单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-07 |
A novel signature incorporating lipid metabolism- and immune-related genes to predict the prognosis and immune landscape in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1182434
PMID:37346073
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种新的基因签名，结合脂质代谢和免疫相关基因，用于预测肝细胞癌的预后和免疫景观 | 本研究首次将脂质代谢和免疫相关基因结合，形成新的预后基因签名，用于肝细胞癌的预后预测和免疫状态评估 | NA | 开发一种新的基因签名，用于评估肝细胞癌患者的预后和免疫状态 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-SEQ) | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用GEO14520和ICGC-LIRI JP数据集进行外部验证 |
| 642 | 2024-08-05 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S413569
PMID:37312900
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研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和大规模RNA测序，通过多种机器学习方法识别了糖尿病肾病中的新免疫标志。 | 本研究提供了糖尿病肾病进程的新免疫学视角，识别了关键免疫相关基因和潜在药物靶点。 | 研究中未详细探讨免疫调节在糖尿病肾病中的具体机制。 | 探讨糖尿病肾病中的免疫调节作用及其潜在治疗靶点。 | 研究重点是1793个免疫相关基因和糖尿病肾病的关键基因。 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | RNA测序 | 随机森林，支持向量机，适应性提升，k近邻 | 基因表达数据 | 分析了多个数据集，最终确定了77个免疫相关基因 |
| 643 | 2024-08-05 |
MAGEB2-Mediated Degradation of EGR1 Regulates the Proliferation and Apoptosis of Human Spermatogonial Stem Cell Lines
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/3610466
PMID:37304127
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研究论文 | 该文章探讨了MAGEB2在调节人类生精干细胞增殖和凋亡中的作用 | 发现MAGEB2主要在男性生精干细胞中表达，并揭示其通过与EGR1相互作用来影响细胞增殖和凋亡 | 尚未明确人类生精干细胞发育调控中的所有关键分子和机制 | 理解影响人类生精干细胞命运决策的机制 | 人类生精干细胞系及其增殖凋亡调控机制 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据集的正常人类睾丸单细胞数据 |
| 644 | 2024-08-05 |
Decoding the molecular landscape of keloids: new insights from single-cell transcriptomics
2023, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkad017
PMID:37293384
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评论 | 本文讨论了单细胞RNA测序技术在瘢痕疙瘩研究中的应用与发现 | 利用单细胞RNA测序技术，解决了传统测序技术的局限性，提供了对细胞组成和功能亚型的前所未有的分辨率 | 由于摘要中未明确提到限制因素，因此无法提供具体的局限性 | 深入了解瘢痕疙瘩形成的病理生物学 | 瘢痕疙瘩的肺细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 645 | 2024-08-05 |
CXCL10 and CCL5 as feasible biomarkers for immunotherapy of homologous recombination deficient ovarian cancer
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37293164
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研究论文 | 本研究旨在识别可用于同源重组缺陷卵巢癌免疫治疗的生物标志物CXCL10和CCL5 | 本研究首次提出CXCL10和CCL5作为卵巢癌免疫治疗的生物标志物，且其效能优于PD-1 | 研究基于TCGA数据库，可能受到样本选择和数据可用性的限制 | 优化同源重组缺陷卵巢癌的免疫治疗 | 卵巢癌患者中表现出同源重组缺陷的肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 来自TCGA数据库的卵巢癌队列中不同HRD评分的患者样本 |
| 646 | 2024-08-05 |
A novel combination therapy of arginine deiminase and an arginase inhibitor targeting arginine metabolism in the tumor and immune microenvironment
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37293150
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研究论文 | 这项研究探讨了阿根廷酶抑制剂与阿根廷酶抑制剂联合治疗对肿瘤和免疫微环境的影响 | 研究提出了将L-诺伐林与ADI-PEG 20联合使用作为新的潜在癌症治疗方案 | 在免疫缺陷小鼠中L-诺伐林未能抑制肿瘤生长，可能影响结果的推广 | 研究旨在开发新的组合疗法，以增强抗肿瘤反应并激活免疫细胞 | 研究对象为ASS1缺乏的小鼠肿瘤细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | NA | 使用了B16F10黑色素瘤细胞的动物模型进行研究 |
| 647 | 2024-08-07 |
Focusing on scRNA-seq-Derived T Cell-Associated Genes to Identify Prognostic Signature and Immune Microenvironment Status in Low-Grade Glioma
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/3648946
PMID:37292257
