单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human Alzheimer's disease brain samples reveals neuronal and glial specific cells differential expression
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0277630
PMID:36827281
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类阿尔茨海默病脑样本，揭示神经元和胶质细胞的特异性差异表达 | 首次在阿尔茨海默病早期阶段（Braak I-II期）使用单细胞分辨率分析脑组织转录组，识别出星形胶质细胞和小胶质细胞的特异性转录程序 | 样本量较小（仅2例患者和对照），未测量APOE状态、CERAD和THAL评分 | 识别阿尔茨海默病中不同神经元群体受影响的转录调控网络 | 人类阿尔茨海默病患者和年龄性别匹配对照的海马脑组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 超过25,000个单细胞核，来自2例阿尔茨海默病患者和匹配对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of murine reproductive tissues during preterm labor
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111846
PMID:36599348
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建感染诱导早产小鼠生殖组织的单细胞图谱 | 首次在感染诱导早产模型中系统描绘小鼠子宫、蜕膜和宫颈的单细胞转录组图谱，揭示早产相关的细胞间通讯信号通路 | 研究仅限于小鼠模型，需进一步验证人类组织的相关性 | 解析早产过程中生殖组织的细胞组成和分子机制 | 小鼠子宫、蜕膜和宫颈组织 | 单细胞组学 | 早产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic characterization of COVID-19 pneumonitis identifies immune circuits related to tissue injury
2023-Jan-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157837
PMID:36472908
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了COVID-19肺炎中免疫细胞与基质细胞相互作用的免疫回路 | 首次利用空间转录组学技术系统描绘COVID-19肺组织损伤区域的免疫细胞信号回路，发现细胞毒性淋巴细胞与促炎巨噬细胞之间的关键相互作用 | 样本量较小（仅3例患者），存在显著的个体间异质性 | 解析COVID-19肺炎中导致组织损伤的免疫机制 | COVID-19患者的肺组织样本 | 空间转录组学 | COVID-19肺炎 | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 相关性网络分析 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 3例患者的46个感兴趣区域，覆盖超过62,000个细胞 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Entropy sorting of single-cell RNA sequencing data reveals the inner cell mass in the human pre-implantation embryo
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.007
PMID:36240776
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研究论文 | 提出熵排序(ES)数学框架用于单细胞RNA测序数据分析，成功识别人类胚胎植入前内细胞团 | 开发无需用户定义显著性阈值的无监督特征选择方法，能够区分随机噪声与真实生物学信号 | 方法仅在合成数据和人类胚胎scRNA-seq数据上验证，需要更多应用场景测试 | 开发单细胞基因表达数据分析方法以更好识别细胞异质性 | 人类植入前胚胎单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 熵排序(ES)数学框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Epsin Nanotherapy Regulates Cholesterol Transport to Fortify Atheroma Regression
2023-01-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.321723
PMID:36444722
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向巨噬细胞Epsins的纳米疗法，通过调节胆固醇运输促进动脉粥样硬化斑块消退 | 开发了S2P偶联脂质纳米颗粒靶向递送siRNA沉默Epsins的创新方法，并揭示了Epsins通过调控CD36和ABCG1影响胆固醇代谢的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证疗效和安全性 | 探究Epsins在巨噬细胞介导的代谢调控中的作用，并开发靶向Epsins的动脉粥样硬化治疗方法 | 髓系特异性Epsin双敲除小鼠和ABCG1基因减量小鼠模型，以及动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, MEBOCOST算法, 纳米颗粒递送系统, siRNA技术 | NA | 基因表达数据, 代谢物通讯数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Molecular and spatial signatures of mouse brain aging at single-cell resolution
2023-01-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.12.010
PMID:36580914
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研究论文 | 通过空间分辨单细胞转录组学构建小鼠大脑衰老的高分辨率细胞图谱，揭示非神经元细胞在衰老过程中的显著变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘小鼠大脑衰老的分子和空间特征，特别关注非神经元细胞的空间组织变化 | 研究仅限于小鼠前额叶皮层和纹状体区域，未涵盖全脑所有区域 | 系统表征大脑衰老过程中的细胞和分子结构变化，理解大脑功能衰退的机制 | 小鼠大脑前额叶皮层和纹状体区域的主要细胞类型 | 空间转录组学 | 衰老相关脑功能衰退 | 空间分辨单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据和空间位置信息 | 覆盖小鼠整个寿命周期的多个时间点样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
