单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-02-14 |
RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Traumatic Spinal Cord Injury (Review)
2023, Sovremennye tekhnologii v meditsine
DOI:10.17691/stm2023.15.6.08
PMID:39944372
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术以及空间转录组学在创伤性脊髓损伤中的应用，探讨了这些技术在揭示细胞类型、定位损伤区域和解析病理机制方面的潜力 | 结合单细胞/单核RNA测序与空间转录组学技术，提供了更精确的细胞定位和病理分析，为神经连接重组和感觉运动功能恢复机制的研究开辟了新视角 | 需要更多关于人类细胞群体特异性的全面信息，以确定脊髓损伤中细胞选择性易感性的原因 | 探讨单细胞和单核RNA测序技术以及空间转录组学在创伤性脊髓损伤中的应用，以揭示细胞类型、定位损伤区域和解析病理机制 | 创伤性脊髓损伤中的细胞类型及其在正常和病理反应中的作用 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA |
| 22 | 2025-02-06 |
Spatial transcriptomic characterization of COVID-19 pneumonitis identifies immune circuits related to tissue injury
2023-Jan-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157837
PMID:36472908
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法，描述了COVID-19肺炎中不同组织损伤区域的细胞、通路和基因，揭示了免疫细胞信号回路与组织损伤的关系 | 首次使用空间转录组学方法在COVID-19肺炎中识别出与组织损伤相关的免疫细胞信号回路，并验证了这些发现在其他患者队列中的普遍性 | 样本量较小，仅包括3名患者的肺组织样本，可能存在一定的异质性 | 研究COVID-19肺炎中免疫细胞与基质细胞之间的复杂相互作用，揭示组织损伤的免疫机制 | COVID-19患者的肺组织样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 3名患者的46个感兴趣区域，覆盖超过62,000个细胞 |
| 23 | 2025-02-06 |
Epsin Nanotherapy Regulates Cholesterol Transport to Fortify Atheroma Regression
2023-01-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.321723
PMID:36444722
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研究论文 | 本研究探讨了Epsins在巨噬细胞介导的代谢调节中的作用，并开发了一种创新的纳米疗法，通过靶向巨噬细胞Epsins来治疗动脉粥样硬化 | 开发了一种新型的S2P共轭脂质纳米颗粒，用于封装小干扰RNA以抑制Epsins，并揭示了Epsins通过结合CD36促进脂质摄取和通过溶酶体促进ABCG1降解的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 研究Epsins在巨噬细胞介导的代谢调节中的作用，并开发针对Epsins的纳米疗法以治疗动脉粥样硬化 | 巨噬细胞和动脉粥样硬化斑块 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、MEBOCOST算法、纳米颗粒技术 | LysM-DKO和LysM-DKO-ABCG1fl/+小鼠模型 | RNA测序数据、生物医学数据 | 使用LysM-DKO和LysM-DKO-ABCG1fl/+小鼠模型进行研究 |
| 24 | 2025-02-06 |
Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts
2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2041
PMID:36239989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术，揭示了结直肠癌肝转移肿瘤微环境中SPP1+巨噬细胞和成纤维细胞之间的免疫抑制性空间网络 | 首次详细描述了结直肠癌肝转移肿瘤微环境中SPP1+巨噬细胞和成纤维细胞之间的相互作用及其在免疫抑制中的作用 | 研究主要关注微卫星稳定的结直肠癌肝转移，可能不适用于其他类型的结直肠癌 | 研究结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞变化及其对肿瘤生长的影响 | 结直肠癌肝转移患者的肿瘤组织、正常肝组织和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重空间成像、细胞去卷积 | NA | RNA测序数据、空间成像数据 | 一系列微卫星稳定的结直肠癌肝转移样本及其配对的正常肝组织和外周血单核细胞 |
| 25 | 2025-01-25 |
Single-Cell RNA sequencing investigation of female-male differences under PAD conditions
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1251141
PMID:37745110
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了在PAD条件下男女之间的差异，特别是内皮细胞在受到不同机械刺激下的基因表达变化 | 首次结合d-flow和硬度两个因素，研究其对内皮细胞表型的影响，并探讨了性别在这些过程中的作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探索性别对PAD相关促动脉粥样硬化通路的影响 | 内皮细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26 | 2025-01-19 |
Preparation of noninfectious scRNAseq samples from SARS-CoV-2-infected epithelial cells
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281898
PMID:36827401
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研究论文 | 本文描述了一种从SARS-CoV-2感染的上皮细胞中制备非传染性单细胞RNA测序（scRNAseq）样本的方法 | 提出了一种在BSL2设施中安全进行scRNAseq分析的方法，使更多研究人员能够进行SARS-CoV-2细胞的分子分析 | 需要进一步验证该方法在其他类型细胞和病毒中的适用性 | 开发一种安全的方法，用于在较低生物安全级别的实验室中研究SARS-CoV-2感染的细胞 | SARS-CoV-2感染的非洲绿猴肾上皮细胞（Vero-E6）和分化在气液界面上的人肺上皮细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA数据 | 非洲绿猴肾上皮细胞和人肺上皮细胞 |
| 27 | 2025-01-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct T cell populations in immune-related adverse events of checkpoint inhibitors
