单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
The origins and dynamic changes of C3- and S100A10-positive reactive astrocytes after spinal cord injury
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1276506
PMID:38188669
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠和谱系追踪技术，探讨了脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | 首次详细描述了C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞在脊髓损伤后的起源和动态变化过程 | NA | 确定脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞 | NA | 脊髓损伤 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 幼年和成年脊髓损伤小鼠模型及培养的星形胶质细胞 |
| 322 | 2024-08-05 |
The role of ARL4C in predicting prognosis and immunotherapy drug susceptibility in pan-cancer analysis
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1288492
PMID:38178862
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研究论文 | 本研究探讨了ARL4C在全癌症分析中的预后预测和免疫治疗药物敏感性中的作用 | 首次揭示了ARL4C在不同类型癌症中的高表达与预后不良及免疫逃逸之间的关系，并对其在免疫微环境中的作用进行了分析 | 该研究可能存在样本量限制及ARL4C在特定癌症类型中的具体机制尚不清楚 | 研究ARL4C在肿瘤预后和免疫治疗药物敏感性中的作用 | 研究了33种不同类型癌症中ARL4C的表达及其与预后的相关性 | 数字病理学 | NA | 免疫组化和免疫荧光染色 | NA | RNA-seq | 23种不同类型癌症的样本 |
| 323 | 2024-08-07 |
Scleraxis-lineage cells are required for tendon homeostasis and their depletion induces an accelerated extracellular matrix aging phenotype
2023-01-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.84194
PMID:36656751
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研究论文 | 本研究通过在小鼠中耗尽Scleraxis-lineage细胞，开发了一种加速肌腱细胞外基质（ECM）衰老的新模型，并探讨了其对肌腱稳态的影响 | 首次开发了一种通过耗尽Scleraxis-lineage细胞来加速肌腱ECM衰老的模型，并揭示了该模型中肌腱细胞功能的变化 | NA | 探究肌腱稳态破坏的机制，为开发维持肌腱健康的治疗方法提供依据 | Scleraxis-lineage细胞在肌腱稳态和ECM衰老中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻小鼠 |
| 324 | 2024-08-05 |
Identification of efferocytosis-related subtypes in gliomas and elucidating their characteristics and clinical significance
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1295891
PMID:38161335
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研究论文 | 本研究识别了胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型，并探讨了其特征和临床意义 | 首次通过分析137个与吞噬凋亡相关的基因，建立了与吞噬凋亡相关的胶质瘤亚型分类，并探讨了其在免疫环境、细胞间通信和代谢过程中的特征 | 未提及特定实验设计或样本选择的限制 | 探讨胶质瘤中吞噬凋亡相关亚型的特征和临床意义 | 胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型及其相关特征 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NMF算法 | 基因表型数据 | NA |
| 325 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA landscape of osteoimmune microenvironment in osteoporotic vertebral compression fracture and Kümmell's disease
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1276098
PMID:38161331
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的分子途径、细胞群组成和细胞间相互作用的差异 | NA | 探讨骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8741个单细胞 |
| 326 | 2024-08-07 |
APOL1 Induces Pyroptosis of Fibroblasts Through NLRP3/Caspase-1/GSDMD Signaling Pathway in Ulcerative Colitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S437875
PMID:38161356
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研究论文 | 本研究探讨了APOL1通过NLRP3/Caspase-1/GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡在溃疡性结肠炎中的作用 | 首次揭示了APOL1通过NLRP3-Caspase1-GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡，并促进趋化因子CXCL1的释放，这一发现有助于理解溃疡性结肠炎的发病机制 | NA | 研究APOL1在溃疡性结肠炎中诱导纤维母细胞焦亡的作用及其分子机制 | 溃疡性结肠炎中的纤维母细胞 | NA | 溃疡性结肠炎 | 生物信息学分析、免疫组织化学、免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE193677和GSE231993数据集 |
| 327 | 2024-08-07 |
Urinary PART1 and PLA2R1 Could Potentially Serve as Diagnostic Markers for Diabetic Kidney Disease Patients
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S445341
PMID:38162802
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研究论文 | 本研究通过bulk-seq、scRNA-seq和snRNA-seq数据分析，识别出与糖尿病肾病相关的尿液-肾脏特异性基因，特别是PART1和PLA2R1，这些基因可能作为早期诊断糖尿病肾病的标志物 | 首次识别出尿液中的PART1和PLA2R1作为糖尿病肾病的潜在诊断标志物，并探讨了它们与肾脏损伤和蛋白尿的关系 | 研究样本量较小，且仅包括糖尿病肾病患者和健康对照组，未来研究需扩大样本量并考虑更多疾病阶段的患者 | 探索糖尿病肾病的非侵入性诊断方法，特别是早期诊断 | 糖尿病肾病患者和健康对照组的尿液样本 | NA | 糖尿病肾病 | bulk-seq, scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 尿液样本 | 56个尿液样本，包括11个来自糖尿病肾病患者和11个来自健康对照组 |
| 328 | 2024-08-07 |
Single-cell analyses EMP1 as a marker of the ratio of M1/M2 macrophages is associated with EMT, immune infiltration, and prognosis in bladder cancer
2023, Bladder (San Francisco, Calif.)
