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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
The integrated single-cell analysis developed a lactate metabolism-driven signature to improve outcomes and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1154410
PMID:37033259
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析构建了乳酸代谢驱动的特征模型，用于改善肺腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 首次利用单细胞RNA测序分析结合乳酸代谢相关基因构建预后模型，并验证了AHSA1基因在肺腺癌中的作用 | 需要更多外部数据集验证模型的普适性，实验验证仅限于AHSA1基因 | 构建基于乳酸代谢相关基因的预后模型，改善肺腺癌患者的治疗结果和免疫治疗效果 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, AUCell算法, 相关性分析, Cox回归, Lasso回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 多个外部独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
A novel liver zonation phenotype-associated molecular classification of hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140201
PMID:36936935
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研究论文 | 基于肝分区特征建立了一种新的肝细胞癌分子分型系统 | 首次鉴定94个人类肝细胞特异性分区标志物，并基于这些标志物将肝细胞癌分为三个具有不同预后和免疫特征的亚型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索肝细胞癌的肝分区特征并建立新的分子分型系统 | 肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序，微阵列分析 | 非负矩阵分解共识聚类 | 基因表达数据 | 训练集616例HCC样本，验证集285例HCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq，微阵列 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究通过人类扁桃体离体模型探索HIV-1感染在淋巴组织中诱导的特定转录组变化 | 首次在人类扁桃体离体模型中揭示HIV-1感染的CD4+ T细胞氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞的NLRP3炎症小体通路激活 | 研究基于离体模型，可能无法完全反映体内复杂环境；样本来源有限 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其与慢性炎症的关系 | 健康人类供体的扁桃体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类供体的扁桃体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Exploring the optimization of autoencoder design for imputing single-cell RNA sequencing data
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.041
PMID:37671239
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研究论文 | 通过实证研究探索自编码器设计对单细胞RNA测序数据插补性能的影响 | 首次系统研究自编码器架构和超参数选择对scRNA-seq数据插补性能的影响，发现与计算机视觉领域不同的最佳实践 | 研究结果基于实证分析，缺乏理论证明 | 优化自编码器设计以提高单细胞RNA测序数据插补性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 多个真实和模拟的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016
PMID:36608902
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研究论文 | 本研究揭示了肠内分泌细胞通过调节隐窝代谢向干细胞巢传递营养信息的重要机制 | 首次证明肠内分泌细胞作为营养传感器，通过调节隐窝代谢向肠道干细胞巢传递营养状态信息 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官，需要进一步验证在完整生理系统中的功能 | 探究肠内分泌细胞在调节肠道干细胞巢代谢和功能中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞、人类肠道类器官、肠道干细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 间接热量测定、1H-NMR代谢组学、线粒体活体成像、单细胞测序 | NA | 代谢数据、成像数据、基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 10x Genomics, Agilent Technologies | 单细胞RNA测序, 代谢分析 | 10x Chromium, Seahorse生物分析仪 | 10x Genomics单细胞测序平台，Agilent Seahorse XF分析仪 |
| 26 | 2025-10-06 |
A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer
2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04471-7
PMID:36376617
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研究论文 | 本研究构建了一个铜死亡相关基因特征模型，用于预测头颈鳞状细胞癌患者的预后和免疫微环境 | 首次系统评估头颈鳞状细胞癌中铜死亡相关基因的差异表达和遗传改变，并构建了基于10个CRG的风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 评估铜死亡相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫微环境关联 | 头颈鳞状细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序，基因表达分析，拷贝数变异分析 | Cox回归分析，lasso回归 | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | 来自公共数据库的头颈鳞状细胞癌和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
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研究论文 | 本研究探讨CD73通过产生细胞外腺苷在胰腺炎中促进中性粒细胞介导的组织损伤修复和抑制化生的作用机制 | 首次揭示CD73缺失导致胰腺炎中持续化生和炎症的机制，并证明中性粒细胞清除可显著减少化生 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 阐明CD73在胰腺炎炎症消退和组织修复中的作用机制 | CD73基因敲除小鼠和野生型C57BL/6小鼠 | 分子病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | CD73敲除和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
