单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
Systematic single cell RNA sequencing analysis reveals unique transcriptional regulatory networks of Atoh1-mediated hair cell conversion in adult mouse cochleae
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0284685
PMID:38079436
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了成年小鼠耳蜗中Atoh1介导的支持细胞向毛细胞转化的独特转录调控网络 | 本文通过使用多种高通量测序分析工具，揭示了先前未被识别的关键调控因子，这些因子指导转化后的毛细胞分化 | NA | 研究成年哺乳动物耳蜗中毛细胞再生的调控机制 | 成年小鼠耳蜗中的支持细胞向毛细胞的转化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 成年小鼠耳蜗中的支持细胞和毛细胞样本 |
| 302 | 2024-08-07 |
Endothelial anthrax toxin receptor 2 plays a protective role in liver fibrosis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1278968
PMID:38322497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析临床肝脏非实质细胞数据，探讨了内皮细胞中的炭疽毒素受体2（ANTXR2）在肝纤维化中的保护作用 | 首次揭示了ANTXR2通过促进MMP2活化降解细胞外基质（ECM）在肝纤维化中的保护作用 | NA | 识别肝纤维化中的关键细胞和分子机制，以开发控制肝脏相关疾病的新策略 | 肝脏非实质细胞中的ANTXR2表达及其在肝纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了GSE136103和GSE181483两个数据集的临床肝脏非实质细胞样本 |
| 303 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling highlights the role of APP in blood vessels in assessing the risk of patients with proliferative diabetic retinopathy developing Alzheimer's disease
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1328979
PMID:38328307
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了增殖性糖尿病视网膜病变（PDR）与阿尔茨海默病（AD）之间血管中APP信号通路的关键作用 | 首次揭示了APP信号通路在PDR和AD血管病变中的重要作用，并验证了APP基因表达与AD相关基因的显著关联 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞间通信预测，未来需更多实验验证 | 探究PDR与AD之间血管病变的关键因素和共享信号通路 | 增殖性糖尿病视网膜病变和阿尔茨海默病的血管 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变，阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类纤维血管膜（PDR）和人类海马血管（AD）的单细胞RNA测序数据 |
| 304 | 2024-08-07 |
Exploring the tumor micro-environment in primary and metastatic tumors of different ovarian cancer histotypes
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1297219
PMID:38328306
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研究论文 | 本研究利用高分辨率单细胞RNA测序技术，探索了不同卵巢癌组织类型中肿瘤微环境的细胞组成及其相互作用 | 首次在不同卵巢癌组织类型中全面描绘了肿瘤微环境的细胞类型及其相互作用 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 进一步阐明肿瘤进展、转移及不同组织类型的分子特征，以实现个性化诊断和治疗 | 21个实体肿瘤样本，来自12名患有六种卵巢癌组织类型的患者，包括原发和转移部位 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个实体肿瘤样本，来自12名患者 |
| 305 | 2024-08-04 |
Integration of Single-Cell RNA-Sequencing and Network Analysis to Investigate Mechanisms of Drug Resistance
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3163-8_7
PMID:37191792
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研究论文 | 本研究探讨了抗癌药物耐药机制的单细胞RNA测序与网络分析的结合 | 提出了一种通过单细胞RNA测序结合网络分析的新方法，以识别与药物耐药相关的通路 | 未在摘要中提供具体的实验数据或样本限制信息 | 探索抗癌药物耐药的机制以发展替代治疗方法 | 药物敏感和耐药变体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PANDA | 表达数据 | NA |
| 306 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of neurofibromas reveals a tumor microenvironment favorable for neural regeneration and immune suppression in a neurofibromatosis type 1 porcine model
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1253659
PMID:37817770
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研究论文 | 本研究揭示了神经纤维瘤的细胞组成和信号传导，强调其肿瘤微环境对神经再生及免疫抑制的影响 | 首次在神经纤维瘤动物模型中观察到肿瘤相关的树突状细胞，并识别到新的成纤维细胞和免疫细胞群体 | 尚未探索成熟、非皮肤神经纤维瘤中的细胞信号网络 | 旨在探讨神经纤维瘤的细胞组成及其与正常组织的信号传导对比 | 研究对象为猪模型中的成熟神经纤维瘤及其相邻正常组织 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 猪模型中的多个成熟神经纤维瘤样本 |
| 307 | 2024-08-07 |
Immunological Analysis of Cryptococcal Meningoencephalitis in a Murine Model
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3199-7_5
PMID:37145276
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研究论文 | 本文描述了一种诱导产生与人类隐球菌病免疫病理学多个方面相符的C. neoformans中枢神经系统感染小鼠模型的方法，并进行了详细的免疫学分析 | 结合基因敲除小鼠、抗体阻断、细胞转移以及单细胞RNA测序等高通量技术，该模型为揭示隐球菌中枢神经系统疾病的发病机制提供了新见解 | NA | 研究隐球菌性脑膜脑炎的免疫学机制，以开发更有效的治疗策略 | 隐球菌性脑膜脑炎的免疫病理学和小鼠模型的建立 | NA | 隐球菌性脑膜脑炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 308 | 2024-08-07 |
Multi-omics segregate different transcriptomic impacts of anti-IL-17A blockade on type 17 T-cells and regulatory immune cells in psoriasis skin
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1250504
PMID:37781383
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研究论文 | 本研究探讨了系统性IL-17A阻断对银屑病皮肤中1型17 T细胞和调节性免疫细胞转录组的影响 | 首次通过多组学方法整合免疫细胞富集的scRNA-seq、微阵列和免疫组化数据，揭示了系统性IL-17A阻断在银屑病皮肤中对T17轴和调节性DC转录组的调控作用 | 研究样本量有限，且仅限于银屑病患者的皮肤样本，可能限制了结果的普遍性 | 寻找系统性IL-17A阻断促进银屑病皮肤免疫细胞亚群调节性转录组修饰的转化证据 | 银屑病患者的皮肤样本，包括治疗前后的6mm穿刺活检组织 | 数字病理学 | 银屑病 | scRNA-seq, 微阵列, 免疫组化 | NA | RNA | scRNA-seq样本18个，微阵列样本61个，免疫组化样本61个，正常对照皮肤scRNA-seq样本10个，微阵列样本8个 |
| 309 | 2024-08-05 |
Spatial Mapping of Genes Implicated in SARS-CoV-2 Neuroinvasion to Dorsolateral Prefrontal Cortex Gray Matter
2023-Jan, COVID
DOI:10.3390/covid3010005
PMID:36714172
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法分析与SARS-CoV-2神经侵犯相关的基因异质性 | 首次对与SARS-CoV-2脑内渗透相关的基因在背外侧前额皮质的空间分布进行表征 | 目前对SARS-CoV-2神经侵犯的基因水平生物学理解仍然很有限 | 探究 SARS-CoV-2 对人类背外侧前额皮质的影响及相关基因的空间分布 | 人类背外侧前额皮质组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 4 |
| 310 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics shows dose-dependent disruption of hepatic zonation by TCDD in mice
2023-01-31, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfac109
PMID:36222588
|
研究论文 | 这篇文章使用单细胞转录组学研究TCDD对小鼠肝区分的剂量依赖性破坏。 | 文章通过单细胞核RNA测序和空间转录组学首次揭示了TCDD引起的剂量依赖性基因表达变化和肝区分的破坏。 | 本研究受限于使用小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理和病理状态。 | 研究TCDD对小鼠肝脏细胞特异性和空间分布的影响。 | 研究对象为给药后接受TCDD处理的小鼠肝脏细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 131,613个细胞核 |
| 311 | 2024-08-07 |
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.87977
PMID:37928259
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研究论文 | 本研究探讨了长非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | 发现了lncR-APDC沉默后牙周炎模型中独特的上皮细胞亚群和显著升高的表达水平，为牙周炎的表观遗传调控提供了新视角 | NA | 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | lncR-APDC基因敲除小鼠和诱导的实验性牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | lncR-APDC基因敲除小鼠和牙周炎牙龈组织 |
| 312 | 2024-08-07 |
Profiles of Wnt pathway gene expression during tooth morphogenesis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1316635
PMID:38274045
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研究论文 | 本研究通过荧光多重杂交和单细胞RNA测序技术，分析了Wnt信号通路基因在牙齿形态发生过程中的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了Wnt信号通路基因在牙齿发育不同阶段的表达模式，并揭示了其在牙本质和牙釉质矿化后的表达变化 | 研究主要集中在小鼠和人类牙齿发育的特定阶段，可能无法完全代表所有牙齿发育过程 | 探讨Wnt信号通路基因在牙齿形态发生中的作用及其表达模式 | Wnt信号通路基因在小鼠和人类牙齿发育中的表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类牙齿发育的不同阶段样本 |
| 313 | 2024-08-07 |
A glycosylation-related gene signature predicts prognosis, immune microenvironment infiltration, and drug sensitivity in glioma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1259051
PMID:38293671
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研究论文 | 本研究通过分析糖基化相关基因在胶质瘤中的表达，预测患者的预后、免疫微环境浸润及药物敏感性 | 首次利用糖基化相关基因构建预测胶质瘤预后和免疫反应的基因签名，并分析其对药物敏感性的影响 | NA | 研究糖基化相关基因在胶质瘤中的作用，预测患者的预后和免疫反应 | 胶质瘤患者的预后、免疫微环境浸润及药物敏感性 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO-regularized Cox模型 | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、CGGA、GEO和Rembrandt数据库的临床信息、bulk RNA-seq数据和单细胞RNA测序数据，以及来自GTEx数据库的正常脑组织RNA测序数据 |
| 314 | 2024-08-07 |
Impact of ferroptosis-related risk genes on macrophage M1/M2 polarization and prognosis in glioblastoma
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1294029
PMID:38283752
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研究论文 | 研究铁死亡相关风险基因对胶质母细胞瘤中巨噬细胞M1/M2极化及患者预后的影响 | 首次探讨了十四种铁死亡相关风险基因在胶质母细胞瘤中的作用，并阐明了这些基因对M1/M2巨噬细胞极化和患者预后的影响 | NA | 探索铁死亡对胶质母细胞瘤中巨噬细胞极化和患者预后的影响 | 铁死亡相关风险基因、巨噬细胞M1/M2极化、患者预后 | 数字病理学 | 脑癌 | LASSO Cox回归模型、CIBERSORTx反卷积算法、qPCR、western blot | NA | 基因表达数据 | 包括来自The Cancer Genome Atlas (TCGA)、中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和一个单细胞RNA测序数据集(GSE84465)的样本 |
| 315 | 2024-08-05 |
Unraveling the timeline of gene expression: A pseudotemporal trajectory analysis of single-cell RNA sequencing data
2023, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.134078.2
PMID:37994351
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研究论文 | 本研究展示了一种对小鼠乳腺单细胞RNA测序数据进行伪时间轨迹分析的全面工作流程 | 提出了一种新的分析方法，利用伪时间轨迹推断细胞分化和发育过程 | 主要集中在小鼠乳腺样本上，可能对其他生物体的适用性有限 | 旨在通过单细胞RNA测序分析细胞的发育和分化轨迹 | 小鼠乳腺中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠乳腺样本 |
| 316 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cancer stem-like cells and dynamics in tumor microenvironment during cholangiocarcinoma progression
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1250215
PMID:38020927
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胆管癌进展过程中肿瘤微环境中癌症干细胞样细胞的转录特征和动态变化 | 首次在YAP/AKT小鼠模型中通过单细胞RNA测序揭示了胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞及其微环境的动态变化 | NA | 深入理解胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞和肿瘤微环境的转录特征 | 胆管癌中的癌症干细胞样细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从YAP/AKT小鼠模型的三个不同肿瘤发生时间点收集的细胞样本 |
| 317 | 2024-08-05 |
Bibliometric and visual analysis of single-cell sequencing from 2010 to 2022
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1285599
PMID:38274109
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研究论文 | 本文对2010年至2022年间单细胞测序相关研究进行了文献计量和视觉分析 | 首次通过文献计量软件绘制出单细胞测序研究的发展趋势图 | 缺乏对单细胞测序相关研究的全面和公正分析 | 旨在通过文献计量方法分析单细胞测序的研究状态和趋势 | 对2010年至2022年间的相关文献进行分析 | 数字病理学 | NA | 文献计量 | NA | 文献 | 9,929篇 |
| 318 | 2024-08-05 |
Identification of a novel, MSC-induced macrophage subtype via single-cell sequencing: implications for intervertebral disc degeneration therapy
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1286011
PMID:38274272
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别了在缺氧条件下由间充质干细胞（MSC）诱导的独特巨噬细胞亚型，可能对椎间盘退变治疗具有重要意义 | 本文章创新性在于发现缺氧条件下MSC诱导的独特巨噬细胞亚群，揭示了MSC如何通过调节巨噬细胞表型影响椎间盘退变 | 研究局限性在于未能全面分离因缺氧影响而产生的所有调节因子 | 研究的目的在于探讨间充质干细胞对巨噬细胞的影响及其在椎间盘退变中的潜在治疗作用 | 研究对象为人类骨髓来源的巨噬细胞及间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养和基因表达数据 | 实验使用了人类骨髓来源的STRO3 MSCs和巨噬细胞 |
| 319 | 2024-08-07 |
Vision-Dependent and -Independent Molecular Maturation of Mouse Retinal Ganglion Cells
2023-01-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本文通过高吞吐量的单细胞RNA测序技术，研究了小鼠视网膜神经节细胞在胚胎期和出生后不同阶段的分子成熟过程，并探讨了视觉依赖和独立的影响因素。 | 首次全面分析了视觉依赖和独立对小鼠视网膜神经节细胞分子成熟的影响，并揭示了视觉活动在细胞类型特异性表达和成熟过程中的作用。 | 研究主要集中在分子层面，未来研究可以进一步探讨这些分子变化如何在细胞和组织层面影响视网膜神经节细胞的功能和连接。 | 探讨视网膜神经节细胞的发育和连接过程中，活动依赖和活动独立转录程序的分子相关性。 | 小鼠视网膜神经节细胞在不同发育阶段的分子成熟过程。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 45种不同转录组特征的视网膜神经节细胞类型 |
| 320 | 2024-08-05 |
Identification of diagnostic molecules and potential traditional Chinese medicine components for Alzheimer's disease by single cell RNA sequencing combined with a systematic framework for network pharmacology
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1335512
PMID:38249960
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和网络药理学框架，发现与阿尔茨海默病相关的关键基因和潜在的传统中药成分 | 创新点在于整合单细胞RNA测序与网络药理学，以识别潜在的治疗阿尔茨海默病的传统中药成分 | 研究可能受限于数据集的多样性和样本规模，影响结果的普适性 | 研究旨在探索与阿尔茨海默病相关的分子以及中药成分的潜在治疗作用 | 研究对象包括与阿尔茨海默病相关的基因和传统中药成分 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了多种样本的数据集，具体样本数量不详 |