单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
561 2024-08-07
[Identification of transcriptional features and surface markers of plasma cell clones in POEMS syndrome by single-cell RNA sequencing]
2023, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别和发现了POEMS综合征中克隆浆细胞的转录特征和表面标记 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了POEMS综合征克隆浆细胞的独特转录特征和表面标记 研究样本仅来自10名患者,可能影响结果的普遍性 识别POEMS综合征中克隆浆细胞的转录特征和表面标记 POEMS综合征患者的骨髓浆细胞 数字病理学 浆细胞疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 10名患者
562 2024-08-07
Comprehensive analysis and immune landscape of chemokines- and chemokine receptors-based signature in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究旨在建立基于趋化因子和趋化因子受体的肝细胞癌(HCC)预后标志物,并探讨其与肿瘤免疫微环境的关系 成功建立了一个包含两个趋化因子(CCL14, CCL20)和一个趋化因子受体(CCR3)的预后标志物,并验证了其在HCC患者中的独立风险因素作用 NA 开发和验证一种新的预后生物标志物,深入探讨预后模型与肿瘤免疫微环境的关系 肝细胞癌(HCC)患者 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),实时定量PCR(RT-qPCR) Cox比例风险回归分析 基因表达数据 342名HCC患者
563 2024-08-07
Single-Cell RNA Sequencing and Transcriptome Analysis Revealed the Immune Microenvironment and Gene Markers of Acute Respiratory Distress Syndrome
2023, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的免疫微环境和基因标志物 首次使用单细胞RNA测序技术比较了脓毒症诱导的ARDS(SEP-ARDS)和肺炎性ARDS(PNE-ARDS)患者的外周血单核细胞,并识别了ARDS中的分子失调机制 NA 探索ARDS患者的免疫微环境和基因标志物 急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者的免疫细胞和基因表达 数字病理学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了GSE152978和GSE152979数据集,涉及ARDS患者和对照组的1939个差异表达基因
564 2024-08-07
Immune landscape in rejection of renal transplantation revealed by high-throughput single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用高吞吐量的单细胞RNA测序技术揭示了肾移植排斥反应中的免疫景观 首次在单细胞水平上分析了肾移植排斥反应中的细胞类型和分子机制,并识别了与排斥反应相关的特定细胞亚群和信号通路 研究样本仅包括三名抗体介导排斥反应患者和两名非排斥原因的急性肾损伤患者,样本量较小 探讨肾移植排斥反应中细胞层面的作用机制 肾移植组织活检样本中的单细胞 数字病理学 肾移植排斥反应 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 从三名抗体介导排斥反应患者和两名急性肾损伤患者的肾移植组织活检中获得了81,139个单细胞
565 2024-08-07
BCR-ABL1-driven exosome-miR130b-3p-mediated gap-junction Cx43 MSC intercellular communications imply therapies of leukemic subclonal evolution
2023, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本文研究了BCR-ABL1驱动的exosome-miR130b-3p介导的间隙连接Cx43 MSC细胞间通讯在白血病亚克隆进化中的作用及其治疗意义。 首次揭示了BCR-ABL1通过上调转录因子C/EBPβ诱导miR130a/b-3p表达,进而通过exosome介导的间隙连接Cx43 MSC细胞间通讯影响白血病微环境中的亚克隆进化。 研究主要集中在细胞和分子层面,临床应用的具体效果和安全性需要进一步验证。 探究BCR-ABL1驱动的exosome-miR130b-3p介导的间隙连接Cx43 MSC细胞间通讯在白血病亚克隆进化中的分子机制及其治疗潜力。 骨髓微环境中的间充质干细胞(MSCs)和白血病细胞。 数字病理学 白血病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 临床样本和细胞共培养实验
566 2024-08-07
Transcriptome sequencing reveals novel molecular features of SLE severity
2023, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用RNA测序和单细胞RNA测序技术,结合临床参数,分析了45名系统性红斑狼疮(SLE)患者的转录组特征,以识别与SLE严重程度相关的分子特征和信号通路 本研究首次识别了12个在严重SLE中差异表达的基因,并发现Treg细胞数量与AMPH表达呈负相关 NA 旨在识别与系统性红斑狼疮严重程度相关的分子特征和信号通路 系统性红斑狼疮(SLE)患者的转录组特征 数字病理学 自身免疫疾病 RNA测序(RNA-seq),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 45名SLE患者
567 2024-08-07
Construction of molecular typing in LIHC microenvironment based on lipid metabolism-related genes
2023, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:37559997
研究论文 本研究基于脂质代谢相关基因构建并验证了肝细胞癌(LIHC)中的两种细胞亚型C1和C2,以深入反映肝癌特征并补充临床分期系统的不足。 首次基于脂质代谢相关基因构建肝细胞癌的分子分型,并通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据进行验证。 研究样本量较小,且依赖于现有数据库中的数据,可能影响结果的普遍性。 旨在通过分子分型提高肝细胞癌的诊断和治疗效果。 肝细胞癌(LIHC)及其分子分型。 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、批量RNA测序 NA RNA序列数据 11个LIHC组织样本
568 2024-08-07
A novel classifier combining G protein-coupled receptors and the tumor microenvironment is associated with survival status in glioblastoma
2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量测序的综合数据,探讨了G蛋白偶联受体(GPCRs)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达模式及其与肿瘤微环境(TME)的关系 首次详细研究了GPCRs在GBM中的表达及其与TME的关联,并发现GPCRs与TME的分类是GBM的独立风险因素 NA 探索GPCRs在GBM中的作用及其与TME的关系,评估其作为GBM预后标志物的潜力 GPCRs在GBM中的表达及其与TME的相互作用 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 来自脑膜瘤和GBM患者的手术样本
569 2024-08-05
Effective Preprocessing of Single-Cell RNA-Seq for Unravelling Alzheimer's Disease Signatures
2023, Advances in experimental medicine and biology
研究论文 本研究探讨了单细胞RNA测序数据的预处理方法,以揭示阿尔茨海默病的特征 开发了一个探索性数据分析方法论,结合多种工具有效处理单细胞RNA测序数据 数据复杂性可能导致分析挑战,需要谨慎处理 研究单细胞RNA测序在阿尔茨海默病诊断中的应用 阿尔茨海默病的数据集 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA
570 2024-08-05
Cuproptosis/ferroptosis-related gene signature is correlated with immune infiltration and predict the prognosis for patients with breast cancer
2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究开发了一个与铜致死/铁死亡相关的基因预测模型,以预测乳腺癌患者的生存情况 提出了一种新的生存预测模型,该模型基于铜致死和铁死亡相关基因,能够有效评估乳腺癌患者的预后 该研究的样本来源主要依赖于TCGA和GEO数据库,可能存在样本选择偏倚 研究的目的是构建一个用于预测乳腺癌患者生存的预后模型 研究对象为乳腺浸润性癌(BRCA)患者的转录组和临床数据 数字病理学 乳腺癌 基因组数据分析 比例风险回归模型 转录组数据 共涉及验证集和训练集的乳腺癌样本,具体数量未说明
571 2024-08-05
Integrative analysis of multi-omics data for discovery of ferroptosis-related gene signature predicting immune activity in neuroblastoma
2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究构建了一种与铁死亡相关的基因签名,以预测神经母细胞瘤的免疫活性 提出了一种新的FRG签名,可用于评估神经母细胞瘤免疫治疗效果,并整合多组学数据进行预测 尚需更多临床验证以确保在不同患者群体中的普遍适用性 探索神经母细胞瘤的免疫治疗结果的评估签名 神经母细胞瘤患者及其相关基因 数字病理学 神经母细胞瘤 RNA测序和蛋白质组学 Cox回归模型 基因数据 训练队列(GSE62564)及外部验证队列(TCGA)中的患者数据
572 2024-08-05
Spatial metabolomics in head and neck tumors: a review
2023, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 该文章全面回顾了空间代谢组学在头颈肿瘤研究中的应用进展 文章创新性地对传统代谢组学和空间代谢组学进行了比较,并讨论了空间代谢组学结合多组学在肿瘤代谢重编程研究中的应用挑战 对头颈肿瘤代谢机制的研究仍然处于未充分开发的阶段 探讨头颈肿瘤的代谢机制及其发生、发展和预后的研究进展 头颈肿瘤的代谢机制 数字病理学 NA 空间代谢组学 NA NA NA
573 2024-08-05
A Consensus Gene Regulatory Network for Neurodegenerative Diseases Using Single-Cell RNA-Seq Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
研究论文 该文章提出了一种基于单细胞RNA测序数据的神经退行性疾病共识基因调控网络 创新点在于开发了一种集成方法,通过整合不同的基因调控网络算法来提升生物学见解 尽管采用了集成方法,但每个基因调控网络算法仍然基于其自身的假设,可能会限制预测的生物学意义 本研究旨在构建一个共识基因调控网络,以更好地理解神经退行性疾病的基因调控机制 研究对象为来自CK-p25小鼠模型的单细胞RNA测序数据集 系统生物学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 集成基因调控网络算法 基因表达数据 NA
574 2024-08-05
High throughput isolation of RNA from single-cells within an intact tissue for spatial and temporal sequencing a reality
