单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Combing Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Analysis to Elucidate the Mechanisms of Kidney Disease: Proceedings of the Henry Shavelle Professorship
2023 Jan-Dec, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000534678
PMID:38033715
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综述 | 本文综述了将全基因组关联研究（GWAS）与单细胞组学（包括转录组学）相结合在肾脏疾病研究中的创新方法 | 本文强调了GWAS和scRNA-seq结合在深入理解肾脏疾病中的变革潜力 | NA | 加深对肾脏疾病潜在机制的理解 | 肾脏疾病 | NA | 肾脏疾病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 362 | 2024-08-07 |
Gene regulatory network reconfiguration in direct lineage reprogramming
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.11.010
PMID:36584685
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研究论文 | 本文结合CellOracle分析与纤维母细胞向诱导内胚层祖细胞（iEP）转化的谱系追踪，揭示了成功与失败命运转化背后的不同网络配置。 | 通过CellOracle模拟TF扰动，识别出新的因子以促进细胞成功转化其身份，并揭示了AP-1亚基Fos与Hippo信号效应子Yap1的中心作用。 | NA | 研究直接谱系转化中基因调控网络（GRN）的重配置。 | 纤维母细胞向诱导内胚层祖细胞（iEP）的转化过程。 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组和表观基因组数据分析 | CellOracle | 转录组和表观基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 363 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomic Analysis of a Diverse Patient Cohort Reveals a Conserved Architecture in Triple-Negative Breast Cancer
2023-01-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2682
PMID:36283023
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析不同人种的三阴性乳腺癌患者的肿瘤架构 | 首次使用联合计数分析展示转录特征集群的非随机方向空间依赖性，支持三阴性乳腺癌中保守的空间转录结构 | 研究样本相对较小，且主要集中在特定人种群体上 | 定义三阴性乳腺癌的肿瘤架构，以便更好地理解疾病差异 | 来自14名患者的28个样本段的肿瘤组织 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间特征数据 | 28个样本段，来自14名患者 |
| 364 | 2024-08-07 |
IER5L is a Prognostic Biomarker in Pan-Cancer Analysis and Correlates with Immune Infiltration and Immune Molecules in Non-Small Cell Lung Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S439190
PMID:38106972
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研究论文 | 本研究探讨了IER5L在非小细胞肺癌中的预后生物标志物作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 | 首次揭示了IER5L在非小细胞肺癌中的预后价值及其与免疫浸润和免疫分子的关联 | NA | 研究IER5L在非小细胞肺癌中的预后作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 | 非小细胞肺癌中的IER5L表达及其与疾病进展、免疫浸润和免疫分子的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | qPCR, scRNA seq | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 临床信息 | 多个癌症数据库中的癌症样本 |
| 365 | 2024-08-07 |
Bioinformatics Prediction and Experimental Validation of the Role of Macrophage Polarization and Ferroptosis in Gestational Diabetes Mellitus
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S440826
PMID:38107385
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研究论文 | 本文通过生物信息学预测和实验验证，探讨了巨噬细胞极化和铁死亡在妊娠糖尿病中的作用 | 首次揭示了妊娠糖尿病中巨噬细胞极化和铁死亡在胎盘炎症中的作用，并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于回顾性队列和公开数据集，未来需在前瞻性队列中进一步验证 | 探究妊娠糖尿病中胎盘炎症的机制并寻找潜在的治疗靶点 | 妊娠糖尿病中的巨噬细胞极化和铁死亡 | 生物信息学 | 妊娠糖尿病 | 转录组测序分析，多重免疫荧光染色 | NA | 转录组数据，临床信息 | 多个公开数据集（GSE154414, GSE70493, GSE173193）和回顾性队列样本 |
| 366 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Roles of Fibroblasts During Intestinal Injury and Repair in Rats with Severe Acute Pancreatitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S436511
PMID:38107381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了严重急性胰腺炎大鼠模型中肠道损伤与修复过程中细胞异质性和组成的分子机制 | 发现纤维母细胞通过细胞间通讯影响肠道损伤与修复，并揭示了RNA结合蛋白在纤维母细胞功能中的潜在作用 | NA | 探索肠道损伤与治疗的分子机制 | 严重急性胰腺炎大鼠模型的肠道组织 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三组实验，包括健康对照组、模型组和治疗组的大鼠肠道组织样本 |
| 367 | 2024-08-07 |
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16499
PMID:38077419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾病患者的肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的基因表达谱，以探索肾病的细胞异质性 | 首次发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在，并提出这些细胞可能作为非侵入性诊断肾病的生物标志物 | 研究样本量较小，仅包括四名肾炎患者 | 探索肾病的病理机制并开发非侵入性诊断方法 | 肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的细胞异质性 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名肾炎患者 |
| 368 | 2024-08-07 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了PD-1阻断疗法对头颈鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境中调节性T细胞（Tregs）的影响 | 研究发现Nivolumab治疗后Treg数量和抑制活性增加，并揭示了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴和KRAS信号通路的变化可能与Treg数量的增加有关 | 需要进一步研究以深入理解患者对免疫疗法反应的限制 | 旨在探讨Nivolumab如何影响HNSCC肿瘤微环境中浸润的Tregs | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤微环境和调节性T细胞（Tregs） | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从四名HNSCC供体中分离的八份组织样本，治疗前后各四份 |
| 369 | 2024-08-05 |
Deciphering the age-dependent changes of pulmonary fibroblasts in mice by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1287133
PMID:38094618
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研究论文 | 这项研究揭示了小鼠肺组织中肺成纤维细胞随年龄变化的转录组特征。 | 本研究首次系统性描述了老化过程中肺成纤维细胞的分化轨迹和转录表型变化。 | 该研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类。 | 本研究旨在阐明年老肺组织中成纤维细胞的转录谱和分化途径。 | 本研究的研究对象为小鼠的肺成纤维细胞及其在衰老过程中的变化。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 共分析了22,826个细胞 |
| 370 | 2024-08-07 |
Retracted: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Importance of IRF1/FSTL1 in Synovial Fibroblast Subsets for the Development of Rheumatoid Arthritis
2023, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2023/9765730
PMID:38094339
|
correction | 该文章已被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals preferential reduction of memory B cell subsets in cladribine patients that correlates with treatment response
2023, Therapeutic advances in neurological disorders
IF:4.7Q1
DOI:10.1177/17562864231211077
PMID:38084102
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研究论文 | 该文章研究了克拉地宾对记忆B细胞亚群的影响及其与治疗反应的相关性 | 该研究首次详细描述了克拉地宾对记忆B细胞的持久影响及其潜在的免疫调节作用 | 本研究仅涉及小规模的样本，且为单臂研究设计 | 深入理解克拉地宾对多发性硬化症患者的免疫反应及其治疗效果 | 23名接受克拉地宾治疗的多发性硬化症患者 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 流式细胞术，RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 23名多发性硬化症患者 |
| 372 | 2024-08-05 |
Up-regulated SPP1 increases the risk from IPF to lung cancer via activating the pro-tumor macrophages
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.018
PMID:38074471
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研究论文 | 本研究旨在调查特发性肺纤维化（IPF）到肺癌（LC）的发病机制，并开发预测因子来检测易患LC的IPF患者 | 通过识别42个与免疫功能相关的病理基因，并开发了一个包含五个基因的LC风险分类器，这是本研究的创新之处 | 研究中未提及样本的多样性或外部验证的结果 | 探讨IPF向LC转变的机制并开发相应风险预测工具 | 特发性肺纤维化患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（Single-cell RNA-seq） | NA | 基因数据 | NA |
| 373 | 2024-08-07 |
Retracted: Identification of the Immune Status of Hypertrophic Cardiomyopathy by Integrated Analysis of Bulk- and Single-Cell RNA Sequencing Data
2023, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2023/9865861
PMID:38077885
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correction | 该文章已被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Fangji Dihuang formulation ameliorated DNCB-induced atopic dermatitis-like skin lesions by IL-17 signaling pathway: integrating network analysis and experimental validation
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1220945
PMID:38089052
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研究论文 | 本研究探讨了方剂地黄汤通过IL-17信号通路改善DNCB诱导的特应性皮炎样皮肤病变的作用，并结合网络分析和实验验证 | 首次研究了方剂地黄汤的抗特应性皮炎活性，并通过网络药理学分析揭示了其核心作用通路为IL-17信号通路 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人体中进行临床试验 | 研究方剂地黄汤的抗特应性皮炎活性及其作用机制 | 方剂地黄汤对DNCB诱导的特应性皮炎样皮肤病变的影响 | 中医药 | 特应性皮炎 | UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS, 单细胞RNA测序, rt-PCR, 流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型 |
| 375 | 2024-08-07 |
Age-Related Alterations in Peripheral Immune Landscape with Magnified Impact on Post-Stroke Brain
2023, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0287
PMID:38090608
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研究论文 | 研究了老年小鼠外周血中免疫衰老的特征及其对缺血性中风后大脑免疫环境的影响 | 首次综合使用单细胞RNA测序、时间飞行流式细胞术和多种免疫学检测方法，揭示了老年小鼠外周血中免疫衰老的具体特征及其对中风后大脑免疫环境的影响 | NA | 探究免疫衰老对老年小鼠缺血性中风后大脑免疫环境的影响 | 老年小鼠的外周血和大脑免疫环境 | 免疫学 | 中风 | 单细胞RNA测序、时间飞行流式细胞术 | NA | 细胞 | 老年小鼠 |
| 376 | 2024-08-05 |
Unveiling the role of regulatory T cells in the tumor microenvironment of pancreatic cancer through single-cell transcriptomics and in vitro experiments
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242909
PMID:37753069
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞在胰腺癌肿瘤微环境中的作用 | 首次通过单细胞转录组学和体外实验揭示了Treg细胞在胰腺癌免疫反应中的重要性 | 研究的特定细胞类型和信号通路可能限制了对Treg细胞功能全面了解的能力 | 调查Treg细胞浸润对胰腺癌免疫反应的影响及其相关的mRNA标记物 | 案例研究胰腺癌中的调节性T细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组分析，机器学习 | NA | 转录组数据 | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
Transcriptional profiles of non-neuronal and immune cells in mouse trigeminal ganglia
2023, Frontiers in pain research (Lausanne, Switzerland)
DOI:10.3389/fpain.2023.1274811
PMID:38028432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，对正常雄性小鼠三叉神经节中的非神经元细胞进行了鉴定、分类和总结 | 首次详细描述了三叉神经节中非神经元细胞的类型和特征，包括三种巨噬细胞和四种中性粒细胞的亚型 | 研究仅限于正常雄性小鼠，未涉及其他性别或病理状态下的情况 | 旨在识别和总结三叉神经节中非神经元细胞的类型，为研究细胞可塑性、神经元与非神经元细胞间的相互作用网络及疼痛功能提供基础信息 | 小鼠三叉神经节中的非神经元细胞，包括神经胶质细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞、内皮细胞和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 正常雄性小鼠的三叉神经节样本 |
| 378 | 2024-08-05 |
Tissue resident iNKT17 cells facilitate cancer cell extravasation in liver metastasis via interleukin-22
2023-01-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.12.014
PMID:36630911
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-22在癌症转移中的作用，特别是在肝转移中。 | 首次揭示了组织驻留的iNKT17细胞通过分泌IL-22促进癌细胞的外渗和转移。 | 该研究主要集中在小鼠模型，可能不完全适用于人类肿瘤转移的复杂性。 | 研究IL-22在癌细胞转移过程中的作用及其潜在的治疗靶点。 | 研究对象为小鼠，特别是IL-22缺失小鼠及相应的iNKT细胞。 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术和单细胞测序 | 小鼠模型 | 细胞 | 多个小鼠样本，包括IL-22缺失小鼠和野生型小鼠 |
| 379 | 2024-08-07 |
Macrophage activation drives ovarian failure and masculinization
2023-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522645
PMID:36711702
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研究论文 | 本文通过斑马鱼模型研究了巨噬细胞激活与卵巢功能障碍之间的关系 | 首次揭示了BMP15基因突变通过激活巨噬细胞导致卵巢功能障碍的细胞机制 | 研究仅在斑马鱼模型中进行，需要进一步在人类中验证 | 探讨BMP15基因突变导致的卵巢功能障碍的细胞机制及其与免疫系统的关系 | 斑马鱼模型中的卵巢功能和巨噬细胞激活 | NA | 卵巢功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼模型 |
| 380 | 2024-08-05 |
OX40L-Armed Oncolytic Virus Boosts T-cell Response and Remodels Tumor Microenvironment for Pancreatic Cancer Treatment
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.83495
PMID:37554264
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研究论文 | 该论文探讨了OX40L武装的溶瘤病毒在胰腺癌治疗中的治疗效果 | 研究表明OX40L武装溶瘤病毒能够重塑肿瘤微环境并增强T细胞反应 | 未提及具体的临床试验数据或人类研究结果 | 研究OX40L武装溶瘤病毒在胰腺导管腺癌治療中的疗效及其机制 | 以KPC鼠模型为对象，研究溶瘤病毒对肿瘤微环境和免疫细胞的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | HSV-1显性病毒 | NA | 单细胞RNA测序 | KPC肿瘤-bearing C57BL/6小鼠 |