单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2024-08-07 |
A chemotherapy response prediction model derived from tumor-promoting B and Tregs and proinflammatory macrophages in HGSOC
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1171582
PMID:37519793
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研究论文 | 本研究开发了一种基于肿瘤促进B细胞、Tregs和促炎性巨噬细胞的高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）化疗反应预测模型 | 该模型包含43个特征基因，AUC值达到0.97，显著优于现有预测模型 | NA | 开发新的预测标志物，以准确预测高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | RNA-seq数据 | 88个样本 |
| 582 | 2024-08-07 |
Aerosolized miR-138-5p and miR-200c targets PD-L1 for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1166951
PMID:37520581
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研究论文 | 本研究探讨了通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c模拟物在肺癌预防中的联合效果 | 采用吸入方式递送微小RNA（miRNA）作为肺癌预防的新方法 | NA | 研究通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的效果 | miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的作用 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | NA | 小鼠 |
| 583 | 2024-08-07 |
Smart Microfluidics: Synergy of Machine Learning and Microfluidics in the Development of Medical Diagnostics for Chronic and Emerging Infectious Diseases
2023, Critical reviews in biomedical engineering
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研究论文 | 本文探讨了机器学习与微流控技术在慢性及新兴传染病医疗诊断中的协同作用 | 结合微流控技术和机器学习算法，开发智能微流控即时诊断设备，以应对传染病和慢性疾病的挑战 | 微流控系统的设计、制造和操作复杂性限制了其广泛应用 | 开发适用于发展中国家的智能微流控即时诊断设备，以改善临床结果 | 慢性及新兴传染病 | 机器学习 | NA | 微流控技术 | 机器学习算法 | NA | NA |
| 584 | 2024-08-07 |
Identifying Network Biomarkers for Alzheimer's Disease Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_19
PMID:37525046
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研究论文 | 本文提出了一种R工作流程，用于从通路网络中提取疾病扰动的子通路，并结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）表达谱构建基因-基因相互作用网络，以识别阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 本文采用了单细胞RNA测序技术，并结合系统层面的网络方法，提取疾病扰动的子通路，为复杂疾病如阿尔茨海默病的研究提供了新的网络生物标志物。 | NA | 开发一种新的方法来识别阿尔茨海默病的网络生物标志物。 | 阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 585 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the clinical implications of myeloid-derived suppressor cells in head and neck squamous cell carcinoma
2023, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2023.1611210
PMID:37475874
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了骨髓来源抑制细胞（MDSCs）在头颈鳞状细胞癌（HNSC）中的临床意义 | 发现了MDSCs在HNSC中的丰富性和其作为不良预后标志物的潜力，并确定了一组与MDSC相关的预后基因 | NA | 探讨MDSCs在HNSC中的作用及其作为免疫治疗靶点的可能性 | 头颈鳞状细胞癌中的骨髓细胞和MDSCs | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 较大的患者群体 |
| 586 | 2024-08-07 |
Development of Spondyloarthritis After COVID-19 in HLA-B27-Positive Monozygotic Twins: Case Reports With Single Cell Transcriptome Profiling
2023-Jan-01, Journal of rheumatic diseases
IF:2.2Q3
DOI:10.4078/jrd.22.0027
PMID:37476527
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病例报告 | 本文描述了两名23岁同卵双胞胎在COVID-19后被诊断为脊柱关节病的病例，并通过单细胞转录组分析探讨了其与典型放射性轴性脊柱关节病的差异。 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了COVID-19后脊柱关节病患者外周血单个核细胞的转录组特征与典型放射性轴性脊柱关节病的差异。 | 病例数量有限，需要更多研究来验证这些发现。 | 探讨COVID-19与脊柱关节病之间的可能联系，并通过单细胞转录组分析揭示其分子机制。 | 两名23岁同卵双胞胎在COVID-19后被诊断为脊柱关节病的病例。 | NA | 脊柱关节病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 两名患者 |
| 587 | 2024-08-07 |
Insight of a lipid metabolism prognostic model to identify immune landscape and potential target for retroperitoneal liposarcoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1209396
PMID:37483592
