单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.87977
PMID:37928259
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研究论文 | 本研究探讨了长非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | 发现了lncR-APDC沉默后牙周炎模型中独特的上皮细胞亚群和显著升高的表达水平，为牙周炎的表观遗传调控提供了新视角 | NA | 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | lncR-APDC基因敲除小鼠和诱导的实验性牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | lncR-APDC基因敲除小鼠和牙周炎牙龈组织 |
| 302 | 2024-08-07 |
Profiles of Wnt pathway gene expression during tooth morphogenesis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1316635
PMID:38274045
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研究论文 | 本研究通过荧光多重杂交和单细胞RNA测序技术，分析了Wnt信号通路基因在牙齿形态发生过程中的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了Wnt信号通路基因在牙齿发育不同阶段的表达模式，并揭示了其在牙本质和牙釉质矿化后的表达变化 | 研究主要集中在小鼠和人类牙齿发育的特定阶段，可能无法完全代表所有牙齿发育过程 | 探讨Wnt信号通路基因在牙齿形态发生中的作用及其表达模式 | Wnt信号通路基因在小鼠和人类牙齿发育中的表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类牙齿发育的不同阶段样本 |
| 303 | 2024-08-07 |
A glycosylation-related gene signature predicts prognosis, immune microenvironment infiltration, and drug sensitivity in glioma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1259051
PMID:38293671
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研究论文 | 本研究通过分析糖基化相关基因在胶质瘤中的表达，预测患者的预后、免疫微环境浸润及药物敏感性 | 首次利用糖基化相关基因构建预测胶质瘤预后和免疫反应的基因签名，并分析其对药物敏感性的影响 | NA | 研究糖基化相关基因在胶质瘤中的作用，预测患者的预后和免疫反应 | 胶质瘤患者的预后、免疫微环境浸润及药物敏感性 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO-regularized Cox模型 | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、CGGA、GEO和Rembrandt数据库的临床信息、bulk RNA-seq数据和单细胞RNA测序数据，以及来自GTEx数据库的正常脑组织RNA测序数据 |
| 304 | 2024-08-07 |
Impact of ferroptosis-related risk genes on macrophage M1/M2 polarization and prognosis in glioblastoma
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1294029
PMID:38283752
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研究论文 | 研究铁死亡相关风险基因对胶质母细胞瘤中巨噬细胞M1/M2极化及患者预后的影响 | 首次探讨了十四种铁死亡相关风险基因在胶质母细胞瘤中的作用，并阐明了这些基因对M1/M2巨噬细胞极化和患者预后的影响 | NA | 探索铁死亡对胶质母细胞瘤中巨噬细胞极化和患者预后的影响 | 铁死亡相关风险基因、巨噬细胞M1/M2极化、患者预后 | 数字病理学 | 脑癌 | LASSO Cox回归模型、CIBERSORTx反卷积算法、qPCR、western blot | NA | 基因表达数据 | 包括来自The Cancer Genome Atlas (TCGA)、中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和一个单细胞RNA测序数据集(GSE84465)的样本 |
| 305 | 2024-08-05 |
Unraveling the timeline of gene expression: A pseudotemporal trajectory analysis of single-cell RNA sequencing data
2023, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.134078.2
PMID:37994351
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研究论文 | 本研究展示了一种对小鼠乳腺单细胞RNA测序数据进行伪时间轨迹分析的全面工作流程 | 提出了一种新的分析方法，利用伪时间轨迹推断细胞分化和发育过程 | 主要集中在小鼠乳腺样本上，可能对其他生物体的适用性有限 | 旨在通过单细胞RNA测序分析细胞的发育和分化轨迹 | 小鼠乳腺中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠乳腺样本 |
| 306 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cancer stem-like cells and dynamics in tumor microenvironment during cholangiocarcinoma progression
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1250215
PMID:38020927
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胆管癌进展过程中肿瘤微环境中癌症干细胞样细胞的转录特征和动态变化 | 首次在YAP/AKT小鼠模型中通过单细胞RNA测序揭示了胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞及其微环境的动态变化 | NA | 深入理解胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞和肿瘤微环境的转录特征 | 胆管癌中的癌症干细胞样细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从YAP/AKT小鼠模型的三个不同肿瘤发生时间点收集的细胞样本 |
| 307 | 2024-08-05 |
Bibliometric and visual analysis of single-cell sequencing from 2010 to 2022
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1285599
PMID:38274109
