单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
621	2024-08-07	IL-15 promotes self-renewal of progenitor exhausted CD8 T cells during persistent antigenic stimulation 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1117092 PMID:37409128	研究论文	本文研究了IL-15在持续抗原刺激下促进前体耗竭CD8 T细胞自我更新的机制	首次揭示了IL-15在慢性感染和癌症中促进前体耗竭CD8 T细胞自我更新的作用	NA	探讨IL-15在维持抗原特异性CD8 T细胞池中的作用及其作为免疫干预治疗靶点的潜力	耗竭的CD8 T细胞及其在慢性感染和癌症中的亚群	免疫学	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠和肾细胞癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞
622	2024-08-05	Transcriptome-wide association study reveals novel susceptibility genes for coronary atherosclerosis 2023, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2023.1149113 PMID:37351287	研究论文	本研究通过转录组关联研究筛选冠状动脉动脉粥样硬化的新易感基因	识别了19个基因并验证NBEAL1与冠状动脉动脉粥样硬化之间的因果关系，确认了NBEAL1的保护作用	未提及具体的研究限制	筛选与冠状动脉动脉粥样硬化相关的潜在致病基因及其机制	筛选与冠状动脉动脉粥样硬化相关的基因	数字病理学	心血管疾病	转录组关联研究（TWAS）	NA	基因表达数据	使用人类冠状动脉单细胞RNA-seq数据进行分析
623	2024-08-05	Single-cell transcriptomics combined with proteomics of intrathecal IgG reveal transcriptional heterogeneity of oligoclonal IgG-secreting cells in multiple sclerosis 2023, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2023.1189709 PMID:37362001	研究论文	本文利用单细胞转录组学和质谱分析研究了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的细胞异质性	首次结合单细胞RNA-seq数据和IgG质谱分析，明确了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞谱系	研究未充分探讨其他潜在细胞类型的影响，可能限制对整体免疫环境的理解	确定多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞的表型和来源	多发性硬化症患者的脑脊液中的B细胞	数字病理学	多发性硬化症	单细胞RNA-seq和质谱分析	NA	RNA数据和蛋白质数据	NA
624	2024-08-05	Single-cell sequencing in primary intraocular tumors: understanding heterogeneity, the microenvironment, and drug resistance 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1194590 PMID:37359513	综述	本文重点讨论了单细胞测序在评估视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者中的应用	单细胞测序为肿瘤生物学的研究提供了独特的视角，揭示了肿瘤异质性、微环境特征和细胞基因组突变	未提及具体的研究限制	探讨单细胞测序如何帮助理解肿瘤的异质性和微环境	研究对象为视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者	数字病理学	视网膜母细胞瘤，葡萄膜黑色素瘤	单细胞测序	NA	NA	NA
625	2024-08-07	Integrated multi-omics analyses reveal the altered transcriptomic characteristics of pulmonary macrophages in immunocompromised hosts with Pneumocystis pneumonia 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1179094 PMID:37359523	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了免疫缺陷宿主中肺泡巨噬细胞在肺孢子菌肺炎感染下的转录特征变化	首次鉴定出一组在肺孢子菌感染中起保护作用的Mmp12+巨噬细胞，并发现糖皮质激素可抑制其功能	NA	探究免疫抑制相关肺炎中先天免疫的异质性和代谢变化	免疫缺陷宿主中的肺泡巨噬细胞	数字病理学	肺孢子菌肺炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	野生型C57BL/6小鼠及地塞米松处理的小鼠
626	2024-08-07	Dynamic heterogeneity of colorectal cancer during progression revealed clinical risk-associated cell types and regulations in single-cell resolution and spatial context 2023, Gastroenterology report IF:3.8Q2 DOI:10.1093/gastro/goad034 PMID:37360193	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，揭示了结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险相关的细胞类型和调控机制	首次详细描述了结直肠癌进展中肿瘤异质性的动态变化，并鉴定了与患者总体生存率相关的细胞类型和癌症相关调控枢纽	研究仅基于八个单细胞RNA测序数据集和三个空间转录组测序数据集，可能存在样本量不足的问题	探究结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险的关系	结直肠癌的肿瘤细胞及其微环境	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组测序（ST-seq）	NA	单细胞RNA测序数据，空间转录组测序数据	八个单细胞RNA测序数据集，三个空间转录组测序数据集
