单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-07 |
Integrative Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals Prognostic Characteristics of Macrophage Polarization-Related Genes in Lung Adenocarcinoma
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S430408
PMID:37942473
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌中与巨噬细胞极化相关基因的预后特征。 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序，从更广泛的角度识别与癌症发展和进展相关的重要基因。 | NA | 探索肺腺癌中巨噬细胞极化相关基因的预后价值及其机制。 | 肺腺癌中的巨噬细胞极化相关基因。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 424个巨噬细胞高变异基因，3920个差异表达基因，9561个差异表达基因 |
| 422 | 2024-08-07 |
A novel f-divergence based generative adversarial imputation method for scRNA-seq data analysis
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0292792
PMID:37948433
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研究论文 | 本文提出了一种基于f-散度的生成对抗插补方法sc-fGAIN，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的缺失值插补 | sc-fGAIN方法通过集成四种f-散度函数（交叉熵、Kullback-Leibler、反向KL和Jensen-Shannon），无需任何假设即可生成插补值，并证明了插补数据与原始数据的分布相同 | NA | 提高对单细胞RNA测序数据中缺失值的插补性能，以更好地理解细胞多样性和开发个性化治疗 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 生成对抗网络（GAN） | 数据 | NA |
| 423 | 2024-08-07 |
Elucidating the role of nicotinamide N-methyltransferase-p53 axis in the progression of chronic kidney disease
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16301
PMID:37953778
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研究论文 | 本文探讨了烟酰胺N-甲基转移酶（NNMT）-p53轴在慢性肾脏疾病进展中的作用 | 发现NNMT在慢性肾脏损伤中积累，可能减少p53的甲基化，增加p53的表达和活性，从而促进成纤维细胞活化和肾脏纤维化 | NA | 研究NNMT在肾脏纤维化中的作用及其机制 | 慢性肾脏疾病中的烟酰胺N-甲基转移酶（NNMT）-p53轴 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠和培养的肾间质成纤维细胞（NRK-49F）进行实验 |
| 424 | 2024-08-07 |
KYNU as a Biomarker of Tumor-Associated Macrophages and Correlates with Immunosuppressive Microenvironment and Poor Prognosis in Gastric Cancer
2023, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/2023/4662480
PMID:37954130
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研究论文 | 本文研究了Kynureninase (KYNU)在胃癌(GC)中的生物学效应和预后价值 | 首次报道KYNU在胃癌中的生物学效应和预后价值 | NA | 探讨KYNU在胃癌中的表达及其对免疫微环境和预后的影响 | 胃癌组织及其相关单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列 | 胃癌样本和正常胃组织样本 |
| 425 | 2024-08-07 |
Consistent analysis of differentially expressed genes across 7 cell types in papillary thyroid carcinoma
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.10.045
PMID:37954148
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研究论文 | 本研究通过整合分析两个甲状腺乳头状癌（PTC）单细胞转录组测序数据集，识别了在七种细胞类型中一致差异表达的基因 | 采用单细胞转录组测序技术，提高了细胞差异的分辨率，并通过整合分析增强了识别差异表达基因的统计能力 | 细胞基因组特征的高度异质性和大量无表达信号的基因可能导致假阳性结果 | 旨在通过单细胞转录组测序技术揭示甲状腺乳头状癌中细胞类型特异性反应的差异表达基因 | 研究对象包括B细胞、内皮细胞、上皮细胞、单核细胞、NK细胞、平滑肌细胞和T细胞等七种细胞类型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及两个研究中的32种常见细胞类型，识别出31个一致差异表达的基因 |
| 426 | 2024-08-07 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the role of phosphorylation-related genes in hepatocellular carcinoma stem cells
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1045260
PMID:37954208
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-07 |
Identification of a prognostic evaluator from glutamine metabolic heterogeneity studies within and between tissues in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1241677
PMID:37954858
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研究论文 | 本研究旨在探讨谷氨酰胺代谢在肝细胞癌（HCC）异质性中的作用，并基于HCC肿瘤内和组织间的谷氨酰胺代谢异质性研究开发一个预后评估器 | 本研究发现了与谷氨酰胺代谢相关的标记基因，并构建了一个六基因预后模型，可能作为HCC患者治疗和预后的预测器 | NA | 确定谷氨酰胺代谢对HCC异质性的影响并开发预后评估器 | 肝细胞癌（HCC）及其谷氨酰胺代谢异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组数据分析 | 机器学习算法（梯度提升机、支持向量机、随机森林、极端梯度提升、决策树、最小绝对收缩和选择算子） | 转录组数据 | GSE149614数据集包括10种细胞类型 |
| 428 | 2024-08-05 |
Research progress of single-cell sequencing in tuberculosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276194
PMID:37901241
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研究论文 | 这篇文章综述了单细胞测序在结核病研究中的进展 | 强调了单细胞测序技术在揭示结核病发病机制及免疫反应中的不同应用 | 文章提到各种技术的应用限制，但具体限制细节未详述 | 深入理解结核病研究中的空白和潜在的未来发展 | 单细胞测序技术在结核病的发病机制和免疫反应中的应用 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-08-05 |
Cardiac cellular diversity and functionality in cardiac repair by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1237208
PMID:37920179
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评论 | 这篇文章总结了单细胞转录组学在心脏修复中的主要发现 | 探讨了心脏细胞异质性及其在心肌缺血修复过程中的作用 | 文章未提供新的实验数据，仅为文献综述 | 旨在探讨心脏修复机制及开发新的治疗方法 | 涵盖心脏细胞类型、成分动态和与缺血相关的分子特征 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis technologies for cancer research: from tumor-specific single cell discovery to cancer therapy
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1276959
PMID:37900181
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综述 | 该文章探讨了单细胞测序(SCS)技术在癌症研究中的应用及其临床优势 | 文章系统性地研究了多种单细胞技术的基础概念、过程步骤及其在癌症治疗中的独特临床优势 | 尽管SCS技术具有改变癌症研究的潜力，但在管理和分析大规模数据方面仍面临挑战 | 突出SCS在癌症研究中的关键作用，并促进单细胞技术在癌症治疗中的应用 | 单细胞，包括循环肿瘤细胞(CTCs)、谱系追踪、肿瘤异质性、耐药性及肿瘤免疫治疗 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序(SCS) | NA | 单细胞数据 | 成千上万到百万的单细胞 |
| 431 | 2024-08-05 |
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1290696
PMID:37900283
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综述 | 本文回顾了黑色素瘤中预后和预测免疫生物标志物检测的不同技术 | 强调了多种方法用于表征黑色素瘤的免疫微环境并提供新型生物标志物 | 未明确提及具体的实验数据或样本规模 | 改善黑色素瘤的免疫生物标志物的检测方法 | 研究不同技术如何检测黑色素瘤中的生物标志物 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因表达谱、空间转录组学、基于人工智能的图像分析 | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-08-07 |
Proposing a novel molecular subtyping scheme for predicting distant recurrence-free survival in breast cancer post-neoadjuvant chemotherapy with close correlation to metabolism and senescence
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1265520
PMID:37900131
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研究论文 | 本研究提出了一种新的分子分型方案，用于预测乳腺癌患者在接受新辅助化疗后的无远处复发生存期，该方案与肿瘤代谢和细胞衰老密切相关。 | 本研究结合生物信息学和机器学习方法，通过综合分析确定了与乳腺癌远处复发相关的关键基因，并开发了一种新的分子分型方案。 | NA | 优化乳腺癌患者在接受新辅助化疗后远处复发的监测方案。 | 乳腺癌患者的无远处复发生存期。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列数据分析、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 101种算法组合 |
| 433 | 2024-08-07 |
Cell-type-specific molecular characterization of cells from circulation and kidney in IgA nephropathy with nephrotic syndrome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1231937
PMID:37908345
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞的细胞类型特异性分子特征 | 首次系统地分析了肾病综合征IgA肾病患者的循环系统和肾脏组织的分子事件，为未来的靶向治疗提供了新的见解 | NA | 探究肾病综合征IgA肾病的细胞和分子状态 | 患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 儿童患者 |
| 434 | 2024-08-07 |
Unraveling the prognostic significance and molecular characteristics of tumor-infiltrating B lymphocytes in clear cell renal cell carcinoma through a comprehensive bioinformatics analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1238312
PMID:37908350
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，探索了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后意义和分子特征 | 本研究首次系统地探讨了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征，并提出了一个10基因标志物 | 需要进一步研究以明确肿瘤浸润B淋巴细胞在透明细胞肾细胞癌患者预后和治疗中的具体影响 | 探索透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征 | 透明细胞肾细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | xCell算法, WGCNA方法, scRNA-seq数据分析 | NA | 转录组数据 | 使用了TCGA-KIRC和其他透明细胞肾细胞癌转录组数据集 |
| 435 | 2024-08-07 |
Construction and validation of a novel senescence-related risk score can help predict the prognosis and tumor microenvironment of gastric cancer patients and determine that STK40 can affect the ROS accumulation and proliferation ability of gastric cancer cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259231
PMID:37915566
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研究论文 | 本研究构建并验证了一种新型衰老相关风险评分，有助于预测胃癌患者的预后和肿瘤微环境，并确定STK40能影响胃癌细胞的ROS积累和增殖能力 | 本研究通过WGCNA算法和Lasso-Cox算法筛选出KL、SERPINE1和STK40作为构建预后模型的关键基因，并利用SSGSEA算法评估不同患者中免疫细胞和免疫功能的浸润及其与风险评分的关联 | NA | 评估胃癌患者的预后和免疫治疗效果 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | WGCNA算法, Lasso-Cox方法, SSGSEA算法, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 436 | 2024-08-07 |
Hepatitis B surface antigen reduction is associated with hepatitis B core-specific CD8+ T cell quality
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1257113
PMID:37920475
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研究论文 | 研究了慢性乙型肝炎（CHB）患者在接受核苷（酸）类似物（NUC）治疗期间，CD8 T细胞的特性及其与乙型肝炎表面抗原（HBsAg）水平的关系 | 揭示了HBV特异性CD8 T细胞在患者体内的质量差异，并发现HBcore特异性CD8 T细胞的多功能性与HBsAg水平呈负相关 | 研究样本量较小，且仅限于特定病毒基因型的患者 | 探讨CD8 T细胞在CHB患者中的作用及其对HBsAg水平的影响 | 慢性乙型肝炎患者的CD8 T细胞及其与HBsAg的关系 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多色流式细胞术 | NA | RNA | 6名捐赠者的CD69 CD8 T细胞用于scRNA-seq分析，26名捐赠者的PBMCs用于HBV特异性CD8 T细胞检测 |
| 437 | 2024-08-07 |
Identification of Cell-Cell Communications by Single-Cell RNA Sequencing in End Stage Renal Disease Provides New Insights into Immune Cell Heterogeneity
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S424911
PMID:37927961
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的细胞间通讯，揭示了免疫细胞异质性的新见解 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的免疫细胞异质性及其细胞间通讯，发现了MIF信号通路在Th17/Treg细胞间通讯中的重要作用 | NA | 揭示慢性肾脏病进展过程中免疫细胞功能、组成及细胞间通讯的改变 | 终末期肾病患者及健康对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括常规血液透析患者和健康对照组的临床数据、血清及外周血单个核细胞样本 |
| 438 | 2024-08-05 |
[Applications of single-cell analysis in blood research]
2023, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.64.1047
PMID:37899182
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研究论文 | 本文介绍了单细胞技术在血液研究中的应用及其成果 | 探讨了单细胞测序技术在血液研究中的最新进展 | NA | 总结单细胞分析在血液研究中的应用 | 单细胞水平的DNA序列、RNA和蛋白质表达水平及表观基因组修饰 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-08-07 |
RGS5 as a Biomarker of Pericytes, Involvement in Vascular Remodeling and Pulmonary Arterial Hypertension
2023, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S429535
PMID:37881333
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研究论文 | 本文研究了RGS5作为周细胞生物标志物在血管重塑和肺动脉高压中的作用 | 发现RGS5通过周细胞调节肺微血管的血管重塑，为肺动脉高压的发生和创新治疗提供了新思路 | NA | 识别关键驱动基因以调控肺微血管的血管重塑，对肺动脉高压管理至关重要 | RGS5在肺动脉高压中的表达及其在血管重塑中的作用 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 逆转录定量PCR (RT-qPCR) | NA | RNA序列 | 使用了多个GEO数据集（GSE117261, GSE48149, GSE113439, GSE53408, GSE16947）和正常及肺动脉高压小鼠样本 |
| 440 | 2024-08-07 |
Chronic HCV infection promotes cytotoxicity in antigen-specific CD8+ T cells regardless of virus specificity
2023, Frontiers in virology (Lausanne, Switzerland)
DOI:10.3389/fviro.2023.1198361
PMID:37886042
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研究论文 | 本研究探讨了慢性HCV感染对特定CD8+ T细胞的细胞毒性影响，并分析了不同治疗阶段对这些细胞的影响。 | 本研究首次描述了慢性HCV感染对非HCV病毒特异性CD8+ T细胞的细胞毒性影响，并提供了单细胞RNA测序技术的新见解。 | 研究仅包括慢性HCV感染者、自发缓解者和接受直接作用抗病毒治疗的患者，可能无法全面代表所有HCV感染情况。 | 深入了解HCV感染对CD8+ T细胞的影响，为开发有效的HCV疫苗提供依据。 | HCV特异性CD8+ T细胞及非HCV病毒特异性CD8+ T细胞。 | 免疫学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括慢性HCV感染者、自发缓解者和接受直接作用抗病毒治疗的患者 |