单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2024-08-07 |
Construction of molecular typing in LIHC microenvironment based on lipid metabolism-related genes
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37559997
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研究论文 | 本研究基于脂质代谢相关基因构建并验证了肝细胞癌（LIHC）中的两种细胞亚型C1和C2，以深入反映肝癌特征并补充临床分期系统的不足。 | 首次基于脂质代谢相关基因构建肝细胞癌的分子分型，并通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据进行验证。 | 研究样本量较小，且依赖于现有数据库中的数据，可能影响结果的普遍性。 | 旨在通过分子分型提高肝细胞癌的诊断和治疗效果。 | 肝细胞癌（LIHC）及其分子分型。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 11个LIHC组织样本 |
| 562 | 2024-08-07 |
A novel classifier combining G protein-coupled receptors and the tumor microenvironment is associated with survival status in glioblastoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1093263
PMID:37560473
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量测序的综合数据，探讨了G蛋白偶联受体（GPCRs）在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达模式及其与肿瘤微环境（TME）的关系 | 首次详细研究了GPCRs在GBM中的表达及其与TME的关联，并发现GPCRs与TME的分类是GBM的独立风险因素 | NA | 探索GPCRs在GBM中的作用及其与TME的关系，评估其作为GBM预后标志物的潜力 | GPCRs在GBM中的表达及其与TME的相互作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自脑膜瘤和GBM患者的手术样本 |
| 563 | 2024-08-05 |
Effective Preprocessing of Single-Cell RNA-Seq for Unravelling Alzheimer's Disease Signatures
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_25
PMID:37525052
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序数据的预处理方法，以揭示阿尔茨海默病的特征 | 开发了一个探索性数据分析方法论，结合多种工具有效处理单细胞RNA测序数据 | 数据复杂性可能导致分析挑战，需要谨慎处理 | 研究单细胞RNA测序在阿尔茨海默病诊断中的应用 | 阿尔茨海默病的数据集 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 564 | 2024-08-05 |
Cuproptosis/ferroptosis-related gene signature is correlated with immune infiltration and predict the prognosis for patients with breast cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1192434
PMID:37521466
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研究论文 | 本研究开发了一个与铜致死/铁死亡相关的基因预测模型，以预测乳腺癌患者的生存情况 | 提出了一种新的生存预测模型，该模型基于铜致死和铁死亡相关基因，能够有效评估乳腺癌患者的预后 | 该研究的样本来源主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在样本选择偏倚 | 研究的目的是构建一个用于预测乳腺癌患者生存的预后模型 | 研究对象为乳腺浸润性癌（BRCA）患者的转录组和临床数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因组数据分析 | 比例风险回归模型 | 转录组数据 | 共涉及验证集和训练集的乳腺癌样本，具体数量未说明 |
| 565 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of multi-omics data for discovery of ferroptosis-related gene signature predicting immune activity in neuroblastoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1162563
PMID:37521469
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研究论文 | 本研究构建了一种与铁死亡相关的基因签名，以预测神经母细胞瘤的免疫活性 | 提出了一种新的FRG签名，可用于评估神经母细胞瘤免疫治疗效果，并整合多组学数据进行预测 | 尚需更多临床验证以确保在不同患者群体中的普遍适用性 | 探索神经母细胞瘤的免疫治疗结果的评估签名 | 神经母细胞瘤患者及其相关基因 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序和蛋白质组学 | Cox回归模型 | 基因数据 | 训练队列(GSE62564)及外部验证队列(TCGA)中的患者数据 |
| 566 | 2024-08-05 |
Spatial metabolomics in head and neck tumors: a review
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1213273
PMID:37519782
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综述 | 该文章全面回顾了空间代谢组学在头颈肿瘤研究中的应用进展 | 文章创新性地对传统代谢组学和空间代谢组学进行了比较，并讨论了空间代谢组学结合多组学在肿瘤代谢重编程研究中的应用挑战 | 对头颈肿瘤代谢机制的研究仍然处于未充分开发的阶段 | 探讨头颈肿瘤的代谢机制及其发生、发展和预后的研究进展 | 头颈肿瘤的代谢机制 | 数字病理学 | NA | 空间代谢组学 | NA | NA | NA |
| 567 | 2024-08-05 |
A Consensus Gene Regulatory Network for Neurodegenerative Diseases Using Single-Cell RNA-Seq Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_20
PMID:37525047
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研究论文 | 该文章提出了一种基于单细胞RNA测序数据的神经退行性疾病共识基因调控网络 | 创新点在于开发了一种集成方法，通过整合不同的基因调控网络算法来提升生物学见解 | 尽管采用了集成方法，但每个基因调控网络算法仍然基于其自身的假设，可能会限制预测的生物学意义 | 本研究旨在构建一个共识基因调控网络，以更好地理解神经退行性疾病的基因调控机制 | 研究对象为来自CK-p25小鼠模型的单细胞RNA测序数据集 | 系统生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成基因调控网络算法 | 基因表达数据 | NA |