627	2024-08-07	Documenting the immune response in patients with COVID-19-induced acute respiratory distress syndrome 2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2023.1207960 PMID:37363730	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者的免疫反应	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了COVID-19诱导的ARDS患者与对照组在单个细胞水平上的显著表型差异	研究仅限于外周血样本，未涉及其他组织或器官	深入了解COVID-19诱导的ARDS患者的细胞状态	COVID-19诱导的ARDS患者的外周血细胞	数字病理学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个COVID-19诱导的ARDS患者的外周血样本
628	2024-08-07	Constructing a cancer stem cell related prognostic model for predicting immune landscape and drug sensitivity in colorectal cancer 2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2023.1200017 PMID:37377935	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据和批量转录组数据，构建了一个与癌症干细胞相关的预测结直肠癌免疫景观和药物敏感性的预后模型	本研究首次构建了一个包含七个基因的预后模型，能够有效区分高风险和低风险患者，并预测化疗和免疫治疗的反应	NA	旨在识别重要的癌症干细胞标记基因，并解析这些标记基因在结直肠癌中的作用	结直肠癌样本的单细胞RNA测序数据和批量转录组数据	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	Lasso和stepAIC	转录组数据	NA
629	2024-08-05	Comprehensive analysis of the basement membrane in lung adenocarcinoma by bulk and single-cell sequencing analysis 2023, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.83407 PMID:37325048	研究论文	本文评估了基底膜在肺腺癌中的临床作用，并探讨了其机制	首次通过一系列差异表达基因发现了37个BM-DEG，并建立了基于4个BM-DEG的预后模型	研究可能受到样本异质性和实验设计限制的影响	阐明基底膜在肺腺癌进展中的作用	1383名肺腺癌患者的临床数据和基因表达信息	数字病理	肺癌	单细胞RNA测序，Cox回归分析	NA	基因表达数据	1383名肺腺癌患者
630	2024-08-05	Single-cell RNA-seq uncovers distinct pathways and genes in endothelial cells during atherosclerosis progression 2023, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2023.1176267 PMID:37325477	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化进展中内皮细胞的不同途径和基因	首次使用单细胞RNA-seq分析确定了在动脉粥样硬化过程中内皮细胞的关键基因和信号通路	研究仅基于小鼠模型和部分人类动脉样本，可能无法完全反映动脉粥样硬化的复杂机制	探索动脉粥样硬化中内皮细胞的分子机制	聚焦于动脉粥样硬化人类冠状动脉中的不同细胞类型及其基因	数字病理学	动脉粥样硬化	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	涉及多个动脉粥样硬化患者的冠状动脉和小鼠样本
631	2024-08-05	Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish 2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1 DOI:10.7150/ijbs.81055 PMID:37324950	研究论文	本研究探讨了褪黑激素在海洋硬骨鱼类的下丘脑-垂体神经内分泌轴中的作用	发现了褪黑激素/黑色素浓缩激素(MCH)和褪黑激素/(tachykinin前体1（TAC1）+促肾上腺皮质激素释放激素（CRH）)/黑色素刺激激素(MSH)的新型调控通路	对褪黑激素信号系统的全面理解仍然有限	研究褪黑激素在鱼类生理性变色中的调控机制	研究对象为大型黄鱼，一种具有昼夜体色变化行为的海洋硬骨鱼	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
632	2024-08-05	Will EGFRvIII and neuronal-derived EGFR be targets for imipramine? 2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2023.1156492 PMID:37324489	研究论文	本文探讨了三环类抗抑郁药imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的潜在分子机制	揭示了imipramine可能通过靶向EGFRvIII和神经衍生的EGFR来调节肿瘤微环境的创新点	尚不清楚抗抑郁药如何影响神经胶质母细胞瘤的具体机制	研究imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的作用机制	神经胶质母细胞瘤（GBM）	数字病理学	神经胶质母细胞瘤	RNA测序, 网络药理学, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟	NA	RNA数据	NA
633	2024-08-05	Laser transfer for circulating tumor cell isolation in liquid biopsy 2023, International journal of bioprinting IF:6.8Q1 DOI:10.18063/ijb.720 PMID:37323505	研究论文	本文提出了一种新的激光转移方法用于循环肿瘤细胞的分离，旨在液体活检中实现高存活率的单细胞分离	使用紫外激光和水泡驱动的激光诱导前转移过程，有效保护细胞免受直接激光照射	研究中可能缺乏较大样本的验证，尚未充分探讨其他类型肿瘤细胞的适应性	开发一种新方法以实现高存活率的单个循环肿瘤细胞的分离	主要研究循环肿瘤细胞及其分离效果	数字病理学	肿瘤	液体激光转移（LLT）	NA	细胞样本	1个MDA-MB-231癌细胞
634	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing revealed subclonal heterogeneity and gene signatures of gemcitabine sensitivity in pancreatic cancer 2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2023.1193791 PMID:37324492	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征	本研究首次揭示了吉西他滨诱导的肿瘤细胞亚克隆的自然选择和肿瘤微环境细胞的重塑，并构建了一个能够预测吉西他滨敏感性和胰腺癌预后的基因面板	NA	研究胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征	胰腺癌患者样本和吉西他滨治疗前后的肿瘤进化和微环境变化	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因数据	17个患者来源的异种移植模型
