单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-07 |
Cross-Validated Loss-Based Covariance Matrix Estimator Selection in High Dimensions
2023, Journal of computational and graphical statistics : a joint publication of American Statistical Association, Institute of Mathematical Statistics, Interface Foundation of North America
IF:1.4Q2
DOI:10.1080/10618600.2022.2110883
PMID:37273839
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research paper | 本文研究了在高维数据中基于交叉验证损失的协方差矩阵估计器选择方法 | 提出了一个通用类别的损失函数用于协方差矩阵估计，并建立了相应的有限样本风险界限和交叉验证选择器的渐近最优条件 | NA | 开发一种在高维数据中选择最优协方差矩阵估计器的理论框架 | 协方差矩阵估计器的选择 | statistics | NA | NA | NA | single-cell transcriptome sequencing data | NA |
| 342 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic analyses reveal the effects of microorganisms on immunity and metabolism in the mouse liver
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.06.020
PMID:38152123
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研究论文 | 本研究通过构建无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠肝脏的单细胞和空间转录组（ST）图谱，揭示了微生物对肝脏免疫和代谢的影响 | 首次综合运用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）和空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq）技术，详细分析了微生物对小鼠肝脏免疫细胞比例和代谢过程的影响 | NA | 探究微生物对小鼠肝脏免疫和代谢的具体细胞和分子影响 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 转录组 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏样本 |
| 343 | 2024-08-07 |
CXCL14 as a potential marker for immunotherapy response prediction in renal cell carcinoma
2023, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359231217966
PMID:38152696
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研究论文 | 本研究探讨了CXCL14在预测肾细胞癌（RCC）患者免疫治疗效果中的作用 | 首次阐明了CXCL14在塑造肿瘤免疫微环境中的作用，并发现其在免疫治疗反应预测中的潜在价值 | NA | 旨在阐明CXCL14在预测RCC患者免疫治疗效果中的作用 | CXCL14表达与RCC患者免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | RCC的公共数据库中的数据集 |
| 344 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.523241
PMID:36711968
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了小鼠皮肤伤口早期炎症过程中的细胞动态变化，发现凋亡途径和吞噬凋亡细胞的受体在成纤维细胞和免疫细胞中上调，并探讨了这些受体在组织修复中的作用。 | 首次揭示了凋亡细胞识别受体在组织修复中的具体作用机制，并提供了慢性伤口治疗的新潜在靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的适用性需要进一步验证。 | 探讨凋亡细胞识别和清除在组织修复中的作用机制。 | 小鼠皮肤伤口中的成纤维细胞、免疫细胞及人类糖尿病足伤口。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口和人类糖尿病足伤口样本 |
| 345 | 2024-08-07 |
Identification of ADAM23 as a Potential Signature for Psoriasis Using Integrative Machine-Learning and Experimental Verification
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S441262
PMID:38148887
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研究论文 | 本研究通过综合机器学习算法和实验验证，识别出ADAM23作为银屑病的一个潜在标志物 | 本研究首次使用四种机器学习算法结合单细胞RNA测序分析，验证了ADAM23作为银屑病的高诊断准确性的关键生物标志物 | NA | 旨在识别银屑病的新型关键生物标志物并分析其潜在的分子机制 | 银屑病相关的生物标志物及其在疾病诊断和治疗中的应用 | 机器学习 | 皮肤疾病 | 机器学习算法（随机森林、LASSO逻辑回归、WGCNA、SVM-RFE）、CIBERSORT、单细胞RNA分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个数据集，包括GSE30999、GSE6710和GSE41662，以及人和小鼠的实验样本 |
| 346 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analyses Reveal Necroptosis's Potential Role in Neuron Degeneration and Show Enhanced Neuron-Immune Cell Interaction in Parkinson's Disease Progression
2023, Parkinson's disease
DOI:10.1155/2023/5057778
PMID:38149092
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了细胞坏死在帕金森病神经元退化中的潜在作用及神经元与免疫细胞间的相互作用 | 首次深入分析了细胞坏死相关基因在神经元退化中的富集情况，并揭示了微胶质细胞与不同类型神经元在帕金森病进展中的增强相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探究帕金森病中神经元死亡和炎症的原因 | 帕金森病中的神经元退化和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 347 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of METTLs (METTL1/13/18/21A/23/25/2A/2B/5/6/9) and Associated mRNA Risk Signature in Hepatocellular Carcinoma
2023, Analytical cellular pathology (Amsterdam)
DOI:10.1155/2023/6007431
PMID:38130905
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研究论文 | 本研究分析了METTLs及其相关的mRNA风险特征在肝细胞癌中的价值 | 本研究构建了与METTLs相关的mRNA风险特征，并探讨了其作为独立预后标志物的临床应用 | 主要的限制是对METTL25之外其他基因的特定功能缺乏深入研究 | 本研究旨在揭示METTL家族基因在肝细胞癌的预后价值 | 主要针对METTLs和关联的mRNA在肝细胞癌患者中的表达及其预后影响进行研究 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA | 共涉及664个mRNA |
| 348 | 2024-08-05 |
Identification and validation of prognostic and tumor microenvironment characteristics of necroptosis index and BIRC3 in clear cell renal cell carcinoma
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16643
PMID:38130918
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研究论文 | 本研究探讨了坏死性凋亡指数及BIRC3在透明细胞肾细胞癌中的预后和肿瘤微环境特征 | 研究识别了新的坏死性凋亡相关基因，并提出了一种新的预后模型，评估了其在免疫特性和肿瘤突变负担中的作用 | 研究可能受到样本量和数据来源的限制，需进一步验证结果的普适性 | 探讨坏死性凋亡在透明细胞肾细胞癌中的重要性及其机制 | 透明细胞肾细胞癌中的坏死性凋亡相关基因及BIRC3的表达和功能 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序、定量实时PCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 涉及TCGA和GEO数据库中的多组样本，具体样本量NA |
| 349 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Exploring the shared molecular mechanisms between systemic lupus erythematosus and primary Sjögren's syndrome based on integrated bioinformatics and single-cell RNA-seq analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1339929
PMID:38143754
|
更正 | 这篇文章纠正了先前关于系统性红斑狼疮和原发性干燥综合症的分子机制研究的错误 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-05 |
Exploring the shared molecular mechanisms between systemic lupus erythematosus and primary Sjögren's syndrome based on integrated bioinformatics and single-cell RNA-seq analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1212330
PMID:37614232
|
研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮与原发性干燥综合征之间的共享分子机制 | 识别出IFI44L、ISG15和ITGB2作为共享基因，并找到了共同的转录因子STAT1和IRF7 | 未详细讨论共享基因的生物学功能及其在疾病中的具体作用 | 研究系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征之间的共同病理机制 | 系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征的基因及转录因子 | 数字病理 | 系统性红斑狼疮与原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 152个共享基因 |
| 351 | 2024-08-05 |
Endothelial cell clonality, heterogeneity and dysfunction in pulmonary arterial hypertension
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1304766
PMID:38126077
|
综述 | 本文总结了内皮细胞亚群及其在肺动脉高压中发展的异常生理表型的机制 | 探讨了内皮细胞的克隆扩展、免疫失调和遗传突变在肺动脉高压发病机制中的作用 | NA | 提供理解参与肺动脉高压发展的独特肺内皮细胞生物学和病理生理学的框架 | 肺动脉高压相关的内皮细胞亚群及其功能特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 文献 | NA |
| 352 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Sequencing Revealed Pivotal Genes Related to Prognosis of Myocardial Infarction Patients
2023, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2023/9895238
PMID:38124937
|
撤回 | 该文章被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-07 |
Combing Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Analysis to Elucidate the Mechanisms of Kidney Disease: Proceedings of the Henry Shavelle Professorship
2023 Jan-Dec, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000534678
PMID:38033715
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综述 | 本文综述了将全基因组关联研究（GWAS）与单细胞组学（包括转录组学）相结合在肾脏疾病研究中的创新方法 | 本文强调了GWAS和scRNA-seq结合在深入理解肾脏疾病中的变革潜力 | NA | 加深对肾脏疾病潜在机制的理解 | 肾脏疾病 | NA | 肾脏疾病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 354 | 2024-08-07 |
Gene regulatory network reconfiguration in direct lineage reprogramming
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.11.010
PMID:36584685
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研究论文 | 本文结合CellOracle分析与纤维母细胞向诱导内胚层祖细胞（iEP）转化的谱系追踪，揭示了成功与失败命运转化背后的不同网络配置。 | 通过CellOracle模拟TF扰动，识别出新的因子以促进细胞成功转化其身份，并揭示了AP-1亚基Fos与Hippo信号效应子Yap1的中心作用。 | NA | 研究直接谱系转化中基因调控网络（GRN）的重配置。 | 纤维母细胞向诱导内胚层祖细胞（iEP）的转化过程。 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组和表观基因组数据分析 | CellOracle | 转录组和表观基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 355 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomic Analysis of a Diverse Patient Cohort Reveals a Conserved Architecture in Triple-Negative Breast Cancer
2023-01-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2682
PMID:36283023
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析不同人种的三阴性乳腺癌患者的肿瘤架构 | 首次使用联合计数分析展示转录特征集群的非随机方向空间依赖性，支持三阴性乳腺癌中保守的空间转录结构 | 研究样本相对较小，且主要集中在特定人种群体上 | 定义三阴性乳腺癌的肿瘤架构，以便更好地理解疾病差异 | 来自14名患者的28个样本段的肿瘤组织 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间特征数据 | 28个样本段，来自14名患者 |
| 356 | 2024-08-07 |
IER5L is a Prognostic Biomarker in Pan-Cancer Analysis and Correlates with Immune Infiltration and Immune Molecules in Non-Small Cell Lung Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S439190
PMID:38106972
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研究论文 | 本研究探讨了IER5L在非小细胞肺癌中的预后生物标志物作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 | 首次揭示了IER5L在非小细胞肺癌中的预后价值及其与免疫浸润和免疫分子的关联 | NA | 研究IER5L在非小细胞肺癌中的预后作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 | 非小细胞肺癌中的IER5L表达及其与疾病进展、免疫浸润和免疫分子的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | qPCR, scRNA seq | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 临床信息 | 多个癌症数据库中的癌症样本 |
| 357 | 2024-08-07 |
Bioinformatics Prediction and Experimental Validation of the Role of Macrophage Polarization and Ferroptosis in Gestational Diabetes Mellitus
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S440826
PMID:38107385
|
研究论文 | 本文通过生物信息学预测和实验验证，探讨了巨噬细胞极化和铁死亡在妊娠糖尿病中的作用 | 首次揭示了妊娠糖尿病中巨噬细胞极化和铁死亡在胎盘炎症中的作用，并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于回顾性队列和公开数据集，未来需在前瞻性队列中进一步验证 | 探究妊娠糖尿病中胎盘炎症的机制并寻找潜在的治疗靶点 | 妊娠糖尿病中的巨噬细胞极化和铁死亡 | 生物信息学 | 妊娠糖尿病 | 转录组测序分析，多重免疫荧光染色 | NA | 转录组数据，临床信息 | 多个公开数据集（GSE154414, GSE70493, GSE173193）和回顾性队列样本 |
| 358 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Roles of Fibroblasts During Intestinal Injury and Repair in Rats with Severe Acute Pancreatitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S436511
PMID:38107381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了严重急性胰腺炎大鼠模型中肠道损伤与修复过程中细胞异质性和组成的分子机制 | 发现纤维母细胞通过细胞间通讯影响肠道损伤与修复，并揭示了RNA结合蛋白在纤维母细胞功能中的潜在作用 | NA | 探索肠道损伤与治疗的分子机制 | 严重急性胰腺炎大鼠模型的肠道组织 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三组实验，包括健康对照组、模型组和治疗组的大鼠肠道组织样本 |
| 359 | 2024-08-07 |
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16499
PMID:38077419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾病患者的肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的基因表达谱，以探索肾病的细胞异质性 | 首次发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在，并提出这些细胞可能作为非侵入性诊断肾病的生物标志物 | 研究样本量较小，仅包括四名肾炎患者 | 探索肾病的病理机制并开发非侵入性诊断方法 | 肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的细胞异质性 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名肾炎患者 |
| 360 | 2024-08-07 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了PD-1阻断疗法对头颈鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境中调节性T细胞（Tregs）的影响 | 研究发现Nivolumab治疗后Treg数量和抑制活性增加，并揭示了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴和KRAS信号通路的变化可能与Treg数量的增加有关 | 需要进一步研究以深入理解患者对免疫疗法反应的限制 | 旨在探讨Nivolumab如何影响HNSCC肿瘤微环境中浸润的Tregs | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤微环境和调节性T细胞（Tregs） | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从四名HNSCC供体中分离的八份组织样本，治疗前后各四份 |