单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
421	2024-08-07	Cell-type-specific molecular characterization of cells from circulation and kidney in IgA nephropathy with nephrotic syndrome 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1231937 PMID:37908345	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞的细胞类型特异性分子特征	首次系统地分析了肾病综合征IgA肾病患者的循环系统和肾脏组织的分子事件，为未来的靶向治疗提供了新的见解	NA	探究肾病综合征IgA肾病的细胞和分子状态	患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞	数字病理学	肾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	儿童患者
422	2024-08-07	Unraveling the prognostic significance and molecular characteristics of tumor-infiltrating B lymphocytes in clear cell renal cell carcinoma through a comprehensive bioinformatics analysis 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1238312 PMID:37908350	研究论文	本研究通过综合生物信息学分析，探索了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后意义和分子特征	本研究首次系统地探讨了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征，并提出了一个10基因标志物	需要进一步研究以明确肿瘤浸润B淋巴细胞在透明细胞肾细胞癌患者预后和治疗中的具体影响	探索透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征	透明细胞肾细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞	数字病理学	肾细胞癌	xCell算法, WGCNA方法, scRNA-seq数据分析	NA	转录组数据	使用了TCGA-KIRC和其他透明细胞肾细胞癌转录组数据集
423	2024-08-07	Construction and validation of a novel senescence-related risk score can help predict the prognosis and tumor microenvironment of gastric cancer patients and determine that STK40 can affect the ROS accumulation and proliferation ability of gastric cancer cells 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1259231 PMID:37915566	研究论文	本研究构建并验证了一种新型衰老相关风险评分，有助于预测胃癌患者的预后和肿瘤微环境，并确定STK40能影响胃癌细胞的ROS积累和增殖能力	本研究通过WGCNA算法和Lasso-Cox算法筛选出KL、SERPINE1和STK40作为构建预后模型的关键基因，并利用SSGSEA算法评估不同患者中免疫细胞和免疫功能的浸润及其与风险评分的关联	NA	评估胃癌患者的预后和免疫治疗效果	胃癌患者及其肿瘤微环境	数字病理学	胃癌	WGCNA算法, Lasso-Cox方法, SSGSEA算法, 单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
424	2024-08-07	Hepatitis B surface antigen reduction is associated with hepatitis B core-specific CD8+ T cell quality 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1257113 PMID:37920475	研究论文	研究了慢性乙型肝炎（CHB）患者在接受核苷（酸）类似物（NUC）治疗期间，CD8 T细胞的特性及其与乙型肝炎表面抗原（HBsAg）水平的关系	揭示了HBV特异性CD8 T细胞在患者体内的质量差异，并发现HBcore特异性CD8 T细胞的多功能性与HBsAg水平呈负相关	研究样本量较小，且仅限于特定病毒基因型的患者	探讨CD8 T细胞在CHB患者中的作用及其对HBsAg水平的影响	慢性乙型肝炎患者的CD8 T细胞及其与HBsAg的关系	免疫学	乙型肝炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq），多色流式细胞术	NA	RNA	6名捐赠者的CD69 CD8 T细胞用于scRNA-seq分析，26名捐赠者的PBMCs用于HBV特异性CD8 T细胞检测
425	2024-08-07	Identification of Cell-Cell Communications by Single-Cell RNA Sequencing in End Stage Renal Disease Provides New Insights into Immune Cell Heterogeneity 2023, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S424911 PMID:37927961	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的细胞间通讯，揭示了免疫细胞异质性的新见解	本研究首次通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的免疫细胞异质性及其细胞间通讯，发现了MIF信号通路在Th17/Treg细胞间通讯中的重要作用	NA	揭示慢性肾脏病进展过程中免疫细胞功能、组成及细胞间通讯的改变	终末期肾病患者及健康对照组的外周血单个核细胞	数字病理学	肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括常规血液透析患者和健康对照组的临床数据、血清及外周血单个核细胞样本
426	2024-08-05	[Applications of single-cell analysis in blood research] 2023, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology DOI:10.11406/rinketsu.64.1047 PMID:37899182	研究论文	本文介绍了单细胞技术在血液研究中的应用及其成果	探讨了单细胞测序技术在血液研究中的最新进展	NA	总结单细胞分析在血液研究中的应用	单细胞水平的DNA序列、RNA和蛋白质表达水平及表观基因组修饰	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	NA	NA
427	2024-08-07	RGS5 as a Biomarker of Pericytes, Involvement in Vascular Remodeling and Pulmonary Arterial Hypertension 2023, Vascular health and risk management IF:2.6Q2 DOI:10.2147/VHRM.S429535 PMID:37881333	研究论文	本文研究了RGS5作为周细胞生物标志物在血管重塑和肺动脉高压中的作用	发现RGS5通过周细胞调节肺微血管的血管重塑，为肺动脉高压的发生和创新治疗提供了新思路	NA	识别关键驱动基因以调控肺微血管的血管重塑，对肺动脉高压管理至关重要	RGS5在肺动脉高压中的表达及其在血管重塑中的作用	数字病理学	肺动脉高压	逆转录定量PCR (RT-qPCR)	NA	RNA序列	使用了多个GEO数据集（GSE117261, GSE48149, GSE113439, GSE53408, GSE16947）和正常及肺动脉高压小鼠样本
428	2024-08-07	Chronic HCV infection promotes cytotoxicity in antigen-specific CD8+ T cells regardless of virus specificity 2023, Frontiers in virology (Lausanne, Switzerland) DOI:10.3389/fviro.2023.1198361 PMID:37886042	研究论文	本研究探讨了慢性HCV感染对特定CD8+ T细胞的细胞毒性影响，并分析了不同治疗阶段对这些细胞的影响。	本研究首次描述了慢性HCV感染对非HCV病毒特异性CD8+ T细胞的细胞毒性影响，并提供了单细胞RNA测序技术的新见解。	研究仅包括慢性HCV感染者、自发缓解者和接受直接作用抗病毒治疗的患者，可能无法全面代表所有HCV感染情况。	深入了解HCV感染对CD8+ T细胞的影响，为开发有效的HCV疫苗提供依据。	HCV特异性CD8+ T细胞及非HCV病毒特异性CD8+ T细胞。	免疫学	肝炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括慢性HCV感染者、自发缓解者和接受直接作用抗病毒治疗的患者
429	2024-08-07	Unveiling mitophagy-mediated molecular heterogeneity and development of a risk signature model for colorectal cancer by integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq analysis 2023, Gastroenterology report IF:3.8Q2 DOI:10.1093/gastro/goad066 PMID:37886241	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，揭示了线粒体自噬在结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的作用，并建立了一个基于线粒体自噬的风险模型。	首次通过单细胞分辨率揭示了线粒体自噬在结直肠癌肿瘤微环境中的分子异质性，并开发了一个新的风险签名模型。	研究仅使用了有限的样本和数据集进行验证，可能需要更多的数据来进一步验证模型的普遍性和准确性。	阐明线粒体自噬在结直肠癌肿瘤微环境中的作用，并建立一个基于线粒体自噬的风险模型。	结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的线粒体自噬相关通路和分子特征。	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq）	无监督聚类算法，LASSO Cox分析	RNA序列	14,719个细胞来自8个样本
430	2024-08-05	Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration 2023, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2023.2268257 PMID:37849962	研究论文	本研究探讨了二肽基肽酶4抑制对放疗中T细胞浸润的促进作用	发现DPP4抑制可以增强放疗的抗肿瘤效果，通过促进化学趋化因子表达及T细胞浸润来实现	未明确提到样本数量及研究局限性	研究如何通过DPP4抑制增强放疗的疗效和T细胞的浸润	肺腺癌和黑色素瘤患者接受放疗后的T细胞浸润情况	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	NA	NA
431	2024-08-05	Expression of CKS2 in Hepatocellular Carcinoma: Correlation with Survival Outcomes and Immune Microenvironment 2023, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JHC.S427624 PMID:37841370	研究论文	本研究探讨了CKS2在肝细胞癌中的表达及其与生存结果和免疫微环境的关系	通过多组学分析揭示了CKS2在肝细胞癌进展中的作用，并提出其作为免疫治疗靶点的潜力	本研究主要依赖数据库分析，可能缺乏样本的多样性和临床验证	明确CKS2在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系	肝细胞癌患者的CKS2表达及其与免疫细胞浸润等相关性的研究	数字病理	肝癌	qRT-PCR和Western blot	NA	转录数据	使用多种数据库进行分析，具体样本数量未说明
432	2024-08-05	Beneficial effects of ginkgetin on improving nonalcoholic steatohepatitis characterized by bulk and single-cell RNA sequencing analysis 2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2023.1267445 PMID:37860111	研究论文	本研究评估了金固素对非酒精性脂肪性肝炎的影响及其相关机制	首次通过大规模和单细胞RNA测序分析揭示了金固素对NASH的影响和相关信号通路	该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的NASH情况	探究金固素对非酒精性脂肪性肝炎的改善作用及其机制	使用高脂饮食构建的NASH小鼠模型	数字病理学	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	构建高脂饮食小鼠模型，样本数量未具体描述
433	2024-08-05	Transcriptional signature of islet neogenesis-associated protein peptide-treated rat pancreatic islets reveals induction of novel long non-coding RNAs 2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2023.1226615 PMID:37842306	研究论文	研究揭示了INGAP-PP对大鼠胰岛施加的全球转录效应，特别是生成新的长非编码RNA	首次识别了由INGAP-PP诱导的9种新的长非编码RNA，这些RNA在成熟的β细胞中富集	研究主要基于大鼠模型，可能无法完全适用于人类	探讨INGAP-PP在大鼠胰岛中的转录机制，以理解其对β细胞功能的影响	成年大鼠胰岛，通过RNA-seq分析INGAP-PP处理的样本	数字病理学	糖尿病	RNA-seq	NA	RNA	大鼠胰岛样本的三重处理和对照组
434	2024-08-07	Integration of scRNA-Seq and bulk RNA-Seq uncover perturbed immune cell types and pathways of Kawasaki disease 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1259353 PMID:37841239	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（bulk RNA-Seq）数据，揭示了川崎病（KD）中免疫细胞类型和信号通路的扰动	本研究首次整合scRNA-Seq和bulk RNA-Seq数据，全面展示了KD中分子和细胞的改变，并指出了潜在的治疗靶点	需要进一步的验证和功能研究来阐明所识别的免疫细胞类型和通路在KD发病机制中的作用，并开发针对性的干预措施	旨在全面理解川崎病中的免疫失调	川崎病患者的免疫细胞类型和信号通路	数字病理学	川崎病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（bulk RNA-Seq）	NA	RNA序列数据	82名川崎病患者
435	2024-08-07	Deciphering Treg cell roles in esophageal squamous cell carcinoma: a comprehensive prognostic and immunotherapeutic analysis 2023, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2023.1277530 PMID:37842637	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了调节性T细胞（Treg细胞）在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的作用，并构建了一个与Treg细胞相关的特征（TAS），用于预测患者预后和免疫治疗反应。	本研究首次构建了一个与Treg细胞相关的特征（TAS），并通过多维评估验证了其预测食管鳞状细胞癌患者预后和免疫治疗反应的准确性和适用性。	NA	揭示Treg细胞在食管鳞状细胞癌中的作用，开发有效的预后模型和免疫治疗策略。	食管鳞状细胞癌（ESCC）中的Treg细胞及其在肿瘤微环境中的作用。	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序	NA	RNA	临床样本包括十对肿瘤和邻近组织
436	2024-08-07	[The Advance of the HSCT Evaluation at Single-Cell Scale --Review] 2023 Auguest, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi DOI:10.19746/j.cnki.issn.1009-2137.2023.05.054 PMID:37846722	综述	本文综述了单细胞尺度下造血干细胞移植（HSCT）评估的最新进展	利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术评估HSCT后的造血动力学	NA	探讨单细胞尺度下HSCT评估的进展及其在改善HSCT方案和临床结果中的应用	造血干细胞移植的细胞组成及移植后造血干细胞的归巢、植入和分化等重要事件	NA	恶性血液病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞数据	NA
437	2024-08-07	On the use of QDE-SVM for gene feature selection and cell type classification from scRNA-seq data 2023, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0292961 PMID:37856458	研究论文	本文研究了使用量子启发式差分进化（QDE）结合支持向量机（SVM）进行基因特征选择和细胞类型分类的方法	本文首次将基于分类的包装方法应用于scRNA-seq数据中的基因特征选择，特别是引入了QDE-SVM方法，显示出优于其他包装方法的细胞类型分类性能	NA	旨在改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别	scRNA-seq数据中的基因特征选择和细胞类型分类	机器学习	NA	scRNA-seq	支持向量机（SVM）	基因表达数据	十二个已知的scRNA-seq转录组数据集
438	2024-08-07	Coordination of Single-cell and Bulk RNA Sequencing to Construct a Cuproptosis-related Gene Prognostic Index for Endometrial Cancer Prognosis, Immune Microenvironment Infiltration, and Immunotherapy Treatment Options 2023, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.86325 PMID:37859813	研究论文	本研究旨在识别子宫内膜癌的分子亚型，并开发与铜死亡相关的基因预后指数（CRGPI），同时描述免疫特征及免疫检查点抑制剂（ICI）疗法在CRGPI定义的子宫内膜癌亚组中的疗效	本研究首次构建了基于铜死亡相关基因的预后指数（CRGPI），并验证了其在预测子宫内膜癌免疫治疗效果中的应用	NA	识别子宫内膜癌的分子亚型，开发铜死亡相关基因预后指数，并评估其在免疫治疗中的应用	子宫内膜癌及其免疫微环境	数字病理学	子宫内膜癌	RNA测序	Cox回归方法	RNA测序数据	TCGA数据集（n=492），IMvigor210数据集（n=348），GSE78220数据集
439	2024-08-07	Formin protein FMNL1 is a biomarker for tumor-infiltrating immune cells and associated with well immunotherapeutic response 2023, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.86965 PMID:37859818	研究论文	本研究通过分析公共数据、单细胞RNA测序和多重定量免疫荧光技术，验证了Formin蛋白FMNL1作为肿瘤浸润免疫细胞的生物标志物，并与良好的免疫治疗反应相关	首次深入验证了FMNL1在肿瘤微环境中的免疫相关性和细胞亚群表达模式，并证实其作为免疫治疗反应的预测标志物	需要进一步的研究来验证FMNL1在更多癌症类型中的作用，并探索其在肿瘤微环境中更深层次的功能	验证FMNL1作为肿瘤浸润免疫细胞的生物标志物，并探索其在免疫治疗反应中的作用	Formin蛋白FMNL1在肿瘤微环境中的表达模式及其与免疫治疗反应的关系	数字病理学	肝细胞癌	RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重定量免疫荧光	NA	mRNA	涉及多种癌症类型
440	2024-08-07	Effect of methanol fixation on single-cell RNA sequencing of the murine dentate gyrus 2023, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fnmol.2023.1223798 PMID:37860083	研究论文	本研究评估了甲醇固定对小鼠齿状回单细胞悬液及其后续单细胞RNA测序分析的影响	首次深入评估甲醇固定对成年原代分离脑组织的影响，并展示了其在单细胞RNA测序中的适用性	NA	评估甲醇固定作为样本保存方法对单细胞RNA测序的影响	小鼠齿状回的单细胞悬液及其后续单细胞RNA测序分析	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	CEL-seq2协议的机器人辅助版本（SORT-seq）	RNA	数千个细胞