单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-05 |
Combining single-cell sequencing and spatial transcriptome sequencing to identify exosome-related features of glioblastoma and constructing a prognostic model to identify BARD1 as a potential therapeutic target for GBM patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263329
PMID:37727789
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤的外泌体相关特征，以更好地理解其细胞组成和分子特性 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组测序分析胶质母细胞瘤的外泌体相关基因，并构建了基于ERGs的预后模型 | 研究可能存在样本量不足或临床数据验证的局限性 | 旨在深入了解胶质母细胞瘤的细胞异质性及外泌体相关的分子特征 | 研究对象为胶质母细胞瘤患者的肿瘤细胞及其外泌体相关基因 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组RNA测序 (stRNA-seq) | NA | RNA | NA |
| 482 | 2024-08-07 |
Smarca4 deficiency induces Pttg1 oncogene upregulation and hyperproliferation of tubular and interstitial cells during kidney development
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1233317
PMID:37727504
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研究论文 | 本研究探讨了染色质重塑因子Smarca4缺失对肾脏发育中管状细胞和间质细胞增殖的影响 | 首次揭示了Smarca4在调控管状细胞分化和癌基因Pttg1表达中的关键作用 | NA | 研究Smarca4在肾脏发育中的作用及其对细胞增殖和分化的影响 | 肾脏发育中的管状细胞和间质细胞 | NA | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种类型的间质细胞和肾单位相关细胞 |
| 483 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing shows the immune cell landscape in the kidneys of patients with idiopathic membranous nephropathy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1203062
PMID:37731504
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了特发性膜性肾病患者的肾脏组织，揭示了免疫细胞的特征及其在疾病发病机制中的潜在作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细分析了特发性膜性肾病患者的肾脏免疫细胞景观，揭示了免疫细胞在疾病中的激活状态和相互作用 | 研究仅限于特发性膜性肾病患者，结果的普遍性和其他类型肾病的适用性有待进一步验证 | 探索特发性膜性肾病的分子机制 | 特发性膜性肾病患者的肾脏组织和健康对照组的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括特发性膜性肾病患者和健康对照组的肾脏组织样本 |
| 484 | 2024-08-07 |
Distribution characteristics of mitochondria-rich segments in the epididymis
2023, American journal of clinical and experimental immunology
IF:1.4Q4
PMID:37736076
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了附睾中线粒体的空间和段特异性分布模式 | 发现了附睾体部和尾部相比头部具有更高丰度的线粒体和线粒体转录，这一发现增加了对附睾复杂性的理解 | NA | 研究附睾细胞及其基因表达的空间-时间特性 | 附睾中的线粒体分布 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 485 | 2024-08-07 |
ScRNA-seq reveals the correlation between M2 phenotype of tumor-associated macrophages and lymph node metastasis of breast cancer
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029638
PMID:37744272
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了肿瘤相关巨噬细胞M2表型与乳腺癌淋巴结转移的关系，并筛选出与M2巨噬细胞激活和迁移相关的关键基因。 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了M2巨噬细胞在乳腺癌淋巴结转移中的作用及其相关基因，为乳腺癌淋巴结转移的治疗提供了潜在的靶点。 | 研究仅基于公开数据库的数据，未进行体内外实验验证，因此研究结果的临床应用还需进一步验证。 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞M2表型与乳腺癌淋巴结转移的关系，并筛选出关键的M2巨噬细胞相关基因。 | 乳腺癌患者的原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括乳腺癌患者的原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的单细胞转录组数据 |
