，并采用生物工程方法模拟组织结构以阐明间质细胞类型的功能和调控 | NA | 研究肺间质细胞的生物学特性和功能 | 肺间质细胞及其在肺部结构和功能中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及遗传小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 731 | 2024-08-05 |
Immune Cell Profiling of Atopic Dermatitis Patients Before and After Treatment with Halometasone Cream Wet-Wrap Therapy by Single-Cell Sequencing
2023 Jan-Feb, Indian journal of dermatology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/ijd.ijd_801_22
PMID:37151231
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术对特应性皮炎患者在治疗前后的外围血免疫细胞进行了分析 | 首次报道了特应性皮炎患者在使用氟氯噻吨乳膏湿包疗法前后的免疫细胞特征 | 样本数量仅限于两名患者，结果的普遍性需要更多研究来验证 | 研究特应性皮炎患者在治疗前后的免疫细胞特征变化 | 特应性皮炎患者 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 732 | 2024-08-05 |
Case report: Immune modulation after PD-1 inhibitor therapy in a patient with extranodal NK/T-cell lymphoma secondary to chronic active Epstein-Barr virus disease unveiled by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172307
PMID:37138889
|
病例报告 | 该文章描述了一个患有CAEBV的ENKTL患者在接受PD-1抑制剂治疗后免疫调节的案例 | 首次使用单细胞转录组学揭示了PD-1抑制剂治疗后患者淋巴细胞的显著增加，特别是自然杀伤细胞的活性 | 只报告了一个病例，无法广泛推广结果 | 探讨PD-1抑制剂治疗在EBV相关疾病中的疗效和安全性 | 一位因CAEBV并发的ENKTL患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1个病例 | NA | NA | NA | NA |
| 733 | 2024-08-05 |
Prognostic value of SLC4A4 and its correlation with the microsatellite instability in colorectal cancer
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1179120
PMID:37152025
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研究论文 | 本研究探讨了与微卫星不稳定性相关的新生物标志物，以更好地预测结直肠癌的预后和指导药物治疗 | 确认了SLC4A4作为肿瘤抑制基因，其表达显著降低并与微卫星不稳定性呈正相关，可以在结直肠癌治疗中联合应用 | 本研究的样本量和具体分析方法可能限制了结论的普遍适用性 | 旨在探索新的生物标志物以改善结直肠癌的预后预测 | 研究对象为结直肠癌患者和相关细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | PCR检测、单细胞测序、免疫组化 | Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 844个不同表达基因，涉及多个结直肠癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 734 | 2024-08-05 |
The effects of mechanical force on fibroblast behavior in cutaneous injury
2023, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2023.1167067
PMID:37143767
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研究论文 | 本文章回顾了机械力对皮肤损伤中成纤维细胞行为的影响。 | 揭示了涉及机械感知的蛋白质及其下游通路如何影响伤口愈合和疤痕形成。 | 研究中动物模型的结果可能不完全适用于人类情况。 | 探讨机械信号在病理性疤痕形成中的作用及其潜在的临床治疗策略。 | 聚焦于皮肤伤口愈合过程中的成纤维细胞及其转变为肌成纤维细胞的行为。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 735 | 2024-08-05 |
Dissecting order amidst chaos of programmed cell deaths: construction of a diagnostic model for KIRC using transcriptomic information in blood-derived exosomes and single-cell multi-omics data in tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1130513
PMID:37153569
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研究论文 | 本文章构建了一个基于转录组信息的肾脏肿瘤（KIRC）诊断模型 | 首次结合了编程性细胞死亡相关基因与单细胞多组学数据构建KIRC的诊断模型 | 未明确指出具体限制 | 探讨KIRC的发病机制和改进其诊断方法 | 使用KIRC患者的血液来源外泌体的转录组信息进行研究 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了1428个样本和216155个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 736 | 2024-08-08 |
The regeneration-responsive element careg monitors activation of Müller glia after MNU-induced damage of photoreceptors in the zebrafish retina
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1160707
PMID:37138703
|
研究论文 | 本文研究了斑马鱼视网膜中光感受器受损后Müller胶质细胞的再生响应元素careg的激活情况。 | 首次发现转录报告因子careg参与斑马鱼视网膜的修复过程，并揭示了Müller胶质细胞在再生过程中的分子特征和异质性响应。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，其结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证。 | 探讨斑马鱼视网膜光感受器受损后Müller胶质细胞的再生机制。 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞和光感受器。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼视网膜中的多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 737 | 2024-08-08 |
Transcriptional networks of transient cell states during human prefrontal cortex development
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1126438
PMID:37138706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序数据，探讨了人类前额叶皮层发育过程中的不同短暂细胞状态及其基因调控网络 | 本研究首次揭示了前额叶皮层发育中的独特中间状态和特定的基因相互作用网络，并验证了在少突胶质细胞前体细胞谱系指定中的关键基因调控成分 | NA | 阐明人类前额叶皮层发育过程中的细胞异质性及其分子调控机制 | 人类前额叶皮层的发育过程及其细胞状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 胎儿阶段的人类前额叶皮层样本 | NA | NA | NA | NA |
| 738 | 2024-08-08 |
Synergistic effect of CD47 blockade in combination with cordycepin treatment against cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1144330
PMID:37138855
|
研究论文 | 本研究探讨了冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 首次展示了冬虫夏草素与抗CD47抗体联合治疗能够显著增强肿瘤抑制效果，并调节肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞的比例 | NA | 研究冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 消化道恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 739 | 2024-08-08 |
Macrophage-derived exosome promotes regulatory T cell differentiation in malignant pleural effusion
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1161375
PMID:37143656
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中促进调节性T细胞分化的作用 | 首次明确了巨噬细胞及其分泌的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节活性和功能 | NA | 探讨巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节作用 | 巨噬细胞、外泌体、T细胞及恶性胸腔积液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、miRNA微阵列 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 740 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of NK Marker Genes in Ovarian Cancer by scRNA-seq Combined with WGCNA Algorithm
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/6845701
PMID:37144238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合WGCNA算法，鉴定和验证了卵巢癌中的NK细胞标记基因，并构建了预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 首次利用单细胞RNA测序和WGCNA算法筛选NK细胞标记基因，并构建了基于这些基因的预测模型，用于预测患者的临床结局和治疗策略 | NA | 鉴定和验证卵巢癌中的NK细胞标记基因，并开发预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 卵巢癌样本中的NK细胞标记基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | RNA | 总共包括1793个样本 | NA | NA | NA | NA |