单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2024-08-07 |
Different iPSC-derived neural stem cells shows various spectrums of spontaneous differentiation during long term cultivation
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1037902
PMID:37201156
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研究论文 | 本研究探讨了不同来源的iPSC衍生的神经干细胞在长期培养过程中自发分化的谱系变化 | 首次详细分析了不同iPSC衍生神经干细胞在长期培养中的自发分化谱系变化 | 研究仅限于体外培养条件，未涉及体内环境的影响 | 旨在优化神经干细胞的生产和长期培养协议 | 不同来源的iPSC衍生的神经干细胞 | 干细胞研究 | 神经退行性疾病 | 免疫细胞化学、qPCR、bulk转录组和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 四条不同的iPSC细胞系 |
| 702 | 2024-08-07 |
Classification of tuberculosis-related programmed cell death-related patient subgroups and associated immune cell profiling
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1159713
PMID:37205113
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研究论文 | 本研究通过分析结核病（TB）相关数据集中的免疫细胞谱，识别并验证了与程序性细胞死亡（PCD）相关的基因表达模式，以此来分层TB患者并探讨其与免疫细胞丰度的关系 | 首次通过机器学习方法筛选出与PCD相关的关键基因，并利用这些基因对TB患者进行分层，进一步验证了这些分层在独立数据集中的有效性 | 研究主要基于公共数据库的数据，未来需要更多的临床样本验证这些发现 | 旨在通过PCD相关基因的表达模式来分层TB患者，并探讨其与免疫细胞丰度的关系，为TB的诊断和治疗提供新的策略 | 结核病患者及其PCD相关基因表达模式 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 基因表达数据 | TB患者样本 |
| 703 | 2024-08-07 |
Bayesian Data Selection
2023, Journal of machine learning research : JMLR
IF:4.3Q2
PMID:37206375
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研究论文 | 本文介绍了“数据选择”问题，并提出了一种新的评分方法——Stein体积准则（SVC），用于在高维数据中发现与给定参数模型匹配的低维统计量 | 提出了Stein体积准则（SVC），这是一种不需拟合非参数模型的新型数据选择评分方法 | NA | 旨在解决高维数据中数据选择的问题，并提出一种新的评分方法以提高效率和统计性能 | 高维数据和单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率主成分分析和自旋玻璃模型 | 高维数据 | NA |
| 704 | 2024-08-07 |
TYROBP-positive endothelial cell-derived TWEAK as a promoter of osteosarcoma progression: insights from single-cell omics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1200203
PMID:37207157
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研究论文 | 本研究探讨了TYROBP阳性内皮细胞在骨肉瘤进展中的作用，特别是通过分泌TWEAK介导的与恶性细胞的相互作用 | 首次揭示了TYROBP阳性内皮细胞作为骨肉瘤进展的启动细胞，并通过TWEAK介导与恶性细胞的强相互作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组数据，需要进一步的体内实验验证 | 探索骨肉瘤中内皮细胞的启动细胞及其与恶性细胞的潜在相互作用 | 骨肉瘤中的内皮细胞及其与恶性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名骨肉瘤患者 |
| 705 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a novel signature based on cell-cell communication in head and neck squamous cell carcinoma by integrated analysis of single-cell transcriptome and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1136729
PMID:37213285
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和批量RNA测序数据，识别并验证了基于细胞间通讯的头颈鳞状细胞癌（HNSCC）新型标志物。 | 开发了一种基于细胞间通讯相关基因的新型标志物，具有强大的预测HNSCC患者预后和免疫治疗反应的能力。 | NA | 研究HNSCC肿瘤免疫微环境中复杂的通讯网络，阐明免疫细胞与肿瘤之间的相互作用，并建立预后风险模型。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的细胞间通讯网络及其对患者临床结果的影响。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20个HNSCC样本 |
| 706 | 2024-08-07 |
Metabolic profiling reveals altered tryptophan metabolism in patients with kawasaki disease
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1180537
PMID:37214338
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研究论文 | 研究探讨了川崎病患者的代谢变化，特别是色氨酸代谢，以确定新的诊断和预后生物标志物 | 发现了川崎病患者中色氨酸代谢途径的显著改变，并提出代谢指标可能作为新的诊断和治疗生物标志物 | NA | 研究川崎病患者的代谢变化，寻找新的诊断和预后生物标志物 | 川崎病患者和健康对照组的色氨酸代谢 | 代谢组学 | 川崎病 | 代谢组学 | NA | 代谢物数据 | 包括川崎病患者和健康对照组，以及川崎病冠状动脉炎小鼠模型 |
| 707 | 2024-08-07 |
Assessing the effects of aging on the renal endothelial cell landscape using single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1175716
PMID:37214419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了衰老对小鼠肾脏内皮细胞转录组的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了衰老过程中肾脏内皮细胞的转录组变化，并确认了免疫调节信号的变化 | NA | 探究衰老对肾脏内皮细胞的影响及其机制 | 小鼠肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 708 | 2024-08-07 |
