单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1189 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
701 2024-08-07
Heme oxygenase-1 determines the cell fate of ferroptotic death of alveolar macrophages in COPD
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中肺泡巨噬细胞的铁死亡命运及其与疾病发展的关系 首次揭示了M2型肺泡巨噬细胞通过调节脂质和铁稳态影响铁死亡敏感性,而M1型肺泡巨噬细胞则表现出对铁死亡的抵抗性 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 探讨COPD中肺泡巨噬细胞的铁死亡机制及其对疾病发展的影响 COPD患者的肺组织和肺泡巨噬细胞 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 包括25名额外受试者和RAW 264.7巨噬细胞,以及实验性香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型
702 2024-08-07
Comprehensive Analyses Reveal Effects on Tumor Immune Infiltration and Immunotherapy Response of APOBEC Mutagenesis and Its Molecular Mechanisms in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本文通过收集169名食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的匹配多组学数据,利用多种生物信息学方法评估APOBEC突变对肿瘤免疫浸润和免疫治疗反应的影响及其分子机制 首次发现AOBEC3A活性主要由FOSL1转激活,并通过上调加剧细胞质双链DNA积累,从而刺激cGAS-STING途径 NA 探讨APOBEC突变在食管鳞状细胞癌中的功能角色及其对免疫治疗的影响 食管鳞状细胞癌患者的免疫浸润和免疫治疗反应 数字病理学 食管鳞状细胞癌 RNA测序(scRNA-seq) NA 多组学数据 169名食管鳞状细胞癌患者
703 2024-08-07
C-C motif chemokine receptor 2 inhibition reduces liver fibrosis by restoring the immune cell landscape
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了C-C基序趋化因子受体2(CCR2)抑制通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的机制 本研究揭示了CVC通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的新机制,并抑制了CCR2-STAT1/NFκB/ERK信号通路中的促纤维化基因转录 NA 探讨CCR2抑制减轻肝纤维化的机制 肝纤维化及其相关机制 NA 肝病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 野生型小鼠和敲除小鼠
704 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood reveals immune cell dysfunction in premature ovarian insufficiency
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了早发性卵巢功能不全(POI)患者外周血单个核细胞(PBMC)的特征,探讨了免疫反应在POI中的潜在作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了POI患者PBMC中免疫细胞的功能障碍,并识别了相关的差异表达基因和细胞间通讯变化 研究样本量较小,仅包括三名正常受试者和三名POI患者 分析POI患者外周血单个核细胞的特征,探索免疫系统在POI中的作用 早发性卵巢功能不全(POI)患者的外周血单个核细胞(PBMC) 数字病理学 妇科疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 三名正常受试者和三名POI患者
705 2024-08-08
Machine learning-based glycolysis-associated molecular classification reveals differences in prognosis, TME, and immunotherapy for colorectal cancer patients
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过结合转录组和单细胞分析,利用机器学习方法基于糖酵解相关基因在结直肠癌中识别新的分子亚型,为结直肠癌患者提供治疗方向 首次探讨了糖酵解相关基因在结直肠癌中的整体意义及其对免疫微环境的影响,并开发了基于单细胞和糖酵解相关簇的预测模型 NA 研究糖酵解相关基因在结直肠癌中的作用及其对免疫微环境的影响 结直肠癌患者的糖酵解相关基因表达模式及其与免疫微环境的关系 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序分析 机器学习方法 转录组数据 NA
706 2024-08-05
Global Single-Cell Sequencing Landscape of Adipose Tissue of Different Anatomical Site Origin in Humans
2023, Stem cells international IF:3.8Q2
研究论文 本研究结合了不同解剖部位来源的人类脂肪组织的单细胞RNA测序,探讨其细胞水平的差异 本研究首次揭示了不同解剖部位来源的脂肪组织中的细胞类型差异及其生物信号通路的变化 研究依赖于公共数据库的数据,可能存在数据来源的偏差 研究不同解剖部位来源的脂肪组织在慢性难愈合创伤治疗中的作用 本研究对象为人类腿部和腹部的皮下脂肪组织样本 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA RNA序列数据 包括腿部和腹部皮下脂肪组织样本及公共数据库中的内脏脂肪组织样本
707 2024-08-05
Ribosomal proteins are blood biomarkers and associated with CD4+ T cell activation in Alzheimer's disease: a study based on machine learning strategies and scRNA-Seq data validation
2023, American journal of translational research IF:1.7Q4
PMID:37193138
研究论文 本文揭示了核糖体蛋白作为阿尔茨海默病的血液生物标志物,并与CD4+ T细胞激活相关 提出了核糖体蛋白作为新的生物标志物,并通过机器学习方法建立了诊断模型 研究可能受限于样本的公共数据库以及可能的外部验证不足 旨在识别与阿尔茨海默病相关的血液标志物并评估其诊断能力 阿尔茨海默病相关的外周血样本及其核糖体蛋白 机器学习 阿尔茨海默病 RNA测序(scRNA-Seq) lightGBM 血液样本 来自公共数据库的四个大样本和单细胞RNA测序外周血样本
708 2024-08-05
Identification of the metabolic state of surviving cardiomyocytes in the human infarcted heart by spatial single-cell transcriptomics
2023 Jan-Mar, Cardiology plus
研究论文 本研究使用空间单细胞RNA测序评估心肌梗死后幸存心肌细胞的代谢状态 首次采用空间单细胞RNA测序分析人类心肌梗死心脏中幸存心肌细胞的代谢状态 没有提到研究的样本规模和患者的具体特征 研究幸存心肌细胞在心肌梗死后的人类心脏中的代谢状态 幸存的心肌细胞 数字病理学 心血管疾病 空间单细胞RNA测序 NA RNA数据 NA
709 2024-08-05
High-Plex Spatial Profiling of RNA and Protein Using Digital Spatial Profiler
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文分享了使用数字空间分析仪(DSP)进行RNA和蛋白质的高通量空间分析的详细操作协议和要点 提出了优化数字空间分析仪(DSP)的工作程序的实用经验和操作规范 未提及具体的实验数据或样本分析 旨在为生物医学研究社区提供使用DSP的高效操作指南 数字空间分析技术在空间转录组学和蛋白质组学中的应用 数字病理学 NA 数字空间分析仪(DSP) NA RNA和蛋白质数据 NA
710 2024-08-08
Analysis of candidate genes for cleft lip ± cleft palate using murine single-cell expression data
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用小鼠单细胞表达数据分析唇裂±腭裂候选基因的表达模式 引入单细胞RNA测序技术,提供高分辨率的胚胎小鼠面部数据资源,并展示其在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 NA 旨在聚合现有的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据,并为颅面研究社区提供这一资源,同时展示这些数据在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 唇裂±腭裂候选基因的表达模式 数字病理学 唇裂±腭裂 单细胞RNA测序 NA 表达数据 两个已发表的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据集
711 2024-08-08
Single-Cell Profiling Uncovers the Roles of Endometrial Fibrosis and Microenvironmental Changes in Adenomyosis
2023, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨腺肌症中子宫内膜纤维化和微环境变化的分子机制 首次通过单细胞RNA测序揭示了腺肌症中不同细胞类型的基因表达差异,并发现了与纤维化相关的异常基因表达 研究样本仅来自一位腺肌症患者,可能影响结果的普遍性 探究腺肌症的病理生理变化和分子机制 腺肌症患者的异位子宫内膜和正常子宫内膜 数字病理学 妇科疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 一位腺肌症患者及三位患者的样本用于验证
712 2024-08-08
Construction of a hypoxia-immune-related prognostic panel based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses in gastric cancer
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据,构建了一个与胃癌中低氧和免疫相关的预后标志物面板 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,构建了胃癌中低氧相关的预后标志物面板,并评估了其对免疫浸润和免疫治疗预测的影响 NA 探索低氧在胃癌中的影响并建立一个低氧相关的预后标志物面板 胃癌中的低氧相关基因表达和免疫浸润 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, 免疫组化 LASSO-COX回归分析 RNA序列数据 使用了来自GEO和TCGA数据库的胃癌单细胞和批量RNA测序数据
713 2024-08-08
Immune heterogeneity in cardiovascular diseases from a single-cell perspective
2023, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
review 本文综述了从单细胞角度观察心血管疾病中免疫异质性的现象及其在三种心血管疾病中的表现 利用单细胞RNA测序等技术,系统性地探究免疫细胞亚群,提供了对免疫群体整合行为的深入理解 由于技术限制,动态免疫网络对心血管疾病的影响及其分子机制尚未完全揭示 增强对免疫异质性如何推动心血管疾病进展的理解,阐明免疫细胞亚群在疾病中的调控作用,指导新免疫疗法的开发 心血管疾病中的免疫细胞亚群及其在疾病进展中的作用 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA
714 2024-08-08