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综述 | 通过单细胞测序技术探讨哺乳动物卵巢储备建立与维持机制的研究综述 | 聚焦单细胞测序技术在卵巢发育研究中的应用，揭示卵巢储备的新型分子调控机制 | NA | 理解卵巢储备建立和维持的细胞与分子动力学，为调控生殖健康提供基础 | 哺乳动物卵巢发育过程，特别是生殖细胞巢形成、分解及原始卵泡形成与激活阶段 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Profiling Transcriptional Heterogeneity with Seq-Well S3: A Low-Cost, Portable, High-Fidelity Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2756-3_3
PMID:36495445
|
研究论文 | 介绍Seq-Well S3平台——一种低成本、便携式、高保真度的单细胞RNA测序技术 | 通过引入第二链合成步骤增强转录本检测能力，解决了传统单细胞RNA测序技术在成本、便携性和可扩展性方面的限制 | NA | 开发改进的单细胞RNA测序平台以更好地分析细胞转录异质性 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well S3 | 基于皮升孔板的高通量单细胞RNA测序平台，具有第二链合成功能 |
| 49 | 2025-10-06 |
A comprehensive single cell data analysis of lymphoblastoid cells reveals the role of super-enhancers in maintaining EBV latency
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28362
PMID:36453088
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析淋巴母细胞系，揭示超级增强子在维持EBV潜伏感染中的作用 | 首次在单细胞水平发现EBV感染细胞的异质性，并证明宿主超级增强子通过调控MYC和IRF4等基因维持EBV潜伏期 | 研究仅使用公开数据集，样本来源有限；未在原代细胞中验证发现 | 探究EBV病毒生命周期中宿主-病毒相互作用的分子机制 | 淋巴母细胞系(LCLs)和EBV病毒 | 单细胞生物学 | EB病毒感染相关疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9个公开淋巴母细胞系 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Revelations in Thymic Epithelial Cell Biology and Heterogeneity from Single-Cell RNA Sequencing and Lineage Tracing Methodologies
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2740-2_2
PMID:36374449
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和谱系追踪方法在揭示胸腺上皮细胞生物学特性和异质性方面的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了传统群体水平RNA测序或表型研究无法发现的胸腺上皮细胞异质性，包括新型髓质TEC亚群的鉴定 | 单细胞RNA测序数据的拟时序分析仅能提示TEC亚群间的关系，需要实验方法进一步验证 | 研究胸腺上皮细胞的生物学特性和异质性 | 胸腺上皮细胞（TECs），包括皮质TECs和髓质TECs | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪， reaggregate thymic organ culture (RTOC) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S413569
PMID:37312900
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，结合多种机器学习方法识别糖尿病肾病的新型免疫特征 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，利用多种机器学习算法识别糖尿病肾病的关键免疫相关基因和潜在药物靶点 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索糖尿病肾病中免疫调节的潜在治疗靶点和分子机制 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据和大鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | 随机森林(RF), 支持向量机(SVM), 自适应增强(AdaBoost), K近邻(KNN) | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集，包括GSE142025 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulated bone development
2023-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.20.524918
PMID:36711590
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研究论文 | 本研究揭示了YAP和TAZ信号在胚胎骨骼发育中协调成骨前体细胞动员与血管生成的新机制 | 首次发现YAP/TAZ信号通过调控趋化因子Cxcl12，将成骨前体细胞与血管空间偶联，并调节血管形态发生和机械传导 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段，成年骨骼稳态中的机制仍需进一步探索 | 探究YAP和TAZ在胚胎骨骼发育过程中协调成骨前体细胞动员与血管生成的分子机制 | 小鼠胚胎长骨中的成骨前体细胞、血管系统及人间充质基质细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除, 3D血管网络培养 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞成像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing profiling to improve the translation between human IBD and in vivo models
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1291990
PMID:38179052
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序技术如何通过分析人类IBD与小鼠模型的异同来改善临床前研究的转化效果 | 首次系统总结单细胞转录组技术在IBD研究中的应用，强调通过比较人类与小鼠模型的细胞特征来提升临床转化效率 | 该技术尚未在IBD临床前模型中广泛应用，缺乏标准化比较框架 | 提高炎症性肠病临床前研究向临床治疗的转化成功率 | 人类IBD患者与实验小鼠模型的单细胞转录组数据 | 单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
Schlafen4+-MDSC in Helicobacter-induced gastric metaplasia reveals role for GTPases
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1139391
PMID:37334372