| 568 | 2024-08-05 |
High throughput isolation of RNA from single-cells within an intact tissue for spatial and temporal sequencing a reality
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0289279
PMID:37527243
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研究论文 | 本研究开发了一种自动化的纳米吸管技术，以高通量从完整组织中分离单细胞RNA | 创新点在于结合了全自动纳米吸管技术与磁性纳米粒子，消除了手动操作的需求 | 研究未针对不同类型组织的适用性进行深入探讨 | 研究旨在提高从组织样本中获取高质量单细胞测序数据的效率 | 研究对象为来自乳腺癌组织切片的单个细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 22个乳腺癌组织切片中的细胞 |
| 569 | 2024-08-07 |
Autoimmune thyroid disease disrupts immune homeostasis in the endometrium of unexplained infertility women-a single-cell RNA transcriptome study during the implantation window
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1185147
PMID:37501789
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了自身免疫性甲状腺疾病（AITD）患者在着床窗口期子宫内膜的免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了AITD患者子宫内膜中免疫细胞亚型的组成和基因表达模式的差异 | 样本量较小，仅包括3名AITD患者和3名对照组 | 探讨AITD如何影响不明原因不孕女性子宫内膜的免疫稳态及其对着床的影响 | 不明原因不孕女性中AITD患者的子宫内膜免疫细胞 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 3名AITD患者和3名对照组 |
| 570 | 2024-08-07 |
Integrating scRNA and bulk-RNA sequencing develops a cell senescence signature for analyzing tumor heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1199002
PMID:37503331
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq），开发了一种细胞衰老标志物，用于分析透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤异质性 | 本研究创新性地结合了scRNA-seq和Bulk RNA-seq技术，以识别ccRCC中恶性与非恶性表型在三个衰老相关通路中的差异，并构建了一个新的风险模型 | NA | 分析细胞衰老在透明细胞肾细胞癌中的生化特性 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的细胞衰老 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 571 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor immune microenvironment in human hypopharygeal squamous cell carcinoma and lymphatic metastasis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1168191
PMID:37503341
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移的肿瘤免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移中的肿瘤免疫微环境，并识别了特定的细胞群和标记基因 | 研究样本仅来自五名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究喉下鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境，以提供新的治疗靶点和策略 | 喉下鳞状细胞癌、癌旁组织及淋巴组织 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 132,869个单细胞样本，来自五名喉下鳞状细胞癌患者 |
| 572 | 2024-08-07 |
A chemotherapy response prediction model derived from tumor-promoting B and Tregs and proinflammatory macrophages in HGSOC
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1171582
PMID:37519793
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研究论文 | 本研究开发了一种基于肿瘤促进B细胞、Tregs和促炎性巨噬细胞的高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）化疗反应预测模型 | 该模型包含43个特征基因，AUC值达到0.97，显著优于现有预测模型 | NA | 开发新的预测标志物，以准确预测高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | RNA-seq数据 | 88个样本 |
| 573 | 2024-08-07 |
Aerosolized miR-138-5p and miR-200c targets PD-L1 for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1166951
PMID:37520581
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研究论文 | 本研究探讨了通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c模拟物在肺癌预防中的联合效果 | 采用吸入方式递送微小RNA（miRNA）作为肺癌预防的新方法 | NA | 研究通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的效果 | miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的作用 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | NA | 小鼠 |
| 574 | 2024-08-07 |
Smart Microfluidics: Synergy of Machine Learning and Microfluidics in the Development of Medical Diagnostics for Chronic and Emerging Infectious Diseases
2023, Critical reviews in biomedical engineering
