单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
Dissecting cellular heterogeneity and intercellular communication in cholangiocarcinoma: implications for individualized therapeutic strategies
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1241834
PMID:38239853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨胆管癌中的细胞异质性和细胞间通讯，并分析了细胞类型、基因富集通路及细胞间通讯网络，为个性化治疗策略提供依据 | 首次通过单细胞RNA测序和CellChat分析揭示胆管癌中细胞异质性和细胞间通讯的复杂性，并发现肿瘤微环境中成纤维细胞的关键作用及T细胞的新克隆型 | 研究样本仅来自两名患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示胆管癌的细胞异质性和细胞间通讯，为开发有效治疗策略提供依据 | 胆管癌及其邻近正常组织的细胞异质性和细胞间通讯 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 两名患者的胆管癌及邻近正常组织 |
| 322 | 2024-08-07 |
Gastric Stem Cell Biology and Helicobacter pylori Infection
2023, Current topics in microbiology and immunology
DOI:10.1007/978-3-031-47331-9_1
PMID:38231213
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研究论文 | 研究幽门螺杆菌感染对胃干细胞生物学的影响及其在胃癌发展中的作用 | 利用细胞系追踪、类器官和单细胞RNA测序技术，深入了解正常稳态和感染状态下上皮和间质细胞亚型的分子“身份”，并揭示了幽门螺杆菌感染下干细胞（微环境）行为的原理 | NA | 探讨幽门螺杆菌感染如何影响胃干细胞行为及其在胃癌发展中的作用 | 胃干细胞、幽门螺杆菌感染、胃癌发展 | 数字病理学 | 胃癌 | 细胞系追踪、类器官、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 323 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals Wolbachia-mediated modification in early stages of Drosophila spermatogenesis
2023-01-11, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2022.1963
PMID:36629101
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇睾丸中的基因表达谱，揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生不同阶段的细胞中产生的影响，特别是在生殖干细胞中的基因表达调控 | 由于精子发生的复杂性和睾丸细胞类型的异质性，沃尔巴克氏菌对不同阶段精子发生细胞的具体影响机制仍需进一步研究 | 探讨沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用及其与细胞质不相容性的关联 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 |
| 324 | 2024-08-07 |
Commensal microbiome promotes hair follicle regeneration by inducing keratinocyte HIF-1α signaling and glutamine metabolism
2023-01-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7555
PMID:36598999
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research paper | 研究揭示了共生微生物群通过诱导角质形成细胞HIF-1α信号传导和谷氨酰胺代谢促进毛囊再生的机制 | 首次发现皮肤共生细菌通过诱导角质形成细胞的谷氨酰胺代谢，增强皮肤和毛囊的再生能力 | NA | 探究组织损伤后干细胞代谢变化对再生的影响 | 皮肤共生细菌、角质形成细胞、毛囊再生 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 皮肤样本 | 小鼠和人类皮肤样本 |
| 325 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in glioblastoma: is knowing the right zip code the key to the next therapeutic breakthrough?
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1266397
PMID:37916170
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review | 本文探讨了空间转录组学在胶质母细胞瘤研究中的应用 | 提出空间转录组学为研究胶质母细胞瘤及其周围脑组织的空间组织提供了新视角 | 仅讨论了当前的研究现状和未来方向，缺乏实证数据支持 | 研究空间转录组学在胶质母细胞瘤中的应用以理解其空间组织 | 胶质母细胞瘤及其与周围脑组织的相互作用 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/9856458
PMID:38189006
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撤回 | 该文章涉及对肌腱损伤发病机制的单细胞转录组学分析 | NA | NA | 研究肌腱损伤的发病机制 | 肌腱损伤的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-05 |
New perspectives on biology, disease progression, and therapy response of head and neck cancer gained from single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.044774
PMID:38188682
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综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在头颈癌中的应用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法，揭示了肿瘤微环境中不同细胞群体之间的异质性和细胞间通信 | 未提及特定的实验或临床数据，可能限制了理论与实际的结合 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学对头颈癌的认识 | 头颈鳞状细胞癌及其微环境中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-07 |
GAPDH: unveiling its impact as a key hypoxia-related player in head and neck squamous cell carcinoma tumor progression, prognosis, and therapeutic potential
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38187058