Barcode demultiplexing of nanopore sequencing raw signals by unsupervised machine learning
2023, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了一种名为UNPLEX的新框架,用于通过直接操作记录的信号来解决纳米孔测序原始信号的条形码解复用问题 UNPLEX结合了两种无监督机器学习方法:自动编码器和自组织映射(SOM),以提取记录信号的紧凑、潜在表示并进行聚类 NA 解决纳米孔测序中条形码解复用的问题 纳米孔测序的原始信号 机器学习 NA 纳米孔测序(ONT) 自动编码器和自组织映射(SOM) 信号 两个数据集,包含生成的类似ONT的信号
715 2024-08-08
Promising immunotherapeutic targets in lung cancer based on single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在肺癌免疫治疗中的最新进展,特别是关注基质细胞,并提出了基于scRNA-seq识别的细胞标志物的肺癌免疫治疗预测性生物标志物和新靶点 利用scRNA-seq技术识别肿瘤微环境(TME)中的细胞标志物,为肺癌免疫治疗提供了新的靶点和策略 NA 提高肺癌患者对免疫治疗的反应 肺癌中的免疫治疗靶点 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
716 2024-08-08
Identification of TREM2-positive tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma: implication for poor prognosis and immunotherapy modulation
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在食管鳞状细胞癌中鉴定出一种新的TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群,并探讨其对患者预后和免疫治疗的影响 首次在食管鳞状细胞癌中发现TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群,并揭示其与不良预后和免疫治疗反应的关系 研究主要基于单细胞RNA测序数据和少量临床样本,需要更多临床数据验证 探讨食管鳞状细胞癌中TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群对患者预后和免疫治疗的影响 食管鳞状细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞亚群 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA RNA 包括48名黑色素瘤患者和80名食管鳞状细胞癌患者的样本
717 2024-08-08
Multicellular network analysis of melanoma heterogeneity by scRNA-seq
2023, American journal of translational research IF:1.7Q4
PMID:37193189
研究论文 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集,绘制了人类黑色素瘤的细胞景观图 本研究首次通过构建细胞特异性网络(CSN)对每个细胞群体进行聚类和伪轨迹分析,提供了黑色素瘤免疫微环境的详细图谱 NA 揭示黑色素瘤的细胞类型组成和肿瘤免疫微环境 分析4645个细胞的转录组数据,来自19个黑色素瘤组织 数字病理学 黑色素瘤 scRNA-seq NA 转录组数据 4645个细胞,来自19个黑色素瘤组织
718 2024-08-08
Engineering and Modeling the Lung Mesenchyme
2023, Advances in experimental medicine and biology
研究论文 本文探讨了肺间质细胞的结构及其在肺部功能中的作用,并介绍了使用单细胞RNA测序和生物工程方法研究肺间质细胞功能的新方法 利用单细胞RNA测序和遗传小鼠模型揭示了肺间质细胞的转录和功能异质性,并采用生物工程方法模拟组织结构以阐明间质细胞类型的功能和调控 NA 研究肺间质细胞的生物学特性和功能 肺间质细胞及其在肺部结构和功能中的作用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及遗传小鼠模型
719 2024-08-05
Immune Cell Profiling of Atopic Dermatitis Patients Before and After Treatment with Halometasone Cream Wet-Wrap Therapy by Single-Cell Sequencing
2023 Jan-Feb, Indian journal of dermatology IF:1.0Q4
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术对特应性皮炎患者在治疗前后的外围血免疫细胞进行了分析 首次报道了特应性皮炎患者在使用氟氯噻吨乳膏湿包疗法前后的免疫细胞特征 样本数量仅限于两名患者,结果的普遍性需要更多研究来验证 研究特应性皮炎患者在治疗前后的免疫细胞特征变化 特应性皮炎患者 数字病理学 特应性皮炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 2名患者
720 2024-08-05
Case report: Immune modulation after PD-1 inhibitor therapy in a patient with extranodal NK/T-cell lymphoma secondary to chronic active Epstein-Barr virus disease unveiled by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
病例报告 该文章描述了一个患有CAEBV的ENKTL患者在接受PD-1抑制剂治疗后免疫调节的案例 首次使用单细胞转录组学揭示了PD-1抑制剂治疗后患者淋巴细胞的显著增加,特别是自然杀伤细胞的活性 只报告了一个病例,无法广泛推广结果 探讨PD-1抑制剂治疗在EBV相关疾病中的疗效和安全性 一位因CAEBV并发的ENKTL患者 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 细胞 1个病例
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