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了低级别胶质瘤中的T细胞相关基因，并构建了预测模型以评估免疫微环境状态和免疫治疗效果 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了低级别胶质瘤中的T细胞相关基因，并构建了预测模型以评估免疫微环境状态和免疫治疗效果 | NA | 研究低级别胶质瘤中T细胞的不同功能，并识别与临床结果相关的T细胞相关基因 | 低级别胶质瘤中的T细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | scRNA-seq | ROC曲线 | RNA | 10个低级别胶质瘤样本的单细胞RNA测序数据和975个低级别胶质瘤样本的批量RNA数据 |
| 648 | 2024-08-07 |
Identification of a novel signature based on macrophage-related marker genes to predict prognosis and immunotherapeutic effects in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1176572
PMID:37305578
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研究论文 | 本研究构建了一个基于肿瘤相关巨噬细胞标记基因的新型特征，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次构建了一个基于肿瘤相关巨噬细胞标记基因的特征，用于评估肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 评估肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 从scRNA-seq数据集中获得了10个子群和165个肿瘤相关巨噬细胞相关标记基因 |
| 649 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals heterogeneity of gastric cancer: progress and prospects
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1074268
PMID:37305583
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在揭示胃癌异质性方面的进展和前景 | 单细胞转录组测序技术为理解胃癌的异质性提供了新的视角 | 文章中讨论了单细胞转录组测序技术的优势和局限性 | 探讨胃癌的异质性，以促进早期诊断、个体化治疗和预后评估 | 胃癌的细胞异质性、肿瘤微环境、癌变和转移以及药物反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 650 | 2024-08-07 |
Epigenetic and Transcriptional Dynamics of Notch Program in Intestinal Differentiation
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3076-1_7
PMID:37310625
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综述 | 本文综述了Notch程序在肠道分化中的表观遗传和转录动态，并介绍了如何利用ChIP-seq和scRNA-seq结合谱系追踪技术来研究饮食和代谢调控下的细胞命运决策。 | 本文介绍了新的表观遗传和转录分析数据如何完善或修正当前对Notch编程在肠道分化中的理解。 | NA | 探讨Notch程序在肠道分化中的作用及其在饮食和代谢调控下的动态变化。 | Notch信号传导和肠道分化过程中的细胞命运决策。 | 表观遗传学 | NA | ChIP-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
| 651 | 2024-08-07 |
Defining Anorectal Transition Zone Heterogeneity Using Single-Cell RNA Sequencing
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3076-1_8
PMID:37310626
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞RNA测序方法，用于分析肛管、肛直肠过渡区和直肠上皮的初级分析 | 本文首次使用单细胞RNA测序技术详细表征了肛直肠过渡区的异质性 | NA | 研究肛直肠过渡区的异质性 | 肛管、肛直肠过渡区和直肠上皮 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 652 | 2024-08-07 |
A fibroblast-associated signature predicts prognosis and immunotherapy in esophageal squamous cell cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1199040
PMID:37313409
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研究论文 | 本研究旨在探讨食管鳞状细胞癌（ESCC）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并构建基于CAFs的风险标志物以预测ESCC患者的预后 | 本研究首次构建了基于CAFs的风险标志物，并开发了一个结合CAF风险标志物和临床阶段的诺模图模型，用于预测ESCC的预后 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的特征，并构建风险标志物以预测患者预后 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Lasso回归 | RNA序列数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据和TCGA数据库的批量RNA-seq数据及微阵列数据 |
| 653 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals developmental deficiencies in both the placentation and the decidualization in women with late-onset preeclampsia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1142273
PMID:37283740
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研究论文 | 本研究利用单细胞 RNA 测序在晚发性子痫前期女性中揭示了胎盘和蜕膜的发育缺陷 | 首次通过单细胞 RNA 测序揭示晚发性子痫前期患者胎盘和蜕膜的发育缺陷 | 研究主要集中于晚发性子痫前期的少数样本，可能无法全面代表所有子痫前期患者 | 探讨晚发性子痫前期的分子机制 | 晚发性子痫前期女性和正常妊娠女性的胎盘及蜕膜 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 晚发性子痫前期患者和正常妊娠女性的多个样本 |