The Simple prEservatioN of Single cElls method for cryopreservation enables the generation of single-cell immune profiles from whole blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271800
PMID:38090590
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研究论文 | 开发了一种名为SENSE的单步冷冻保存全血方法，用于生成高质量单细胞免疫图谱 | 开发了单步冷冻保存全血的新方法，在单细胞检测过程中同时进行粒细胞去除，简化了传统多步骤流程 | 样本量较小（n=6），在髓系细胞中存在批次效应 | 开发简化的全血单细胞冷冻保存方法，促进单细胞RNA测序在临床中的应用 | 人类全血样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6个全血样本，获得22,353个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
EasyCellType: marker-based cell-type annotation by automatically querying multiple databases
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad029
PMID:36998720
|
研究论文 | 开发了一个名为EasyCellType的用户友好计算工具，用于基于标记基因自动注释单细胞RNA测序数据的细胞类型 | 通过自动查询多个数据库并提供图形化注释建议，解决了手动检查细胞标记列表的困难 | NA | 促进单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的自动化过程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因集富集分析，改进的Fisher精确检验 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Epithelial Endoplasmic Reticulum Stress Enhances the Risk of Muc5b-associated Lung Fibrosis
2023-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0252OC
PMID:36108173
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研究论文 | 本研究探讨了MUC5B过表达如何通过内质网应激途径加剧肺纤维化，并发现ISRIB药物可逆转这一过程 | 首次揭示MUC5B通过内质网应激途径促进肺纤维化的分子机制，并证明ISRIB可逆转该过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MUC5B相关肺纤维化的分子机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型和人类IPF患者组织样本 | 分子病理学 | 肺纤维化 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Quantification of spatial pharmacogene expression heterogeneity in breast tumors
2023-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1686
PMID:35906899
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析乳腺癌组织中286个药物基因的空间表达异质性 | 首次在乳腺癌组织中系统量化药物基因的空间表达异质性，并识别出与活性氧处理和解毒机制相关的关键异质性基因 | 样本量较小（仅6个乳腺癌样本），且主要基于观察性数据 | 确定药物基因在肿瘤组织中是否存在空间表达异质性，并识别最具异质性的药物基因 | 乳腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序 | NA | 空间基因表达数据 | 6个乳腺癌样本（4个来自生物样本库，2个来自10x Genomics数据集） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台，55微米直径条形码区域 |
| 32 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Exploration of the Transcriptomic Landscape in Multiple Sclerosis: A Systematic Review
2023-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24021448
PMID:36674968
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综述 | 本文通过系统综述探讨多发性硬化症中的转录组学特征及其相关生物学过程 | 整合了近年来RNA测序技术在多发性硬化症研究中的应用，揭示了疾病不同阶段的特异性分子特征和非编码RNA的关键作用 | 作为综述文章，未进行原始数据分析，依赖于已有研究结果的整合 | 探索转录组学在多发性硬化症中的作用机制 | 多发性硬化症相关的转录组学研究 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Intracellular Spatial Transcriptomic Analysis Toolkit (InSTAnT)
2023-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2481749/v1
PMID:36747718
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研究论文 | 开发用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT | 首个专门针对细胞内分辨率空间转录组数据的计算分析工具包，能够检测基因对和模块在细胞内外的共定位模式 | NA | 开发计算工具以充分挖掘成像空间转录组技术的潜力 | 人类癌细胞系和小鼠下丘脑视前区 | 空间转录组学 | 癌症 | 成像空间转录组技术 | 图挖掘算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Delayed boosting improves human antigen-specific Ig and B cell responses to the RH5.1/AS01B malaria vaccine
2023-01-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163859
PMID:36692019
|
研究论文 | 本研究通过延迟加强免疫策略显著改善了RH5.1/AS01B疟疾疫苗的抗原特异性抗体和B细胞反应 | 首次揭示延迟分次给药方案通过增强FcRn结合、改变IgG Fc糖基化模式和减少循环短寿命浆细胞来提升抗体持久性的机制 | 研究样本量有限，且主要关注短期免疫反应变化，长期保护效果需要进一步验证 | 探索延迟加强免疫策略对疟疾疫苗免疫反应的影响机制 | 接种RH5.1/AS01B疟疾疫苗的人类受试者 | 免疫学 | 疟疾 | ELISA, 流式细胞术, 系统血清学, 单细胞RNA测序 | NA | 血清学数据, 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 临床试验受试者（NCT02927145） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
