单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-07 |
Exploration of the shared gene signatures and molecular mechanisms between periodontitis and inflammatory bowel disease: evidence from transcriptome data
2023, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goad041
PMID:37456714
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研究论文 | 本研究通过转录组数据分析，探索了牙周炎与炎症性肠病之间的共享基因特征和分子机制 | 揭示了牙周炎与炎症性肠病之间通过交叉基因和嗜中性粒细胞的先前未被认识的机制 | NA | 探索牙周炎与炎症性肠病之间的共享基因特征和分子机制 | 牙周炎和炎症性肠病 | NA | 牙周炎, 炎症性肠病 | 差异表达基因分析, 加权基因共表达网络分析 (WGCNA), 单样本基因集富集分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 602 | 2024-08-07 |
HDAC inhibition delays photoreceptor loss in Pde6b mutant mice of retinitis pigmentosa: insights from scRNA-seq and CUT&Tag
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.15659
PMID:37456870
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研究论文 | 研究旨在确定组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制对视网膜光感受器细胞的保护作用，使用单细胞RNA测序和CUT&Tag方法在Pde6brd1小鼠模型中进行研究。 | 本研究揭示了HDAC和PARP异构体在光感受器细胞死亡中的不同作用，并发现HDAC抑制剂SAHA能显著延缓光感受器细胞的损失，减少HDAC和PARP活性。 | NA | 研究HDAC抑制对视网膜光感受器细胞的保护作用 | Pde6brd1小鼠模型中的视网膜光感受器细胞 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CUT&Tag | NA | 基因表达数据 | 野生型（WT）和Pde6b突变rd1小鼠的视网膜组织样本 |
| 603 | 2024-08-07 |
Mitochondrial DNA methylation is a predictor of immunotherapy response and prognosis in breast cancer: scRNA-seq and bulk-seq data insights
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1219652
PMID:37457713
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和批量测序数据，分析了线粒体DNA甲基化（MTDM）在乳腺癌中的作用及其对免疫治疗反应和预后的预测价值。 | 首次全面评估了MTDM在乳腺癌中的多方面作用，并发现MTDM水平不仅能够预测免疫治疗反应，还可作为乳腺癌患者的准确预后指标。 | NA | 探讨线粒体DNA甲基化在乳腺癌发展中的作用及其对免疫治疗反应和预后的影响。 | 乳腺癌患者及其线粒体DNA甲基化水平。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序 | 加权共表达网络分析（WGCNA）、COX回归和LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA/GEO数据集中的乳腺癌患者 |
| 604 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq and spatial transcriptomics: exploring the occurrence and treatment of coronary-related diseases starting from development
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1064949
PMID:37416923
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综述 | 本文回顾了冠状动脉病的发展及治疗的分子机制 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组技术，探讨了冠状动脉病的新治疗方案 | 没有明显的局限性信息 | 探讨冠状动脉发展与疾病的分子机制及其潜在治疗 | 单细胞和冠状动脉疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-08-05 |
ACME Dissociation-Fixation, Flow Cytometry, and Cell Sorting of Freshwater Planarian Cells
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3275-8_10
PMID:37428377
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研究论文 | 本文描述了一种用于平面虫细胞解离的方法 | 提出了一种基于醋酸和甲醇的ACME解离-固定方法，解决了传统酶法引起的细胞应激反应问题 | 不适用于所有类型的细胞，可能需要进一步验证 | 改善平面虫细胞的解离和固定过程，以便用于单细胞转录组学研究 | 平面虫细胞 | 数字病理学 | NA | ACME解离-固定方法 | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-08-05 |
Redistribution of the astrocyte phenotypes in the medial vestibular nuclei after unilateral labyrinthectomy
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1146147
PMID:37434761
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研究论文 | 本研究探讨了单侧迷路切除后内侧前庭核中星形胶质细胞亚型的变化。 | 发现了四种内侧前庭核中的星形胶质细胞亚型，并揭示了它们在迷路损伤后的适应性变化。 | 未深入探讨星形胶质细胞亚型对神经系统功能的具体影响和机制。 | 研究单侧迷路切除后内侧前庭核中星形胶质细胞的响应状态。 | 使用单细胞测序技术分析小鼠模型中的星形胶质细胞亚型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因数据 | NA |
| 607 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of the role of immune-related PANoptosis lncRNA model in renal clear cell carcinoma based on RNA transcriptome and single-cell sequencing
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029563
PMID:37415739
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研究论文 | 本文综合分析了免疫相关的PANoptosis lncRNA模型在肾透明细胞癌中的作用 | 建立了基于免疫相关PANoptosis lncRNAs的新预测模型，并发现LINC00944与癌细胞迁移和浸润显著相关 | NA | 探索免疫相关PANoptosis lncRNAs在肾透明细胞癌中的生物学价值 | 肾透明细胞癌患者的免疫相关PANoptosis lncRNAs | 数字病理学 | 肾癌 | RNA转录组和单细胞测序 | 风险模型 | 转录组数据和单细胞数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的数据，样本数量未具体说明 |
| 608 | 2024-08-05 |
TERT expression is associated with metastasis from thin primaries, exhausted CD4+ T cells in melanoma and with DNA repair across cancer entities
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281487
PMID:37418389
|
研究论文 | 本文研究TERT表达与黑色素瘤转移及免疫抵抗的关系 | 揭示了TERT表达与CD4+ T细胞衰竭和肿瘤进展之间的联系，及其在多种肿瘤类型中的非经典功能 | 未能在免疫检查点抑制的黑色素瘤队列中找到TERT启动子突变或表达与生存率的持续关联 | 扩展对TERT启动子突变及表达改变在肿瘤进展中影响的认识 | 分析数个高度注释的黑色素瘤队列 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 (RNA-seq) | 多变量模型 | 基因表达数据 | 涉及多个黑色素瘤队列的样本 |
| 609 | 2024-08-07 |
Editorial: Statistical and computational methods for single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1235174
PMID:37415605
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-07 |
System analysis based on the T cell exhaustion‑related genes identifies CD38 as a novel therapy target for ovarian cancer
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029282
PMID:37415732
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨卵巢癌中T细胞亚群的异质性，并筛选出与T细胞耗竭相关的基因，特别是CD38作为新的治疗靶点 | 首次通过单细胞转录组分析揭示卵巢癌中T细胞耗竭的异质性，并构建基于T细胞耗竭基因的预后模型，为精准治疗提供新思路 | 研究样本量较小，仅基于五个卵巢癌患者的单细胞RNA测序数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨卵巢癌中T细胞亚群的异质性及其临床意义，并开发基于T细胞耗竭基因的预后模型 | 卵巢癌患者的T细胞亚群及其相关基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林 | 转录组数据 | 五个卵巢癌患者 |
| 611 | 2024-08-07 |
Comprehensive immune landscape of lung-resident memory CD8+ T cells after influenza infection and reinfection in a mouse model
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1184884
PMID:37415817
|
研究论文 | 本研究利用综合转录组数据和体内实验，探讨了流感病毒感染和再感染后肺驻留记忆CD8+ T细胞的关键特征及其功能转换和调控机制。 | 本研究首次详细描述了流感感染和再感染后肺中CD8+ T细胞亚群的景观，并揭示了CD8+ Trm细胞在感染后的动态变化和关键信号通路。 | NA | 探讨流感病毒感染和再感染后肺驻留记忆CD8+ T细胞的功能转换和调控机制。 | 肺驻留记忆CD8+ T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq） | Seurat，scCODE，Monocle 3，CellChat | 转录组数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和一个RNA测序数据集 |
| 612 | 2024-08-07 |
Characterization of tumor-associated reactive astrocytes in gliomas by single-cell and bulk tumor sequencing
2023, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2023.1193844
PMID:37416308
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研究论文 | 本文通过单细胞和整体肿瘤测序技术，全面评估了胶质瘤中的肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs），并分析了其在胶质瘤中的作用和潜在的临床应用 | 首次系统地研究了TARAs在胶质瘤中的浸润水平及其与临床和分子特征的关联，并探讨了其在免疫治疗中的预测价值 | NA | 探讨肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs）在胶质瘤中的作用及其临床意义 | 胶质瘤中的肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35,563个细胞来自23名患者，1,379个弥漫性星形细胞瘤和胶质母细胞瘤样本 |
| 613 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and Bulk RNA sequencing reveals a malignancy-related signature in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1198746
PMID:37427142
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌中与恶性相关的特征 | 识别了一种新的与恶性相关的特征，用于预测肺腺癌患者的预后，并强调了这一特征作为肺腺癌患者预后和治疗标记的潜力 | NA | 建立基于恶性相关风险评分（MRRS）的肺腺癌预后模型 | 肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机生存森林分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumor Immune Single Cell Hub数据库的单细胞RNA测序数据和来自The Cancer Genome Atlas数据库的RNA-seq数据，以及GSE68465和GSE72094数据集进行验证 |
| 614 | 2024-08-07 |
Accumulation of plasmacytoid dendritic cell is associated with a treatment response to DNA-damaging treatment and favorable prognosis in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1154881
PMID:37435086
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光及免疫组织化学染色方法，探讨了吸烟与非吸烟者肺腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞组成差异，并验证了相关生物标志物的临床意义。 | 首次揭示了吸烟者肺腺癌肿瘤微环境中浆细胞样树突状细胞（pDCs）的积累与DNA损伤治疗反应及良好预后之间的关联。 | NA | 研究吸烟状态对肺腺癌肿瘤微环境的影响，并探讨pDCs在免疫检查点抑制剂治疗反应中的作用。 | 吸烟与非吸烟者的肺腺癌组织及其邻近正常肺组织。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，免疫组织化学染色 | NA | 组织 | 来自吸烟与非吸烟者的肺腺癌组织及邻近正常肺组织样本 |
| 615 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Müller Glia in the rd10 Retina
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-27681-1_55
PMID:37440060
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了rd10视网膜模型中穆勒胶质细胞对杆状细胞退化的反应。 | 发现了Pde6b穆勒胶质细胞中组织相容性复合体成员的表达增加，这可能是穆勒胶质细胞在视网膜色素变性中的一种新型免疫功能。 | NA | 探讨穆勒胶质细胞在视网膜色素变性中的反应及其潜在机制。 | 穆勒胶质细胞在rd10视网膜模型中的转录组变化。 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 616 | 2024-08-05 |
Transcriptome sequencing and single-cell sequencing analysis identify GARS1 as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker for multiple cancers, including bladder cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1169588
PMID:37404826
|
研究论文 | 本研究识别GARS1作为多种癌症（包括膀胱癌）的潜在预后和免疫治疗生物标志物 | GARS1在多种癌症中表现出预后价值，并与免疫调节通路紧密相关，未被广泛探索 | GARS1的角色在肿瘤免疫学中的影响仍然未完全理解 | 研究GARS1在多种癌症中的表达及其预后和免疫学影响 | 人类癌症中的GARS1表达及其在膀胱癌细胞中的生物学功能 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 转录组测序和单细胞测序 | NA | mRNA和蛋白表达数据，单细胞数据 | NA |
| 617 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals tumor heterogeneity and a signature based on NK cell marker genes for predicting prognosis in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1200114
PMID:37397471
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研究论文 | 本文构建了一个基于NK细胞相关基因的肝细胞 carcinoma (HCC) 患者预后预测模型 | 使用NK细胞标记基因作为创新生物标志物进行HCC的预后评估 | NA | 研究旨在评估NK细胞相关基因预测HCC患者预后的可行性 | 以肝细胞癌患者为研究对象 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Cox回归和lasso回归 | 基因表达数据 | 从TCGA数据集中获得数据，涉及161个HCC相关的NK细胞标记基因 |
| 618 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics and data analyses for prokaryotes-Past, present and future concepts
2023, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2023.04.002
PMID:37400172
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研究论文 | 这篇文章探讨了原核生物的单细胞转录组学及其数据分析的过去、现在和未来概念 | 提出了针对细菌的单细胞RNA测序新方法，并讨论了实验与数据分析中面临的挑战 | 在实验工作流程和数据处理分析中仍然存在难题，例如放大过程中引入的偏差 | 研究原核生物单细胞转录组学的应用以及如何优化实验和数据分析 | 主要针对原核生物，尤其是细菌的单细胞mRNA测序 | 数字病理学 | NA | mRNA测序 | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA sequencing of leaf sheath cells reveals the mechanism of rice resistance to brown planthopper (Nilaparvata lugens)
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1200014
PMID:37404541
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了水稻对褐飞虱的抗性机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了不同水稻细胞类型在抵抗褐飞虱中的作用 | 研究的细胞类型尚不全面，可能遗漏其他相关细胞的作用 | 探讨水稻对褐飞虱的抗性分子机制 | 比较易感和抗性水稻品种的叶鞘细胞反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了30,000个细胞来自两个水稻品种 |
| 620 | 2024-08-05 |
Deciphering the contributions of cuproptosis in the development of hypertrophic scar using single-cell analysis and machine learning techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1207522
PMID:37409114
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研究论文 | 本研究探讨了铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的作用。 | 通过单细胞分析和机器学习算法，鉴定出新的治疗靶标基因（如ATP7A、ULK1和MTF1）并提出治疗新思路。 | 未提及样本量和具体实验设置的详细信息，可能影响结果的普适性。 | 研究铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的潜在作用。 | 主要关注肥厚性瘢痕及相关细胞（如成纤维细胞）。 | 数字病理学 | 肥厚性瘢痕 | 单细胞测序，转录组数据分析，qRT-PCR | 随机森林，支持向量机 | 基因表达数据 | 未提供具体的样本量 |