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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
The Simple prEservatioN of Single cElls method for cryopreservation enables the generation of single-cell immune profiles from whole blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271800
PMID:38090590
|
研究论文 | 开发了一种名为SENSE的单步冷冻保存全血方法，用于生成高质量单细胞免疫图谱 | 开发了单步冷冻保存全血的新方法，在单细胞检测过程中同时进行粒细胞去除，简化了传统多步骤流程 | 样本量较小（n=6），在髓系细胞中存在批次效应 | 开发简化的全血单细胞冷冻保存方法，促进单细胞RNA测序在临床中的应用 | 人类全血样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6个全血样本，获得22,353个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
EasyCellType: marker-based cell-type annotation by automatically querying multiple databases
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad029
PMID:36998720
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研究论文 | 开发了一个名为EasyCellType的用户友好计算工具，用于基于标记基因自动注释单细胞RNA测序数据的细胞类型 | 通过自动查询多个数据库并提供图形化注释建议，解决了手动检查细胞标记列表的困难 | NA | 促进单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的自动化过程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因集富集分析，改进的Fisher精确检验 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Epithelial Endoplasmic Reticulum Stress Enhances the Risk of Muc5b-associated Lung Fibrosis
2023-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0252OC
PMID:36108173
|
研究论文 | 本研究探讨了MUC5B过表达如何通过内质网应激途径加剧肺纤维化，并发现ISRIB药物可逆转这一过程 | 首次揭示MUC5B通过内质网应激途径促进肺纤维化的分子机制，并证明ISRIB可逆转该过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MUC5B相关肺纤维化的分子机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型和人类IPF患者组织样本 | 分子病理学 | 肺纤维化 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Quantification of spatial pharmacogene expression heterogeneity in breast tumors
2023-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1686
PMID:35906899
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析乳腺癌组织中286个药物基因的空间表达异质性 | 首次在乳腺癌组织中系统量化药物基因的空间表达异质性，并识别出与活性氧处理和解毒机制相关的关键异质性基因 | 样本量较小（仅6个乳腺癌样本），且主要基于观察性数据 | 确定药物基因在肿瘤组织中是否存在空间表达异质性，并识别最具异质性的药物基因 | 乳腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序 | NA | 空间基因表达数据 | 6个乳腺癌样本（4个来自生物样本库，2个来自10x Genomics数据集） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台，55微米直径条形码区域 |
| 25 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Exploration of the Transcriptomic Landscape in Multiple Sclerosis: A Systematic Review
2023-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24021448
PMID:36674968
|
综述 | 本文通过系统综述探讨多发性硬化症中的转录组学特征及其相关生物学过程 | 整合了近年来RNA测序技术在多发性硬化症研究中的应用，揭示了疾病不同阶段的特异性分子特征和非编码RNA的关键作用 | 作为综述文章，未进行原始数据分析，依赖于已有研究结果的整合 | 探索转录组学在多发性硬化症中的作用机制 | 多发性硬化症相关的转录组学研究 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Intracellular Spatial Transcriptomic Analysis Toolkit (InSTAnT)
2023-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2481749/v1
PMID:36747718
|
研究论文 | 开发用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT | 首个专门针对细胞内分辨率空间转录组数据的计算分析工具包，能够检测基因对和模块在细胞内外的共定位模式 | NA | 开发计算工具以充分挖掘成像空间转录组技术的潜力 | 人类癌细胞系和小鼠下丘脑视前区 | 空间转录组学 | 癌症 | 成像空间转录组技术 | 图挖掘算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Delayed boosting improves human antigen-specific Ig and B cell responses to the RH5.1/AS01B malaria vaccine
2023-01-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163859
PMID:36692019
|
研究论文 | 本研究通过延迟加强免疫策略显著改善了RH5.1/AS01B疟疾疫苗的抗原特异性抗体和B细胞反应 | 首次揭示延迟分次给药方案通过增强FcRn结合、改变IgG Fc糖基化模式和减少循环短寿命浆细胞来提升抗体持久性的机制 | 研究样本量有限，且主要关注短期免疫反应变化，长期保护效果需要进一步验证 | 探索延迟加强免疫策略对疟疾疫苗免疫反应的影响机制 | 接种RH5.1/AS01B疟疾疫苗的人类受试者 | 免疫学 | 疟疾 | ELISA, 流式细胞术, 系统血清学, 单细胞RNA测序 | NA | 血清学数据, 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 临床试验受试者（NCT02927145） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
A cellular hierarchy of Notch and Kras signaling controls cell fate specification in the developing mouse salivary gland
2023-01-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.009
PMID:36693323
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研究论文 | 本研究通过结合克隆谱系追踪、三维重建和单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠唾液腺发育中细胞命运决定的分子机制 | 首次在唾液腺发育中揭示了Notch和Kras信号通路在细胞命运决定中的层级调控作用，并识别了从多能状态向单能状态过渡的两个转录特征不同的双能状态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究小鼠唾液腺发育过程中细胞命运决定的分子调控机制 | 发育中的小鼠唾液腺 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，克隆谱系追踪，三维重建，遗传扰动 | NA | 基因表达数据，空间重建数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Molecular and Cellular Characterization of the TH Pathway in the Sea Urchin Strongylocentrotus purpuratus
2023-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12020272
PMID:36672206
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和单细胞转录组学技术，对海胆甲状腺激素通路的分子组成和细胞特征进行了系统表征 | 首次在无脊椎动物海胆中系统鉴定了甲状腺激素通路的完整分子工具包，并确定了参与激素合成和响应的特定细胞类型 | 研究主要基于生物信息学预测和表达分析，甲状腺激素的具体功能机制仍需进一步实验验证 | 探究无脊椎动物海胆中甲状腺激素通路的分子基础和细胞特征 | 紫球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)及其胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 原位杂交, 免疫组织化学, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 海胆胚胎和幼虫阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
NF-κB in monocytes and macrophages - an inflammatory master regulator in multitalented immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1134661
PMID:36911661
|
综述 | 本文总结了NF-κB在单核细胞和巨噬细胞中的复杂作用及其在炎症性疾病中的关键调控机制 | 整合了单细胞测序和细胞命运图谱等新技术对NF-κB研究的新发现，强调其时间动态和细胞特异性功能 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨NF-κB在先天免疫细胞中的特异性功能及其在炎症调控中的作用 | 单核细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞测序, 细胞命运图谱 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Location, location, location: mapping the lymphoma tumor microenvironment using spatial transcriptomics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1258245
PMID:37869076
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在淋巴瘤肿瘤微环境研究中的应用与进展 | 系统总结了空间转录组学在解析淋巴瘤肿瘤微环境空间结构方面的独特优势，弥补了单细胞测序缺乏空间信息的局限 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨空间转录组学技术在淋巴瘤肿瘤微环境研究中的应用价值 | 淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞 | 空间转录组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Highly Multiplexed Spatially Resolved Proteomic and Transcriptional Profiling of the Glioblastoma Microenvironment Using Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Specimens
2023-01, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2022.100034
PMID:36788070
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研究论文 | 本研究采用多模态空间生物学方法分析胶质母细胞瘤微环境的分子异质性 | 首次在存档FFPE样本中整合空间转录组/蛋白质组分析、单细胞RNA测序和神经病理学评估来表征胶质母细胞瘤微环境 | 研究样本量未明确说明，且仅使用存档FFPE样本可能限制分析灵敏度 | 表征胶质母细胞瘤微环境的分子和细胞异质性，识别免疫治疗靶点 | 存档福尔马林固定石蜡包埋胶质母细胞瘤标本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 数字空间分析、单细胞RNA测序、神经病理学评估 | 聚类分析、混合细胞反卷积分析 | 空间蛋白质组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NanoString | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiling | NanoString GeoMx数字空间分析平台 |
| 33 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1118024
PMID:36968839
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析COVID-19重症患者冠状动脉内皮细胞和心肌组织的基因表达模式 | 首次在保持解剖结构完整的情况下对SARS-CoV-2感染的心脏组织进行原位空间转录组分析，揭示了心肌感染的异质性和独特的转录特征 | 样本量较小（对照组4例，COVID-19组8例），且仅针对尸检组织进行分析 | 探究SARS-CoV-2感染对冠状动脉内皮细胞和心肌组织基因表达的影响 | 尸检获得的心脏组织样本，包括对照组和COVID-19患者组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 对照组4例，COVID-19组8例，共12例尸检心脏组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Mimicking Tumor Cell Heterogeneity of Colorectal Cancer in a Patient-derived Organoid-Fibroblast Model
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.02.014
PMID:36868311
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研究论文 | 开发了一种包含上皮细胞和基质成纤维细胞的结直肠癌患者来源类器官模型 | 首次构建了包含匹配上皮细胞和基质成纤维细胞的结直肠癌类器官模型，模拟肿瘤微环境复杂性 | 模型仍无法完全复制体内肿瘤微环境的所有组分 | 研究结直肠癌肿瘤微环境中上皮细胞与成纤维细胞的相互作用 | 结直肠癌患者来源的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,蛋白质组学分析 | 类器官-成纤维细胞共培养模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据,图像数据 | 结直肠癌标本来源的原代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Tick innate immune responses to hematophagy and Ehrlichia infection at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1305976
PMID:38274813
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了孤星蜱免疫细胞对吸血和埃立克体感染的反应机制 | 首次在单细胞分辨率下系统鉴定蜱类14种不同的血细胞群体，并发现7个在感染和未感染状态下均存在的血细胞谱系 | 研究仅针对孤星蜱一种物种，血细胞功能验证仍需进一步深入 | 阐明蜱类免疫细胞在吸血过程和病原体感染中的免疫功能 | 孤星蜱(Amblyomma americanum)的血细胞(hemocytes) | 单细胞生物学 | 蜱传疾病 | 单细胞RNA测序，RNA干扰 | NA | 转录组数据 | 未吸血、部分吸血和埃立克体感染蜱的血细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 36 | 2025-10-06 |
The slan antigen identifies the prototypical non-classical CD16+-monocytes in human blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1287656
PMID:37965335
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研究论文 | 通过转录组和蛋白质组分析证明slan+/NC-单核细胞是人类血液中原型非经典单核细胞的代表 | 首次系统比较slan+/NC-和slan-/NC-单核细胞的分子特征，证明slan+/NC-单核细胞更能代表原型非经典单核细胞 | 样本来源仅限于外周血单核细胞，未涉及组织驻留单核细胞 | 确定slan抗原在非经典单核细胞分型中的生物学意义 | 人类外周血单核细胞亚群（经典、中间型和非经典单核细胞） | 免疫学 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表面标志物 | 人类外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Comparing engineered nuclear-localized reporter cassettes
2023, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001014
PMID:38021170
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9基因组工程技术比较了不同核定位报告基因盒在神经肽基因表达分析中的性能 | 首次系统比较了不同工程化核定位报告基因盒在神经肽基因表达研究中的效果，并推荐了最优报告基因盒设计 | 仅测试了6种神经肽编码基因的报告基因盒，样本规模有限 | 分析神经肽基因表达动态并解析其调控机制 | 秀丽隐杆线虫神经系统中的神经肽编码基因 | 分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组工程、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 6个神经肽编码基因（3个神经肽基因、1个神经肽基因和2个胰岛素基因） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Profiles of Wnt pathway gene expression during tooth morphogenesis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1316635
PMID:38274045
|
研究论文 | 本研究通过荧光多重杂交和单细胞RNA测序技术，揭示了Wnt通路基因在牙齿形态发生过程中的时空表达模式 | 首次在牙齿发育过程中同时分析多个Wnt配体和调节因子的共定位模式，并发现Sfrp5在完全分化的成釉细胞中的表达特征 | 研究主要聚焦于特定发育阶段，对Wnt信号通路与其他信号通路的相互作用分析有限 | 阐明Wnt信号通路在牙齿形态发生过程中的表达动态和细胞间通讯机制 | 小鼠牙齿发育过程中的上皮和间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 荧光多重杂交, 单细胞RNA测序 | CellChat | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠胚胎期15.5天至出生后14天的牙齿组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals cancer stem-like cells and dynamics in tumor microenvironment during cholangiocarcinoma progression
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1250215
PMID:38020927
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞的特征及肿瘤微环境的动态变化 | 首次在YAP/AKT小鼠模型中系统揭示胆管癌形成过程中Tm4sf1高表达恶性细胞作为癌症干细胞样细胞的特性及肿瘤微环境三阶段动态变化 | 研究基于小鼠模型，在人体中的适用性需要进一步验证；样本量相对有限 | 探究胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞的转录特征及肿瘤微环境动态变化 | YAP/AKT小鼠模型中的胆管癌细胞及肿瘤微环境组成细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | YAP/AKT小鼠模型 | 单细胞转录组数据，批量RNA测序数据 | 三个不同时间点的肿瘤发生样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Identification of TREM2-positive tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma: implication for poor prognosis and immunotherapy modulation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162032
PMID:37187751
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研究论文 | 本研究在食管鳞状细胞癌中发现了一种新型TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，该亚群与不良预后和免疫治疗反应相关 | 首次在食管鳞状细胞癌中鉴定出TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并证明其与免疫治疗耐药性和不良预后的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞亚群在食管鳞状细胞癌中的作用及其对免疫治疗的影响 | 食管鳞状细胞癌患者和黑色素瘤患者 | 单细胞测序分析 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，定量实时PCR，酶联免疫吸附试验，多重免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，临床数据 | 多个数据集：GSE145370和GSE160269（食管鳞癌scRNA-seq），GSE120575（48例黑色素瘤患者），GSE78220（29例黑色素瘤bulk-RNA），TCGA ESCC队列（80例），10例接受抗PD1治疗的ESCC患者 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |