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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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621 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of PVR/PVRL2 in the immunosuppressive tumour microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1164448
PMID:37383234
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中的免疫抑制作用,特别是PVR/PVRL2轴的作用 | 首次揭示了VCAN+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)可能经历M2样极化,并发现TIGIT-PVR/PVRL2轴在免疫抑制微环境中的重要作用 | 研究仅限于体外实验,尚未进行临床试验验证 | 深入理解肝细胞癌中肿瘤微环境的异质性和细胞间通讯网络 | 肝细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 35786个未选择的单细胞来自3个肝细胞癌肿瘤和3个匹配的邻近样本 |
622 | 2024-08-07 |
The Regulation Network of Glycerolipid Metabolism as Coregulators of Immunotherapy-Related Myocarditis
2023, Cardiovascular therapeutics
IF:3.4Q2
DOI:10.1155/2023/8774971
PMID:37388276
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,研究了免疫疗法相关心肌炎中甘油酯代谢的调控网络 | 首次揭示了线粒体调控的甘油酯代谢在免疫疗法相关心肌炎中的关键作用,特别是DGKZ蛋白的作用 | NA | 探究免疫疗法相关心肌炎中代谢重编程的机制 | 免疫细胞在免疫疗法相关心肌炎中的异质性和代谢网络差异 | NA | 心肌炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS) | NA | RNA序列,代谢组学数据 | Pdcd1-/-Ctla4+/-和野生型小鼠心脏的CD45+单细胞 |
623 | 2024-08-07 |
Impact of Cuproptosis-related markers on clinical status, tumor immune microenvironment and immunotherapy in colorectal cancer: A multi-omic analysis
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.06.011
PMID:37389187
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了铜死亡相关标记物在结直肠癌中的临床状态、肿瘤免疫微环境和免疫治疗中的作用 | 构建了一种基于铜死亡相关标记物的新型评分系统(CuproScore),用于预测结直肠癌患者的预后、肿瘤微环境及免疫治疗反应 | NA | 探讨铜死亡及其相关生物标志物在结直肠癌中的功能和临床价值 | 结直肠癌中的铜死亡相关标记物及其对临床状态、分子功能和肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析(转录组学、基因组学和单细胞转录组) | NA | 转录组数据 | 15对结直肠癌组织样本,以及4种结直肠癌细胞系的体外实验 |
624 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of neural stem cells derived from human trisomic iPSCs reveals the abnormalities during neural differentiation of Down syndrome
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1137123
PMID:37396785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了从唐氏综合征患者和正常对照患者的诱导多能干细胞(iPSCs)分化而来的神经干细胞(NSCs),揭示了唐氏综合征神经分化过程中的异常情况。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了唐氏综合征神经分化过程中的分子机制异常,特别是发现了一组未能分化为神经干细胞的唐氏综合征iPSCs(DS-iPSCs-ND),并分析了其异常表达模式。 | 研究仅限于细胞水平,未涉及临床患者,且未探讨这些发现如何转化为临床治疗策略。 | 探究唐氏综合征神经分化过程中的分子机制异常。 | 唐氏综合征患者的诱导多能干细胞(iPSCs)及其分化后的神经干细胞(NSCs)。 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从唐氏综合征和正常对照的iPSC样本中分别获得了8,500和10,922个细胞,从NSC样本中分别获得了7,182和9,324个细胞。 |
625 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome profiling reveals cutaneous immune microenvironment remodeling by photodynamic therapy in photoaged skin
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1183709
PMID:37404811
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析,探讨了5-氨基酮戊酸光动力疗法(ALA-PDT)对光老化皮肤中免疫微环境的改造作用 | 首次详细揭示了ALA-PDT如何通过改变免疫细胞的功能和相互作用,逆转光老化皮肤的免疫衰老状态 | 研究仅限于人类前臂的伸侧皮肤样本,且结果需要进一步在更广泛的样本和人群中验证 | 探讨ALA-PDT对光老化皮肤免疫微环境的影响及其潜在机制 | 光老化皮肤中的免疫细胞及其功能变化 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 光老化皮肤样本在ALA-PDT治疗前后的对比 |
626 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of dorsal root ganglion: an overview
2023, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2023.1162049
PMID:37405309
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在背根神经节(DRG)中的应用,以增进对人类和啮齿动物DRG神经元分子转录组、细胞类型和功能注释的全面理解 | 利用单细胞(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)技术,提供了对DRG神经元组成和功能异质性的单细胞分辨率理解 | NA | 总结当前关于DRG单细胞转录组测序的文献,以全面理解DRG神经元的分子转录组、细胞类型和功能注释 | 背根神经节(DRG)中的感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
627 | 2024-08-07 |
IL-15 promotes self-renewal of progenitor exhausted CD8 T cells during persistent antigenic stimulation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1117092
PMID:37409128
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研究论文 | 本文研究了IL-15在持续抗原刺激下促进前体耗竭CD8 T细胞自我更新的机制 | 首次揭示了IL-15在慢性感染和癌症中促进前体耗竭CD8 T细胞自我更新的作用 | NA | 探讨IL-15在维持抗原特异性CD8 T细胞池中的作用及其作为免疫干预治疗靶点的潜力 | 耗竭的CD8 T细胞及其在慢性感染和癌症中的亚群 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和肾细胞癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
628 | 2024-08-05 |
Transcriptome-wide association study reveals novel susceptibility genes for coronary atherosclerosis
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1149113
PMID:37351287
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研究论文 | 本研究通过转录组关联研究筛选冠状动脉动脉粥样硬化的新易感基因 | 识别了19个基因并验证NBEAL1与冠状动脉动脉粥样硬化之间的因果关系,确认了NBEAL1的保护作用 | 未提及具体的研究限制 | 筛选与冠状动脉动脉粥样硬化相关的潜在致病基因及其机制 | 筛选与冠状动脉动脉粥样硬化相关的基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组关联研究(TWAS) | NA | 基因表达数据 | 使用人类冠状动脉单细胞RNA-seq数据进行分析 |
629 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics combined with proteomics of intrathecal IgG reveal transcriptional heterogeneity of oligoclonal IgG-secreting cells in multiple sclerosis
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1189709
PMID:37362001
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学和质谱分析研究了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的细胞异质性 | 首次结合单细胞RNA-seq数据和IgG质谱分析,明确了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞谱系 | 研究未充分探讨其他潜在细胞类型的影响,可能限制对整体免疫环境的理解 | 确定多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞的表型和来源 | 多发性硬化症患者的脑脊液中的B细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq和质谱分析 | NA | RNA数据和蛋白质数据 | NA |
630 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing in primary intraocular tumors: understanding heterogeneity, the microenvironment, and drug resistance
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1194590
PMID:37359513
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综述 | 本文重点讨论了单细胞测序在评估视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者中的应用 | 单细胞测序为肿瘤生物学的研究提供了独特的视角,揭示了肿瘤异质性、微环境特征和细胞基因组突变 | 未提及具体的研究限制 | 探讨单细胞测序如何帮助理解肿瘤的异质性和微环境 | 研究对象为视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤,葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
631 | 2024-08-07 |
Integrated multi-omics analyses reveal the altered transcriptomic characteristics of pulmonary macrophages in immunocompromised hosts with Pneumocystis pneumonia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1179094
PMID:37359523
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了免疫缺陷宿主中肺泡巨噬细胞在肺孢子菌肺炎感染下的转录特征变化 | 首次鉴定出一组在肺孢子菌感染中起保护作用的Mmp12+巨噬细胞,并发现糖皮质激素可抑制其功能 | NA | 探究免疫抑制相关肺炎中先天免疫的异质性和代谢变化 | 免疫缺陷宿主中的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 野生型C57BL/6小鼠及地塞米松处理的小鼠 |
632 | 2024-08-07 |
Dynamic heterogeneity of colorectal cancer during progression revealed clinical risk-associated cell types and regulations in single-cell resolution and spatial context
2023, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goad034
PMID:37360193
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组测序技术,揭示了结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险相关的细胞类型和调控机制 | 首次详细描述了结直肠癌进展中肿瘤异质性的动态变化,并鉴定了与患者总体生存率相关的细胞类型和癌症相关调控枢纽 | 研究仅基于八个单细胞RNA测序数据集和三个空间转录组测序数据集,可能存在样本量不足的问题 | 探究结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险的关系 | 结直肠癌的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组测序(ST-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组测序数据 | 八个单细胞RNA测序数据集,三个空间转录组测序数据集 |
633 | 2024-08-07 |
Documenting the immune response in patients with COVID-19-induced acute respiratory distress syndrome
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1207960
PMID:37363730
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者的免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了COVID-19诱导的ARDS患者与对照组在单个细胞水平上的显著表型差异 | 研究仅限于外周血样本,未涉及其他组织或器官 | 深入了解COVID-19诱导的ARDS患者的细胞状态 | COVID-19诱导的ARDS患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个COVID-19诱导的ARDS患者的外周血样本 |
634 | 2024-08-07 |
Constructing a cancer stem cell related prognostic model for predicting immune landscape and drug sensitivity in colorectal cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1200017
PMID:37377935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和批量转录组数据,构建了一个与癌症干细胞相关的预测结直肠癌免疫景观和药物敏感性的预后模型 | 本研究首次构建了一个包含七个基因的预后模型,能够有效区分高风险和低风险患者,并预测化疗和免疫治疗的反应 | NA | 旨在识别重要的癌症干细胞标记基因,并解析这些标记基因在结直肠癌中的作用 | 结直肠癌样本的单细胞RNA测序数据和批量转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso和stepAIC | 转录组数据 | NA |
635 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of the basement membrane in lung adenocarcinoma by bulk and single-cell sequencing analysis
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.83407
PMID:37325048
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研究论文 | 本文评估了基底膜在肺腺癌中的临床作用,并探讨了其机制 | 首次通过一系列差异表达基因发现了37个BM-DEG,并建立了基于4个BM-DEG的预后模型 | 研究可能受到样本异质性和实验设计限制的影响 | 阐明基底膜在肺腺癌进展中的作用 | 1383名肺腺癌患者的临床数据和基因表达信息 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 1383名肺腺癌患者 |
636 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq uncovers distinct pathways and genes in endothelial cells during atherosclerosis progression
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1176267
PMID:37325477
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化进展中内皮细胞的不同途径和基因 | 首次使用单细胞RNA-seq分析确定了在动脉粥样硬化过程中内皮细胞的关键基因和信号通路 | 研究仅基于小鼠模型和部分人类动脉样本,可能无法完全反映动脉粥样硬化的复杂机制 | 探索动脉粥样硬化中内皮细胞的分子机制 | 聚焦于动脉粥样硬化人类冠状动脉中的不同细胞类型及其基因 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个动脉粥样硬化患者的冠状动脉和小鼠样本 |
637 | 2024-08-05 |
Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.81055
PMID:37324950
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研究论文 | 本研究探讨了褪黑激素在海洋硬骨鱼类的下丘脑-垂体神经内分泌轴中的作用 | 发现了褪黑激素/黑色素浓缩激素(MCH)和褪黑激素/(tachykinin前体1(TAC1)+促肾上腺皮质激素释放激素(CRH))/黑色素刺激激素(MSH)的新型调控通路 | 对褪黑激素信号系统的全面理解仍然有限 | 研究褪黑激素在鱼类生理性变色中的调控机制 | 研究对象为大型黄鱼,一种具有昼夜体色变化行为的海洋硬骨鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
638 | 2024-08-05 |
Will EGFRvIII and neuronal-derived EGFR be targets for imipramine?
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1156492
PMID:37324489
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研究论文 | 本文探讨了三环类抗抑郁药imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的潜在分子机制 | 揭示了imipramine可能通过靶向EGFRvIII和神经衍生的EGFR来调节肿瘤微环境的创新点 | 尚不清楚抗抑郁药如何影响神经胶质母细胞瘤的具体机制 | 研究imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的作用机制 | 神经胶质母细胞瘤(GBM) | 数字病理学 | 神经胶质母细胞瘤 | RNA测序, 网络药理学, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | RNA数据 | NA |
639 | 2024-08-05 |
Laser transfer for circulating tumor cell isolation in liquid biopsy
2023, International journal of bioprinting
IF:6.8Q1
DOI:10.18063/ijb.720
PMID:37323505
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研究论文 | 本文提出了一种新的激光转移方法用于循环肿瘤细胞的分离,旨在液体活检中实现高存活率的单细胞分离 | 使用紫外激光和水泡驱动的激光诱导前转移过程,有效保护细胞免受直接激光照射 | 研究中可能缺乏较大样本的验证,尚未充分探讨其他类型肿瘤细胞的适应性 | 开发一种新方法以实现高存活率的单个循环肿瘤细胞的分离 | 主要研究循环肿瘤细胞及其分离效果 | 数字病理学 | 肿瘤 | 液体激光转移(LLT) | NA | 细胞样本 | 1个MDA-MB-231癌细胞 |
640 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed subclonal heterogeneity and gene signatures of gemcitabine sensitivity in pancreatic cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1193791
PMID:37324492
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征 | 本研究首次揭示了吉西他滨诱导的肿瘤细胞亚克隆的自然选择和肿瘤微环境细胞的重塑,并构建了一个能够预测吉西他滨敏感性和胰腺癌预后的基因面板 | NA | 研究胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征 | 胰腺癌患者样本和吉西他滨治疗前后的肿瘤进化和微环境变化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 17个患者来源的异种移植模型 |