DOI:10.14440/bladder.2023.852
PMID:38163006
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞分析中EMP1作为M1/M2巨噬细胞比例的标志物与膀胱癌的EMT、免疫浸润及预后的关联 | 首次研究了M1和M2巨噬细胞联合作用在膀胱癌发展、生长、进展和转移中的意义，并识别了EMP1作为关键基因 | 研究样本量较小，仅涉及32名患者 | 探究EMP1在膀胱癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 膀胱癌中的M1/M2巨噬细胞比例及EMP1基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | Cibersortx算法、流式细胞术、Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)、Gene Set Variation Analysis (GSVA)、Gene Ontology (GO)、单细胞转录组分析(scRNA-seq)、Cellchat | NA | 基因表达数据 | 32名膀胱癌患者 |
| 329 | 2024-08-07 |
Deciphering the Divergent Gene Expression Landscapes of m6A/m5C/m1A Methylation Regulators in Hepatocellular Carcinoma Through Single-Cell and Bulk RNA Transcriptomic Analysis
2023, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S448047
PMID:38164510
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA转录组分析，探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | 本研究首次在单细胞水平上探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达，并验证了其在癌组织和邻近非癌肝组织中的表达 | 本研究仅分析了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达差异，未深入探讨其具体功能和机制 | 探索m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 收集了成人肝细胞癌患者的癌组织和邻近非癌肝组织样本 |
| 330 | 2024-08-05 |
Hepatocyte Adenosine Kinase Promotes Excessive Fat Deposition and Liver Inflammation
2023-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.09.027
PMID:36181835
|
研究论文 | 本文研究了肝细胞腺苷激酶如何促进过量脂肪沉积和肝脏炎症 | 揭示了肝细胞腺苷激酶在肥胖基因/酶中的作用以及其在肝脏脂肪沉积和炎症中的机制 | 尚未提供各种治疗方法的临床验证 | 研究肝细胞腺苷激酶的功能及其在肥胖和非酒精性脂肪肝疾病中的作用 | 人类肝脏切片和特定转基因小鼠 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，脂质组学 | 小鼠模型 | 人类组织样本和小鼠生物样本 | 人类样本和多种小鼠样本，具体数量未提供 |
| 331 | 2024-08-05 |
Highly Multiplexed Spatially Resolved Proteomic and Transcriptional Profiling of the Glioblastoma Microenvironment Using Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Specimens
2023-01, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2022.100034
PMID:36788070
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研究论文 | 本研究使用归档的福尔马林固定石蜡包埋标本对胶质母细胞瘤微环境进行了高度多重的空间解析蛋白质组和转录组分析 | 创新性地应用了整合的多模态方法来表征胶质母细胞瘤微环境的分子异质性 | 仅使用归档的固定标本，可能对新鲜样本的分析结果有局限性 | 研究胶质母细胞瘤微环境的空间分布及其潜在的治疗靶点 | 归档的福尔马林固定石蜡包埋的胶质母细胞瘤标本 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | NanoString GeoMx数字空间分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 空间蛋白质组和转录组数据 | 使用了归档的多个胶质母细胞瘤标本 |
| 332 | 2024-08-05 |
Integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA transcriptome sequencing reveals a heterogeneous immune landscape and pivotal cell subpopulations associated with colorectal cancer prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1184167
PMID:37675100
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌预后相关的异质性免疫景观和关键细胞亚群。 | 通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA转录组测序，提供了关于结直肠癌免疫细胞异质性的新见解。 | 该研究主要集中于免疫细胞的分析，其他肿瘤微环境因素的作用未得到足够探讨。 | 研究结直肠癌中免疫细胞的异质性及其对预后的影响。 | 结直肠癌患者的免疫细胞及其在肿瘤微环境中的分布。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、大规模RNA测序 | NA | 免疫细胞数据 | 62,398个免疫细胞 |
| 333 | 2024-08-05 |
Substrate stiffness enhances human regulatory T cell induction and metabolism
2023-01, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 该文章探讨了基质刚度对人类调节性T细胞（Tregs）诱导和代谢的影响 | 揭示了Tregs诱导对基质机械刚度的敏感性，并发现刚性的基质促进了氧化磷酸化的使用 | 研究未探讨不同类型的基质对Tregs诱导的影响 | 旨在提高调节性T细胞的诱导效率，以改善细胞免疫治疗 | 人类调节性T细胞（Tregs） | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物材料 | 使用了不同刚度的聚丙烯酰胺胶（PA-gels）作为实验样本 |
| 334 | 2024-08-07 |
Remarkable sex-specific differences at single-cell resolution in neonatal hyperoxic lung injury
2023-01-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00269.2022
PMID:36283964
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研究论文 | 研究了新生儿暴露于高氧环境下肺损伤的性别特异性及细胞类型特异性转录变化，并描绘了发育中肺部细胞间通信网络的变化。 | 首次在单细胞分辨率下研究新生儿高氧肺损伤的性别特异性转录变化，并识别了肺部血管内皮细胞对高氧暴露的敏感性及新的中间型内皮细胞群体。 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，可能限制了结果在人类中的直接应用。 | 探讨新生儿高氧暴露下肺损伤的性别特异性及细胞类型特异性转录变化，以及细胞间通信网络的变化。 | 新生儿肺部在高氧暴露下的细胞类型特异性转录变化及细胞间通信网络。 | 数字病理学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 从暴露于高氧或正常氧环境的新生雄性和雌性C57BL/6小鼠肺部分离的超过35,000个细胞 |
| 335 | 2024-08-07 |
Molecular Diversity of Neuron Types in the Salamander Amygdala and Implications for Amygdalar Evolution
2023, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000527899
PMID:36574764
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了蝾螈大脑中杏仁核的谷氨酸能神经元类型多样性，并探讨了其对杏仁核进化的影响 | 首次详细描述了非哺乳动物蝾螈杏仁核中谷氨酸能神经元的多样性，揭示了其与哺乳动物杏仁核神经元的分子差异 | 研究仅限于蝾螈这一种非哺乳动物，可能需要更多物种的数据来全面理解杏仁核的进化 | 探讨蝾螈杏仁核中神经元类型的多样性及其对杏仁核进化的影响 | 蝾螈杏仁核中的谷氨酸能神经元类型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 至少十种不同的谷氨酸能神经元类型和亚型 |
| 336 | 2024-08-07 |
Cross-Validated Loss-Based Covariance Matrix Estimator Selection in High Dimensions
2023, Journal of computational and graphical statistics : a joint publication of American Statistical Association, Institute of Mathematical Statistics, Interface Foundation of North America
IF:1.4Q2
DOI:10.1080/10618600.2022.2110883
PMID:37273839
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research paper | 本文研究了在高维数据中基于交叉验证损失的协方差矩阵估计器选择方法 | 提出了一个通用类别的损失函数用于协方差矩阵估计，并建立了相应的有限样本风险界限和交叉验证选择器的渐近最优条件 | NA | 开发一种在高维数据中选择最优协方差矩阵估计器的理论框架 | 协方差矩阵估计器的选择 | statistics | NA | NA | NA | single-cell transcriptome sequencing data | NA |
| 337 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic analyses reveal the effects of microorganisms on immunity and metabolism in the mouse liver
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.06.020
PMID:38152123
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研究论文 | 本研究通过构建无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠肝脏的单细胞和空间转录组（ST）图谱，揭示了微生物对肝脏免疫和代谢的影响 | 首次综合运用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）和空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq）技术，详细分析了微生物对小鼠肝脏免疫细胞比例和代谢过程的影响 | NA | 探究微生物对小鼠肝脏免疫和代谢的具体细胞和分子影响 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 转录组 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏样本 |
| 338 | 2024-08-07 |
CXCL14 as a potential marker for immunotherapy response prediction in renal cell carcinoma
2023, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359231217966
PMID:38152696
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研究论文 | 本研究探讨了CXCL14在预测肾细胞癌（RCC）患者免疫治疗效果中的作用 | 首次阐明了CXCL14在塑造肿瘤免疫微环境中的作用，并发现其在免疫治疗反应预测中的潜在价值 | NA | 旨在阐明CXCL14在预测RCC患者免疫治疗效果中的作用 | CXCL14表达与RCC患者免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | RCC的公共数据库中的数据集 |
| 339 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.523241
PMID:36711968
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了小鼠皮肤伤口早期炎症过程中的细胞动态变化，发现凋亡途径和吞噬凋亡细胞的受体在成纤维细胞和免疫细胞中上调，并探讨了这些受体在组织修复中的作用。 | 首次揭示了凋亡细胞识别受体在组织修复中的具体作用机制，并提供了慢性伤口治疗的新潜在靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的适用性需要进一步验证。 | 探讨凋亡细胞识别和清除在组织修复中的作用机制。 | 小鼠皮肤伤口中的成纤维细胞、免疫细胞及人类糖尿病足伤口。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口和人类糖尿病足伤口样本 |
| 340 | 2024-08-07 |
Identification of ADAM23 as a Potential Signature for Psoriasis Using Integrative Machine-Learning and Experimental Verification
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S441262
PMID:38148887
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研究论文 | 本研究通过综合机器学习算法和实验验证，识别出ADAM23作为银屑病的一个潜在标志物 | 本研究首次使用四种机器学习算法结合单细胞RNA测序分析，验证了ADAM23作为银屑病的高诊断准确性的关键生物标志物 | NA | 旨在识别银屑病的新型关键生物标志物并分析其潜在的分子机制 | 银屑病相关的生物标志物及其在疾病诊断和治疗中的应用 | 机器学习 | 皮肤疾病 | 机器学习算法（随机森林、LASSO逻辑回归、WGCNA、SVM-RFE）、CIBERSORT、单细胞RNA分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个数据集，包括GSE30999、GSE6710和GSE41662，以及人和小鼠的实验样本 |