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研究论文 | 本文探讨了糖酵解酶GAPDH在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用，特别是在不同缺氧条件下的功能和治疗潜力 | 首次详细分析了GAPDH在HNSCC中的表达与患者生存率、免疫细胞浸润及药物疗效的关系 | 研究主要基于现有数据库和细胞系实验，未涉及临床试验验证 | 揭示GAPDH在HNSCC中的生物学功能及其对肿瘤进展、预后和治疗潜力的影响 | GAPDH在HNSCC中的表达及其与缺氧条件的关系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GSE29330、GSE41613和GSE139324等多个数据库的数据 |
| 329 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of senescence-related genes and immune infiltration in intervertebral disc degeneration: a meta-data approach utilizing bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1296782
PMID:38187091
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研究论文 | 本研究旨在通过分析大量和单细胞RNA测序数据，识别与椎间盘退变相关的衰老基因及其潜在调控机制 | 本研究通过结合大量和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于关键衰老相关差异表达基因和免疫细胞浸润的诊断模型，为椎间盘退变的发病机制和免疫治疗策略提供了新的见解 | NA | 识别与椎间盘退变相关的关键衰老基因及其潜在调控机制 | 椎间盘退变（IDD）的衰老基因和免疫浸润 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | RNA测序 | lasso回归 | RNA测序数据 | 涉及GSE34095和GSE70362数据集以及单细胞数据集GSE165722 |
| 330 | 2024-08-07 |
The origins and dynamic changes of C3- and S100A10-positive reactive astrocytes after spinal cord injury
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1276506
PMID:38188669
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠和谱系追踪技术，探讨了脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | 首次详细描述了C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞在脊髓损伤后的起源和动态变化过程 | NA | 确定脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞 | NA | 脊髓损伤 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 幼年和成年脊髓损伤小鼠模型及培养的星形胶质细胞 |
| 331 | 2024-08-05 |
The role of ARL4C in predicting prognosis and immunotherapy drug susceptibility in pan-cancer analysis
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1288492
PMID:38178862
|
研究论文 | 本研究探讨了ARL4C在全癌症分析中的预后预测和免疫治疗药物敏感性中的作用 | 首次揭示了ARL4C在不同类型癌症中的高表达与预后不良及免疫逃逸之间的关系，并对其在免疫微环境中的作用进行了分析 | 该研究可能存在样本量限制及ARL4C在特定癌症类型中的具体机制尚不清楚 | 研究ARL4C在肿瘤预后和免疫治疗药物敏感性中的作用 | 研究了33种不同类型癌症中ARL4C的表达及其与预后的相关性 | 数字病理学 | NA | 免疫组化和免疫荧光染色 | NA | RNA-seq | 23种不同类型癌症的样本 |
| 332 | 2024-08-07 |
Scleraxis-lineage cells are required for tendon homeostasis and their depletion induces an accelerated extracellular matrix aging phenotype
2023-01-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.84194
PMID:36656751
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研究论文 | 本研究通过在小鼠中耗尽Scleraxis-lineage细胞，开发了一种加速肌腱细胞外基质（ECM）衰老的新模型，并探讨了其对肌腱稳态的影响 | 首次开发了一种通过耗尽Scleraxis-lineage细胞来加速肌腱ECM衰老的模型，并揭示了该模型中肌腱细胞功能的变化 | NA | 探究肌腱稳态破坏的机制，为开发维持肌腱健康的治疗方法提供依据 | Scleraxis-lineage细胞在肌腱稳态和ECM衰老中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻小鼠 |
| 333 | 2024-08-05 |
Identification of efferocytosis-related subtypes in gliomas and elucidating their characteristics and clinical significance
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1295891
PMID:38161335
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研究论文 | 本研究识别了胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型，并探讨了其特征和临床意义 | 首次通过分析137个与吞噬凋亡相关的基因，建立了与吞噬凋亡相关的胶质瘤亚型分类，并探讨了其在免疫环境、细胞间通信和代谢过程中的特征 | 未提及特定实验设计或样本选择的限制 | 探讨胶质瘤中吞噬凋亡相关亚型的特征和临床意义 | 胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型及其相关特征 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NMF算法 | 基因表型数据 | NA |
| 334 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA landscape of osteoimmune microenvironment in osteoporotic vertebral compression fracture and Kümmell's disease
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1276098
PMID:38161331
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的分子途径、细胞群组成和细胞间相互作用的差异 | NA | 探讨骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8741个单细胞 |
| 335 | 2024-08-07 |
APOL1 Induces Pyroptosis of Fibroblasts Through NLRP3/Caspase-1/GSDMD Signaling Pathway in Ulcerative Colitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S437875
PMID:38161356
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研究论文 | 本研究探讨了APOL1通过NLRP3/Caspase-1/GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡在溃疡性结肠炎中的作用 | 首次揭示了APOL1通过NLRP3-Caspase1-GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡，并促进趋化因子CXCL1的释放，这一发现有助于理解溃疡性结肠炎的发病机制 | NA | 研究APOL1在溃疡性结肠炎中诱导纤维母细胞焦亡的作用及其分子机制 | 溃疡性结肠炎中的纤维母细胞 | NA | 溃疡性结肠炎 | 生物信息学分析、免疫组织化学、免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE193677和GSE231993数据集 |
| 336 | 2024-08-07 |
Urinary PART1 and PLA2R1 Could Potentially Serve as Diagnostic Markers for Diabetic Kidney Disease Patients
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S445341
PMID:38162802
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研究论文 | 本研究通过bulk-seq、scRNA-seq和snRNA-seq数据分析，识别出与糖尿病肾病相关的尿液-肾脏特异性基因，特别是PART1和PLA2R1，这些基因可能作为早期诊断糖尿病肾病的标志物 | 首次识别出尿液中的PART1和PLA2R1作为糖尿病肾病的潜在诊断标志物，并探讨了它们与肾脏损伤和蛋白尿的关系 | 研究样本量较小，且仅包括糖尿病肾病患者和健康对照组，未来研究需扩大样本量并考虑更多疾病阶段的患者 | 探索糖尿病肾病的非侵入性诊断方法，特别是早期诊断 | 糖尿病肾病患者和健康对照组的尿液样本 | NA | 糖尿病肾病 | bulk-seq, scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 尿液样本 | 56个尿液样本，包括11个来自糖尿病肾病患者和11个来自健康对照组 |
| 337 | 2024-08-07 |
Single-cell analyses EMP1 as a marker of the ratio of M1/M2 macrophages is associated with EMT, immune infiltration, and prognosis in bladder cancer
2023, Bladder (San Francisco, Calif.)
DOI:10.14440/bladder.2023.852
PMID:38163006
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞分析中EMP1作为M1/M2巨噬细胞比例的标志物与膀胱癌的EMT、免疫浸润及预后的关联 | 首次研究了M1和M2巨噬细胞联合作用在膀胱癌发展、生长、进展和转移中的意义，并识别了EMP1作为关键基因 | 研究样本量较小，仅涉及32名患者 | 探究EMP1在膀胱癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 膀胱癌中的M1/M2巨噬细胞比例及EMP1基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | Cibersortx算法、流式细胞术、Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)、Gene Set Variation Analysis (GSVA)、Gene Ontology (GO)、单细胞转录组分析(scRNA-seq)、Cellchat | NA | 基因表达数据 | 32名膀胱癌患者 |
| 338 | 2024-08-07 |
Deciphering the Divergent Gene Expression Landscapes of m6A/m5C/m1A Methylation Regulators in Hepatocellular Carcinoma Through Single-Cell and Bulk RNA Transcriptomic Analysis
2023, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S448047
PMID:38164510
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA转录组分析，探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | 本研究首次在单细胞水平上探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达，并验证了其在癌组织和邻近非癌肝组织中的表达 | 本研究仅分析了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达差异，未深入探讨其具体功能和机制 | 探索m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 收集了成人肝细胞癌患者的癌组织和邻近非癌肝组织样本 |
| 339 | 2024-08-05 |
Hepatocyte Adenosine Kinase Promotes Excessive Fat Deposition and Liver Inflammation
2023-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.09.027
PMID:36181835
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研究论文 | 本文研究了肝细胞腺苷激酶如何促进过量脂肪沉积和肝脏炎症 | 揭示了肝细胞腺苷激酶在肥胖基因/酶中的作用以及其在肝脏脂肪沉积和炎症中的机制 | 尚未提供各种治疗方法的临床验证 | 研究肝细胞腺苷激酶的功能及其在肥胖和非酒精性脂肪肝疾病中的作用 | 人类肝脏切片和特定转基因小鼠 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，脂质组学 | 小鼠模型 | 人类组织样本和小鼠生物样本 | 人类样本和多种小鼠样本，具体数量未提供 |
| 340 | 2024-08-05 |
Highly Multiplexed Spatially Resolved Proteomic and Transcriptional Profiling of the Glioblastoma Microenvironment Using Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Specimens
2023-01, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2022.100034
PMID:36788070
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研究论文 | 本研究使用归档的福尔马林固定石蜡包埋标本对胶质母细胞瘤微环境进行了高度多重的空间解析蛋白质组和转录组分析 | 创新性地应用了整合的多模态方法来表征胶质母细胞瘤微环境的分子异质性 | 仅使用归档的固定标本，可能对新鲜样本的分析结果有局限性 | 研究胶质母细胞瘤微环境的空间分布及其潜在的治疗靶点 | 归档的福尔马林固定石蜡包埋的胶质母细胞瘤标本 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | NanoString GeoMx数字空间分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 空间蛋白质组和转录组数据 | 使用了归档的多个胶质母细胞瘤标本 |