单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-07 |
Deciphering the single-cell transcriptome network in keloids with intra-lesional injection of triamcinolone acetonide combined with 5-fluorouracil
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1106289
PMID:37275903
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了三胺环己酮（TAC）与5-氟尿嘧啶（5-FU）联合注射治疗瘢痕疙瘩的基因表达调控和细胞重编程模式 | 本研究揭示了TAC+5-FU通过中断成纤维细胞向促纤维化亚型的分化轨迹和抑制细胞间FGF信号通路，诱导瘢痕疙瘩萎缩，并刺激部分成纤维细胞具有自我复制和多向分化潜能 | 本研究未充分探讨TAC+5-FU抑制瘢痕疙瘩增殖的分子机制 | 阐明TAC+5-FU注射治疗瘢痕疙瘩的分子和细胞重编程机制 | 瘢痕疙瘩、皮肤及TAC+5-FU治疗后的瘢痕疙瘩 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 682 | 2024-08-07 |
Machine learning-based solution reveals cuproptosis features in inflammatory bowel disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1136991
PMID:37275904
|
研究论文 | 本文利用机器学习方法揭示了炎症性肠病中铜死亡特征的相关基因及其与免疫微环境的关系 | 首次系统研究了铜死亡相关基因在炎症性肠病中的临床意义及其与免疫微环境的关联 | NA | 探讨铜死亡在炎症性肠病中的作用及其相关基因作为免疫标志物和治疗靶点的潜力 | 铜死亡相关基因在炎症性肠病患者中的表达及其与免疫微环境的关系 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单样本GSEA (ssGSEA)、基因集富集分析 (GSEA)、基因集变异分析 (GSVA)、CIBERSORT、加权基因共表达网络分析 (WGCNA)、差异表达基因分析 (DEGs)、蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络构建、分子复合物检测 (MCODE) 算法、单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了多个基因表达数据集 (GSE75214, GSE36807, GSE10616) 和公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 683 | 2024-08-07 |
Upregulation of HCFC1 expression promoted hepatocellular carcinoma progression through inhibiting cell cycle arrest and correlated with immune infiltration
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.84579
PMID:37283799
|
研究论文 | 本文研究了宿主细胞因子1（HCFC1）在肝细胞癌（HCC）中的表达及其对预后和免疫特性的影响 | 首次揭示了HCFC1在HCC患者预后和免疫特性中的作用 | 研究主要基于TCGA数据集和150名HCC患者的队列，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨HCFC1在HCC中的表达及其对预后和免疫特性的影响 | HCFC1在HCC中的表达及其与细胞周期、免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 150名HCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 684 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals dysregulated inflammatory response in peripheral blood immunity in patients with acute respiratory distress syndrome
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1199122
PMID:37283946
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量测序技术，分析了健康志愿者和患有脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征（sep-ARDS）及肺炎相关急性呼吸窘迫综合征（PNE-ARDS）患者的外周血单核细胞转录组，揭示了不同病因ARDS在细胞和分子水平以及生物信号通路上的差异性改变 | 首次详细揭示了不同病因ARDS患者外周血免疫细胞亚群的动态变化及其在细胞凋亡、炎症和免疫相关通路中的作用 | NA | 确定不同病因急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的差异机制，以提高ARDS治疗的有效性 | 健康志愿者和患有脓毒症相关ARDS及肺炎相关ARDS患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序 | NA | 转录组数据 | 健康志愿者和不同病因ARDS患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 685 | 2024-08-07 |
Development of a novel copper metabolism-related risk model to predict prognosis and tumor microenvironment of patients with stomach adenocarcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1185418
PMID:37284310
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研究论文 | 本文开发了一种与铜代谢相关的新风险模型，用于预测胃腺癌患者的预后和肿瘤微环境特征 | 首次利用铜代谢相关基因（CMRGs）构建风险模型，并探讨其在胃腺癌预后和免疫治疗反应预测中的应用 | NA | 旨在识别铜代谢相关基因在胃腺癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 胃腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用TCGA数据库中的胃腺癌队列和GEO数据库中的GSE84437数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 686 | 2024-08-07 |
Risk prediction model construction for post myocardial infarction heart failure by blood immune B cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1163350
PMID:37287974
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研究论文 | 本研究通过分析心肌梗死患者的外周血单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个用于预测心肌梗死后心力衰竭风险的模型 | 发现了区分心肌梗死后心力衰竭患者与非心力衰竭患者的免疫激活B细胞亚型，并开发了一个包含13个标记基因的预测模型 | NA | 构建一个用于预测心肌梗死后心力衰竭风险的模型 | 心肌梗死患者的外周血样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括心肌梗死后发展为心力衰竭和未发展为心力衰竭的患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 687 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing technology in colorectal cancer: a new technology to disclose the tumor heterogeneity and target precise treatment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175343
PMID:37256123
|
综述 | 本文探讨了单细胞测序技术在结直肠癌中应用的潜力 | 介绍了单细胞测序如何揭示肿瘤的异质性并指导精准治疗 | 未提及具体实验数据或样本分析 | 旨在更好地理解结直肠癌的发展和转移机制 | 分析结直肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组序列信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2024-08-05 |
Single-nucleus ribonucleic acid-sequencing and spatial transcriptomics reveal the cardioprotection of Shexiang Baoxin Pill (SBP) in mice with myocardial ischemia-reperfusion injury
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1173649
PMID:37229263
|
研究论文 | 本研究探讨了雪香百补丸（SBP）在小鼠心肌缺血再灌注损伤中的心脏保护机制 | 该研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学首次揭示了SBP对心肌缺血再灌注损伤的保护作用及其相关的细胞机制 | 研究主要是在小鼠模型中进行的，尚需在人类或其他动物模型中验证结果 | 探讨雪香百补丸在心肌缺血再灌注损伤中的潜在机制 | C57BL/6小鼠样本，使用心肌缺血再灌注模型进行研究 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞数据 | 9个样本来自9个个体，获得了75,546个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 689 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Reactive astrogliosis in the era of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1212975
PMID:37256151
|
更正 | 本文为先前发表文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 690 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptomic analysis and meta-analysis identify therapeutic effects of N-acetylcysteine in nonalcoholic fatty liver disease
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1186582
PMID:37256235
|
meta-analysis | 本研究通过转录组学分析和元分析探讨了N-乙酰半胱氨酸在非酒精性脂肪肝病中的治疗作用 | 本研究首次系统评估了N-乙酰半胱氨酸在非酒精性脂肪肝病中的疗效，并提供了转录组学数据支持 | 本研究仅基于13项临床前研究，可能不足以得出全面的结论 | 调查N-乙酰半胱氨酸在非酒精性脂肪肝病中的疗效 | 临床前研究中的多项关于N-乙酰半胱氨酸的研究 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 13项研究 | NA | NA | NA | NA |
| 691 | 2024-08-05 |
Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analyses for Studies of Spermatogonia
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3139-3_4
PMID:37249866
|
研究论文 | 本文介绍了用于研究哺乳动物睾丸转录组的批量和单细胞RNA测序分析方法 | 提出了针对大量和单个细胞的RNA测序的生物信息学工作流程的稳健选项 | 未提及具体的限制 | 研究睾丸转录组的转录物丰度 | 涉及数百到数百万个细胞的样本以及单个细胞 | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | mRNA | 数百到数百万个细胞的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 692 | 2024-08-07 |
Cellular dynamics of distinct skeletal cells and the development of osteosarcoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1181204
PMID:37229448
|
综述 | 本文综述了不同骨骼细胞的动态变化及其在骨肉瘤发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序分析和小鼠谱系追踪方法揭示了骨骼干细胞及其谱系细胞的多样性 | 骨肉瘤的起源尚未完全阐明，对整个骨骼细胞多样性和动态的了解不足 | 探讨多种骨骼细胞类型的多样性和动态，以及骨肉瘤在原生环境中的起源 | 骨骼干细胞、前体细胞、成骨细胞、软骨细胞、骨髓基质细胞和脂肪细胞等骨骼细胞类型 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 693 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and traditional RNA sequencing reveals the role of cancer-associated fibroblasts in oral squamous cell carcinoma cohort
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1195520
PMID:37234985
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和传统RNA测序，探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）与牙周病之间的潜在关联，并构建了基于癌症相关成纤维细胞（CAFs）的风险模型。 | 本研究首次构建了基于CAFs的牙周病相关风险模型，并通过单细胞RNA测序获得了CAFs的生物标志物。 | NA | 探索口腔鳞状细胞癌与牙周病之间的潜在关联，并构建相关的风险模型。 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者及癌症相关成纤维细胞（CAFs）。 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析，COX回归分析 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 694 | 2024-08-07 |
Single-Molecule Fluorescence In Situ Hybridization for Spatial Detection of mRNAs in Sections of Mammalian Testes
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3139-3_3
PMID:37249865
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研究论文 | 本文介绍了一种结合单分子荧光原位杂交（smFISH）和间接免疫荧光（IIF）的方法，用于在小鼠睾丸切片中同时可视化mRNA和蛋白质 | 本文采用RNAscope方法进行多重smFISH，并与IIF结合，提高了检测的特异性和与单细胞RNA测序（scRNA-seq）的一致性 | NA | 验证并空间重映射在分离细胞中描述的mRNA表达模式到其原始组织 | 小鼠睾丸组织中的mRNA和蛋白质 | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | NA | 图像 | 涉及小鼠睾丸的冷冻切片 | NA | NA | NA | NA |
| 695 | 2024-08-07 |
Combined analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals the expression patterns of circadian rhythm disruption in the immune microenvironment of Alzheimer's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1182307
PMID:37251379
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研究论文 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了阿尔茨海默病免疫微环境中昼夜节律紊乱的表达模式 | 首次在单细胞水平上揭示了阿尔茨海默病微环境中基于昼夜节律紊乱的细胞亚型，并提出了一个强有力的昼夜节律紊乱特征签名用于阿尔茨海默病的诊断 | NA | 探索昼夜节律紊乱在阿尔茨海默病免疫微环境中的功能及其对疾病发展的影响 | 阿尔茨海默病患者的免疫微环境和昼夜节律相关基因的表达 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，RT-PCR | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 涉及阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据和批量转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 696 | 2024-08-07 |
CD16+ monocytes are involved in the hyper-inflammatory state of Prader-Willi Syndrome by single-cell transcriptomic analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1153730
PMID:37251380
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了CD16+单核细胞在Prader-Willi综合征（PWS）患者中过度炎症状态的作用 | 首次在单细胞水平上扩展了我们对PWS外周免疫细胞的了解 | NA | 探讨PWS患者中CD16+单核细胞在过度炎症状态中的作用 | PWS患者的外周免疫细胞 | NA | Prader-Willi综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和高维流式细胞术（CyTOF） | NA | 细胞 | 健康对照组13人，PWS患者10人，scRNA-seq和CyTOF分析中PWS患者6人，健康对照组12人 | NA | NA | NA | NA |
| 697 | 2024-08-07 |
Identification of the shared gene signatures and molecular mechanisms between multiple sclerosis and non-small cell lung cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1180449
PMID:37251402
|
研究论文 | 本研究旨在识别多发性硬化症（MS）和非小细胞肺癌（NSCLC）之间的共享基因特征和分子机制 | 本研究首次识别了MS和NSCLC之间最显著的共享基因PDE4A，并探讨了其在NSCLC患者中的表达及其对患者预后的影响和分子机制 | 本研究的局限性在于对MS和NSCLC之间分子机制的研究尚不完全 | 识别MS和NSCLC之间的共享基因特征、共享局部免疫微环境和分子机制 | 多发性硬化症（MS）和非小细胞肺癌（NSCLC） | NA | 多发性硬化症，非小细胞肺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集，包括GSE19188，GSE214334，GSE199460，和GSE148071 | NA | NA | NA | NA |
| 698 | 2024-08-07 |
Identification of a chemoresistance-related prognostic gene signature by comprehensive analysis and experimental validation in pancreatic cancer
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1132424
PMID:37251940
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研究论文 | 本研究通过综合分析和实验验证，在胰腺癌中识别出与化疗耐药相关的预后基因特征 | 开发了一个与化疗耐药相关的五基因特征，并构建了一个预测诺模图，该特征不仅是一个独立的预后因子，还是一个预测化疗耐药、肿瘤突变负荷和免疫细胞的生物标志物 | NA | 旨在识别调控化疗耐药的关键基因，并开发一个与化疗耐药相关的基因特征用于预后预测 | 胰腺癌细胞系和基因表达数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RT-qPCR, Western blot, CCK-8 | LASSO Cox风险模型 | 基因表达数据 | 30个胰腺癌细胞系，四个GEO数据集（GSE28735, GSE62452, GSE85916, GSE102238） | NA | NA | NA | NA |
| 699 | 2024-08-07 |
Chondrocyte-like cells in nucleus pulposus and articular chondrocytes have similar transcriptomic profiles and are paracrine-regulated by hedgehog from notochordal cells and subchondral bone
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1151947
PMID:37255604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，探讨了椎间盘核（NP）中的软骨细胞样细胞（CLCs）与关节软骨细胞之间的转录组相似性及其调控机制 | 首次揭示了CLCs和部分关节软骨细胞具有相似的基因表达谱，并受来自脊索细胞和软骨下骨的旁分泌刺猬蛋白调控 | 研究样本仅限于三岁猕猴，且未包括软骨下骨样本进行单细胞RNA测序 | 阐明NP和软骨细胞中的细胞调控机制 | 椎间盘核中的软骨细胞样细胞和关节软骨细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三岁猕猴的关节软骨和椎间盘核样本 | NA | NA | NA | NA |
| 700 | 2024-08-07 |
Gene representation in scRNA-seq is correlated with common motifs at the 3' end of transcripts
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1120290
PMID:37255988
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研究论文 | 研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）中基因表达的稀疏性及其与转录本3'端常见motif的关系 | 发现了一组在scRNA-seq中经常被低估的基因，并观察到这些基因的3'端富集了poly(T) motif，这可能是导致它们在scRNA-seq中被低估的机制 | 研究依赖于公共数据源，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探究scRNA-seq中是否存在更容易被低估的基因以及这些基因的共同特征 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达及其与转录本3'端motif的关系 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 53个人类样本 | NA | NA | NA | NA |