635	2024-08-07	The elucidation of the anti-inflammatory mechanism of EMO in rheumatoid arthritis through an integrative approach combining bioinformatics and experimental verification 2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2023.1195567 PMID:37324499	研究论文	本研究通过整合生物信息学和实验验证的方法，阐明了大黄素（EMO）在类风湿性关节炎（RA）中的抗炎机制	采用网络药理学方法筛选EMO的关键靶点，并通过单细胞RNA测序和实验验证其可靠性	NA	探索大黄素在类风湿性关节炎中的抗炎作用机制	大黄素（EMO）及其在类风湿性关节炎中的作用靶点	数字病理学	类风湿性关节炎	RNA测序	NA	基因表达数据	使用了来自GEO数据库的GSE55457基因表达数据和GSE159117单细胞RNA测序数据，以及对MH7A细胞和关节滑膜成纤维细胞的实验
636	2024-08-07	Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-Seq) Data Analysis of Retinal Homeostasis and Degeneration of Microglia 2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3255-0_6 PMID:37326706	research paper	本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析和可视化的方法，特别关注视网膜稳态和微胶质细胞退化的研究	揭示了以前未见的分子特征	NA	探索单细胞RNA测序在视网膜稳态和微胶质细胞退化中的应用	视网膜稳态和微胶质细胞退化	digital pathology	NA	scRNA-seq	NA	RNA sequencing data	NA
637	2024-08-07	Circulating neutrophils activated by cancer cells and M2 macrophages promote gastric cancer progression during PD-1 antibody-based immunotherapy 2023, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2023.1081762 PMID:37333017	研究论文	分析中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）与接受PD-1抗体治疗的晚期胃癌（AGC）患者预后的相关性，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）描绘循环中性粒细胞的分子特征	发现治疗后NLR高的AGC患者预后较差，且循环中性粒细胞的亚群NE-1通过与恶性上皮细胞和M2巨噬细胞的信号交互参与胃癌进展	研究样本量较小，仅基于45名患者的数据，且仅在两个患者中进行了单细胞RNA测序分析	探讨PD-1抗体治疗对AGC患者NLR的影响及其与预后的关系，以及循环中性粒细胞在胃癌进展中的作用	接受PD-1抗体治疗的晚期胃癌患者及其循环中性粒细胞	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	45名晚期胃癌患者，88名胃癌患者的组织样本
638	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals cell subpopulations in the tumor microenvironment contributing to hepatocellular carcinoma 2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2023.1194199 PMID:37333982	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中具有特定功能的细胞亚群及其与环境的相互作用	首次揭示了肿瘤微环境中某些细胞亚群与肿瘤细胞的相互作用，特别是癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞在肿瘤微环境重塑中的作用	研究样本仅限于14名肝细胞癌患者，可能影响结果的普遍性	探索肝细胞癌肿瘤微环境中特定细胞亚群的功能及其与环境的相互作用，以理解肿瘤的发展、预后和治疗	肝细胞癌患者的肿瘤组织及其邻近的正常组织	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	43个肿瘤组织样本和14个邻近控制样本
639	2024-08-07	Single-cell multi-omics analysis reveals dysfunctional Wnt signaling of spermatogonia in non-obstructive azoospermia 2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2023.1138386 PMID:37334314	研究论文	本研究通过单细胞多组学分析揭示了非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的失调	首次揭示了非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的下调活性和功能障碍，并确定了可能涉及的三种转录因子（CTCF、AR和ARNTL）	NA	探讨非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的功能及其上游调控分子	非阻塞性无精症患者的精原细胞	NA	男性不育症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq）、空间转录组学	NA	RNA序列数据	NA
640	2024-08-07	Schlafen4+-MDSC in Helicobacter-induced gastric metaplasia reveals role for GTPases 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1139391 PMID:37334372	研究论文	本研究探讨了Schlafen4+ MDSC在幽门螺杆菌诱导的胃肠化生中的作用，并揭示了GTP酶在这一过程中的关键角色。	首次揭示了SLFN4在MDSC中的表达及其对GTP酶活性的调控作用，以及其在抑制T细胞功能和减轻胃肠化生发展中的作用。	NA	旨在阐明SLFN4+细胞的身份及其在MDSC中的作用。	Schlafen4+ MDSC在幽门螺杆菌感染的胃中的作用。	NA	胃癌	单细胞RNA测序，siRNA敲低技术，GTPase-Glo试剂盒	NA	RNA	来自未感染和6个月H. felis感染小鼠的免疫细胞。