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研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌感染胃部中SLFN4+髓源性抑制细胞通过GTPase通路调控免疫抑制功能的新机制 | 首次发现SLFN4在MDSC中调控GTPase通路活性，并阐明其通过抑制ROS产生维持MDSC功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明SLFN4+MDSC在幽门螺杆菌诱导的胃黏膜肠化生中的身份特征和功能作用 | 幽门螺杆菌感染小鼠的免疫细胞和胃组织 | 单细胞生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, GTPase活性检测, ROS定量, 凋亡检测 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质活性数据, 细胞功能数据 | 未感染和6个月幽门螺杆菌感染小鼠的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Identifying fibrogenic cells following salivary gland obstructive injury
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1190386
PMID:37287453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1-CreER谱系追踪技术，系统分析唾液腺损伤后纤维化反应中的基质细胞异质性和Gli1信号的作用 | Gli1信号和Gli1细胞对机械损伤诱导的唾液腺纤维化改变贡献较小，且仅少数基质细胞亚群表达典型纤维化标志物 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺和胚胎期E16小鼠 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | Gli1-CreER; ROSA26tdTomato谱系追踪小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 雌性小鼠颌下唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Isolation of Thymus Stromal Cells from Human and Murine Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2679-5_13
PMID:36255703
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研究方法论文 | 详细介绍从人类和小鼠组织中分离胸腺基质细胞的方法学 | 提供了针对胸腺基质细胞分离优化的组织解离方案 | NA | 开发胸腺基质细胞分离方法以支持下游分析 | 人类和小鼠的胸腺组织 | 单细胞分析 | 免疫系统疾病 | 组织解离、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for identifying hidden drivers from single-cell omics data
2023-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.523391
PMID:36747870
|
研究论文 | 开发了一个基于互信息的计算框架scMINER，用于从单细胞RNA-seq数据中识别隐藏的转录和信号驱动因子 | 利用互信息捕获非线性细胞-细胞和基因-基因关系，能够识别传统表达分析难以检测的隐藏驱动因子 | 仅基于scRNA-seq数据，未整合多组学数据验证 | 从单细胞组学数据中识别调控细胞状态的隐藏转录和信号驱动因子 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互信息框架 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for identifying hidden drivers from single-cell omics data
2023-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2476875/v1
PMID:36747874
|
研究论文 | 开发了一种基于互信息的计算框架scMINER，用于从单细胞RNA-seq数据中识别隐藏的转录和信号驱动因子 | 利用互信息捕获非线性的细胞-细胞和基因-基因关系，能够识别常规表达分析难以检测的隐藏驱动因子 | 未在摘要中明确说明具体限制 | 解决单细胞组学数据稀疏性问题，识别调控细胞状态的隐藏转录和信号驱动因子 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互信息框架 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals correct developmental dynamics and high-quality midbrain cell types by improved hESC differentiation
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.10.016
PMID:36400027
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研究论文 | 本研究通过改进人类胚胎干细胞分化方案，获得高质量中脑细胞类型并揭示其发育动态 | 发现层粘连蛋白-511、双重WNT激活联合GSK3β抑制和FGF8b能改善中脑模式化，并首次通过单细胞转录组分析显示与内源性人类腹侧中脑相似的发育动态 | 未提及具体样本数量限制，研究主要聚焦于体外分化系统 | 优化人类胚胎干细胞向中脑多巴胺能神经元的分化方案并验证细胞类型质量 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 | 单细胞生物学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-10-07 |
Predicting tumor immune microenvironment and checkpoint therapy response of head & neck cancer patients from blood immune single-cell transcriptomics
2023-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.524455
PMID:36789425
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研究论文 | 本研究探索如何通过血液单细胞转录组数据推断头颈癌患者肿瘤免疫微环境状态并预测免疫检查点治疗反应 | 首次证明肿瘤免疫细胞比例和基因表达可从匹配的PBMC单细胞转录组数据推断，并发现肿瘤记忆B细胞与调节性T细胞比例比传统标志物更能预测免疫治疗反应 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 开发基于血液单细胞转录组的肿瘤免疫微环境推断和免疫治疗反应预测方法 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 头颈癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两个头颈癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 外周血单个核细胞单细胞RNA测序 |