| 486 | 2024-08-07 |
Multi-omics analysis reveals the association between elevated KIF18B expression and unfavorable prognosis, immune evasion, and regulatory T cell activation in nasopharyngeal carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1258344
PMID:37744335
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了KIF18B高表达与鼻咽癌不良预后、免疫逃逸及调节性T细胞激活的关联 | 首次全面分析了KIF18B在鼻咽癌中的表达及其对免疫抑制、上皮-间质转化（EMT）和治疗反应的影响 | 研究主要基于批量和单细胞转录组数据，未来需更多实验验证KIF18B在鼻咽癌中的具体作用机制 | 探讨KIF18B在鼻咽癌中的表达及其对预后和免疫微环境的影响 | 鼻咽癌组织及其中的KIF18B表达 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 免疫组化、Cox模型、CIBERSORT、EPIC、quanTIseq、BisqueRNA、CellChat、SRAMP平台 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 487 | 2024-08-07 |
TAGAP expression influences CD4+ T cell differentiation, immune infiltration, and cytotoxicity in LUAD through the STAT pathway: implications for immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1224340
PMID:37744350
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研究论文 | 本研究探讨了T-细胞激活GTP酶激活蛋白（TAGAP）在肺腺癌（LUAD）中的表达及其对CD4+ T细胞功能和预后的影响 | 本研究首次揭示了TAGAP通过STAT途径影响CD4+ T细胞的分化和功能，促进免疫浸润和细胞毒性 | NA | 研究TAGAP在肺腺癌中的表达及其对CD4+ T细胞功能和预后的影响 | 肺腺癌（LUAD）患者中的TAGAP表达及其与免疫浸润和临床数据的相关性 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个数据集，包括TCGA-LUAD、GEO和scRNA-seq数据集 |
| 488 | 2024-08-07 |
No NLRP3 inflammasome activity in kidney epithelial cells, not even when the NLRP3-A350V Muckle-Wells variant is expressed in podocytes of diabetic mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1230050
PMID:37744356
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析和实验验证，探讨了NLRP3炎症小体在糖尿病小鼠肾小管上皮细胞中的表达及活性，特别是Muckle-Wells变异体的影响。 | 首次证实肾小管上皮细胞（包括足细胞）即使表达NLRP3-A350V变异体，也不产生IL-1β和IL-18，表明NLRP3介导的肾小球炎症主要限于免疫细胞。 | 研究主要集中在小鼠模型和体外人足细胞实验，可能需要进一步的人体临床研究来验证结果。 | 验证NLRP3炎症小体在糖尿病肾病中肾小管上皮细胞的作用。 | 肾小管上皮细胞、足细胞、糖尿病小鼠模型。 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组分析、STED显微镜、组织清除技术 | 深度学习 | 转录组数据、图像 | 包括人肾组织、人足细胞、糖尿病小鼠模型 |
| 489 | 2024-08-07 |
The Cxcr2+ subset of the S100a8+ gastric granylocytic myeloid-derived suppressor cell population (G-MDSC) regulates gastric pathology
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1147695
PMID:37744359
|
研究论文 | 本文研究了胃髓源性抑制细胞（MDSCs）中S100a8+Cxcr2+亚群在胃病理中的调节作用 | 识别S100a8作为胃粒细胞MDSC（G-MDSC）群体的泛特异性标记，并研究了Cxcr2敲低的效果 | 先前研究中对胃CD11b+Ly6G+群体的异质性特征和不同亚群的靶向存在局限 | 探讨胃MDSCs的异质性和功能，特别是S100a8+Cxcr2+亚群的作用 | 胃髓源性抑制细胞（MDSCs）及其亚群 | 免疫学 | 胃癌 | 转录组和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及6个月Helicobacter felis感染的小鼠模型 |
| 490 | 2024-08-05 |
A novel signature constructed by differential genes of muscle-invasive and non-muscle-invasive bladder cancer for the prediction of prognosis in bladder cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1187286
PMID:37691944
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研究论文 | 本研究构建了一种基于肌肉侵袭性和非肌肉侵袭性膀胱癌差异基因的预后模型 | 提出了一种新的预后模型，并发现S100A9可能成为新的预后标志物和治疗靶点 | 研究的样本数据主要来源于公共数据库，可能限制了结果的广泛适用性 | 构建膀胱癌患者的预后模型并研究其预后情况 | 膀胱癌患者的差异表达基因及其在肌肉侵袭性和非肌肉侵袭性膀胱癌中的作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，微阵列 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌患者数据，以及GSE135337数据库的三名患者的单细胞测序数据 |
| 491 | 2024-08-05 |
Target-Captured mRNA from Murine Olfactory Bulb
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3425-7_12
PMID:37688731
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研究论文 | 本文描述了一种从小鼠嗅球富集低丰度嗅觉受体mRNA的方法，以进行空间转录组学。 | 提出了一种通过序列切割和靶向捕获富集测序的结合方法，以克服低丰度目标表达的挑战。 | 本文未详细讨论该方法在其他物种中的适用性 | 研究嗅觉系统中受体组织和功能策略的基本原理 | 小鼠的嗅球及其中的嗅觉受体mRNA | 数字病理学 | NA | 靶向捕获富集测序 | NA | RNA | NA |
| 492 | 2024-08-05 |
Identification of CHMP7 as a promising immunobiomarker for immunotherapy and chemotherapy and impact on prognosis of colorectal cancer patients
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1211843
PMID:37711849
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研究论文 | 本研究探讨了CHMP7作为结直肠癌患者免疫治疗和化疗的潜在免疫生物标志物及其对预后的影响 | CHMP7在肿瘤免疫中的作用和作为化疗及免疫治疗预后标志物的潜力是这项研究的创新点 | 肿瘤学对CHMP7的研究相对有限 | 旨在探讨CHMP7在结直肠癌中的表达及其对治疗效果和预后的影响 | 研究对象为结直肠癌组织样本和公共数据库中的多种肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 分析了多个肿瘤组织和临床收集的结直肠癌组织样本 |
| 493 | 2024-08-05 |
Genome-Wide RNA Tomography in the Mouse Whole Olfactory Mucosa
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3425-7_2
PMID:37688721
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研究论文 | 本研究描述了一种从新鲜冷冻小鼠整个嗅粘膜生成高质量RNA-seq文库的方法 | 开发了一种能够扩展到几乎任何脊椎动物器官或组织样本的空间转录组学方法 | 未提及具体的样本数量和不同类型的组织样本的应用限制 | 研究空间转录组学在组织内基因表达模式的整体轮廓 | 新鲜冷冻的小鼠整个嗅粘膜 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals zinc and copper ions homeostasis in epicardial adipose tissue of heart failure
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.82844
PMID:37705737
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了心力衰竭患者心外膜脂肪组织中的锌铜离子稳态 | 第一次使用伪时间重建技术绘制了心外膜脂肪组织中各种主要细胞类型的细胞轨迹 | 对心力衰竭患者心外膜脂肪组织的非免疫细胞的特征研究仍然有限 | 研究心力衰竭患者心外膜脂肪组织的免疫特征 | 包括一名新生儿、一名婴儿、一名儿童、两名成人心力衰竭患者及两名成人心脏移植供体的心外膜脂肪组织样本 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 七个样本，包括一名新生儿、一名婴儿、一名儿童、两名成人心力衰竭患者和两名成人非心力衰竭供体 |
| 495 | 2024-08-05 |
The core role of macrophages in hepatocellular carcinoma: the definition of molecular subtypes and the prognostic risk system
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1228052
PMID:37693905
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在肝细胞癌中的核心作用，定义了分子亚型及预后风险系统 | 创新点在于通过分析巨噬细胞特异性高表达基因建立了肝细胞癌的分类和预后评估系统 | 本研究的限制在于未能探讨其他免疫细胞在肝细胞癌中的作用 | 研究巨噬细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的功能及其对患者预后的影响 | 研究对象为不同亚型的肝细胞癌患者，重点关注巨噬细胞的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | GSE149614数据集中包含的样本数量未具体说明，但涉及肝细胞癌的单细胞RNA-seq数据 |
| 496 | 2024-08-07 |
Exploring the relationship between lactate metabolism and immunological function in colorectal cancer through genes identification and analysis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1173803