| 654 | 2024-08-05 |
Bioinformatics analysis of aging-related genes in thoracic aortic aneurysm and dissection
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1089312
PMID:37283588
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研究论文 | 本研究探讨了老化与胸主动脉瘤和撕裂（TAAD）之间的关系及其潜在机制 | 研究首次系统性地分析了与老化相关的基因在胸主动脉瘤和撕裂中的表达差异，并识别了五个关键基因，可能为TAAD的诊断和治疗提供新见解 | 本研究依赖于现有数据集，可能存在数据偏倚，且尚需在临床样本中验证结果 | 旨在揭示老化如何影响胸主动脉瘤和撕裂的发病机制 | 研究对象为与老化相关的基因和胸主动脉瘤患者样本 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 总共分析了70个差异共表达基因 |
| 655 | 2024-08-05 |
Protecting RNA quality for spatial transcriptomics while improving immunofluorescent staining quality
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1198154
PMID:37274189
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研究论文 | 本文开发了一种方法来改善空间转录组学中的RNA质量，并同时提升免疫荧光染色质量 | 提出了一种改进的生产商协议，既不影响RNA质量，又能使用更多以前不兼容的额外抗体 | 实验主要基于小鼠脑切片，可能限制了结果的广泛适用性 | 旨在提高免疫荧光染色的效率，同时保持RNA的质量 | 针对新鲜冷冻小鼠脑切片进行研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 采用了多个小鼠脑切片 |
| 656 | 2024-08-05 |
Subject clustering by IF-PCA and several recent methods
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1166404
PMID:37287536
|
研究论文 | 本文提出了IF-VAE作为一种新的受试者聚类方法，并与多种方法进行了比较 | 结合了变分自编码器和影响特征主成分分析的新方法IF-VAE | IF-VAE相较于IF-PCA表现较差 | 研究如何结合无监督深度学习和其他方法进行受试者聚类 | 研究基于10个基因微阵列数据集和8个单细胞RNA-seq数据集的受试者聚类 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分自编码器 | 基因数据 | 10个基因微阵列数据集和8个单细胞RNA-seq数据集 |
| 657 | 2024-08-05 |
Machine learning and integrative analysis identify the common pathogenesis of azoospermia complicated with COVID-19
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1114870
PMID:37283758
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研究论文 | 本研究探讨了与COVID-19相关的无精症的共同发病机制 | 通过整合加权共表达网络分析、机器学习和单细胞RNA测序，识别与无精症和COVID-19相关的关键基因和通路 | 未提及具体的局限性 | 进一步研究无精症与COVID-19的共同发病机制 | 无精症患者和COVID-19患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 无精症，COVID-19 | 单细胞RNA测序，机器学习 | NA | 基因表达数据 | 分析了阻塞性无精症和非阻塞性无精症样本的转录组数据 |
| 658 | 2024-08-05 |
Expression quantitative trait locus studies in the era of single-cell omics
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1182579
PMID:37284065
|
综述 | 本文概述了单细胞eQTL研究及其在基因表达调控中的应用 | 介绍了单细胞RNA-seq技术对细胞类型特异性基因表达调控的识别 | 单细胞eQTL分析的局限性被讨论 | 研究基因表达调控与遗传变异之间的关系 | 主要关注单细胞eQTL和其数据处理及映射过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 659 | 2024-08-05 |
Single-cell atlas of dental pulp stem cells exposed to the oral bacteria Porphyromonas gingivalis and Enterococcus faecalis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1166934
PMID:37287452
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研究论文 | 本文探讨了口腔细菌对人类牙髓干细胞的影响及其机制 | 该研究建立了牙髓干细胞在细菌刺激下的单细胞转录组图谱，并揭示了细菌如何影响干细胞的分化和再生能力 | 文章未详细探讨不同细菌种类的影响程度和比较分析 | 研究人类牙髓干细胞在细菌侵袭下的反应机制 | 人类牙髓干细胞（hDPSCs） | 数字病理学 | 牙髓炎和根尖周围炎 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 660 | 2024-08-07 |
Bioinformatic analysis reveals potential relationship between chondrocyte senescence and protein glycosylation in osteoarthritis pathogenesis
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1153689
PMID:37265706
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了软骨细胞衰老与蛋白质糖基化在骨关节炎发病机制中的潜在关系 | 揭示了软骨细胞衰老信号与O-连接糖基化途径在骨关节炎发病机制中的相互关联 | NA | 研究软骨细胞衰老与蛋白质糖基化在骨关节炎发病机制中的关系 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的临床骨关节炎样本 |