单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
SCALA: A complete solution for multimodal analysis of single-cell Next Generation Sequencing data
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.10.032
PMID:38022693
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研究论文 | 本文介绍了SCALA，一个用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）数据分析和可视化的生物信息学工具 | SCALA支持单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据的独立或整合分析，并提供多种分析模块，如功能富集、细胞轨迹推断、配体-受体分析和调控网络重建 | SCALA主要以独立版本提供，在线服务的功能有限 | 开发一个全面的解决方案，用于单细胞下一代测序数据的多模态分析 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 数据表，可视化图表 | 与TNF驱动的关节炎小鼠相关的两个用例 |
| 402 | 2024-08-07 |
Comprehensive bioinformatics analysis revealed potential key genes and pathways underlying abdominal aortic aneurysm
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.10.052
PMID:38022704
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和综合生物信息学分析，揭示了腹主动脉瘤潜在的关键基因和通路 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了关键基因在不同细胞类型中的差异分布模式，并发现了与这些基因相关的26种潜在药物 | NA | 识别腹主动脉瘤的潜在关键基因和通路，以开发治疗药物 | 腹主动脉瘤患者的腹主动脉组织和正常个体的腹主动脉组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1148个差异表达基因（631个上调，517个下调） |
| 403 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis and Alzheimer's disease: a bibliometric analysis
2023, American journal of neurodegenerative disease
PMID:38024391
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研究论文 | 本文通过文献计量分析研究单细胞RNA测序在阿尔茨海默病中的应用 | NA | NA | 探讨单细胞RNA测序在阿尔茨海默病早期检测和基因组治疗中的应用 | 阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 404 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling of Tumor-Associated Neutrophils in Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
2023, Lung Cancer (Auckland, N.Z.)
DOI:10.2147/LCTT.S430967
PMID:38025400
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对晚期非小细胞肺癌中的肿瘤相关中性粒细胞进行了全面的单细胞分辨率转录组分析 | 本研究首次定义了七种不同的肿瘤相关中性粒细胞亚型，并揭示了它们在肿瘤微环境中的相互作用 | NA | 旨在全面理解晚期非小细胞肺癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性 | 晚期非小细胞肺癌中的肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9个新鲜获取的样本 |
| 405 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Colonic Lamina Propria Immune Cells Reveals the Key Immune Cell-Related Genes of Ulcerative Colitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S440076
PMID:38026254
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结肠固有层免疫细胞，揭示与溃疡性结肠炎相关的关键免疫细胞相关基因 | 通过单细胞RNA测序技术，本研究首次识别出与溃疡性结肠炎相关的关键免疫细胞相关基因，并验证了这些基因与免疫细胞浸润的关系 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据库中的微阵列数据，可能需要进一步的人体试验验证 | 探索溃疡性结肠炎的新诊断基因及其与免疫细胞的潜在关系 | 结肠固有层免疫细胞及相关基因 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个公共数据库中的微阵列数据集（GSE75214, GSE87473, GSE92415, GSE87466）以及DSS诱导的结肠炎小鼠模型 |
| 406 | 2024-08-07 |
A novel prognostic signature and immune microenvironment characteristics associated with disulfidptosis in papillary thyroid carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1308352
PMID:38033866
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研究论文 | 研究基于单细胞RNA测序数据，探讨了二硫化物应激相关基因与甲状腺乳头状癌临床结果及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 首次构建了基于二硫化物应激相关基因的4基因风险模型，并验证了其在甲状腺乳头状癌中的独立预后价值 | NA | 探索二硫化物应激相关基因与甲状腺乳头状癌临床结果及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 甲状腺乳头状癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO分析 | RNA测序数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE191288数据集和TCGA-THCA数据库的数据 |
| 407 | 2024-08-07 |
Cascading effects of hypobaric hypoxia on the testis: insights from a single-cell RNA sequencing analysis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1282119
PMID:38033870
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了低压低氧环境对睾丸的级联效应及其对生殖细胞发育的影响。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了低压低氧环境对生殖细胞形成的调控作用及精子分化的影响。 | 研究仅限于实验室条件下的细胞和基因水平分析，未涉及临床或实际环境中的应用。 | 旨在阐明低压低氧环境对生殖细胞发育的调控机制及其对精子分化的影响。 | 研究对象包括生殖细胞、体细胞以及低压低氧环境对其相互作用的影响。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 408 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identified two subtypes and a taurine-related signature to predict the prognosis and efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.014
PMID:38034399
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研究论文 | 本研究通过综合分析识别出两种异质性肝细胞癌亚型及与牛磺酸相关的特征，用于预测肝细胞癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次识别并验证了两种具有不同牛磺酸代谢特征的肝细胞癌亚型，并构建了一个基于牛磺酸代谢相关基因的风险模型，用于评估患者的预后、免疫细胞浸润、免疫治疗反应和药物敏感性 | NA | 研究旨在识别能够预测肝细胞癌患者预后和免疫治疗反应的可靠生物标志物 | 肝细胞癌患者及其牛磺酸代谢特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 转录组数据分析 | 风险模型 | 转录组数据 | 多个独立的外部队列 |
| 409 | 2024-08-07 |
Construction of EMT related prognostic signature for kidney renal clear cell carcinoma, through integrating bulk and single-cell gene expression profiles
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1302142
PMID:38035023
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞基因表达数据，构建了与肾透明细胞癌（KIRC）相关的上皮-间质转化（EMT）预测模型 | 本研究构建了一个新的EMT相关预测模型，并发现si-LGALS1能够抑制KIRC细胞的迁移和侵袭能力 | NA | 挖掘更多与EMT相关的细节，并为KIRC构建预测模型 | 肾透明细胞癌（KIRC）及其EMT过程 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 2,249个显著差异表达基因（DEGs）在KIRC样本中，其中289个DEGs在上皮细胞中 |
| 410 | 2024-08-07 |
Insights on epithelial cells at the single-cell level in hepatocellular carcinoma prognosis and response to chemotherapy
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1292831
PMID:38044951
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌中的上皮细胞，旨在为肝细胞癌的预后和药物治疗反应提供靶点洞察 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肝细胞癌中上皮细胞的组成、分化演化和功能景观，并建立了一个与临床特征、上皮-间质转化及药物敏感性预测紧密相关的3基因风险模型 | NA | 专注于上皮细胞，为检测肝细胞癌的预后和药物治疗反应提供靶点洞察 | 肝细胞癌中的上皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自GSE149614的数据，包括八个主要的细胞亚群 |
| 411 | 2024-08-05 |
Organotypic heterogeneity in microvascular endothelial cell responses in sepsis-a molecular treasure trove and pharmacological Gordian knot
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1252021
PMID:38020105
|
review | 本文回顾了微血管内皮细胞在脓毒症相关多脏器功能障碍综合症中的异质性以及药物干预的潜在分子靶点 | 探讨了器官特异性微血管内皮细胞的分子异质性及其在脓毒症中的作用 | 未能将所获取的信息转化为有效的治疗方案 | 旨在深入理解脓毒症中内皮细胞的分子机制及其异质性 | 研究了脓毒症患者和动物模型中内皮细胞的响应 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 分子数据 | NA |
| 412 | 2024-08-07 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Merkel细胞癌患者的免疫治疗耐受性进行了纵向多组学分析，识别了T细胞、B细胞和单核细胞的反应特征。 | 首次通过纵向多组学研究揭示了Merkel细胞癌患者免疫治疗耐受性的细胞特征和动态变化。 | 研究样本量较小，仅包括四个时间点的外周血样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究Merkel细胞癌患者免疫逃逸的机制及促进免疫逃避的恶性细胞条件。 | Merkel细胞癌患者的免疫细胞反应和耐药性机制。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个时间点的外周血样本 |
| 413 | 2024-08-05 |
The m6A/m1A/m5C-Related Methylation Modification Patterns and Immune Landscapes in Rheumatoid Arthritis and Osteoarthritis Revealed by Microarray and Single-Cell Transcriptome
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S431076
PMID:37933335
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研究论文 | 本研究探讨了RNA修饰相关基因的表达特征，揭示了免疫景观并识别了潜在的诊断生物标志物 | 识别了六个潜在的OA和RA发病机制生物标志物，首次结合了RNA修饰与细胞焦亡的关系 | 未提及具体的限制 | 探究OA和RA患者RNA修饰相关基因的表达特征 | OA和RA患者的RNA修饰相关基因 | 数字病理学 | 关节炎 | RNA微阵列和单细胞测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 人类膝关节滑膜组织和小鼠DMM模型中的样本 |
| 414 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq public data reveal the gene regulatory network landscape of respiratory epithelial and peripheral immune cells in COVID-19 patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1194614
PMID:37936693
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研究论文 | 本研究分析了COVID-19患者和健康个体的基因调控网络 | 首次揭示了COVID-19患者呼吸上皮细胞和外周免疫细胞的基因调控网络 | 未详细探索不同感染严重程度下的所有潜在细胞互作 | 研究COVID-19患者中呼吸上皮细胞和外周免疫细胞的基因调控机制 | 健康个体及COVID-19患者的上皮和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和大规模RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公共数据集中的患者和健康个体 |
| 415 | 2024-08-05 |
Exploring key genes associated with neutrophil function and neutrophil extracellular traps in heart failure: a comprehensive analysis of single-cell and bulk sequencing data
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1258959
PMID:37941896
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研究论文 | 本文探讨了与心力衰竭中中性粒细胞功能和中性粒细胞外陷阱相关的关键基因 | 本文首次通过单细胞和整体测序数据的综合分析，识别了心力衰竭中与中性粒细胞外陷阱相关的13个差异表达基因，并确定了4个潜在的诊断生物标志物 | 研究可能受到样本规模和选择偏倚的影响 | 研究心力衰竭中中性粒细胞及其外陷阱功能的关键基因及生物标志物 | 心力衰竭患者和健康对照者的转录组数据，以及TAC小鼠模型中的中性粒细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 包括心力衰竭样本和TAC小鼠模型的数据集 |
| 416 | 2024-08-05 |
Multiscale modeling of drug resistance in glioblastoma with gene mutations and angiogenesis
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.10.037
PMID:37941656
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研究论文 | 本研究提出了一个多尺度的基于智能体的胶质母细胞瘤模型，探讨了基因突变和血管生成在药物耐受性中的作用 | 提出了一个整合的模型，结合了细胞动态、信号通路、基因突变和血管生成，提供了对肿瘤动态演化的深入理解 | 数学模型常常孤立地划分这些因素，可能无法全面反映其相互作用 | 研究胶质母细胞瘤中遗传突变与微环境适应对药物耐受性的影响 | 胶质母细胞瘤细胞及其相关的基因突变和微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq | 基于智能体的模型 | RNA-seq数据 | 来自胶质母细胞瘤患者的临床数据 |
| 417 | 2024-08-05 |
On-demand chlorine dioxide solution enhances odontoblast differentiation through desulfation of cell surface heparan sulfate proteoglycan and subsequent activation of canonical Wnt signaling
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1271455
PMID:37954207
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研究论文 | 本研究探讨了MA-T对牙本质生成的影响，强调了其通过调节细胞表面肝素硫酸蛋白聚糖和激活Wnt信号通路实现的机制 | 引入了新型的氯化氧化剂MA-T，展示了其在增强牙本质生成过程中的作用 | 研究中未提及具体的样本来源和数量，可能影响结果的广泛适用性 | 研究MA-T如何通过调节HSPG和激活Wnt信号通路来增强牙本质生成 | 研究对象为成牙本质细胞及其在不同处理下的反应 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA数据 | 发生在开发中的牙齿切片中的牙本质细胞群体 |
| 418 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing and transcriptome analyses in the construction of a liquid-liquid phase separation-associated gene model for rheumatoid arthritis
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1210722
PMID:37953920
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研究论文 | 本文探讨了液-液相分离在类风湿关节炎发病机制中的作用，并筛选了相关基因模型。 | 文章首次揭示了液-液相分离相关的中心基因MYC和MAP1LC3B在类风湿关节炎中的潜在角色与免疫学意义。 | 研究仅基于公开数据集，可能受样本异质性和数据质量的影响。 | 本研究旨在探讨液-液相分离在类风湿关节炎发病中的作用。 | 本文的研究对象为类风湿关节炎样本及正常样本。 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞测序，转录组分析 | 随机森林，支持向量机 | 转录组数据，单细胞测序数据 | 来自多个基因表达数据库的类风湿及正常样本，总体样本数量未详细说明 |
| 419 | 2024-08-07 |
Analysis of damage-associated molecular patterns in amyotrophic lateral sclerosis based on ScRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1259742
PMID:37942135
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序（ScRNA-seq）和批量RNA测序数据，分析了肌萎缩侧索硬化症（ALS）中损伤相关分子模式（DAMPs）的作用。 | 本研究首次详细分析了ALS中DAMPs在微胶质细胞中的表达及其在细胞间通讯中的作用，并构建了一个预测ALS患者生存的预后风险模型。 | 研究主要依赖于公共数据库中的数据，未来需要更多的临床样本验证研究结果。 | 探讨ALS中DAMPs的具体作用及其在疾病发展中的机制。 | ALS患者的初级运动皮质中的细胞类型及其DAMPs相关基因的表达。 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 从Gene Expression Omnibus（GEO）数据库中获取的ALS患者的初级运动皮质样本 |
| 420 | 2024-08-07 |
Identification of Genes Associated with Decreasing Abundance of Monocytes in Long-Term Peritoneal Dialysis Patients
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S435041
PMID:37942472
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研究论文 | 本研究旨在识别与长期腹膜透析患者单核细胞减少相关的基因 | 首次识别了长期腹膜透析患者中单核细胞减少相关的核心基因及其信号通路 | NA | 识别与长期腹膜透析患者单核细胞减少相关的基因及其分子机制 | 长期和短期腹膜透析患者的单核细胞相关基因 | NA | 慢性肾脏病 | RNA-seq | NA | RNA | 长期腹膜透析（LPD）和短期腹膜透析（SPD）患者的细胞样本 |