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研究论文 | 本研究通过基于脂质代谢相关基因（LMAGs）的预测模型，探索了腹膜后脂肪肉瘤（RPLS）的潜在靶点和免疫景观 | 本研究首次基于脂质代谢相关基因构建了预测模型，并识别了与抗原呈递细胞负相关的潜在靶点ELOVL2 | NA | 旨在通过脂质代谢相关基因探索腹膜后脂肪肉瘤的潜在靶点和免疫景观 | 腹膜后脂肪肉瘤（RPLS） | 数字病理学 | 腹膜后脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | 基因表达数据 | 234例样本，包括TCGA队列（58例）、GSE30929队列（92例）、FD队列（50例）、scRNA-seq队列（4例）和验证队列（30例） |
| 588 | 2024-08-07 |
Sox, Fox, and Lmx1b binding sites differentially regulate a Gdf5-Associated regulatory region during elbow development
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1215406
PMID:37492222
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研究论文 | 本文研究了转录因子Sox、Fox和Lmx1b结合位点在肘关节发育过程中对Gdf5相关调控区域的差异化调控作用 | 首次揭示了Fox/Sox结合位点对Gdf5相关调控区域活性的正向调控作用，以及Sox-only位点的抑制作用 | 研究主要集中在鸡和小鼠模型上，可能不完全适用于其他物种 | 探究Gdf5相关调控区域在肘关节发育中的调控机制 | Gdf5相关调控区域及其结合位点在肘关节发育中的作用 | 生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、原位杂交（ISH）、定点突变 | NA | 基因表达数据 | 鸡和小鼠的肢体和膝盖样本 |
| 589 | 2024-08-07 |
Identifying SARS-CoV-2 infected cells with scVDN
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1236653
PMID:37492254
|
研究论文 | 本研究提出了一种深度学习框架——单细胞病毒检测网络（scVDN），用于预测单细胞的感染状态，特别是在识别SARS-CoV-2感染细胞方面表现出色 | scVDN在识别SARS-CoV-2感染细胞方面优于四种最先进的机器学习模型，即使在真实数据中标签极度不平衡的情况下也能达到完美的AUC评分 | NA | 开发一种有效的工具来识别单细胞水平的SARS-CoV-2感染细胞，以促进病毒研究和改善公共卫生 | SARS-CoV-2感染细胞的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多个鼻拭子样本来自多个贡献者，包含多种细胞类型 |
| 590 | 2024-08-07 |
A risk score combining co-expression modules related to myeloid cells and alternative splicing associates with response to PD-1/PD-L1 blockade in non-small cell lung cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1178193
PMID:37492578
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）中与PD-1/PD-L1免疫检查点阻断（ICB）反应相关的转录组特征，并构建了一个风险评分模型。 | 本研究首次结合髓系细胞相关的共表达模块和选择性剪接事件，开发了一个与ICB反应相关的风险评分，作为潜在的预测生物标志物。 | NA | 探讨非小细胞肺癌中与PD-1/PD-L1免疫检查点阻断反应相关的转录组特征，并开发预测生物标志物。 | 非小细胞肺癌患者接受ICB治疗的转录组数据。 | 数字病理学 | 肺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | Lasso-COX回归 | 转录组数据 | 两个NSCLC数据集（GSE135222和GSE126044）中的患者样本 |
| 591 | 2024-08-07 |
Rapamycin and Low-dose IL-2 Mediate an Immunosuppressive Microenvironment to Inhibit Benign Prostatic Hyperplasia
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.85089
PMID:37497009
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析老年不同前列腺体积患者的过渡区组织，揭示了前列腺增生症（BPH）的免疫微环境特征，并验证了雷帕霉素和低剂量IL-2的免疫抑制治疗效果。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了BPH患者前列腺组织中Treg/CD4+ T细胞比例降低和免疫微环境激活的现象，并证实了免疫抑制药物对BPH进展的抑制作用。 | 研究主要基于老年患者和动物模型，可能不完全适用于所有年龄段的患者；单细胞RNA测序的样本量和多样性可能有限。 | 探讨前列腺增生症（BPH）的病因及其免疫微环境特征，并评估免疫抑制治疗的效果。 | 老年不同前列腺体积患者的前列腺过渡区组织及BPH的免疫微环境。 | NA | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 老年不同前列腺体积患者的过渡区组织 |
| 592 | 2024-08-07 |
Integration analysis of senescence-related genes to predict prognosis and immunotherapy response in soft-tissue sarcoma: evidence based on machine learning and experiments
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1229233
PMID:37497116
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研究论文 | 本研究通过机器学习和实验方法，分析了衰老相关基因（SRGs）在软组织肉瘤（STS）中的表达，并构建了预测预后和免疫治疗反应的模型 | 首次在STS中系统分析了SRGs的分子特征，并建立了基于SRGs的聚类和评分模型，用于指导临床管理 | NA | 研究衰老相关基因在软组织肉瘤中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 软组织肉瘤中的衰老相关基因 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | PCA | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的队列数据以及qPCR和自测序数据进行验证 |
| 593 | 2024-08-07 |
PreCanCell: An ensemble learning algorithm for predicting cancer and non-cancer cells from single-cell transcriptomes
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.009
PMID:37501705
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研究论文 | 本文提出了一种名为PreCanCell的新算法，用于从单细胞转录组数据中预测恶性与非恶性细胞 | PreCanCell通过识别五种常见癌症类型中恶性与非恶性细胞的差异表达基因，并使用多数投票机制进行分类，显示出比其他七种算法更高的准确性和更简单的实现 | NA | 开发一种新的算法来预测单细胞转录组数据中的癌症与非癌症细胞 | 五种常见癌症类型的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | NA | 集成学习算法 | 转录组数据 | 19个单细胞数据集 |
| 594 | 2024-08-05 |
Improved single-cell genome amplification by a high-efficiency phi29 DNA polymerase
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1233856
PMID:37456715
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的单细胞基因组扩增方法，称为iSGA。 | 通过phi29 DNA聚合酶工程和过程工程，开发出了一种效率更高的酶HotJa Phi29 DNA聚合酶，改善了扩增覆盖率。 | NA | 提高单细胞基因组扩增的效率和覆盖率。 | 单细胞样本及商业益生菌样本。 | 数字病理学 | NA | DNA聚合酶工程 | NA | 基因组数据 | 包括单细胞样本和商业益生菌样本 |
| 595 | 2024-08-05 |
Scdrake: a reproducible and scalable pipeline for scRNA-seq data analysis
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad089
PMID:37465398
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研究论文 | 本文开发了一个完全自动化的工作流程scdrake，用于scRNA-seq数据的二次分析 | 该工作流程以内置于drake框架的R语言中实现，遵循最佳编程实践，支持完全自动化 | 未提及具体的局限性 | 研究的目的是提供一个可重复性和可扩展性的scRNA-seq数据分析管道 | 研究对象为scRNA-seq数据的特征条形码矩阵 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 596 | 2024-08-05 |
Lineage Tracing and Single-Cell RNA-seq in C. elegans to Analyze Transgenerational Epigenetic Phenotypes Inherited from Germ Cells
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3259-8_3
PMID:37464235
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研究论文 | 本文探讨了C. elegans中的跨代表观遗传继承及其对胚胎发育的影响 | 提供了自动谱系追踪与单细胞RNA-seq结合的实用指南，以促进其在研究C. elegans胚胎中的跨代表观遗传继承方面的应用 | 这些技术的普及受到困难的限制 | 研究跨代表观遗传继承对胚胎发育的影响 | C. elegans胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 597 | 2024-08-05 |
Exploring PANoptosis in breast cancer based on scRNA-seq and bulk-seq
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1164930
PMID:37455906
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研究论文 | 这篇文章探讨了PANoptosis在乳腺癌中的作用和预后特征 | 首次全面分析了PANoptosis在乳腺癌中的分子聚类和预后预测潜力 | 研究可能受限于单一的数据集，未能整合更多相关研究 | 研究PANoptosis与乳腺癌肿瘤细胞之间的相互作用 | 重点研究乳腺癌的PANoptosis相关基因及其在预后中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq和bulk-seq | COX和LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了GSE176078单细胞测序数据集及其他乳腺癌数据 |
| 598 | 2024-08-07 |
Single-cell chromatin accessibility profiling of cell-state-specific gene regulatory programs during mouse organogenesis
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1170355
PMID:37440917
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC-seq技术分析了小鼠胚胎E8.5-E10.5阶段的染色质可及性，揭示了早期器官发生过程中的细胞状态特异性基因调控程序 | 首次通过单细胞ATAC-seq技术揭示了小鼠早期器官发生过程中的细胞状态特异性基因调控程序，并发现了与人类疾病相关的潜在单核苷酸变异 | NA | 揭示小鼠早期器官发生过程中细胞状态特异性基因调控程序的分子机制 | 小鼠胚胎E8.5-E10.5阶段的细胞 | 数字病理学 | 发育畸形 | 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 101,599个单细胞 |
| 599 | 2024-08-07 |
Variability of the innate immune response is globally constrained by transcriptional bursting
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1176107
PMID:37441161
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研究论文 | 本文利用单细胞基因组学数据和转录的随机模型，对 toll 样受体（TLR）诱导的基因表达变异性进行了全局分析 | 本文展示了单细胞基因表达变异性可以通过群体均值的线性函数进行经验描述，并揭示了转录爆发动力学的线性关系 | NA | 探讨哺乳动物基因转录的基本控制机制及其对单细胞响应的影响 | TLR 诱导的基因表达变异性 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组学 | 随机模型 | 基因表达数据 | 超过 2000 个 TLR 响应基因 |
| 600 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing identifies various proportions of excitatory and inhibitory neurons in cultured human fetal brain cortical tissues
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1177747
PMID:37449269
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同胎龄的人类胎儿前额叶皮质组织中兴奋性和抑制性神经元的比例 | 首次展示了从胎儿皮质组织培养中获取兴奋性和抑制性神经细胞的新策略 | NA | 探究皮质神经前体细胞分化为兴奋性和抑制性神经元的精确比例 | 人类胎儿前额叶皮质组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 收集了不同胎龄的人类胎儿前额叶皮质组织 |