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研究论文 | 本文探讨了机器学习与微流控技术在慢性及新兴传染病医疗诊断中的协同作用 | 结合微流控技术和机器学习算法，开发智能微流控即时诊断设备，以应对传染病和慢性疾病的挑战 | 微流控系统的设计、制造和操作复杂性限制了其广泛应用 | 开发适用于发展中国家的智能微流控即时诊断设备，以改善临床结果 | 慢性及新兴传染病 | 机器学习 | NA | 微流控技术 | 机器学习算法 | NA | NA |
| 575 | 2024-08-07 |
Identifying Network Biomarkers for Alzheimer's Disease Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_19
PMID:37525046
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研究论文 | 本文提出了一种R工作流程，用于从通路网络中提取疾病扰动的子通路，并结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）表达谱构建基因-基因相互作用网络，以识别阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 本文采用了单细胞RNA测序技术，并结合系统层面的网络方法，提取疾病扰动的子通路，为复杂疾病如阿尔茨海默病的研究提供了新的网络生物标志物。 | NA | 开发一种新的方法来识别阿尔茨海默病的网络生物标志物。 | 阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 576 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the clinical implications of myeloid-derived suppressor cells in head and neck squamous cell carcinoma
2023, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2023.1611210
PMID:37475874
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了骨髓来源抑制细胞（MDSCs）在头颈鳞状细胞癌（HNSC）中的临床意义 | 发现了MDSCs在HNSC中的丰富性和其作为不良预后标志物的潜力，并确定了一组与MDSC相关的预后基因 | NA | 探讨MDSCs在HNSC中的作用及其作为免疫治疗靶点的可能性 | 头颈鳞状细胞癌中的骨髓细胞和MDSCs | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 较大的患者群体 |
| 577 | 2024-08-07 |
Development of Spondyloarthritis After COVID-19 in HLA-B27-Positive Monozygotic Twins: Case Reports With Single Cell Transcriptome Profiling
2023-Jan-01, Journal of rheumatic diseases
IF:2.2Q3
DOI:10.4078/jrd.22.0027
PMID:37476527
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病例报告 | 本文描述了两名23岁同卵双胞胎在COVID-19后被诊断为脊柱关节病的病例，并通过单细胞转录组分析探讨了其与典型放射性轴性脊柱关节病的差异。 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了COVID-19后脊柱关节病患者外周血单个核细胞的转录组特征与典型放射性轴性脊柱关节病的差异。 | 病例数量有限，需要更多研究来验证这些发现。 | 探讨COVID-19与脊柱关节病之间的可能联系，并通过单细胞转录组分析揭示其分子机制。 | 两名23岁同卵双胞胎在COVID-19后被诊断为脊柱关节病的病例。 | NA | 脊柱关节病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 两名患者 |
| 578 | 2024-08-07 |
Insight of a lipid metabolism prognostic model to identify immune landscape and potential target for retroperitoneal liposarcoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1209396
PMID:37483592
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研究论文 | 本研究通过基于脂质代谢相关基因（LMAGs）的预测模型，探索了腹膜后脂肪肉瘤（RPLS）的潜在靶点和免疫景观 | 本研究首次基于脂质代谢相关基因构建了预测模型，并识别了与抗原呈递细胞负相关的潜在靶点ELOVL2 | NA | 旨在通过脂质代谢相关基因探索腹膜后脂肪肉瘤的潜在靶点和免疫景观 | 腹膜后脂肪肉瘤（RPLS） | 数字病理学 | 腹膜后脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | 基因表达数据 | 234例样本，包括TCGA队列（58例）、GSE30929队列（92例）、FD队列（50例）、scRNA-seq队列（4例）和验证队列（30例） |
| 579 | 2024-08-07 |
Sox, Fox, and Lmx1b binding sites differentially regulate a Gdf5-Associated regulatory region during elbow development
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1215406
PMID:37492222
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研究论文 | 本文研究了转录因子Sox、Fox和Lmx1b结合位点在肘关节发育过程中对Gdf5相关调控区域的差异化调控作用 | 首次揭示了Fox/Sox结合位点对Gdf5相关调控区域活性的正向调控作用，以及Sox-only位点的抑制作用 | 研究主要集中在鸡和小鼠模型上，可能不完全适用于其他物种 | 探究Gdf5相关调控区域在肘关节发育中的调控机制 | Gdf5相关调控区域及其结合位点在肘关节发育中的作用 | 生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、原位杂交（ISH）、定点突变 | NA | 基因表达数据 | 鸡和小鼠的肢体和膝盖样本 |
| 580 | 2024-08-07 |
Identifying SARS-CoV-2 infected cells with scVDN
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1236653
PMID:37492254
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研究论文 | 本研究提出了一种深度学习框架——单细胞病毒检测网络（scVDN），用于预测单细胞的感染状态，特别是在识别SARS-CoV-2感染细胞方面表现出色 | scVDN在识别SARS-CoV-2感染细胞方面优于四种最先进的机器学习模型，即使在真实数据中标签极度不平衡的情况下也能达到完美的AUC评分 | NA | 开发一种有效的工具来识别单细胞水平的SARS-CoV-2感染细胞，以促进病毒研究和改善公共卫生 | SARS-CoV-2感染细胞的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多个鼻拭子样本来自多个贡献者，包含多种细胞类型 |