2023, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究开发了一种自动化的纳米吸管技术,以高通量从完整组织中分离单细胞RNA 创新点在于结合了全自动纳米吸管技术与磁性纳米粒子,消除了手动操作的需求 研究未针对不同类型组织的适用性进行深入探讨 研究旨在提高从组织样本中获取高质量单细胞测序数据的效率 研究对象为来自乳腺癌组织切片的单个细胞 数字病理学 乳腺癌 RNA测序 NA RNA数据 22个乳腺癌组织切片中的细胞
575 2024-08-07
Autoimmune thyroid disease disrupts immune homeostasis in the endometrium of unexplained infertility women-a single-cell RNA transcriptome study during the implantation window
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了自身免疫性甲状腺疾病(AITD)患者在着床窗口期子宫内膜的免疫微环境 首次通过单细胞RNA测序揭示了AITD患者子宫内膜中免疫细胞亚型的组成和基因表达模式的差异 样本量较小,仅包括3名AITD患者和3名对照组 探讨AITD如何影响不明原因不孕女性子宫内膜的免疫稳态及其对着床的影响 不明原因不孕女性中AITD患者的子宫内膜免疫细胞 NA 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 3名AITD患者和3名对照组
576 2024-08-07
Integrating scRNA and bulk-RNA sequencing develops a cell senescence signature for analyzing tumor heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(Bulk RNA-seq),开发了一种细胞衰老标志物,用于分析透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤异质性 本研究创新性地结合了scRNA-seq和Bulk RNA-seq技术,以识别ccRCC中恶性与非恶性表型在三个衰老相关通路中的差异,并构建了一个新的风险模型 NA 分析细胞衰老在透明细胞肾细胞癌中的生化特性 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的细胞衰老 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(Bulk RNA-seq) NA RNA NA
577 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals tumor immune microenvironment in human hypopharygeal squamous cell carcinoma and lymphatic metastasis
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移的肿瘤免疫微环境 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移中的肿瘤免疫微环境,并识别了特定的细胞群和标记基因 研究样本仅来自五名患者,可能影响结果的普遍性 研究喉下鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境,以提供新的治疗靶点和策略 喉下鳞状细胞癌、癌旁组织及淋巴组织 数字病理学 头颈部癌症 单细胞RNA测序 NA 转录组 132,869个单细胞样本,来自五名喉下鳞状细胞癌患者
578 2024-08-07
A chemotherapy response prediction model derived from tumor-promoting B and Tregs and proinflammatory macrophages in HGSOC
2023, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究开发了一种基于肿瘤促进B细胞、Tregs和促炎性巨噬细胞的高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)化疗反应预测模型 该模型包含43个特征基因,AUC值达到0.97,显著优于现有预测模型 NA 开发新的预测标志物,以准确预测高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 预测模型 RNA-seq数据 88个样本
579 2024-08-07
Aerosolized miR-138-5p and miR-200c targets PD-L1 for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c模拟物在肺癌预防中的联合效果 采用吸入方式递送微小RNA(miRNA)作为肺癌预防的新方法 NA 研究通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的效果 miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的作用 NA 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和成像质谱流式细胞术(IMC) NA NA 小鼠
580 2024-08-07
Smart Microfluidics: Synergy of Machine Learning and Microfluidics in the Development of Medical Diagnostics for Chronic and Emerging Infectious Diseases
2023, Critical reviews in biomedical engineering
研究论文 本文探讨了机器学习与微流控技术在慢性及新兴传染病医疗诊断中的协同作用 结合微流控技术和机器学习算法,开发智能微流控即时诊断设备,以应对传染病和慢性疾病的挑战 微流控系统的设计、制造和操作复杂性限制了其广泛应用 开发适用于发展中国家的智能微流控即时诊断设备,以改善临床结果 慢性及新兴传染病 机器学习 NA 微流控技术 机器学习算法 NA NA
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