PMID:37691826
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研究论文 | 本研究通过综合分析乳酸代谢相关基因，利用单变量Cox回归分析和随机森林算法，识别与结直肠癌代谢相关的关键基因，并探讨这些基因与免疫微环境的关系 | 本研究首次揭示了MPC1、COQ2和ADAMTS13这三个乳酸代谢关键基因在结直肠癌中的预后价值，并验证了它们与CD4 T细胞的相关性 | NA | 探索乳酸代谢与结直肠癌免疫功能之间的关系，并识别相关的关键基因 | 结直肠癌患者的乳酸代谢相关基因及免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光多重免疫组化 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | NA |
| 497 | 2024-08-07 |
ANGPTL2+cancer-associated fibroblasts and SPP1+macrophages are metastasis accelerators of colorectal cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1185208
PMID:37691929
|
研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌肝转移的机制，并识别了ANGPTL2+癌症相关成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞作为转移促进因子。 | 本研究首次识别了ANGPTL2+癌症相关成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞作为结直肠癌肝转移的促进因子，并提供了潜在的治疗靶点。 | NA | 深入探索结直肠癌肝转移的新型促进因子和治疗靶点。 | 结直肠癌患者的RNA测序数据和临床病理信息。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数百个差异表达基因在肝转移结直肠癌与原发性结直肠癌中被筛选出。 |
| 498 | 2024-08-07 |
Pan-glioma analyses reveal species- and tumor-specific regulation of neuron-glioma synapse genes by lncRNAs
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1218408
PMID:37693314
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研究论文 | 本文通过跨物种的胶质瘤分析，揭示了长链非编码RNAs（lncRNAs）在神经-胶质瘤突触基因表达调控中的物种和肿瘤特异性 | 发现非人灵长类特异性的lncRNAs在神经-胶质瘤突触基因调控中比哺乳动物保守的lncRNAs更为重要，为肿瘤特异性胶质瘤治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 探讨神经-胶质瘤突触基因表达及其调控的物种和肿瘤特异性 | 胶质瘤中的神经-胶质瘤突触结构及其基因表达调控 | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 九个来自人和小鼠的scRNA-seq数据集 |
| 499 | 2024-08-05 |
Upregulated CD8+ MAIT cell differentiation and KLRD1 gene expression after inactivated SARS-CoV-2 vaccination identified by single-cell sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1174406
PMID:37654490
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研究论文 | 这项研究分析了灭活新冠病毒疫苗接种后T细胞的动态和转录组基因表达 | 通过单细胞测序技术揭示了CD8+ MAIT细胞分化和KLRD1基因表达的上调 | 研究仅基于三名参与者的数据，样本量较小 | 探讨灭活新冠病毒疫苗接种后T细胞亚群的特征和机制 | 三名参与者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 三名参与者的外周血单核细胞在四个时间点提取 |
| 500 | 2024-08-05 |
Helicase-like transcription factor (HLTF)-deleted CDX/TME model of colorectal cancer increased transcription of oxidative phosphorylation genes and diverted glycolysis to boost S-glutathionylation in lymphatic intravascular metastatic niches
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0291023
PMID:37682902
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研究论文 | 本研究探讨了缺失赫利卡酶样转录因子（HLTF）对结直肠癌的影响，发现其与代谢重编程和淋巴血管转移微环境中的S-谷胱甘肽化相关 | 首次展示了HLTF缺失在癌细胞及肿瘤微环境中的代谢重编程，减轻了淋巴血管转移微环境中的氧化应激 | 研究中未探讨肠道微生物组的多样性对代谢的潜在影响 | 研究HLTF缺失对结直肠癌细胞代谢及其微环境的作用 | 缺失HLTF的结直肠癌细胞与肿瘤微环境中的内皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，空间转录组学，2D DIGE，MALDI-TOF/TOF质谱 | 细胞系源性异种移植模型（CDX） | 转录组数据，蛋白质组数据 | NA |