Heme oxygenase-1 determines the cell fate of ferroptotic death of alveolar macrophages in COPD
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162087
PMID:37215140
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中肺泡巨噬细胞的铁死亡命运及其与疾病发展的关系 | 首次揭示了M2型肺泡巨噬细胞通过调节脂质和铁稳态影响铁死亡敏感性，而M1型肺泡巨噬细胞则表现出对铁死亡的抵抗性 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨COPD中肺泡巨噬细胞的铁死亡机制及其对疾病发展的影响 | COPD患者的肺组织和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 包括25名额外受试者和RAW 264.7巨噬细胞，以及实验性香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型 |
| 709 | 2024-08-07 |
Comprehensive Analyses Reveal Effects on Tumor Immune Infiltration and Immunotherapy Response of APOBEC Mutagenesis and Its Molecular Mechanisms in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.83824
PMID:37215984
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研究论文 | 本文通过收集169名食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的匹配多组学数据，利用多种生物信息学方法评估APOBEC突变对肿瘤免疫浸润和免疫治疗反应的影响及其分子机制 | 首次发现AOBEC3A活性主要由FOSL1转激活，并通过上调加剧细胞质双链DNA积累，从而刺激cGAS-STING途径 | NA | 探讨APOBEC突变在食管鳞状细胞癌中的功能角色及其对免疫治疗的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的免疫浸润和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | RNA测序（scRNA-seq） | NA | 多组学数据 | 169名食管鳞状细胞癌患者 |
| 710 | 2024-08-07 |
C-C motif chemokine receptor 2 inhibition reduces liver fibrosis by restoring the immune cell landscape
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.83530
PMID:37215993
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研究论文 | 本研究探讨了C-C基序趋化因子受体2（CCR2）抑制通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的机制 | 本研究揭示了CVC通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的新机制，并抑制了CCR2-STAT1/NFκB/ERK信号通路中的促纤维化基因转录 | NA | 探讨CCR2抑制减轻肝纤维化的机制 | 肝纤维化及其相关机制 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 野生型小鼠和敲除小鼠 |
| 711 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood reveals immune cell dysfunction in premature ovarian insufficiency
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1129657
PMID:37223018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了早发性卵巢功能不全（POI）患者外周血单个核细胞（PBMC）的特征，探讨了免疫反应在POI中的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了POI患者PBMC中免疫细胞的功能障碍，并识别了相关的差异表达基因和细胞间通讯变化 | 研究样本量较小，仅包括三名正常受试者和三名POI患者 | 分析POI患者外周血单个核细胞的特征，探索免疫系统在POI中的作用 | 早发性卵巢功能不全（POI）患者的外周血单个核细胞（PBMC） | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 三名正常受试者和三名POI患者 |
| 712 | 2024-08-08 |
Machine learning-based glycolysis-associated molecular classification reveals differences in prognosis, TME, and immunotherapy for colorectal cancer patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181985
PMID:37228620
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研究论文 | 本文通过结合转录组和单细胞分析，利用机器学习方法基于糖酵解相关基因在结直肠癌中识别新的分子亚型，为结直肠癌患者提供治疗方向 | 首次探讨了糖酵解相关基因在结直肠癌中的整体意义及其对免疫微环境的影响，并开发了基于单细胞和糖酵解相关簇的预测模型 | NA | 研究糖酵解相关基因在结直肠癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者的糖酵解相关基因表达模式及其与免疫微环境的关系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习方法 | 转录组数据 | NA |
| 713 | 2024-08-05 |
Global Single-Cell Sequencing Landscape of Adipose Tissue of Different Anatomical Site Origin in Humans
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/8282961
PMID:37197688
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研究论文 | 本研究结合了不同解剖部位来源的人类脂肪组织的单细胞RNA测序，探讨其细胞水平的差异 | 本研究首次揭示了不同解剖部位来源的脂肪组织中的细胞类型差异及其生物信号通路的变化 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据来源的偏差 | 研究不同解剖部位来源的脂肪组织在慢性难愈合创伤治疗中的作用 | 本研究对象为人类腿部和腹部的皮下脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 包括腿部和腹部皮下脂肪组织样本及公共数据库中的内脏脂肪组织样本 |
| 714 | 2024-08-05 |
Ribosomal proteins are blood biomarkers and associated with CD4+ T cell activation in Alzheimer's disease: a study based on machine learning strategies and scRNA-Seq data validation