2023-01-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100868
PMID:36513074
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了检查点抑制剂治疗中免疫相关不良事件（irAEs）中T细胞的不同群体 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析抗PD-1治疗期间循环T细胞的细胞变化，识别出与不同irAEs相关的特定T细胞亚群 | 研究样本量未明确说明，可能限制结果的普遍性 | 探讨抗PD-1治疗中免疫相关不良事件的细胞基础 | 癌症患者的循环T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | K近邻网络图绘制布局 | RNA序列数据 | 未明确说明 |
| 28 | 2025-01-16 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
|
研究论文 | 本研究通过人类扁桃体离体模型，探讨了HIV-1感染对不同细胞类型转录组变化的影响，特别是CD4+ T细胞中氧化磷酸化的激活 | 首次在人类扁桃体离体模型中揭示了HIV-1感染导致的CD4+ T细胞氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞中NLRP3炎症小体通路基因表达增加 | 研究仅限于离体模型，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其对慢性炎症的贡献 | 人类扁桃体离体模型中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 生物医学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 健康人类供体的扁桃体组织 |
| 29 | 2025-01-16 |
The slan antigen identifies the prototypical non-classical CD16+-monocytes in human blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1287656
PMID:37965335
|
研究论文 | 本文通过转录组、蛋白质组、细胞表面标志物和细胞因子产生分析，比较了人类外周血中slan+/NC-和slan-/NC-单核细胞的特征，证明slan+/NC-单核细胞更符合非经典单核细胞的典型特征 | 首次通过转录组和蛋白质组分析，证明slan+/NC-单核细胞比slan-/NC-单核细胞更能代表非经典单核细胞的典型特征 | 研究未涉及slan+/NC-单核细胞在疾病中的具体功能和作用机制 | 研究人类外周血中非经典单核细胞的典型特征 | 人类外周血中的slan+/NC-和slan-/NC-单核细胞 | 免疫学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 细胞表面标志物数据 | 人类外周血单核细胞样本 |
| 30 | 2025-01-12 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Global Markers of Transcriptional Diversity across Different Forms of Cellular Senescence
2023, Aging biology
DOI:10.59368/agingbio.20230008
PMID:39781544
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了不同形式细胞衰老中的转录多样性全局标记 | 首次通过单细胞转录组学技术全面分析了不同形式细胞衰老中的细胞亚群及其表达谱，揭示了共同的转录特征和次级衰老现象 | 研究主要基于体外实验，未涉及体内复杂环境的影响 | 探究不同形式细胞衰老中的转录多样性及其共同特征 | 基因同源的克隆细胞系，包括癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA测序数据 | 多种形式的衰老细胞系 |
| 31 | 2024-12-12 |
Tick innate immune responses to hematophagy and Ehrlichia infection at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1305976
PMID:38274813
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了孤星蜱在未进食、部分进食和感染埃立克体时的血细胞反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示了蜱对埃立克体感染和吸血的先天免疫反应 | NA | 深入了解血细胞在蜱与蜱传微生物相互作用中的作用，揭示其在媒介传播能力中的功能 | 孤星蜱的血细胞及其在不同状态下的基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未进食、部分进食和感染埃立克体的孤星蜱血细胞样本 |
| 32 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA-seq methods to interrogate virus-host interactions
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00972-2
PMID:36414692
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 本文总结了scRNA-seq技术及其在抗病毒免疫中的应用，强调了其在理解病毒基因组和宿主反应异质性、感染细胞与旁观细胞的差异反应以及细胞间通信网络方面的重要作用 | NA | 探讨scRNA-seq技术在病毒-宿主相互作用研究中的应用及其在抗病毒治疗策略开发中的潜力 | 病毒与宿主细胞的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 33 | 2024-11-23 |
SPICEMIX enables integrative single-cell spatial modeling of cell identity
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01256-z
PMID:36624346
|
研究论文 | 介绍了一种名为SPICEMIX的计算方法，用于整合单细胞空间转录组数据，以揭示细胞身份 | SPICEMIX基于概率潜变量建模，能够显著改进细胞类型及其空间模式的推断，优于现有方法 | NA | 开发一种能够利用空间转录组数据独特性质揭示细胞身份的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞类型及其空间模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 概率潜变量模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠脑区的空间转录组数据，通过seqFISH+、STARmap和Visium技术获取 |
| 34 | 2024-11-22 |
Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016
PMID:36608902
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研究论文 | 研究探讨了肠内分泌细胞在调节隐窝代谢和肠道干细胞功能中的作用 | 首次揭示了肠内分泌细胞在传递营养信息至干细胞微环境中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官，可能无法完全代表所有物种的肠道生理 | 探讨肠内分泌细胞在调节隐窝代谢和肠道干细胞功能中的作用 | 肠内分泌细胞、肠道干细胞、隐窝代谢 | NA | NA | 间接量热法、1H-核磁共振代谢组学、线粒体活体成像、Seahorse生物分析仪、10x Genomics单细胞测序 | NA | 代谢数据、单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类肠道类器官 |
| 35 | 2024-10-30 |
Systems biological assessment of the temporal dynamics of immunity to a viral infection in the first weeks and months of life
2023-Jan-31, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.01.28.23285133
PMID:36778389
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研究论文 | 本文通过多组学方法，对婴儿和幼儿在生命早期几周和几个月内对SARS-CoV-2感染的免疫动态进行了纵向分析 | 首次提供了生命早期几周和几个月内对病毒感染的免疫动态的快照 | NA | 研究婴儿和幼儿在生命早期对SARS-CoV-2感染的免疫动态 | 婴儿和幼儿对SARS-CoV-2感染的先天性和适应性免疫反应 | NA | NA | 多组学分析 | NA | 血液样本 | 感染前、感染期间和感染后收集的血液样本 |
| 36 | 2024-10-30 |
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2402606/v1
PMID:36747878
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研究论文 | 研究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 首次揭示了人类心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的分子机制，并展示了通过靶向炎症治疗组织纤维化的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类心脏样本，可能存在种属差异 | 探讨心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞的相互作用机制 | 心肌梗死和心脏纤维化中的免疫细胞与成纤维细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | 38名急性心肌梗死和慢性心力衰竭患者的心脏样本 |
| 37 | 2024-10-21 |
Virus infection pattern imprinted and diversified the differentiation of T-cell memory in transcription and function
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1334597
PMID:38264657
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研究论文 | 研究比较了由不同病毒（CMV、EBV和SARS-CoV-2）诱导的记忆T细胞的转录组和功能差异 | 发现CD28和CTLA4可作为评估T细胞抗病毒能力的连续指标，并提出REL是CMV特异性T细胞产生细胞因子的主要调控因子 | NA | 理解不同病毒特异性记忆T细胞的差异，为开发新的抗病毒治疗策略提供基础 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞样本 |
| 38 | 2024-10-21 |
ATF5 promotes malignant T cell survival through the PI3K/AKT/mTOR pathway in cutaneous T cell lymphoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1282996
PMID:38223508
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研究论文 | 研究探讨了转录因子ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的作用及其通过PI3K/AKT/mTOR通路促进恶性T细胞生存的机制 | 首次揭示了ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的肿瘤特异性高表达及其促进肿瘤生存的机制 | 研究仅限于两个CTCL细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 识别皮肤T细胞淋巴瘤中肿瘤特异性的转录因子 | 皮肤T细胞淋巴瘤中的恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 两个CTCL细胞系Myla和H9 |
| 39 | 2024-10-21 |
Comprehensive analysis of senescence-associated genes in sepsis based on bulk and single-cell sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1322221
PMID:38259686
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞测序数据分析了与脓毒症相关的衰老相关基因，并开发了一种基于关键基因的脓毒症诊断模型 | 本文首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，揭示了衰老相关基因与脓毒症之间的关联，并开发了一种高可靠性的诊断模型 | 本文仅使用了两个RNA表达数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨衰老相关基因与脓毒症之间的关系，并开发一种新的脓毒症诊断模型 | 衰老相关基因、脓毒症患者、健康对照组 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 无监督聚类分析、加权基因共表达网络分析 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个RNA表达数据集（GSE28750和GSE57065），具体样本量未详细说明 |
| 40 | 2024-10-21 |
Single-cell sequencing reveals an important role of SPP1 and microglial activation in age-related macular degeneration
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1322451
PMID:38259505
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研究论文 | 研究衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 揭示了SPP1和微胶质细胞激活在年龄相关性黄斑变性中的重要作用，并提出SPP1可能成为潜在的治疗靶点 | 需要更多的体外和体内研究来验证结果和治疗效果 | 探讨衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性病理生理中的作用 | 人类视网膜神经节细胞和年龄相关性黄斑变性患者 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 118例人类黄斑神经视网膜样本 |