单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-07 |
The role of tumor-associated macrophages in glioma cohort: through both traditional RNA sequencing and single cell RNA sequencing
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1249448
PMID:37781198
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研究论文 | 本研究通过传统的RNA测序和单细胞RNA测序分析了胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的作用 | 成功开发了一个包含12个基因的预测模型，该模型基于TAM相关基因，并通过生存分析和时间依赖的ROC曲线验证了其在胶质瘤中的预测意义 | NA | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在胶质瘤中的作用及其对预后的影响 | 胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质瘤队列 |
| 462 | 2024-08-07 |
High CD8+tumor-infiltrating lymphocytes indicate severe exhaustion and poor prognosis in angioimmunoblastic T-cell lymphoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1228004
PMID:37781365
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研究论文 | 本研究探讨了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的耗竭状态及其对预后的影响 | 首次全面揭示了AITL中CD8+TILs的耗竭状态及其对预后的潜在负面影响 | 研究样本量相对较小，需要进一步的大规模研究验证 | 阐明AITL中CD8+TILs的耗竭状态及其对预后的影响 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞（TILs） | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、RNA测序 | NA | RNA | 单细胞RNA测序（n=2）、流式细胞术（n=20）、RNA测序（n=20）、GEO数据集（n=51） |
| 463 | 2024-08-07 |
Comprehensive single-cell analysis reveals novel anergic antigen-presenting cell subtypes in human sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1257572
PMID:37781404
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对脓毒症患者的抗原呈递细胞进行全面的高分辨率分析 | 首次在人类脓毒症中进行抗原呈递细胞的全面单细胞分析，揭示了与疾病相关的新型无反应性树突状细胞亚型 | NA | 研究脓毒症中抗原呈递细胞的细胞亚群及其基因表达和细胞间相互作用 | 脓毒症患者的抗原呈递细胞，包括树突状细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 所有已发表的人类单细胞RNA测序数据 |
| 464 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals tumor heterogeneity in family neuroblastoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1197773
PMID:37790931
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了家族性神经母细胞瘤和散发性神经母细胞瘤病例的临床样本，构建了家族性神经母细胞瘤的完整转录组图谱，并发现了与家族性神经母细胞瘤相关的遗传因素和代谢特征。 | 首次通过单细胞RNA测序分析家族性神经母细胞瘤，揭示了其遗传和代谢特征，为治疗提供了新的靶点。 | 研究样本量较小，仅包括两个家族性神经母细胞瘤和四个散发性神经母细胞瘤病例。 | 揭示家族性神经母细胞瘤的遗传和代谢机制，为治疗提供新的靶点。 | 家族性神经母细胞瘤和散发性神经母细胞瘤的临床样本。 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | 单细胞RNA测序(sc-RNAseq) | NA | 转录组数据 | 18,394个细胞 |
| 465 | 2024-08-07 |
GPX8 regulates pan-apoptosis in gliomas to promote microglial migration and mediate immunotherapy responses
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1260169
PMID:37795080
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研究论文 | 本研究探讨了泛凋亡相关基因在胶质瘤患者中的分子特性，并利用机器学习技术开发了相关特征 | 首次深入研究了泛凋亡在胶质瘤中的作用，并开发了相关的分子特征 | 需要进一步的体外和体内实验来验证GPX8在胶质瘤中的致癌和免疫原性过程 | 阐明泛凋亡相关基因在胶质瘤患者中的分子特性，并开发预测肿瘤进展和免疫治疗策略的特征 | 胶质瘤患者中的泛凋亡相关基因 | 机器学习 | 脑肿瘤 | CCK-8, Transwell, EdU | NA | RNA测序 | NA |
| 466 | 2024-08-07 |
Analyzing alternative splicing in Alzheimer's disease postmortem brain: a cell-level perspective
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1237874
PMID:37799732
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研究论文 | 本文通过生物信息学方法分析了阿尔茨海默病（AD）患者死后脑组织中细胞水平的可变剪接事件（ASEs），揭示了AD病理中的剪接和表达变化 | 本文提供了一种新的策略，通过细胞水平的ASEs分析来识别神经退行性疾病中的显著变化，揭示了AD中细胞类型特异性的剪接变化 | NA | 研究阿尔茨海默病中细胞水平的可变剪接事件，以深入理解其病理机制 | 阿尔茨海默病患者的死后脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及大量RNA测序研究和两个单细胞RNA测序研究 |
| 467 | 2024-08-07 |
Cell-type expression and activation by light of neuropsins in the developing and mature Xenopus retina
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1266945
PMID:37799826
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研究论文 | 研究了神经视蛋白在发育中和成熟的非洲爪蟾视网膜中的细胞类型表达和光激活 | 探讨了神经视蛋白家族在视网膜中的表达和功能，这是先前研究较少的领域 | NA | 深入了解视网膜中神经视蛋白表达细胞的发育起始和光激活 | 神经视蛋白在非洲爪蟾视网膜中的表达和功能 | NA | NA | 原位杂交和免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及非洲爪蟾、斑马鱼、鸡和鼠的视网膜细胞 |
| 468 | 2024-08-05 |
Detection of lineage-reprogramming efficiency of tumor cells in a 3D-printed liver-on-a-chip model
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.86921
PMID:37771785
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研究论文 | 该研究探讨了在3D打印的肝脏芯片模型中肿瘤细胞的谱系重编程效率 | 通过简化重编程试剂的制备，使用两种慢病毒载体表达六个转录因子，实现了将MDA-MB-231肿瘤细胞重编程为人源诱导肝细胞样细胞（hiHeps） | 虽然已观察到肝特异性基因的激活，但重编程的所有机制和最佳策略尚未完全确定 | 研究谱系重编程在治疗三阴性乳腺癌肝转移中的应用 | MDA-MB-231肿瘤细胞及其重编程后的肝细胞样细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 慢病毒载体 | 3D打印肝脏芯片模型 | 单细胞测序 | 使用了MDA-MB-231细胞进行研究 |
| 469 | 2024-08-05 |
Regulatory T cells are associated with the tumor immune microenvironment and immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263537
PMID:37767092
|
研究论文 | 这篇文章探讨了调节性T细胞与三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应的关系 | 提出了一种基于调节性T细胞浸润的预后模型，并揭示了TK1作为肿瘤生物标志物的潜力 | 未提及具体的临床验证和多中心研究加强结果的局限性 | 研究三阴性乳腺癌中调节性T细胞浸润对肿瘤进展和免疫治疗反应的影响 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本和相关基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | METABRIC三阴性乳腺癌样本 |
| 470 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironment of ground glass nodules and solid nodules in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1198338
PMID:37745301
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了肺腺癌中的磨玻璃结节（GGN）和实性结节（SN）的肿瘤微环境 | 首次详细描述了GGN和SN的肿瘤微环境，并揭示了两者在细胞组成和转录组特征上的差异 | 研究样本量较小，仅包括三名GGN患者和三名SN患者 | 探究肺腺癌中磨玻璃结节和实性结节的不同恶性程度背后的机制 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 共分析了15,902个细胞，来自三名GGN患者和三名SN患者的肿瘤样本 |
| 471 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of mitophagy-related genes in diagnosis and heterogeneous endothelial cells in chronic rhinosinusitis: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1228028
PMID:37745856
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研究论文 | 本研究旨在探讨慢性鼻窦炎（CRS）中与线粒体自噬相关的基因（MRGs）的作用，特别是内皮细胞（ECs）的异质性 | 本研究首次综合分析了线粒体自噬相关基因在慢性鼻窦炎中的作用，并强调了内皮细胞异质性的重要性 | NA | 研究线粒体自噬相关基因在慢性鼻窦炎中的作用及其对内皮细胞异质性的影响 | 线粒体自噬相关基因和内皮细胞在慢性鼻窦炎中的作用 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | RNA测序 | 逻辑回归模型 | RNA测序数据 | 92个慢性鼻窦炎样本和35个健康对照样本 |
| 472 | 2024-08-07 |
A prognostic signature based on seven T-cell-related cell clustering genes in bladder urothelial carcinoma
2023, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2023-0773
PMID:37745978
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，筛选出与膀胱尿路上皮癌预后相关的七个T细胞相关细胞聚类基因，并构建了预测模型。 | 首次基于单细胞RNA测序数据筛选出七个T细胞相关细胞聚类基因，并构建了针对膀胱尿路上皮癌的预后模型。 | NA | 旨在通过分析膀胱尿路上皮癌的免疫微环境，为诊断和治疗提供指导。 | 膀胱尿路上皮癌的免疫细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Cox和LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 473 | 2024-08-07 |
Unveiling novel insights in prostate cancer through single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1224913
PMID:37746302
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示前列腺癌的新见解 | 使用单细胞RNA测序技术，能够在单个细胞水平上提供详细信息，特别适合识别稀有细胞群体 | NA | 揭示前列腺癌的复杂性和多样性 | 前列腺癌的细胞异质性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 474 | 2024-08-07 |
The immune checkpoint adenosine 2A receptor is associated with aggressive clinical outcomes and reflects an immunosuppressive tumor microenvironment in human breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1201632
PMID:37753093
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研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点腺苷2A受体（A2AR）在人乳腺癌中的临床和免疫学意义，发现A2AR的高表达与乳腺癌的侵袭性临床结果和免疫抑制性肿瘤微环境相关。 | 首次阐明了A2AR在乳腺癌患者中的临床和免疫学相关性，揭示了A2AR作为克服乳腺癌免疫逃逸的治疗靶点的潜力。 | NA | 研究A2AR在人乳腺癌中的临床和免疫学意义。 | 人乳腺癌中的A2AR表达及其与肿瘤微环境的关系。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RT-qPCR, 免疫组织化学, 数字细胞计量术, ESTIMATE计算方法, GSEA分析, scRNA-seq | NA | mRNA表达, 蛋白质分析, 微阵列数据, 单细胞数据库 | 使用大规模微阵列数据（METABRIC）进行分析 |
| 475 | 2024-08-05 |
Prediction of distinct populations of innate lymphoid cells by transcriptional profiles
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1227452
PMID:37719706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析结合机器学习技术来识别先天淋巴细胞。 | 提出了一种新的方法，通过深度神经网络准确分类淋巴细胞，并确定了在淋巴细胞发育中起重要作用的四个基因。 | 研究仅聚焦于外围血液中的ILCs，未能涵盖其他组织中的ILCs。 | 研究先天淋巴细胞的识别及其发育功能。 | 647名患者的单细胞RNA-seq数据。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度神经网络 | 转录组数据 | 647名患者，共26087个转录本 |
| 476 | 2024-08-05 |
Progress in research on tumor microenvironment-based spatial omics technologies
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029494
PMID:37744276
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研究论文 | 本文总结了空间转录组学和空间蛋白组学技术在表征肿瘤免疫微环境中的研究进展 | 本研究创新性地将空间组学应用于肿瘤微环境研究，揭示传统研究技术无法解决的问题 | 本文未提及具体的实验数据或样本分析，限制了结论的普遍适用性 | 旨在探讨空间组学在肿瘤微环境研究中的应用 | 研究对象为肿瘤微环境及其相关的免疫细胞和分子信息 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间组学技术 | NA | 分子信息 | NA |
| 477 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics of Aging Rat Ovaries Reveals Unexplored Cell Subpopulations with Reduced Antioxidative Defense
2023, Gerontology
IF:3.1Q3
DOI:10.1159/000533922
PMID:37717573
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研究论文 | 该研究首次描述了与卵巢衰老相关的空间转录组变化，并识别了潜在的预防目标 | 利用空间转录组学技术探索了老化大鼠卵巢中未被探索的细胞亚群及其抗氧化防御减少的特征 | 研究局限于大鼠模型，结果是否适用于人类尚不明确 | 更好地理解卵巢衰老过程中的遗传调控，以便改善与卵巢衰老相关的疾病治疗和生育保护选择 | 老鼠卵巢的空间转录组特征 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 年轻和老化大鼠的卵巢样本 |
| 478 | 2024-08-05 |
Discovery of neutralizing SARS-CoV-2 antibodies enriched in a unique antigen specific B cell cluster
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0291131
PMID:37729215
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研究论文 | 本文研究了从SARS-CoV-2恢复患者中分离的中和抗体，通过单细胞测序识别出特定B细胞簇 | 发现了一类富含SARS-CoV-2中和抗体的激活B细胞簇，并鉴定出两种有效的中和抗体 | 研究样本量较小，仅涉及15名参与者 | 探索新的SARS-CoV-2治疗抗体以应对病毒变异带来的抵抗问题 | 从15名SARS-CoV-2恢复患者收集的样本中分离的B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 抗体 | 15名SARS-CoV-2恢复参与者 |
| 479 | 2024-08-05 |
A 12-gene panel in estimating hormone-treatment responses of castration-resistant prostate cancer patients generated using a combined analysis of bulk and single-cell sequencing data
2023, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2023.2260387
PMID:37729607
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研究论文 | 本研究开发了一个12基因面板，用于估计去势抗性前列腺癌患者的激素治疗反应 | 提出了基于CRPC特有的肿瘤微环境特征构建的基因面板，为激素治疗反应预测提供了新工具 | 对CRPC特有的肿瘤微环境特征的了解仍然有限 | 研究去势抗性前列腺癌的激素治疗反应预测 | 去势抗性前列腺癌样本及相关基因表达特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | bulk-sequencing和单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 共分析了16个正常前列腺样本、13个前列腺癌样本、11个前列腺癌样本和6个去势抗性前列腺癌样本 |
| 480 | 2024-08-05 |
Advancement of single-cell sequencing for clinical diagnosis and treatment of pancreatic cancer
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1213136
PMID:37720505
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研究论文 | 单细胞测序技术在胰腺癌的临床诊断和治疗中的进展 | 本研究展示了单细胞测序在揭示胰腺癌转移和恶病质机制方面的独特见解 | NA | 探索单细胞测序在胰腺癌诊断和治疗中的应用潜力 | 胰腺癌中的单细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据 | NA |