A cellular hierarchy of Notch and Kras signaling controls cell fate specification in the developing mouse salivary gland
2023-01-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.009
PMID:36693323
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研究论文 | 本研究通过结合克隆谱系追踪、三维重建和单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠唾液腺发育中细胞命运决定的分子机制 | 首次在唾液腺发育中揭示了Notch和Kras信号通路在细胞命运决定中的层级调控作用，并识别了从多能状态向单能状态过渡的两个转录特征不同的双能状态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究小鼠唾液腺发育过程中细胞命运决定的分子调控机制 | 发育中的小鼠唾液腺 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，克隆谱系追踪，三维重建，遗传扰动 | NA | 基因表达数据，空间重建数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Molecular and Cellular Characterization of the TH Pathway in the Sea Urchin Strongylocentrotus purpuratus
2023-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12020272
PMID:36672206
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和单细胞转录组学技术，对海胆甲状腺激素通路的分子组成和细胞特征进行了系统表征 | 首次在无脊椎动物海胆中系统鉴定了甲状腺激素通路的完整分子工具包，并确定了参与激素合成和响应的特定细胞类型 | 研究主要基于生物信息学预测和表达分析，甲状腺激素的具体功能机制仍需进一步实验验证 | 探究无脊椎动物海胆中甲状腺激素通路的分子基础和细胞特征 | 紫球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)及其胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 原位杂交, 免疫组织化学, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 海胆胚胎和幼虫阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
NF-κB in monocytes and macrophages - an inflammatory master regulator in multitalented immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1134661
PMID:36911661
|
综述 | 本文总结了NF-κB在单核细胞和巨噬细胞中的复杂作用及其在炎症性疾病中的关键调控机制 | 整合了单细胞测序和细胞命运图谱等新技术对NF-κB研究的新发现，强调其时间动态和细胞特异性功能 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨NF-κB在先天免疫细胞中的特异性功能及其在炎症调控中的作用 | 单核细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞测序, 细胞命运图谱 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Location, location, location: mapping the lymphoma tumor microenvironment using spatial transcriptomics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1258245
PMID:37869076
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在淋巴瘤肿瘤微环境研究中的应用与进展 | 系统总结了空间转录组学在解析淋巴瘤肿瘤微环境空间结构方面的独特优势，弥补了单细胞测序缺乏空间信息的局限 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨空间转录组学技术在淋巴瘤肿瘤微环境研究中的应用价值 | 淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞 | 空间转录组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Highly Multiplexed Spatially Resolved Proteomic and Transcriptional Profiling of the Glioblastoma Microenvironment Using Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Specimens
2023-01, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2022.100034
PMID:36788070
|
研究论文 | 本研究采用多模态空间生物学方法分析胶质母细胞瘤微环境的分子异质性 | 首次在存档FFPE样本中整合空间转录组/蛋白质组分析、单细胞RNA测序和神经病理学评估来表征胶质母细胞瘤微环境 | 研究样本量未明确说明，且仅使用存档FFPE样本可能限制分析灵敏度 | 表征胶质母细胞瘤微环境的分子和细胞异质性，识别免疫治疗靶点 | 存档福尔马林固定石蜡包埋胶质母细胞瘤标本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 数字空间分析、单细胞RNA测序、神经病理学评估 | 聚类分析、混合细胞反卷积分析 | 空间蛋白质组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NanoString | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiling | NanoString GeoMx数字空间分析平台 |
| 40 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1118024
PMID:36968839
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析COVID-19重症患者冠状动脉内皮细胞和心肌组织的基因表达模式 | 首次在保持解剖结构完整的情况下对SARS-CoV-2感染的心脏组织进行原位空间转录组分析，揭示了心肌感染的异质性和独特的转录特征 | 样本量较小（对照组4例，COVID-19组8例），且仅针对尸检组织进行分析 | 探究SARS-CoV-2感染对冠状动脉内皮细胞和心肌组织基因表达的影响 | 尸检获得的心脏组织样本，包括对照组和COVID-19患者组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 对照组4例，COVID-19组8例，共12例尸检心脏组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |