单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA transcriptome sequencing reveals a heterogeneous immune landscape and pivotal cell subpopulations associated with colorectal cancer prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1184167
PMID:37675100
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌预后相关的异质性免疫景观和关键细胞亚群。 | 通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA转录组测序，提供了关于结直肠癌免疫细胞异质性的新见解。 | 该研究主要集中于免疫细胞的分析，其他肿瘤微环境因素的作用未得到足够探讨。 | 研究结直肠癌中免疫细胞的异质性及其对预后的影响。 | 结直肠癌患者的免疫细胞及其在肿瘤微环境中的分布。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、大规模RNA测序 | NA | 免疫细胞数据 | 62,398个免疫细胞 |
| 342 | 2024-08-05 |
Substrate stiffness enhances human regulatory T cell induction and metabolism
2023-01, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 该文章探讨了基质刚度对人类调节性T细胞（Tregs）诱导和代谢的影响 | 揭示了Tregs诱导对基质机械刚度的敏感性，并发现刚性的基质促进了氧化磷酸化的使用 | 研究未探讨不同类型的基质对Tregs诱导的影响 | 旨在提高调节性T细胞的诱导效率，以改善细胞免疫治疗 | 人类调节性T细胞（Tregs） | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物材料 | 使用了不同刚度的聚丙烯酰胺胶（PA-gels）作为实验样本 |
| 343 | 2024-08-07 |
Remarkable sex-specific differences at single-cell resolution in neonatal hyperoxic lung injury
2023-01-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00269.2022
PMID:36283964
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研究论文 | 研究了新生儿暴露于高氧环境下肺损伤的性别特异性及细胞类型特异性转录变化，并描绘了发育中肺部细胞间通信网络的变化。 | 首次在单细胞分辨率下研究新生儿高氧肺损伤的性别特异性转录变化，并识别了肺部血管内皮细胞对高氧暴露的敏感性及新的中间型内皮细胞群体。 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，可能限制了结果在人类中的直接应用。 | 探讨新生儿高氧暴露下肺损伤的性别特异性及细胞类型特异性转录变化，以及细胞间通信网络的变化。 | 新生儿肺部在高氧暴露下的细胞类型特异性转录变化及细胞间通信网络。 | 数字病理学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 从暴露于高氧或正常氧环境的新生雄性和雌性C57BL/6小鼠肺部分离的超过35,000个细胞 |
| 344 | 2024-08-07 |
Molecular Diversity of Neuron Types in the Salamander Amygdala and Implications for Amygdalar Evolution
2023, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000527899
PMID:36574764
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了蝾螈大脑中杏仁核的谷氨酸能神经元类型多样性，并探讨了其对杏仁核进化的影响 | 首次详细描述了非哺乳动物蝾螈杏仁核中谷氨酸能神经元的多样性，揭示了其与哺乳动物杏仁核神经元的分子差异 | 研究仅限于蝾螈这一种非哺乳动物，可能需要更多物种的数据来全面理解杏仁核的进化 | 探讨蝾螈杏仁核中神经元类型的多样性及其对杏仁核进化的影响 | 蝾螈杏仁核中的谷氨酸能神经元类型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 至少十种不同的谷氨酸能神经元类型和亚型 |
| 345 | 2024-08-07 |
Cross-Validated Loss-Based Covariance Matrix Estimator Selection in High Dimensions
2023, Journal of computational and graphical statistics : a joint publication of American Statistical Association, Institute of Mathematical Statistics, Interface Foundation of North America
IF:1.4Q2
DOI:10.1080/10618600.2022.2110883
PMID:37273839
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research paper | 本文研究了在高维数据中基于交叉验证损失的协方差矩阵估计器选择方法 | 提出了一个通用类别的损失函数用于协方差矩阵估计，并建立了相应的有限样本风险界限和交叉验证选择器的渐近最优条件 | NA | 开发一种在高维数据中选择最优协方差矩阵估计器的理论框架 | 协方差矩阵估计器的选择 | statistics | NA | NA | NA | single-cell transcriptome sequencing data | NA |
| 346 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic analyses reveal the effects of microorganisms on immunity and metabolism in the mouse liver
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.06.020
PMID:38152123
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研究论文 | 本研究通过构建无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠肝脏的单细胞和空间转录组（ST）图谱，揭示了微生物对肝脏免疫和代谢的影响 | 首次综合运用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）和空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq）技术，详细分析了微生物对小鼠肝脏免疫细胞比例和代谢过程的影响 | NA | 探究微生物对小鼠肝脏免疫和代谢的具体细胞和分子影响 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 转录组 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏样本 |
| 347 | 2024-08-07 |
CXCL14 as a potential marker for immunotherapy response prediction in renal cell carcinoma
2023, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359231217966
PMID:38152696
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研究论文 | 本研究探讨了CXCL14在预测肾细胞癌（RCC）患者免疫治疗效果中的作用 | 首次阐明了CXCL14在塑造肿瘤免疫微环境中的作用，并发现其在免疫治疗反应预测中的潜在价值 | NA | 旨在阐明CXCL14在预测RCC患者免疫治疗效果中的作用 | CXCL14表达与RCC患者免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | RCC的公共数据库中的数据集 |
| 348 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.523241
PMID:36711968
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了小鼠皮肤伤口早期炎症过程中的细胞动态变化，发现凋亡途径和吞噬凋亡细胞的受体在成纤维细胞和免疫细胞中上调，并探讨了这些受体在组织修复中的作用。 | 首次揭示了凋亡细胞识别受体在组织修复中的具体作用机制，并提供了慢性伤口治疗的新潜在靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的适用性需要进一步验证。 | 探讨凋亡细胞识别和清除在组织修复中的作用机制。 | 小鼠皮肤伤口中的成纤维细胞、免疫细胞及人类糖尿病足伤口。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口和人类糖尿病足伤口样本 |
| 349 | 2024-08-07 |
Identification of ADAM23 as a Potential Signature for Psoriasis Using Integrative Machine-Learning and Experimental Verification
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S441262
PMID:38148887
|
研究论文 | 本研究通过综合机器学习算法和实验验证，识别出ADAM23作为银屑病的一个潜在标志物 | 本研究首次使用四种机器学习算法结合单细胞RNA测序分析，验证了ADAM23作为银屑病的高诊断准确性的关键生物标志物 | NA | 旨在识别银屑病的新型关键生物标志物并分析其潜在的分子机制 | 银屑病相关的生物标志物及其在疾病诊断和治疗中的应用 | 机器学习 | 皮肤疾病 | 机器学习算法（随机森林、LASSO逻辑回归、WGCNA、SVM-RFE）、CIBERSORT、单细胞RNA分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个数据集，包括GSE30999、GSE6710和GSE41662，以及人和小鼠的实验样本 |
| 350 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analyses Reveal Necroptosis's Potential Role in Neuron Degeneration and Show Enhanced Neuron-Immune Cell Interaction in Parkinson's Disease Progression
2023, Parkinson's disease
DOI:10.1155/2023/5057778
PMID:38149092
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了细胞坏死在帕金森病神经元退化中的潜在作用及神经元与免疫细胞间的相互作用 | 首次深入分析了细胞坏死相关基因在神经元退化中的富集情况，并揭示了微胶质细胞与不同类型神经元在帕金森病进展中的增强相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探究帕金森病中神经元死亡和炎症的原因 | 帕金森病中的神经元退化和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 351 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of METTLs (METTL1/13/18/21A/23/25/2A/2B/5/6/9) and Associated mRNA Risk Signature in Hepatocellular Carcinoma
2023, Analytical cellular pathology (Amsterdam)
DOI:10.1155/2023/6007431
PMID:38130905
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研究论文 | 本研究分析了METTLs及其相关的mRNA风险特征在肝细胞癌中的价值 | 本研究构建了与METTLs相关的mRNA风险特征，并探讨了其作为独立预后标志物的临床应用 | 主要的限制是对METTL25之外其他基因的特定功能缺乏深入研究 | 本研究旨在揭示METTL家族基因在肝细胞癌的预后价值 | 主要针对METTLs和关联的mRNA在肝细胞癌患者中的表达及其预后影响进行研究 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA | 共涉及664个mRNA |
| 352 | 2024-08-05 |
Identification and validation of prognostic and tumor microenvironment characteristics of necroptosis index and BIRC3 in clear cell renal cell carcinoma
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16643
PMID:38130918
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研究论文 | 本研究探讨了坏死性凋亡指数及BIRC3在透明细胞肾细胞癌中的预后和肿瘤微环境特征 | 研究识别了新的坏死性凋亡相关基因，并提出了一种新的预后模型，评估了其在免疫特性和肿瘤突变负担中的作用 | 研究可能受到样本量和数据来源的限制，需进一步验证结果的普适性 | 探讨坏死性凋亡在透明细胞肾细胞癌中的重要性及其机制 | 透明细胞肾细胞癌中的坏死性凋亡相关基因及BIRC3的表达和功能 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序、定量实时PCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 涉及TCGA和GEO数据库中的多组样本，具体样本量NA |
| 353 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Exploring the shared molecular mechanisms between systemic lupus erythematosus and primary Sjögren's syndrome based on integrated bioinformatics and single-cell RNA-seq analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1339929
PMID:38143754
|
更正 | 这篇文章纠正了先前关于系统性红斑狼疮和原发性干燥综合症的分子机制研究的错误 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-05 |
Exploring the shared molecular mechanisms between systemic lupus erythematosus and primary Sjögren's syndrome based on integrated bioinformatics and single-cell RNA-seq analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1212330
PMID:37614232
|
研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮与原发性干燥综合征之间的共享分子机制 | 识别出IFI44L、ISG15和ITGB2作为共享基因，并找到了共同的转录因子STAT1和IRF7 | 未详细讨论共享基因的生物学功能及其在疾病中的具体作用 | 研究系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征之间的共同病理机制 | 系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征的基因及转录因子 | 数字病理 | 系统性红斑狼疮与原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 152个共享基因 |
| 355 | 2024-08-05 |
Endothelial cell clonality, heterogeneity and dysfunction in pulmonary arterial hypertension
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1304766
PMID:38126077
|
综述 | 本文总结了内皮细胞亚群及其在肺动脉高压中发展的异常生理表型的机制 | 探讨了内皮细胞的克隆扩展、免疫失调和遗传突变在肺动脉高压发病机制中的作用 | NA | 提供理解参与肺动脉高压发展的独特肺内皮细胞生物学和病理生理学的框架 | 肺动脉高压相关的内皮细胞亚群及其功能特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 文献 | NA |
| 356 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Sequencing Revealed Pivotal Genes Related to Prognosis of Myocardial Infarction Patients
2023, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2023/9895238
PMID:38124937
|
撤回 | 该文章被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-07 |
Combing Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Analysis to Elucidate the Mechanisms of Kidney Disease: Proceedings of the Henry Shavelle Professorship
2023 Jan-Dec, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000534678
PMID:38033715
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综述 | 本文综述了将全基因组关联研究（GWAS）与单细胞组学（包括转录组学）相结合在肾脏疾病研究中的创新方法 | 本文强调了GWAS和scRNA-seq结合在深入理解肾脏疾病中的变革潜力 | NA | 加深对肾脏疾病潜在机制的理解 | 肾脏疾病 | NA | 肾脏疾病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 358 | 2024-08-07 |
Gene regulatory network reconfiguration in direct lineage reprogramming
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.11.010
PMID:36584685
|
研究论文 | 本文结合CellOracle分析与纤维母细胞向诱导内胚层祖细胞（iEP）转化的谱系追踪，揭示了成功与失败命运转化背后的不同网络配置。 | 通过CellOracle模拟TF扰动，识别出新的因子以促进细胞成功转化其身份，并揭示了AP-1亚基Fos与Hippo信号效应子Yap1的中心作用。 | NA | 研究直接谱系转化中基因调控网络（GRN）的重配置。 | 纤维母细胞向诱导内胚层祖细胞（iEP）的转化过程。 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组和表观基因组数据分析 | CellOracle | 转录组和表观基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 359 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomic Analysis of a Diverse Patient Cohort Reveals a Conserved Architecture in Triple-Negative Breast Cancer
2023-01-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2682
PMID:36283023
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析不同人种的三阴性乳腺癌患者的肿瘤架构 | 首次使用联合计数分析展示转录特征集群的非随机方向空间依赖性，支持三阴性乳腺癌中保守的空间转录结构 | 研究样本相对较小，且主要集中在特定人种群体上 | 定义三阴性乳腺癌的肿瘤架构，以便更好地理解疾病差异 | 来自14名患者的28个样本段的肿瘤组织 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间特征数据 | 28个样本段，来自14名患者 |
| 360 | 2024-08-07 |
IER5L is a Prognostic Biomarker in Pan-Cancer Analysis and Correlates with Immune Infiltration and Immune Molecules in Non-Small Cell Lung Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S439190
PMID:38106972
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研究论文 | 本研究探讨了IER5L在非小细胞肺癌中的预后生物标志物作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 | 首次揭示了IER5L在非小细胞肺癌中的预后价值及其与免疫浸润和免疫分子的关联 | NA | 研究IER5L在非小细胞肺癌中的预后作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 | 非小细胞肺癌中的IER5L表达及其与疾病进展、免疫浸润和免疫分子的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | qPCR, scRNA seq | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 临床信息 | 多个癌症数据库中的癌症样本 |