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研究论文 | 本文对2010年至2022年间单细胞测序相关研究进行了文献计量和视觉分析 | 首次通过文献计量软件绘制出单细胞测序研究的发展趋势图 | 缺乏对单细胞测序相关研究的全面和公正分析 | 旨在通过文献计量方法分析单细胞测序的研究状态和趋势 | 对2010年至2022年间的相关文献进行分析 | 数字病理学 | NA | 文献计量 | NA | 文献 | 9,929篇 |
| 308 | 2024-08-05 |
Identification of a novel, MSC-induced macrophage subtype via single-cell sequencing: implications for intervertebral disc degeneration therapy
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1286011
PMID:38274272
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别了在缺氧条件下由间充质干细胞（MSC）诱导的独特巨噬细胞亚型，可能对椎间盘退变治疗具有重要意义 | 本文章创新性在于发现缺氧条件下MSC诱导的独特巨噬细胞亚群，揭示了MSC如何通过调节巨噬细胞表型影响椎间盘退变 | 研究局限性在于未能全面分离因缺氧影响而产生的所有调节因子 | 研究的目的在于探讨间充质干细胞对巨噬细胞的影响及其在椎间盘退变中的潜在治疗作用 | 研究对象为人类骨髓来源的巨噬细胞及间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养和基因表达数据 | 实验使用了人类骨髓来源的STRO3 MSCs和巨噬细胞 |
| 309 | 2024-08-07 |
Vision-Dependent and -Independent Molecular Maturation of Mouse Retinal Ganglion Cells
2023-01-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本文通过高吞吐量的单细胞RNA测序技术，研究了小鼠视网膜神经节细胞在胚胎期和出生后不同阶段的分子成熟过程，并探讨了视觉依赖和独立的影响因素。 | 首次全面分析了视觉依赖和独立对小鼠视网膜神经节细胞分子成熟的影响，并揭示了视觉活动在细胞类型特异性表达和成熟过程中的作用。 | 研究主要集中在分子层面，未来研究可以进一步探讨这些分子变化如何在细胞和组织层面影响视网膜神经节细胞的功能和连接。 | 探讨视网膜神经节细胞的发育和连接过程中，活动依赖和活动独立转录程序的分子相关性。 | 小鼠视网膜神经节细胞在不同发育阶段的分子成熟过程。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 45种不同转录组特征的视网膜神经节细胞类型 |
| 310 | 2024-08-05 |
Identification of diagnostic molecules and potential traditional Chinese medicine components for Alzheimer's disease by single cell RNA sequencing combined with a systematic framework for network pharmacology
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1335512
PMID:38249960
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和网络药理学框架，发现与阿尔茨海默病相关的关键基因和潜在的传统中药成分 | 创新点在于整合单细胞RNA测序与网络药理学，以识别潜在的治疗阿尔茨海默病的传统中药成分 | 研究可能受限于数据集的多样性和样本规模，影响结果的普适性 | 研究旨在探索与阿尔茨海默病相关的分子以及中药成分的潜在治疗作用 | 研究对象包括与阿尔茨海默病相关的基因和传统中药成分 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了多种样本的数据集，具体样本数量不详 |
| 311 | 2024-08-07 |
Dissecting cellular heterogeneity and intercellular communication in cholangiocarcinoma: implications for individualized therapeutic strategies
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1241834
PMID:38239853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨胆管癌中的细胞异质性和细胞间通讯，并分析了细胞类型、基因富集通路及细胞间通讯网络，为个性化治疗策略提供依据 | 首次通过单细胞RNA测序和CellChat分析揭示胆管癌中细胞异质性和细胞间通讯的复杂性，并发现肿瘤微环境中成纤维细胞的关键作用及T细胞的新克隆型 | 研究样本仅来自两名患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示胆管癌的细胞异质性和细胞间通讯，为开发有效治疗策略提供依据 | 胆管癌及其邻近正常组织的细胞异质性和细胞间通讯 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 两名患者的胆管癌及邻近正常组织 |
| 312 | 2024-08-07 |
Gastric Stem Cell Biology and Helicobacter pylori Infection
2023, Current topics in microbiology and immunology
DOI:10.1007/978-3-031-47331-9_1
PMID:38231213
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研究论文 | 研究幽门螺杆菌感染对胃干细胞生物学的影响及其在胃癌发展中的作用 | 利用细胞系追踪、类器官和单细胞RNA测序技术，深入了解正常稳态和感染状态下上皮和间质细胞亚型的分子“身份”，并揭示了幽门螺杆菌感染下干细胞（微环境）行为的原理 | NA | 探讨幽门螺杆菌感染如何影响胃干细胞行为及其在胃癌发展中的作用 | 胃干细胞、幽门螺杆菌感染、胃癌发展 | 数字病理学 | 胃癌 | 细胞系追踪、类器官、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 313 | 2024-08-07 |
A novel Bayesian framework for harmonizing information across tissues and studies to increase cell type deconvolution accuracy
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac616
PMID:36631398
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研究论文 | 本文介绍了一种新的贝叶斯框架tranSig，用于从单细胞RNA测序数据中提高细胞类型参考特征矩阵的推断准确性 | tranSig框架通过利用不同组织和研究中共享的细胞类型特异性表达模式，提高了特征矩阵推断的准确性和鲁棒性 | NA | 提高从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特征矩阵的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特征矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯框架 | RNA测序数据 | 涉及外周血、支气管肺泡灌洗和主动脉的bulk RNA测序数据 |
| 314 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals Wolbachia-mediated modification in early stages of Drosophila spermatogenesis
2023-01-11, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2022.1963
PMID:36629101
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇睾丸中的基因表达谱，揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生不同阶段的细胞中产生的影响，特别是在生殖干细胞中的基因表达调控 | 由于精子发生的复杂性和睾丸细胞类型的异质性，沃尔巴克氏菌对不同阶段精子发生细胞的具体影响机制仍需进一步研究 | 探讨沃尔巴克氏菌在果蝇精子发生早期阶段的介导修饰作用及其与细胞质不相容性的关联 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染和未感染沃尔巴克氏菌的成年雄性果蝇的睾丸细胞 |
| 315 | 2024-08-07 |
Commensal microbiome promotes hair follicle regeneration by inducing keratinocyte HIF-1α signaling and glutamine metabolism
2023-01-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7555
PMID:36598999
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research paper | 研究揭示了共生微生物群通过诱导角质形成细胞HIF-1α信号传导和谷氨酰胺代谢促进毛囊再生的机制 | 首次发现皮肤共生细菌通过诱导角质形成细胞的谷氨酰胺代谢，增强皮肤和毛囊的再生能力 | NA | 探究组织损伤后干细胞代谢变化对再生的影响 | 皮肤共生细菌、角质形成细胞、毛囊再生 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 皮肤样本 | 小鼠和人类皮肤样本 |
| 316 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in glioblastoma: is knowing the right zip code the key to the next therapeutic breakthrough?
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1266397
PMID:37916170
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review | 本文探讨了空间转录组学在胶质母细胞瘤研究中的应用 | 提出空间转录组学为研究胶质母细胞瘤及其周围脑组织的空间组织提供了新视角 | 仅讨论了当前的研究现状和未来方向，缺乏实证数据支持 | 研究空间转录组学在胶质母细胞瘤中的应用以理解其空间组织 | 胶质母细胞瘤及其与周围脑组织的相互作用 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/9856458
PMID:38189006
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撤回 | 该文章涉及对肌腱损伤发病机制的单细胞转录组学分析 | NA | NA | 研究肌腱损伤的发病机制 | 肌腱损伤的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-05 |
New perspectives on biology, disease progression, and therapy response of head and neck cancer gained from single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.044774
PMID:38188682
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综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在头颈癌中的应用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法，揭示了肿瘤微环境中不同细胞群体之间的异质性和细胞间通信 | 未提及特定的实验或临床数据，可能限制了理论与实际的结合 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学对头颈癌的认识 | 头颈鳞状细胞癌及其微环境中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-07 |
GAPDH: unveiling its impact as a key hypoxia-related player in head and neck squamous cell carcinoma tumor progression, prognosis, and therapeutic potential
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38187058
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研究论文 | 本文探讨了糖酵解酶GAPDH在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用，特别是在不同缺氧条件下的功能和治疗潜力 | 首次详细分析了GAPDH在HNSCC中的表达与患者生存率、免疫细胞浸润及药物疗效的关系 | 研究主要基于现有数据库和细胞系实验，未涉及临床试验验证 | 揭示GAPDH在HNSCC中的生物学功能及其对肿瘤进展、预后和治疗潜力的影响 | GAPDH在HNSCC中的表达及其与缺氧条件的关系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GSE29330、GSE41613和GSE139324等多个数据库的数据 |
| 320 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of senescence-related genes and immune infiltration in intervertebral disc degeneration: a meta-data approach utilizing bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1296782
PMID:38187091
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研究论文 | 本研究旨在通过分析大量和单细胞RNA测序数据，识别与椎间盘退变相关的衰老基因及其潜在调控机制 | 本研究通过结合大量和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于关键衰老相关差异表达基因和免疫细胞浸润的诊断模型，为椎间盘退变的发病机制和免疫治疗策略提供了新的见解 | NA | 识别与椎间盘退变相关的关键衰老基因及其潜在调控机制 | 椎间盘退变（IDD）的衰老基因和免疫浸润 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | RNA测序 | lasso回归 | RNA测序数据 | 涉及GSE34095和GSE70362数据集以及单细胞数据集GSE165722 |