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193138
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研究论文 | 本文揭示了核糖体蛋白作为阿尔茨海默病的血液生物标志物，并与CD4+ T细胞激活相关 | 提出了核糖体蛋白作为新的生物标志物，并通过机器学习方法建立了诊断模型 | 研究可能受限于样本的公共数据库以及可能的外部验证不足 | 旨在识别与阿尔茨海默病相关的血液标志物并评估其诊断能力 | 阿尔茨海默病相关的外周血样本及其核糖体蛋白 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | RNA测序（scRNA-Seq） | lightGBM | 血液样本 | 来自公共数据库的四个大样本和单细胞RNA测序外周血样本 |
| 715 | 2024-08-05 |
Identification of the metabolic state of surviving cardiomyocytes in the human infarcted heart by spatial single-cell transcriptomics
2023 Jan-Mar, Cardiology plus
DOI:10.1097/CP9.0000000000000038
PMID:37187809
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研究论文 | 本研究使用空间单细胞RNA测序评估心肌梗死后幸存心肌细胞的代谢状态 | 首次采用空间单细胞RNA测序分析人类心肌梗死心脏中幸存心肌细胞的代谢状态 | 没有提到研究的样本规模和患者的具体特征 | 研究幸存心肌细胞在心肌梗死后的人类心脏中的代谢状态 | 幸存的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 716 | 2024-08-05 |
High-Plex Spatial Profiling of RNA and Protein Using Digital Spatial Profiler
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3163-8_6
PMID:37191791
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研究论文 | 本文分享了使用数字空间分析仪(DSP)进行RNA和蛋白质的高通量空间分析的详细操作协议和要点 | 提出了优化数字空间分析仪(DSP)的工作程序的实用经验和操作规范 | 未提及具体的实验数据或样本分析 | 旨在为生物医学研究社区提供使用DSP的高效操作指南 | 数字空间分析技术在空间转录组学和蛋白质组学中的应用 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析仪(DSP) | NA | RNA和蛋白质数据 | NA |
| 717 | 2024-08-08 |
Analysis of candidate genes for cleft lip ± cleft palate using murine single-cell expression data
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1091666
PMID:37169019
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研究论文 | 本研究利用小鼠单细胞表达数据分析唇裂±腭裂候选基因的表达模式 | 引入单细胞RNA测序技术，提供高分辨率的胚胎小鼠面部数据资源，并展示其在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 | NA | 旨在聚合现有的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据，并为颅面研究社区提供这一资源，同时展示这些数据在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 | 唇裂±腭裂候选基因的表达模式 | 数字病理学 | 唇裂±腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 两个已发表的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据集 |
| 718 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiling Uncovers the Roles of Endometrial Fibrosis and Microenvironmental Changes in Adenomyosis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S402734
PMID:37179754
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨腺肌症中子宫内膜纤维化和微环境变化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了腺肌症中不同细胞类型的基因表达差异，并发现了与纤维化相关的异常基因表达 | 研究样本仅来自一位腺肌症患者，可能影响结果的普遍性 | 探究腺肌症的病理生理变化和分子机制 | 腺肌症患者的异位子宫内膜和正常子宫内膜 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 一位腺肌症患者及三位患者的样本用于验证 |
| 719 | 2024-08-08 |
Construction of a hypoxia-immune-related prognostic panel based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses in gastric cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140328
PMID:37180146
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个与胃癌中低氧和免疫相关的预后标志物面板 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，构建了胃癌中低氧相关的预后标志物面板，并评估了其对免疫浸润和免疫治疗预测的影响 | NA | 探索低氧在胃癌中的影响并建立一个低氧相关的预后标志物面板 | 胃癌中的低氧相关基因表达和免疫浸润 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, 免疫组化 | LASSO-COX回归分析 | RNA序列数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的胃癌单细胞和批量RNA测序数据 |
| 720 | 2024-08-08 |
Immune heterogeneity in cardiovascular diseases from a single-cell perspective
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1057870
PMID:37180791
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review | 本文综述了从单细胞角度观察心血管疾病中免疫异质性的现象及其在三种心血管疾病中的表现 | 利用单细胞RNA测序等技术，系统性地探究免疫细胞亚群，提供了对免疫群体整合行为的深入理解 | 由于技术限制，动态免疫网络对心血管疾病的影响及其分子机制尚未完全揭示 | 增强对免疫异质性如何推动心血管疾病进展的理解，阐明免疫细胞亚群在疾病中的调控作用，指导新免疫疗法的开发 | 心血管疾病中的免疫细胞亚群及其在疾病进展中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |