单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
Identification of fibroblast-related genes based on single-cell and machine learning to predict the prognosis and endocrine metabolism of pancreatic cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1201755
PMID:37588985
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和机器学习识别了与成纤维细胞相关的基因，以预测胰腺癌的预后和内分泌代谢 | 通过单细胞分析和加权共表达网络分析，构建了一个新的风险评估工具以评估胰腺癌的预后 | 本研究的样本量和数据集限制可能影响模型的泛化能力 | 探索胰腺癌相关基因的作用，并构建预测胰腺癌预后的风险评估工具 | 研究对象为胰腺腺癌细胞中的特定细胞亚群及相关基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | COX模型 | 基因组数据 | GSE165399数据集中的多种细胞亚群 |
| 382 | 2024-08-05 |
VG161 activates systemic antitumor immunity in pancreatic cancer models as a novel oncolytic herpesvirus expressing multiple immunomodulatory transgenes
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28108
PMID:36042555
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研究论文 | VG161是一种表达多种免疫调节转基因的新型溶瘤疱疹病毒，可以激活胰腺癌模型中的全身抗肿瘤免疫 | VG161是首个携带多种协同抗肿瘤免疫调节因素的重组溶瘤疱疹病毒 | 目前尚未进行临床试验，实际临床效果需进一步验证 | 研究VG161在胰腺癌模型中激活抗肿瘤免疫的机制 | 胰腺癌模型中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、气流辅助解吸电喷雾离子化-质谱成像（AFADSI-MSI）、纳米字符串技术 | NA | 细胞样本 | 临床样本变化，具体数量未明确 |
| 383 | 2024-08-07 |
Bulk and single-cell RNA-sequencing analyses along with abundant machine learning methods identify a novel monocyte signature in SKCM
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1094042
PMID:37304304
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析，结合多种机器学习方法，识别出皮肤黑色素瘤（SKCM）中与疾病特异性生存相关的新型单核细胞特征 | 本研究构建了一个由八个基因组成的单核细胞相关特征（MRS），并验证其为疾病特异性生存的独立风险因素，具有比传统临床变量和分子特征更高的准确性 | NA | 探索皮肤黑色素瘤（SKCM）免疫微环境中免疫细胞通信的全局模式，并建立基于关键特异性生物标志物的预后特征 | 皮肤黑色素瘤（SKCM）中的免疫细胞及其通信网络 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的单细胞RNA测序数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 384 | 2024-08-05 |
Identification of cytokine-induced cell communications by pan-cancer meta-analysis
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16221
PMID:38054018
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研究论文 | 本研究提供了一个关于不同癌症中细胞因子介导的细胞通讯的综合分析 | 开发了一种单细胞方法，揭示了84种细胞因子和受体的稳定细胞通讯 | 在不同癌症中细胞因子介导的细胞通讯的知识仍然有限 | 研究细胞因子与受体的相互作用及其在癌症中的作用 | 涉及41,900个细胞和32种TCGA癌症类型的样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 包括32种TCGA癌症类型的10,967个样本 |
| 385 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell Transcriptomics Data Reveal Differences in Cell Composition and Communication in Acne
2023, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S436776
PMID:38053721
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研究论文 | 这篇文章探讨了痤疮患者与健康皮肤之间细胞组成和沟通模式的差异 | 揭示了痤疮患者中不同细胞群体的特征变化以及性别之间的细胞沟通差异 | 研究未涉及其他影响痤疮患者细胞特征和沟通的潜在因素 | 旨在为痤疮患者提供精确治疗的细胞比较数据 | 分析痤疮患者与健康皮肤中的细胞 | 数字病理学 | 痤疮 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 分析了70,189个细胞 |
| 386 | 2024-08-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data reveals epithelial-mesenchymal transition molecular subtype and signature to predict prognosis, immunotherapy efficacy, and drug candidates in low-grade gliomas
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1276466
PMID:38053842
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了低级别胶质瘤中上皮-间质转化（EMT）分子亚型及其特征，用于预测预后、免疫治疗效果和药物候选 | 本研究首次通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了低级别胶质瘤中EMT相关的分子亚型和预后特征，为个性化治疗和预后判断提供了新方法 | 本研究主要基于TCGA-LGG数据集，未来需要更多独立数据集的验证 | 探索低级别胶质瘤中基于EMT相关基因的分子亚型、免疫景观和预后特征，以促进治疗决策和药物发现 | 低级别胶质瘤（LGG）中的上皮-间质转化（EMT）相关基因及其在分子亚型、免疫景观和预后中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类算法 | 基因表达数据 | TCGA-LGG数据集 |
| 387 | 2024-08-05 |
Core binding factor subunit β plays diverse and essential roles in the male germline
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1284184
PMID:38020932
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研究论文 | 这篇文章报告了核心结合因子亚单位β（CBFβ）在男性生殖系中的关键角色 | 揭示了CBFβ在未分化精原细胞中的多种功能，包括增殖、存活和生殖系维护 | 研究主要限于小鼠模型，尚不清楚其在人类中的具体作用 | 探讨CBFβ在青少年时期生殖系发育及精子生成过程中的作用 | 研究对象为小鼠模型中的男性生殖细胞 | 数字病理学 | 不育 | 条件性基因敲除（cKO） | NA | 空间转录组学 | 小鼠 |
| 388 | 2024-08-05 |
Erratum: Atlas of human dental pulp cells at multiple spatial and temporal levels based on single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1331650
PMID:38028768
|
更正 | 本文是对先前文章的更正。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-05 |
Enhanced annotation of CD45RA to distinguish T cell subsets in single-cell RNA-seq via machine learning
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad159
PMID:38023329
|
研究论文 | 本研究通过机器学习增强了CD45RA的注释，以区分单细胞RNA-seq中的T细胞亚群 | 采用机器学习训练CD45RA+/-分类器，首次实现了对T细胞scRNA-seq分析中的细胞类型注释 | 由于短读段映射到基因的困难，CD45RA的特征化仍存在一定的局限性 | 提高对T细胞亚群的准确识别与理解 | CD45RA阳性和阴性T细胞亚群的单细胞RNA表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 | mRNA计数数据 | NA |
| 390 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis reveals specific neuronal transition during mouse corticogenesis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1209320
PMID:38020907
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠皮层发生过程中的特定神经元转变 | 发现一个特定的细胞群体D-T-U，显示出在小鼠皮层发育过程中直接的深层与上层神经元转变 | 研究主要集中在小鼠和人类胚胎皮层，未能涵盖其他物种或发育阶段 | 探索小鼠皮层发育中的神经元转变机制 | 小鼠和人类胚胎皮层的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及小鼠和人类胚胎皮层的多个单细胞样本 |
| 391 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals a four-gene signature for predicting survival and immunotherapy response in colon cancer patients using bulk and single-cell RNA-seq data
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1277084
PMID:38023180
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研究论文 | 本研究开发了一个新的四基因预后模型，以预测结肠癌患者的生存率和免疫治疗反应 | 提出了一个基于四个独立预后基因的风险模型，并通过多种数据验证其临床意义 | 尽管模型经过训练和验证，但对不同癌症类型的普适性仍需进一步研究 | 利用单细胞RNA测序和批量转录组测序数据开发结肠癌的预后模型 | 结肠癌样本中的细胞类型及其基因表达特征 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 33,213个细胞 |
| 392 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis reveals CLIC1 as a therapeutic vulnerability of gliomas
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1279370
PMID:38027011
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了氯离子通道1 (CLIC1) 在胶质瘤中的重要性和作为治疗靶点的潜力 | 通过多组学数据分析和实验验证，首次系统阐明了CLIC1在胶质瘤中的作用及其与治疗响应的关联 | 虽然揭示了CLIC1的治疗潜力，但受限于对肿瘤微环境和免疫反应的复杂性分析不足 | 研究CLIC1在胶质瘤中的功能及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 主要研究对象为胶质瘤细胞系U251和U373 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 多组学分析，包括转录组学和单细胞转录组学 | NA | NA | 来自多个公共队列的胶质瘤多组学数据 |
| 393 | 2024-08-05 |
A Macrophage-Related Gene Signature for Identifying COPD Based on Bioinformatics and ex vivo Experiments
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S438308
PMID:38050560
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研究论文 | 本研究旨在探讨免疫细胞与COPD发展的关联，并根据免疫微环境的变化提供COPD的诊断新方法 | 构建了一个新的基于M0巨噬细胞相关基因的COPD诊断模型，具有良好的预测价值 | 样本量的多样性和外部验证集的性能差异可能限制模型的广泛应用 | 研究COPD的免疫微环境变化以及其对COPD诊断的影响 | 主要研究巨噬细胞及其相关基因在COPD患者中的作用 | 数字病理学 | COPD | 生物信息学, 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个数据集，包含GSE20257和GSE10006等 |
| 394 | 2024-08-05 |
Cellular crosstalk of macrophages and therapeutic implications in non-small cell lung cancer revealed by integrative inference of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1295442
PMID:38044943
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研究论文 | 本研究描绘了非小细胞肺癌中巨噬细胞的细胞间相互作用及其治疗意义 | 首次生成了398170个细胞的单细胞图谱，揭示了巨噬细胞在肿瘤微环境中的适应能力及其肿瘤相关巨噬细胞亚型 | 研究主要集中于特定的肿瘤细胞和巨噬细胞，可能未能涵盖所有可能的相互作用 | 探讨非小细胞肺癌中巨噬细胞的角色以及其对免疫治疗的影响 | 52名非小细胞肺癌患者的单细胞及巨噬细胞特征 | 数字病理 | 非小细胞肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 52名非小细胞肺癌患者，398170个细胞 |
| 395 | 2024-08-07 |
Development of a diagnostic and risk prediction model for Alzheimer's disease through integration of single-cell and bulk transcriptomic analysis of glutamine metabolism
2023, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2023.1275793
PMID:38020758
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析谷氨酰胺代谢，开发了一种用于阿尔茨海默病诊断和风险预测的模型 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量转录组分析，结合机器学习算法，识别了与谷氨酰胺代谢相关的特征基因，并构建了风险模型 | NA | 提高阿尔茨海默病的诊断和风险预测效果 | 阿尔茨海默病患者 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习算法（Boruta, LASSO, SVM-RFE） | 转录组数据 | NA |
| 396 | 2024-08-07 |
Analysis of Nucleoporin 107 Overexpression and Its Association with Prognosis and Immune Infiltration in Lung Adenocarcinoma by Bioinformatics Methods
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S441185
PMID:38021066
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法分析了核孔蛋白107（NUP107）在肺腺癌（LUAD）中的过表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 首次阐明了NUP107在肺腺癌中的作用及其与细胞周期调控和免疫浸润的关联 | NA | 探讨NUP107在肺腺癌中的表达及其对预后和免疫浸润的影响 | 肺腺癌中的NUP107表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR），免疫组化（IHC） | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 使用TCGA和多个GEO数据集进行分析 |
| 397 | 2024-08-07 |
SCALA: A complete solution for multimodal analysis of single-cell Next Generation Sequencing data
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.10.032
PMID:38022693
|
研究论文 | 本文介绍了SCALA，一个用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）数据分析和可视化的生物信息学工具 | SCALA支持单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据的独立或整合分析，并提供多种分析模块，如功能富集、细胞轨迹推断、配体-受体分析和调控网络重建 | SCALA主要以独立版本提供，在线服务的功能有限 | 开发一个全面的解决方案，用于单细胞下一代测序数据的多模态分析 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 数据表，可视化图表 | 与TNF驱动的关节炎小鼠相关的两个用例 |
| 398 | 2024-08-07 |
Comprehensive bioinformatics analysis revealed potential key genes and pathways underlying abdominal aortic aneurysm
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.10.052
PMID:38022704
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和综合生物信息学分析，揭示了腹主动脉瘤潜在的关键基因和通路 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了关键基因在不同细胞类型中的差异分布模式，并发现了与这些基因相关的26种潜在药物 | NA | 识别腹主动脉瘤的潜在关键基因和通路，以开发治疗药物 | 腹主动脉瘤患者的腹主动脉组织和正常个体的腹主动脉组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1148个差异表达基因（631个上调，517个下调） |
| 399 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis and Alzheimer's disease: a bibliometric analysis
2023, American journal of neurodegenerative disease
PMID:38024391
|
研究论文 | 本文通过文献计量分析研究单细胞RNA测序在阿尔茨海默病中的应用 | NA | NA | 探讨单细胞RNA测序在阿尔茨海默病早期检测和基因组治疗中的应用 | 阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 400 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling of Tumor-Associated Neutrophils in Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
2023, Lung Cancer (Auckland, N.Z.)
DOI:10.2147/LCTT.S430967
PMID:38025400
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对晚期非小细胞肺癌中的肿瘤相关中性粒细胞进行了全面的单细胞分辨率转录组分析 | 本研究首次定义了七种不同的肿瘤相关中性粒细胞亚型，并揭示了它们在肿瘤微环境中的相互作用 | NA | 旨在全面理解晚期非小细胞肺癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性 | 晚期非小细胞肺癌中的肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9个新鲜获取的样本 |